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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-12-25 |
Implications of Single-Cell RNA Sequencing in Cervical Cancer: Unravelling the Molecular Landscape
2025-Dec-16, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c06987
PMID:41427221
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在宫颈癌研究中的应用,重点关注方法学进展、关键发现及其对诊断、预后和治疗干预的影响 | 利用单细胞RNA测序技术,在单细胞分辨率下解析宫颈癌肿瘤微环境,识别具有诊断和预后潜力的生物标志物,并发现新的治疗靶点 | NA | 总结单细胞RNA测序在宫颈癌研究中的应用,以改善诊断、预后和治疗策略 | 宫颈癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 702 | 2025-12-25 |
An Anti-Inflammatory and Pro-Angiogenic Porous Aloe Polysaccharide-Collagen Dressing Accelerates Wound Healing
2025-Dec-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c01158
PMID:41329879
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研究论文 | 本研究开发了一种新型多孔芦荟多糖-胶原复合伤口敷料,并通过体内外实验验证其加速伤口愈合的效果 | 首次结合芦荟多糖与胶原蛋白构建多孔复合伤口敷料,并利用单细胞测序技术揭示其调控免疫细胞比例的作用机制 | 未明确说明动物模型的具体类型与样本量细节,长期生物相容性数据有待进一步验证 | 开发具有抗炎促血管生成功能的新型伤口敷料以加速伤口愈合 | 芦荟多糖-胶原复合伤口敷料(AP-CD)及其对伤口愈合过程的影响 | 生物材料与组织工程 | 伤口愈合障碍 | 单细胞测序,扫描电子显微镜,能量色散谱,CCK-8检测,乳酸脱氢酶渗漏率测定 | NA | 显微图像,生化检测数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-12-25 |
Spatiotemporal trajectory of senescence in mesocarp cell clusters of Hylocereus undatus based on single-cell and spatial transcriptomics
2025-Dec-12, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154672
PMID:41435797
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学,揭示了火龙果中果皮细胞簇在衰老过程中的时空轨迹和功能分化 | 首次通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合,精确映射火龙果中果皮四个细胞簇的空间分布和分化轨迹,并揭示其在衰老过程中的功能分工 | 研究主要基于火龙果这一特定物种,结论在其他植物中的普适性有待验证 | 探究火龙果果实衰老过程中中果皮细胞簇的时空分化轨迹和功能 | 火龙果(Hylocereus undatus)果实的中果皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,荧光显微镜 | SingleR, SciBet, CARD, RCTD, SCODE | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 704 | 2025-12-25 |
Distinct expression of CD56 and CD19 marks molecular and functional endotypes of tetanus- versus RBD-specific human bone marrow plasma cells
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf059
PMID:40581803
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研究论文 | 本研究通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序数据,探讨了CD56和CD19在人骨髓浆细胞(BMPC)上的共表达模式,揭示了破伤风类毒素与SARS-CoV-2 RBD特异性BMPC之间的分子和功能差异 | 首次将CD56和CD19的表达差异与抗原特异性BMPC的分子和功能内型联系起来,特别是发现CD56+CD19- BMPC在破伤风特异性群体中富集,而RBD特异性群体则缺乏CD56表达,这为理解浆细胞存活和组织驻留机制提供了新见解 | 研究主要基于流式细胞术和现有scRNA-seq数据,未进行功能性实验验证CD56在组织驻留中的直接作用,且样本来源和数量可能有限 | 探究不同抗原特异性骨髓浆细胞亚群的表型和转录特征,以理解其存活和竞争动态 | 人骨髓浆细胞,包括总BMPC以及破伤风类毒素和SARS-CoV-2 RBD特异性BMPC | 免疫学 | 传染病 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞术数据,scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-12-25 |
Type 1 regulatory cells suppress T-cell cytotoxicity to alleviate liver injury during acute hepatitis B virus infection in mice
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf229
PMID:40925590
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠急性HBV感染模型,利用单细胞RNA测序揭示了HBsAg特异性CD4+ T细胞的异质性,并发现Tr1细胞通过IL-10介导的机制抑制T细胞毒性,从而减轻肝脏免疫病理损伤 | 首次在急性HBV感染模型中,通过单细胞RNA测序技术系统性地表征了HBsAg特异性CD4+ T细胞的功能亚群,特别是明确了Tr1细胞通过IL-10调节T细胞毒性以保护肝脏免受免疫病理损伤的关键作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能无法完全直接转化到人类HBV感染;主要关注急性感染阶段,对慢性感染的调控机制未涉及;IL-10的具体作用通路和靶细胞有待进一步阐明 | 探究急性HBV感染期间调节T细胞反应以避免免疫病理损伤的机制 | 小鼠急性HBV感染模型中的HBsAg特异性CD4+ T细胞亚群,特别是Tr1细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,水动力注射,腺病毒载体递送 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 706 | 2025-12-25 |
Transcriptional states of lung cancer microenvironment reveal macrophage subtype dynamics linked to disease progression
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf253
PMID:40972001
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和临床数据集,对肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞亚型进行了精细分类,揭示了脂质相关巨噬细胞亚型在疾病进展中的动态变化及其与预后的关联 | 结合细胞基因评分与层次分类方法,定义了7种具有不同转录程序和丰度的巨噬细胞亚型,特别是发现了脂质相关TAMs随疾病进展扩张并具有免疫抑制和促肿瘤特征,而组织驻留巨噬细胞减少 | 空间转录组分析依赖于去卷积技术推断细胞类型组成,对于TAMs的精细亚群,准确的基因表达特征至关重要,这可能引入推断偏差 | 解析肺癌微环境中肿瘤相关巨噬细胞的多样性和功能特化,以揭示其与疾病进展和预后的关系 | 肺腺癌和肺鳞状细胞癌患者样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 来自大型癌症队列的数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 707 | 2025-12-25 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了固始鸡胸肌和腹部脂肪组织的细胞类型和分子特征,揭示了脂肪沉积的组织特异性差异 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术比较胸肌和腹部脂肪组织的细胞类型特异性基因表达,并验证了G0S2基因在腹部脂肪细胞中的特异性促脂肪生成作用 | 研究仅针对2周龄鸡的组织样本,未涵盖其他发育阶段;样本量有限,且仅针对固始鸡一个品种 | 探究固始鸡胸肌和腹部脂肪沉积的机制差异 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 2周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 708 | 2025-12-25 |
Decoding the B-cell immune landscape in duck hepatitis A virus type 3 through single-cell genomics
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105929
PMID:41056664
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和B细胞受体分析,解码了鸭甲型肝炎病毒3型感染下小鼠脾脏B细胞的免疫景观 | 创新性地识别了一个新的IGHV1种系克隆IGHV1-20,并发现了一个新的B细胞亚群Gm37915+ B细胞与Nuggc+ B细胞之间增强的细胞通讯趋势 | 研究仅基于小鼠模型,可能无法完全反映鸭或其他物种中的免疫反应,且样本量未明确说明 | 探索DHAV-3免疫机制并识别潜在治疗靶点 | 用DHAV-3免疫的小鼠脾脏B细胞 | 单细胞基因组学 | 鸭病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),B细胞受体(BCR)文库分析 | NA | 单细胞基因表达数据,BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 709 | 2025-12-25 |
Roxadustat enhances inflammation and metabolic reprogramming in human leukocytes by affecting oxygen sensing
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf167
PMID:40796302
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研究论文 | 本研究探讨了罗沙司他对人类外周血单个核细胞的影响,重点关注其通过影响氧感应机制增强炎症反应和代谢重编程的作用 | 首次在临床相关浓度下系统评估罗沙司他对人类PBMCs的免疫调节作用,结合单细胞RNA测序揭示白细胞亚群动态变化,并模拟炎症性缺氧条件探索联合效应 | 研究主要基于体外实验,未在体内模型或患者中验证;样本量有限;未长期观察罗沙司他的免疫效应 | 探究HIF稳定剂罗沙司他对循环白细胞免疫活性和代谢的影响 | 人类外周血单个核细胞(PBMCs) | 免疫学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序,蛋白质和基因表达分析,氧消耗和细胞外酸化率测定 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-12-24 |
Extracellular Vesicle-Packaged MIR4435-2HG Facilitates Cigarette Smoke-Induced Bladder Cancer Progression through Enolase 1-Dependent Glycolytic Reprogramming
2025-Dec-23, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c15108
PMID:41348936
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研究论文 | 本研究揭示了吸烟相关细胞外囊泡包装的lncRNA MIR4435-2HG通过促进糖酵解重编程驱动膀胱癌进展的机制 | 首次发现M2巨噬细胞在吸烟致癌物4-ABP刺激下分泌EV包装的MIR4435-2HG,通过ac4C修饰稳定ENO1和海绵miR-143-3p双重机制促进糖酵解 | 机制研究主要基于体外实验,临床样本验证需扩大队列;动物模型数据未在摘要中体现 | 阐明吸烟促进膀胱癌进展的分子机制 | 膀胱癌患者尿液/血浆样本、M2巨噬细胞、肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | RNA测序、组织芯片、单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9、Seahorse能量代谢分析、ac4C乙酰化实验 | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据、临床样本数据 | 有吸烟史的膀胱癌患者尿液和血浆样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 711 | 2025-12-24 |
CKAP5: Unraveling Its Crucial Function in Liver Hepatocellular Carcinoma Progression and Prognosis
2025-Dec-23, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-09632-5
PMID:41432972
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析及功能验证,揭示了CKAP5在肝细胞癌进展及肿瘤免疫微环境中的关键作用 | 首次系统性地将CKAP5与肝细胞癌的肿瘤免疫微环境及免疫检查点分子关联,并通过CRISPR-Cas9功能实验验证其促癌功能 | 研究主要基于公共数据库和细胞系实验,缺乏体内动物模型验证及临床样本的功能机制深入探索 | 探究CKAP5在肝细胞癌中的表达模式、临床意义、免疫微环境调控作用及分子机制 | 肝细胞癌患者样本数据及HepG2肝癌细胞系 | 生物信息学与肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 多组学数据分析、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因敲除、细胞功能实验 | Cox回归模型、Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线分析 | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于TCGA、GEO等公共数据库的肝细胞癌样本,未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-12-24 |
Differential Gene Expression Across Species Following Spinal Cord Injury: A Systematic Review and Meta-Analysis
2025-Dec-20, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05496-y
PMID:41420753
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系统综述与荟萃分析 | 本文通过系统综述和荟萃分析,比较了不同物种在脊髓损伤后基因表达的差异,旨在揭示影响神经再生能力的分子机制 | 首次跨物种整合基因组范围的脊髓基因表达数据,通过荟萃分析识别了再生与非再生物种间共享的差异表达基因,并利用蛋白互作网络分析鉴定了关键枢纽基因 | 纳入研究的异质性较高,物种和损伤模型多样,且部分研究样本量较小,可能影响结果的普适性 | 探究脊髓损伤后不同物种的基因表达差异,以理解神经再生的分子基础 | 多物种的脊髓组织,包括再生能力强的非哺乳动物(如硬骨鱼、蝾螈)和再生能力有限的哺乳动物(如大鼠、小鼠) | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 微阵列,RNA测序,单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自42项研究的多个物种样本,其中约43%使用褐家鼠 | NA | 微阵列,bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq,单核RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2025-12-24 |
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Dec-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513989122
PMID:41364757
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研究论文 | 本研究通过跨种族全基因组关联分析,首次发现HLA-DQB1*03:01是独立于DQA1和种族、显著影响1型发作性睡病发病年龄的主要遗传因素 | 首次进行跨种族GWAS研究,明确HLA-DQB1*03:01对发病年龄的独立影响,并发现其通过改变T细胞受体库发挥作用 | 未直接鉴定出致病的T细胞,病理生理机制的具体联系尚待进一步阐明 | 探究1型发作性睡病发病年龄的遗传决定因素 | 1型发作性睡病患者 | 遗传学 | 发作性睡病 | 全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA测序数据 | 5,339例来自中国、欧洲、韩国、日本和美国的病例 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2025-12-24 |
[Analyzing the impact of chemotherapy on cellular heterogeneity and identifying potential therapeutic targets in breast cancer patients via single-cell RNA sequencing]
2025-Dec-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了一名乳腺癌患者化疗前后肿瘤组织的细胞异质性,旨在描绘细胞进化轨迹并识别潜在的治疗靶点 | 在单细胞分辨率下,对同一患者化疗前后的肿瘤微环境进行纵向比较,描绘了细胞组成和发育轨迹的动态变化,并预测了APOD、ELN和F2R等基因在疾病进展中的关键作用 | 研究仅基于单一样本(一名患者),样本量小,限制了结果的普遍性和统计效力 | 分析化疗对乳腺癌肿瘤细胞异质性的影响,并识别潜在的治疗干预靶点 | 一名乳腺癌女性患者的化疗前活检组织和化疗后手术切除组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者,2个时间点(化疗前和化疗后)的肿瘤组织样本,共分析了8,599个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-12-24 |
[Single-cell transcriptomic analysis of the impact of circadian rhythm disruption on immune function in zebrafish]
2025-Dec-06, Zhonghua yu fang yi xue za zhi [Chinese journal of preventive medicine]
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序,揭示了昼夜节律紊乱对斑马鱼免疫系统结构和功能的影响 | 首次在单细胞水平上系统解析了昼夜节律紊乱如何重塑斑马鱼免疫细胞组成、比例变化及发育轨迹,并识别了关键的免疫激活标记基因变化 | 研究基于斑马鱼幼虫模型,结果向高等脊椎动物或人类的直接外推需谨慎;且仅分析了短期(三天)恒定光照干扰,未探讨长期或不同模式节律紊乱的影响 | 探究昼夜节律紊乱在单细胞水平上调控免疫系统结构与功能的精确机制 | 斑马鱼幼虫的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 睡眠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类、Monocle伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 对照组与昼夜节律紊乱组斑马鱼幼虫的免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2025-12-24 |
DAP12 deletion reduces neuronal SLIT2 and demyelination and enhances brain resilience in female tauopathy mice
2025-Dec-02, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00903-3
PMID:41331787
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研究论文 | 本研究探讨了在小鼠tau蛋白病模型中,删除DAP12基因如何通过影响神经元SLIT2信号和髓鞘形成,增强大脑对tau病理的耐受性 | 首次揭示了DAP12缺失通过抑制兴奋性神经元中SLIT2的上调,减轻tau蛋白病中的脱髓鞘,从而增强大脑耐受性的新机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,在人类中的直接相关性仍需进一步验证;性别差异的机制尚不完全清楚 | 探究DAP12在tau蛋白病中介导大脑耐受性的分子机制,为阿尔茨海默病提供新的治疗策略 | 携带人类Tau P301S突变的转基因小鼠模型,以及人类阿尔茨海默病脑组织 | 神经科学,单细胞组学 | 阿尔茨海默病,tau蛋白病 | 单核RNA测序,空间转录组学,细胞通讯分析 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及转基因小鼠和人类脑组织 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 717 | 2025-12-24 |
Identification and validation of tricarboxylic acid cycle-related diagnostic biomarkers for diabetic nephropathy via weighted gene co-expression network analysis and single-cell transcriptome analysis
2025-Dec, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02557-5
PMID:40742465
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研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析和单细胞转录组分析,识别并验证了与三羧酸循环相关的糖尿病肾病诊断生物标志物 | 首次结合单细胞转录组数据和机器学习方法,从三羧酸循环相关基因中筛选出HPGD和G6PC作为糖尿病肾病的新型诊断标志物 | 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的前瞻性临床队列验证 | 开发糖尿病肾病的早期诊断生物标志物 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),加权基因共表达网络分析(WGCNA),单样本基因集富集分析(ssGSEA) | 机器学习模型(未指定具体类型) | 基因表达数据 | 基于GSE131882和GSE30122数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2025-12-24 |
Glucokinase activators contribute to gastrointestinal disease risks through metabolic-immune interplay in the gut-liver axis: insights from a multi-omics study
2025-Dec, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-025-02571-7
PMID:40748365
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨了葡萄糖激酶激活剂(GKAs)通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的长期影响 | 首次利用孟德尔随机化和多组学方法系统比较了直接GK激活与GK-GKRP解离两种机制对胃肠道疾病的因果效应,并揭示了代谢-免疫串扰在其中的关键作用 | 研究主要基于遗传变异作为代理,可能无法完全反映药物干预的复杂生物学效应,且样本来源和疾病模型的局限性需进一步验证 | 探究GKAs通过代谢-免疫相互作用对胃肠道疾病风险的长期影响机制 | 葡萄糖激酶激活剂(GKAs)的两种作用机制(直接GK激活与GK-GKRP解离)及其与胃肠道疾病的关联 | 多组学研究 | 胃肠道疾病 | 孟德尔随机化、meta分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用网络、功能富集分析 | NA | 遗传变异数据、脂质性状数据、炎症蛋白数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2025-12-24 |
Single-cell transcriptomics reveals an abnormal immune microenvironment in plasma cell mastitis
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2024.2446694
PMID:41421796
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,揭示了浆细胞性乳腺炎中异常的免疫微环境 | 首次应用CITE-seq技术对浆细胞性乳腺炎进行全面的单细胞转录组分析,构建了详细的转录组图谱 | 样本量相对较小,仅基于10,185个细胞进行分析,且未涉及长期随访或治疗干预数据 | 探究浆细胞性乳腺炎的免疫微环境特征及细胞分子机制 | 浆细胞性乳腺炎患者的组织样本 | 数字病理学 | 乳腺炎 | CITE-seq(转录组和表位测序) | NA | 单细胞转录组数据 | 10,185个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-12-23 |
MAGIC: A Multimodal Adaptive GRN Inference Constructor
2025-Dec-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02370
PMID:41329984
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研究论文 | 本研究提出了一种名为MAGIC的多模态自适应基因调控网络推断方法,通过整合基因表达、序列和语义特征来改进单细胞RNA测序数据的GRN推断 | MAGIC首次将基因表达、序列和语义特征进行多模态对齐与整合,并构建共识相似性网络与已知GRN形成双拓扑网络,同时采用共享图注意力权重对齐模块和知识感知多模态融合模块来应对数据稀疏性问题 | 方法依赖于已知GRN和生物知识库的准确性,且在非常稀疏的单细胞数据中性能可能受限 | 改进单细胞RNA测序数据中的基因调控网络推断 | 基因调控网络 | 生物信息学 | 膀胱癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 图注意力网络, 多模态融合模型 | 基因表达数据, 序列数据, 语义特征 | 七个单细胞RNA测序数据集和两个空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |