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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
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研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食行为中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群,并发现其在摄食状态下的激活机制 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型,在成年动物和人类中的保守性需要进一步验证 | 阐明侧下丘脑神经元在食欲调控中的分子和细胞特征及其进化保守性 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,Act-seq方法,整合比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元(饥饿和饱食状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法(活动依赖性转录特征捕获) |
| 682 | 2025-11-14 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
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研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键连接分子,并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 侵袭性乳腺癌基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,图像数据,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2025-11-13 |
Single-cell immune landscape of acute kidney injury after cardiac surgery with cardiopulmonary bypass
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2581506
PMID:41199602
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了心脏手术后急性肾损伤患者的免疫细胞景观 | 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和蛋白质微阵列技术研究心脏手术相关急性肾损伤 | 单中心研究,样本量较小(4名患者) | 阐明心脏手术后急性肾损伤的免疫细胞机制 | 接受心脏手术的成年患者 | 单细胞分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 蛋白质微阵列 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 蛋白质微阵列数据 | 4名患者,42,362个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 684 | 2025-11-10 |
Exploring the therapeutic role of thiabendazole in lung adenocarcinoma via network pharmacology and single-cell analysis
2025-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102548
PMID:41130017
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研究论文 | 通过网络药理学和单细胞分析探索噻苯达唑在肺腺癌中的治疗作用 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究抗寄生虫药物噻苯达唑在肺腺癌中的抗癌机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索噻苯达唑在肺腺癌治疗中的作用机制 | 肺腺癌相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 网络药理学, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个GEO数据集(GSE136103, GSE10072, GSE19188, GSE19804, GSE30219, GSE40791) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 685 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Potential Mechanism of RUNX3 Reshaping Tumor Microenvironment in Non-small-cell Lung Cancer
2025-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18034-w
PMID:40916017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了RUNX3在非小细胞肺癌中重塑肿瘤微环境的潜在机制 | 首次在单细胞水平上系统分析RUNX3表达状态对非小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 样本量较小(仅7例患者),需要更大规模研究验证 | 探索RUNX3在非小细胞肺癌中调控肿瘤微环境的具体生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织 | 单细胞测序分析 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 | Seurat分析流程 | 单细胞转录组数据 | 7例非小细胞肺癌患者,包含3对癌和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 686 | 2025-11-09 |
Tumor-derived CCL5 recruits CCR1+ macrophages to suppress apoptosis and drive proliferation in duodenal adenocarcinoma
2025-Dec-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218064
PMID:41015267
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了十二指肠腺癌中肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞抑制细胞凋亡并促进增殖的机制 | 首次在十二指肠腺癌中发现肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞并抑制凋亡的免疫逃逸机制 | 研究样本量有限且为罕见胃肠道恶性肿瘤 | 阐明十二指肠腺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 | 十二指肠腺癌患者原发肿瘤组织及匹配的癌旁正常组织 | 单细胞测序分析 | 十二指肠腺癌 | 单细胞RNA测序, 患者来源类器官培养, 功能实验, 批量转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 十二指肠腺癌患者原发肿瘤和匹配正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 687 | 2025-11-09 |
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70405
PMID:41204708
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态 | 首次揭示高HBsAg母亲所生新生儿存在持续的先天免疫激活和促炎症状态,即使疫苗接种后产生抗体反应 | 样本量有限,仅比较了高和低HBsAg两组母亲的新生儿 | 研究母体HBsAg水平对新生儿免疫发育和乙肝疫苗接种反应的影响 | 高和低HBsAg母亲所生新生儿的PBMCs | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞多组学测序,免疫表型分析 | Seurat R包 | 单细胞转录组数据,表面标志物表达数据 | 两组新生儿(低HBsAg组和高HBsAg组) | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 688 | 2025-11-08 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05317-9
PMID:40750734
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA测序,揭示了心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边缘区动态变化 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统解析心肌梗死后免疫细胞时空动态变化,并发现TREM2高表达巨噬细胞在组织修复中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;技术方法复杂度高,数据分析存在一定主观性 | 探究心肌梗死后复杂细胞和分子动态变化机制 | 小鼠心肌梗死模型、AC16心肌细胞、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,RT-qPCR,Western blot,免疫组织化学,免疫荧光,流式细胞术 | Milo,Monocle2,CellPhoneDB,NicheNet,SCENIC | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠心肌梗死模型和缺血再灌注模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 689 | 2025-11-07 |
ABCA4-mutant human retinal organoids sequencing reveals organoids application in inherited retinal diseases
2025-Dec, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110677
PMID:41038369
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序验证人视网膜类器官作为ABCA4突变引起的Stargardt病疾病模型的应用价值 | 首次使用人视网膜类器官模型研究Stargardt病,并在早期发育阶段成功捕捉患者与对照样本间的分子差异 | 样本量较小(仅2名STGD患者),且视网膜类器官模拟晚发性遗传性视网膜疾病特征的能力仍需进一步验证 | 验证视网膜类器官作为遗传性视网膜疾病的疾病模型 | 人视网膜类器官 | 单细胞测序 | Stargardt病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 2名STGD患者和健康对照的视网膜类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2025-11-06 |
Decoding Xylem Development in Flowering Plants: Insights From Single-Cell Transcriptomics
2025-Dec, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70169
PMID:40905378
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综述 | 本文综述单细胞转录组测序技术在解码开花植物木质部发育中的应用进展 | 整合激光显微切割原位转录组分析技术,提供更精确的细胞类型注释并支持当前最佳的木质部发育谱系工作模型 | 存在跨研究比较的技术挑战,包括生物信息学流程不一致、原生质体化效率变异和潜在错误注释的标记基因使用 | 研究开花植物木质部发育过程 | 单子叶植物和双子叶植物的初生及次生木质部 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 激光显微切割 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 691 | 2025-11-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals T and B cell-related immune features in foot and mouth disease virus-infected mice
2025-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2580141
PMID:41144693
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中T细胞和B细胞的免疫特征 | 首次在单细胞水平系统揭示口蹄疫病毒感染过程中T细胞和B细胞的组成变化、基因表达特征、细胞间通讯状态和调控网络 | 研究仅限于小鼠模型,未在自然宿主中验证 | 解析口蹄疫病毒感染过程中适应性免疫应答的特征 | 口蹄疫病毒感染小鼠脾脏中的T细胞和B细胞 | 单细胞组学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | FMDV感染组和模拟感染对照组小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 692 | 2025-11-06 |
Single-cell aneuploidy and chromosomal arm imbalances define subclones with divergent transcriptomic phenotypes
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf138
PMID:41179709
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研究论文 | 开发了一种整合单细胞RNA测序和单细胞DNA测序的计算框架scAlign,用于在单个细胞分辨率下定义亚克隆的细胞表型 | 开发了scAlign计算框架,首次实现了在单个细胞水平上整合scRNA-seq和scDNA-seq数据,能够基于基因剂量将细胞分配到特定亚克隆并分析其转录组表型 | 仅使用G0/G1期的细胞进行分析,可能忽略了细胞周期其他阶段的生物学信息 | 研究癌症中亚克隆的基因组不稳定性与转录组表型之间的关系 | 原发性和转移性癌症中的肿瘤细胞亚克隆 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | scAlign计算框架 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 693 | 2025-11-05 |
Cellular cholesterol metabolism rewiring through SREBP2-LXR-mTOR signaling convergence orchestrates T cell fate and keratinocyte apoptosis in oral lichen planus
2025-Dec-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115457
PMID:40957169
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多平台验证揭示了口腔扁平苔藓中T细胞胆固醇代谢异常通过SREBP2-LXR-mTOR信号通路调控T细胞命运和角质形成细胞凋亡的机制 | 首次发现OLP中T细胞胆固醇代谢异常通过SREBP2-LXR轴失衡和mTOR-SREBP2双向串扰调控疾病进程 | 研究主要基于体外细胞实验,需要更多体内实验验证;样本量相对有限 | 探究T细胞胆固醇代谢在口腔扁平苔藓发病机制中的作用 | 口腔扁平苔藓患者的T细胞、Jurkat T细胞系、角质形成细胞 | 单细胞生物学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 流式细胞术, PCR, 免疫共沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 口腔扁平苔藓患者组织样本和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 694 | 2025-11-05 |
SPP1 as a key modulator of M2 macrophage polarization promotes endometriosis progression via activation of the FAK/PI3K/AKT pathway: A bioinformatics and experimental study
2025-Dec-03, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115563
PMID:40967048
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证发现SPP1通过调控M2巨噬细胞极化促进子宫内膜异位症进展 | 首次揭示SPP1作为M2巨噬细胞极化的关键调节因子,并通过FAK/PI3K/AKT信号通路促进子宫内膜异位症发展 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索子宫内膜异位症中巨噬细胞极化的关键调控基因及其作用机制 | 子宫内膜异位症患者组织样本和人子宫内膜基质细胞(ihESCs) | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | LASSO,SVM-RFE,Random Forest | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | GSE6364数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 695 | 2025-11-05 |
Multi-omics analysis of the potential association between ageing and rheumatoid arthritis and screening of potential therapeutic targets
2025-Dec, Artificial cells, nanomedicine, and biotechnology
DOI:10.1080/21691401.2025.2582448
PMID:41185125
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研究论文 | 通过多组学方法探索衰老与类风湿关节炎之间的关联并筛选潜在治疗靶点 | 首次通过整合基因组数据库、转录组数据和单细胞RNA测序系统揭示衰老与RA的分子联系 | 分子机制研究仍需进一步实验验证 | 探索衰老与类风湿关节炎的关联机制并识别治疗靶点 | 类风湿关节炎患者与衰老相关基因 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 多组学分析,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习算法 | 转录组数据,基因组数据 | 基于GBD数据库1990-2021年55岁及以上人群数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 696 | 2025-11-04 |
Short-chain fatty acids regulate T cell heterogeneity to alleviate recurrent spontaneous abortion
2025-Dec, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70155
PMID:40759431
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研究论文 | 本研究探讨肠道微生物源性短链脂肪酸通过调节T细胞异质性改善复发性流产的机制 | 首次揭示短链脂肪酸通过GPR43受体调控CD4+ T细胞分化在复发性流产中的作用机制,并开发了结肠靶向短链脂肪酸纳米递送系统 | 动物模型与人类病理生理存在差异,临床转化需要进一步验证 | 探究肠道微生物代谢产物短链脂肪酸在复发性流产免疫耐受中的作用 | 复发性流产患者和小鼠模型 | 免疫学 | 复发性流产 | 单细胞测序, 16S rDNA测序, 粪便微生物移植, 分子生物学方法 | NA | 单细胞数据, 微生物组数据 | 复发性流产患者和小鼠模型 | NA | 单细胞测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2025-11-02 |
Integrative multiomics elucidate crotonylation-associated GCDH in Parkinson's disease pathogenesis via metabolome remodeling
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10151-x
PMID:40640550
|
研究论文 | 通过整合多组学方法阐明巴豆酰化相关基因GCDH通过代谢组重塑在帕金森病发病机制中的作用 | 首次将孟德尔随机化与中介分析相结合,系统揭示GCDH通过代谢物X-21,471和十四烷二酸介导帕金森病风险降低的机制,并发现GCDH在星形胶质细胞中特异性高表达 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,缺乏实验验证 | 阐明巴豆酰化及其代谢组调控网络在帕金森病发病机制中的作用 | 帕金森病患者脑组织和相关代谢物 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析,中介分析,单细胞转录组分析 | NA | 基因组数据,转录组数据,代谢组数据 | eQTLGen数据集和GEO单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 698 | 2025-11-02 |
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10163-7
PMID:41028288
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍在慢性阻塞性肺疾病中的因果机制 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CXCL16在COPD中的因果作用,并发现其通过破坏免疫代谢稳态驱动疾病进展 | NA | 识别COPD中肺泡巨噬细胞衍生的因果分子驱动因素 | 人类肺组织样本 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析, 细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 699 | 2025-11-02 |
Multi-omics dissection of RAD21-PON1 axis reveals metabolic-immune crosstalk and prognostic significance in hepatocellular carcinoma
2025-Dec, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10166-4
PMID:41143965
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了RAD21-PON1轴在肝细胞癌中连接代谢与免疫的核心调控作用 | 首次发现RAD21通过结合PON1启动子调控代谢通路活性并塑造免疫微环境,建立了RAD21-PON1风险特征用于预后分层 | 研究主要基于组学数据分析,需要进一步的实验验证机制细节 | 探究RAD21是否调控PON1以及该轴如何在肝细胞癌中整合代谢和免疫信号 | 肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, GSVA, TIDE, LASSO建模 | LASSO | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ChIP-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 700 | 2025-10-31 |
Pan-cancer neural regulation pattern with implications for patient stratification and immunotherapy
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102732
PMID:41147013
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研究论文 | 通过整合多组学数据系统描绘了泛癌神经调控模式及其对患者分层和免疫治疗的临床意义 | 首次系统性描绘泛癌神经-肿瘤相互作用全景图,发现神经信号与临床特征的相关性并构建神经癌症亚型分类 | 基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证神经调控机制 | 探究神经系统与癌症相互作用的调控模式及其在免疫治疗中的临床应用价值 | 10,000+ TCGA批量转录组、239个泛癌空间转录组、115个批量检查点抑制剂治疗转录组和120,000+单细胞转录组 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 批量转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组测序 | 配体-受体相互作用网络分析 | 转录组数据, 空间转录组数据 | >10,000 TCGA样本 + 239空间样本 + 115治疗样本 + >120,000单细胞 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |