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当前共找到 1119 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-12-06 |
SUV39H2 is a vulnerability in glioblastoma stem cells enhanced by co-targeting SUV39H1
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2568366
PMID:41047764
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研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用，并评估了同时靶向SUV39H2和SUV39H1对破坏干细胞维持的效果 | 发现SUV39H2是胶质母细胞瘤干细胞的新调控因子，且同时靶向SUV39H2和SUV39H1能更有效地破坏干细胞维持 | NA | 研究SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用，并评估同时靶向SUV39H2和SUV39H1的治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, western blot | NA | RNA-seq数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 922 | 2025-12-06 |
Human neural stem cell-derived exosomes promote functional recovery in subarachnoid hemorrhage via bdnf/trkb pathway activation and astrocyte modulation
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02155-0
PMID:41327445
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研究论文 | 本研究探讨了人神经干细胞来源的外泌体通过激活BDNF/TRKB通路和调节星形胶质细胞，在蛛网膜下腔出血模型中促进功能恢复的神经保护作用 | 首次利用单细胞RNA测序和转录组分析，揭示了hNSC-exo通过BDNF/TRKB信号通路激活和星形胶质细胞调节发挥神经保护作用的分子机制 | 研究基于大鼠模型，临床转化潜力需进一步验证；未详细探讨外泌体的具体成分及其递送效率 | 探究人神经干细胞来源的外泌体在蛛网膜下腔出血中的神经保护潜力及其分子机制 | 大鼠蛛网膜下腔出血模型、人神经干细胞来源的外泌体 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及大鼠模型和体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 923 | 2025-12-06 |
Brain-derived neurotrophic factor supports pericyte and vascular homeostasis in the aging brain
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02181-y
PMID:41327464
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研究论文 | 本研究揭示了脑源性神经营养因子（BDNF）通过激活Akt信号通路调节周细胞PDGFRβ表达，从而维持衰老大脑中周细胞和微血管稳态的机制 | 首次发现并证实了BDNF-TrkB信号通路在衰老大脑周细胞稳态和微血管完整性中的直接调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；对BDNF信号通路下游的具体分子机制探索尚不全面 | 探究BDNF在衰老大脑中维持周细胞和微血管稳态的调控机制 | 不同年龄段的C57BL/6J小鼠、条件性敲除Bdnf基因的C57BL/6小鼠、以及体外培养的周细胞系 | 神经生物学 | 衰老相关脑疾病 | 免疫染色、Western blot、流式细胞术、单细胞测序、转录组分析 | NA | 图像数据、蛋白质印迹数据、流式细胞数据、测序数据 | 使用不同年龄段的小鼠模型及体外培养的周细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 924 | 2025-12-06 |
Materiobiology in the omics era
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102539
PMID:41332940
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综述 | 本文综述了多组学技术在材料生物学中的应用，包括单细胞转录组学、转录组学、RNomics、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、糖组学和免疫组学，并讨论了多组学策略如何支持骨类器官的构建 | 整合多种组学技术揭示细胞与生物材料相互作用的复杂调控机制，为下一代生物材料的理性设计提供理论基础和方法学 | NA | 探讨多组学技术在材料生物学中的应用，以推动精准和再生医学中的材料创新 | 细胞与生物材料的相互作用，以及骨类器官作为生理相关模型 | 材料生物学 | NA | 单细胞转录组学, 转录组学, RNomics, 基因组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 脂质组学, 糖组学, 免疫组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 925 | 2025-12-05 |
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501658RR
PMID:41329022
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析，比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 | 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中，结合空间转录组学和单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 | 样本量相对较小（空间转录组学分析仅8例，免疫组化分析35例），且未包括其他卒中病因亚型 | 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 | 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 | 42例急性缺血性卒中患者（其中8例LAA，27例CE），空间转录组学分析8例（4例LAA，4例CE），免疫组化分析35例（8例LAA，27例CE） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 926 | 2025-12-05 |
Endothelial ADAR1 Deficit Induces the NOCT-IRF7 Axis in Pulmonary Hypertension
2025-Dec-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326277
PMID:41342206
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的ADAR1缺乏通过上调NOCT表达，激活肺内皮细胞干扰素信号通路，导致细胞凋亡并促进肺动脉高压的发病机制 | 首次发现ADAR1通过RNA编辑调控NOCT基因表达，并建立了ADAR1-NOCT轴在肺动脉高压中的关键作用机制 | 研究主要基于体外细胞和动物模型，人类样本验证相对有限，且具体RNA编辑位点的功能机制需进一步阐明 | 阐明ADAR1依赖性RNA编辑在调控肺内皮细胞病理表型和肺动脉高压发病中的功能和靶点 | 肺内皮细胞、人类和小鼠肺动脉高压模型 | 分子生物学 | 肺动脉高压 | RNA测序、单细胞RNA测序、腺相关病毒表达 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类肺动脉高压肺组织、缺氧PH小鼠模型、多种啮齿动物疾病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 927 | 2025-12-05 |
Identification of CD7 as a novel biomarker of embryonal hepatoblastoma
2025-Dec-04, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06255-9
PMID:41343061
|
研究论文 | 本研究通过多种生物信息学分析和免疫组化染色，探讨了CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为新型生物标志物的潜力 | 首次将CD7鉴定为胚胎型肝母细胞瘤的新型生物标志物，并揭示其与肿瘤进展和不良临床结局的关联 | 研究主要基于回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证和功能实验来确认CD7的生物学作用 | 研究CD7在肝母细胞瘤中的表达及其作为生物标志物的潜力 | 人类肝母细胞瘤样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学分析, 免疫组化染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 928 | 2025-12-05 |
ScisTree2 enables large-scale inference of cell lineage trees and genotype calling using efficient local search
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280542.125
PMID:40903391
|
研究论文 | 本文介绍了ScisTree2，一种基于无限位点模型、用于大规模细胞谱系树推断和基因型调用的快速准确方法 | ScisTree2是首个能够处理数万或更多细胞数据集的基于模型的细胞谱系树推断和基因型调用方法，并采用高效局部搜索优化树结构 | NA | 开发一种能够从大规模单细胞数据中准确推断细胞谱系树并进行基因型调用的计算方法 | 单细胞测序数据中的细胞谱系树和基因型 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 无限位点模型 | 单细胞测序数据 | 数万或更多细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2025-12-05 |
Label-free selection of marker genes in single-cell and spatial transcriptomics with geneCover
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280539.125
PMID:41224531
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为geneCover的无标签组合方法，用于在单细胞RNA测序和空间转录组学数据中选择最优的标记基因面板 | 提出了一种基于基因-基因相关性的无标签组合方法，能有效识别稀有细胞类型或微妙空间模式的标记基因，并具有出色的可扩展性 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种无标签的标记基因选择方法，以捕获单细胞和空间转录组学数据中的细胞和空间异质性 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据中的标记基因面板 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 组合方法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 930 | 2025-12-05 |
Unified integration of spatial transcriptomics across platforms with LLOKI
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280803.125
PMID:41233159
|
研究论文 | 本文提出了一种名为LLOKI的新型框架，用于整合不同平台的空间转录组学数据，无需共享基因面板 | LLOKI通过最优传输引导的特征传播和基于图的插补技术，解决了跨平台ST数据整合中基因面板差异、数据稀疏性和技术变异性的挑战，并利用scGPT等单细胞基础模型生成统一特征 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个能够整合不同平台空间转录组学数据的统一框架，以促进对组织结构和细胞相互作用的深入理解 | 小鼠脑组织样本和卵巢癌数据集 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | scGPT（单细胞基础模型），基于图的插补模型 | 空间转录组学数据，单细胞RNA测序数据 | 来自五种不同技术的小鼠脑样本，以及五个卵巢癌数据集 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 931 | 2025-12-05 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280555.125
PMID:41249066
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SIID的算法，用于整合不同空间转录组学平台的数据，以进行基因表达的插补和解卷积 | SIID算法通过联合非负因子分解模型，结合空间对齐，能够同时处理基因表达缺失和细胞类型特异性表达推断，在模拟和真实数据中均表现出优于现有工具的性能 | NA | 整合不同空间转录组学技术的数据，以克服单个技术的局限性，实现基因表达的准确插补和解卷积 | 空间转录组学数据，特别是来自10x Genomics Visium和Xenium平台的人类乳腺癌和结肠癌组织切片 | 空间转录组学 | 乳腺癌，结肠癌 | 空间转录组学 | 联合非负因子分解模型 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium平台测量多细胞大小点的全转录组，10x Xenium平台在亚细胞分辨率下测量数百个基因 |
| 932 | 2025-12-05 |
Optimal marker genes for c-separated cell types with SepSolve
2025-Dec-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280637.125
PMID:41067889
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SepSolve的新方法，用于在单细胞RNA-seq研究中识别细胞类型，通过优化选择标记基因以实现细胞类型的c-分离 | 引入c-分离概念，并设计线性规划模型，在考虑细胞类型内表达变异的同时避免处理所有细胞对，从而高效计算最优标记基因集 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发一种高效且稳定的标记基因选择方法，以准确区分单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型及其标记基因 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | 线性规划 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 933 | 2025-12-05 |
Delta-like ligand 4 mediated myeloid-derived suppressor cell metabolic reprogramming promotes neoadjuvant therapy resistance in titin-inactivated triple-negative breast cancer
2025-Dec-02, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00372-6
PMID:41326912
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研究论文 | 本研究揭示了Titin失活通过DLL4-MCT4轴调控髓源性抑制细胞代谢重编程，促进三阴性乳腺癌新辅助治疗耐药的机制 | 首次定义了“Titin失活”状态，并发现其通过DLL4增强MDSCs的糖酵解功能，驱动肿瘤免疫逃逸和治疗抵抗 | 研究主要基于临床样本和动物模型，尚未在更大规模人群中验证，且机制细节需进一步探索 | 探究Titin失活如何调控免疫逃逸并影响三阴性乳腺癌的治疗抵抗 | 三阴性乳腺癌患者样本、基因编辑的TNBC细胞系、原位MCT4基因修饰小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 全外显子组测序、单细胞转录组测序、空间转录组测序、CRISPR-Cas9基因编辑、糖酵解相关分子实验 | 基因修饰小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及TNBC患者临床样本和多种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、全外显子组测序 | NA | NA |
| 934 | 2025-12-05 |
Marsupial single-cell transcriptomics identifies temporal diversity in mammalian developmental programs
2025-Dec-01, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.037
PMID:40712578
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学分析有袋类动物负鼠的发育过程，揭示了哺乳动物发育程序中的时间多样性 | 首次将有袋类动物纳入单细胞转录组学研究，识别了异时性组织并发现前部结构转录程序启动更早、进展更快 | 研究仅聚焦于有袋类动物负鼠，可能无法完全代表所有哺乳动物发育模式 | 探究哺乳动物发育程序中的时间多样性，特别关注有袋类动物的异时性现象 | 有袋类动物负鼠（Monodelphis domestica）的原肠胚形成和早期器官发生过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及负鼠发育多个阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 935 | 2025-12-05 |
The extracellular-matrix-remodeling capability exposes therapeutic vulnerability in a subset of renal cell carcinomas with tumor thrombi
2025-Dec-01, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.07.010
PMID:40774251
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研究论文 | 本研究通过多中心、多组学数据分析，识别了肾细胞癌伴癌栓的两种亚型，并揭示了预后不良亚型中由上皮LOX表达驱动的细胞外基质重塑及其在构建肿瘤免疫屏障中的作用 | 首次在肾细胞癌伴癌栓中识别出两种临床相关亚型，并发现预后不良亚型中上皮LOX驱动的细胞外基质重塑是关键的肿瘤免疫屏障形成机制，为LOX抑制联合免疫治疗提供了新策略 | 研究基于回顾性多中心数据，需要前瞻性临床试验验证LOX抑制剂的治疗效果 | 探究肾细胞癌伴癌栓的肿瘤微环境特征、分子亚型及其对治疗抵抗的影响，寻找新的治疗靶点 | 164例肾细胞癌伴癌栓患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学，多组学数据分析，多重免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，多组学数据，临床数据 | 164例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 936 | 2025-12-05 |
Combinatorial BMP4 and activin direct the choice between alternate routes to endoderm in a stem cell model of human gastrulation
2025-Dec-01, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.08.009
PMID:40930099
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研究论文 | 本研究结合单细胞转录组学、活细胞成像和数学模型，探索了激活素和骨形态发生蛋白4（BMP4）如何协同或拮抗地引导人类原肠胚形成过程中的命运决定，揭示了内胚层通过直接和间接两条路径产生的机制 | 揭示了BMP4在诱导中胚层基因的同时促进多能性退出的双重作用，并首次在人类干细胞模型中阐明了信号组合不仅决定细胞最终命运，还影响其发育路径的选择，表明谱系汇聚增强了命运决定的稳健性 | 研究基于干细胞模型，可能与体内实际发育过程存在差异；未全面探索其他可能参与的信号通路 | 探究组合信号（激活素和BMP4）如何引导人类原肠胚形成过程中的细胞命运决定 | 人类干细胞模型中的细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、活细胞成像、数学建模 | NA | 转录组数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2025-12-05 |
Endothelial protective effects of ferulic acid in preeclampsia treatment
2025-Dec-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00495.2025
PMID:41165539
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研究论文 | 本研究探讨了阿魏酸通过靶向STAT3/VEGF信号轴改善子痫前期小鼠模型的内皮功能和炎症反应 | 首次在子痫前期模型中系统验证阿魏酸通过调控STAT3/VEGF信号通路改善内皮功能障碍的保护作用 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；机制研究主要聚焦STAT3/VEGF轴，可能存在其他通路参与 | 评估阿魏酸作为子痫前期治疗策略的疗效和机制 | L-NAME诱导的子痫前期小鼠模型 | NA | 子痫前期 | 单细胞RNA测序，分子检测 | NA | 基因表达数据，生理指标数据 | 未明确说明样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 938 | 2025-12-05 |
LCN2 drives ferroptosis-associated ischemia-reperfusion injury after renal transplantation: integrated machine learning and in vivo validation
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02182-1
PMID:41205031
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习与体内验证，揭示了脂质运载蛋白-2（LCN2）在肾移植后铁死亡相关缺血-再灌注损伤中的关键作用 | 首次将LCN2确定为移植相关肾缺血-再灌注损伤中铁死亡和免疫失调的关键介质，并开发了一个包含LCN2的六基因机器学习模型用于IRI预测 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性人类队列，需要在更大规模的前瞻性临床研究中验证LCN2抑制剂的治疗效果 | 阐明LCN2在肾移植缺血-再灌注损伤中的作用机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠肾缺血-再灌注损伤模型、人类肾移植患者样本 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 转录组测序、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、差异表达分析 | 逻辑回归、随机森林、集成模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 6个小鼠IRI转录组数据集（83个样本）、2个人类移植队列（212个样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 939 | 2025-12-05 |
Neutrophil CD11b is a pivotal PANoptosis marker correlated with disease activity in antineutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis
2025-Dec, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02193-y
PMID:41100001
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别CD11B为抗中性粒细胞胞质抗体相关性血管炎中关键的PANoptosis相关基因，并验证了中性粒细胞上活化的CD11b水平与疾病活动性相关 | 首次将CD11B鉴定为AAV中关键的PANoptosis相关基因，并揭示了其通过脂肪酸代谢途径调节中性粒细胞活化和PANoptosis的机制 | 研究样本量有限，且主要依赖生物信息学分析和体外实验，需要更大规模的临床队列和体内实验验证 | 识别抗中性粒细胞胞质抗体相关性血管炎中关键的PANoptosis相关标志物，并探究其与疾病活动性的关联 | 抗中性粒细胞胞质抗体相关性血管炎患者、ANCA相关性肾炎小鼠模型、中性粒细胞 | 生物信息学 | 血管炎 | 基因微阵列、单细胞测序、免疫荧光染色、代谢通路分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床参数 | AAV患者和健康对照的血液、尿液、血浆及肾脏标本，ANCA-GN小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 940 | 2025-12-05 |
Joint profiling of cell morphology and gene expression during in vitro neurodevelopment
2025-Dec-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102578
PMID:41324988
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研究论文 | 本研究通过联合分析诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的皮质神经元在三个发育时间点的细胞形态和基因表达，揭示了形态特征与基因表达之间的关系，并评估了其在神经发育相关疾病模型中的应用潜力 | 首次在单细胞分辨率上联合使用Cell Painting（CP）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，对iPSC衍生的皮质神经元进行多模态表征，将形态特征与生物学功能关联，并展示了其在捕获疾病遗传性方面的能力 | 研究主要基于体外iPSC衍生的神经元模型，可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性；样本虽大但仅限于特定时间点和细胞类型 | 探究iPSC衍生的皮质神经元在神经发育过程中的形态与基因表达关系，并评估其作为脑相关复杂性状（如精神分裂症和双相情感障碍）疾病模型的适用性 | 诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的皮质神经元，包括来自Kabuki综合征患者的神经祖细胞 | 数字病理学 | 精神分裂症, 双相情感障碍, Kabuki综合征 | Cell Painting（CP）, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像, 基因表达数据 | 约60,000个iPSC衍生的皮质神经元，覆盖三个发育时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |