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当前共找到 1237 篇文献，本页显示第 781 - 800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 781 | 2025-12-16 |
Integrated single-cell atlases unveil the operation principles of whole-brain 5-HT neuronal subsystems
2025-Dec-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8128
PMID:41385633
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞图谱揭示了全脑5-HT神经元亚系统的运作原理 | 开发了包含单细胞投射组学、两个独立的scRNA-seq数据集和全脑5-HT神经元功能成像数据库的资源数据集，首次在斑马鱼中系统揭示了5-HT神经元亚系统的模块化功能组织原则 | 研究基于斑马鱼模型，虽然为哺乳动物系统提供了见解，但直接转化到哺乳动物仍需进一步验证 | 阐明5-羟色胺（5-HT）神经元亚系统的运作原理及其在生理和行为调节中的复杂作用 | 斑马鱼全脑5-HT神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能成像，单细胞投射组学 | NA | 单细胞转录组数据，成像数据，投射组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 782 | 2025-12-16 |
A single-cell transcriptomic atlas reveals resident dendritic-like cells in the zebrafish brain parenchyma
2025-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91427
PMID:41379882
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了成年斑马鱼大脑中免疫细胞的复杂性，并发现了一种与哺乳动物树突状细胞相似的驻留性髓系细胞亚群 | 首次在非哺乳类脊椎动物（斑马鱼）大脑中发现并表征了具有树突状细胞特征的髓系细胞亚群，揭示了脊椎动物大脑免疫细胞异质性的进化保守性 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限；突变体表型分析尚未完全阐明这些细胞的生理功能 | 探究斑马鱼大脑免疫细胞的多样性及其与哺乳动物的进化保守性 | 成年斑马鱼大脑中的免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及野生型和多种突变体斑马鱼 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 783 | 2025-12-16 |
scRegulate: single-cell regulatory-embedded variational inference of transcription factor activity from gene expression
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf638
PMID:41288963
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性和基因调控网络 | scRegulate通过变分推理整合先验生物学知识与数据驱动推断，能够捕获新颖、动态和上下文特定的调控相互作用，相比现有方法更具可扩展性和生物学基础 | NA | 开发一种从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性和基因调控网络的计算方法 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习框架，变分推理 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 784 | 2025-12-16 |
Deciphering the Osteoimmune Landscape in Subtalar Arthrodesis: A Single-Cell RNA Sequencing Approach
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70980
PMID:41381396
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了距下关节融合术患者中免疫细胞动态变化与骨愈合的关系 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统性解析距下关节融合术后的骨免疫景观，揭示了单核细胞和NK细胞在骨愈合中的关键作用及功能差异 | 样本量相对较小，仅分析了术后3个月的时间点，未涵盖更长期的愈合过程 | 阐明距下关节融合术后骨愈合的免疫机制，并探索免疫调节对骨修复的潜在影响 | 接受距下关节融合术的患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体数量，但涉及早期愈合和延迟愈合两组患者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 785 | 2025-12-16 |
Loureirin B Accelerates Diabetic Wound Healing by Promoting TGFβ/Smad-Dependent Macrophage M2 Polarization: A Concerted Analytical Approach Through Single-Cell RNA Sequencing and Experimental Verification
2025-Dec, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.8373
PMID:39532388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证，揭示了龙血竭提取物龙血素B通过激活TGFβ/Smad信号通路促进巨噬细胞M2极化，从而加速糖尿病伤口愈合的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术与实验验证，系统阐明了龙血素B在糖尿病伤口愈合中通过TGFβ/Smad通路调控巨噬细胞极化的具体分子机制 | 研究主要在动物模型和体外实验中进行，尚未在人体临床试验中验证其疗效和机制 | 探究龙血素B促进糖尿病伤口愈合的分子机制和疗效 | 糖尿病伤口愈合过程中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病足溃疡组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 786 | 2025-12-16 |
Unveiling the role of the extracellular matrix in the osteosarcoma tumor microenvironment through integrated transcriptomics and experimental validation
2025-Dec, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00970-0
PMID:41057667
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学分析和实验验证，揭示了细胞外基质（ECM）在骨肉瘤肿瘤微环境中的关键作用，并确定了COL5A2基因和C0成骨细胞簇作为重要的ECM相关标志物 | 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合实验验证，系统性地揭示了COL5A2基因通过激活黏着斑通路和IGFBP3-TMEM219轴介导的细胞间通讯来驱动骨肉瘤增殖的新机制 | 研究主要基于公共数据库的数据和体外实验，缺乏体内动物模型的验证，并且ECM其他成分的作用有待进一步探索 | 阐明细胞外基质在骨肉瘤肿瘤微环境中的作用机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞外基质成分及相关细胞类型（如成骨细胞、内皮细胞） | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析, Western blot, CCK-8, 集落形成实验 | 预后模型 | 转录组数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 787 | 2025-12-15 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2025-Dec-13, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
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研究论文 | 本研究探讨了克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制，揭示了circPLCE1/XYLB/Xu5P轴在调节磷酸戊糖途径和纤维生成中的作用 | 首次通过多层整合分析发现成纤维细胞中磷酸戊糖途径在克罗恩病肠道纤维化中的激活，并揭示了circPLCE1通过直接结合XYLB抑制其酶活性来调控该途径的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型和动物模型，人类样本验证相对有限，且未探讨其他潜在调控因子或信号通路 | 探索克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控机制 | 人类肠道成纤维细胞、小鼠肠道纤维化模型、配对黏膜和黏膜下组织 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 代谢组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、circRNA转录组学、代谢通量分析、Seahorse分析、RNA pull-down实验 | NA | 代谢组数据、转录组数据、空间转录组数据、circRNA数据 | 配对狭窄和非狭窄肠道段组织、原代人肠道肌成纤维细胞、葡聚糖硫酸钠诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 788 | 2025-12-15 |
Untangling the fusion of spatial omics and mechanobiology
2025-Dec-12, Progress in biomedical engineering (Bristol, England)
DOI:10.1088/2516-1091/ae16f2
PMID:41130259
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综述 | 本文探讨了空间转录组学与力学生物学的融合，提出了一种名为空间机械转录组学的整合平台，用于研究细胞物理特性与转录谱之间的关系 | 首次提出将空间转录组学与力学生物学数据整合在同一细胞中，创建空间机械转录组学平台，以关联细胞机械特性与转录差异 | 未提及具体实验验证或技术实施细节，目前仍处于概念探索阶段 | 探索整合空间转录组学和力学生物学数据，以预测疾病状态并推动精准诊断 | 细胞（特别是其物理特性和转录谱） | 空间转录组学 | 肌肉萎缩症、癌症、青光眼等 | 空间转录组学、力学生物学测量 | NA | 空间转录组数据、机械数据（如细胞膜硬度） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 789 | 2025-12-15 |
Immune cell uptake of glycinated nanoparticles conjugated to anti-fibrotic peptides enables their prolonged activity and oral administration
2025-Dec-12, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-025-01198-8
PMID:41382190
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研究论文 | 本研究开发了一种结合甘氨酸功能化可生物降解纳米颗粒与抗纤维化肽的递送平台，以实现肽类药物的口服给药和延长活性 | 首次将松弛素及其类似物与甘氨酸功能化的超顺磁性氧化铁纳米颗粒结合，通过口服给药实现抗纤维化疗效，并利用单细胞转录组学揭示了其被树突状细胞摄取的机制 | 研究仅在心肌病小鼠模型中进行，尚未在人体中验证；长期安全性和免疫原性未充分评估 | 开发一种口服给药的抗纤维化肽类药物递送系统，以替代传统的注射给药方式 | 心肌病小鼠模型、松弛素（RLX）及其类似物B7-33、甘氨酸功能化超顺磁性氧化铁纳米颗粒（SPIONs） | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 790 | 2025-12-15 |
SOX18 and SOX30 in NSCLC: The Epigenetic Landscape of Methylation, miRNA Regulation, and Network Crosstalk in Tumor Progression
2025-Dec-02, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262311669
PMID:41373817
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研究论文 | 本研究探讨了SOX18和SOX30在非小细胞肺癌中的表观遗传调控、miRNA调节及其与血管生成和免疫调节通路的网络互作 | 首次在NSCLC中系统揭示了SOX18和SOX30的差异性表达模式及其表观遗传调控机制，并利用空间转录组学技术揭示了SOX18在肿瘤核心和侵袭边缘的富集定位及其与关键信号分子的共定位关系 | 研究主要基于组织样本和体外细胞模型，缺乏体内动物模型的验证；样本量虽达800例，但未涉及更广泛的NSCLC亚型或转移性样本 | 阐明SOX18和SOX30在非小细胞肺癌肿瘤进展中的表观遗传调控机制、miRNA调节作用及其与肿瘤微环境的相互作用 | 800例非小细胞肺癌标本（400例肺腺癌，400例鳞状细胞癌）、NSCLC细胞系及3D球状体培养模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学、RT-qPCR、Western印迹、空间转录组学、液滴数字甲基化特异性PCR | NA | 图像、文本、空间转录组数据 | 800例NSCLC标本（400例腺癌，400例鳞癌） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 791 | 2025-12-15 |
A Large-Scale Single-Cell Atlas Reveals the Peripheral Immune Panorama of Bacterial Pneumonia
2025-Dec, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202501-0217OC
PMID:40758632
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研究论文 | 本研究通过构建大规模单细胞转录组图谱，揭示了细菌性肺炎患者外周血免疫细胞在疾病不同严重程度下的全景变化 | 首次构建了涵盖不同严重程度细菌性肺炎患者的大规模外周血免疫细胞单细胞转录组图谱，系统揭示了疾病严重程度与免疫细胞亚群组成、功能状态及信号通路活性的关联 | 研究样本量相对有限（共100例），且为横断面研究，无法完全阐明免疫动态变化的因果关系 | 阐明细菌性肺炎的免疫发病机制，识别驱动疾病严重程度的关键细胞和分子特征 | 细菌性肺炎患者（包括重症和轻症）及健康对照者的外周血免疫细胞 | 单细胞组学 | 细菌性肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据、分子数据 | 100名个体（39例重症肺炎、31例轻症肺炎、30例健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 792 | 2025-12-15 |
Mapping Plasmodium transitions and interactions in the Anopheles female
2025-Dec, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09653-0
PMID:41125888
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在按蚊中肠内的关键发育阶段转换和宿主-寄生虫相互作用 | 首次结合单细胞RNA测序和共聚焦显微镜，系统解析了疟原虫在按蚊中肠内的发育过渡和相互作用，并识别出调控卵囊生长的关键过程及转录因子PfSIP2 | 研究主要基于实验室条件，尽管验证了野外来源的寄生虫，但可能未完全覆盖自然传播环境中的所有变异 | 探究疟原虫在按蚊中肠内的发育机制和宿主-寄生虫相互作用，以识别阻断传播的潜在靶点 | 恶性疟原虫和按蚊中肠细胞，包括不同发育阶段和代谢条件下的寄生虫与宿主细胞 | 单细胞组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，功能分析 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多个发育阶段和代谢条件下的寄生虫与蚊子细胞样本，包括野外来源的寄生虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 793 | 2025-12-15 |
Decidual cell invasion and decidualization at the trophoblast-decidual interaction in the progression of cesarean scar pregnancy
2025-Dec, Journal of reproductive immunology
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.jri.2025.104747
PMID:41151220
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，探讨了KISS1基因在剖宫产瘢痕妊娠（CSP）进展中蜕膜细胞侵袭和蜕膜化过程中的作用 | 首次在单细胞水平上揭示了CSP中蜕膜细胞KISS1表达下调及其通过PI3K/AKT信号通路影响蜕膜化的机制，并发现miR-6809和miR-4768对KISS1的调控作用 | 研究样本量有限，且主要基于体外实验，需要更多临床样本和体内实验验证 | 阐明KISS1基因在CSP进展中蜕膜细胞侵袭过程中的作用及其分子机制 | 剖宫产瘢痕妊娠（CSP）和正常早孕宫内妊娠（IUP）的蜕膜组织样本 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组化，qRT-PCR，Western blotting，RNA干扰，过表达实验，RNA-seq，荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | CSP和IUP的蜕膜组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 794 | 2025-12-15 |
Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02814-z
PMID:41168487
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研究论文 | 本文介绍了Nicheformer，一个基于Transformer的基础模型，用于单细胞和空间组学分析，旨在捕获细胞的空间上下文信息 | Nicheformer是首个在人类和小鼠的单细胞及空间转录组数据上训练的基础模型，能够学习捕获空间上下文的细胞表示，并支持空间组成和标签预测等下游任务 | 仅使用解离数据训练的模型无法恢复空间微环境的复杂性，强调了多尺度整合的必要性 | 开发一个基础模型以改善单细胞和空间组学数据的分析，特别是空间上下文的预测和整合 | 人类和小鼠的细胞，包括解离单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Transformer | 单细胞和空间转录组数据 | 超过5700万解离细胞和5300万空间解析细胞，涵盖73个组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 795 | 2025-12-15 |
Cancer-associated fibroblast miR-148a-5p/CALD1/collagen VI pathway promotes proliferation in Helicobacter pylori-positive gastric cancer
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01116-y
PMID:41171370
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研究论文 | 本研究揭示了幽门螺杆菌通过激活癌症相关成纤维细胞中的TLR/miR-148a-5p/CALD1/胶原VI通路促进胃癌细胞增殖的机制 | 首次在幽门螺杆菌阳性胃癌中鉴定出CAFs通过miR-148a-5p/CALD1/胶原VI轴促进肿瘤增殖的新信号通路，并证明miR-148a-5p激动剂可作为化疗增敏剂 | 未明确说明样本量大小，且研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究幽门螺杆菌如何通过影响癌症相关成纤维细胞促进胃癌增殖，并寻找潜在治疗靶点 | 幽门螺杆菌阳性胃癌、癌症相关成纤维细胞、胃癌细胞 | 肿瘤生物学 | 胃癌 | microRNA测序、转录组测序、单细胞测序、分子生物学实验、体外细胞共培养、体内CDX和PDX模型 | NA | 测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 796 | 2025-12-15 |
Characteristics linking ischemia-reperfusion to chronic lung allograft dysfunction in lung transplantation: A single-cell bioinformatics analysis
2025-Dec, Transplant immunology
IF:1.6Q3
DOI:10.1016/j.trim.2025.102326
PMID:41232781
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq数据集，揭示了肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 | 首次使用单细胞生物信息学方法系统描绘了IRI到CLAD过程中的细胞动态变化、代谢抑制、铜死亡激活及巨噬细胞向肌成纤维细胞转变等关键机制 | 研究结果需要进一步在动物模型和临床样本中进行验证 | 探究肺移植中缺血再灌注损伤与慢性肺移植物功能障碍之间的细胞和分子联系 | 肺移植相关的细胞群体，包括上皮细胞、Club细胞和髓系细胞 | 生物信息学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA-seq | Louvain聚类、UMAP可视化、Augur方法、CellChat、MEBOCOST、pySCENIC | 单细胞RNA-seq数据 | 整合自GSE220797和GSE224210数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 797 | 2025-12-15 |
Spatially resolved multi-omics of human metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Dec, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02407-8
PMID:41286103
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学及代谢组学技术，绘制了人类代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的空间多组学图谱 | 首次在人类MASLD中整合单细胞与空间转录组学及代谢组学数据，识别了MITF作为脂质相关巨噬细胞的关键调控因子，并揭示了其通过肝细胞生长因子分泌的肝保护作用 | 样本量相对有限（共61例），且主要基于观察性数据，需要进一步功能验证 | 探究人类代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的分子机制和空间异质性 | 人类肝脏组织，包括对照组、代谢功能障碍相关脂肪肝（MASL）和代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）患者 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 质谱成像 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间数据 | 61例人类肝脏样本（对照组10例, MASL 17例, MASH 34例） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 798 | 2025-12-15 |
Presynaptic Changes in Mouse Rod Photoreceptors During Early Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.4
PMID:41324324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，探讨了P23H/Gnat2-/-视网膜色素变性小鼠早期视杆细胞突触前分子变化 | 首次结合单细胞RNA测序和蛋白质组学技术，揭示了视网膜色素变性早期视杆细胞突触SNARE复合体和囊泡蛋白的分子上调机制 | 研究仅使用1月龄小鼠模型，未涵盖疾病晚期阶段；样本量有限，且主要基于动物模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究视网膜色素变性早期视杆细胞突触可塑性的分子机制 | P23H/Gnat2-/-视网膜色素变性小鼠和Gnat2-/-对照小鼠的视网膜组织 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 1月龄P23H/Gnat2-/- RP小鼠和Gnat2-/-对照小鼠的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 799 | 2025-12-15 |
Antiviral and immune modulatory activities of STING agonists in a mouse model of persistent hepatitis B virus infection
2025-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013709
PMID:41364734
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研究论文 | 本文研究了STING激动剂在持续HBV感染小鼠模型中的抗病毒和免疫调节活性 | 首次使用STING敲除和人类STING敲入小鼠模型，证明STING激动剂治疗以STING依赖性方式激活免疫反应并抑制HBV复制，为慢性乙型肝炎治疗提供了新策略 | 研究仅基于小鼠模型，人类应用效果未验证；样本量较小，HBs-Ab仅在1/4小鼠中检测到 | 评估STING激动剂作为免疫疗法治疗慢性乙型肝炎的潜力 | AAV-HBV转导的小鼠模型 | 免疫学 | 乙型肝炎 | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 未明确指定，但涉及小鼠模型和单细胞RNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 800 | 2025-12-12 |
Fibroblasts in the tumor microenvironment: heterogeneity and dynamic interactions in tumor progression revealed by spatial transcriptomics
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01108-y
PMID:41129052
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |