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当前共找到 1109 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2026-09-20 |
scCotag: Diagonal integration of single-cell multi-omics data via prior-informed co-optimal transport and regularized barycentric mapping
2025-Dec-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693589
PMID:41446270
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研究论文 | 本文提出了scCotag，一种基于协同最优传输（COOT）的深度学习框架，用于单细胞多组学数据的对角整合，通过先验信息驱动的COOT和正则化重心映射联合学习细胞与特征嵌入 | 首次在COOT框架中引入先验信息并迭代精炼细胞对齐与特征对应关系，不再假设所有细胞均可对齐，采用正则化重心映射和图重加权联合学习细胞与特征嵌入 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决现有单细胞多组学对角整合方法中假设所有细胞均可对齐以及先验特征对应关系完全可靠且未经精炼的问题，实现更精细的生物学解释和调控推断 | 人类大脑、骨髓和血液的单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据，以及阿尔茨海默病（AD）和非AD患者死后大脑数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 协同最优传输（COOT）, 深度学习框架 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-09-20 |
Influenza A infection accelerates disease-associated microglia formation during physiological aging
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693336
PMID:41415465
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研究论文 | 该研究通过多种技术手段，揭示了流感A病毒感染如何加速生理性衰老过程中疾病相关小胶质细胞的形成 | 首次证明非神经侵袭性流感A病毒肺炎可诱导大脑小胶质细胞产生一过性免疫衰老样反应，并加速衰老依赖性的疾病相关小胶质细胞在白质区域的扩增，且该过程由中枢神经系统微环境驱动而非细胞内在机制 | 研究主要基于雄性小鼠，未验证雌性小鼠中的表现；人类数据为观察性关联，缺乏因果验证；未明确IAV肺炎诱导的认知 decline 与DAM扩增之间的直接因果联系 | 验证非神经侵袭性流感A病毒肺炎是否引起大脑小胶质细胞的转录反应，从而驱动疾病相关小胶质细胞的过早扩增 | 年轻、中年和老年雄性小鼠在IAV感染及恢复期间的大脑神经免疫细胞群，以及正常衰老者、超级衰老者及痴呆患者的中额回组织 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌, 心血管疾病, 老年疾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据, 图像 | 年轻、中年和老年雄性小鼠在IAV感染及恢复期间的多个时间点样本，以及正常衰老者、超级衰老者及痴呆患者的中额回组织样本 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 43 | 2026-09-20 |
SEEK-VEC: Robust Latent Structure Discovery via Ensemble Topic Modeling
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.12.693799
PMID:41427368
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研究论文 | 提出SEEK-VEC集成主题建模框架，通过谱集成过程从多个候选主题模型中发现计数数据中的潜在结构，并生成共识低维嵌入 | 集成多个候选主题模型，通过谱集成自动强化信号并减轻噪声，对主题数量K不敏感，在信号强度弱时优于最先进的oracle方法 | 摘要中未明确提及 | 在计数数据中稳健地发现潜在结构，实现变量分类、交互式模式发现和模型诊断 | 计数数据，包括自报精神病理症状数据、食物偏好问卷数据和单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 主题建模 | 集成主题模型 | 计数数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2026-09-20 |
Conserved phenotype and function of human brain border-associated macrophages in iPSC-derived models
2025-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693582
PMID:41427352
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研究论文 | 该研究通过将iPSC来源的造血祖细胞移植到小鼠大脑，成功构建了人源BAM嵌合模型，并利用单细胞RNA测序揭示了BAM的保守高内吞表型及其在清除Aβ中的功能。 | 首次报道了通过移植iPS细胞来源的造血祖细胞到小鼠大脑中实现脑边界免疫区的人源化嵌合，并定义了BAM区别于小胶质细胞的保守转录特征和高内吞表型，同时开发了iPSC来源的BAM样细胞分化方案。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 建立并表征人源脑边界相关巨噬细胞（BAM）模型，以研究其在脑保护功能（如清除Aβ）中的作用。 | 人源脑边界相关巨噬细胞（BAM）、小鼠BAM、iPSC来源的BAM样细胞（iBAMs）和iPSC来源的小胶质样细胞（iMGLs）。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-09-20 |
Multimodal analysis defines GNG4 as a distinguishing feature of germinal center-positioned CD4 T follicular helper cells in humans
2025-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693235
PMID:41427421
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研究论文 | 该研究利用三模态单细胞测序和光谱流式细胞术，在人类扁桃体及外周血中定义CD4 T滤泡辅助（Tfh）细胞的异质性，发现GNG4是生发中心定位的活化Tfh细胞的标志性特征 | 首次整合表观基因组、转录组和蛋白质组三模态单细胞数据表征人类Tfh细胞状态，并结合单细胞空间转录组学，将GNG4鉴定为生发中心定位的活化Tfh细胞的区分性特征，其特异性优于传统生发中心相关标志物如PD-1、CXCL13和BCL6 | 摘要中未明确说明样本量及具体平台细节，可能受限于扁桃体组织来源的样本数量，且外周血与扁桃体Tfh状态的对应关系有待进一步验证 | 解析人类CD4 Tfh细胞的异质性，定义不同功能状态的Tfh细胞（尤其是生发中心定位的Tfh）的基因表达程序及分子通路，为监测或靶向特定Tfh状态提供转化依据 | 人类扁桃体组织及外周血中的CD4 T细胞，重点关注Tfh细胞 | 单细胞组学、免疫学 | 自身免疫性疾病、疫苗应答（非特定疾病） | 三模态单细胞测序、光谱流式细胞术、单细胞空间转录组学 | NA | 单细胞表观基因组、转录组、蛋白质组及空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2026-09-20 |
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011665
PMID:41386973
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研究论文 | 本研究探讨了原位DC疫苗（CisVac）联合CD137激动剂在肺癌和结肠癌小鼠模型中通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞应答产生持久抗肿瘤免疫的效果及机制 | 揭示了CisVac联合α-CD137抗体通过cDC1依赖途径促进肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞的扩增和细胞因子产生，并建立持久系统性免疫记忆，同时通过单细胞转录组分析发现了Treg功能性重塑及CD40L-CD40通路介导的细胞间调控机制 | 研究仅基于小鼠肿瘤模型，尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性，长期疗效和临床转化潜力仍需进一步探索 | 评估原位DC疫苗联合CD137激动剂的抗肿瘤疗效并阐明其诱导CD8+ T细胞启动的免疫学机制 | 植入肺癌和结肠癌的小鼠模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-09-20 |
Spatiotemporal Atlas of Heart Development Reveals Blood-Flow-Dependent Cellular, Structural, Metabolic, and Spatial Remodeling
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693024
PMID:41427371
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研究论文 | 通过扰乱鸡胚心脏血流并结合单细胞和空间转录组学，构建了心脏发育的时空图谱，揭示了血流依赖的细胞、结构、代谢和空间重塑 | 结合单细胞和空间转录组学构建了血流依赖的心脏发育时空图谱，揭示了血流力学与组织发育的双向相互作用，发现了LOX表达心肌细胞和心内膜状态等新的血流特异性重塑特征 | 研究仅基于鸡胚模型，结果是否适用于哺乳动物或人类尚需验证；样本量未明确说明 | 探究机械血流信号如何塑造胚胎心脏发育中的细胞和分子通路 | 鸡胚心脏 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 发育生物学 | 心血管疾病, 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2026-09-20 |
PD-1 regulates CD4+ T cell-mediated CD8+ T cell responses in the brain to balance viral control and neuroinflammation
2025-Dec-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8215051/v1
PMID:41510262
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研究论文 | 该研究通过小鼠多瘤病毒脑炎模型，揭示PD-1在CD4+ T细胞中调控CD8+ T细胞应答以平衡病毒控制与神经炎症的机制 | 首次证明PD-1缺失以脑自主方式增加脑浸润CD4和CD8 T细胞数量及病毒特异性CD8 T细胞功能，并发现CD4 T细胞而非CD8 T细胞中PD-1缺失可重现全局PD-1缺失效应，通过单细胞RNA测序揭示PD-1缺陷CD8 T细胞向效应细胞聚类 | 研究基于小鼠多瘤病毒脑炎模型，PD-1阻断在PML患者中效果不一的原因尚未完全阐明，尚未明确该机制在人类PML中的直接适用性 | 探究PD-1在多瘤病毒中枢神经系统感染中如何调控CD4和CD8 T细胞应答，以平衡病毒控制与神经炎症 | 小鼠多瘤病毒脑炎模型中的脑浸润CD4和CD8 T细胞 | 单细胞组学，免疫学 | 进行性多灶性白质脑病，脑炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-09-20 |
HEIST: A Graph Foundation Model for Spatial Transcriptomics and Proteomics Data
2025-Dec-11, ArXiv
PMID:41040798
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研究论文 | 本文提出了一种名为HEIST的分层图Transformer基础模型，用于空间转录组学和蛋白质组学数据分析，通过将组织建模为分层图并利用基因共表达网络计算基因嵌入，实现了跨数据类型的泛化能力 | 1. 提出分层图Transformer基础模型，将组织建模为空间细胞图和基因共表达网络图的双层结构；2. 不依赖固定基因词汇表，而是从共表达网络和细胞上下文计算基因嵌入；3. 通过层内和跨层消息传递利用层次结构信息；4. 可泛化到包括空间蛋白质组学在内的新数据类型而无需重新训练 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决现有模型忽略空间信息或细胞内复杂遗传和蛋白质程序的问题，以及固定基因词汇表限制模型泛化性的问题，实现对空间转录组学和蛋白质组学数据的统一建模 | 空间转录组学和空间蛋白质组学数据，涵盖15个器官的124个组织的2230万个细胞 | 空间组学、机器学习 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | 分层图Transformer、图神经网络 | 图像、文本 | 2230万个细胞，来自15个器官的124个组织 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 50 | 2026-09-20 |
Building dynamical models of multi-step state transitions from single cell gene expression trajectories
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693064
PMID:41415381
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研究论文 | 本文介绍了一种整合自上而下和自下而上系统生物学方法的计算工具NetDes，能够从单细胞基因表达轨迹推断核心转录因子调控网络，并构建基于常微分方程的动力学模型 | NetDes能够在一个单一动力学模型中捕获多步骤细胞状态转换，而现有方法通常无法做到这一点 | 摘要中未提及该方法的局限性 | 从单细胞基因表达轨迹推断转录因子调控网络并构建动力学模型，以理解多步骤细胞状态转换的调控机制 | 单细胞基因表达时间序列轨迹、转录因子调控网络、细胞状态转换过程 | 机器学习, 计算生物学, 系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 常微分方程建模 | 常微分方程模型 | 基因表达数据（文本/数值） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2026-09-20 |
Heat-shock pathway activation by TRC051384 protects spiral ganglion neurons from noise-induced hearing loss
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693048
PMID:41415422
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研究论文 | 本文研究噪声诱导的听力损失中小分子化合物TRC051384激活热休克通路保护螺旋神经节神经元的作用 | 首次发现噪声暴露在螺旋神经节神经元中引发蛋白质毒性应激，并证明药理学激活HSF1可恢复泛素-蛋白酶体功能并保护听力 | 研究基于小鼠模型，需进一步验证在人类中的转化潜力及长期安全性 | 探究噪声诱导耳蜗突触病变中的细胞应激反应，并评估HSF1激活剂的治疗潜力 | 小鼠耳蜗螺旋神经节神经元及其支持细胞 | 耳科学、神经生物学 | 噪声性听力损失 | RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-09-20 |
Plasma cell identity escape drives resistance to anti-BCMA T-cell-redirecting therapy in multiple myeloma
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692978
PMID:41415462
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研究论文 | 该研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了多发性骨髓瘤对抗BCMA T细胞重定向治疗原发性耐药的细胞和分子机制 | 首次提出'浆细胞身份逃逸'概念，即骨髓瘤细胞通过降低浆细胞身份相关转录程序并增加增殖特征来逃避抗BCMA治疗，并通过临床前小鼠模型进行了功能验证 | 研究主要聚焦于原发性耐药机制，对获得性耐药机制的探讨有限，且样本仅限于复发患者队列 | 探究多发性骨髓瘤患者对抗BCMA CAR-T和T细胞衔接器治疗原发性耐药的基因组和转录组机制 | 接受抗BCMA CAR-T和TCE治疗的复发多发性骨髓瘤患者 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 102例接受抗BCMA CAR-T和TCE治疗的复发多发性骨髓瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-09-20 |
OddSNP: a predictive framework for optimizing multiplexed single-cell RNA-seq experiments
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692882
PMID:41415468
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研究论文 | 本文提出了一个基于SNP信息含量的预测框架OddSNP，用于优化多重单细胞RNA测序实验设计，预测基因型去多重化的成功率 | 提出了SNP-IC和cpSNP-IC定量指标，可从简单的未混样预实验数据计算，准确预测基于基因型的去多重化成功率；并开发了开源框架OddSNP，允许研究人员进行测序深度和供体复杂度的计算机模拟滴定，以优化实验设计 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 解决多重单细胞RNA测序实验中缺乏明确实验设计指南的问题，帮助研究人员在投入大规模研究前优化实验设计，最大化实验成功率并控制成本 | 使用干细胞和类器官模型的大规模单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 文本 | 多个大规模数据集（使用干细胞和类器官模型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2026-09-20 |
The circadian clock regulates scavenging of fluid-borne substrates by brain border-associated macrophages
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693074
PMID:41427288
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研究论文 | 通过对脑免疫区室进行昼夜节律的单细胞RNA测序，发现脑边界相关巨噬细胞（BAMs）具有高度节律性，通过时钟基因和CD206受体调控对脑脊液中包括Aβ在内的物质清除，其节律紊乱与阿尔茨海默病 amyloidosis 相关 | 首次揭示脑边界相关巨噬细胞（BAMs）具有高度昼夜节律性，发现其在休息期协调上调内吞基因并增强对细胞外液来源物质（包括Aβ）的摄取；阐明时钟基因通过内吞受体CD206调控该节律性清除功能，并证明BAMs中时钟基因缺失会加重AD小鼠血管周围和软脑膜Aβ斑块负担 | 研究主要基于小鼠模型，尚需在人类中验证；未明确时钟基因调控BAMs内吞功能的具体分子机制细节；年龄因素对节律性清除的影响仅作初步观察 | 探究昼夜节律紊乱是否通过脑免疫失调增加阿尔茨海默病风险，明确脑边界相关巨噬细胞在昼夜节律调控下的免疫功能及其在AD病理中的作用 | 小鼠脑边界相关巨噬细胞（BAMs）及脑免疫区室细胞，AD小鼠模型 | 单细胞组学，神经免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2026-09-20 |
Riemannian Metric Learning for Alignment of Spatial Multiomics
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693237
PMID:41427348
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研究论文 | 提出了一种基于黎曼度量学习的流形Gromov-Wasserstein框架，用于对齐空间多组学数据 | 利用空间多组学的乘积结构，通过神经场推断模态特定的黎曼度量，并利用Gromov-Wasserstein最优传输对齐黎曼距离，实现了跨任意模态的无超参数对齐，具有正交变换和全局特征缩放的理论不变性 | 摘要中未明确提及 | 解决如何对齐来自异质特征空间的空间数据这一难题，实现跨任意模态的空间对齐 | 小鼠胚胎、结直肠癌、人类纹状体和肾癌的空间多组学数据 | 机器学习 | 结直肠癌, 肾癌 | Stereo-Seq, Xenium, Visium, 空间代谢组学 | 流形Gromov-Wasserstein (MGW), 神经场 | 空间转录组学数据, 空间代谢组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | Stereo-Seq, Xenium, Visium | NA |
| 56 | 2026-09-20 |
Erythrocyte-microglia crosstalk contributing to sex differences in pediatric brain tumorigenesis
2025-Dec-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6323329/v1
PMID:41510281
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研究论文 | 该研究以髓母细胞瘤为模型，揭示了红细胞-小胶质细胞相互作用导致儿童脑肿瘤性别差异的机制 | 首次发现红细胞-小胶质细胞通过红细胞吞噬作用和脂质转移调控神经祖细胞的内在性别二态性，从而影响儿童脑肿瘤的发生发展 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本验证，临床转化应用仍需进一步研究 | 阐明儿童脑肿瘤发生中性别差异的起源和潜在机制 | 发育中的人和小鼠小脑、神经祖细胞、小胶质细胞、红细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-09-20 |
Deep profiling of human T cells defines compartmentalized clones and phenotypic trajectories across blood and tonsils
2025-Dec-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.025
PMID:41308653
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研究论文 | 该研究对10名供体的血液和扁桃体来源的570万个T细胞进行单细胞测序，揭示了T细胞克隆扩增、表型轨迹及TCR库在血液与扁桃体之间的区室化差异 | 首次在如此大规模（570万T细胞）上对配对血液和扁桃体进行单细胞测序，发现血液与扁桃体之间的克隆共享率低于既往估计，且相同TCR序列在不同区室中表型一致性有限，并利用免疫类器官证明抗原暴露驱动功能不同的T细胞克隆 | 样本量有限（仅10名供体），且仅比较了血液和扁桃体两个区室，未涵盖其他组织部位；免疫类器官实验可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 系统解析人类T细胞在血液和扁桃体之间的克隆分布、表型轨迹及TCR库特征，探讨组织特异性对抗原特异性T细胞应答的影响 | 10名供体的自体血液和扁桃体T细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序、TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据 | 10名供体的血液和扁桃体共570万个T细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 58 | 2026-09-20 |
Copula modeling of gene coexpression in single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692380
PMID:41415412
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研究论文 | 该文章评估了六种Copula模型在单细胞RNA测序数据中建模基因共表达的能力 | 首次系统评估Copula模型在scRNA-seq数据基因共表达建模中的效用，并比较了不同Copula模型的准确性和效率 | Vine Copula模型虽然有望实现高精度，但当前实现无法扩展到典型scRNA-seq数据集的大规模 | 评估不同Copula模型在单细胞RNA测序数据中建模基因共表达的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据的基因共表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Copula模型（包括高斯Copula、Vine Copula等） | 基因表达数据 | 多种参考数据集（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2026-09-20 |
Phenotypic and functional characterization of tumor-reactive T cells in malignant pleural effusions
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.05.692662
PMID:41415427
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研究论文 | 该研究对黑色素瘤患者恶性胸腔积液（MPE）、肺转移灶和血液中的T细胞进行了表型、转录组和功能特征的比较分析 | 首次系统比较了同一黑色素瘤患者MPE与肺转移灶及血液中T细胞的免疫组成、转录特征和功能特性，发现MPE富含肿瘤反应性T细胞且耗竭程度低于肿瘤组织，提示MPE可作为更易获取的TIL治疗细胞来源 | 研究仅基于单个黑色素瘤患者样本，样本量有限，结论的普遍性需在更多患者和癌种中验证 | 表征恶性胸腔积液中肿瘤反应性T细胞的表型和功能特征，评估其作为TIL治疗替代细胞来源的可行性 | 一名转移性黑色素瘤患者的恶性胸腔积液、肺转移灶和血液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 高维流式细胞术 | NA | 文本, 图像 | 1名转移性黑色素瘤患者的同步采集的恶性胸腔积液、肺转移灶和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 60 | 2026-09-20 |
From features to slice: parameter-cloud modeling of spatial transcriptomics for simulation and 3D interpolatory augmentation
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692251
PMID:41415403
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研究论文 | 本文提出了FEAST，一个通过参数云建模空间转录组数据以进行模拟和三维插值增强的计算基础设施 | FEAST通过参数云（编码基因水平均值、方差和稀疏性的潜在流形）建模空间转录组数据，支持可控的空间和转录异质性模拟，并首次实现了基于最优传输和基准对齐的三维参数云插值 | 摘要中未明确提及局限性 | 开发一个用于空间转录组数据模拟、数据增强和三维重建的计算平台，以支持标准化基准测试和方法学创新 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 参数云模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |