本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-12-17 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-Dec-12, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf317
PMID:41384851
|
研究论文 | 本研究通过多模态单细胞测序和体外刺激实验,定义了人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 | 首次系统性地揭示了人类巨噬细胞在多个组织(如肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结)中的转录组和蛋白质组特征,并展示了这些特征在激活过程中的稳定性 | 研究基于器官捐赠者的样本,可能无法完全反映活体动态变化,且样本来源有限 | 探索人类巨噬细胞在不同组织中的身份特征及其在稳态和激活状态下的变化 | 人类巨噬细胞和单核细胞,从肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结中分离 | 单细胞组学 | NA | 多模态单细胞测序,单核转座酶可及染色质测序(snATAC-seq),体外刺激实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,染色质可及性数据 | 来自个体器官捐赠者的多个组织样本(肺、小肠、脾脏、骨髓、淋巴结) | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 762 | 2025-12-17 |
Uncovering functional divergence and cellular clusters with specific gene signatures in HNSCC clonal spheroids
2025-Dec-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02360-3
PMID:41388470
|
研究论文 | 本研究通过生成头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的克隆球体,揭示了其功能异质性,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了与增殖和迁移相关的不同细胞簇及其基因特征 | 首次在HNSCC克隆球体中系统识别了超增殖和低增殖球体的功能差异,并通过单细胞RNA测序揭示了与肿瘤微环境相关的特定细胞簇和基因表达谱 | 研究基于细胞系和患者肿瘤细胞生成的球体模型,可能无法完全模拟体内肿瘤的复杂性,且样本来源有限 | 探究HNSCC克隆球体的功能异质性及其与肿瘤进展的关系 | HNSCC细胞系和患者肿瘤细胞生成的克隆球体 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自HNSCC细胞系和患者肿瘤细胞的克隆球体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 763 | 2025-12-17 |
The transcriptome of CD14+CD163-HLA-DRlow monocytes predicts mortality in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2025-Dec-11, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00804-2025
PMID:41360505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析特发性肺纤维化(IPF)患者外周血单个核细胞,发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组特征能预测IPF患者的死亡率 | 首次将CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组特征与IPF死亡率相关联,并验证其在多个样本类型(PBMC、BAL、肺组织)中的预后准确性 | 样本量相对有限(总样本1054例,IPF患者555例),且研究结果需要在更大队列中进一步验证 | 探究免疫细胞特异性转录组特征与IPF患者死亡率之间的关联,并寻找潜在的治疗靶点 | 特发性肺纤维化(IPF)患者的外周血单个核细胞、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、细胞反卷积分析 | LASSO回归 | 转录组数据 | 总样本1054例(IPF患者555例,其他499例) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 764 | 2025-12-17 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Dec-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12201-9
PMID:41382277
|
研究论文 | 本研究通过整合固定细胞和活细胞数据,更新了Hydractinia symbiolongicarpus的单细胞图谱,揭示了细胞类型多样性和空间表达模式 | 整合新数据集扩展了细胞数量至超过47,000个,识别了新的免疫细胞群、神经亚型、空间不同的腺细胞群以及完整的刺细胞发育轨迹 | NA | 构建并验证Hydractinia symbiolongicarpus的更新单细胞图谱,以促进对刺胞动物细胞多样性和动态的理解 | Hydractinia symbiolongicarpus的喂养息肉和匍匐茎组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过47,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 765 | 2025-12-17 |
Single-cell transcriptomics reveals probiotic reversal of neonatal morphine-induced gene disruptions underlying adolescent pain hypersensitivity
2025-Dec-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09150-0
PMID:41372449
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了新生儿期吗啡暴露导致青春期小鼠中脑基因表达广泛改变,并发现益生菌Bifidobacterium infantis可逆转这些改变 | 首次提供了新生儿吗啡暴露及益生菌干预后青春期小鼠中脑的单细胞RNA测序数据集,揭示了益生菌对阿片类药物诱导的神经发育影响的逆转作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床中得到验证;观察时间点局限于青春期 | 探究新生儿期吗啡暴露对疼痛通路神经发育的长期影响及益生菌干预的潜在治疗作用 | 青春期小鼠的中脑单细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛敏感性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 107,427个中脑单细胞,来自新生儿期接受生理盐水、吗啡或吗啡加益生菌处理的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2025-12-17 |
CANTAO: guiding clustering and annotation in single-cell RNA sequencing using average overlap
2025-Dec-08, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00176-4
PMID:41361656
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CANTAO的新方法,通过平均重叠度量来指导单细胞RNA测序数据的聚类和注释,以更准确地识别细胞身份 | 提出了平均重叠度量来定义单细胞聚类之间的距离,通过比较差异表达基因的排序列表,实现了对真实细胞身份的一致、精确且具有生物学意义的再现 | NA | 解决单细胞RNA测序中未知细胞身份情况下的聚类比较和注释挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 包含已知真实细胞身份的基准数据集以及未分选的小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 767 | 2025-12-17 |
Protoplast technology in woody plants: current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Dec-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
|
综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 全面概述了木本植物原生质体分离、纯化、活力评估方法及其在基因功能分析、融合、再生、基因组编辑和单细胞测序等领域的多样化应用,并展望了未来技术突破带来的新研究方向 | NA | 总结木本植物原生质体技术的最新进展,并探讨其在遗传改良和生物技术创新中的潜力 | 木本植物 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达系统、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 768 | 2025-12-17 |
Intestinal fibroblast heterogeneity - unifying RNA-seq studies and introducing consensus-driven nomenclature
2025-Dec-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.264147
PMID:41170756
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了小鼠结肠黏膜中的六个成纤维细胞亚群,并提出了标准化的命名法 | 整合多个数据集以识别保守的成纤维细胞群体,并引入共识驱动的命名法来统一分类 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;在稳态条件下进行,未充分探讨疾病状态下的变化 | 研究肠道成纤维细胞的异质性,并建立标准化的命名体系 | 小鼠结肠黏膜中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 769 | 2025-12-17 |
Hub genes and common pathogenic mechanisms between COPD and H. pylori infection
2025-Dec, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2025.100622
PMID:41386886
|
研究论文 | 本文通过整合分析公共数据集,识别了慢性阻塞性肺疾病(COPD)和幽门螺杆菌(H. pylori)感染之间的共享基因和共同致病机制 | 首次通过多组学方法(包括WGCNA、SVM-RFE、单细胞RNA测序和细胞间通讯分析)系统识别了COPD和H. pylori感染之间的共享枢纽基因CCR1和CCL19,并揭示了它们在免疫细胞和成纤维细胞中的表达模式及相互作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;样本来源和实验条件可能存在异质性;单细胞分析可能受限于数据集的细胞类型覆盖和分辨率 | 探究COPD和H. pylori感染之间的共同分子机制和共享基因,以揭示潜在的整合治疗靶点 | COPD和H. pylori感染的基因表达数据,包括差异表达基因、共表达模块、免疫细胞浸润和单细胞转录组 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、基因集富集分析(GSEA)、受试者工作特征曲线(ROC)、免疫浸润分析(CIBERSORT)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞间通讯分析 | SVM-RFE | 基因表达数据(微阵列或RNA-seq) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 770 | 2025-12-17 |
Single-cell analysis of human thymus and peripheral blood unveils the dynamics of T cell development and aging
2025-Dec, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00990-3
PMID:41136751
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了人类胸腺和外周血中T细胞发育与衰老的动态过程 | 首次结合单细胞测序和TCR测序,揭示了胸腺衰老对T细胞谱系潜力和外周T细胞老化的影响,并建立了基于初始T细胞的免疫年龄预测模型 | 样本量相对有限,且研究主要基于转录组数据,功能验证不足 | 探究年龄相关胸腺退化的机制及其对外周T细胞的影响 | 人类胸腺和外周血细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关免疫疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 387,762个细胞,来自年轻和年老个体的胸腺和外周血 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 771 | 2025-12-16 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
|
研究论文 | 本研究揭示了SPOP通过降解STING促进黑色素瘤生长,并发现SPOP抑制剂可作为分子胶降解剂增强STING依赖性免疫治疗效果 | 首次发现SPOP抑制剂具有分子胶降解剂功能,能重定向SPOP降解新底物如CBX4,从而增强DNA损伤和先天免疫反应 | 研究主要基于小鼠黑色素瘤模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探索SPOP在肿瘤免疫中的作用及其抑制剂在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤细胞、小鼠B16肿瘤模型、STING蛋白、CBX4蛋白 | 癌症免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫检查点阻断、CAR-T细胞疗法 | NA | RNA-seq数据、免疫细胞浸润数据 | 小鼠B16肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 772 | 2025-12-16 |
Artificial Intelligence and Multimodality Data Integration Decipher Tertiary Lymphoid Structure Maturity in Gastric Cancer
2025-Dec-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1793
PMID:41150905
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于Transformer的深度学习模型,用于从胃腺癌全切片图像中定量表征三级淋巴结构(TLS)的成熟度,并结合多组学数据揭示了成熟TLS中关键的免疫细胞相互作用 | 首次开发了基于Transformer的AI模型来自动化评估胃腺癌中TLS成熟度,并通过整合单细胞RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术和功能共培养实验,揭示了CD8+组织驻留记忆T细胞与B细胞通过CXCL13-CXCR5轴形成的免疫回路 | 样本量相对有限(单细胞RNA测序仅来自17例患者),且模型在外部验证队列中的泛化能力未明确说明 | 开发自动化工具以评估胃腺癌中三级淋巴结构的成熟度,并探究其与患者预后及抗肿瘤免疫机制的关系 | 胃腺癌患者组织样本及其相关的多模态数据 | 数字病理学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 功能共培养实验 | Transformer | 图像, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 253例胃腺癌患者(全切片图像),其中17例进行了单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 773 | 2025-12-16 |
The cell-type-specific genetic architecture of chronic pain in brain and dorsal root ganglia
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI197583
PMID:41055971
|
研究论文 | 本研究整合了慢性疼痛的GWAS数据与人类大脑和背根神经节的单细胞RNA测序数据,揭示了慢性疼痛在特定细胞类型中的遗传结构 | 通过整合GWAS与单细胞测序数据,首次系统性地揭示了慢性疼痛在中央和周围神经系统特定细胞类型中的遗传富集模式,包括谷氨酸能神经元和特定神经元亚型 | 研究主要基于相关性分析,未进行功能验证实验;样本来源和数量可能限制结果的普适性;依赖动物模型数据可能不完全反映人类生物学 | 探究慢性疼痛在细胞类型特异性层面的遗传基础,以理解其病理机制 | 人类大脑、背根神经节(hDRG)、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | GWAS, 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组关联数据, 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞染色质可及性分析 | NA | NA |
| 774 | 2025-12-16 |
IL-17-producing γδ T cells in the tumor microenvironment promote radioresistance in mice
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193945
PMID:41055972
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤微环境中产生IL-17的γδ T细胞通过招募髓源性抑制细胞促进小鼠放疗抵抗的机制 | 首次阐明了放疗后肿瘤微环境中γδ T细胞通过产生IL-17A促进放疗抵抗的具体机制,并发现肿瘤细胞来源的微粒通过cGAS-STING/NF-κB通路调控CCL20表达的关键作用 | 研究基于小鼠模型,在人体中的适用性有待验证;机制研究主要集中在γδ T细胞和巨噬细胞的相互作用,其他免疫细胞的作用可能未完全涵盖 | 探究γδ T细胞在肿瘤放疗抵抗中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型中的γδ T细胞、髓源性抑制细胞、巨噬细胞及肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 775 | 2025-12-16 |
Distinct Cellular and Molecular Patterns in Pretreatment Peripheral Blood Are Associated with CAR T-cell Outcomes in Diffuse Large B-cell Lymphoma
2025-Dec-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3596
PMID:41071708
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者治疗前外周血样本和CAR T细胞产品,揭示了与临床结局相关的分子和细胞特征 | 首次在单细胞水平上系统关联了治疗前外周血免疫特征与CAR T细胞治疗结局,并识别了与良好反应相关的B细胞存在 | 样本量相对有限(57例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性验证 | 探究CAR T细胞治疗在弥漫性大B细胞淋巴瘤中反应和耐药的决定因素 | 57例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的治疗前外周血样本和抗CD19 CAR T细胞产品 | 单细胞组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 57例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2025-12-16 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals RNA-Binding Protein Dysregulation in Immune Checkpoint Inhibitor-Induced Colitis
2025-Dec-15, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf181
PMID:41392552
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了RNA结合蛋白在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎中的失调作用 | 首次系统性地在单细胞水平上鉴定了免疫检查点抑制剂诱导结肠炎中RNA结合蛋白的细胞类型特异性表达模式,并识别出与疾病相关的关键RBP簇和分子 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据进行重新分析,未进行实验验证,且样本来源和数量可能有限 | 探究RNA结合蛋白在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎发病机制中的作用 | 从免疫检查点抑制剂结肠炎患者、免疫检查点抑制剂治疗非结肠炎患者和健康对照中分离的CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自免疫检查点抑制剂结肠炎患者、免疫检查点抑制剂治疗非结肠炎患者和健康对照的CD45+免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2025-12-16 |
Single-cell RNA sequencing informs precision targeting of monogenic lupus associated with IKZF1 haploinsufficiency
2025-Dec-15, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70017
PMID:41392616
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探究了由IKZF1单倍体不足驱动的单基因狼疮患者的免疫失调机制 | 首次将单细胞RNA测序应用于IKZF1单倍体不足相关的单基因狼疮患者,揭示了B细胞和T细胞的特定失调模式,并基于此提出了精准靶向治疗策略 | 研究仅基于一名儿科患者,样本量较小,限制了结果的普适性 | 探究IKZF1单倍体不足导致的单基因狼疮的免疫失调机制,并为精准治疗提供依据 | IKZF1单倍体不足的儿科狼疮患者、无已知基因突变的狼疮病例及健康对照者的外周免疫细胞 | 数字病理学 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 一名IKZF1单倍体不足患者、多名狼疮病例及健康对照者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 778 | 2025-12-16 |
Cholesterol-metabolic TAMs regulates tumor budding like cell subpopulation to promote chordoma stemness via BACH1/ANGPTL4/SDC4 axis
2025-Dec-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf286
PMID:41390963
|
研究论文 | 本研究揭示了脊索瘤中肿瘤出芽样结构的存在及其通过BACH1/ANGPTL4/SDC4轴与胆固醇代谢性肿瘤相关巨噬细胞相互作用,促进肿瘤干细胞性和恶性进展的机制 | 首次在脊索瘤中定义并评估了肿瘤出芽样结构,并发现了胆固醇代谢性肿瘤相关巨噬细胞通过BACH1-ANGPTL4-SDC4信号轴激活肿瘤出芽样细胞亚群的新机制 | 研究主要基于回顾性队列和临床前模型,需要进一步的前瞻性临床验证 | 探究脊索瘤中肿瘤出芽样结构的分子机制及其对肿瘤进展的功能影响 | 481例脊索瘤患者的肿瘤样本及临床前模型 | 数字病理学 | 脊索瘤 | GeoMx数字空间分析、空间转录组学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多重定量免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 481例脊索瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2025-12-16 |
High-throughput proteomics uncovers molecular clusters and biomarkers of severity in bullous pemphigoid
2025-Dec-14, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70252
PMID:41392513
|
研究论文 | 本研究利用高通量蛋白质组学技术,分析了天疱疮患者的皮肤和血清样本,揭示了疾病相关的分子簇和严重程度生物标志物 | 首次在天疱疮中通过蛋白质组学识别出两个不同的皮肤分子簇,并发现CCL13作为关键的炎症蛋白与疾病活动性相关 | 样本量较小(29例皮肤活检和27例血清样本),且为单中心研究,可能限制结果的普遍性 | 全面分析天疱疮的局部和全身炎症反应,探索其与疾病严重程度、临床特征和治疗结果的关联 | 天疱疮患者的皮肤活检和血清样本,以及健康对照样本 | 蛋白质组学 | 天疱疮 | Olink Target 96炎症面板蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | 主成分分析、无监督聚类、差异表达分析、基因集富集分析、k-means聚类 | 蛋白质组数据、转录组数据 | 29例天疱疮皮肤活检、27例匹配血清样本、14例健康对照 | Olink | 高通量蛋白质组学 | Olink Target 96 Inflammation panel | 用于炎症相关蛋白质的靶向蛋白质组学分析 |
| 780 | 2025-12-16 |
Spatially defined multicellular functional units in colorectal cancer revealed from single cell and spatial transcriptomics
2025-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104815
PMID:41384492
|
研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序、Slide-seq空间转录组学和原位多重RNA分析,绘制了健康和发育不良结肠细胞生态系统的详细空间图谱,并揭示了其在结直肠癌进展中的关联 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术,首次在结直肠癌中定义了具有特定空间组织和功能交互的多细胞功能单元,并验证了小鼠模型与人类疾病之间的保守性 | 研究主要基于小鼠模型,虽然与人类数据进行了比较,但直接应用于临床仍需进一步验证 | 揭示结直肠癌中细胞的空间组织和功能交互,以理解疾病进展机制 | 健康和发育不良的结肠组织,包括诱导性遗传结直肠癌小鼠模型和人类结直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原位多重RNA分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Slide-seq | NA |