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当前共找到 1157 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2025-12-10 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013692
PMID:41325434
|
研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto，一种用于长读长测序数据的转录本定量方法，旨在解决转录异构体准确量化的问题 | 开发了lr-kallisto，将kallisto方法适配于长读长技术，并证明外显子捕获能提高定量准确性 | 未明确提及具体样本量或实验验证范围，可能受限于长读长数据特性和遗传变异复杂性 | 实现长读长测序数据中转录异构体的快速准确定量 | RNA转录本，特别是全长转录异构体 | 自然语言处理 | NA | ONT长读长测序，外显子捕获 | kallisto适配模型 | 长读长RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长RNA测序 | ONT平台 | Oxford Nanopore长读长测序技术，结合外显子捕获 |
| 882 | 2025-12-09 |
CD33 drives cutaneous melanoma: mendelian randomization confirms causality, multi-omics and in vitro experiments reveal M2 macrophage polarization-mediated progression
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004100
PMID:41346267
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、多组学分析和体外实验，揭示了CD33通过促进M2巨噬细胞极化驱动皮肤黑色素瘤发展的因果机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、多组学转录组分析和体外实验验证，系统证实了CD33与皮肤黑色素瘤之间的因果关系，并阐明了其通过M2巨噬细胞极化介导肿瘤进展的具体机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据和体外实验，缺乏体内模型或临床样本的直接验证，且对CD33调控M2极化的具体信号通路尚未完全阐明 | 探索皮肤黑色素瘤的新型治疗靶点并阐明其作用机制 | 皮肤黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是巨噬细胞/树突状细胞） | 生物信息学与计算生物学 | 皮肤黑色素瘤 | 孟德尔随机化、基于汇总数据的孟德尔随机化、共定位分析、批量转录组测序、单细胞转录组测序、体外细胞实验 | NA | 基因组关联研究汇总数据、蛋白质数量性状位点数据、批量转录组数据、单细胞转录组数据 | FinnGen队列（皮肤黑色素瘤：3194病例/314193对照；原位黑色素瘤：980病例/313899对照；葡萄膜黑色素瘤：293病例/345118对照）、731个免疫细胞特征（N=3757）、TCGA/GTEx/GENT2数据库转录组数据、GEO单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 883 | 2025-12-09 |
[Novel progress in exploring drug resistance mechanisms of breast cancer by single-cell sequencing technology]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 884 | 2025-12-09 |
[Fibroblast heterogeneity and functional roles in interstitial lung diseases: insights from histopathology and single-cell transcriptomics analyses]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 885 | 2025-12-09 |
Glioblastoma-associated fibroblasts enhance vascular stiffness and confer to poor prognosis
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004114
PMID:41355159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，在胶质母细胞瘤中鉴定出一种独特的COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并揭示了其通过COL6A3-ITGA1信号通路导致血管功能障碍和缺氧，从而促进肿瘤进展的机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并阐明其通过介导内皮细胞硬度增加来驱动血管功能障碍和缺氧的新机制 | 未明确说明样本量大小及具体来源，且GAFs来源于髓系细胞的机制仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤中癌症相关成纤维细胞的功能及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤组织、COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞、血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学分析、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 886 | 2025-12-09 |
MicroRNA-mediated neuronal detargeting alters astrocyte cell fate conversion trajectories in vivo
2025-Dec-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09169-3
PMID:41350397
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研究论文 | 本研究通过在GFAP微型启动子驱动的转录盒中引入microRNA-124靶序列，优化了体内星形胶质细胞向神经元重编程的特异性，并揭示了不同转录因子组合对细胞命运转换轨迹的调控作用 | 首次将microRNA-124靶序列整合到星形胶质细胞重编程系统中，有效避免了内源性神经元的脱靶转染，并通过单细胞转录组学揭示了重编程过程中细胞命运分叉的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证；对长期重编程细胞的稳定性和功能整合评估有限 | 优化体内星形胶质细胞向神经元重编程的特异性，并探究细胞命运转换的分子机制 | 小鼠星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、假时间轨迹分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及谱系追踪和单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 887 | 2025-12-09 |
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-Dec-05, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01901-9
PMID:41350740
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学孟德尔随机化分析，识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 克服了先前研究表型覆盖窄、多组学验证不足和机制探索不充分的限制，通过全面MR分析识别稳健治疗靶点 | NA | 识别阿尔茨海默病的遗传药物靶点 | 阿尔茨海默病及相关生物标志物、神经影像内表型、认知特征和风险因素 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组, 蛋白质组, 转录组 | 超过50个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 888 | 2025-12-09 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Dec-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.108331
PMID:41342897
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠视网膜前体细胞中的Ptbp1基因，评估其在发育性神经发生中的作用，发现Ptbp1对视网膜细胞命运决定并非必需 | 首次在体内条件下系统评估Ptbp1在视网膜神经发生中的功能，挑战了Ptbp1作为神经发生核心抑制因子的传统观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育，未在其他神经系统或成年神经发生中验证Ptbp1的功能 | 探究RNA结合蛋白Ptbp1在发育性神经发生中的具体作用机制 | 小鼠视网膜前体细胞和Müller胶质细胞 | 发育神经生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、剪接模式数据 | 突变型小鼠视网膜组织（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 889 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Molecular Mechanisms of Neutrophil Dysfunction in Chronic Bone Infection
2025-Dec-04, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了慢性骨感染中中性粒细胞功能障碍的分子机制 | 首次在MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中，通过单细胞RNA测序识别出7个中性粒细胞亚群，并发现NeuP2ry10亚群变化最显著，揭示了中性粒细胞向N2抗炎表型极化的分子特征 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性有待验证；单细胞测序样本量可能有限 | 探究慢性骨感染中中性粒细胞功能异常的分子机制 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型中的骨髓细胞 | 单细胞组学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序，基因本体论分析，通路富集分析，免疫荧光染色，活性氧定量 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | MRSA诱导的慢性骨感染大鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 890 | 2025-12-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals a putative lncRNA-associated ceRNA network in high-grade serous ovarian cancer
2025-Dec, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01691-2
PMID:41099994
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高级别浆液性卵巢癌中一个由长链非编码RNA MIR100HG、微小RNA mir-224-5p和EYA4基因组成的竞争性内源RNA网络，该网络可能通过调控Wnt信号通路促进肿瘤进展 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别出癌细胞特异性的竞争性内源RNA网络，并揭示了MIR100HG可能作为mir-224-5p的分子海绵调控EYA4表达的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和公共数据库验证，缺乏直接的实验功能验证来证实ceRNA网络的具体调控机制 | 识别高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中活跃的长链非编码RNA相关竞争性内源RNA网络 | 高级别浆液性卵巢癌的癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了单细胞RNA测序和批量RNA测序数据集，并利用癌症基因组图谱数据进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 891 | 2025-12-09 |
Spatial Transcriptomics of Patients With Kaposi Sarcoma Identifies Mechanisms of Immune Evasion
2025-Dec, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70728
PMID:41342328
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析卡波西肉瘤（KS）皮肤病变，以识别KSHV感染的细胞类型和免疫相互作用 | 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序参考数据集结合，对KS病变进行空间解析的细胞类型反卷积分析，并同时检测人类和KSHV基因表达 | 样本量较小（7个KS肿瘤和6个正常皮肤样本），且仅针对皮肤病变进行分析 | 阐明KSHV感染如何重塑皮肤组织、抑制免疫反应并导致抗癌治疗耐药的潜在机制 | 卡波西肉瘤（KS）患者的皮肤肿瘤组织 | 空间转录组学 | 卡波西肉瘤 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 空间解析的细胞类型反卷积方法 | 空间基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 7个KS皮肤肿瘤样本，6个正常皮肤样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 892 | 2025-12-08 |
Regenerative teeth induced by in vitro mesenchymal cells in mice via repressing BMP4 and activating retinoic acid/osteopontin
2025-Dec-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00271-9
PMID:41345270
|
研究论文 | 本研究开发了一种优化的N2B27培养基，成功在小鼠中通过抑制BMP4和激活视黄酸/骨桥蛋白，诱导了体外培养的牙间充质细胞再生牙齿 | 开发了能维持牙间充质细胞成牙潜能长达14天的优化培养基，显著优于传统方法（≤24小时），并揭示了BMP4抑制和骨桥蛋白/视黄酸激活在牙齿再生中的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证，且培养基的长期效果和安全性需进一步评估 | 研究牙齿再生中牙间充质细胞的体外培养和功能维持，以推进组织工程应用 | 小鼠牙间充质细胞（mDMCs） | 组织工程与再生医学 | 牙齿疾病或缺失 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 893 | 2025-12-08 |
Reversing lysosomal dysfunction restores youthful state in aged hematopoietic stem cells
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.012
PMID:41289991
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研究论文 | 本研究揭示了溶酶体功能障碍是造血干细胞衰老的关键驱动因素，并通过抑制溶酶体过度活化来恢复其年轻状态 | 首次发现衰老造血干细胞中溶酶体过度酸化、耗竭和异常激活，并证明通过v-ATPase抑制剂干预可逆转这些变化，显著提升干细胞再生能力 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行验证，长期安全性和临床转化效果需进一步评估 | 探究溶酶体在造血干细胞衰老中的作用机制，并寻找恢复其功能的干预策略 | 衰老的造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组学、功能分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 894 | 2025-12-08 |
Human peripheral osteoclast-precursor-development patterns reveal the significance of RPS17-dependent ribosome synthesis to Ankylosing Spondylitis lesions
2025-Dec-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00474-5
PMID:41345114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了强直性脊柱炎（AS）患者外周血中破骨细胞前体（OCP）发育模式的改变，并发现RPS17依赖性核糖体合成在AS病变中的关键作用 | 首次在AS患者外周血单核细胞中系统描绘了OCP发育轨迹，并识别出RPS17依赖性核糖体合成作为AS病变的核心机制，同时提出RPS17过表达的单核性OCP具有治疗潜力 | 研究样本量有限，且主要基于外周血分析，未深入探讨局部关节微环境的影响 | 阐明AS条件下破骨细胞前体发育模式的变化及其在AS病变中的作用 | 健康供体和AS患者（早期、加重期和缓解期）的外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据 | 健康供体和AS患者（早期、加重期和缓解期）的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 895 | 2025-12-08 |
LIMD2 is associated with an exhausted CD8⁺ T cell state linked to ICI response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27315-z
PMID:41345477
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，发现LIMD2高表达的CD8⁺ T细胞与肾透明细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的反应相关 | 首次将LIMD2鉴定为与CD8⁺ T细胞耗竭状态及免疫治疗反应相关的候选预测生物标志物 | 研究主要基于回顾性队列和公开数据集，需要前瞻性临床验证 | 阐明肾透明细胞癌中CD8⁺ T细胞功能状态与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 肾透明细胞癌患者肿瘤浸润CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 整合六个公开数据集及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 896 | 2025-12-08 |
Multi-omics integrated analysis identifies causal risk factors and therapeutic targets for diabetic retinopathy
2025-Dec-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07353-x
PMID:41340073
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，系统识别了糖尿病视网膜病变的因果风险因素和治疗靶点 | 首次通过双样本孟德尔随机化、共定位/SMR、NHANES数据、转录组学和机器学习等多方法整合，系统识别DR的因果基因、风险因素和核心调控靶点 | 研究主要基于观察性数据和遗传学证据，需要进一步实验验证靶点的功能机制 | 探索糖尿病视网膜病变的风险因素、致病机制和潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者及其亚型（背景性DR、增殖性DR） | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 孟德尔随机化、共定位分析、SMR、转录组学、单细胞转录组学、机器学习 | 逻辑回归、限制性立方样条、机器学习模型、列线图 | 遗传数据、蛋白质数据、转录组数据、临床调查数据 | NHANES 1999-2010横断面数据，涉及16,989个基因和2,923个蛋白质 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 897 | 2025-12-08 |
Pan-cancer gene set discovery via scRNA-seq for optimal deep learning based downstream tasks
2025-Dec-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27296-z
PMID:41330999
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研究论文 | 本研究提出了一种通过整合单细胞RNA测序数据和先进分析技术，为癌症基因组学下游任务进行特征选择的稳健方法 | 首次提出利用单细胞RNA测序数据推导的基因集在泛癌研究中优于基于批量RNA测序选择的基因集，并整合hdWGCNA和XGBoost进行特征选择 | 研究仅分析了13种癌症类型的181个肿瘤活检样本，样本量和癌症类型覆盖范围可能有限 | 开发优化的基因集选择方法以提高泛癌下游任务的预测准确性 | 13种癌症类型的肿瘤活检样本及TCGA泛癌RNA测序数据 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 多层感知机，图神经网络，XGBoost | 转录组数据 | 181个肿瘤活检样本（来自13种癌症类型） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 898 | 2025-12-08 |
Deciphering the liver's role in pancreatic cancer metastasis: pathways and therapeutic approaches
2025-Dec-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01202-2
PMID:41331510
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌肝转移的机制，重点关注肝脏作为转移前微环境的形成过程及其分子通路 | 结合空间组织学图谱、单细胞测序等前沿技术，重新审视并批判性评估了Paget的‘种子与土壤’假说在肝转移微环境研究中的适用性 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行分析，未提出新的原始实验数据或临床验证 | 深入理解胰腺导管腺癌肝转移的生物学机制，为开发靶向治疗和改善临床预后提供理论基础 | 胰腺导管腺癌（PDAC）及其肝转移病灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间组织学图谱、单细胞测序、分子标记物鉴定 | NA | 组织切片、测序数据、分子标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 899 | 2025-12-08 |
Abatacept restores dysregulated transcriptomic and proteomic profile in disorders of CTLA-4 insufficiency
2025-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.08.027
PMID:40967277
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究了阿巴西普治疗对LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者免疫系统的影响 | 首次采用整合纵向流式细胞术、靶向及单细胞转录组学与血浆蛋白质组学的多模态方法，揭示了阿巴西普治疗逆转免疫失调的新机制 | 研究样本可能较小，且为罕见疾病，结果推广需谨慎 | 探究阿巴西普在LRBA缺陷和CTLA-4功能不全疾病中的免疫调节作用 | LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者 | 生物信息学 | 原发性免疫失调疾病 | 纵向流式细胞术、靶向转录组学、单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 900 | 2025-12-08 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-Dec, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞RNA测序数据，结合机器学习方法，在小鼠模型中系统分析了辐射诱导肺损伤的氧化应激特征，并筛选出关键生物标志物 | 首次整合bulk RNA和单细胞RNA测序数据，结合随机森林和SVM机器学习算法构建诊断模型，识别出5个与辐射诱导肺损伤相关的关键基因及其信号通路 | 研究基于小鼠模型，结果在人类临床中的适用性需要进一步验证 | 为辐射诱导肺损伤的早期诊断和靶向干预提供理论依据 | 小鼠辐射诱导肺损伤模型 | 机器学习 | 肺损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-PCR, IHC | 随机森林, SVM | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |