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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-12-18 |
Integrating RNA-seq and Single-Cell RNA-seq to Uncover Transcriptional Signature of Fibroblasts in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Dec-16, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11310-0
PMID:41402612
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 722 | 2025-12-18 |
POU5F1 upregulates SPP1 to sustain stem-like traits and malignant phenotypes via JAK1/STAT3 in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004469
PMID:41403335
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研究论文 | 本研究揭示了POU5F1通过上调SPP1并激活JAK1/STAT3信号通路,维持透明细胞肾细胞癌的干细胞样特性和恶性表型 | 首次系统验证了POU5F1-SPP1-JAK1/STAT3轴在ccRCC中的作用机制,为同时靶向肿瘤细胞和癌症干细胞提供了新的治疗策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本量有限(30对组织),需要更大规模的临床验证 | 探究SPP1在透明细胞肾细胞癌中的功能及其上游调控机制 | 透明细胞肾细胞癌组织样本(30对)、786-O/769-P细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA-seq、功能实验(增殖、迁移、肿瘤球形成)、分子机制研究(ChIP、Co-IP、双荧光素酶报告基因检测)、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床生存数据 | 30对ccRCC组织样本、2种细胞系(786-O/769-P)、裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2025-12-18 |
Prognostic role of stress granule-related Gene signatures in pancreatic ductal adenocarcinoma: insights from 101-combination machine learning and single-cell sequencing
2025-Dec-16, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004458
PMID:41403347
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研究论文 | 本研究通过结合机器学习与单细胞测序技术,开发并验证了一个基于应激颗粒相关基因的胰腺导管腺癌预后风险模型 | 首次利用101种机器学习算法组合识别预后相关的应激颗粒基因,并结合单细胞测序分析关键细胞类型与细胞间通讯 | 研究依赖于公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性队列验证 | 探究应激颗粒在胰腺导管腺癌中的机制,重点关注风险分层与治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者及其相关基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习算法组合(包括Cox回归等) | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个PDAC数据集,包括单细胞数据集GSE197177 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2025-12-18 |
Natural killer cell infiltration elicits gender-dependent dichotomous clinical outcomes in urothelial carcinoma
2025-Dec-15, Cancer
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/cncr.70196
PMID:41368948
|
研究论文 | 本研究通过多队列回顾性分析,揭示了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中具有性别依赖性的临床影响 | 首次系统阐明了自然杀伤细胞在尿路上皮癌中的性别二态性临床作用,并揭示了其背后不同的功能状态和肿瘤微环境特征 | 研究为回顾性设计,需前瞻性研究验证;机制探索尚不完整 | 探究自然杀伤细胞如何介导尿路上皮癌的性别差异及其临床意义 | 尿路上皮癌患者 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 免疫组化、转录组学、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 图像、文本(转录组数据) | 885名患者(671名男性,214名女性) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 725 | 2025-12-18 |
Targeting KRAS Inhibitor-Resistant Pancreatic Cancer with an MUC1-C Antibody-Drug Conjugate
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2333
PMID:41086055
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研究论文 | 本研究探讨了MUC1-C蛋白在介导胰腺导管腺癌细胞对KRAS抑制剂耐药中的作用,并评估了抗MUC1-C抗体药物偶联物的治疗效果 | 揭示了KRAS G12D抑制通过激活MUC1-C/NF-κB p65自诱导通路上调MUC1-C蛋白,进而驱动耐药的新机制,并首次证明抗MUC1-C ADC能有效克服KRAS抑制剂耐药 | 研究主要基于KRAS G12D突变模型,未涵盖其他KRAS突变类型;临床前模型的转化潜力需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌对KRAS抑制剂耐药的机制,并开发针对耐药的新型治疗策略 | 胰腺导管腺癌KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及PDAC患者肿瘤样本 | 癌症生物学与治疗学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学染色、体外和体内药效评估 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、药效数据 | 3个PDAC KRAS G12D突变细胞系、患者来源的耐药类器官和异种移植模型,以及未明确数量的PDAC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 726 | 2025-12-18 |
Prostaglandin E2-EP2/EP4 signaling induces the tumor-infiltrating Treg phenotype for tumor growth
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424251122
PMID:41343674
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研究论文 | 本文揭示了肿瘤微环境中前列腺素E2通过EP2/EP4信号通路诱导肿瘤浸润性调节性T细胞表型,从而促进肿瘤生长的核心机制 | 首次鉴定出PGE2-EP2/EP4-cAMP-PKA通路是诱导跨物种、跨肿瘤类型保守的TI-Treg表型的共同机制,并证实其在人和小鼠模型中的关键作用 | 研究主要聚焦于PGE2信号通路,肿瘤微环境中可能还存在其他诱导TI-Treg表型的机制未被探讨 | 探究肿瘤微环境中诱导肿瘤浸润性调节性T细胞独特表型的分子机制及其对肿瘤生长的影响 | 小鼠和人类的调节性T细胞(包括诱导性Tregs和天然Tregs)、Lewis肺癌模型、鼻咽癌患者单细胞数据 | 肿瘤免疫学 | 肺癌、鼻咽癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、细胞功能实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、细胞功能数据 | 小鼠肿瘤模型、人类鼻咽癌患者单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 727 | 2025-12-18 |
Targeting Treg-fibroblast interaction to enhance immunotherapy in steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Dec-05, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335084
PMID:40695620
|
研究论文 | 本研究揭示了脂肪肝相关肝癌中独特的肿瘤微环境免疫抑制机制,并发现靶向TNFSF14-TNFRSF14信号轴可增强免疫治疗效果 | 首次结合单细胞转录组、质谱流式细胞术和两种独立的空间转录组学平台,系统解析了SLD-HCC的免疫微环境,并识别出Treg-CAF通过TNFSF14-TNFRSF14信号介导的相互作用是驱动免疫治疗抵抗的关键机制 | 研究样本量相对有限(22例SLD-HCC和31例非SLD-HCC),且主要基于观察性数据和动物模型验证,临床转化仍需进一步大规模临床试验证实 | 探究脂肪肝相关肝癌的免疫微环境特征、免疫抑制机制及免疫治疗抵抗的原因,以寻找新的治疗靶点 | 脂肪肝相关肝细胞癌患者的肿瘤组织、HCC动物模型以及接受免疫治疗的患者队列 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、空间转录组学、多重免疫组织化学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间定位数据、组织图像数据 | 22例SLD-HCC患者和31例非SLD-HCC患者的肿瘤样本,以及103例患者的独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 728 | 2025-12-18 |
Imbalances in adrenal hormones and their effects on bone metabolism
2025-Dec-01, Endocrine journal
IF:1.3Q4
DOI:10.1507/endocrj.EJ25-0117
PMID:40545362
|
综述 | 本文综述了肾上腺激素失衡对骨代谢的影响,重点关注自主皮质醇分泌、原发性醛固酮增多症和嗜铬细胞瘤/副神经节瘤三种病理状态,以及衰老过程中的激素变化 | 总结了近期类固醇谱分析和单细胞转录组分析的新发现,揭示了肾上腺皮质腺瘤中多种类固醇激素共同影响骨代谢,而非单一激素的作用 | 本文为综述性文章,未提供新的原始研究数据,主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨肾上腺激素失衡对骨健康的影响机制 | 肾上腺激素(皮质醇、醛固酮、儿茶酚胺等)与骨代谢的相互作用 | NA | 骨质疏松症 | 类固醇谱分析,单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2025-12-18 |
Randomized controlled clinical trial of Shenzhuo Formula in the treatment of macroalbuminuria in diabetic kidney disease and its inflammation-modulating mechanisms
2025-Dec, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbaf031
PMID:41393243
|
研究论文 | 一项随机对照临床试验评估了肾浊方治疗糖尿病肾病大量蛋白尿的疗效,并探讨了其调节炎症的机制 | 首次在随机双盲对照试验中评估肾浊方对糖尿病肾病大量蛋白尿患者的疗效,并结合Olink炎症蛋白组学、单细胞RNA测序及体内实验揭示其通过下调CX3CL1和MCP-1介导的抗炎作用机制 | 样本量相对较小(120例患者),研究周期为24周,长期疗效和安全性需进一步验证 | 评估肾浊方治疗糖尿病肾病大量蛋白尿的疗效和安全性,并探究其抗炎作用机制 | 糖尿病肾病伴大量蛋白尿患者(120例)及KK-Ay小鼠肾脏组织 | NA | 糖尿病肾病 | Olink炎症蛋白组学,单细胞RNA测序,体内实验 | NA | 临床数据,蛋白质组学数据,单细胞RNA测序数据 | 120例患者(肾浊方组57例,厄贝沙坦组63例)及KK-Ay小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2025-12-18 |
Targeting B cells in IgA nephropathy: from pathogenic insight to therapeutic horizon
2025-Dec, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf322
PMID:41393859
|
综述 | 本文综述了IgA肾病中B细胞的靶向治疗,从病理机制到治疗前景 | 聚焦于B细胞在IgA肾病中的致病作用,并探讨了靶向黏膜免疫系统、B细胞生存和分化途径的新型治疗策略,包括晚期开发中的药物和新兴细胞及双特异性平台 | NA | 探讨IgA肾病中B细胞靶向治疗的机制、进展和未来方向 | IgA肾病(IgAN)患者 | NA | IgA肾病 | 单细胞转录组学、药物基因组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2025-12-18 |
Uncovering the genetic architecture of pungency, carotenoids, and flavor in Capsicum chinense via TWAS-mGWAS integration and spatial transcriptomics
2025-Dec, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf243
PMID:41393923
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组学、全基因组关联分析(GWAS)、转录组关联分析(TWAS)和空间转录组学,揭示了辣椒果实辛辣度、类胡萝卜素和风味的遗传与调控基础 | 首次在辣椒中整合GWAS、TWAS和空间转录组学分析,并利用CRISPR/Cas9基因编辑在番茄中验证候选基因功能 | NA | 解析辣椒果实辛辣度、颜色和风味等品质性状的遗传与调控机制 | 244个不同辣椒种质资源及其果实组织 | 植物遗传学 | NA | 代谢组学分析、全基因组关联研究(GWAS)、转录组关联研究(TWAS)、空间转录组学(Stereo-seq)、CRISPR/Cas9基因编辑、广泛靶向代谢组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、空间转录组数据 | 244个辣椒种质资源 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 732 | 2025-12-17 |
Multi-omics characterization of autophagy-related molecular features in intrahepatic cholestasis of pregnancy†
2025-Dec-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf184
PMID:40796229
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研究论文 | 本研究通过多组学方法系统表征了妊娠期肝内胆汁淤积症中自噬相关的分子特征 | 首次结合非靶向脂质组学、单细胞RNA测序和RNA测序数据,全面揭示ICP中自噬相关脂质、细胞和基因表达变化,并验证了TNFSF10作为潜在治疗靶点 | 样本量未在摘要中明确说明,可能限制结果的普遍性 | 探究自噬在妊娠期肝内胆汁淤积症发病机制中的作用 | 胎盘组织、细胞模型和动物模型 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 非靶向脂质组学, scRNA-seq, RNA-seq | NA | 脂质组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2025-12-17 |
Single Cell RNAseq Analysis of Thyroid Hormone Effects on Retinal Glial Cells
2025-Dec-15, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.1221
PMID:41400582
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探究了三碘甲状腺原氨酸对视网膜胶质细胞的转录组影响 | 首次在单细胞分辨率下系统分析甲状腺激素对视网膜胶质细胞转录调控的异质性 | 研究仅使用小鼠模型,未验证人类样本;实验周期较短(4周),未评估长期效应 | 揭示甲状腺激素信号如何通过调控视网膜胶质细胞转录组参与视网膜退行性病变 | C57BL/6小鼠的视网膜胶质细胞(Müller细胞、星形胶质细胞、小胶质细胞) | 单细胞转录组学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1月龄C57BL/6小鼠(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 734 | 2025-12-17 |
Uncovering functional divergence and cellular clusters with specific gene signatures in HNSCC clonal spheroids
2025-Dec-12, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02360-3
PMID:41388470
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研究论文 | 本研究通过生成头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的克隆球体,揭示了其功能异质性,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了与增殖和迁移相关的不同细胞簇及其基因特征 | 首次在HNSCC克隆球体中系统识别了超增殖和低增殖球体的功能差异,并通过单细胞RNA测序揭示了与肿瘤微环境相关的特定细胞簇和基因表达谱 | 研究基于细胞系和患者肿瘤细胞生成的球体模型,可能无法完全模拟体内肿瘤的复杂性,且样本来源有限 | 探究HNSCC克隆球体的功能异质性及其与肿瘤进展的关系 | HNSCC细胞系和患者肿瘤细胞生成的克隆球体 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 来自HNSCC细胞系和患者肿瘤细胞的克隆球体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2025-12-17 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Dec-11, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12201-9
PMID:41382277
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研究论文 | 本研究通过整合固定细胞和活细胞数据,更新了Hydractinia symbiolongicarpus的单细胞图谱,揭示了细胞类型多样性和空间表达模式 | 整合新数据集扩展了细胞数量至超过47,000个,识别了新的免疫细胞群、神经亚型、空间不同的腺细胞群以及完整的刺细胞发育轨迹 | NA | 构建并验证Hydractinia symbiolongicarpus的更新单细胞图谱,以促进对刺胞动物细胞多样性和动态的理解 | Hydractinia symbiolongicarpus的喂养息肉和匍匐茎组织细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过47,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2025-12-17 |
Single-cell transcriptomics reveals probiotic reversal of neonatal morphine-induced gene disruptions underlying adolescent pain hypersensitivity
2025-Dec-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09150-0
PMID:41372449
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了新生儿期吗啡暴露导致青春期小鼠中脑基因表达广泛改变,并发现益生菌Bifidobacterium infantis可逆转这些改变 | 首次提供了新生儿吗啡暴露及益生菌干预后青春期小鼠中脑的单细胞RNA测序数据集,揭示了益生菌对阿片类药物诱导的神经发育影响的逆转作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床中得到验证;观察时间点局限于青春期 | 探究新生儿期吗啡暴露对疼痛通路神经发育的长期影响及益生菌干预的潜在治疗作用 | 青春期小鼠的中脑单细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛敏感性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 107,427个中脑单细胞,来自新生儿期接受生理盐水、吗啡或吗啡加益生菌处理的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2025-12-17 |
Protoplast technology in woody plants: current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Dec-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
|
综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 全面概述了木本植物原生质体分离、纯化、活力评估方法及其在基因功能分析、融合、再生、基因组编辑和单细胞测序等领域的多样化应用,并展望了未来技术突破带来的新研究方向 | NA | 总结木本植物原生质体技术的最新进展,并探讨其在遗传改良和生物技术创新中的潜力 | 木本植物 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达系统、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 738 | 2025-12-17 |
Intestinal fibroblast heterogeneity - unifying RNA-seq studies and introducing consensus-driven nomenclature
2025-Dec-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.264147
PMID:41170756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了小鼠结肠黏膜中的六个成纤维细胞亚群,并提出了标准化的命名法 | 整合多个数据集以识别保守的成纤维细胞群体,并引入共识驱动的命名法来统一分类 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;在稳态条件下进行,未充分探讨疾病状态下的变化 | 研究肠道成纤维细胞的异质性,并建立标准化的命名体系 | 小鼠结肠黏膜中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2025-12-17 |
Hub genes and common pathogenic mechanisms between COPD and H. pylori infection
2025-Dec, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2025.100622
PMID:41386886
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研究论文 | 本文通过整合分析公共数据集,识别了慢性阻塞性肺疾病(COPD)和幽门螺杆菌(H. pylori)感染之间的共享基因和共同致病机制 | 首次通过多组学方法(包括WGCNA、SVM-RFE、单细胞RNA测序和细胞间通讯分析)系统识别了COPD和H. pylori感染之间的共享枢纽基因CCR1和CCL19,并揭示了它们在免疫细胞和成纤维细胞中的表达模式及相互作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;样本来源和实验条件可能存在异质性;单细胞分析可能受限于数据集的细胞类型覆盖和分辨率 | 探究COPD和H. pylori感染之间的共同分子机制和共享基因,以揭示潜在的整合治疗靶点 | COPD和H. pylori感染的基因表达数据,包括差异表达基因、共表达模块、免疫细胞浸润和单细胞转录组 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、支持向量机递归特征消除(SVM-RFE)、基因集富集分析(GSEA)、受试者工作特征曲线(ROC)、免疫浸润分析(CIBERSORT)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞间通讯分析 | SVM-RFE | 基因表达数据(微阵列或RNA-seq) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2025-12-17 |
Single-cell analysis of human thymus and peripheral blood unveils the dynamics of T cell development and aging
2025-Dec, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00990-3
PMID:41136751
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了人类胸腺和外周血中T细胞发育与衰老的动态过程 | 首次结合单细胞测序和TCR测序,揭示了胸腺衰老对T细胞谱系潜力和外周T细胞老化的影响,并建立了基于初始T细胞的免疫年龄预测模型 | 样本量相对有限,且研究主要基于转录组数据,功能验证不足 | 探究年龄相关胸腺退化的机制及其对外周T细胞的影响 | 人类胸腺和外周血细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关免疫疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 387,762个细胞,来自年轻和年老个体的胸腺和外周血 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞TCR-seq | NA | NA |