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当前共找到 764 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2025-12-17 |
Safety and efficacy of AAV8-aflibercept in treating choroidal neovascularization via single-cell RNA sequencing
2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101625
PMID:41399432
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研究论文 | 本研究评估了AAV8-aflibercept通过单细胞RNA测序治疗小鼠脉络膜新生血管的安全性和有效性 | 首次结合AAV8-aflibercept基因疗法与单细胞RNA测序技术，系统分析视网膜细胞类型及基因表达变化 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类临床试验；高剂量组观察到视网膜变薄和RPE改变 | 评估AAV8-aflibercept治疗脉络膜新生血管的疗效与安全性，并探索其细胞水平作用机制 | 激光诱导脉络膜新生血管的小鼠模型 | 数字病理学 | 脉络膜新生血管 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-12-17 |
Cell-type- and chromosome-specific chromatin landscapes and DNA replication programs of Drosophila testis tumor stem cell-like cells
2025-Dec-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280809.125
PMID:41371963
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研究论文 | 本研究开发了细胞类型特异性基因组技术，分析果蝇睾丸肿瘤干细胞样细胞的转录组、组蛋白修饰模式和复制时序 | 开发了细胞类型特异性染色质分析技术，整合转录组、染色质和复制时序数据，揭示体内干细胞群间的基因组调控差异 | 研究局限于果蝇模型，且干细胞数量少、组织异质性高，可能限制基因组研究的全面性 | 研究体内成年干细胞的转录、染色质和复制时序特征 | 果蝇睾丸中的生殖干细胞样细胞和体细胞囊干细胞样细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序，细胞类型特异性染色质分析 | NA | 转录组数据，组蛋白修饰数据，复制时序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-12-17 |
Single-cell transcriptomics reveals probiotic reversal of neonatal morphine-induced gene disruptions underlying adolescent pain hypersensitivity
2025-Dec-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09150-0
PMID:41372449
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了新生儿期吗啡暴露导致青春期小鼠中脑基因表达广泛改变，并发现益生菌Bifidobacterium infantis可逆转这些改变 | 首次提供了新生儿吗啡暴露及益生菌干预后青春期小鼠中脑的单细胞RNA测序数据集，揭示了益生菌对阿片类药物诱导的神经发育影响的逆转作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床中得到验证；观察时间点局限于青春期 | 探究新生儿期吗啡暴露对疼痛通路神经发育的长期影响及益生菌干预的潜在治疗作用 | 青春期小鼠的中脑单细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛敏感性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 107,427个中脑单细胞，来自新生儿期接受生理盐水、吗啡或吗啡加益生菌处理的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-12-17 |
Under pressure: integrated endothelial cell response to hydrostatic and shear stresses
2025-Dec-10, Vascular biology (Bristol, England)
DOI:10.1530/VB-25-0015
PMID:41378902
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研究论文 | 本研究通过体外模型探讨了静水压力如何影响内皮细胞对血流的响应，揭示了压力与剪切应力在调控内皮细胞转录变化中的协同作用 | 开发了体外模型以研究静水压力对内皮细胞血流响应的调节作用，并首次在单细胞水平上展示了压力如何剂量依赖性地调控剪切应力诱导的信号通路 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的血管环境；压力与剪切应力的具体分子相互作用机制仍需进一步探索 | 探究静水压力与剪切应力在内皮细胞机械转导中的综合作用，以更全面地理解血流动力学对内皮细胞身份和功能的影响 | 人内皮细胞及早期小鼠胚胎血管发育过程中的内皮细胞 | 细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-12-17 |
Sustained diabetes remission induced by FGF1 involves a shift in transcriptionally distinct AgRP neuron subpopulations
2025-Dec-09, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102300
PMID:41371441
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研究论文 | 本研究通过单细胞核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了FGF1诱导糖尿病缓解的机制，涉及AgRP神经元亚群的转录重编程 | 首次发现FGF1能诱导糖尿病小鼠中过度活跃的AgRP神经元亚群向野生型样状态转变，并揭示了空间定位和神经胶质相互作用的机制 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类中验证；机制细节如具体信号通路仍需进一步探索 | 探究FGF1诱导2型糖尿病长期缓解的分子和细胞机制 | 野生型和糖尿病（Lep）小鼠的AgRP神经元及其相关神经胶质细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | 单细胞核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 野生型和Lep小鼠在注射后第5天和第14天的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 46 | 2025-12-17 |
CANTAO: guiding clustering and annotation in single-cell RNA sequencing using average overlap
2025-Dec-08, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00176-4
PMID:41361656
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CANTAO的新方法，通过平均重叠度量来指导单细胞RNA测序数据的聚类和注释，以更准确地识别细胞身份 | 提出了平均重叠度量来定义单细胞聚类之间的距离，通过比较差异表达基因的排序列表，实现了对真实细胞身份的一致、精确且具有生物学意义的再现 | NA | 解决单细胞RNA测序中未知细胞身份情况下的聚类比较和注释挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 包含已知真实细胞身份的基准数据集以及未分选的小鼠胸腺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-12-17 |
An α-specific PI3K inhibitor improves chemotherapy efficacy by inhibiting hepatic stellate cell activation in liver cancer
2025-Dec-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001639
PMID:41397162
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研究论文 | 本研究探讨了化疗对肝星状细胞活化的影响，并发现α特异性PI3K抑制剂阿培利司可抑制化疗诱导的HSC活化，从而提高肝癌治疗效果 | 揭示了铂类化疗通过肿瘤细胞产生的过量ROS旁分泌作用激活HSC的新机制，并首次提出使用α特异性PI3K抑制剂靶向PI3K p110α来抑制化疗诱导的HSC活化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在大型临床队列中验证；未详细探讨其他PI3K亚型的作用 | 研究化疗对肝星状细胞活化的影响，并探索通过调节HSC活化来提高肝癌治疗效果的策略 | 肝星状细胞、癌症相关成纤维细胞、肝细胞癌、胆道癌 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、免疫组化染色、12参数流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据、免疫组化图像、流式细胞术数据 | 患者样本（具体数量未明确）、小鼠肝癌模型（非纤维化和纤维化肝脏） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-12-17 |
PEGylated black-phosphorus nanosheet-alginate hydrogels enable local PRRX1 delivery to drive fibroblast reprogramming in intestinal fibrosis
2025-Dec-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03896-9
PMID:41350883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析克罗恩病患者的肠道纤维化，识别出PRRX1作为关键转录因子，并开发了一种基于PEG化黑磷-海藻酸盐水凝胶的局部递送系统，以驱动成纤维细胞重编程，从而加剧或缓解肠道纤维化 | 首次将PRRX1识别为肠道纤维化的核心调控因子，并创新性地开发了PEG化黑磷-海藻酸盐水凝胶系统用于局部递送PRRX1，实现了对成纤维细胞的重编程调控 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在更广泛的人类临床样本中进行验证，且水凝胶系统的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究肠道纤维化的核心调控机制，并开发一种局部递送系统以调控成纤维细胞活性，为克罗恩病等疾病的纤维化治疗提供新策略 | 克罗恩病患者的配对纤维化和非纤维化回肠组织、Col1a2-Cre; Prrx1小鼠模型、人类肠道成纤维细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、报告基因检测、蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、基因组学数据 | 克罗恩病患者的配对回肠组织样本（具体数量未明确）、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-12-17 |
Protoplast technology in woody plants: current advances and potential applications in genetic improvement
2025-Dec-03, Tree physiology
IF:3.5Q1
DOI:10.1093/treephys/tpaf138
PMID:41182256
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综述 | 本文综述了木本植物原生质体技术的当前进展及其在遗传改良中的潜在应用 | 全面概述了木本植物原生质体分离、纯化、活力评估方法及其在基因功能分析、融合、再生、基因组编辑和单细胞测序等领域的多样化应用，并展望了未来技术突破带来的新研究方向 | NA | 总结木本植物原生质体技术的最新进展，并探讨其在遗传改良和生物技术创新中的潜力 | 木本植物 | 植物生物技术 | NA | 原生质体分离、瞬时表达系统、基因编辑、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-12-17 |
A deep generative model for deciphering cellular dynamics and in silico drug discovery in complex diseases
2025-Dec, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01423-7
PMID:40542107
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以揭示疾病进展中的复杂细胞动态并辅助计算机药物发现 | 开发了首个专门针对时间序列单细胞转录组数据的深度生成模型，能够学习疾病相关的细胞嵌入表征，并实现高精度的药物扰动模拟与筛选 | 模型在更广泛疾病类型中的验证仍需进一步扩展，且对数据质量和时间点密度有一定依赖性 | 开发计算工具以解析复杂疾病中的细胞动态变化，并实现计算机药物发现 | 时间序列单细胞转录组数据，特发性肺纤维化患者样本，COVID-19相关数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 单细胞转录组数据 | 特发性肺纤维化患者数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-12-17 |
αCGRP deficiency aggravates pulmonary fibrosis by promoting senescence in alveolar type 2 cells
2025-Dec, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00361-3
PMID:41023452
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研究论文 | 本研究探讨了αCGRP缺乏通过促进肺泡II型细胞衰老而加剧肺纤维化的机制 | 首次揭示了αCGRP缺乏通过扰乱AT2细胞脂质代谢和加速炎症性衰老来促进肺纤维化的新机制，并利用单细胞RNA测序和蛋白质组学进行了多组学验证 | 样本量较小（n=15），且为回顾性分析，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究αCGRP缺乏在肺纤维化发病机制中的作用 | 肺纤维化患者、Calca基因敲除大鼠、D-半乳糖诱导的衰老模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，无标记蛋白质组学，免疫组织化学 | NA | 临床数据，组织样本，单细胞转录组数据，蛋白质组数据 | 15例肺纤维化患者，Calca基因敲除大鼠模型，D-半乳糖诱导衰老模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-12-17 |
Single-cell analysis of differential fat deposition in chicken pectoral muscle and abdominal fat tissues
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105938
PMID:41108936
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了固始鸡胸肌和腹部脂肪组织中脂肪沉积的细胞类型和分子特征 | 首次在固始鸡中应用单细胞RNA测序技术，揭示了腹部脂肪和肌肉内脂肪沉积的细胞类型特异性基因表达差异，并验证了G0S2基因在腹部脂肪细胞中的独特功能 | 研究仅针对2周龄鸡的组织进行单细胞测序，未覆盖其他年龄阶段；样本量相对较小，可能影响统计效力 | 探究固始鸡腹部脂肪和肌肉内脂肪沉积的机制及其组织特异性差异 | 固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2周龄固始鸡的胸肌和腹部脂肪组织（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-12-17 |
Intestinal fibroblast heterogeneity - unifying RNA-seq studies and introducing consensus-driven nomenclature
2025-Dec-01, Journal of cell science
IF:3.3Q3
DOI:10.1242/jcs.264147
PMID:41170756
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了小鼠结肠黏膜中的六个成纤维细胞亚群，并提出了标准化的命名法 | 整合多个数据集以识别保守的成纤维细胞群体，并引入共识驱动的命名法来统一分类 | 研究主要基于小鼠模型，可能不完全适用于人类；在稳态条件下进行，未充分探讨疾病状态下的变化 | 研究肠道成纤维细胞的异质性，并建立标准化的命名体系 | 小鼠结肠黏膜中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-12-17 |
Non-cell-autonomous control of mouse gastruloid development by the ultra-conserved lncRNA T-UCstem1
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00558-2
PMID:41174250
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研究论文 | 本研究利用小鼠胃胚体模型，揭示了超保守长链非编码RNA T-UCstem1通过非细胞自主方式调控DKK1依赖性WNT通路，从而在哺乳动物体轴形成中发挥关键作用 | 首次发现超保守lncRNA T-UCstem1在胃胚体发育中的非细胞自主调控功能，并阐明其通过DKK1-WNT通路调控细胞身份建立的分子机制 | 研究基于体外胃胚体模型，与真实胚胎发育环境存在差异；机制研究尚未完全解析T-UCstem1的具体作用靶点 | 探究超保守lncRNA T-UCstem1在哺乳动物早期胚胎体轴形成中的功能与机制 | 小鼠胃胚体（干细胞衍生的胚胎发育模型） | 发育生物学 | NA | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 图像数据, 转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-12-17 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00613-y
PMID:41184589
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研究论文 | 本研究利用海鞘Ciona模型，通过单细胞RNA测序技术揭示了心脏咽部祖细胞在细胞周期驱动下的转录组成熟过程，及其对多谱系能力获得的影响 | 首次结合转基因样本条形码与scRNA-seq技术，在迁移性心脏咽部祖细胞中系统解析了G1、S和G2期转录组动态，提出了“转录组成熟”概念，并发现Depdc1b等候选基因在晚期G2达到峰值，揭示了细胞周期与谱系特异性程序部署的耦合机制 | 研究基于海鞘模型，其结论在哺乳动物系统中的普适性需进一步验证；功能实验主要聚焦于Depdc1b等少数基因，转录组成熟的全面调控网络尚未完全阐明 | 探究心脏咽部祖细胞在发育过程中如何通过细胞周期驱动的转录组变化获得多谱系能力 | 海鞘Ciona的迁移性心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转基因样本条形码 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-12-17 |
Randomized Spatial PCA (RASP): A computationally efficient method for dimensionality reduction of high-resolution spatial transcriptomics data
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013759
PMID:41370353
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研究论文 | 本文提出了一种名为随机空间主成分分析（RASP）的计算高效方法，用于高分辨率空间转录组学数据的降维处理 | RASP是一种新颖的空间感知降维方法，比现有技术快几个数量级，可扩展到具有10万+位置的数据集，支持非转录组协变量的灵活集成，并能重建去噪、空间平滑的基因表达值 | RASP本身不是聚类或区域检测方法，细胞类型和空间区域需要通过聚类RASP的主成分来获得，且有效聚类分辨率取决于K近邻图和平滑参数β | 开发一种计算高效的空间转录组学数据降维方法，以促进组织结构和疾病进展机制的理解 | 人类和小鼠组织中的空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 随机化两阶段PCA框架 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, 10x Xenium | 10x Visium, Stereo-Seq, MERFISH, 10x Xenium |
| 57 | 2025-12-17 |
Single-cell transcriptomics reveals the functional trajectories of the endocarp cell clusters in the postharvest fruit senescence process of Hylocereus undatus
2025-Dec, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110623
PMID:41109014
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学结合表型和功能分析，探讨了火龙果（Hylocereus undatus）采后果实衰老过程中内果皮细胞簇的功能轨迹 | 首次在火龙果中应用单细胞转录组学揭示内果皮细胞簇在果实衰老中的功能分化轨迹，并识别出关键调控基因HuGIP2 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证；实验在特定品种和条件下进行，普适性需进一步验证 | 探究火龙果采后衰老过程中内果皮细胞簇的功能角色和分子机制 | 火龙果（Hylocereus undatus）果实的内果皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，病毒诱导基因沉默，荧光显微镜 | 伪时间轨迹分析，基因调控网络推断 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及火龙果内果皮细胞的多时间点分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-12-17 |
Hub genes and common pathogenic mechanisms between COPD and H. pylori infection
2025-Dec, Journal, genetic engineering & biotechnology
DOI:10.1016/j.jgeb.2025.100622
PMID:41386886
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研究论文 | 本文通过整合分析公共数据集，识别了慢性阻塞性肺疾病（COPD）和幽门螺杆菌（H. pylori）感染之间的共享基因和共同致病机制 | 首次通过多组学方法（包括WGCNA、SVM-RFE、单细胞RNA测序和细胞间通讯分析）系统识别了COPD和H. pylori感染之间的共享枢纽基因CCR1和CCL19，并揭示了它们在免疫细胞和成纤维细胞中的表达模式及相互作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证；样本来源和实验条件可能存在异质性；单细胞分析可能受限于数据集的细胞类型覆盖和分辨率 | 探究COPD和H. pylori感染之间的共同分子机制和共享基因，以揭示潜在的整合治疗靶点 | COPD和H. pylori感染的基因表达数据，包括差异表达基因、共表达模块、免疫细胞浸润和单细胞转录组 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 基因表达分析、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、支持向量机递归特征消除（SVM-RFE）、基因集富集分析（GSEA）、受试者工作特征曲线（ROC）、免疫浸润分析（CIBERSORT）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞间通讯分析 | SVM-RFE | 基因表达数据（微阵列或RNA-seq） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-12-17 |
Decoding the B-cell immune landscape in duck hepatitis A virus type 3 through single-cell genomics
2025-Dec, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105929
PMID:41056664
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和B细胞受体分析，解码了鸭甲型肝炎病毒3型感染下小鼠脾脏B细胞的免疫景观 | 创新性地识别了一个新的IGHV1种系克隆IGHV1-20，并发现了一个新的B细胞亚群Gm37915+ B细胞与Nuggc+ B细胞之间增强的细胞通讯趋势 | 研究仅基于小鼠模型，未在鸭或其他宿主中进行验证，且样本量有限 | 探索DHAV-3免疫机制并识别潜在治疗靶点 | 用DHAV-3免疫的小鼠脾脏B细胞 | 单细胞基因组学 | 鸭病毒性肝炎 | 单细胞RNA测序，B细胞受体分析 | NA | 单细胞基因表达数据，B细胞受体序列数据 | 未明确指定样本数量，但涉及免疫小鼠的脾脏B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-12-17 |
Single-cell analysis of human thymus and peripheral blood unveils the dynamics of T cell development and aging
2025-Dec, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00990-3
PMID:41136751
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析了人类胸腺和外周血中T细胞发育与衰老的动态过程 | 首次结合单细胞测序和TCR测序，揭示了胸腺衰老对T细胞谱系潜力和外周T细胞老化的影响，并建立了基于初始T细胞的免疫年龄预测模型 | 样本量相对有限，且研究主要基于转录组数据，功能验证不足 | 探究年龄相关胸腺退化的机制及其对外周T细胞的影响 | 人类胸腺和外周血细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关免疫疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | 387,762个细胞，来自年轻和年老个体的胸腺和外周血 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞TCR-seq | NA | NA |