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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2025-12-18 |
Cancer associated fibroblast exosomal miR-214-3p regulated by hnRNPA2B1 promotes cisplatin resistance by inhibiting ferroptosis
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003946
PMID:41405275
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研究论文 | 本研究揭示了hnRNPA2B1通过调控CAF中外泌体miR-214-3p的分选,促进骨肉瘤顺铂耐药的新机制 | 首次发现hnRNPA2B1通过识别GGAG基序调控CAF外泌体中miR-214-3p的分选,并阐明该外泌体通过抑制GPX4表达减少铁死亡从而介导顺铂耐药 | 研究主要聚焦于骨肉瘤,未在其他癌症类型中验证该机制;体内实验数据可能有限 | 探究CAF外泌体介导的骨肉瘤顺铂耐药机制 | 骨肉瘤细胞、癌症相关成纤维细胞(CAF)、外泌体 | 单细胞组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、RNA免疫沉淀、外泌体功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、分子表达数据 | 顺铂敏感与耐药样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 742 | 2025-12-18 |
Natural killer cell infiltration elicits gender-dependent dichotomous clinical outcomes in urothelial carcinoma
2025-Dec-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.70196
PMID:41368948
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研究论文 | 本研究通过多队列回顾性分析,揭示了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中具有性别依赖性的临床影响 | 首次系统阐明了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中的性别二态性临床作用,并揭示了其背后不同的功能状态和肿瘤微环境特征 | 研究为回顾性设计,需前瞻性研究验证;机制探索尚不完整 | 探究自然杀伤细胞如何介导尿路上皮癌的性别差异及其临床意义 | 尿路上皮癌患者 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 免疫组化、转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 885名患者(671名男性,214名女性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 743 | 2025-12-18 |
Targeting KRAS Inhibitor-Resistant Pancreatic Cancer with an MUC1-C Antibody-Drug Conjugate
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2333
PMID:41086055
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研究论文 | 本研究探讨了MUC1-C蛋白在介导胰腺导管腺癌细胞对KRAS抑制剂耐药中的作用,并评估了抗MUC1-C抗体药物偶联物的治疗效果 | 揭示了KRAS G12D抑制通过激活MUC1-C/NF-κB p65自诱导通路上调MUC1-C蛋白,进而驱动耐药的新机制,并首次证明抗MUC1-C ADC能有效克服KRAS抑制剂耐药 | 研究主要基于KRAS G12D突变模型,未涵盖其他KRAS突变类型;临床前模型的转化潜力需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌对KRAS抑制剂耐药的机制,并开发针对耐药的新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及PDAC患者肿瘤样本 | 癌症生物学与治疗学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学染色、体外和体内药效评估 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、药效数据 | 3个PDAC KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及未明确数量的PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 744 | 2025-12-18 |
Systematic scRNA-seq screens profile neural organoid response to morphogens
2025-Dec-15, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02927-5
PMID:41398501
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研究论文 | 本研究通过系统性的单细胞RNA测序筛选,全面描绘了人类神经类器官对形态发生素的响应模式 | 首次在人类神经类器官中系统性地研究了形态发生素的时间、浓度和组合对神经上皮区域特化的影响,并整合深度学习模型预测分化结果 | 研究主要基于体外类器官模型,与体内发育环境的生理相关性仍需进一步验证 | 解析形态发生素在人类神经类器官区域化过程中的调控机制 | 人类神经类器官 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及多条件、多时间点的系统性筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 745 | 2025-12-18 |
Identification of diagnostic and prognostic phospholipid biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis via machine learning and in vivo validation
2025-Dec-12, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00845-3
PMID:41388329
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研究论文 | 本研究通过整合多个数据集的微阵列数据,利用机器学习技术构建了特发性肺纤维化(IPF)的诊断和预后模型,并鉴定了磷脂相关的生物标志物 | 结合加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习方法,首次开发了基于8个基因的诊断模型和11个基因的预后模型,并通过单细胞测序和动物模型验证了关键基因GABARAPL1和UNC13B在IPF中的下调表达 | 需要进一步验证以评估其临床适用性 | 鉴定特发性肺纤维化(IPF)的诊断和预后磷脂生物标志物 | 特发性肺纤维化(IPF)患者和IPF小鼠模型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 微阵列数据分析,加权基因共表达网络分析(WGCNA),单细胞测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 来自八个数据集的微阵列数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 746 | 2025-12-18 |
Deciphering precursor cell dynamics in esophageal preneoplasia via genetic barcoding and single-cell transcriptomics
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509534122
PMID:41337486
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研究论文 | 本研究通过结合遗传条形码技术与单细胞转录组测序,追踪了食管癌前病变细胞的谱系,揭示了具有高可塑性的前体细胞群及其在肿瘤发生早期的作用 | 首次将遗传条形码技术与单细胞RNA测序相结合,用于追踪食管癌前病变细胞的谱系动态,并鉴定出具有高可塑性的独特前体细胞群 | NA | 阐明食管癌前病变细胞的起源、谱系轨迹及其在早期肿瘤发生中的作用 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 遗传条形码技术,单细胞RNA测序,空间转录组学 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 747 | 2025-12-18 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces the tumor-infiltrating Treg phenotype for tumor growth
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424251122
PMID:41343674
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤微环境中前列腺素E2通过EP2/EP4信号通路诱导肿瘤浸润性调节性T细胞表型,从而促进肿瘤生长的核心机制 | 首次鉴定出PGE2-EP2/EP4-cAMP-PKA通路是诱导跨物种、跨肿瘤类型保守的TI-Treg表型的共同机制,并证实其在人和小鼠模型中的关键作用 | 研究主要聚焦于PGE2信号通路,肿瘤微环境中可能还存在其他诱导TI-Treg表型的机制未被探讨 | 探究肿瘤微环境中诱导肿瘤浸润性调节性T细胞独特表型的分子机制及其对肿瘤生长的影响 | 小鼠和人类的调节性T细胞(包括诱导性Tregs和天然Tregs)、Lewis肺癌模型、鼻咽癌患者单细胞数据 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、鼻咽癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、细胞功能数据 | 小鼠肿瘤模型、人类鼻咽癌患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 748 | 2025-12-18 |
Hybrid identity and distinct methylation profiles of incomplete intestinal metaplasia in the stomach
2025-Dec-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335793
PMID:40691053
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学、DNA甲基化分析和单细胞RNA测序,揭示了胃不完全肠上皮化生(Inc IM)的分子特征及其作为胃癌前病变的角色 | 首次利用空间转录组学结合定制谱系富集面板,揭示了Inc IM的混合谱系特征和起源于深部胃窦腺细胞,并发现其与胃癌(特别是微卫星稳定型肿瘤)的分子相似性 | 研究主要基于组织样本和类器官模型,可能无法完全反映体内环境的复杂性,且样本量未明确说明 | 阐明Inc IM的分子身份、分化潜能和致癌相关性,以确定其作为胃癌前病变的真实性 | 胃肠上皮化生(GIM)组织、胃癌组织以及亚型特异性GIM类器官模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学、DNA甲基化分析、染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、甲基化数据、染色质可及性数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 定制谱系富集面板用于空间转录组学分析 |
| 749 | 2025-12-18 |
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Dec-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084
PMID:40695620
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪肝相关肝癌中独特的肿瘤微环境免疫抑制机制,并发现靶向TNFSF14-TNFRSF14信号轴可增强免疫治疗效果 | 首次结合单细胞转录组、质谱流式细胞术和两种独立的空间转录组学平台,系统解析了SLD-HCC的免疫微环境,并识别出Treg-CAF通过TNFSF14-TNFRSF14信号介导的相互作用是驱动免疫治疗抵抗的关键机制 | 研究样本量相对有限(22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC),且主要基于观察性数据和动物模型验证,临床转化仍需进一步大规模临床试验证实 | 探究脂肪肝相关肝癌的免疫微环境特征、免疫抑制机制及免疫治疗抵抗的原因,以寻找新的治疗靶点 | 脂肪肝相关肝细胞癌患者的肿瘤组织、HCC动物模型以及接受免疫治疗的患者队列 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、空间转录组学、多重免疫组织化学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间定位数据、组织图像数据 | 22例SLD-HCC患者和31例非SLD-HCC患者的肿瘤样本,以及103例患者的独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 750 | 2025-12-18 |
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2025-Dec, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287463
PMID:39639676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,对人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体进行了转录组学分析,揭示了不同细胞簇在激素表达、营养感知机制等方面的差异 | 首次通过CRISPR-Cas9基因编辑技术构建CHGA-Venus标记的人类小肠类器官模型,并结合10X单细胞RNA测序技术,系统性地绘制了人类肠内分泌细胞的转录组图谱,发现了不同细胞类型在营养感知受体(如GPBAR1、FFAR1、FFAR2、OR51E1、SLC5A1)上的差异表达模式 | 研究基于类器官模型,可能无法完全模拟体内肠内分泌细胞的复杂微环境;样本来源仅限于十二指肠和回肠,未涵盖整个肠道区域;肠内分泌细胞在肠道上皮中占比仅约1%,在现有单细胞图谱中代表性不足 | 绘制人类肠内分泌细胞的单细胞转录组图谱,比较不同细胞类型的相似性和差异,以促进针对肠内分泌轴的药物开发 | 人类十二指肠和回肠活检组织来源的类器官中的肠内分泌细胞 | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病、肥胖症、肠道疾病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑、流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类十二指肠和回肠活检组织来源的类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Chromium | 10X单细胞RNA测序平台 |
| 751 | 2025-12-18 |
Imbalances in adrenal hormones and their effects on bone metabolism
2025-Dec-01, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ25-0117
PMID:40545362
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综述 | 本文综述了肾上腺激素失衡对骨代谢的影响,重点关注自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症和嗜铬细胞瘤/副神经节瘤三种病理状态,以及衰老过程中的激素变化 | 总结了近期类固醇谱分析和单细胞转录组分析的新发现,揭示了肾上腺皮质腺瘤中多种类固醇激素共同影响骨代谢,而非单一激素的作用 | 本文为综述性文章,未提供新的原始研究数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨肾上腺激素失衡对骨健康的影响机制 | 肾上腺激素(皮质醇、醛固酮、儿茶酚胺等)与骨代谢的相互作用 | NA | 骨质疏松症 | 类固醇谱分析,单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 752 | 2025-12-18 |
Randomized controlled clinical trial of Shenzhuo Formula in the treatment of macroalbuminuria in diabetic kidney disease and its inflammation-modulating mechanisms
2025-Dec, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf031
PMID:41393243
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研究论文 | 一项随机对照临床试验评估了肾浊方治疗糖尿病肾病大量蛋白尿的疗效,并探讨了其调节炎症的机制 | 首次在随机双盲对照试验中评估肾浊方对糖尿病肾病大量蛋白尿患者的疗效,并结合Olink炎症蛋白组学、单细胞RNA测序及体内实验揭示其通过下调CX3CL1和MCP-1介导的抗炎作用机制 | 样本量相对较小(120例患者),研究周期为24周,长期疗效和安全性需进一步验证 | 评估肾浊方治疗糖尿病肾病大量蛋白尿的疗效和安全性,并探究其抗炎作用机制 | 糖尿病肾病伴大量蛋白尿患者(120例)及KK-Ay小鼠肾脏组织 | NA | 糖尿病肾病 | Olink炎症蛋白组学,单细胞RNA测序,体内实验 | NA | 临床数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据 | 120例患者(肾浊方组57例,厄贝沙坦组63例)及KK-Ay小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 753 | 2025-12-18 |
Targeting B cells in IgA nephropathy: from pathogenic insight to therapeutic horizon
2025-Dec, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf322
PMID:41393859
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综述 | 本文综述了IgA肾病中B细胞的靶向治疗,从病理机制到治疗前景 | 聚焦于B细胞在IgA肾病中的致病作用,并探讨了靶向黏膜免疫系统、B细胞生存和分化途径的新型治疗策略,包括晚期开发中的药物和新兴细胞及双特异性平台 | NA | 探讨IgA肾病中B细胞靶向治疗的机制、进展和未来方向 | IgA肾病(IgAN)患者 | NA | IgA肾病 | 单细胞转录组学、药物基因组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 754 | 2025-12-18 |
Uncovering the genetic architecture of pungency, carotenoids, and flavor in Capsicum chinense via TWAS-mGWAS integration and spatial transcriptomics
2025-Dec, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf243
PMID:41393923
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学、全基因组关联分析(GWAS)、转录组关联分析(TWAS)和空间转录组学,揭示了辣椒果实辛辣度、类胡萝卜素和风味的遗传与调控基础 | 首次在辣椒中整合GWAS、TWAS和空间转录组学分析,并利用CRISPR/Cas9基因编辑在番茄中验证候选基因功能 | NA | 解析辣椒果实辛辣度、颜色和风味等品质性状的遗传与调控机制 | 244个不同辣椒种质资源及其果实组织 | 植物遗传学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联研究(GWAS)、转录组关联研究(TWAS)、空间转录组学(Stereo-seq)、CRISPR/Cas9基因编辑、广泛靶向代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、空间转录组数据 | 244个辣椒种质资源 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 755 | 2025-12-17 |
Multi-omics characterization of autophagy-related molecular features in intrahepatic cholestasis of pregnancy†
2025-Dec-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf184
PMID:40796229
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研究论文 | 本研究通过多组学方法系统表征了妊娠期肝内胆汁淤积症中自噬相关的分子特征 | 首次结合非靶向脂质组学、单细胞RNA测序和RNA测序数据,全面揭示ICP中自噬相关脂质、细胞和基因表达变化,并验证了TNFSF10作为潜在治疗靶点 | 样本量未在摘要中明确说明,可能限制结果的普遍性 | 探究自噬在妊娠期肝内胆汁淤积症发病机制中的作用 | 胎盘组织、细胞模型和动物模型 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 非靶向脂质组学, scRNA-seq, RNA-seq | NA | 脂质组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 756 | 2025-12-17 |
Vitamin D Regulates Olfactory Function via Dual Transcriptional and mTOR-Dependent Translational Control of Synaptic Proteins
2025-Dec-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507181
PMID:41400017
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研究论文 | 本文揭示了维生素D通过VDR受体和mTOR信号通路,在转录和翻译水平上调控嗅球僧帽细胞突触蛋白表达,从而影响嗅觉功能的细胞特异性机制 | 首次发现维生素D通过VDR-mTOR翻译调控轴与经典转录调控并行作用,将营养状态与突触功能及感觉处理直接联系起来 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的相关性及临床转化潜力尚需进一步验证 | 探究维生素D缺乏与神经功能障碍的细胞类型特异性机制 | 小鼠(从断奶到成年期控制维生素D水平) | 神经科学 | 神经功能障碍 | 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、染色质结合数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 757 | 2025-12-17 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2025-Dec-15, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
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研究论文 | 本研究利用大鼠模型,通过bulk和空间转录组学技术,揭示了创伤诱导急性肾损伤中出血性休克和横纹肌溶解的个体及协同作用机制 | 首次在临床相关大鼠模型中结合bulk和空间转录组学,成功将小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾脏组织,实现了成本效益高且区域特异性的基因表达分析 | 研究基于大鼠模型,结果向人类临床转化的直接适用性需进一步验证 | 阐明创伤诱导急性肾损伤的分子机制,以识别新型生物标志物和治疗策略 | 大鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 758 | 2025-12-17 |
New insights into macrophage heterogeneity in renal injury and repair
2025-Dec-15, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70369
PMID:41396841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤不同阶段的动态变化和异质性 | 识别了四种不同的肾脏巨噬细胞亚群,并阐明了单核来源巨噬细胞在损伤进展中驱动炎症,而肾脏驻留Cx3cr1巨噬细胞通过AXL-GAS6信号介导的胞葬作用促进修复 | NA | 探究巨噬细胞在急性肾损伤中的异质性及其在肾脏损伤和修复中的作用 | 巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤模型中的动态变化 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 759 | 2025-12-17 |
Breaking and making genes: the genesis of novel traits in plants
2025-Dec-15, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70844
PMID:41398987
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综述 | 本文综述了植物中基因融合事件的分子机制、功能及其在适应性进化中的作用 | 系统性地概述了植物中基因融合的形成机制及其在功能多样化和适应性中的重要性,填补了该领域相对研究不足的空白 | NA | 探讨基因融合在植物新性状形成和适应性进化中的机制与功能 | 植物基因融合事件 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序技术,单细胞测序平台 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 760 | 2025-12-17 |
Single Cell RNAseq Analysis of Thyroid Hormone Effects on Retinal Glial Cells
2025-Dec-15, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.1221
PMID:41400582
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了三碘甲状腺原氨酸对视网膜胶质细胞的转录组影响 | 首次在单细胞分辨率下系统分析甲状腺激素对视网膜胶质细胞转录调控的异质性 | 研究仅使用小鼠模型,未验证人类样本;实验周期较短(4周),未评估长期效应 | 揭示甲状腺激素信号如何通过调控视网膜胶质细胞转录组参与视网膜退行性病变 | C57BL/6小鼠的视网膜胶质细胞(Müller细胞、星形胶质细胞、小胶质细胞) | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1月龄C57BL/6小鼠(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |