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当前共找到 764 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-11-21 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了默克尔细胞癌中表皮和真皮区域的基因表达差异 | 首次在空间分辨率下展示了表皮性默克尔细胞癌的转录组特征，发现其具有角质形成细胞分化特征 | 样本数量有限，且主要关注表皮性肿瘤区域 | 探索表皮微环境对默克尔细胞癌肿瘤细胞行为的调控作用 | 默克尔细胞癌肿瘤细胞，特别是表皮性和真皮性肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 默克尔细胞癌 | 高分辨率空间转录组学，单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2025-11-21 |
Macrophage Phospholipase D3 promotes atherosclerosis via exacerbating foam cell formation and inducing inflammatory responses
2025-Dec, International journal of cardiology. Heart & vasculature
DOI:10.1016/j.ijcha.2025.101834
PMID:41245776
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞磷脂酶D3通过加剧泡沫细胞形成和诱导炎症反应促进动脉粥样硬化的机制 | 首次系统阐明PLD3在动脉粥样硬化中的功能作用及分子机制，发现其通过CD36介导的脂质积累和NF-κB驱动的炎症反应促进疾病进展 | 研究主要基于小鼠模型和THP-1细胞系，人类样本验证相对有限 | 探究PLD3在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠模型、THP-1源性巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blotting、慢病毒介导的基因敲降、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠、THP-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 643 | 2025-11-21 |
YAP/TAZ deletion in vascular smooth muscle cells mirrors atherosclerosis-associated transcriptional programs
2025-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2025.100487
PMID:41246212
|
研究论文 | 本研究通过血管平滑肌细胞特异性缺失YAP/TAZ，揭示其转录程序与动脉粥样硬化发展的相似性 | 首次证明YAP/TAZ缺失诱导的VSMC转录变化能重现动脉粥样硬化关键特征，并鉴定出19个保守的YAP-TEAD靶基因 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究YAP/TAZ缺失对血管平滑肌细胞表型的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 转录组学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-seq, 启动子基序分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠VSMC样本（2周和8周YAP/TAZ缺失时间点） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 644 | 2025-11-20 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Dec, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析探讨短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析儿科乳糜泻患者短期无麸质饮食后的免疫细胞转录变化 | 样本量较小（仅5名患者），结果需谨慎解读，需要更大规模队列研究验证 | 研究短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节机制 | 儿科乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名儿科乳糜泻患者（治疗前后配对样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 645 | 2025-11-19 |
Aldehyde dehydrogenase ALDH3A1 rescues cigarette smoke-induced emphysema by conferring alveolar type 2 to type 1 cell transition
2025-Dec-16, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了醛脱氢酶ALDH3A1通过促进肺泡Ⅱ型细胞向Ⅰ型细胞转化来挽救香烟烟雾诱导的肺气肿 | 首次发现AHR/ARNT/ALDH3A1信号通路在维持肺泡结构中的关键作用，并建立小鼠肺泡类器官模型模拟人类肺部变化 | 研究主要基于体外模型和动物模型，需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 探究香烟烟雾诱导肺气肿中肺泡Ⅱ型细胞向Ⅰ型细胞转化的调控机制 | 人类肺泡细胞、小鼠肺气肿模型、肺泡类器官 | 生物医学研究 | 肺气肿 | 单细胞RNA测序，肺泡类器官培养，基因过表达 | 动物模型，体外类器官模型 | 基因表达数据，肺功能数据，组织形态数据 | 未明确样本数量，使用人类肺泡细胞、小鼠模型和类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 646 | 2025-11-19 |
High serum LDL promotes EMT and stemness through LDLR/FOXQ1/NF-κB1 pathway in epithelial ovarian cancer
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03609-4
PMID:41125790
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研究论文 | 本研究揭示了高血清LDL通过LDLR/FOXQ1/NF-κB1通路促进上皮性卵巢癌EMT和干性特征的机制 | 首次发现FOXQ1/β-Catenin/ADNP转录复合物，并阐明β-Catenin和ADNP在该通路中作为竞争性抑制因子的作用 | NA | 探究循环LDL在卵巢癌进展中的作用机制 | 上皮性卵巢癌细胞、卵巢癌异种移植转移模型、人类病理标本 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 647 | 2025-11-18 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Dec, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中通过血脑屏障功能障碍和神经炎症的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用，并揭示其通过影响小胶质细胞、血脑屏障功能和IL-1β表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因，为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 基因表达数据、慢性不可预见应激小鼠模型的前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据 | 慢性不可预见应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 648 | 2025-11-18 |
Multi-tissue spatial transcriptomics identified simultaneous responses to oxidative stress and apoptosis in parallel with tissue-specific reprogramming in modeled chronic kidney disease-mineral and bone disorder
2025-Dec, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf161
PMID:41216610
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研究论文 | 本研究通过多组织空间转录组学方法，揭示了慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱模型中氧化应激和凋亡的同步响应以及组织特异性重编程 | 首次采用多组织空间转录组学方法同时分析皮质骨、肌肉和骨髓中的基因组重编程，识别了组织特异性和共同性转录变化 | 研究仅使用雄性小鼠模型，样本量有限，且仅采用一种疾病诱导方法 | 识别和区分慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱中组织特异性和共同性基因组重编程 | 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱雄性小鼠的股骨-肌肉组织 | 空间转录组学 | 慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱 | 空间转录组学，qPCR | 均匀流形逼近与投影 | 空间转录组数据，基因表达数据 | 腺嘌呤饮食诱导CKD-MBD小鼠和酪蛋白对照饮食小鼠的股骨-肌肉组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术 |
| 649 | 2025-11-18 |
Claudin-1 is a mediator and therapeutic target in primary sclerosing cholangitis
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.005
PMID:40846184
|
研究论文 | 本研究揭示Claudin-1在原发性硬化性胆管炎发病机制中的关键作用，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统证实CLDN1在PSC中的病理作用，并开发特异性单克隆抗体作为新型治疗策略 | 主要依赖临床前模型验证，需要进一步临床试验确认疗效 | 探究CLDN1在PSC发病机制中的作用并评估其作为治疗靶点的可行性 | PSC患者队列、小鼠模型和患者来源的细胞模型 | 数字病理学 | 原发性硬化性胆管炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 五个PSC患者队列的肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 650 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals T cell heterogeneity and metabolic reprogramming in human immune-mediated glomerulonephritis
2025-Dec-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2582720
PMID:41241792
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类免疫介导性肾小球肾炎中T细胞的异质性和代谢重编程 | 首次构建人类免疫介导性肾小球肾炎T细胞的单细胞图谱，揭示疾病特异性T细胞状态、代谢特征和激活机制 | 研究局限于三种主要IMGN类型，样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 阐明T细胞在人类免疫介导性肾小球肾炎发病机制中的特征和功能作用 | 免疫介导性肾小球肾炎患者的肾脏T细胞 | 单细胞组学 | 肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序 | 基因共表达网络，细胞分化轨迹推断 | 单细胞转录组数据 | 三种主要IMGN类型（IgA肾病、狼疮性肾炎、膜性肾病）的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 651 | 2025-11-17 |
Digital pathology and spatial omics in steatohepatitis: Clinical applications and discovery potentials
2025-Dec-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000866
PMID:38517078
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综述 | 本文综述了数字病理学和空间组学在脂肪性肝炎中的临床应用与发现潜力 | 整合数字病理学与空间生物学，通过机器学习算法增强组织学解读准确性，并探讨多模态整合的潜力 | 讨论了现有工具的局限性、知识缺口和技术前提条件 | 改善脂肪性肝炎的组织学解读准确性并探索疾病异质性 | 脂肪性肝炎患者的肝脏组织切片 | 数字病理学 | 脂肪性肝炎 | 线性与非线性显微镜、空间转录组学、空间蛋白质组学 | 机器学习算法 | 全切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 652 | 2025-11-17 |
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156280
PMID:41177096
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综述 | 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 | 系统梳理了NGS技术在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗等领域的广泛应用，并展望了多组学数据整合和单细胞测序的发展前景 | 作为综述文章，未涉及具体实验设计和数据验证 | 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 | 新一代测序技术及其产生的基因组数据 | 基因组学 | 癌症,罕见病 | 新一代测序(NGS) | NA | DNA序列数据,RNA序列数据 | NA | NA | 新一代测序,单细胞测序 | NA | NA |
| 653 | 2025-11-17 |
EMC8 expression in head and neck squamous cell carcinoma: Implications for poor prognosis and deficient CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156255
PMID:41072210
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研究论文 | 本研究探讨EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与预后和CD8+ T细胞浸润的关系 | 首次揭示EMC8在HNSCC中高表达与不良预后和CD8+ T细胞浸润减少的关联 | EMC8促进免疫逃避和恶性肿瘤的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的临床意义和免疫功能 | 头颈部鳞状细胞癌组织和患者临床样本 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 临床生存数据, 单细胞测序数据 | HNSCC患者组织样本和临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 654 | 2025-11-17 |
A newly developed Germlings Harvester (GEHA) in combination with metabarcoding analysis detected numerous plankton species, particularly HABs-causing species, from in-situ germination of resting stage cells
2025-Dec, Harmful algae
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.hal.2025.103002
PMID:41241549
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研究论文 | 开发了新型Germlings Harvester (GEHA)设备并结合宏条形码技术，首次实现海洋沉积物中浮游生物休眠阶段细胞的原位萌发检测 | 首次开发GEHA设备实现原位检测浮游生物休眠细胞萌发，结合宏条形码技术发现128种新型休眠阶段细胞生产者，首次观测到9种有害藻华物种的原位萌发 | 未提及方法检测限和定量准确性，尚未进行大规模推广应用验证 | 研究浮游生物休眠阶段细胞萌发对群落组成和有害藻华形成的影响 | 海洋沉积物中的浮游生物休眠阶段细胞（包括甲藻孢囊、硅藻孢子等） | 环境微生物学 | NA | 宏条形码分析、单细胞测序、克隆培养 | NA | 基因序列数据、物种鉴定数据 | 从青岛湾沉积物中鉴定出220种浮游生物物种 | NA | 宏条形码测序、单细胞测序 | NA | NA |
| 655 | 2025-11-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-Dec, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
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综述 | 本文系统评述了空间转录组学中细胞类型反卷积方法的类型、功能对比，并创建了在线交互式表格以促进方法选择 | 开发了基于网络的交互式表格工具，帮助研究人员更高效地选择适合的空间转录组细胞类型反卷积方法 | NA | 评述空间转录组学中细胞类型反卷积方法的现状与发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型组成 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 656 | 2025-11-16 |
Simultaneously infer cell pseudotime, velocity field, and gene interaction from multi-branch scRNA-seq data with scPN
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf144
PMID:41229398
|
研究论文 | 提出一种名为scPN的新型高维动力学建模方法，可从单细胞RNA测序数据同时推断细胞伪时间、速度场和基因相互作用 | 首次能够在多分支数据集上同时恢复伪时间、速度场和基因相互作用，使用分段基因-基因相互作用网络建模基因调控动力学 | NA | 从单细胞RNA测序数据建模细胞动力学，理解细胞发育和基因调控关系 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育过程和基因相互作用网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 高维动力学模型，分段网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2025-11-16 |
Allele-specific immune gene quantification and expression analysis in single-cell RNA-seq data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf149
PMID:41229397
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据中免疫基因等位基因特异性表达定量的新型计算方法 | 开发了新型R/Bioconductor数据结构，可处理多个免疫遗传注释层的表达数据，并支持免疫基因表达的交互式探索 | NA | 研究人类免疫基因组多样性中的等位基因特异性表达模式 | 人类免疫基因（如HLA和KIR基因） | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 658 | 2025-11-15 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肠道微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控结肠上皮细胞身份和功能的机制 | 发现了微生物通过丁酸盐-GPR109A信号通路调控具有吸收和分泌双重特征的非常规隐窝间杯状细胞的新机制 | NA | 阐明微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞身份和功能 | 小鼠结肠上皮细胞和人类样本 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 使用无菌小鼠、抗生素处理小鼠和定植实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 659 | 2025-11-15 |
GPR91 mediates low shear stress-induced endothelial ferroptosis via EGR1-dependent GPX4 repression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112127
PMID:40939914
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研究论文 | 本研究揭示低剪切应力通过GPR91/EGR1/GPX4信号轴诱导血管内皮细胞铁死亡的分子机制 | 首次发现GPR91作为机械敏感受体连接低剪切应力与铁死亡信号通路，并阐明EGR1介导的GPX4转录抑制机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步在体实验验证 | 探究低剪切应力诱导内皮细胞铁死亡的分子机制 | 血管内皮细胞、HEK293T细胞、动脉粥样硬化斑块 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、ChIP-qPCR、RNA测序、平行板流动腔系统 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 660 | 2025-11-15 |
Elevated P4HB expression in hepatocellular carcinoma and its role in UCA1-mediated malignant progression
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112131
PMID:40945634
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研究论文 | 本研究探讨P4HB在肝细胞癌中的表达及其通过UCA1促进恶性进展的作用机制 | 首次发现P4HB与lncRNA UCA1的相互作用机制，揭示其通过增强糖酵解促进HCC恶性行为 | NA | 研究P4HB在肝细胞癌进展中的作用及其作为诊断生物标志物的潜力 | 肝细胞癌细胞和患者血清样本 | 癌症研究 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，ROC分析，体外和体内功能实验 | NA | 单细胞测序数据，血清蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |