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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-12-21 |
Immunoregulatory Roles of Tumor-Originated Pericytes Identified by Single-Cell Analysis in Glioblastoma
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511856
PMID:41001759
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人原发胶质母细胞瘤中的周细胞,揭示了肿瘤来源周细胞的存在及其在调节肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤生长中的免疫调节作用 | 首次在胶质母细胞瘤中通过单细胞分析区分出肿瘤来源周细胞和正常来源周细胞,并发现CD44标记的周细胞亚群与肿瘤相关巨噬细胞密切相关,具有促进M2极化和肿瘤生长的功能 | NA | 阐明胶质母细胞瘤中周细胞的起源、功能异质性及其免疫调节作用 | 人原发胶质母细胞瘤样本中的CD146阳性周细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人原发胶质母细胞瘤样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2025-12-21 |
Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514008
PMID:41017455
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)来源的细胞外囊泡(EVs)中circTAX1BP1通过VIRMA的乳酰化调控RNA m6A修饰,从而促进结直肠癌肝转移(CRLM)的分子机制 | 首次发现CAFs来源的EVs中circTAX1BP1通过招募AARS2促进VIRMA的乳酰化,进而增强SP1 mRNA的m6A修饰和稳定性,形成CRC细胞与ITGA11 myCAFs亚群之间的正反馈环路 | 研究主要基于体外和体内模型,临床样本验证有限,且PDX模型中的联合阻断策略需进一步临床前评估 | 阐明结直肠癌肝转移(CRLM)中肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞(CAFs)相互作用的分子机制 | 结直肠癌(CRC)细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、细胞外囊泡(EVs)、circTAX1BP1、VIRMA蛋白、SP1转录因子 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体内外功能实验、患者来源异种移植(PDX)模型 | NA | 测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2025-12-21 |
Associations of Plasma Metabolite Phenylacetylglutamine on Coronary Plaque Characterization in Patients with ST-Segment Elevation Myocardial Infarction
2025-Dec, Cardiovascular toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12012-025-10067-7
PMID:41091431
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研究论文 | 本研究探讨了肠道菌群代谢物苯乙酰谷氨酰胺(PAGln)与ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者罪犯斑块特征之间的关联 | 首次揭示了PAGln浓度与易损斑块特征独立相关,并通过单细胞RNA测序发现巨噬细胞可能参与此过程 | 研究为观察性设计,无法确定因果关系;样本仅来自STEMI患者,结果可能不适用于其他人群 | 探究血浆PAGln水平与STEMI患者罪犯斑块特征之间的关系 | ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 光学相干断层扫描(OCT),单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归模型 | 血浆代谢物数据,OCT影像数据,单细胞RNA测序数据 | 776名接受OCT成像的STEMI患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 664 | 2025-12-21 |
Effect of acupuncture on brain microenvironment in rats with post-stroke limb spasticity based on single-cell transcriptome sequencing technology
2025-Dec, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序技术,探讨了针刺对脑卒中后肢体痉挛大鼠脑微环境的影响及其可能机制 | 首次结合单细胞转录组测序技术研究针刺改善脑卒中后肢体痉挛的细胞类型比例变化及关键差异基因 | 研究仅在大鼠模型中进行,样本量有限,且未进行长期随访观察 | 探究针刺改善脑卒中后肢体痉挛的可能机制 | 大脑中动脉闭塞模型大鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,Western blot,实时定量聚合酶链反应,酶联免疫吸附测定 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 32只大鼠,分为对照组、假手术组、模型组和针刺组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 665 | 2025-12-21 |
Exploring Functionally Enhanced BLP-Trained Macrophage Subpopulations in S. Aureus Infection: Underlying Mechanisms and Therapeutic Significance
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417142
PMID:41117166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析BLP训练巨噬细胞在金黄色葡萄球菌感染中的转录组特征,揭示其增强抗感染能力的机制 | 首次在单细胞水平鉴定出BLP训练诱导的两个新巨噬细胞亚群C5和C7,并阐明其通过NRF2信号通路和代谢重编程增强抗感染功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化潜力需进一步评估 | 探究BLP训练巨噬细胞增强抗感染能力的分子机制及其治疗潜力 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) | 单细胞组学 | 败血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 666 | 2025-12-21 |
Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Implications
2025-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70521
PMID:41409095
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化(IPF)的细胞异质性、致病机制及治疗意义,整合了单细胞RNA测序和空间转录组学的最新发现 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示IPF中关键致病细胞群及其信号串扰,提出多维数据合成的细胞分子框架 | IPF的动态细胞间网络和时空调控机制仍不明确,致病机制尚未完全理解 | 阐明IPF的致病机制,为生物标志物引导的精准治疗提供概念基础 | 特发性肺纤维化(IPF)及其纤维化微环境中的上皮细胞、间充质细胞、免疫细胞和血管细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 667 | 2025-12-20 |
Microbial metabolite trimethylamine-N-oxide facilitates colorectal inflammation-cancer transformation by blocking lysosomal degradation of Wnt signaling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2597626
PMID:41376600
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了肠道微生物代谢物三甲胺-N-氧化物通过阻断Wnt信号通路的溶酶体降解促进结直肠炎症-癌症转化的机制 | 首次发现TMAO通过结合Hspa8分子伴侣阻断β-catenin的溶酶体降解,从而增强Wnt信号通路,为微生物代谢物在结直肠癌发生中的作用提供了新的机制见解 | 研究主要基于小鼠模型和患者来源的类器官,尚未在人体临床试验中得到验证,且TMAO的具体作用机制可能涉及其他未知通路 | 探究肠道微生物代谢物在结直肠炎症-癌症转化过程中的作用机制 | 结肠炎相关结直肠癌小鼠模型和患者来源的结直肠癌类器官 | NA | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、微生物组学、代谢组学 | NA | RNA测序数据、微生物组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2025-12-20 |
Dissecting antibody-mediated NK cell effects reveals a cytotoxic CX3CR1⁺KLRC2⁻CD16hisubset linked to HBV outcomes
2025-Dec-19, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2025.0842
PMID:41414761
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染中抗体介导的自然杀伤(NK)细胞反应,并鉴定了一个具有高细胞毒性的CX3CR1⁺KLRC2⁻CD16hi NK细胞亚群,该亚群与HBV治疗结局相关 | 利用特异性T细胞受体样抗体(cTCRL-Ab)检测NK细胞功能,并通过单细胞RNA测序揭示了一个先前未被充分认识的功能性NK细胞亚群(CX3CR1⁺KLRC2⁻CD16hi),该亚群在治疗反应良好的患者中富集 | 研究主要基于体外实验和队列观察,需要进一步的功能验证和机制研究来确认该NK细胞亚群的具体作用 | 评估慢性HBV感染中抗体介导的NK细胞反应的动态变化,并鉴定与疾病阶段和治疗反应相关的NK细胞亚群 | 慢性HBV感染患者的NK细胞 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 横断面和纵向队列的慢性HBV感染患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-12-20 |
Periaortic lymphatic vessels protect against thoracic aortic dissection through mobilizing immune response
2025-Dec-18, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf215
PMID:41213294
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研究论文 | 本研究揭示了主动脉周围淋巴管通过CXCL12-CXCR4信号通路招募免疫细胞,从而在胸主动脉夹层中发挥保护作用 | 首次系统阐明了主动脉周围淋巴管及其引流淋巴结(气管支气管淋巴结)在胸主动脉夹层中的功能,并揭示了其通过CXCL12-CXCR4信号轴招募免疫细胞的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;淋巴管功能增强疗法的长期安全性和临床转化潜力仍需进一步评估 | 探究淋巴管在胸主动脉夹层发病机制中的作用 | 胸主动脉夹层患者组织样本、小鼠疾病模型、淋巴管内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类TAD组织样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 670 | 2025-12-20 |
Exploring fibroblast activation protein as an early biomarker in chronic lung allograft dysfunction
2025-Dec-18, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01738-2025
PMID:41412718
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研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞激活蛋白(FAP)作为慢性肺移植物功能障碍(CLAD)早期生物标志物的潜力 | 首次在鼠类和人类单细胞RNA测序数据中证实FAP表达在CLAD中特异性上调于致病性成纤维细胞亚群,并建立了临床队列中FAP阳性面积阈值用于早期诊断和风险分层 | FAP的判别能力中等(AUC 0.78),需要在多中心队列中进行前瞻性验证 | 评估FAP在慢性肺移植物功能障碍中的表达变化及其作为早期诊断标志物的可行性 | 鼠类肺移植模型、人类肺组织样本以及240名肺移植受者的经支气管活检样本 | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | RNA测序数据,组织图像数据 | 鼠类模型2种,人类对照组5例,CLAD患者5例,临床队列240名肺移植受者(62例CLAD,178例非CLAD) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2025-12-20 |
CSF1R modulates megakaryopoiesis by targeting RUNX1 in immune thrombocytopenia
2025-Dec-18, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288511
PMID:41414965
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序发现CSF1R在免疫性血小板减少症患者巨核细胞中上调,并揭示其通过抑制RUNX1损害巨核细胞生成,为ITP提供了新的治疗靶点 | 首次发现CSF1R在ITP患者巨核细胞中上调,并阐明其通过抑制RUNX1损害巨核细胞生成的机制 | 样本量较小,仅包括一名新诊断ITP患者和少量临床样本进行验证 | 探究免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的机制 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓细胞、临床样本以及小鼠ITP模型 | 数字病理学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞术数据 | 一名新诊断ITP患者及额外临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 672 | 2025-12-20 |
Sodium butyrate inhibits colorectal cancer development by reducing M2 macrophage polarization and PD-L1 expression
2025-Dec-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00692-25
PMID:41251471
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研究论文 | 本研究探讨了短链脂肪酸丁酸钠通过抑制M2巨噬细胞极化和PD-L1表达来抑制结直肠癌发展的机制 | 结合单细胞转录组学与小鼠模型,揭示了丁酸钠通过HDAC/TLR4/MyD88信号通路抑制M2巨噬细胞极化,并与PD-L1阻断产生协同作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索丁酸钠抑制结直肠癌发展的机制及其与现有免疫疗法的联合策略 | 结直肠癌小鼠模型、巨噬细胞与结直肠癌细胞共培养系统 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 673 | 2025-12-20 |
Heat stress induced testicular impairment is related to orchitis and complement activation in Rongchang boars
2025-Dec-17, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01296-5
PMID:41402910
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研究论文 | 本研究探讨了热应激如何通过诱导睾丸炎和补体激活影响荣昌公猪的精液质量 | 首次在公猪中结合单细胞RNA测序技术揭示热应激诱导的睾丸炎与补体系统激活之间的关联,并明确了CD163+巨噬细胞在补体级联反应中的关键作用 | 样本量相对较小(26头8周龄荣昌公猪),且实验周期较短(3周),可能限制了结果的普遍性和长期效应评估 | 揭示热应激下公猪的潜在免疫反应及其对精液质量的影响,以解决环境温度相关的季节性不育问题并优化人工授精中的公猪选择 | 荣昌公猪的睾丸组织和精液样本 | 生殖生物学与免疫学 | 睾丸炎与不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、组织学评估、免疫组化、精液分析 | NA | 基因表达数据、组织图像、精液参数 | 26头8周龄荣昌公猪 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2025-12-20 |
Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Colorectal Cancer Lung Metastases: Implications for Recurrence After Metastasectomy
2025-Dec-17, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2025.691
PMID:41414807
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌肺转移灶中免疫抑制性肿瘤微环境(TME)的特征,特别是SPP1+肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的富集和效应T细胞、NK细胞的耗竭,并发现这些特征与术后复发相关 | 首次在结直肠癌肺转移灶中综合运用多重免疫组化、全外显子组测序、转录组分析和单细胞RNA测序,系统描绘了其免疫抑制性TME,并明确了SPP1+ TAMs作为复发预测的关键细胞亚群 | 样本量较小(15例患者),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 | 表征结直肠癌肺转移灶的肿瘤微环境,并识别与术后复发相关的因素 | 接受肺转移灶切除术的结直肠癌患者的匹配肿瘤组织、癌旁组织和远处正常肺组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 多重免疫组化(IHC)、全外显子组测序、转录组分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 图像、基因组序列、转录组表达数据、单细胞表达数据 | 15名结直肠癌肺转移患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 675 | 2025-12-20 |
Single-cell identification of an endothelial cell proximal SPP1+ macrophage population defines the metastatic vascular niche in lymph nodes
2025-Dec-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27796-y
PMID:41402359
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据,在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中发现了一个独特的、高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群,并揭示了其通过与内皮细胞的相互作用促进血管生成,从而形成转移性血管微环境的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌的转移淋巴结中,通过单细胞分析鉴定出一个特定的、富含SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明了该亚群通过SPP1-ITGa9b1和FN1-ITGa2b1信号轴与内皮细胞相互作用,促进血管生成和淋巴转移的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据分析,样本量相对有限(n=41),且功能机制验证主要依赖生物信息学分析和免疫组化,缺乏更深入的体内外功能实验验证 | 探究头颈鳞状细胞癌淋巴结转移的细胞和分子机制,特别是肿瘤微环境中细胞间的相互作用 | 头颈鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、转移淋巴结和非转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组化,多重免疫组化,空间分析 | NA | 单细胞转录组数据,bulk RNA-seq数据,图像数据 | 41个样本(来自多个公共数据库) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2025-12-20 |
Single-cell and spatial transcriptomic characterization of pulmonary pleomorphic carcinoma
2025-Dec-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09162-w
PMID:41402584
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,对肺多形性癌的分子基础进行了多组学分析,揭示了其上皮和肉瘤样成分的细胞动态及潜在治疗靶点 | 首次结合数字空间分析和单细胞RNA测序对肺多形性癌进行多组学表征,发现MET基因和蛋白仅在上皮成分中过表达,并识别出具有中间EMT状态和ECM重塑特征的细胞群作为新治疗靶点 | 研究样本量较小,且为罕见肺癌亚型,可能限制结果的普遍性 | 阐明肺多形性癌的分子基础,包括其上皮和肉瘤样成分的细胞动态,以识别潜在治疗靶点 | 肺多形性癌(PPC)患者样本,包括上皮和肉瘤样成分 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),数字空间分析,多组学分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 677 | 2025-12-18 |
ST-FFPE-mIF: integrating spatial transcriptomics and multiplex immunofluorescence in formalin-fixed paraffin-embedded tissues using Stereo-seq
2025-Dec-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03900-3
PMID:41402878
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 678 | 2025-12-20 |
Spatial transcriptomic alignment, integration, and 3D reconstruction by STAIR
2025-Dec-15, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03895-x
PMID:41398698
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STAIR的端到端解决方案,用于空间转录组学中的切片对齐、整合和3D重建 | 首次提出使用具有点水平和切片水平注意力机制的异构图注意力网络,实现统一嵌入空间并指导无监督3D重建,在平行切片的z轴重建方面表现出首创性性能 | NA | 解决空间转录组学中将多个切片合并为统一3D图谱的挑战 | 空间转录组学数据切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 异构图注意力网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 679 | 2025-12-20 |
Differential Regulation of APOE4-Mediated Astrocytic Lipid Metabolism by BMP Signaling Exacerbates Alzheimer's Disease Pathologies in Neurons
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.14.694212
PMID:41415446
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研究论文 | 本研究探讨了BMP信号如何通过调控APOE4介导的星形胶质细胞脂质代谢,加剧阿尔茨海默病神经元病理 | 首次揭示了BMP信号在APOE4与衰老相互作用中的关键角色,并建立了星形胶质细胞脂质代谢与神经元tau蛋白过度磷酸化之间的因果关系 | 研究主要基于体外iPSC模型,缺乏体内验证;样本规模未明确说明 | 探究衰老相关BMP信号与APOE4多态性在阿尔茨海默病发病机制中的相互作用 | iPSC来源的星形胶质细胞与共培养的神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 细胞共培养模型 | 转录组数据、蛋白质磷酸化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 680 | 2025-12-20 |
A transition zone enriched WIF1 ⁺ basal cell subtype is associated with benign prostatic hyperplasia
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692826
PMID:41415376
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,识别出在良性前列腺增生中富集的WIF1⁺基底细胞亚型,并探讨其在前列腺过渡区的分布及潜在病理作用 | 首次通过大规模单细胞RNA测序识别出前列腺过渡区富集的WIF1⁺基底细胞亚型,并揭示其与良性前列腺增生发病机制的关联 | 研究基于前列腺切除标本的良性区域,可能未完全反映疾病进展或不同阶段的细胞变化 | 探究人类前列腺不同区域的细胞组成及其疾病易感性,特别是良性前列腺增生的发病机制 | 人类前列腺的良性区域,包括过渡区和非过渡区 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前列腺切除标本的良性区域 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |