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当前共找到 1237 篇文献,本页显示第 641 - 660 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
641 2025-12-23
GSDME-dependent pyroptosis drives abdominal aortic aneurysm via promoting vascular senescence
2025-Dec-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了GSDME依赖性非经典焦亡在腹主动脉瘤中的作用及其通过促进血管衰老的机制 首次揭示了GSDME依赖性非经典焦亡在腹主动脉瘤中作为'主开关'调控血管衰老的作用 研究主要基于小鼠模型和患者样本,临床转化潜力需进一步验证 确定GSDME依赖性非经典焦亡在腹主动脉瘤病理中的作用 腹主动脉瘤小鼠模型和患者样本 数字病理 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重流式细胞术 NA RNA测序数据, 流式细胞数据 小鼠模型和患者样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
642 2025-12-23
Neutrophil-derived thrombospondin-1 (THBS1) drives type 2 diabetes-induced osteoporosis via CD36-PPARγ-POU2F2 signaling
2025-Dec-15, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 本研究揭示了2型糖尿病中中性粒细胞来源的血小板反应蛋白-1通过CD36-PPARγ-POU2F2信号通路促进破骨细胞生成,从而加剧骨质疏松的新机制 首次发现中性粒细胞来源的THBS1在2型糖尿病诱导的骨质疏松中的关键作用,并阐明了其通过CD36-PPARγ-POU2F2-c-FOS轴促进破骨细胞分化的分子通路 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体临床相关性有待进一步验证;虚拟筛选发现的抑制剂nasunin的临床疗效和安全性需要更多研究 探究2型糖尿病中中性粒细胞如何促进骨质疏松及其分子机制,寻找潜在治疗靶点 2型糖尿病小鼠模型、野生型小鼠、原代细胞培养、中性粒细胞、巨噬细胞、破骨细胞 NA 2型糖尿病、骨质疏松 单细胞RNA测序、TRAP染色、micro-CT成像、定量PCR、Western blotting、染色质免疫沉淀-qPCR、流式细胞术、虚拟筛选 NA 基因表达数据、影像数据、蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
643 2025-12-23
Lipid accumulation in foam cells drives C1q-dependent synaptic loss and impairs motor function recovery after spinal cord injury
2025-Dec-13, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了脊髓损伤后巨噬细胞脂质积累通过C1q依赖性突触损失损害运动功能恢复的新机制 首次将巨噬细胞脂质代谢与C1q依赖性突触损伤联系起来,并发现bazedoxifene作为潜在治疗候选物 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 探究脊髓损伤后巨噬细胞功能机制及其对功能恢复的影响 脊髓损伤小鼠模型中的巨噬细胞亚群 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序,高通量筛选 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
644 2025-12-23
Fibroblasts sense spatial proximity via an EGFR-CREB5 axis to restore quiescent synovial lining in remission rheumatoid arthritis
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学揭示了类风湿关节炎缓解期成纤维细胞通过EGFR-CREB5轴感知空间邻近性以恢复静息滑膜内衬的机制 首次发现成纤维细胞通过HB-EGF-EGFR信号通路感知空间密度,并通过CREB5转录因子调控滑膜内衬成纤维细胞分化的新机制 研究样本仅限于缓解期RA患者活检组织,未探讨其他关节炎类型或疾病活动期的机制差异 探究类风湿关节炎缓解期滑膜内衬稳态恢复的分子机制 类风湿关节炎患者的滑膜活检组织 空间转录组学 类风湿关节炎 空间转录组学 NA 空间转录组数据 缓解期RA患者活检样本(具体数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
645 2025-12-23
SIDISH integrates single-cell and bulk transcriptomics to identify high-risk cells and guide precision therapeutics through in silico perturbation
2025-Dec-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 SIDISH是一个神经网络框架,通过整合单细胞和批量转录组数据来识别高风险细胞群并指导精准治疗 结合变分自编码器、深度Cox回归和迁移学习,实现单细胞粒度与大规模临床数据的整合,并包含in silico扰动模块以模拟干预 未在摘要中明确提及具体限制 开发一个计算工具,用于疾病风险评估和治疗优先排序,以促进精准医学 单细胞和批量转录组数据,以及空间转录组数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序,空间转录组学 变分自编码器,深度Cox回归,神经网络 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq,空间转录组学 NA NA
646 2025-12-23
Elucidating a Myofibroblast-dominated Fibrotic Niche in Crohn's Disease-associated Fibrostenosis Through High-resolution Spatial Transcriptomics
2025-Dec-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过高分辨率空间转录组学揭示了克罗恩病相关纤维狭窄中一个以肌成纤维细胞为主的纤维化微环境 首次在克罗恩病纤维狭窄中应用高分辨率空间转录组学技术,明确了肌成纤维细胞的细胞身份、起源及周细胞向肌成纤维细胞样表型的转录重编程 研究样本量有限(仅分析了1例非纤维化和1例纤维狭窄性回肠标本),且为回顾性分析,可能影响结果的普遍性 阐明克罗恩病相关纤维狭窄中黏膜下层肌样细胞增生的细胞身份和分子机制 克罗恩病患者(正常、非狭窄性和狭窄性)的回肠组织,以及公共单细胞RNA测序数据集 数字病理学 克罗恩病 高分辨率空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光,原代周细胞培养,定量聚合酶链反应 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,组织学图像 117例克罗恩病患者回顾性超声分析,104例组织样本(25例正常,35例非狭窄性CD,44例狭窄性CD),外加公共单细胞RNA测序数据集(n=158) NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
647 2025-12-23
TMPRSS11B promotes an acidified microenvironment and immune suppression in squamous lung cancer
2025-Dec, EMBO reports IF:6.5Q1
研究论文 本研究揭示了跨膜丝氨酸蛋白酶TMPRSS11B通过促进肿瘤微环境酸化和免疫抑制,驱动肺鳞状细胞癌进展的机制 首次发现TMPRSS11B通过促进乳酸外排导致肿瘤微环境酸化,并富集免疫抑制性巨噬细胞,为肺鳞癌提供了新的治疗靶点 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证尚不充分;TMPRSS11B的具体下游信号通路机制有待进一步阐明 探究TMPRSS11B对肺鳞状细胞癌肿瘤微环境及免疫系统的影响 肺鳞状细胞癌(LUSC)肿瘤微环境、免疫细胞、Krt13 hillock样细胞 肿瘤免疫学 肺癌 RNA FISH、空间转录组学、超pH敏感纳米颗粒成像、代谢物分析 NA 空间转录组数据、代谢物数据、成像数据 免疫健全小鼠模型(SNL模型) NA 空间转录组学 NA NA
648 2025-12-23
Beyond FoxP3-Identification of a Chicken Regulatory T Cell Signature
2025-Dec, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序技术,定义了鸡调节性T细胞的可靠标记物,包括CD4、CD25、CTLA-4和GITR的组合,揭示了其进化保守性和物种特异性差异 首次描述了鸡特异性CTLA-4抗体,该抗体仅染色细胞内CTLA-4,区别于哺乳动物,并首次通过单细胞RNA测序确认了富含CTLA4和TNFRSF18表达的FOXP3簇 CTLA-4的细胞内表达限制了其在功能实验中的应用 研究鸡调节性T细胞的表型,以定义可靠的标记物用于其鉴定和表征 鸡的CD4脾细胞,包括CD25+、CD25-和CD25亚群 免疫学 NA RNA测序, 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
649 2025-12-22
Robust integration and annotation of single-cell and spatial omics data using interpretable gene programs
2025-Dec-19, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 提出一个名为SSpMosaic的计算框架,利用可解释的基因程序作为通用锚点,实现单细胞和空间组学数据的稳健整合与注释 建立了元程序作为跨数据集对齐的高阶基因程序表示,实现了跨批次、模态和物种的一致整合,并能进行分辨率无关的空间转录组解卷积 NA 开发一个计算框架来整合和注释单细胞与空间组学数据,以解码细胞身份和生物功能 单细胞和空间组学数据 生物信息学 NA 单细胞转录组学、染色质可及性、空间转录组学 NA 基因表达数据、空间位置数据 NA 10x Genomics, NanoString 单细胞RNA-seq、空间转录组学 10x Visium, CosMx, Visium HD Visium(点水平)、CosMx/Visium HD(亚细胞水平)
650 2025-12-22
Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis
2025-Dec-18, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和TRAP-seq技术,在小鼠动脉粥样硬化模型中表征了巨噬细胞在主动脉、脂肪组织和肝脏中的功能多样性,并识别了Trem2、Folr2和Slc7a7作为巨噬细胞相关生物标志物,用于疾病诊断和监测 首次结合单细胞RNA测序和TRAP-seq技术,系统评估了巨噬细胞在动脉粥样硬化关键组织中的组织特异性基因程序,并识别了跨物种共享的生物标志物,包括Trem2作为循环生物标志物、Folr2和Slc7a7作为PET示踪剂靶点 研究基于小鼠模型,人类样本验证有限;PET示踪剂应用尚处探索阶段,需进一步临床验证 阐明巨噬细胞在动脉粥样硬化中的驱动机制,识别可用于诊断、监测和治疗的生物标志物 小鼠动脉粥样硬化模型中的巨噬细胞,涉及主动脉、脂肪组织和肝脏组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, TRAP-seq, PET成像 NA RNA测序数据, 成像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
651 2025-12-22
[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]
2025-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:41399063
研究论文 本研究通过B细胞单细胞RNA测序对干燥综合征患者进行分子分型,揭示了三种具有不同基因特征和临床异质性的亚型 首次利用B细胞scRNA-seq数据对干燥综合征患者进行无监督聚类,建立了分子分型框架,并识别了亚型特异性的核心调控基因和潜在治疗靶点 研究样本量相对较小(24名患者和4名健康对照),且数据来源于公共数据库,缺乏独立验证队列 建立干燥综合征的分子分类框架,以阐明其临床异质性并为靶向治疗提供见解 干燥综合征患者和健康对照者的B细胞 单细胞组学 干燥综合征 单细胞RNA测序 无监督聚类 单细胞RNA测序数据 24名干燥综合征患者和4名健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
652 2025-12-22
Pomalidomide enhances CAR-T cell therapeutic efficacy and remodels immune microenvironment in lymphoid malignancies
2025-Dec-18, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究探讨了泊马度胺如何增强CAR-T细胞功能并重塑免疫微环境,以克服淋巴恶性肿瘤治疗中的局限性 揭示了泊马度胺通过直接增强CAR-T细胞功能(如记忆、细胞因子/趋化因子产生、代谢适应性和减少耗竭)以及重塑抑制性免疫微环境(增加细胞毒性效应细胞、减少MDSC活性)来协同CAR-T治疗的机制 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本仅来自一名淋巴瘤患者,样本量有限,需要更大规模的临床研究验证 阐明泊马度胺增强CAR-T细胞功能和重塑免疫微环境的机制,以优化难治性淋巴恶性肿瘤的治疗组合 人类CAR-T细胞、多发性骨髓瘤异种移植模型、淋巴瘤患者外周血单个核细胞 肿瘤免疫治疗 淋巴恶性肿瘤 CCK-8、LDH、qPCR、ELISA、流式细胞术、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、细胞表型数据 体外人类CAR-T细胞、多发性骨髓瘤异种移植模型、一名淋巴瘤患者的外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
653 2025-12-22
Integrating whole-exome sequencing and scRNA-seq reveal the characteristic in one clear cell renal cell carcinoma sample arising in the setting of VHL disease
2025-Dec-18, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合全外显子组测序和单细胞RNA测序技术,揭示了VHL疾病背景下透明细胞肾细胞癌的基因表达特征和肿瘤微环境特点 首次在单细胞水平上对VHL疾病相关的ccRCC进行特征分析,并整合了DNA突变和转录组数据以揭示其独特特性 仅使用了一个VHL突变样本进行研究,样本量较小,可能限制结果的普遍性 探究VHL疾病背景下透明细胞肾细胞癌的分子特征和肿瘤微环境 一个VHL突变ccRCC样本和六个非VHL突变ccRCC样本 数字病理学 肾癌 全外显子组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 Seurat 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 一个VHL突变ccRCC样本和六个非VHL突变ccRCC样本 NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 NA NA
654 2025-12-22
Molecular subtyping and prognostic evaluation in idiopathic pulmonary fibrosis: a focus on mechanical-related genes
2025-Dec-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究聚焦于机械力相关基因,对特发性肺纤维化进行分子分型与预后评估 首次将机械力相关基因评分应用于IPF,识别出与机械力相关的核心基因和分子亚型,并通过单细胞RNA测序和CMap分析揭示了潜在的致病机制与治疗靶点 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床队列验证核心基因的预后价值 探究机械敏感基因在特发性肺纤维化发病机制中的作用,并进行分子分型与预后评估 特发性肺纤维化患者样本与对照样本 生物信息学 肺纤维化 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法,Cox回归分析,Connectivity Map分析 机器学习算法,Cox回归模型,列线图 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,临床病理数据 IPF样本与对照样本(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
655 2025-12-22
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-Dec, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了健康成年人中与年龄相关的免疫动态变化 结合单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术,纵向追踪96名成年人两年,首次系统描绘了年龄相关的T细胞转录重编程及其功能影响 研究主要关注外周血免疫细胞,未涉及组织特异性免疫变化;样本量虽大但年龄范围有限(25-90岁),且仅针对流感疫苗响应 探究健康成年人免疫系统随年龄变化的动态过程及其机制 300多名健康成年人(25-90岁)的外周血单个核细胞,重点关注T细胞和B细胞亚群 免疫学 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 蛋白质数据, 流式细胞数据 超过300名健康成年人,其中96人进行为期两年的纵向追踪 NA 单细胞RNA-seq NA NA
656 2025-12-22
Anti-progestin therapy targets hallmarks of breast cancer risk
2025-Dec, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究评估了抗孕激素药物醋酸乌利司他通过12周治疗,对24名绝经前女性乳腺癌风险标志物的影响,发现其能减少上皮增殖、基质重塑和管腔祖细胞活性 首次在临床试验中结合多层组学、活细胞方法、临床成像和组织微力学,揭示抗孕激素治疗通过胶原VI重塑和SOX9管腔祖细胞定位关联,抑制乳腺癌风险 样本量较小(仅24名绝经前女性),治疗周期较短(12周),且为早期阶段试验,长期效果和安全性需进一步验证 评估抗孕激素疗法是否通过减少乳腺癌风险标志物,实现绝经前乳腺癌的预防 24名绝经前女性乳腺癌风险患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、蛋白质组学、组织学、原子力显微镜、MRI成像 NA 组学数据、图像、微力学数据 24名绝经前女性 NA 单细胞RNA-seq NA NA
657 2025-12-22
IFN-Mediated Bronchial Epithelium Cellular Senescence in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Dec, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者支气管上皮细胞中细胞衰老的机制,并探讨了IFN通路在其中的作用 首次在COPD中结合单细胞RNA测序技术,系统分析了支气管上皮细胞亚型中的衰老标记分布,并发现I/II型干扰素介导的衰老表型,以及JAK-STAT和cGAS-STING通路抑制剂对衰老的缓解作用 研究样本量有限,且主要基于体外培养细胞和组织学分析,未涉及长期体内干预效果验证 阐明COPD中支气管上皮细胞衰老的分子机制及其在疾病发病中的作用 COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞及肺组织 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、组织学图像 COPD患者和健康受试者的原代支气管上皮细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
658 2025-12-22
MAGNET: Multi-view graph autoencoder with cell-gene attention for cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2025-Dec, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为MAGNET的多视图图自编码器框架,通过细胞-基因注意力模块整合细胞外部相互作用与内部基因调控,用于从空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 开发了细胞-基因注意力模块,将细胞环境与内部基因活动在统一表示中连接,克服了现有方法将两者分离处理的限制 未明确提及 从空间转录组数据中准确推断细胞间相互作用网络 空间转录组数据中的细胞 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 多视图图自编码器 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
659 2025-12-22
Identification of intestinal enteroendocrine cell subtypes and their associated hormones in zebrafish
2025-Dec, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和质谱分析,鉴定了斑马鱼肠道内分泌细胞的亚型及其相关激素,并揭示了其分化机制 首次在斑马鱼中系统鉴定肠道内分泌细胞亚型,发现神经生成素3(neurog3)和胃饥饿素阳性细胞作为不同亚型的前体细胞,并识别出新的斑马鱼分泌素同源物 研究主要基于斑马鱼模型,结果可能不完全适用于哺乳动物,且神经生成素3在斑马鱼中的作用与哺乳动物存在差异 探究斑马鱼肠道内分泌细胞亚型的分化、激素产生及其发育生物学机制 斑马鱼的肠道内分泌细胞及其亚型 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 质谱分析 NA RNA测序数据, 质谱数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
660 2025-12-21
Bulk Transcriptome and Single-Cell Sequencing Datasets Reveal Key Programmed Cell Death Patterns in Radiation-Induced Lung Injury: Crosstalk Between NETosis and Macrophages' Responses
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究整合了批量转录组和单细胞RNA测序数据集,揭示了辐射诱导肺损伤中NETosis与巨噬细胞反应之间的关键程序性细胞死亡模式 首次通过整合批量转录组和单细胞测序数据,识别出NETosis是辐射诱导肺损伤中最显著的程序性细胞死亡亚型,并揭示了中性粒细胞与巨噬细胞之间的交互作用及转录因子调控网络 研究依赖于公共数据集,可能受限于样本来源和实验条件的异质性,且未进行体内或体外实验验证 探究辐射诱导肺损伤中程序性细胞死亡的特定亚型及其细胞类型特异性模式 肺组织样本,包括辐射处理和对照 数字病理学 肺损伤 RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自三个公共数据集(GSE25295, GSE41789, GSE211713)的样本,具体数量未明确 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
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