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当前共找到 1109 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2025-12-13 |
Clonal cell states link gastroesophageal junction tissues with metaplasia and cancer
2025-Dec-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66302-w
PMID:41360789
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研究论文 | 本研究通过单细胞谱系追踪和转录组分析，揭示了Barrett食管与食管腺癌前病变的细胞状态和谱系连接 | 意外发现食管鳞状上皮、胃贲门和组织交界处过渡基底细胞之间的谱系联系，并识别了Barrett食管与食管和胃组织的谱系连接 | 未明确提及研究局限性 | 解析Barrett食管起源、维持和进展过程中的细胞状态和谱系连接 | 从化生和健康组织中分离的患者细胞 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞谱系追踪，转录组分析，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 842 | 2025-12-13 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals therapeutic mechanisms of adipose-derived stem cell exosomes in sepsis-induced lung injury
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002894
PMID:40607951
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了脂肪来源干细胞外泌体在脓毒症诱导的肺损伤中的治疗机制 | 首次利用单细胞RNA测序技术全面解析ADSC外泌体治疗脓毒症肺损伤的细胞类型特异性转录组变化和细胞间通讯网络 | 样本量较小（单细胞RNA测序每组仅2个样本），且仅使用雄性小鼠模型，可能限制结果的普适性 | 研究脂肪来源干细胞外泌体对脓毒症诱导的肺损伤的治疗效果及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠（8-10周龄）的脓毒症模型 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 每组2个样本进行单细胞RNA测序，每组5个样本进行肺组织病理学评估，每组12个样本进行生存率分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 843 | 2025-12-13 |
Comprehensive in silico analyses of keratin heterodimerisation
2025-Dec, European journal of cell biology
IF:4.5Q2
DOI:10.1016/j.ejcb.2025.151513
PMID:40912191
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研究论文 | 本文通过整合AlphaFold Multimer建模、VoroIF-GNN相互作用界面质量评估、相互作用能计算及与实验解析结构的比较，系统研究了角蛋白异二聚化，并提供了分析中间丝组装的指南 | 开发了一个高通量计算流程，结合多种计算方法系统研究角蛋白异二聚化，揭示了异二聚体比同二聚体具有更低的相互作用能和更稳定的结构配置，并强调了coil 1区域对二聚体稳定性的重要性 | 研究主要基于计算模拟，虽然通过vimentin同二聚体验证了准确性，但角蛋白异二聚化的实验验证可能有限，且依赖于现有空间转录组学数据的分析 | 系统研究角蛋白异二聚化的配对偏好和分子基础，为中间丝组装提供分析指南 | 角蛋白异二聚体，包括不同类型的角蛋白对，以及作为参考的vimentin同二聚体 | 计算生物学 | NA | AlphaFold Multimer建模、VoroIF-GNN相互作用界面质量评估、相互作用能计算、结构比较、空间转录组学数据分析 | AlphaFold Multimer、VoroIF-GNN | 蛋白质结构数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 844 | 2025-12-13 |
Androgen receptor interacts with c-Myc to regulate macrophage-osteoclast axis and drive bone metastasis in triple negative breast cancer
2025-Dec, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03202-2
PMID:41039017
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研究论文 | 本研究揭示了雄激素受体（AR）与c-Myc相互作用，通过调控巨噬细胞-破骨细胞轴来驱动三阴性乳腺癌（TNBC）骨转移的机制 | 首次发现AR与c-Myc相互作用调控巨噬细胞向破骨细胞分化，阐明了LAR亚型TNBC骨转移倾向性的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证有限，且未探讨其他潜在信号通路的影响 | 探究三阴性乳腺癌（TNBC）骨转移的器官趋向性及其调控机制 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞、小鼠模型、巨噬细胞、破骨细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、免疫共沉淀（CoIP）、CUT&TAG测序、破骨细胞分化实验 | 小鼠模型 | 测序数据、实验数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及公共数据库回顾性分析和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、CUT&TAG | NA | NA |
| 845 | 2025-12-13 |
The joint impact of elevated homocysteine and type 2 diabetes on non-healing wounds and all-cause mortality: integrated clinical and multi-omics analyses
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003715
PMID:41186525
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研究论文 | 本研究通过整合临床数据和多组学分析，探讨了高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病对不愈合伤口及全因死亡率的联合影响及其潜在机制 | 首次系统评估了HHcy与T2D对不愈合伤口的协同作用，并利用多组学数据揭示了Hcy通过MIF-CD74/CXCR4轴重塑糖尿病足溃疡微环境的免疫代谢重编程机制 | 研究基于横断面调查数据，因果关系推断受限；单细胞测序样本量可能有限；结果外推至其他人群需谨慎 | 阐明高同型半胱氨酸血症与2型糖尿病联合作用对伤口愈合及死亡风险的影响机制 | 美国国家健康与营养调查（NHANES）的8406名参与者（1999-2004年），以及糖尿病足溃疡的转录组和单细胞测序数据 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权逻辑回归, Cox比例风险模型, 限制性立方样条, 中介分析 | 临床数据, 转录组数据, 单细胞数据 | 8406名NHANES参与者 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 846 | 2025-12-13 |
Single Cell Sequencing Identifies Distinct Cellular Alterations in Impaired Aged and Diabetic Wounds
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70217
PMID:41189300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，比较了老年和糖尿病小鼠伤口愈合过程中的细胞差异，揭示了两种条件下独特的分子机制 | 首次在单细胞水平直接比较老年和糖尿病伤口愈合，识别了蛋白酶富集状态和炎症表型等不同分子机制 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本，且样本规模有限，可能影响结果的普适性 | 探究老年和糖尿病伤口愈合受损的细胞和分子基础，以寻找更精确的治疗靶点 | 老年和糖尿病小鼠的伤口组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定，但涉及年轻、老年和糖尿病小鼠的伤口样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 847 | 2025-12-13 |
Decoding the Therapeutic Effects of Acupuncture in Hemorrhagic Stroke Using Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70689
PMID:41363028
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探索了针灸在出血性中风恢复中的治疗作用及其分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示针灸如何通过调节胶质细胞（如小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞）的基因表达，特别是通过APOE-TREM2信号轴，促进神经保护和炎症消退 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；样本量未在摘要中明确说明；机制细节需进一步验证 | 探究针灸在出血性中风恢复中的治疗机制 | 小鼠模型中的胶质细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 848 | 2025-12-13 |
Removal of unwanted variation in pseudobulk analysis of single-cell RNA sequencing data and the leveraging of pseudoreplicates
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf179
PMID:41368194
|
研究论文 | 本文评估了在单细胞RNA测序数据的伪批量分析中去除不必要变异的策略，并提出了新方法RUVIII PBPS以解决技术重复不足或阴性对照基因缺失的问题 | 引入了RUVIII PBPS新策略，可在缺乏技术重复或阴性对照基因时有效控制伪发现率，扩展了RUV方法在单细胞数据中的应用范围 | 研究主要基于模拟和特定生物信号数据，可能未覆盖所有真实世界复杂场景，且方法性能依赖于数据质量和模型假设 | 评估和优化单细胞RNA测序伪批量数据中去除不必要变异的方法，以提高差异表达分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据的伪批量分析，重点关注技术噪声和混杂因素的影响 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | RUV2, RUVIII, RUV4, RUVIII PBPS | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 849 | 2025-12-13 |
Comment on "Bidirectional Mendelian randomization and single-cell sequencing reveal T cell-mediated causal links between COPD and lung adenocarcinoma"
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003223
PMID:40839102
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 850 | 2025-12-13 |
Spatial mapping of rheumatoid arthritis synovial niches reveals a LYVE1+ macrophage network associated with response to therapy
2025-Dec, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.07.019
PMID:40849271
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研究论文 | 本研究通过高维成像质谱流式技术，揭示了类风湿关节炎滑膜中LYVE1+巨噬细胞网络在治疗响应中的关键作用 | 首次在空间和动态层面绘制了类风湿关节炎滑膜对治疗响应的蓝图，并识别出LYVE1+巨噬细胞网络作为滑膜稳态的核心组件 | 研究样本量有限，且主要关注早期类风湿关节炎患者，可能无法完全代表所有患者群体 | 旨在解析类风湿关节炎治疗期间滑膜的细胞和分子变化，识别与临床缓解相关的关键细胞网络和通路 | 健康对照、骨关节炎患者及早期类风湿关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 成像质谱流式技术、全组织RNA测序、免疫荧光、配体-受体分析、单细胞RNA测序、体外共培养实验 | NA | 图像、文本 | 包括健康对照、骨关节炎患者及早期类风湿关节炎患者的滑膜组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 851 | 2025-12-13 |
The regulatory role and mechanism of TGFBI on Tregs in the immune microenvironment of clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003225
PMID:40865943
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研究论文 | 本研究阐明了TGFBI通过上调CCL22分泌招募Tregs，从而促进透明细胞肾细胞癌免疫抑制微环境的机制 | 首次在ccRCC中揭示了TGFBI通过CCL22轴调控Tregs介导的免疫抑制的具体机制，并提出了靶向该轴作为增强免疫治疗疗效的新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证相对有限，且TGFBI-CCL22轴在其他肿瘤类型中的普适性未探讨 | 阐明TGFBI在ccRCC免疫微环境中调控Tregs的机制及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的肿瘤微环境，特别是Tregs和TGFBI蛋白 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序，Western blotting，流式细胞术，ELISA，CCL22中和抗体实验 | BALB/c小鼠模型，TGFBI敲低（RENCA）和过表达（A498）细胞系 | 基因表达数据，单细胞测序数据，体外实验数据，体内实验数据 | TCGA数据集，单细胞测序数据，细胞系（RENCA, A498），BALB/c小鼠模型，临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 852 | 2025-12-13 |
Healthy human enthesis stromal cells mediate immunoregulation via the CD39/CD73 adenosine ectonucleotidase pathway
2025-Dec, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.001
PMID:41058388
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能分析，揭示了健康人类附着点基质细胞通过CD39/CD73腺苷外核苷酸酶途径介导免疫调节的机制 | 首次在人类附着点组织中识别出基质细胞通过CD39/CD73腺苷途径进行免疫调节，并比较了其与肠道Treg依赖机制的差异 | 研究样本量有限（27,348个细胞），且主要基于体外共培养实验，体内验证不足 | 探究附着点组织的免疫稳态机制及其在脊柱关节病中的作用 | 健康人类附着点组织细胞、肠道组织数据集、活化T细胞 | 单细胞转录组学 | 脊柱关节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 27,348个附着点细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 853 | 2025-12-13 |
A multi-omics pipeline integrating machine learning and spatial-cellular analysis identifies SASH1 as a prognostic biomarker and therapeutic target in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Dec-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003647
PMID:41099090
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、机器学习算法和空间细胞分析，识别出SASH1作为头颈部鳞状细胞癌的预后生物标志物和治疗靶点 | 整合了多平台转录组学、多种机器学习算法以及单细胞和空间转录组学数据，系统性地识别并验证了SASH1作为HNSCC的新型生物标志物，并揭示了其空间分布特征 | 研究主要基于公共数据库和细胞系数据，缺乏大规模临床样本的独立验证 | 识别和验证头颈部鳞状细胞癌的关键驱动基因，以发现可靠的分子生物标志物用于改善临床管理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 转录组学分析，单细胞RNA-seq，空间转录组学，Western blot | LASSO, SVM-RFE, XGBoost, Boruta | 转录组数据，单细胞数据，空间转录组数据，蛋白质数据 | 多个GEO数据集（GSE29330, GSE6631, GSE138206）和TCGA-HNSC队列，以及公共单细胞（GSE215403）和空间转录组（GSE252265）数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 854 | 2025-12-13 |
Deconstruction of tophi and synovium defines SPP1+ macrophages involved in extracellular matrix remodelling in gout
2025-Dec, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.003
PMID:41107120
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研究论文 | 本研究首次提供了痛风石关节的单细胞转录组图谱，揭示了SPP1+/MMP9+/CHI3L1+巨噬细胞在痛风石形成中的关键作用 | 首次对痛风石关节进行单细胞转录组分析，识别出痛风石特有的SPP1+/MMP9+/CHI3L1+巨噬细胞亚群，并揭示了其具有免疫调节和基质重塑的双重功能 | NA | 探究痛风石形成的免疫-基质细胞相互作用机制 | 痛风患者的滑膜组织和痛风石组织 | 数字病理学 | 痛风 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 44,221个滑膜组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 855 | 2025-12-13 |
High KCNJ14 expression is associated with an immunosuppressive tumor microenvironment and advanced pathological features: An RNA in situ hybridization-based analysis of colorectal carcinoma
2025-Dec, Experimental and molecular pathology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.yexmp.2025.105005
PMID:41124752
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研究论文 | 本研究通过RNA原位杂交技术分析了结直肠癌中KCNJ14的表达，发现其高表达与免疫抑制性肿瘤微环境和晚期病理特征相关 | 首次在结直肠癌中利用RNA原位杂交技术揭示KCNJ14的高表达与免疫抑制性肿瘤微环境及晚期病理特征的关联 | KCNJ14并非独立的预后因素，且与FOXP3细胞浸润、总生存期或无复发生存期无显著关联 | 探究KCNJ14在结直肠癌中的临床意义、空间表达模式及其与肿瘤微环境和病理特征的关系 | 259例结直肠癌病例的组织芯片样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA原位杂交，单细胞RNA测序 | NA | 图像，RNA表达数据 | 259例结直肠癌病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNAscope技术用于RNA原位杂交分析 |
| 856 | 2025-12-12 |
Breaking the shields of resistance: multidimensional therapeutic strategies in the breast cancer drug resistance conundrum
2025-Dec-11, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004424
PMID:41376375
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综述 | 本文综述了乳腺癌治疗中多维度策略的临床应用与最新进展，并探讨了克服耐药性的创新方法 | 系统整合了单细胞测序、纳米技术和靶向治疗等新兴方法，以应对乳腺癌治疗中的耐药性挑战 | 作为综述文章，未提供原始实验数据或具体临床验证结果 | 总结乳腺癌治疗的临床现状与进展，探讨克服耐药性的多维度策略 | 乳腺癌及其治疗耐药性 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 857 | 2025-12-12 |
GBP1 as a machine learning-prioritized biomarker and therapeutic target for epstein-barr virus-induced clear cell renal cell carcinoma: multi-omics causal validation
2025-Dec-10, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004393
PMID:41376480
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和机器学习，揭示了EBV感染通过调节性T细胞和B细胞介导增加透明细胞肾细胞癌风险的因果机制，并确定GBP1为核心生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次将孟德尔随机化、单细胞RNA测序与机器学习模型（SHAP框架）相结合，系统性地识别并验证了EBV诱导ccRCC的因果机制和核心靶点GBP1，并通过药物预测和分子对接提出了非那雄胺作为潜在抑制剂的新治疗策略 | 研究主要基于遗传学和计算生物学证据，缺乏体内或体外实验的功能性验证；药物预测结果需要进一步的临床前和临床研究确认 | 探索EBV在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制，并识别可操作的生物标志物和治疗靶点 | EBV感染、透明细胞肾细胞癌、免疫细胞（调节性T细胞和B细胞）、候选基因（GBP1等） | 机器学习 | 肾细胞癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习, 药物预测, 分子对接 | 机器学习模型（未指定具体类型，使用SHAP框架进行解释） | 遗传数据, 单细胞RNA测序数据, 批量mRNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 858 | 2025-12-12 |
scCirclehunter delineates ecDNA-containing cells using single-cell ATAC-seq, with a focus on glioblastoma
2025-Dec-09, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00842-9
PMID:41360770
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研究论文 | 本研究介绍了scCirclehunter框架，用于从单细胞ATAC-seq数据中识别ecDNA并分配到特定细胞群，聚焦于胶质母细胞瘤 | 开发了首个从单细胞ATAC-seq数据中识别ecDNA的框架scCirclehunter，实现了患者特异性ecDNA的单细胞精度分析 | 研究主要基于现有胶质母细胞瘤数据集，可能受数据质量和样本量限制，且ecDNA与线粒体转移频率的关联仅为初步发现 | 开发单细胞精度分析ecDNA的方法，以揭示ecDNA在胶质母细胞瘤异质性中的作用 | 胶质母细胞瘤患者来源的细胞，特别是携带ecDNA的恶性细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 859 | 2025-12-12 |
Single-cell sequencing and organoids: applications in organ development and disease
2025-Dec-08, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00364-6
PMID:41359105
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综述 | 本文系统探讨了单细胞测序与类器官技术在器官发育和疾病研究中的协同应用潜力 | 整合单细胞测序与类器官技术，构建生理相关的多功能研究平台，以高分辨率解析细胞异质性和动态行为，推动从描述性研究向机制驱动、精准导向和个性化方法的转变 | NA | 探索单细胞测序与类器官技术在生物医学研究中的整合应用，以加速疾病机制阐明和精准医学、再生医学的创新突破 | 器官发育机制（如脑、肺、心脏、肝、肠、肾）以及多种疾病的体外模型（如神经退行性疾病、遗传病、传染病、代谢综合征、肿瘤） | NA | 神经退行性疾病, 遗传病, 传染病, 代谢综合征, 肿瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 860 | 2025-12-12 |
Interferon signaling pathways in health and disease
2025-Dec-08, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00381-5
PMID:41359111
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综述 | 本文全面综述了干扰素信号通路的分子机制及其在健康和疾病中的作用 | 系统整合了经典与非经典干扰素信号通路，并探讨了其在治疗策略中的双重应用及基于单细胞组学的个性化治疗前景 | NA | 概述干扰素信号通路的分子机制及其在免疫调节和疾病治疗中的临床意义 | 干扰素信号通路及其在健康与疾病状态下的功能 | NA | 自身免疫性疾病、神经炎症、心血管疾病、癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |