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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-02-03
Development and application of a barcoded rabies viral tracing method for mapping brain-wide inputs to single neurons
2025-Dec-15, Cell reports methods IF:4.3Q2
研究论文 本研究开发了一种条形码狂犬病毒示踪方法,用于在单细胞水平上绘制全脑对单个神经元的输入连接图谱 将逆行病毒示踪与单细胞RNA测序相结合,创建了条形码狂犬病毒示踪方法,首次实现了在单细胞分辨率下对转录组定义的神经元进行局部和长程输入连接的同时绘制 未在摘要中明确说明 开发一种能够绘制单个神经元输入连接图谱的方法,以构建细胞分辨率的大脑介观连接组 小鼠内侧前额叶皮层神经元 神经科学 NA 逆行病毒示踪,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,连接数据 未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
42 2026-02-03
Investigating the role of inflammatory bowel disease-associated gene expression in oral cancer using single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨炎症性肠病相关基因在口腔癌中的表达及其潜在治疗靶点 首次在口腔癌中通过单细胞RNA测序分析炎症性肠病相关基因的表达,揭示了NFKBIA与趋化因子介导信号通路的关联 样本来源和数量未在摘要中明确说明,可能限制结果的普遍性 研究炎症性肠病相关基因在口腔癌中的作用,以识别潜在治疗靶点 口腔癌组织样本 数字病理学 口腔癌 单细胞RNA测序 UMAP, t-SNE RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
43 2026-02-03
Decoding osteosarcoma from heterogeneity to precision therapy
2025-Dec-11, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了骨肉瘤的分子亚型研究进展,强调了亚型特异性致癌驱动因素及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的作用,并探讨了基于分子谱的精准医学策略潜力 整合了多组学数据(包括单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱)来解码骨肉瘤的异质性,并识别了新的生物标志物 NA 解码骨肉瘤的异质性,并探索针对其分子亚型的精准治疗策略 骨肉瘤(OS),一种青少年中最常见的恶性骨肿瘤 数字病理学 骨肉瘤 多组学研究,包括基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、空间分析和表观遗传图谱 NA 多组学数据 NA NA 单细胞转录组学, 空间分析, 表观遗传图谱 NA NA
44 2026-02-02
CellScope: high-performance cell atlas workflow with tree-structured representation
2025-Dec-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellScope的高性能细胞图谱工作流程,该流程采用树状结构表示,旨在解决现有单细胞分析框架在同时探索和可视化多级生物层次方面的不足 CellScope通过两阶段流形拟合过程进行基因选择和降噪,结合凝聚聚类,并整合UMAP可视化与层次聚类,直观地同时表示细胞在多个层次(如细胞谱系、细胞类型和细胞亚型)上的关系,从而在聚类性能、可视化清晰度、计算效率和算法可解释性方面全面超越现有方法 未在摘要中明确提及 开发一个能够同时探索和可视化多级生物层次的高性能细胞图谱工作流程,以更深入地理解细胞异质性和功能 单细胞测序数据 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 单细胞测序数据 多个单细胞数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
45 2026-02-02
Venetoclax resistance in preclinical KMT2A-rearranged acute lymphoblastic leukemia models is characterized by high inter- and intra-model heterogeneity
2025-Dec-29, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究探讨了KMT2A重排急性淋巴细胞白血病模型中Venetoclax耐药的机制,揭示了其高异质性及肿瘤微环境的作用 首次在KMT2A重排ALL模型中系统表征Venetoclax耐药,并发现耐药具有高模型间和模型内异质性,同时通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤微环境在耐药发展中的潜在贡献 研究基于临床前细胞系和异种移植模型,可能无法完全反映人类患者的复杂情况,且耐药机制的多因素性仍需进一步验证 阐明Venetoclax在KMT2A重排急性淋巴细胞白血病中产生耐药的机制 KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型 数字病理学 急性淋巴细胞白血病 靶向DNA测序、mRNA测序、单细胞mRNA测序、蛋白质表达分析 NA 基因组数据、转录组数据、蛋白质数据 未明确指定具体样本数量,涉及细胞系和异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
46 2026-02-02
Interpretable multimodal deep learning improves postoperative risk stratification in intrahepatic cholangiocarcinoma in multicentre cohorts
2025-Dec-29, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
研究论文 本研究开发了一种基于Transformer的可解释多模态深度学习框架,用于整合临床变量、影像组学特征和全切片病理图像,以改善肝内胆管癌患者的术后风险分层 提出了一种结合预训练编码器和Transformer网络的可解释多模态深度学习管道,并利用空间转录组学和蛋白质组学进行生物学验证,揭示了模型注意力机制与肿瘤侵袭性行为的关联 未明确说明样本的具体数量或来源细节,且模型在更广泛人群中的泛化能力有待进一步验证 提高肝内胆管癌患者术后风险分层的准确性 肝内胆管癌患者 计算机视觉 肝内胆管癌 空间转录组学,空间蛋白质组学 Transformer 临床变量,影像组学特征,全切片病理图像 NA NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
47 2026-02-02
Defining the marker and developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in aging by single-cell transcriptomics
2025-Dec-24, npj aging IF:4.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学定义了衰老过程中髓源性抑制细胞(MDSCs)的标记物和发育轨迹 建立了MDSC特异性基因特征,揭示了衰老过程中MDSCs的一般特性,并发现CD300c可作为改善衰老中MDSCs检测和富集的特异性标记物 未明确提及研究局限性 研究衰老过程中MDSCs的标记物和发育轨迹,以区分MDSCs与正常髓系细胞 衰老小鼠和年轻对照小鼠的MDSCs,以及人类髓系细胞 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确提及具体样本数量,涉及小鼠和人类细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
48 2026-02-02
A proteogenomic gene signature defines prognostic subgroups highlighting PI3K/AKT/mTOR signaling pathway as a therapeutic vulnerability in myeloid malignancies
2025-Dec-16, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究通过整合蛋白质组学和基因组学数据,开发了一个用于骨髓恶性肿瘤风险分层的预后基因标签,并验证了PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制作为一种有前景的治疗策略 通过双向孟德尔随机化分析确立了MPN是AML的前体,并整合血浆蛋白质组学数据开发了一个新的预后蛋白基因组学基因标签,揭示了PI3K/AKT/mTOR通路作为治疗靶点 研究主要基于回顾性队列分析,需要在前瞻性临床研究中进一步验证基因标签和治疗策略的有效性 探索骨髓恶性肿瘤(特别是MPN向AML转化)的分子机制,开发预后生物标志物并寻找新的治疗靶点 骨髓恶性肿瘤患者,包括急性髓系白血病(AML)和骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者,以及相关的细胞系和动物模型 生物信息学 血液系统恶性肿瘤 双向孟德尔随机化分析,血浆蛋白质组学,单细胞RNA测序(scRNA-seq),药物基因组学分析,体外和体内实验 预后基因标签模型 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据,临床数据 BEAT-AML队列和TCGA-LAML队列的患者样本,未明确具体数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
49 2026-02-02
Tumor Microenvironment in Cancer Biology: A Comprehensive Review of Stromal, Immune, and Vascular Components Driving Malignancy
2025-Dec, Cureus
综述 本文全面综述了肿瘤微环境(TME)中的基质、免疫和血管组分在癌症生长、转移和治疗反应中的关键作用 整合了单细胞RNA测序和AI辅助成像等先进方法的最新发现,强调了TME靶向治疗作为癌症治疗重大转变的潜力 TME的异质性和肿瘤适应性对新兴靶向策略构成挑战 综述肿瘤微环境各组分在癌症生物学中的作用及靶向治疗策略 肿瘤微环境,包括细胞外基质、基质细胞、免疫细胞和血管组分 数字病理 癌症 单细胞RNA测序,AI辅助成像 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
50 2026-01-30
4R-tau seeding activity reveals molecular subtypes in progressive supranuclear palsy
2025-Dec-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过分析进行性核上性麻痹(PSP)患者脑组织中不同分子形式的tau蛋白,揭示了tau种子活性与疾病分子异质性及临床异质性的关联 首次将tau种子活性(特别是高分子量tau组装体)与PSP的分子亚型联系起来,并发现高tau种子活性病例具有独特的免疫和代谢通路改变特征 未明确说明样本的具体数量或来源细节,且分子机制与临床症状的直接关联仍需进一步验证 探究PSP临床异质性的分子基础,并开发基于tau种子活性的患者分层方法 进行性核上性麻痹(PSP)患者脑组织,特别是初级运动皮层 神经退行性疾病研究 进行性核上性麻痹 生化检测、种子扩增试验、蛋白质组学分析、空间转录组学 NA 蛋白质组数据、转录组数据、生化检测数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
51 2026-01-30
Unraveling the cellular characteristics of cardiomyopathy with rare variant-driven gene signatures using multi-omics analysis
2025-Dec-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合全基因组测序与单细胞转录组学数据,揭示了罕见变异驱动的基因特征在心肌病中的细胞特性与致病机制 首次将罕见变异(包括意义未明变异)与单细胞转录组学数据整合,系统解析了心肌病相关基因在心脏细胞异质性中的表达模式及细胞间互作网络 研究样本仅来自韩国人群,可能限制结论在其他人群中的普适性;单细胞数据来源于独立数据集,未与基因组数据直接配对 阐明罕见变异在心肌病发病机制中的作用,并揭示其在不同心脏细胞类型中的表达特征 245名韩国扩张型或肥厚型心肌病患者的心脏组织细胞 计算生物学 心肌病 全基因组测序, 单细胞RNA-seq NA 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 245名患者(扩张型48.2%,肥厚型47.8%)及11,664个心脏组织细胞 NA 全基因组测序, 单细胞RNA-seq NA NA
52 2026-01-30
PET/CT-guided management of immune checkpoint blockade and multi-modal profiling following treatment in long-term responders with metastatic lung cancer in the National Network Genomic Medicine Lung Cancer Germany (nNGM)
2025-Dec-30, Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology IF:56.7Q1
研究论文 本研究探讨了在转移性肺癌长期应答者中,基于PET/CT指导的免疫检查点阻断治疗管理策略的有效性,并通过多模态分析揭示了治疗后的耐药机制 首次在大型回顾性队列中评估PET/CT指导的ICB停药策略,结合基因组分析、组织学评估和空间转录组学探索晚期耐药机制,并发现第二原发性肺癌的高发生率 研究为回顾性设计,可能存在选择偏倚;样本量相对有限;需要前瞻性试验验证 确定免疫检查点阻断在肺癌长期应答者中的最佳治疗持续时间,并探索耐药机制 来自德国国家网络基因组医学肺癌网络的455名转移性肺癌患者,这些患者在接受一线ICB治疗后疾病控制时间≥2年 数字病理学 肺癌 综合基因组分析、组织肿瘤浸润淋巴细胞定量、空间转录组学 NA 临床数据、影像数据(PET/CT)、基因组数据、组织学数据 455名患者(队列A:126名,队列B:329名),匹配的治疗前后肿瘤样本 NA 空间转录组学 NA NA
53 2026-01-30
Revealing the Best Strategies for Rare Cell Type Detection in Multi-Sample Single-Cell Datasets
2025-Dec-29, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究系统评估了多样本单细胞RNA测序数据中罕见细胞检测方法的性能,并比较了不同分析策略的效果 首次在多样本设置下对罕见细胞检测工具进行系统性基准测试,并识别出批校正合并样本检测为最优策略 仅评估了五种代表性工具,可能未涵盖所有现有方法;依赖于公开数据集,可能受数据质量和异质性限制 评估和比较多样本单细胞数据中罕见细胞检测方法的性能,以确定最有效的分析策略 单细胞RNA测序数据中的罕见细胞群体 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 Isolation Forest, 以及基于scGPT的方法 单细胞RNA测序数据 多个公开可用的scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2026-01-30
Controllability of the gene regulatory network in zebrafish embryogenesis
2025-Dec-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序数据重建斑马鱼胚胎发生过程中的基因调控网络,并分析其可控性 首次在斑马鱼胚胎发育全过程中重建基因调控网络,并发现网络可控性随发育进程增强,同时识别出关键转录因子 基于推断的基因调控网络可能不完全准确,且未考虑非转录因子调控机制 探究斑马鱼胚胎发生过程中基因调控网络的可控性 斑马鱼胚胎发育过程中的基因调控网络 计算生物学 NA 单细胞RNA测序 网络可控性理论 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
55 2026-01-30
ATG7 dysfunction in senescent melanocytes and hypopigmented skin: Reversal by metformin
2025-Dec-26, The British journal of dermatology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和时序转录组分析,揭示了自噬功能障碍是紫外线诱导黑素细胞衰老的早期关键事件,并发现二甲双胍可通过上调ATG7恢复自噬活性、延缓衰老 首次将ATG7下调确定为紫外线诱导黑素细胞衰老的最早期分子事件,并在特发性点状白斑皮肤中得到验证,同时提出二甲双胍作为通过恢复自噬延缓黑素细胞衰老的干预策略 研究主要基于体外UVB诱导的衰老模型和有限的患者皮肤样本,体内长期疗效和安全性尚未验证 识别黑素细胞衰老的早期分子事件,并评估预防黑素细胞老化的治疗策略 UVB诱导的衰老黑素细胞、特发性点状白斑患者皮肤样本 单细胞组学 皮肤色素减退性疾病 单细胞RNA测序, 时序转录组分析, 免疫组化, 基因敲低/过表达 NA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
56 2026-01-30
Molecular architecture of mesoderm cells across early to middle stage of human embryo development at single-cell resolution
2025-Dec-25, BMC molecular and cell biology IF:2.4Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC测序,分析了人类胚胎7-17周期间中胚层细胞向心脏、肾脏、脾脏、肝脏和大脑分化的分子架构和关键事件 首次在单细胞分辨率下揭示了早期至中期人类胚胎中胚层细胞的分子架构,并识别了EGR1、RPL10P9+PTMAP5+和NDUFA4L2+A2M+等关键分子标记与分化潜能的关联 研究仅基于7-17周的人类胚胎样本,可能未覆盖更早期或更晚期的发育阶段,且样本量有限 探究人类胚胎早期中胚层细胞分化的分子机制和谱系进展 人类胚胎7-17周期间的中胚层细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 人类胚胎7-17周期间的样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
57 2026-01-30
Single-Cell Transcriptomics on PRPF31-Mutated Retinal Organoids Reveal Early Müller Glial Activation and Progressive Photoreceptor Degeneration
2025-Dec-24, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究利用患者来源的视网膜类器官,通过单细胞RNA测序揭示了PRPF31突变导致的早期Müller胶质细胞激活和进行性光感受器退化 首次在PRPF31突变视网膜类器官中,通过单细胞转录组学全面分析了早期和晚期分化阶段所有视网膜细胞群的动态转录变化,揭示了早期Müller胶质细胞激活和视网膜神经节细胞应激等新发现 研究基于体外视网膜类器官模型,可能无法完全模拟体内视网膜的复杂微环境;样本量可能有限;未涉及长期疾病进展的全面分析 研究PRPF31突变在视网膜色素变性(RP11亚型)中的分子机制,特别是早期分子事件和其他视网膜细胞类型的参与 患者来源的视网膜类器官(ROs) 数字病理学 视网膜色素变性 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
58 2026-01-30
Simultaneous targeting of KRAS and CDK4 synergistically induces durable growth arrest in pancreatic cancer cells
2025-Dec-23, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文探讨了KRAS抑制剂与CDK4/6抑制剂联合使用在胰腺癌治疗中的协同效应及其机制 揭示了KRAS-G12C抑制剂Sotorasib与CDK4/6抑制剂Palbociclib在胰腺癌和非小细胞肺癌细胞中的协同作用,并首次报道了KRAS-G12D抑制剂MRTX1133与Palbociclib的联合效果 在体内小鼠模型中,Palbociclib未能增强MRTX1133的抗肿瘤效果,可能由于药物诱导的肿瘤血管化作用 探索克服KRAS抑制剂耐药性的联合治疗策略 胰腺导管腺癌细胞、类器官、非小细胞肺癌细胞以及免疫健全小鼠模型 癌症治疗学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
59 2026-01-30
Enhanced therapeutic efficacy of repeated bone marrow-derived MSC administration in a murine model of pulmonary fibrosis
2025-Dec-23, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了重复骨髓来源间充质干细胞(MSCs)给药在小鼠矽肺模型中的治疗效果 揭示了重复MSC给药相比单次给药能改善细胞存留、减轻纤维化,并首次提出ZC3H4在巨噬细胞激活中的调控作用 研究基于小鼠模型,结果需在人类临床试验中验证;ZC3H4的具体作用机制尚未完全阐明 评估重复骨髓来源MSC给药对矽肺纤维化的治疗效果并探索其作用机制 小鼠矽肺模型、人骨髓来源间充质干细胞(hBMSCs)、巨噬细胞 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序、细胞因子检测、转录组学分析、体内表达谱分析、体外敲低实验 NA RNA测序数据、细胞因子数据、影像数据、组织学数据 小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
60 2026-01-30
Simultaneous generation of transplantable RGC-like and corneal progenitor cells from hiPSCs using a dual-lineage platform
2025-Dec-23, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究开发了一种基于hiPSCs的双谱系平台,可同时生成可移植的视网膜神经节细胞样细胞和角膜祖细胞,用于治疗视网膜和角膜细胞退化引起的视力丧失 创新点在于整合2D和3D培养技术,通过单细胞RNA测序鉴定表面标记物(CD184和CD171用于RGCs,CD104用于角膜祖细胞),实现高效纯化和同步生成视网膜与角膜类器官 研究基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证,且长期安全性和免疫排斥反应需进一步评估 开发一种高效、成本效益高的方法,从hiPSCs中生成可移植的视网膜和角膜细胞,以克服眼再生医学中的关键障碍 人类诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化的视网膜神经节细胞样细胞和角膜祖细胞 数字病理学 眼疾 单细胞RNA测序,FACS细胞分选,2D和3D培养技术 NA RNA测序数据 四个时间点的细胞样本用于单细胞RNA测序 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Genomics单细胞RNA测序平台 10x Genomics单细胞RNA测序用于追踪RGC和角膜谱系发育
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