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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-12-08 |
Decoding immune aging at single-cell resolution
2025-Dec, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2025.09.001
PMID:41006183
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解码免疫衰老方面的应用,重点分析了年龄相关的细胞组成和功能变化 | 利用单细胞多组学技术绘制人类生命周期中的免疫轨迹,揭示了外周免疫细胞中先前未被认识的异质性和功能转变 | 存在显著的技术和分析挑战,包括跨平台和跨人群的数据整合问题 | 通过单细胞分辨率解码免疫衰老,以实现免疫衰老的早期检测、个性化免疫调节和延长健康寿命的精准策略 | 人类外周免疫细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 902 | 2025-12-08 |
Integrated multi-omics identifies GZMA targeting NK cells as a novel therapeutic strategy for hidradenitis suppurativa
2025-Dec, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100363
PMID:41192724
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学、孟德尔随机化和单细胞转录组分析,确定了GZMA作为化脓性汗腺炎(HS)的潜在治疗靶点,并揭示了NK细胞在疾病发病机制中的关键作用 | 首次通过多组学整合方法将GZMA确定为HS的核心治疗靶点,并利用单细胞测序技术揭示了GZMA在NK细胞中的特异性表达及其与T细胞、B细胞的通讯差异 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;样本量可能有限,且孟德尔随机化分析可能存在残留混杂因素 | 阐明化脓性汗腺炎的发病机制并开发基于患者免疫特征的精准干预策略 | 化脓性汗腺炎(HS)患者及相关生物样本 | 生物信息学 | 皮肤病 | 批量转录组学、孟德尔随机化、单细胞转录组测序、分子对接模拟 | WGCNA、LASSO回归、IVW、加权中位数、简单模式、加权模式、贝叶斯MR | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 903 | 2025-12-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor cell and immune cell variations associated with lymphatic metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Dec-01, Endocrine connections
IF:2.6Q3
DOI:10.1530/EC-25-0514
PMID:41257484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了甲状腺乳头状癌中与淋巴转移相关的肿瘤细胞和免疫细胞变异 | 首次在单细胞水平上系统分析了PTC中淋巴转移相关的细胞异质性和细胞间通讯变化,特别是识别了CD8+驻留记忆T细胞在淋巴转移中的关键调控作用 | 样本量较小(仅6例患者),缺乏外部验证队列,且仅基于转录组数据 | 探究甲状腺乳头状癌中淋巴转移的细胞分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例PTC患者的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 904 | 2025-12-08 |
Single-cell transcriptomics reveals stepwise transformation of epithelial cells into Non-Professional Phagocytes
2025-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011953
PMID:41343490
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了果蝇卵巢上皮细胞分化为非专业吞噬细胞的逐步转化过程 | 通过Notch信号激活模型,结合单细胞RNA测序和轨迹分析,首次定义了NPP成熟的三个转录阶段,并鉴定了JNK-Jra-Arp2/3轴作为细胞骨架重塑的关键调控通路 | 研究基于果蝇模型,其机制在哺乳动物中的保守性尚未验证,且功能实验主要聚焦于JNK通路,其他潜在调控因子可能未被全面探索 | 探究上皮细胞向非专业吞噬细胞分化的遗传调控机制 | 果蝇卵巢上皮细胞(卵泡细胞) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,轨迹分析,SCENIC分析,ChIP-seq,免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据,染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 905 | 2025-12-08 |
ZBTB16 promotes the transcription of glycolytic enzyme PFKFB2 to participate in fibrogenesis in septic lung injury
2025-Dec, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.10.007
PMID:41166797
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子ZBTB16在脓毒症肺损伤纤维化中的作用,通过单细胞测序和基因集富集分析发现ZBTB16通过促进糖酵解酶PFKFB2的转录参与纤维化过程 | 首次揭示ZBTB16通过调控PFKFB2介导的糖酵解途径参与脓毒症肺损伤纤维化的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,缺乏临床样本验证,且具体信号通路细节需进一步探索 | 探究ZBTB16在脓毒症肺损伤纤维化中的功能及其分子机制 | LPS诱导的ALI小鼠模型、MRC-5细胞和原代成纤维细胞 | 单细胞测序 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序,基因集富集分析(GSEA) | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,涉及小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 906 | 2025-12-07 |
Microglial Prrc2a regulates microglia-neuron interaction in cerebellum and motor functions in mice
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113949
PMID:41341849
|
研究论文 | 本研究探讨了转录后调节因子Prrc2a在小脑小胶质细胞中的功能,及其对小胶质细胞-神经元相互作用和小鼠运动功能的调控机制 | 首次在小脑特异性小胶质细胞条件性敲除模型中揭示Prrc2a通过调控转录组稳定性影响小胶质细胞活化状态,进而调节浦肯野细胞形态与电生理活动 | 研究局限于小鼠模型,未在人类组织或临床样本中验证;机制研究主要基于转录组层面,缺乏蛋白质水平验证 | 探究小胶质细胞特异性转录后调节因子Prrc2a在小脑发育与功能中的作用机制 | 小脑小胶质细胞、浦肯野细胞、小鼠运动功能 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、电生理记录 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、形态学数据、电生理数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 907 | 2025-12-07 |
Unraveling tumor associated macrophage biology in gynecological cancers for targeted therapy in the single cell omics era
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113924
PMID:41341850
|
综述 | 本文总结了单细胞组学时代下,针对妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的生物学特性及其作为靶向治疗新策略的最新证据 | 系统性地整合了单细胞RNA测序技术揭示的TAM亚群异质性、表型可塑性及其在肿瘤进展和耐药中的特定作用,并评估了靶向特定TAM亚型的转化策略 | 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结和评述,未提供新的原始实验数据或验证 | 旨在阐明妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞的生物学特性,探索其作为改善临床疗效的靶向治疗新途径 | 妇科癌症(如卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌等)及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 908 | 2025-12-07 |
Drosophila and mouse intestinal stem cells are spatiotemporally specified by Notch suppression and Wnt activation
2025-Dec-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7272
PMID:41337595
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研究论文 | 本研究通过果蝇和小鼠模型,揭示了肠道干细胞在发育过程中通过Notch抑制和Wnt激活的时空协调机制进行特化的保守过程 | 首次在果蝇蛹期肠道中精确量化了ISC特化的时间窗口和细胞数量,并证明了Notch抑制与Wnt激活的空间协同作用在昆虫到哺乳动物中的保守性 | 研究主要基于果蝇和小鼠的胚胎/发育阶段,成年肠道稳态中的机制可能有所不同,且单细胞测序样本量相对有限 | 探究肠道干细胞在发育过程中的特化机制及其信号通路调控 | 果蝇蛹期中肠和小鼠胚胎肠道中的肠道干细胞及前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序、遗传学实验、细胞计数与追踪 | NA | 单细胞基因表达数据、显微图像数据 | 约6000个果蝇肠道上皮细胞(其中约150个ISC) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 909 | 2025-12-07 |
Molecular basis for de novo thymus regeneration in a vertebrate, the axolotl
2025-Dec-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adw9903
PMID:41348861
|
研究论文 | 本研究揭示了脊椎动物蝾螈能够实现胸腺的从头再生,并探讨了其分子机制 | 首次在脊椎动物中展示了胸腺的从头再生能力,并识别了midkine信号作为早期驱动因子,而FOXN1在再生启动中非必需 | 研究主要基于蝾螈模型,其发现向哺乳动物临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究脊椎动物胸腺再生的分子基础,以指导未来促进胸腺再生的临床策略 | 蝾螈(axolotl)的胸腺组织 | 发育生物学与再生医学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组学、遗传学方法、移植实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 910 | 2025-12-07 |
Clonal differentiation of plasmablasts undergoing oral immunotherapy in patients with milk allergy
2025-Dec-04, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.10.006
PMID:41350126
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析,描述了牛奶过敏患者在接受口服免疫疗法期间浆母细胞的克隆分化特征 | 首次通过单细胞转录组学和B细胞免疫受体分析,结合重组抗体谱分析,揭示了浆母细胞在口服免疫疗法中的克隆扩增、IgD克隆识别过敏原以及超过80%匹配CDR克隆的发现 | 研究仅基于2名患者的小样本,限制了结果的普遍性和统计效力 | 旨在表征接受口服免疫疗法的牛奶过敏患者中浆母细胞的谱系特征 | 牛奶过敏患者在接受口服免疫疗法期间的浆母细胞 | 免疫学 | 过敏性疾病 | 单细胞转录组学分析、B细胞免疫受体分析、重组抗体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、免疫受体序列数据 | 2名牛奶过敏患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 911 | 2025-12-07 |
Treg-microglia partnership in the injured spinal cord preserves Treg cell function and regulates microglial cholesterol metabolism
2025-Dec-03, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.09.001
PMID:41027425
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研究论文 | 本研究揭示了在脊髓损伤中,调节性T细胞(Treg细胞)与微胶质细胞之间的相互作用机制,特别是Treg细胞如何通过调节微胶质细胞的胆固醇代谢来发挥神经保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序等技术,明确了胸腺来源的Treg细胞在脊髓损伤后的时空动态、克隆性及其通过MHC II依赖的机制与微胶质细胞形成伙伴关系,从而调节胆固醇代谢和炎症反应 | 研究主要基于动物模型,人类脊髓损伤中的Treg-微胶质细胞相互作用机制尚需进一步验证;单细胞测序样本量可能有限,需扩大以增强统计效力 | 探究脊髓损伤中Treg细胞的动态、功能及其与微胶质细胞的相互作用机制,为开发基于Treg细胞的治疗策略提供理论基础 | 脊髓损伤模型中的Treg细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | RNA序列数据,图像数据 | 未明确指定样本数量,但涉及脊髓损伤模型的细胞分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 912 | 2025-12-07 |
Neutrophil Extracellular Traps (NETs) in health and disease
2025-Dec-03, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00337-9
PMID:41335221
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综述 | 本文综述了中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)在健康和疾病中的作用,包括其形成机制、生理功能、病理关联及治疗策略 | 整合了NETs在多种疾病中的最新研究进展,并探讨了基于NETs的靶向治疗策略 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行总结 | 探讨NETs在免疫、炎症和组织重塑中的动态调节作用及其在疾病发病机制中的角色 | 中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)及其在健康和疾病状态下的生物学功能 | NA | 自身免疫性疾病,心血管疾病,癌症,感染性疾病,炎症相关疾病 | 成像技术,蛋白质组学,单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 913 | 2025-12-07 |
LOSTdb: a manually curated multi-omics database for lung cancer research
2025-Dec-03, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06319-6
PMID:41339793
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研究论文 | 开发了一个名为LOSTdb的手动整理的多组学数据库,用于肺癌研究 | 首次系统性地整合了肺癌的多组学数据,并提供了分子亚型注释系统、交叉搜索功能和多种分析工具 | NA | 为肺癌精准医学研究提供一个综合性的多组学数据资源和分析平台 | 肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk RNA-seq, 基因组学, 蛋白质组学, 甲基化测序, scRNA-seq | NA | 多组学数据 | 34,393个样本(包括高质量临床标本、小鼠模型和细胞系)及超过120万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 基因组学, 蛋白质组学, 甲基化测序 | NA | NA |
| 914 | 2025-12-07 |
Next-generation immune profiling - beyond blood cancer cells
2025-Dec, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2025.06.004
PMID:40645853
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评论 | 本文讨论了下一代免疫分析技术在血液恶性肿瘤中的应用,强调超越癌细胞特征,整合免疫环境以改善疾病分类和精准免疫治疗 | 提出将免疫环境纳入血液恶性肿瘤诊断分类,并倡导利用单细胞测序等新技术标准化免疫亚型定义,以弥补现有WHO/ICC 2022分类的不足 | 未提及具体实施这些技术的临床验证数据或样本规模,可能缺乏实证支持 | 旨在推动下一代免疫分析技术整合到临床工作流中,以提升血液恶性肿瘤的诊断准确性和个体化治疗潜力 | 血液恶性肿瘤及其非恶性免疫环境 | 数字病理学 | 血液癌症 | 单细胞测序、空间转录组学、高级细胞计数法 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 915 | 2025-12-07 |
Benchmarking Ploidy Estimation Methods for Bulk and Single-Cell Whole Genome Sequencing
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507839
PMID:40916931
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研究论文 | 本研究对用于批量及单细胞全基因组测序数据的倍性估计方法进行了系统性基准测试与性能比较 | 首次系统性地比较了11种批量WGS和8种单细胞WGS倍性估计方法的性能,并评估了多种实验条件对工具表现的影响 | 现有工具在整倍体样本或长读长测序数据上表现均不佳 | 评估和比较不同计算工具在估计细胞倍性方面的性能,为相关研究提供方法学指导 | 批量与单细胞全基因组测序数据 | 生物信息学 | 肿瘤 | 全基因组测序 | NA | 基因组测序数据 | 基于实验和模拟数据集(二倍体细胞与异倍体或多倍体细胞的混合物) | NA | 批量全基因组测序, 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 916 | 2025-12-07 |
Neural basis for parental behavioral transitions in mice
2025-Dec, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.103113
PMID:40972155
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综述 | 本文综述了小鼠中亲代行为转变的神经基础,重点探讨了激素与特定脑区细胞类型相互作用驱动亲代行为的机制 | 整合了单细胞转录组学和细胞类型特异性基因操作的最新进展,阐明了激素如何与特定脑细胞类型相互作用以驱动亲代行为相关脑区的结构和生理可塑性,并探讨了亲代行为作为研究自然动机行为学习模型的潜力 | 本文是一篇综述,不包含原始实验数据,主要基于已有研究进行总结和讨论 | 探讨哺乳动物亲代行为转变的神经和激素机制 | 小鼠(主要研究模型),涉及雌性和雄性的亲代行为 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学,细胞类型特异性基因操作 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 917 | 2025-12-07 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals ITGA2-Mediated Metabolic Reprogramming and Immune Crosstalk in Pediatric Thyroid Carcinogenesis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504088
PMID:40985182
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示ITGA2介导的代谢重编程和免疫互作在儿童甲状腺癌发生中的作用 | 识别出ITGA2-PTC细胞亚群,并阐明其通过增强糖酵解通量和诱导M2巨噬细胞极化双重致癌通路驱动儿童甲状腺癌的机制 | 样本量相对较小(4例PPTC和9例APTC),可能限制结果的普适性 | 探究儿童甲状腺癌特异性分子机制,以推动精准诊断和靶向治疗发展 | 儿童和成人甲状腺癌临床样本及器官模型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学 | 器官模型 | 转录组数据,图像数据 | 90234个细胞转录组,来自4例PPTC和9例APTC临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 918 | 2025-12-07 |
Single-Cell Immune Profiling Reveals Neutrophils Promote Myasthenia Gravis Exacerbation Through BAFF Secretion
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509260
PMID:40995750
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序、动物模型和临床队列分析,揭示了中性粒细胞通过分泌BAFF促进重症肌无力急性加重的机制 | 首次在单细胞水平上揭示了中性粒细胞-BAFF-浆细胞轴在重症肌无力急性加重中的关键作用,并发现IFN-γ信号通路是驱动该过程的核心 | 研究主要基于急性加重期样本,对疾病稳定期或其他自身免疫病的普适性有待验证 | 探究中性粒细胞在重症肌无力急性加重中的具体功能和分子机制 | 重症肌无力患者的骨髓和外周血样本、实验性自身免疫性重症肌无力小鼠模型、临床患者队列 | 单细胞组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及患者骨髓/外周血、EAMG小鼠模型及临床队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 919 | 2025-12-07 |
Identification of novel differentiation trajectories and gene network associations with ectopic pregnancy in fallopian tube epithelium
2025-Dec-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf200
PMID:41183511
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据的网络建模,揭示了输卵管上皮细胞的新型分化轨迹及其与子宫内膜的功能差异,并识别了与异位妊娠相关的候选基因 | 发现了一种新型的OVGP1+上皮祖细胞群体,并绘制了其向成熟分泌或纤毛细胞的双向分化轨迹;通过因果网络建模揭示了输卵管与子宫内膜分泌细胞之间的功能差异,并识别了与异位妊娠相关的基因网络 | 先前研究中育龄妇女的样本量有限,且未进行候选基因的体外或体内验证 | 识别输卵管上皮细胞的发育轨迹,并揭示其与子宫内膜的功能差异,以探究异位妊娠的分子机制 | 输卵管和子宫内膜的上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 异位妊娠 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RNA速度分析,表达数量性状位点(eQTL)映射,超图建模 | 超图模型 | 单细胞转录组数据 | 13名女性的输卵管scRNA-seq样本(来自三项先前研究)和13名女性的子宫内膜scRNA-seq样本(来自一项研究) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 920 | 2025-12-07 |
APOE4 to APOE2 allelic switching in mice improves Alzheimer's disease-related metabolic signatures, neuropathology and cognition
2025-Dec, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02094-y
PMID:41219507
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研究论文 | 本研究开发了一种可诱导的APOE等位基因转换小鼠模型,探究了从APOE4转换为APOE2对阿尔茨海默病相关代谢特征、神经病理学和认知功能的改善作用 | 首次开发了可诱导的APOE4到APOE2等位基因转换小鼠模型,并证明短期转换能广泛影响大脑转录组和脂质组,星形胶质细胞特异性APOE替换可能成为未来基因编辑治疗AD的可行策略 | 研究基于小鼠模型,与人类AD病理可能存在差异;基因转换的长期效果和安全性仍需进一步验证 | 探究APOE等位基因转换对阿尔茨海默病病理和认知功能的影响 | APOE4s2基因转换小鼠模型,以及其与5xFAD背景的杂交小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 基因敲入模型、单细胞转录组测序、蛋白质组学分析、脂质组学分析 | 基因编辑小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据、脂质组数据、单细胞转录组数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |