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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_102704
PMID:41437906
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研究论文 | 本研究通过构建单核和空间转录组图谱,分析了突触核蛋白病和阿尔茨海默病的分子机制 | 首次构建了突触核蛋白病和阿尔茨海默病的单核及空间转录组综合图谱,识别了44个疾病特异性元程序,并揭示了不同细胞类型间的共失调网络 | 研究基于死后人脑样本,可能无法完全反映疾病早期动态;样本量虽大但可能存在批次效应 | 全面表征突触核蛋白病和阿尔茨海默病的共享与独特分子特征 | 513例死后人脑样本中的3.4百万个细胞核 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | 513例人脑样本, 3.4百万个细胞核 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | MERFISH空间转录组验证技术 |
| 582 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_103001
PMID:41437931
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析,探究了Bexarotene在阿尔茨海默病小鼠模型中如何改变染色质结构和基因活性 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和snATAC-seq数据,揭示了Bexarotene对大脑细胞类型特异性转录因子活性和染色质可及性的影响 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类阿尔茨海默病 | 探究Bexarotene如何通过调节染色质结构和基因活性发挥神经保护作用 | APP/PS1阿尔茨海默病模型小鼠的大脑细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 8个样本(4个Bexarotene处理组和4个对照组),共37,640个细胞(scRNA-seq)和61,353个细胞核(snATAC-seq) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10X平台 | NA |
| 583 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106875
PMID:41439611
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研究论文 | 本文研究了抗Aβ抗体暴露对大脑免疫反应的影响,特别是与ARIA相关的神经炎症机制 | 结合单细胞测序和空间转录组学技术,探索急性和慢性抗Aβ抗体暴露下的免疫细胞变化,并研究MMP9抑制对脑血管破坏的影响 | 慢性研究分析仍在进行中,结论尚未完整 | 理解抗Aβ抗体暴露对大脑免疫系统的影响,并探索ARIA的潜在原因 | 携带人源化Aβ(hAβ)及家族性淀粉样突变(Swedish, Arctic, Austrian; hAβSAA)的17-20月龄小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序(SCseq),空间转录组学,免疫组织化学(IHC),磁共振成像(MRI) | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,影像数据 | 17-20月龄hAβ及hAβSAA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 584 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_105077
PMID:41442221
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研究论文 | 本研究开发了一种新颖的计算流程,整合单细胞和批量RNA-seq数据,以识别阿尔茨海默病中稳健的细胞间通讯网络 | 首次将细胞优先级工具与细胞间相互作用整合,系统识别并优先处理AD病理相关的细胞间通讯网络 | NA | 揭示阿尔茨海默病中驱动病理过程的细胞间通讯网络 | 阿尔茨海默病患者脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光, 共免疫沉淀 | DEGAS, CellChat | RNA-seq数据 | 超过240万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106882
PMID:41442480
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学和蛋白质分析技术,在老年猕猴大脑中探究了Aβ斑块与细胞类型特异性分子变化之间的关联 | 首次在缺乏神经原纤维缠结的猕猴模型中,结合空间转录组学和蛋白质组学技术,系统研究了早期阿尔茨海默病的细胞特异性分子机制 | 样本量较小(仅10只猕猴),且研究局限于顶叶皮层区域,可能无法完全反映大脑其他区域的病理变化 | 探究早期阿尔茨海默病阶段中Aβ斑块与细胞类型特异性分子变化之间的关联 | 老年猕猴(Chlorocebus aethiops)的大脑组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞空间转录组学,免疫荧光共标记,蛋白质空间分析 | NA | 空间转录组数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 | 10只老年猕猴(平均年龄24.3岁,约相当于人类95岁),其中5只用于蛋白质分析 | NanoString | 单细胞空间转录组学,空间蛋白质组学 | CosMx Spatial Molecular Imager, GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString CosMx空间分子成像仪配合人类RNA 6K发现面板,NanoString GeoMx数字空间分析仪 |
| 586 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106438
PMID:41442569
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了衰老和年轻血液暴露下,小胶质细胞在不同脑区的异质性及转录组变化 | 首次在单细胞水平上,系统揭示了小胶质细胞在衰老和年轻血液暴露下的区域特异性转录组动态,并鉴定出一个与衰老和反应性状态相关的核心基因激活特征 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需进一步验证,且未深入探究所识别基因特征的功能机制 | 探究大脑衰老和年轻血液暴露对小胶质细胞转录组的影响,以理解脑衰老的分子机制和区域脆弱性 | 小鼠大脑中的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及小脑、皮层、海马体和纹状体四个不同脑区 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 587 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_105192
PMID:41442606
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研究论文 | 本文通过多模态方法表征APPSAA小鼠模型在阿尔茨海默病研究中的临床相关表型,包括淀粉样斑块积累、神经炎症反应和认知缺陷 | 首次全面评估无转基因过表达限制的APPSAA小鼠模型,结合体内成像、空间转录组学和认知测试,为临床前研究提供更相关的疾病阶段选择 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性,且样本年龄范围有限 | 建立APPSAA小鼠作为阿尔茨海默病临床前研究的实用模型,并确定适合的实验阶段和检测方法 | APPSAA转基因小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 免疫标记、转录组学、代谢组学、脂质组学、空间转录组学、认知行为测试 | 小鼠疾病模型 | 图像、转录组数据、代谢数据、行为数据 | 未明确指定具体数量,但涉及多个年龄阶段的小鼠样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10X Genomics Xenium | 10X Genomics Xenium平台用于9月龄小鼠脑空间转录组学分析 |
| 588 | 2025-12-27 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106777
PMID:41442738
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研究论文 | 本研究利用CROP-seq技术,在单细胞转录组水平上探究阿尔茨海默病基因如何影响小胶质细胞的表型调控网络 | 首次结合CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术,系统分析AD基因对小胶质细胞转录调控网络的影响,并识别出受扰动最显著的特定小胶质细胞亚群 | 研究主要基于体外实验,尚未在体内模型中验证;样本来源和数量未明确说明,可能限制结果的普适性 | 探究阿尔茨海默病基因如何影响小胶质细胞的表型调控网络,以寻找潜在的治疗靶点 | 人类小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CROP-seq(CRISPR筛选与单细胞RNA测序结合技术) | CRISPR筛选 | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台,采用改进的单细胞RNA测序流程 |
| 589 | 2025-12-26 |
HDAC5 deacetylates cytosolic ACTN4 during skin reepithelialization and represents a therapeutic target for chronic wound healing
2025-Dec-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ads0594
PMID:41442502
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研究论文 | 本研究揭示了HDAC5通过去乙酰化ACTN4促进皮肤再上皮化的新机制,并发现其激活剂可改善慢性伤口愈合 | 首次发现HDAC5通过核质穿梭去乙酰化非组蛋白ACTN4,调控YBX1转录活性,从而促进皮肤再上皮化,并鉴定出HDAC5选择性激活剂G194-0712在多种慢性伤口模型中的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和离体人皮肤,临床转化效果需进一步验证 | 探究皮肤伤口愈合中再上皮化的分子调控机制,寻找慢性伤口治疗新靶点 | 人类皮肤组织、小鼠伤口模型(包括糖尿病伤口、缺血性伤口和辐射损伤模型) | 分子生物学与皮肤修复 | 慢性伤口愈合障碍 | 条件性基因敲除小鼠模型、液相色谱-质谱联用、定点突变、免疫荧光、荧光素酶报告基因检测、单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、图像数据 | 未明确具体样本数量,涉及人类组织、多种小鼠伤口模型 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 590 | 2025-12-26 |
Novel common target genes for breast cancer and colorectal cancer: a Mendelian randomization and spatial transcriptomics study
2025-Dec-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03546-4
PMID:41427984
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和空间转录组学分析,识别了乳腺癌和结直肠癌在中央记忆CD8+ T细胞中的共同靶基因 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和空间转录组学技术,系统性探索了乳腺癌与结直肠癌在T细胞免疫微环境中的共同分子机制 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,样本量有限,且未进行实验验证 | 识别乳腺癌和结直肠癌在中央记忆T细胞中的共同信号分子,以促进对这两种疾病的理解并开发潜在的双效疗法 | 乳腺癌和结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据及空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌, 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的乳腺癌数据集GSE161529和结直肠癌数据集GSE222300 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 591 | 2025-12-26 |
Integrative transcriptomic and single-cell analysis reveals mitochondrial-related gene biomarkers in heart failure with preserved ejection fraction
2025-Dec-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03926-4
PMID:41422136
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,识别了与射血分数保留型心力衰竭相关的线粒体基因生物标志物 | 结合机器学习、单细胞RNA测序和ceRNA网络分析,识别了Vwa8、Mthfd2和Decr1作为HFpEF的关键枢纽基因,并揭示了其分子机制和诊断潜力 | 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅限于RT-qPCR,缺乏更深入的体内外功能验证 | 识别与HFpEF和线粒体功能相关的枢纽基因,并阐明其潜在机制,为治疗策略提供新见解 | 射血分数保留型心力衰竭患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | LASSO回归, SVM-RFE, Boruta分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多个公共数据集(GSE194151, GSE236585, GSE236584, GSE180065)及RT-qPCR验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 592 | 2025-12-26 |
Proteomic Profiles of Neutrophils from Behcet's Uveitis Patients and their Sex Differences
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02305-5
PMID:40263198
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析,揭示了白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质表达变化及其性别差异 | 首次对白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞进行蛋白质组学分析,并结合单细胞RNA测序数据揭示性别差异的分子机制 | 样本量有限,未进行长期随访或功能验证实验 | 探究白塞病葡萄膜炎患者中性粒细胞的蛋白质组变化及其在疾病发病机制和性别差异中的作用 | 活动期白塞病葡萄膜炎患者的外周血中性粒细胞 | 蛋白质组学 | 白塞病葡萄膜炎 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据,RNA测序数据 | 未明确具体样本数量,包括活动期BU患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 593 | 2025-12-26 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Transcriptome Data Reveals the Role and Regulatory Mechanisms of Neuroinflammation in Parkinson's Disease
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02306-4
PMID:40285838
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和转录组数据分析,揭示了神经炎症在帕金森病中的角色及其调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和微阵列数据,聚焦于帕金森病患者中脑黑质致密部,识别了STAT3作为小胶质细胞促炎激活的关键转录因子 | 研究主要基于公开数据库数据,样本来源可能有限,且动物和细胞模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究帕金森病中神经炎症的细胞特异性特征和调控机制 | 人类帕金森病中脑组织(特别是黑质致密部)、MPTP诱导的帕金森病小鼠模型、MPP+诱导的BV2细胞模型及SH-SY5Y细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、微阵列分析、GSVA、GSEA、KEGG、GO分析、轨迹分析、SCENIC分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 594 | 2025-12-26 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Landscape of Granulomatous Mastitis
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02310-8
PMID:40338490
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较分析了肉芽肿性乳腺炎病变组织与正常乳腺组织的免疫图谱 | 首次通过单细胞RNA测序揭示肉芽肿性乳腺炎的免疫细胞浸润、免疫紊乱、巨噬细胞亚群向促炎表型转变以及细胞间相互作用的复杂网络 | NA | 揭示肉芽肿性乳腺炎的潜在发病机制和免疫图谱 | 肉芽肿性乳腺炎病变组织和正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 595 | 2025-12-26 |
Multi-omics Analysis Reveals the Propagation Mechanism of Ferroptosis in Acute Kidney Injury
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02311-7
PMID:40358793
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了铁死亡在急性肾损伤中的传播机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学,在AKI中系统阐明了GPX4、FTH1和FTL基因驱动铁死亡传播的关键作用,并识别出KLF6作为铁死亡相关基因的抑制因子以及SPP1信号通路在调节铁死亡中的潜在功能 | 研究主要基于小鼠模型和有限的临床样本数据,其结论在人类AKI中的普适性仍需更大规模临床队列验证 | 探究急性肾损伤中铁死亡广泛发生的分子机制 | 急性肾损伤患者的肾组织、小鼠双侧肾缺血再灌注损伤模型 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单核RNA测序、空间转录组学、染色质可及性分析、转录因子分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | AKI患者与健康人的肾组织样本、小鼠模型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 596 | 2025-12-26 |
Salidroside Alleviates Renal Ischemia-reperfusion Injury by Inhibiting Macrophage Pyroptosis Through HIF Signaling
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02328-y
PMID:40591075
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研究论文 | 本研究探讨了红景天中生物活性成分红景天苷通过抑制HIF信号通路减轻巨噬细胞焦亡,从而缓解肾缺血再灌注损伤的保护作用 | 首次揭示红景天苷通过抑制ROS-HIF-1α正反馈环路,靶向HIF-1α驱动的焦亡级联反应,作为多靶点药物缓解肾缺血再灌注损伤 | 需要进一步研究验证其临床潜力和分子特异性 | 探究红景天苷在肾缺血再灌注损伤中的肾脏保护作用及其机制 | 小鼠肾缺血再灌注损伤模型中的巨噬细胞 | NA | 肾缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 597 | 2025-12-26 |
A Comparative Analysis Dissecting the Immune Landscape of Vitiligo and Melanoma from a single-cell Perspective: Two Sides of the Same Coin?
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02332-2
PMID:40608219
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序比较了白癜风和黑色素瘤的免疫微环境,揭示了它们在免疫激活与免疫逃逸方面的差异 | 首次从单细胞角度全面比较白癜风和黑色素瘤的免疫微环境,识别了关键的细胞亚型和信号轴 | 研究基于现有单细胞数据,样本量有限,且未进行实验验证 | 比较白癜风和黑色素瘤的免疫微环境差异,探索潜在治疗靶点 | 健康对照、白癜风患者和黑色素瘤患者的皮肤组织样本 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自健康对照、白癜风和黑色素瘤患者的样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 598 | 2025-12-26 |
STING agonists drive recruitment and intrinsic type I interferon responses in monocytic lineage cells for optimal anti-tumor immunity
2025-Dec-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf131
PMID:40633091
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研究论文 | 本研究探讨了单核细胞谱系细胞在STING激动剂诱导的I型干扰素信号传导中的作用,揭示了其在抗肿瘤免疫中的关键机制 | 首次阐明STING激动剂通过CCR5依赖的迁移机制招募单核细胞谱系细胞至淋巴结,并依赖IL-18促进CD8+ T细胞产生IFN-γ,从而优化抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型(MC38和B16F10肿瘤),尚未在人类临床试验中验证,且特定基因缺陷小鼠(如CCR2或IFNAR1缺陷)可能无法完全反映人类免疫系统的复杂性 | 探究STING激动剂治疗中单核细胞谱系细胞在I型干扰素信号传导和抗肿瘤免疫中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型(MC38和B16F10)、单核细胞谱系细胞、CD8+ T细胞、自然杀伤细胞 | 免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从小鼠淋巴结和肿瘤中分离的CD45+细胞进行单细胞RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 599 | 2025-12-26 |
Zmiz1-Mediated SUMOylation of NLRP3 Inflammasome Regulates Satellite Glial Cell Activation and Neuronal Autophagy in Trigeminal Neuralgia
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02330-4
PMID:40650830
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研究论文 | 本研究揭示了Zmiz1通过促进NLRP3炎症小体的SUMO化修饰,调控三叉神经痛中卫星胶质细胞激活和神经元自噬的新机制 | 首次发现Zmiz1作为关键SUMO化相关基因,通过调节NLRP3的SUMO化水平影响三叉神经痛的病理过程 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人体样本中进行验证 | 探究三叉神经痛中神经炎症和卫星胶质细胞激活的分子机制 | 三叉神经痛大鼠模型、卫星胶质细胞、神经元 | 神经科学 | 三叉神经痛 | 单细胞转录组学、生物信息学分析、共免疫沉淀、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 600 | 2025-12-26 |
Identification and Experimental Validation of OS-Related Gene Sets Based on Integrated Analysis of Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Data with Machine Learning in Patients with Sepsis
2025-Dec, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02346-w
PMID:40864216
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,结合机器学习方法,识别并验证了脓毒症中与氧化应激相关的关键基因 | 首次在单细胞水平阐明了脓毒症中氧化应激的异质性,并识别出TXN、MAPK14和CYP1B1作为关键调控基因 | NA | 探究脓毒症中氧化应激的关键调控基因及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 脓毒症患者及小鼠模型 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |