单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202512-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 1109 篇文献,本页显示第 601 - 620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
601 2026-01-02
Spatial Transcriptomics and snRNA-seq Expose CAF Niches Orchestrating Dual Stromal-Immune Barriers in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了肝细胞癌中缺氧代谢性肌成纤维细胞在构建双重基质-免疫屏障中的核心作用 首次通过多模态方法鉴定hmmyCAFs作为物理免疫抑制、分子调控和代谢重塑的三重架构者,并明确其与临床预后的关联 研究主要基于观察性数据,需要进一步功能实验验证hmmyCAFs的具体作用机制 探究肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞在免疫抑制微环境中的角色及其临床意义 肝细胞癌组织样本中的细胞群体,包括成纤维细胞、T_NK细胞和内皮细胞 数字病理学 肝细胞癌 单核RNA测序, 空间转录组学 RCTD算法 基因表达数据, 空间定位数据 未明确指定样本数量 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
602 2026-01-02
Erucic Acid, Derived by Lactobacillus Crispatus, Induces Ferroptosis in Cervical Cancer Organoids Through the PPAR-δ Signaling Pathway
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过16S rRNA测序发现宫颈癌患者阴道微生物群中Lactobacillus crispatus的丰度差异,并揭示其代谢产物芥酸通过激活PPAR-δ信号通路诱导宫颈癌细胞铁死亡 首次发现Lactobacillus crispatus代谢产物芥酸作为PPARδ受体配体,通过激活PPAR-δ通路诱导宫颈癌细胞铁死亡,为宫颈癌治疗提供了新的辅助治疗策略 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化效果需进一步验证;微生物群与癌症相互作用的机制细节尚未完全阐明 探究阴道微生物群中Lactobacillus crispatus及其代谢产物在宫颈癌治疗中的作用机制 宫颈癌患者阴道微生物群、宫颈癌细胞、患者来源类器官(PDO)、宫颈癌异种移植(CDX)模型 微生物组学与癌症生物学 宫颈癌 16S rRNA测序、靶向细菌培养、非靶向代谢组学、单细胞RNA测序 NA 微生物组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 宫颈癌患者与健康个体的阴道微生物样本、患者来源类器官、细胞系及动物模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
603 2026-01-01
Glycosylated IgG antibodies contribute to the recovery of haemorrhagic fever with renal syndrome patients
2025-Dec-29, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析肾综合征出血热患者的B细胞亚群,结合超高效液相色谱检测IgG糖基化,揭示了IgG糖基化在汉坦病毒感染恢复中的关键作用 首次系统研究了肾综合征出血热患者中IgG抗体的糖基化特征,发现急性期患者抗体分泌记忆B细胞和浆母细胞显著扩增,并揭示了糖基化相关基因在特定B细胞亚群中的差异表达,为优化糖工程治疗抗体提供了新见解 样本来源仅限于外周血单核细胞,未涉及其他组织或体液;研究为观察性分析,缺乏直接的机制验证实验;糖基化分析的深度和广度可能受技术限制 探究肾综合征出血热患者中IgG抗体的糖基化特征及其在病毒感染恢复中的作用 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞及IgG抗体 免疫学 肾综合征出血热 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 超高效液相色谱 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 色谱数据 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
604 2026-01-01
Turncoat antibodies unmasked in a model of autoimmune demyelination: From biology to therapy
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中发现了分泌自身抗体的卵泡外浆母细胞,并开发了一种合成抗体变体来中和致病性抗MOG抗体 首次在EAE模型中鉴定出分泌非亲和力成熟IgG抗体的卵泡外浆母细胞,并证明合成抗体8-18C5及其变体可阻断致病性抗体结合并减轻疾病严重程度 研究基于小鼠模型,结果在人类疾病中的直接应用需进一步验证 开发选择性中和自身抗体的疗法,以治疗自身免疫性疾病 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型及MOG抗体疾病患者 NA 自身免疫性脱髓鞘疾病 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
605 2026-01-01
Single-nucleus and spatial transcriptomics reveal the cell populations of intercalary meristems in bamboo
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术,结合染色体水平基因组组装和高分辨率解剖图谱,揭示了竹子节间分生组织的细胞群体动态及其遗传基础 首次在竹子中整合单核RNA测序与空间转录组学,构建了节间分生组织的动态单核转录组连续体,并识别了关键的干细胞样亚群及其功能 研究主要基于毛竹,结果在其他单子叶植物中的普适性有待验证,且功能实验仅初步探索了特定基因的作用 理解单子叶植物节间分生组织的细胞群体动态、遗传基础及其在快速茎伸长中的作用 毛竹的节间分生组织及其相关细胞群体 植物发育生物学 NA 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位杂交, 超微结构成像 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 涉及毛竹节间分生组织的三个关键发育阶段(初始细胞分裂期、快速细胞分裂期、快速细胞伸长期) NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
606 2026-01-01
Mapping Gene Impact on Single-cell Transcriptomic Networks via Perturbation Response Scanning
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为单细胞扰动影响指数(scPII)的数据驱动度量方法,用于量化基因扰动对系统层面的影响,无需依赖CRISPR筛选信息 将最初为蛋白质结构动力学开发的扰动响应框架应用于单细胞转录组网络,以识别最易受扰动的基因模块 未明确提及具体的技术或数据限制,但方法依赖于基因调控网络的准确性 开发一种量化基因扰动系统级影响的方法,以识别对细胞状态有最大全局影响的基因 单细胞转录组网络和基因调控网络 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
607 2026-01-01
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Dec, European journal of epidemiology IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过前瞻性队列分析,探讨了血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险之间的关联 首次结合LASSO-COX和随机森林方法筛选代谢物,并构建代谢风险评分,同时联合生活方式因素评估结直肠癌风险 研究基于英国生物银行数据,可能受人群特异性限制,且代谢物测量为单时间点,无法反映动态变化 评估代谢物、代谢风险评分及其与生活方式因素的联合效应对结直肠癌风险的影响 英国生物银行中的82,514名参与者 代谢组学与流行病学 结直肠癌 血浆代谢物分析、单细胞RNA测序 LASSO-COX、随机森林、Cox回归 代谢组数据、临床随访数据、单细胞RNA测序数据 82,514名参与者,其中1,151例结直肠癌病例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
608 2026-01-01
The mouse neonatal small intestine is regionally specialized for protein absorption and transepithelial transport
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究揭示了小鼠新生儿小肠中空肠与回肠肠上皮细胞在蛋白质吸收与跨上皮转运方面的区域特异性功能分工 首次通过体内外转运实验结合转录组学方法,系统阐明了新生儿小肠不同区段(空肠与回肠)肠上皮细胞在完整蛋白质转运与降解方面的功能分化及其分子基础 研究主要基于小鼠模型,人类新生儿肠道是否存在完全相同的机制仍需验证;Dab2条件性敲除对蛋白质转运的影响机制尚未完全解析 探究新生儿肠道蛋白质吸收的区域特异性机制及其分子调控网络 新生小鼠小肠肠上皮细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序、转录组分析、遗传学方法、体内外转运实验 NA 转录组数据、遗传数据、功能实验数据 新生小鼠肠道组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
609 2026-01-01
NETosis-Like Response Triggered by Extracellular Vesicle (EV)-Delivered Viral Nucleic Acid, a Novel Cellular Immune Mechanism in Crustacean
2025-Dec, Journal of extracellular vesicles IF:15.5Q1
研究论文 本研究揭示了在甲壳动物中,细胞外囊泡递送病毒核酸触发NETosis样反应的新型细胞免疫机制 首次在甲壳动物中基于单细胞转录组学鉴定出中性粒细胞样细胞,并揭示了由EVs递送病毒核酸介导的新型NETosis诱导机制 研究主要聚焦于甲壳动物模型,机制在脊椎动物中的普适性尚未验证 探究甲壳动物中细胞外囊泡在病毒核酸递送和NETosis样免疫反应中的作用机制 泥蟹的血细胞(特别是中性粒细胞样细胞)和WSSV病毒 免疫学 病毒感染 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
610 2026-01-01
A novel computational analysis integrating social determinants information from EHR and literature with Alzheimer's disease biological knowledge through large language models and knowledge graphs
2025-Dec, Innovation in aging IF:4.9Q1
研究论文 本研究利用大型语言模型和知识图谱整合电子健康记录与文献中的社会健康决定因素信息,通过图深度学习预测阿尔茨海默病相关生物网络中的链接 首次将社会健康决定因素与阿尔茨海默病生物知识通过知识图谱和大型语言模型进行整合,并利用图深度学习进行链接预测 研究主要基于现有文献和电子健康记录数据,可能受数据质量和覆盖范围的限制 探索社会健康决定因素对阿尔茨海默病的影响,并整合生物知识以增强疾病理解 阿尔茨海默病及相关痴呆症 自然语言处理 老年疾病 单细胞RNA测序、蛋白质组学 图深度学习 文本、多模态生物数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
611 2025-12-31
Nanoplastics in Duckweed: Single-Cell Responses and Recovery
2025-Dec-30, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、酶活性测定和铕掺杂纳米塑料示踪技术,全面探究了浮萍对聚苯乙烯纳米塑料在环境相关剂量和高剂量下的响应与恢复过程 首次在单细胞分辨率下揭示了浮萍对纳米塑料的细胞类型特异性响应机制,并整合纳米示踪技术量化了吸收与排泄过程 研究仅针对聚苯乙烯纳米塑料和浮萍模型,其他类型纳米塑料或水生植物的响应机制仍需进一步探究 阐明水生植物对纳米塑料污染的响应与恢复分子机制 浮萍(水生植物模型) 单细胞组学 NA 单细胞转录组学,酶活性测定,纳米示踪技术 NA 单细胞转录组数据,酶活性数据,示踪定量数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA 单核RNA测序(snRNA-seq)
612 2025-12-31
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文探讨了早期皮肤定居调节性T细胞(ETregs)在新生儿皮肤中通过调控PPARγ信号通路,促进毛囊黑素干细胞介导的皮肤色素沉着的作用 首次揭示了ETregs在出生后第一周内对皮肤色素沉着的关键调控作用,并明确了PPARγ信号通路在此过程中的核心地位 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来源于对白癜风患者的单细胞转录组分析,需要进一步验证ETregs在人类皮肤发育中的具体机制 探究早期皮肤定居调节性T细胞(ETregs)在新生儿皮肤发育中对色素沉着的调控机制 小鼠新生儿皮肤组织、人类白癜风患者皮肤组织 免疫学与皮肤生物学 白癜风 单细胞转录组分析、转录组学分析 NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
613 2025-12-31
C3a-C3aR1-Mediated Interactions Between Fibroblast-Like Synoviocytes and Macrophages Promote the Progression of Rheumatoid Arthritis
2025-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜中成纤维样滑膜细胞与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号介导的相互作用,促进疾病进展的机制 首次结合成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序解析RA滑膜细胞邻域,并发现FLS与巨噬细胞间通过C3a-C3aR1信号形成正反馈环路驱动炎症 研究主要基于胶原诱导关节炎小鼠模型,人体内的验证和临床转化仍需进一步探索 探究类风湿关节炎滑膜炎症微环境中细胞间相互作用机制及潜在治疗靶点 类风湿关节炎患者滑膜组织、胶原诱导关节炎小鼠模型 数字病理学 类风湿关节炎 成像质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 图像, 单细胞转录组数据 未明确样本数量,涉及RA患者滑膜组织与CIA小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
614 2025-12-31
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Dec, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究探讨了成熟三级淋巴结构(mTLS)在直肠癌中的抗肿瘤免疫作用及其受新辅助治疗的影响 首次在直肠癌中系统评估mTLS与B细胞介导的免疫特征及预后的关联,并揭示新辅助治疗对TLS的破坏作用 回顾性研究设计可能引入选择偏倚,样本量有限且需进一步验证 阐明mTLS在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及新辅助治疗的免疫调节效应 直肠癌患者组织样本 数字病理学 直肠癌 bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组化, 多重免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 组织图像 队列1:bulk RNA-seq 123例,免疫组化/多重免疫荧光161例,scRNA-seq/scBCR-seq 10例;队列2:bulk RNA-seq 19例,免疫组化125例 NA 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 空间转录组学相关技术 NA NA
615 2025-12-31
Subpopulation-specific apoptotic responses of hemocytes to decapod iridescent virus 1 in Macrobrachium rosenbergii
2025-Dec, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究整合流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异 首次结合流式细胞术和单细胞RNA测序技术,系统解析了罗氏沼虾血细胞亚群在DIV1感染下的凋亡动态和分化轨迹,揭示了透明细胞的凋亡激活和补偿性分化机制 研究主要关注早期感染阶段(24小时),长期感染动态和具体凋亡信号通路的功能验证有待进一步探索 探究罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异和免疫机制 罗氏沼虾的血细胞亚群,包括无颗粒细胞(透明细胞和前血细胞)、半颗粒细胞和颗粒细胞 单细胞组学 病毒感染 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
616 2025-12-30
Single-cell and spatial transcriptomics reveal the interaction between PRRX2-driven epithelial cells and SPP1+ macrophages in mediating gemcitabine resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Dec-26, Chinese medical journal IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过整合分析单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了PRRX2+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用在介导胰腺导管腺癌吉西他滨耐药中的关键机制 首次通过整合单细胞和空间转录组学技术,系统揭示了PRRX2驱动的上皮细胞与SPP1+巨噬细胞通过TGFB1/TGFBR2轴相互作用,促进EMT和ECM重塑,从而介导吉西他滨耐药的新机制 研究结论主要基于细胞系和临床样本的体外验证,缺乏体内动物模型的进一步验证,且临床队列样本量可能有限 阐明胰腺导管腺癌对吉西他滨产生耐药的分子和细胞机制,以优化治疗策略并改善患者预后 胰腺导管腺癌患者样本、PDAC细胞系 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNA-seq,免疫荧光染色 NA 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 临床队列样本及PDAC细胞系 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
617 2025-12-30
Integrating single-cell and bulk RNA-Seq to unravel the molecular mechanisms of airway stenosis
2025-Dec-23, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-Seq数据,揭示了气道狭窄的分子机制,并识别出四个关键基因及其调控通路 首次整合单细胞和bulk转录组数据系统研究气道狭窄的分子机制,识别出FAM118A、RCN3、PCSK7和REEP3四个关键促狭窄基因,并阐明了其通过KRAS→PI3K-AKT通路激活成纤维细胞的机制 NA 阐明气道狭窄的潜在分子机制 气道狭窄组织 数字病理学 气道狭窄 单细胞RNA测序, bulk RNA-Seq, 分子生物学实验 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
618 2025-12-30
Spatiotemporal landscape of intrahepatic cholangiocarcinoma liver metastasis at the single-cell level
2025-Dec-10, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过整合单细胞和空间转录组学等技术,揭示了肝内胆管癌肝转移过程中肿瘤微环境的关键变化和生物学机制 首次在单细胞水平上描绘了肝内胆管癌肝转移的时空景观,并发现了COL3A1+上皮细胞通过诱导内皮细胞间质转化和形成中性粒细胞胞外陷阱促进肿瘤侵袭和定植的新机制 样本量相对较小(16名患者),且主要关注肝内转移,可能未涵盖所有转移模式 探究肝内胆管癌肝转移过程中肿瘤微环境的特异性变化及其生物学机制 肝内胆管癌患者(包括有和无肝内转移者)的肿瘤组织样本 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA测序, 全外显子组测序, 体内外功能实验 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据, 全外显子组测序数据 16名患者的28份标本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq, 全外显子组测序 NA NA
619 2025-12-30
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用来自不同祖先背景个体的iPSC衍生神经球,探究了阿尔茨海默病GWAS基因的祖先和细胞类型特异性调控景观 首次在iPSC衍生的三维神经球模型中,整合单细胞多组学数据,系统比较了非洲、美洲原住民和欧洲祖先背景对AD相关基因调控架构的影响 样本量较小(每个祖先背景仅6个iPSC系),且仅使用了外周血单核细胞来源的iPSC,可能无法完全代表其他细胞类型或组织中的调控差异 探究祖先依赖性的基因组调控架构差异如何影响阿尔茨海默病的遗传风险,特别是在不同脑细胞类型中的特异性 来自阿尔茨海默病患者和认知健康对照的外周血单核细胞(PBMCs)及其衍生的iPSC神经球 基因组学与神经科学 阿尔茨海默病 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 批量Hi-C, iPSC重编程, 神经球分化 iPSC衍生三维神经球模型 单细胞多组学数据(表观基因组与转录组) 18个iPSC细胞系(非洲、美洲原住民、欧洲祖先各6个),分化为包含星形胶质细胞、神经元、少突胶质前体细胞和少突胶质细胞的神经球 NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq, 批量Hi-C NA NA
620 2025-12-29
Multi-omics analysis reveals distinct spatial compartmentalization of lung repair niches in pediatric ARDS
2025-Dec-27, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了儿童急性呼吸窘迫综合征(PARDS)中与预后相关的、空间区隔化的肺修复生态位 首次在儿童流感相关PARDS中整合单细胞RNA测序、空间转录组学和血浆蛋白质组学,并结合人类肺细胞图谱(HLCA)和成人COVID-19数据进行跨年龄比较,识别出与生存相关的KRT17阳性上皮细胞等关键修复特征 本研究为试点性病例系列研究,样本量小,需要在更大的多中心队列中进行验证 探究儿童相较于成人在急性呼吸窘迫综合征中生存率更高、肺修复能力更强的潜在机制 儿童流感相关急性呼吸窘迫综合征(PARDS)患者的肺组织、支气管肺泡灌洗液(BALF)和血浆 数字病理学 肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间转录组学, 血浆蛋白质组学 NA 基因表达数据, 空间定位数据, 蛋白质数据 试点性病例系列研究(具体样本数未明确说明), 结合了公共儿科PARDS气道scRNA-seq数据和成人致死性COVID-19肺数据 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
回到顶部