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当前共找到 1237 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-12-20 |
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2025-Dec-18, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01738-2025
PMID:41412718
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研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞激活蛋白（FAP）作为慢性肺移植物功能障碍（CLAD）早期生物标志物的潜力 | 首次在鼠类和人类单细胞RNA测序数据中证实FAP表达在CLAD中特异性上调于致病性成纤维细胞亚群，并建立了临床队列中FAP阳性面积阈值用于早期诊断和风险分层 | FAP的判别能力中等（AUC 0.78），需要在多中心队列中进行前瞻性验证 | 评估FAP在慢性肺移植物功能障碍中的表达变化及其作为早期诊断标志物的可行性 | 鼠类肺移植模型、人类肺组织样本以及240名肺移植受者的经支气管活检样本 | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | RNA测序数据，组织图像数据 | 鼠类模型2种，人类对照组5例，CLAD患者5例，临床队列240名肺移植受者（62例CLAD，178例非CLAD） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2025-12-20 |
CRISPRi screening in cultured human astrocytes uncovers distal enhancers controlling genes dysregulated in Alzheimer's disease
2025-Dec-18, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02154-3
PMID:41413662
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研究论文 | 本研究通过结合CRISPRi、单细胞RNA-seq和机器学习，在人类原代星形胶质细胞中构建了增强子-基因互作资源AstroREG，并开发了预测模型EGrf | 首次在人类原代星形胶质细胞中系统功能测试了近1,000个PsychENCODE增强子，识别了150多个调控互作，并利用这些数据训练了高特异性的随机森林预测模型 | 研究仅聚焦于星形胶质细胞这一特定细胞类型，可能未涵盖其他神经细胞类型中的增强子调控网络 | 揭示远端增强子在星形胶质细胞中的功能状态及其与基因的调控关系，特别关注阿尔茨海默病相关基因 | 人类原代星形胶质细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制（CRISPRi）、单细胞RNA-seq | 随机森林（RF） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2025-12-20 |
CSF1R modulates megakaryopoiesis by targeting RUNX1 in immune thrombocytopenia
2025-Dec-18, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288511
PMID:41414965
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序发现CSF1R在免疫性血小板减少症患者巨核细胞中上调，并揭示其通过抑制RUNX1损害巨核细胞生成，为ITP提供了新的治疗靶点 | 首次发现CSF1R在ITP患者巨核细胞中上调，并阐明其通过抑制RUNX1损害巨核细胞生成的机制 | 样本量较小，仅包括一名新诊断ITP患者和少量临床样本进行验证 | 探究免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的机制 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓细胞、临床样本以及小鼠ITP模型 | 数字病理学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据 | 一名新诊断ITP患者及额外临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2025-12-20 |
Sodium butyrate inhibits colorectal cancer development by reducing M2 macrophage polarization and PD-L1 expression
2025-Dec-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00692-25
PMID:41251471
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研究论文 | 本研究探讨了短链脂肪酸丁酸钠通过抑制M2巨噬细胞极化和PD-L1表达来抑制结直肠癌发展的机制 | 结合单细胞转录组学与小鼠模型，揭示了丁酸钠通过HDAC/TLR4/MyD88信号通路抑制M2巨噬细胞极化，并与PD-L1阻断产生协同作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索丁酸钠抑制结直肠癌发展的机制及其与现有免疫疗法的联合策略 | 结直肠癌小鼠模型、巨噬细胞与结直肠癌细胞共培养系统 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2025-12-20 |
Heat stress induced testicular impairment is related to orchitis and complement activation in Rongchang boars
2025-Dec-17, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01296-5
PMID:41402910
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研究论文 | 本研究探讨了热应激如何通过诱导睾丸炎和补体激活影响荣昌公猪的精液质量 | 首次在公猪中结合单细胞RNA测序技术揭示热应激诱导的睾丸炎与补体系统激活之间的关联，并明确了CD163+巨噬细胞在补体级联反应中的关键作用 | 样本量相对较小（26头8周龄荣昌公猪），且实验周期较短（3周），可能限制了结果的普遍性和长期效应评估 | 揭示热应激下公猪的潜在免疫反应及其对精液质量的影响，以解决环境温度相关的季节性不育问题并优化人工授精中的公猪选择 | 荣昌公猪的睾丸组织和精液样本 | 生殖生物学与免疫学 | 睾丸炎与不育症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织学评估、免疫组化、精液分析 | NA | 基因表达数据、组织图像、精液参数 | 26头8周龄荣昌公猪 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 686 | 2025-12-20 |
Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer Lung Metastases: Implications for Recurrence After Metastasectomy
2025-Dec-17, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2025.691
PMID:41414807
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌肺转移灶中免疫抑制性肿瘤微环境（TME）的特征，特别是SPP1+肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的富集和效应T细胞、NK细胞的耗竭，并发现这些特征与术后复发相关 | 首次在结直肠癌肺转移灶中综合运用多重免疫组化、全外显子组测序、转录组分析和单细胞RNA测序，系统描绘了其免疫抑制性TME，并明确了SPP1+ TAMs作为复发预测的关键细胞亚群 | 样本量较小（15例患者），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性队列验证 | 表征结直肠癌肺转移灶的肿瘤微环境，并识别与术后复发相关的因素 | 接受肺转移灶切除术的结直肠癌患者的匹配肿瘤组织、癌旁组织和远处正常肺组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化（IHC）、全外显子组测序、转录组分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像、基因组序列、转录组表达数据、单细胞表达数据 | 15名结直肠癌肺转移患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 687 | 2025-12-20 |
Single-cell identification of an endothelial cell proximal SPP1+ macrophage population defines the metastatic vascular niche in lymph nodes
2025-Dec-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27796-y
PMID:41402359
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中发现了一个独特的、高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并揭示了其通过与内皮细胞的相互作用促进血管生成，从而形成转移性血管微环境的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中，通过单细胞分析鉴定出一个特定的、富含SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群，并阐明了该亚群通过SPP1-ITGa9b1和FN1-ITGa2b1信号轴与内皮细胞相互作用，促进血管生成和淋巴转移的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析，样本量相对有限（n=41），且功能机制验证主要依赖生物信息学分析和免疫组化，缺乏更深入的体内外功能实验验证 | 探究头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的细胞和分子机制，特别是肿瘤微环境中细胞间的相互作用 | 头颈鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结和非转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，免疫组化，多重免疫组化，空间分析 | NA | 单细胞转录组数据，bulk RNA-seq数据，图像数据 | 41个样本（来自多个公共数据库） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 688 | 2025-12-20 |
Single-cell and spatial transcriptomic characterization of pulmonary pleomorphic carcinoma
2025-Dec-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09162-w
PMID:41402584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，对肺多形性癌的分子基础进行了多组学分析，揭示了其上皮和肉瘤样成分的细胞动态及潜在治疗靶点 | 首次结合数字空间分析和单细胞RNA测序对肺多形性癌进行多组学表征，发现MET基因和蛋白仅在上皮成分中过表达，并识别出具有中间EMT状态和ECM重塑特征的细胞群作为新治疗靶点 | 研究样本量较小，且为罕见肺癌亚型，可能限制结果的普遍性 | 阐明肺多形性癌的分子基础，包括其上皮和肉瘤样成分的细胞动态，以识别潜在治疗靶点 | 肺多形性癌（PPC）患者样本，包括上皮和肉瘤样成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），数字空间分析，多组学分析 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 689 | 2025-12-18 |
ST-FFPE-mIF: integrating spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence in formalin-fixed paraffin-embedded tissues using Stereo-seq
2025-Dec-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03900-3
PMID:41402878
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 690 | 2025-12-20 |
Spatial transcriptomic alignment, integration, and 3D reconstruction by STAIR
2025-Dec-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03895-x
PMID:41398698
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研究论文 | 本文提出了一种名为STAIR的端到端解决方案，用于空间转录组学中的切片对齐、整合和3D重建 | 首次提出使用具有点水平和切片水平注意力机制的异构图注意力网络，实现统一嵌入空间并指导无监督3D重建，在平行切片的z轴重建方面表现出首创性性能 | NA | 解决空间转录组学中将多个切片合并为统一3D图谱的挑战 | 空间转录组学数据切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 异构图注意力网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 691 | 2025-12-20 |
Differential Regulation of APOE4-Mediated Astrocytic Lipid Metabolism by BMP Signaling Exacerbates Alzheimer's Disease Pathologies in Neurons
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.14.694212
PMID:41415446
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研究论文 | 本研究探讨了BMP信号如何通过调控APOE4介导的星形胶质细胞脂质代谢，加剧阿尔茨海默病神经元病理 | 首次揭示了BMP信号在APOE4与衰老相互作用中的关键角色，并建立了星形胶质细胞脂质代谢与神经元tau蛋白过度磷酸化之间的因果关系 | 研究主要基于体外iPSC模型，缺乏体内验证；样本规模未明确说明 | 探究衰老相关BMP信号与APOE4多态性在阿尔茨海默病发病机制中的相互作用 | iPSC来源的星形胶质细胞与共培养的神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 细胞共培养模型 | 转录组数据、蛋白质磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 692 | 2025-12-20 |
A transition zone enriched WIF1 ⁺ basal cell subtype is associated with benign prostatic hyperplasia
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692826
PMID:41415376
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出在良性前列腺增生中富集的WIF1⁺基底细胞亚型，并探讨其在前列腺过渡区的分布及潜在病理作用 | 首次通过大规模单细胞RNA测序识别出前列腺过渡区富集的WIF1⁺基底细胞亚型，并揭示其与良性前列腺增生发病机制的关联 | 研究基于前列腺切除标本的良性区域，可能未完全反映疾病进展或不同阶段的细胞变化 | 探究人类前列腺不同区域的细胞组成及其疾病易感性，特别是良性前列腺增生的发病机制 | 人类前列腺的良性区域，包括过渡区和非过渡区 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前列腺切除标本的良性区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 693 | 2025-12-20 |
Acute neuroinflammation induces prolonged transcriptional reprogramming in microglia
2025-Dec-10, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03572-7
PMID:41372988
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研究论文 | 本研究探讨急性神经炎症对小鼠小胶质细胞的长期转录影响，发现即使炎症消退，小胶质细胞仍存在持续的转录重编程和疾病相关特征 | 首次系统揭示急性神经炎症可诱导小胶质细胞产生持久的转录重编程，并发现这些急性特征与阿尔茨海默病模型及人类神经炎症疾病的小胶质细胞特征重叠 | 观察期短于慢性神经退行性疾病的病程，且主要基于小鼠模型 | 探究急性神经炎症对小胶质细胞的长期影响及其与神经退行性疾病的潜在关联 | 小鼠小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 694 | 2025-12-20 |
MoDaH achieves rate optimal batch correction
2025-Dec-10, ArXiv
PMID:41415606
|
研究论文 | 本文提出了一种基于混合模型的数据协调方法（MoDaH），用于单细胞组学数据的批次校正，并首次提供了批次校正的理论保证 | 首次为批次校正问题建立了极小极大最优误差率，并证明所提方法MoDaH能够达到该最优率，这是首个具有理论保证的批次校正算法 | NA | 开发一种具有理论保证的批次校正算法，以解决单细胞组学数据分析中批次效应带来的技术干扰 | 单细胞RNA测序数据和空间蛋白质组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，空间蛋白质组学 | 高斯混合模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 695 | 2025-12-20 |
Toward a better pan-tumor predictive signature for unleashing precision immuno-oncology
2025-Dec-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013213
PMID:41365533
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评论 | 本文探讨了免疫检查点抑制剂（ICI）在实体瘤治疗中的预测生物标志物，并提出了一种新型免疫特征评分以优化精准免疫肿瘤学 | 提出了一种基于DNA和RNA分析的新型免疫特征评分（Immune Profile Score），旨在预测实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的反应，并强调了整合多组学数据、单细胞技术和临床因素的重要性 | 该评分系统仍需前瞻性验证和进一步优化，以实现其在精准免疫肿瘤学中的全部潜力 | 开发更准确的预测生物标志物，以改善实体瘤患者对免疫检查点抑制剂的治疗反应和精准医疗应用 | 实体瘤患者，特别是接受免疫检查点抑制剂治疗的群体 | 精准医疗 | 实体瘤 | DNA和RNA分析，单细胞RNA技术，多组学基因特征分析 | NA | 基因表达数据，分子特征数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 696 | 2025-12-20 |
ALKBH5-Mediated ITGB1 m6A Modification in Ovarian Cancer Progression and Immune Evasion
2025-Dec-09, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01127-w
PMID:41366552
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研究论文 | 本研究揭示了m6A去甲基化酶ALKBH5通过调控ITGB1表达促进卵巢癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次发现ALKBH5通过介导ITGB1的m6A修饰调控卵巢癌免疫逃逸，并提出了ALKBH5-ITGB1轴作为新的诊断标志物和治疗靶点 | 未明确说明样本量大小，且主要依赖公共数据库验证，缺乏大规模临床队列验证 | 探究ALKBH5介导的m6A修饰在卵巢癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 卵巢癌细胞及相关的m6A修饰调控机制 | 计算生物学 | 卵巢癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 深度学习, 共表达网络分析 | 深度学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 697 | 2025-12-20 |
SP140 limits type I interferon-driven pathology, preserving T cell motility and promoting resistance in tuberculosis
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.05.692491
PMID:41415425
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型探究SP140在结核病中如何通过限制I型干扰素信号通路来维持T细胞免疫和宿主抵抗力 | 首次揭示SP140通过抑制I型干扰素驱动的病理过程来保护T细胞功能和运动性，从而促进结核病抵抗力 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究结核病易感宿主中CD8⁺ T细胞反应的差异及SP140的作用机制 | 感染结核分枝杆菌的小鼠模型，特别是缺乏SP140转录抑制因子的小鼠 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序，活体显微镜成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 698 | 2025-12-20 |
Senescence-Linked Fibrosis in the Aging Human Ovary Revealed by p16-Based Histological Profiling and Spatial Transcriptomics
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692228
PMID:41415409
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研究论文 | 本研究通过p16蛋白表达、空间转录组学和AI引导的数字病理学，揭示了人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布及其与纤维化的关联 | 首次结合p16免疫组化、多重免疫荧光、空间转录组学和AI分析，系统绘制了绝经后卵巢衰老细胞的空间微环境，并识别出与p16阳性区域相关的32基因特征BuckSenOvary | 研究主要基于绝经后卵巢样本，可能未全面涵盖卵巢衰老的早期阶段；样本数量有限，需进一步验证 | 探究人类绝经后卵巢中衰老细胞的空间分布、特征及其与纤维化的关系，以识别潜在的治疗靶点 | 人类绝经后卵巢组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | p16免疫组化、多重免疫荧光、空间转录组学、AI引导的数字病理学 | AI | 图像、空间转录组数据 | 92个空间区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 699 | 2025-12-20 |
A deep generative model for deciphering cellular dynamics and in silico drug discovery in complex diseases
2025-Dec, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01423-7
PMID:40542107
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以解析疾病进展中的复杂细胞动态并辅助计算机药物发现 | 开发了首个专门针对时间序列单细胞转录组数据的深度生成模型，能够学习疾病相关的细胞嵌入表示，并用于精准的药物扰动建模和筛选 | 论文未明确说明模型在其他疾病类型中的验证范围和局限性，也未详细讨论计算资源需求或模型可扩展性 | 开发计算工具以深入分析疾病进展的细胞动态，并实现靶向的计算机药物干预发现 | 特发性肺纤维化患者的单细胞转录组数据、COVID-19相关数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2025-12-20 |
MMP13-Expressing and COL11A1-Expressing Cancer-Associated Fibroblasts: Key Drivers of Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression and Prognostic Indicators
2025-Dec, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104247
PMID:41005711
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了食管鳞状细胞癌中三种关键的癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示了其中MMP13和COL11A1表达的CAF亚型与不良预后及癌症进展的关联 | 首次报道了CAF亚型与食管鳞状细胞癌病理分期进展之间的关联，并识别出MMP13和COL11A1表达的myCAF亚型作为关键的预后指标 | 研究样本量有限，且主要关注晚期患者，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的作用及其预后价值 | 食管鳞状细胞癌患者组织样本 | 单细胞组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，组织切片图像 | 未明确样本数量，但包括单细胞测序样本和手术切除标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |