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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-05-21
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究使用小鼠适应型SARS-CoV-2(MA10)感染5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠,发现感染虽未加剧阿尔茨海默病神经病理,但诱导了广泛的基因表达变化 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中系统评估SARS-CoV-2感染对Aβ病理的直接效应,并利用批量RNA测序与空间转录组学揭示无神经侵袭情况下的细胞功能基因组变化 病毒RNA在中枢神经系统中未检测到,未评估长期感染或多次感染对神经病理的潜在累积效应,且仅使用特定年龄小鼠探讨急性感染阶段 探究SARS-CoV-2感染如何影响阿尔茨海默病的神经病理机制 老年5xFAD(阿尔茨海默病模型)和野生型C57BL/6小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 RNA测序, 空间转录组学 NA RNA测序数据 两种基因型(5xFAD和WT)的老年小鼠,详细样本数量未在摘要中说明 NA 批量RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
62 2026-05-21
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-12, The American journal of pathology
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示M2a巨噬细胞与肺腺癌气腔扩散的关联 创新性地结合单细胞RNA测序和数字空间分析空间转录组学技术,研究特定类型肿瘤相关巨噬细胞对肺腺癌气腔扩散发生和发展的影响机制 未提及明显的局限性 探索肿瘤相关巨噬细胞亚型在肺腺癌气腔扩散中的作用及其分子机制 肺腺癌中的气腔扩散和M2a巨噬细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
63 2026-05-20
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-12-29, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 基于衰老相关特征基因构建肺动脉高压早期诊断模型并识别潜在治疗靶点 首次整合多数据集转录组分析,利用三种机器学习方法筛选衰老相关特征基因,构建高精度诊断列线图,并发现TUL-XXI039作为多靶点潜在治疗化合物 研究基于已有数据集和体外模型,缺乏大规模临床验证及体内实验证据 开发肺动脉高压早期诊断生物标志物并探索衰老靶向治疗策略 肺动脉高压患者转录组数据及体外缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞模型 数字病理学 肺动脉高压 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、分子对接 LASSO回归、随机森林、支持向量机、列线图 基因表达数据 训练队列及多个独立验证队列(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
64 2026-05-20
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 详细描述了利用Xenium Prime 5K平台对小鼠脱钙骨骼肌组织进行空间转录组分析的完整样本处理流程 首次提出针对小鼠骨骼肌组织的完整样本处理流程,包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及共嵌入策略,实现了高质量空间转录组数据生成,并保留了关键解剖背景 未提及明显的局限性,但可实现性可能受限于特定组织类型和平台成本 开发一个能够高效生成小鼠骨骼肌组织空间转录组数据的样本处理流程 成年小鼠完整膝关节、胫骨和腰椎骨样本 数字病理学 不适用 基于成像的空间转录组学 不适用 空间转录组数据 成年小鼠的多个肌肉骨骼组织样本 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Prime 5K 10x Genomics Xenium Prime 5K平台进行成像型空间转录组分析
65 2026-05-20
Resistance of endothelial cells to SARS-CoV-2 infection in vitro
2025-12-23, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究重新评估了内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性,发现培养的或原位的内皮细胞均不容易被活病毒直接感染 首次在体外培养及人肺切片原位实验中证明,无论培养还是天然的人内皮细胞均不易直接受SARS-CoV-2感染,这挑战了之前认为内皮细胞是病毒靶点的观点 研究主要基于体外实验,可能无法完全模拟体内复杂环境;且样本量有限,结果需要进一步在动物模型或临床研究中验证 探讨内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性,以澄清其在COVID-19血管炎症中的角色 人肺、主动脉内皮细胞、内皮祖细胞以及人肺切片中的原位内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、荧光成像、ELISA、RT-qPCR、假病毒试验 NA 图像、基因表达数据 内皮细胞来自肺、主动脉和祖细胞培养物,以及人肺切片中的原位细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 用于人肺切片的单细胞RNA测序,捕获与SARS-CoV-2病毒基因组对齐的分子标识符
66 2026-05-19
Integrative analysis of RiboSis-related gene expression in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 综合分析了结直肠癌中核糖体生物合成相关基因的表达,探讨了其在预后和免疫治疗中的意义 首次利用单细胞RNA测序和整合机器学习方法,构建了基于核糖体生物合成相关基因的预后模型,并验证了PFDN2作为枢纽基因在结直肠癌中的作用 未提及具体局限性 探索核糖体生物合成相关基因在结直肠癌中的临床意义,特别是在预后和免疫治疗响应中的潜在作用 结直肠癌组织样本中的细胞和基因 机器学习 结直肠癌 scRNA-seq, NMF, 机器学习 基于十种算法的整合机器学习模型 单细胞RNA测序数据 3个结直肠癌组织的scRNA-seq数据,13个样本的26,961个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-05-18
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 GLP-1R激动剂直接提高小鼠集合淋巴管的泵血能力 首次发现GLP-1R激动剂(如semaglutide)可直接作用于淋巴管内皮细胞(LECs),通过血管舒张增加淋巴管泵血能力,且该作用独立于体重减轻带来的系统性益处 机制中除一氧化氮、活性氧和血管舒张性前列腺素外,其他信号成分尚待阐明 研究GLP-1R激动剂对淋巴管功能的直接作用及其分子机制 健康野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 数字病理学 继发性淋巴水肿 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 NA 图像、基因表达数据 小鼠淋巴管样本,具体数量未报告 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于淋巴管细胞转录组分析
68 2026-05-18
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过整合病理基因组学与单细胞基因组学,识别与黑色素瘤乳酸代谢相关的预后特征和治疗策略 首次整合病理图像特征、单细胞转录组、空间转录组等多组学数据,构建乳酸代谢预后模型(LMS),并发现RAB32在肿瘤代谢重编程和侵袭性中的核心作用 未提及明显的局限性 系统表征黑色素瘤中乳酸代谢的分子特征,构建预后模型并探索潜在治疗策略 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的病理图像、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据及临床信息 数字病理学、机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、深度学习、基因集变异分析、RAB32敲低实验 ResNet50卷积神经网络、LMS预后模型(基于10种机器学习算法的101种组合) 图像、文本(基因表达数据)、视频(非核心) TCGA训练集和验证集样本、单细胞测序样本、小鼠异种移植模型样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序技术、空间转录组学技术、病理图像分析技术 NA NA
69 2026-05-18
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过多组学分析揭示内皮SPRY1缺陷与肺动脉高压中血管生成-代谢重编程的关系 首次通过整合单细胞RNA测序数据和高维加权基因共表达网络分析与机器学习,鉴定SPRY1为肺动脉高压发病机制中的新型关键生物标志物,并证实其在疾病中的显著下调 研究仅基于数据库分析,且仅在一个大鼠模型中验证,缺乏更多临床样本和功能验证实验 探究肺动脉高压中内皮细胞稳态失调的分子机制,特别是SPRY1在血管重塑中的作用 肺动脉高压患者和正常对照的肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、机器学习 高维加权基因共表达网络分析、机器学习模型 基因表达数据 来自GEO数据库的肺动脉高压患者和正常对照肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
70 2026-05-18
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究采用多组学方法,整合21个多中心结直肠癌队列数据,鉴定了ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群,并发现其与癌症进展和不良预后相关 首次鉴定出ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌进展中的关键作用,并构建了基于该细胞亚群与肿瘤微环境相互作用的风险预测模型ETSRM,该模型优于111个现有结直肠癌模型 未提及明显局限 探讨ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的作用及其作为预后标志物的潜力 结直肠癌肿瘤上皮细胞,特别是ERO1A阳性上皮细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、批量转录组学、空间转录组学、蛋白质组学 风险预测模型(ETSRM) 转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 2767名患者,来自21个结直肠癌队列 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
71 2026-05-18
LCN2 drives ferroptosis-associated ischemia-reperfusion injury after renal transplantation: integrated machine learning and in vivo validation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过整合机器学习与体内验证,揭示LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的关键作用 首次结合加权基因共表达网络分析、113种机器学习算法和单细胞测序,系统鉴定并验证LCN2在肾移植缺血再灌注损伤中驱动铁死亡和免疫失调的核心机制,提出新型诊断框架和治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和有限的人类移植队列数据,LCN2抑制剂的临床转化效果和长期安全性尚需进一步验证 探究LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的作用,并构建基于机器学习的诊断模型 小鼠缺血再灌注损伤模型和人类肾移植队列样本 机器学习 肾脏疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 机器学习的 逻辑回归, 随机森林, 集成模型 基因表达数据, 转录组数据 6个小鼠IRI转录组数据集(83个样本)和2个人类移植队列(212个样本) NA 单细胞RNA-seq NA 使用GSE237429单细胞RNA-seq数据集
72 2026-05-18
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-12, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,研究了寒冷暴露后皮下白色脂肪组织中胆碱能脂肪巨噬细胞的转录组可塑性和起源 首次对胆碱能脂肪巨噬细胞在急性热生成反应中的转录组动态进行高分辨率评估,揭示了其混合起源和寒冷诱导的广泛基因表达变化 NA(摘要未提及局限性) 阐明胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露中的转录组动态及其起源与身份 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+细胞 单细胞转录组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠皮下白色脂肪组织样本(热中性或急性冷暴露后) NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-05-18
Neutrophil CD11b is a pivotal PANoptosis marker correlated with disease activity in antineutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究鉴定CD11b为中性粒细胞PANoptosis的关键标志物,并发现其活性与ANCA相关性血管炎疾病活动度呈正相关 首次发现CD11b作为PANoptosis关键基因在AAV中的枢纽作用,并揭示其通过脂肪酸代谢异常调控中性粒细胞活化与PANoptosis的机制 未明确说明样本量大小及多中心验证,动物模型仅使用ANCA-GN小鼠,临床相关性分析可能受限于单中心数据 鉴定ANCA相关性血管炎中PANoptosis关键标志物并探索其与疾病活动度的关联 AAV患者外周血中性粒细胞、尿液及血浆样本、肾活检标本、ANCA-GN小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 基因微阵列,单细胞测序,免疫荧光染色,代谢途径分析 综合生物信息分析 基因表达数据,单细胞转录组数据 AAV患者血液、尿液和肾标本,ANCA-GN小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA 来自GEO数据库的基因微阵列数据及小鼠单细胞测序数据
74 2026-05-18
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及驱动M2极化的因素 首次发现BCAT1在免疫耐药患者组织中与M2巨噬细胞浸润正相关,并证实BCAT1可通过驱动M2极化促进免疫抑制微环境 未提及具体局限性 揭示肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性和可塑性,并识别影响其极化的基因 肺腺癌患者组织中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用公开数据集GSE207422 NA 单细胞RNA测序 NA NA
75 2026-05-18
Multi-omics nominates VDAC2 as a candidate protective locus in sepsis-associated cholesterol dysregulation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 利用多组学和机器学习方法探索败血症中胆固醇代谢失调的机制,并识别候选保护基因VDAC2 首次通过整合转录组、单细胞RNA测序和机器学习算法,将VDAC2确定为败血症相关胆固醇代谢失调的候选保护基因,并构建了高精度的诊断和预后模型 NA 探索败血症中胆固醇代谢失调的分子机制,识别新的治疗靶点 败血症患者的转录组和单细胞RNA测序数据 机器学习和多组学 败血症 转录组测序、单细胞RNA测序、机器学习 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、非负矩阵分解(NMF)、101种机器学习算法集成模型 基因表达数据 多个队列的败血症患者样本,具体数量未提及 NA 转录组测序、单细胞RNA测序 NA NA
76 2026-05-17
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-12, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2
研究论文 研究年龄对年轻和中年小鼠股骨近端骨折愈合的影响 利用空间转录组学结合多重细胞因子分析,揭示了中年小鼠骨折愈合能力下降与衰老相关分泌表型(SASP)因子的关联 仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未包括雌性小鼠及更年长小鼠,且未深入探讨SASP因子的具体分子机制 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响,并评估该模型是否适用于研究年龄相关性延迟骨折愈合的分子机制 12周龄(年轻)和52周龄(中年)雄性C57BL/6J小鼠 机器学习 骨质疏松, 骨折 空间转录组学, 多重细胞因子分析, μCT分析, 组织形态计量学, 免疫染色 NA 基因表达数据, 图像数据 12周龄和52周龄雄性C57BL/6J小鼠(具体数量未提及) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于骨折后14天的组织分析
77 2026-05-17
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-12-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究发现ETS变异转录因子1(ETV1)是肠内分泌L细胞中PYY产生的关键调节因子 首次揭示ETV1在L细胞中特异调节PYY表达的转录调控机制,而对GLP-1表达无影响 未明确说明 探究肠内分泌L细胞中ETV1对激素PYY和GLP-1的转录调控作用 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 医学 代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR NA 基因表达数据 小鼠小肠组织样本和类器官培养样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2026-05-16
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-12-05, Alzheimer's research & therapy
研究论文 整合多组学孟德尔随机化分析识别阿尔茨海默病药物靶点 通过大规模多组学数据整合(包括50多个GWAS数据集、蛋白质组QTL、单细胞RNA测序和蛋白质互作网络),建立了一个全面的阿尔茨海默病靶点图谱,并验证了六个最高置信度靶点 未明确说明,但可能包括依赖现有数据库的质量和样本量,以及孟德尔随机化方法的固有局限性 识别阿尔茨海默病的稳健治疗靶点,建立从机制到安全性的临床可操作框架 阿尔茨海默病的潜在药物靶点 机器学习 阿尔茨海默病 全基因组关联研究、蛋白质组定量性状位点分析、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 涉及超过50个GWAS数据集及大规模蛋白质组学研究数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
79 2026-05-16
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-12, The Journal of nutrition IF:3.7Q2
研究论文 构建小鼠回肠综合单细胞图谱,揭示营养代谢与上皮-免疫细胞互作机制 首次整合小鼠回肠单细胞转录组图谱,同时覆盖上皮和免疫细胞群体,发现Bco2-Il18在多种细胞类型中的共表达以及非经典杯状细胞的高表达特征 研究仅基于雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别和遗传背景差异;缺乏功能验证实验 构建回肠细胞异质性图谱,解析上皮分化、营养代谢程序及上皮-免疫互作在健康与疾病中的作用 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 32,076个回肠细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 使用Seurat软件进行基因表达聚类分析,结合伪时间轨迹、细胞间通讯和通路富集分析
80 2026-05-16
Oxidative Stress and Pyroptosis Mediated by CEBPB/HMGB1 Signaling in Sepsis-Exacerbated Coronary Atherosclerosis
2025-12, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠状动脉粥样硬化中介导氧化应激和细胞焦亡的作用 首次揭示了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠心病中的分子机制,为心血管并发症的预防提供了新靶点 研究主要在动物模型和细胞实验中进行,尚需更大规模临床样本验证 阐明脓毒症加重冠状动脉疾病的氧化应激和炎症信号通路机制 雄性ApoE小鼠模型和THP-1来源巨噬细胞及人主动脉内皮细胞 数字病理学 冠状动脉疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测, 酶联免疫吸附测定, 活性氧检测, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 分子生物学数据 使用ApoE小鼠模型(样本量未明确报告),以及THP-1来源巨噬细胞和人主动脉内皮细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
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