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当前共找到 1157 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2025-12-28 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_105086
PMID:41443261
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研究论文 | 本研究结合iPSC细胞模型和功能基因组学，系统性地探索了阿尔茨海默病和多发性硬化症风险位点的因果基因 | 首次将iPSC衍生细胞模型与CRISPRi单细胞筛选相结合，系统性地扰动AD和MS风险SNP，揭示了新的风险基因如MAF和ELMO1 | 研究主要基于体外细胞模型，与体内环境的生理相关性仍需进一步验证 | 识别阿尔茨海默病和多发性硬化症风险位点的因果基因及其在神经免疫通路中的作用 | iPSC衍生的神经祖细胞、兴奋性神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞，以及原代人类脑细胞 | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病, 多发性硬化症 | RNA-seq, H3K27ac ChIP-seq, Promoter Capture Hi-C, CRISPRi, 单细胞RNA-seq | iPSC细胞模型 | 基因组学数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2025-12-28 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106126
PMID:41443946
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研究论文 | 本文介绍了阿尔茨海默病知识门户（AD Knowledge Portal）作为一个数据共享平台的功能、资源规模、使用情况及其对阿尔茨海默病研究的推动作用 | 整合了来自14个NIH资助研究项目和97项资助的多元化数据资源，提供大规模多模态单细胞组学数据，并支持与云端分析平台的互操作性 | NA | 促进阿尔茨海默病研究数据的共享与再利用 | 人类和非人类（动物模型）的阿尔茨海默病相关数据 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 下一代测序，成像，行为数据分析 | NA | 基因组测序数据，影像数据，行为数据，单细胞组学数据 | 来自超过11,000个个体的数据 | NA | 单细胞组学，空间转录组学，下一代测序 | NA | NA |
| 523 | 2025-12-28 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106203
PMID:41443969
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、遗传学、功能/物理测量、转录组学和代谢组学信息，提出了一个多组学框架，以表征阿尔茨海默病（AD）中遗传学支持的代谢物信号网络在特定细胞环境中的动态变化 | 开发了单细胞功能代谢物传感器通信（scFUMES）算法，用于在单细胞水平预测代谢感知谱，并系统揭示了循环代谢物介导的信号重编程网络 | 研究主要基于特定脑区域（如MTG和DLPFC）的数据，可能无法全面反映AD在所有脑区的代谢异质性，且scFUMES算法的泛化能力需进一步验证 | 旨在阐明AD中代谢信号动态如何以单细胞水平重编程细胞病理生物学，以理解代谢异质性和基于代谢的治疗开发 | 阿尔茨海默病患者和非AD对照的脑组织样本，重点关注神经元细胞、非神经细胞（如免疫细胞和少突胶质细胞） | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 遗传学分析, 转录组学, 代谢组学, Mendelian Randomization分析 | scFUMES算法 | 单细胞RNA测序数据, 遗传数据, 功能/物理测量数据, 转录组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2025-12-28 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_106221
PMID:41445081
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研究论文 | 本研究开发了一种新型人源化APOE小鼠模型，以探究APOE4等位基因如何影响阿尔茨海默病中tau蛋白的局部传播 | 首次在APOE人源化小鼠模型中结合tau过表达，模拟AD早期tau蛋白的区域特异性传播，并揭示APOE基因型、性别和年龄对病理过程的交互影响 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全复制人类AD的复杂性；样本量未明确说明；结果存在性别依赖性差异，需进一步验证 | 探究APOE4等位基因是否以局部方式改变阿尔茨海默病中tau蛋白的传播 | 人源化APOE小鼠模型（APOE3/3和APOE4/4基因型），包括雄性和雌性小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学分析，体内和体外技术 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，病理学数据，行为学数据 | 小鼠在三个时间点（5-7、15-17和25-27个月）被分析，具体数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 525 | 2025-12-28 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_107308
PMID:41445488
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研究论文 | 本研究使用Xenium空间转录组学技术，探讨外周炎症如何通过改变小胶质细胞的转录谱影响阿尔茨海默病模型中的Aβ和tau病理 | 首次结合单细胞多组学测序（Multiome）与空间转录组学，系统分析外周病毒感染诱导的炎症对小胶质细胞转录组的动态影响及其与神经退行性病变的关联 | 研究仅基于3xTg-AD小鼠模型，人类临床意义尚不明确；样本时间点有限（7天和2个月），长期效应需进一步验证 | 探究外周炎症是否通过改变小胶质细胞转录状态来影响阿尔茨海默病病理进程 | 3xTg-AD转基因小鼠的小胶质细胞、神经元和内皮细胞 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、单细胞多组学测序（RNA-seq+ATAC-seq）、免疫染色、ELISA | NA | 空间转录组数据、单细胞转录组数据、表观遗传数据、蛋白质表达数据 | 3xTg-AD小鼠脑组织样本（感染后7天和2个月时间点） | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞多组学测序 | Xenium, 10x Chromium | Xenium空间转录组学平台用于原位基因表达分析，10x Chromium系统用于单细胞多组学测序 |
| 526 | 2025-12-28 |
Drug Development
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70859_100777
PMID:41447159
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研究论文 | 本文介绍了一种新型小分子TREM2激动剂MTX46943，用于治疗早期阿尔茨海默病，通过激活小胶质细胞并减少淀粉样蛋白病理 | MTX46943是一种新型、强效、选择性、安全且能穿透血脑屏障的TREM2小分子激动剂，与TREM2激动抗体相比，具有独特的受体复合物形成和稳定化机制 | 研究主要基于5xFAD/hTREM2敲入小鼠模型，人类临床效果尚未验证，且长期安全性和耐受性需进一步评估 | 开发并评估MTX46943作为TREM2激动剂在治疗早期阿尔茨海默病中的机制和疗效 | TREM2受体、小胶质细胞、阿尔茨海默病病理模型（如5xFAD/hTREM2敲入小鼠） | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | nanoBiT、Western blot、alphaLISA、细胞迁移和吞噬实验、qPCR、单细胞RNA测序、免疫染色分析 | NA | 体外细胞数据、体内小鼠模型数据、单细胞RNA测序数据 | 使用5xFAD/hTREM2敲入小鼠进行3个月治疗实验，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 527 | 2025-12-28 |
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70855_107229
PMID:41447258
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研究论文 | 本研究利用皮质类器官模型，探讨了APOE3-Christchurch变异在非疾病条件下如何改变APOE生物学，包括对代谢和细胞相互作用的影响 | 首次在皮质类器官模型中系统研究APOE3-Christchurch变异对APOE生物学的基础机制，揭示了其在线粒体功能和脂质代谢方面的独特作用 | 研究主要基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；样本批次有限 | 探究APOE3-Christchurch变异如何改变APOE生物学机制及其潜在治疗意义 | 皮质类器官、iPSC来源的星形胶质细胞和神经元 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、脂质组学分析、Seahorse压力测定 | NA | 基因表达数据、脂质代谢数据 | 三批独立的6月龄大脑类器官进行scRNA-seq，8月龄类器官进行脂质组学分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 528 | 2025-12-28 |
Drug Development
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz70859_099554
PMID:41447588
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，探究了长期C31治疗对tau病理模型中神经元-胶质细胞通讯的影响 | 首次结合单核RNA测序和空间分子成像技术，系统分析了C31治疗对tau病理模型中神经元-胶质细胞相互作用的影响，揭示了药物对特定信号通路的调节作用 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；观察时间点有限，长期效应尚不明确；空间转录组学数据分辨率可能受技术限制 | 探究C31药物在tau病理模型中如何调节神经元-胶质细胞通讯，以阐明其治疗神经退行性疾病的机制 | TauP301S (PS19)转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间成像数据 | PS19和野生型小鼠皮质组织（具体数量未明确说明） | 10x Genomics, NanoString | 单核RNA测序, 空间分子成像 | 10x Chromium, CosMx | 10x单核RNA测序平台和CosMx空间分子成像系统 |
| 529 | 2025-12-28 |
Spatial Dynamics of Tumor Cell Plasticity in Lung Adenocarcinoma Revealed by Region-Specific Single Cell Transcriptomics
2025-Dec, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70101
PMID:41454525
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研究论文 | 本研究通过区域特异性单细胞转录组学揭示了肺腺癌中肿瘤细胞可塑性的空间动态特征 | 首次在单细胞分辨率下揭示了肺腺癌不同区域（核心、邻近核心、边缘）肿瘤细胞可塑性的空间异质性，并发现了与不良预后相关的生物标志物 | 研究仅基于单个肺腺癌病例的10个肿瘤片段，样本量较小，需要更大规模的研究进行验证 | 探究肺腺癌中肿瘤细胞可塑性（上皮-间质转化和干性）的空间分布及其预后相关性 | 肺腺癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CytoTRACE2, UCell, Scissor | 单细胞转录组数据 | 来自单个肺腺癌三个区域（核心、邻近核心、边缘）的10个肿瘤片段 | NA | 单细胞RNA-seq | SURFSeq 5000 | SURFSeq 5000平台 |
| 530 | 2025-12-27 |
PCK1 attenuates intrahepatic cholangiocarcinoma progression by suppressing lactate accumulation and PI3K-AKT signaling
2025-Dec-26, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01779-8
PMID:41449217
|
研究论文 | 本研究通过分析批量与单细胞RNA测序数据，鉴定出肝内胆管癌中与乳酸代谢相关的关键基因PCK1，并证实其通过抑制乳酸积累和PI3K-AKT信号通路发挥肿瘤抑制作用 | 首次系统鉴定肝内胆管癌中的乳酸代谢相关基因，发现PCK1作为新型肿瘤抑制因子，并阐明其通过同时调控乳酸积累和PI3K-AKT通路的多重抑癌机制 | 研究主要基于细胞和动物实验，临床样本验证相对有限；PCK1调控乳酸代谢与信号通路的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究乳酸代谢在肝内胆管癌进展中的作用，并寻找新的诊断标志物和治疗靶点 | 肝内胆管癌细胞系、动物模型及相关的基因表达数据 | 计算生物学与肿瘤学 | 肝内胆管癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、机器学习算法、体外细胞实验、体内动物实验 | 机器学习诊断模型（具体算法未明确）、列线图 | 基因表达数据（RNA-seq）、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及批量RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据、细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 531 | 2025-12-27 |
Characterization of Human Group 9 Innate Lymphoid Cells in Response to Allergen Immunotherapy in Patients With Allergic Rhinitis
2025-Dec-26, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70202
PMID:41451507
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研究论文 | 本研究首次报道了人类第9组先天淋巴样细胞（ILC9s）的存在，并描述了其在过敏性鼻炎患者中的特征及对过敏原免疫疗法的反应 | 首次发现并表征了ILC9s这一新的先天淋巴样细胞亚群，揭示了其与Th9细胞的对应关系及在过敏性疾病中的潜在作用 | 研究样本可能有限，且机制研究主要基于体外实验，体内验证不足 | 探索ILC9s在过敏性鼻炎中的作用及其作为过敏原免疫疗法潜在靶点的可能性 | 过敏性鼻炎患者及接受皮下免疫疗法患者的鼻黏膜组织和外周血单个核细胞 | 免疫学 | 过敏性鼻炎 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、qRT-PCR、siRNA敲低、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 过敏性鼻炎患者及免疫疗法患者的样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 532 | 2025-12-27 |
Sclerotic GVHD and scleroderma share dysregulated gene expression that is ameliorated by EREG therapeutic antibody
2025-Dec-25, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029836
PMID:40961242
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研究论文 | 本研究开发了一种全人源抗EREG中和抗体，用于治疗硬皮病和硬化性移植物抗宿主病，通过单细胞转录组学和空间转录组学分析揭示了其抗纤维化机制 | 开发了高亲和力和特异性的全人源抗EREG中和抗体，并首次在硬皮病、局限性硬皮病和硬化性GVHD中通过单细胞转录组学比较揭示了EREG通过驱动TNC产生促进纤维化的共同机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者皮肤外植体，缺乏大规模临床试验数据，且样本量有限 | 研究抗EREG抗体在治疗免疫驱动的纤维化皮肤疾病（如硬皮病和硬化性GVHD）中的疗效和机制 | 硬皮病/系统性硬化症、局限性硬皮病和硬化性移植物抗宿主病患者 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质数据 | 患者皮肤外植体（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 533 | 2025-12-27 |
CD177+ neutrophils drive extracellular matrix remodelling and HGF-alpha release in ALPPS-induced liver regeneration
2025-Dec-25, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336300
PMID:41390175
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了在ALPPS手术诱导的肝脏再生过程中，CD177+中性粒细胞通过促进内皮细胞迁移、细胞外基质降解和HGF-α释放来驱动肝脏再生的免疫学机制 | 首次在ALPPS临床队列和小鼠模型中，通过单细胞测序和功能验证，明确了CD177+中性粒细胞亚群在肝脏再生中的关键作用及其通过CD177-PECAM1互作和MMP9分泌的分子机制 | 研究主要基于手术后的肝脏组织样本，对于其他类型肝脏损伤或疾病中的中性粒细胞作用尚未验证，且临床样本量虽为最大队列但仍有限 | 阐明ALPPS手术后肝脏再生的免疫学机制，特别是中性粒细胞的作用 | ALPPS患者的残余肝组织、小鼠ALPPS模型、CD177+中性粒细胞 | 数字病理学 | 肝脏肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 流式细胞数据, 组织图像数据 | 世界最大的ALPPS临床队列患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 534 | 2025-12-27 |
TL1A-activated T cells remodel the rectal mucosa in patients with Crohn's disease with perianal fistulising disease
2025-Dec-25, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336246
PMID:41448881
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了克罗恩病伴肛周瘘管病患者直肠黏膜中TL1A激活的T细胞驱动的独特细胞和转录组改变 | 识别了TL1A-LTα1β2/IL-22轴作为肛周瘘管病特异性特征的新介导通路，该通路独立于TNF信号且在抗TNF治疗下仍保持活性 | 样本量较小（n=31），且研究主要基于直肠活检，可能无法完全代表瘘管部位的病理变化 | 探究克罗恩病肛周瘘管形成的驱动因素和分子机制 | 克罗恩病伴或不伴肛周瘘管病患者的直肠黏膜组织、外周CD3+ T细胞、肠道组织外植体、原代成纤维细胞和二维上皮单层细胞培养物 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 31例患者（克罗恩病伴或不伴肛周瘘管病） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2025-12-27 |
Targeting cancer stem cells enhances multikinase inhibitor therapy in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease-related hepatocellular carcinoma
2025-Dec-25, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336527
PMID:41448879
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研究论文 | 本研究通过表征代谢功能障碍相关脂肪性肝病相关肝细胞癌中的CD133+癌症干细胞，揭示了其在肿瘤发生和治疗反应中的关键作用，并提出了一种靶向CD133以增强多激酶抑制剂疗效的新策略 | 首次在MASLD-HCC中系统表征CD133+癌症干细胞的功能，揭示了CD133通过MYH9/β-catenin轴驱动肿瘤发生的机制，并开发了CD133-siRNA纳米颗粒联合多激酶抑制剂的新型治疗策略 | 临床样本量相对较小（n=29对），主要依赖临床前小鼠模型，人类样本的验证有待进一步扩展 | 阐明MASLD-HCC中癌症干细胞的身份、功能及其在肿瘤发生和治疗抵抗中的作用，并探索靶向CSCs的治疗策略 | 人类MASLD-HCC肿瘤组织、CD133+癌症干细胞、临床前小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 表达谱分析、体内遗传谱系追踪、单细胞RNA测序、质谱分析、siRNA纳米颗粒递送 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 29对（肿瘤与癌旁正常组织）人类MASLD-HCC样本，以及多个临床前小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2025-12-27 |
Multi-omics profiling reveals an immunosuppressive plasma cell subset within tertiary lymphoid structures in cervical cancer
2025-Dec-23, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04268-w
PMID:41432933
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了宫颈癌中三级淋巴结构内存在免疫抑制性浆细胞亚群 | 首次在宫颈癌中整合单细胞RNA测序、空间转录组学等多组学数据，鉴定出与免疫抑制相关的HSPA1B_PC浆细胞亚群，并发现其与三级淋巴结构中的免疫抑制性T细胞亚群空间共定位 | 研究主要基于观察性数据，功能验证实验有限，样本量相对较小，且未深入探讨浆细胞亚群的具体免疫抑制机制 | 探究宫颈癌肿瘤免疫微环境中B细胞（特别是浆细胞）的组成、转录状态及其在免疫抑制中的作用 | 宫颈癌患者组织样本中的B细胞和浆细胞亚群 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据, 免疫荧光图像 | 未明确具体样本数量，但涉及癌症和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 537 | 2025-12-27 |
Maternal acute SARS-CoV-2 infection impairs preimplantation embryo development and reprograms the early offspring hematopoietic system
2025-Dec-23, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00856-3
PMID:41436442
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研究论文 | 本研究探讨了母体急性SARS-CoV-2感染对胚胎植入前发育和子代早期造血系统的负面影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了感染母体来源的形态正常囊胚存在发育延迟，并发现母体急性感染诱导胚胎异常甲基化模式，以及子代造血干细胞功能改变 | 研究样本量有限，且长期子代免疫功能影响需进一步追踪验证 | 探究母体急性SARS-CoV-2感染对胚胎发育和子代造血健康的分子机制 | 感染SARS-CoV-2母体的胚胎、胎盘组织和脐带血细胞 | 生殖医学与免疫学 | SARS-CoV-2感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、全基因组DNA甲基化分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、甲基化数据 | 未明确具体样本数量，但涉及感染母体的胚胎、胎盘和脐带血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全基因组DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 538 | 2025-12-27 |
Single-cell transcriptomics reveals notch regulation in quiescent LEPR⁺ endometrial mesenchymal stem cells
2025-Dec-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04803-7
PMID:41437139
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了LEPR⁺子宫内膜间充质干细胞（eMSCs）作为原始、静止的干细胞亚群，并发现Notch信号通路在维持其干细胞特性和静止状态中起关键作用 | 首次在子宫内膜间充质干细胞中鉴定出LEPR⁺原始、静止亚群，并阐明Notch信号通路通过JAG1和DLL1维持其表型和静止状态 | 研究主要基于体外培养细胞和已发表的单细胞数据，体内功能验证可能有限，且样本来源和数量未明确说明 | 探究子宫内膜中更原始、静止的间充质干细胞亚群的身份和调控机制 | 人类子宫内膜间充质干细胞（eMSCs），特别是CD140b⁺CD146⁺培养细胞和LEPR⁺亚群 | 单细胞转录组学 | 子宫内膜再生相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2025-12-27 |
LONMF: a non-negative matrix factorization model based on graph Laplacian and optimal transmission for paired single-cell multi-omics data integration
2025-Dec-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06301-2
PMID:41437217
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图拉普拉斯和最优传输的非负矩阵分解模型LONMF，用于整合配对单细胞多组学数据 | LONMF结合图拉普拉斯和最优传输，提升了聚类性能和可解释性，在生物可解释性方面优于现有方法 | 未在摘要中明确提及 | 整合单细胞多组学数据以揭示细胞异质性并提供新的生物学视角 | 配对单细胞多组学数据，包括10X-multi-group、CITE-seq和TEA-multi-group seq | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 非负矩阵分解（NMF） | 单细胞多组学数据 | 未在摘要中明确提及 | 10x Genomics | 单细胞多组学 | 10X-multi-group | NA |
| 540 | 2025-12-27 |
HiSTaR: identifying spatial domains with hierarchical spatial transcriptomics variational autoencoder
2025-Dec-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07404-3
PMID:41437257
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研究论文 | 本文提出了一种名为HiSTaR的分层空间转录组学变分自编码器，用于从空间转录组学数据中捕获多级潜在特征，以识别空间域并校正批次效应 | HiSTaR采用多个分层块来捕获多级潜在特征，支持空间域识别、批次效应校正、轨迹分析和差异基因表达分析，无需外部工具即可整合多个组织切片 | NA | 开发一种计算工具以改进空间转录组学数据的分析，特别是空间域识别和批次效应校正 | 空间转录组学数据中的点（spots） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器（VAE） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |