单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202512-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 1109 篇文献,本页显示第 801 - 820 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
801 2025-12-17
Single-cell analysis of human thymus and peripheral blood unveils the dynamics of T cell development and aging
2025-Dec, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析了人类胸腺和外周血中T细胞发育与衰老的动态过程 首次结合单细胞测序和TCR测序,揭示了胸腺衰老对T细胞谱系潜力和外周T细胞老化的影响,并建立了基于初始T细胞的免疫年龄预测模型 样本量相对有限,且研究主要基于转录组数据,功能验证不足 探究年龄相关胸腺退化的机制及其对外周T细胞的影响 人类胸腺和外周血细胞 单细胞组学 衰老相关免疫疾病 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据 387,762个细胞,来自年轻和年老个体的胸腺和外周血 NA 单细胞RNA-seq,单细胞TCR-seq NA NA
802 2025-12-16
Artificial Intelligence and Multimodality Data Integration Decipher Tertiary Lymphoid Structure Maturity in Gastric Cancer
2025-Dec-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究开发了一种基于Transformer的深度学习模型,用于从胃腺癌全切片图像中定量表征三级淋巴结构(TLS)的成熟度,并结合多组学数据揭示了成熟TLS中关键的免疫细胞相互作用 首次开发了基于Transformer的AI模型来自动化评估胃腺癌中TLS成熟度,并通过整合单细胞RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术和功能共培养实验,揭示了CD8+组织驻留记忆T细胞与B细胞通过CXCL13-CXCR5轴形成的免疫回路 样本量相对有限(单细胞RNA测序仅来自17例患者),且模型在外部验证队列中的泛化能力未明确说明 开发自动化工具以评估胃腺癌中三级淋巴结构的成熟度,并探究其与患者预后及抗肿瘤免疫机制的关系 胃腺癌患者组织样本及其相关的多模态数据 数字病理学 胃腺癌 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 功能共培养实验 Transformer 图像, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 253例胃腺癌患者(全切片图像),其中17例进行了单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
803 2025-12-16
IL-17-producing γδ T cells in the tumor microenvironment promote radioresistance in mice
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究揭示了肿瘤微环境中产生IL-17的γδ T细胞通过招募髓源性抑制细胞促进小鼠放疗抵抗的机制 首次阐明了放疗后肿瘤微环境中γδ T细胞通过产生IL-17A促进放疗抵抗的具体机制,并发现肿瘤细胞来源的微粒通过cGAS-STING/NF-κB通路调控CCL20表达的关键作用 研究基于小鼠模型,在人体中的适用性有待验证;机制研究主要集中在γδ T细胞和巨噬细胞的相互作用,其他免疫细胞的作用可能未完全涵盖 探究γδ T细胞在肿瘤放疗抵抗中的作用机制 小鼠肿瘤模型中的γδ T细胞、髓源性抑制细胞、巨噬细胞及肿瘤细胞 肿瘤免疫学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
804 2025-12-16
Distinct Cellular and Molecular Patterns in Pretreatment Peripheral Blood Are Associated with CAR T-cell Outcomes in Diffuse Large B-cell Lymphoma
2025-Dec-15, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者治疗前外周血样本和CAR T细胞产品,揭示了与临床结局相关的分子和细胞特征 首次在单细胞水平上系统关联了治疗前外周血免疫特征与CAR T细胞治疗结局,并识别了与良好反应相关的B细胞存在 样本量相对有限(57例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性验证 探究CAR T细胞治疗在弥漫性大B细胞淋巴瘤中反应和耐药的决定因素 57例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的治疗前外周血样本和抗CD19 CAR T细胞产品 单细胞组学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 57例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
805 2025-12-16
Spatially defined multicellular functional units in colorectal cancer revealed from single cell and spatial transcriptomics
2025-Dec-12, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文结合单细胞RNA测序、Slide-seq空间转录组学和原位多重RNA分析,绘制了健康和发育不良结肠细胞生态系统的详细空间图谱,并揭示了其在结直肠癌进展中的关联 通过整合单细胞和空间转录组学技术,首次在结直肠癌中定义了具有特定空间组织和功能交互的多细胞功能单元,并验证了小鼠模型与人类疾病之间的保守性 研究主要基于小鼠模型,虽然与人类数据进行了比较,但直接应用于临床仍需进一步验证 揭示结直肠癌中细胞的空间组织和功能交互,以理解疾病进展机制 健康和发育不良的结肠组织,包括诱导性遗传结直肠癌小鼠模型和人类结直肠癌样本 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原位多重RNA分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Slide-seq NA
806 2025-12-16
Integrated single-cell atlases unveil the operation principles of whole-brain 5-HT neuronal subsystems
2025-Dec-12, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞图谱揭示了全脑5-HT神经元亚系统的运作原理 开发了包含单细胞投射组学、两个独立的scRNA-seq数据集和全脑5-HT神经元功能成像数据库的资源数据集,首次在斑马鱼中系统揭示了5-HT神经元亚系统的模块化功能组织原则 研究基于斑马鱼模型,虽然为哺乳动物系统提供了见解,但直接转化到哺乳动物仍需进一步验证 阐明5-羟色胺(5-HT)神经元亚系统的运作原理及其在生理和行为调节中的复杂作用 斑马鱼全脑5-HT神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),功能成像,单细胞投射组学 NA 单细胞转录组数据,成像数据,投射组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
807 2025-12-16
A single-cell transcriptomic atlas reveals resident dendritic-like cells in the zebrafish brain parenchyma
2025-Dec-11, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了成年斑马鱼大脑中免疫细胞的复杂性,并发现了一种与哺乳动物树突状细胞相似的驻留性髓系细胞亚群 首次在非哺乳类脊椎动物(斑马鱼)大脑中发现并表征了具有树突状细胞特征的髓系细胞亚群,揭示了脊椎动物大脑免疫细胞异质性的进化保守性 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;突变体表型分析尚未完全阐明这些细胞的生理功能 探究斑马鱼大脑免疫细胞的多样性及其与哺乳动物的进化保守性 成年斑马鱼大脑中的免疫细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确说明具体样本数量,但涉及野生型和多种突变体斑马鱼 NA 单细胞RNA-seq NA NA
808 2025-12-16
Deciphering the Osteoimmune Landscape in Subtalar Arthrodesis: A Single-Cell RNA Sequencing Approach
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了距下关节融合术患者中免疫细胞动态变化与骨愈合的关系 首次应用单细胞RNA测序技术系统性解析距下关节融合术后的骨免疫景观,揭示了单核细胞和NK细胞在骨愈合中的关键作用及功能差异 样本量相对较小,仅分析了术后3个月的时间点,未涵盖更长期的愈合过程 阐明距下关节融合术后骨愈合的免疫机制,并探索免疫调节对骨修复的潜在影响 接受距下关节融合术的患者外周血单个核细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 未明确具体数量,但涉及早期愈合和延迟愈合两组患者的外周血单个核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
809 2025-12-16
Loureirin B Accelerates Diabetic Wound Healing by Promoting TGFβ/Smad-Dependent Macrophage M2 Polarization: A Concerted Analytical Approach Through Single-Cell RNA Sequencing and Experimental Verification
2025-Dec, Phytotherapy research : PTR IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证,揭示了龙血竭提取物龙血素B通过激活TGFβ/Smad信号通路促进巨噬细胞M2极化,从而加速糖尿病伤口愈合的机制 首次结合单细胞RNA测序技术与实验验证,系统阐明了龙血素B在糖尿病伤口愈合中通过TGFβ/Smad通路调控巨噬细胞极化的具体分子机制 研究主要在动物模型和体外实验中进行,尚未在人体临床试验中验证其疗效和机制 探究龙血素B促进糖尿病伤口愈合的分子机制和疗效 糖尿病伤口愈合过程中的巨噬细胞和成纤维细胞 单细胞组学 糖尿病足溃疡 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 糖尿病足溃疡组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
810 2025-12-16
Unveiling the role of the extracellular matrix in the osteosarcoma tumor microenvironment through integrated transcriptomics and experimental validation
2025-Dec, Cancer gene therapy IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合转录组学分析和实验验证,揭示了细胞外基质(ECM)在骨肉瘤肿瘤微环境中的关键作用,并确定了COL5A2基因和C0成骨细胞簇作为重要的ECM相关标志物 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,结合实验验证,系统性地揭示了COL5A2基因通过激活黏着斑通路和IGFBP3-TMEM219轴介导的细胞间通讯来驱动骨肉瘤增殖的新机制 研究主要基于公共数据库的数据和体外实验,缺乏体内动物模型的验证,并且ECM其他成分的作用有待进一步探索 阐明细胞外基质在骨肉瘤肿瘤微环境中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞外基质成分及相关细胞类型(如成骨细胞、内皮细胞) 数字病理学 骨肉瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析, Western blot, CCK-8, 集落形成实验 预后模型 转录组数据, 实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
811 2025-12-15
Immune cell uptake of glycinated nanoparticles conjugated to anti-fibrotic peptides enables their prolonged activity and oral administration
2025-Dec-12, Journal of biomedical science IF:9.0Q1
研究论文 本研究开发了一种结合甘氨酸功能化可生物降解纳米颗粒与抗纤维化肽的递送平台,以实现肽类药物的口服给药和延长活性 首次将松弛素及其类似物与甘氨酸功能化的超顺磁性氧化铁纳米颗粒结合,通过口服给药实现抗纤维化疗效,并利用单细胞转录组学揭示了其被树突状细胞摄取的机制 研究仅在心肌病小鼠模型中进行,尚未在人体中验证;长期安全性和免疫原性未充分评估 开发一种口服给药的抗纤维化肽类药物递送系统,以替代传统的注射给药方式 心肌病小鼠模型、松弛素(RLX)及其类似物B7-33、甘氨酸功能化超顺磁性氧化铁纳米颗粒(SPIONs) NA 心血管疾病 单细胞转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
812 2025-12-15
SOX18 and SOX30 in NSCLC: The Epigenetic Landscape of Methylation, miRNA Regulation, and Network Crosstalk in Tumor Progression
2025-Dec-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨了SOX18和SOX30在非小细胞肺癌中的表观遗传调控、miRNA调节及其与血管生成和免疫调节通路的网络互作 首次在NSCLC中系统揭示了SOX18和SOX30的差异性表达模式及其表观遗传调控机制,并利用空间转录组学技术揭示了SOX18在肿瘤核心和侵袭边缘的富集定位及其与关键信号分子的共定位关系 研究主要基于组织样本和体外细胞模型,缺乏体内动物模型的验证;样本量虽达800例,但未涉及更广泛的NSCLC亚型或转移性样本 阐明SOX18和SOX30在非小细胞肺癌肿瘤进展中的表观遗传调控机制、miRNA调节作用及其与肿瘤微环境的相互作用 800例非小细胞肺癌标本(400例肺腺癌,400例鳞状细胞癌)、NSCLC细胞系及3D球状体培养模型 数字病理学 肺癌 免疫组织化学、RT-qPCR、Western印迹、空间转录组学、液滴数字甲基化特异性PCR NA 图像、文本、空间转录组数据 800例NSCLC标本(400例腺癌,400例鳞癌) NA 空间转录组学 NA NA
813 2025-12-15
Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics
2025-Dec, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了Nicheformer,一个基于Transformer的基础模型,用于单细胞和空间组学分析,旨在捕获细胞的空间上下文信息 Nicheformer是首个在人类和小鼠的单细胞及空间转录组数据上训练的基础模型,能够学习捕获空间上下文的细胞表示,并支持空间组成和标签预测等下游任务 仅使用解离数据训练的模型无法恢复空间微环境的复杂性,强调了多尺度整合的必要性 开发一个基础模型以改善单细胞和空间组学数据的分析,特别是空间上下文的预测和整合 人类和小鼠的细胞,包括解离单细胞和空间转录组数据 数字病理学 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Transformer 单细胞和空间转录组数据 超过5700万解离细胞和5300万空间解析细胞,涵盖73个组织 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
814 2025-12-15
Characteristics linking ischemia-reperfusion to chronic lung allograft dysfunction in lung transplantation: A single-cell bioinformatics analysis
2025-Dec, Transplant immunology IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA-seq数据集,揭示了肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 首次使用单细胞生物信息学方法系统描绘了IRI到CLAD过程中的细胞动态变化、代谢抑制、铜死亡激活及巨噬细胞向肌成纤维细胞转变等关键机制 研究结果需要进一步在动物模型和临床样本中进行验证 探究肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 肺移植相关的细胞群体,包括上皮细胞、Club细胞和髓系细胞 生物信息学 肺移植相关疾病 单细胞RNA-seq Louvain聚类、UMAP可视化、Augur方法、CellChat、MEBOCOST、pySCENIC 单细胞RNA-seq数据 整合自GSE220797和GSE224210数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
815 2025-12-15
Spatially resolved multi-omics of human metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Dec, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学及代谢组学技术,绘制了人类代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的空间多组学图谱 首次在人类MASLD中整合单细胞与空间转录组学及代谢组学数据,识别了MITF作为脂质相关巨噬细胞的关键调控因子,并揭示了其通过肝细胞生长因子分泌的肝保护作用 样本量相对有限(共61例),且主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 探究人类代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的分子机制和空间异质性 人类肝脏组织,包括对照组、代谢功能障碍相关脂肪肝(MASL)和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)患者 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 质谱成像 NA 转录组数据, 代谢组数据, 空间数据 61例人类肝脏样本(对照组10例, MASL 17例, MASH 34例) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 NA NA
816 2025-12-15
Presynaptic Changes in Mouse Rod Photoreceptors During Early Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,探讨了P23H/Gnat2-/-视网膜色素变性小鼠早期视杆细胞突触前分子变化 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术,揭示了视网膜色素变性早期视杆细胞突触SNARE复合体和囊泡蛋白的分子上调机制 研究仅使用1月龄小鼠模型,未涵盖疾病晚期阶段;样本量有限,且主要基于动物模型,人类临床相关性需进一步验证 探究视网膜色素变性早期视杆细胞突触可塑性的分子机制 P23H/Gnat2-/-视网膜色素变性小鼠和Gnat2-/-对照小鼠的视网膜组织 数字病理学 视网膜色素变性 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 1月龄P23H/Gnat2-/- RP小鼠和Gnat2-/-对照小鼠的视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
817 2025-12-15
Antiviral and immune modulatory activities of STING agonists in a mouse model of persistent hepatitis B virus infection
2025-Dec, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本文研究了STING激动剂在持续HBV感染小鼠模型中的抗病毒和免疫调节活性 首次使用STING敲除和人类STING敲入小鼠模型,证明STING激动剂治疗以STING依赖性方式激活免疫反应并抑制HBV复制,为慢性乙型肝炎治疗提供了新策略 研究仅基于小鼠模型,人类应用效果未验证;样本量较小,HBs-Ab仅在1/4小鼠中检测到 评估STING激动剂作为免疫疗法治疗慢性乙型肝炎的潜力 AAV-HBV转导的小鼠模型 免疫学 乙型肝炎 RNA-seq NA RNA序列数据 未明确指定,但涉及小鼠模型和单细胞RNA-seq分析 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
818 2025-12-14
Breakthroughs of ultrasound-targeted microbubble destruction in treating myocardial ischemia-reperfusion injury: from angiogenesis regulation to precise inflammation suppression
2025-Dec-31, Drug delivery IF:6.5Q1
综述 本文综述了超声靶向微泡破坏技术在治疗心肌缺血再灌注损伤中的最新进展,涵盖从血管生成调控到精准炎症抑制等多个方面 系统总结了UTMD技术通过调控HIF-1α/VEGF通路促进血管生成、抑制NLRP3炎症小体激活以减轻炎症反应的双重作用机制,并强调了结合放射组学、人工智能及多组学技术(如单细胞RNA测序)实现精准诊断与治疗的新策略 作为一篇综述文章,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,主要基于现有文献进行总结与展望 探讨超声靶向微泡破坏技术治疗心肌缺血再灌注损伤的机制、应用及未来研究方向 心肌缺血再灌注损伤及其相关的分子通路、细胞过程与治疗策略 心血管疾病 心血管疾病 超声靶向微泡破坏、单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学、放射组学、人工智能图像分析 NA 多组学数据、医学影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
819 2025-12-14
Systemic immune activity occurs during human immune system maturation
2025-Dec-11, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了321个样本中2,868,420个免疫细胞,揭示了人类免疫系统在妊娠中期成熟过程中的系统性免疫活动 发现了胸腺外CD4 T细胞亚群介导TOX2前体细胞向成熟初始CD4 T细胞的转变,挑战了胎儿免疫静默的现有范式,揭示了跨器官共享的记忆/活化T细胞和驻留记忆克隆,并识别了两种抑制胎儿T细胞活化的耐受机制 NA 探究人类免疫系统在妊娠中期的成熟过程和耐受机制 人类胎儿和成人组织中的免疫细胞,包括23个器官的样本 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 NA 单细胞RNA测序数据, T细胞受体测序数据 321个样本,涵盖23个器官,包括成人组织作为对照 NA 单细胞RNA-seq, T细胞受体测序 NA NA
820 2025-12-14
RoCK and ROI: single-cell transcriptomics with multiplexed enrichment of selected transcripts and region-specific sequencing
2025-Dec-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为RoCK和ROI的单细胞转录组测序工作流程,通过靶向捕获和选择性引物技术增强关键转录本和特定区域的检测 开发了RoCKseq和ROIseq两种技术,能够在单细胞转录组测序中富集关键转录本并定向测序特定区域,同时不损害整体转录组信息 未在摘要中明确提及具体限制 提高单细胞转录组测序中特定转录本和转录区域的检测率,以更好地理解细胞生物学 单细胞转录组 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),靶向捕获,选择性引物 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部