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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-12-06 |
Prehabilitation during neoadjuvant chemotherapy results in an enhanced immune response in esophageal adenocarcinoma tumors: A randomized controlled trial
2025-Dec, Journal of sport and health science
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.jshs.2025.101063
PMID:40499717
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研究论文 | 本研究是一项随机对照试验,旨在探讨食管腺癌患者在新辅助化疗期间进行预康复运动训练是否能增强肿瘤的免疫反应 | 首次在食管腺癌患者中,通过随机对照试验设计,结合高分辨率多光谱免疫组化和空间转录组学技术,系统评估了预康复运动对肿瘤免疫微环境(特别是肿瘤浸润淋巴细胞和三级淋巴结构)的影响 | 样本量较小(n=22),且未观察到预康复组与对照组在生存率、治疗耐受性或肿瘤再分级等临床结局指标上存在显著差异 | 确定预康复运动训练是否能增加食管腺癌肿瘤中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 局部晚期食管腺癌患者 | 数字病理学 | 食管癌 | 高分辨率多光谱免疫组化,空间转录组学 | NA | 图像,转录组数据 | 22名局部晚期食管癌患者(预康复组11人,对照组11人) | NanoString | 空间转录组学 | NA | NanoString空间转录组学技术用于分析福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤组织 |
| 482 | 2025-12-06 |
A dynamic model for Waddington's landscape accounting for cell-to-cell communication
2025-Dec, Mathematical biosciences
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.mbs.2025.109537
PMID:40976482
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研究论文 | 本研究提出了一个考虑细胞间通讯的细胞成熟与发育动态模型,作为Waddington景观的扩展 | 首次在Waddington景观框架中整合细胞间通讯机制,通过偏微分方程与常微分方程耦合系统描述细胞状态依赖的配体产生与群体动态 | 模型验证主要基于单细胞转录组数据,尚未在更多实验体系或体内环境中进行广泛验证 | 建立包含细胞间通讯的细胞发育数学模型,更准确描述生物恢复过程 | 细胞成熟与发育过程,重点关注肠道隐窝干细胞再生和免疫细胞对LSP刺激的响应 | 计算生物学 | NA | 单细胞转录组学分析 | 偏微分方程与常微分方程耦合系统 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2025-12-06 |
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-Dec, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.09.034
PMID:41033583
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠回肠的综合单细胞图谱,揭示了上皮细胞和免疫细胞的异质性、营养代谢程序以及上皮-免疫互作 | 首次整合了小鼠回肠的上皮和免疫细胞单细胞图谱,发现了肠上皮细胞亚群在维生素A、类胡萝卜素和维生素B12吸收中的特异性功能,以及非经典杯状细胞中Bco2和Il18的共表达与脂肪酸代谢和应激反应的关联 | 研究仅基于8周龄雄性C57BL/6J小鼠,样本来源和年龄性别有限,未涵盖疾病模型或人类样本 | 绘制回肠细胞异质性图谱,定义上皮分化、营养代谢程序以及与健康和疾病相关的上皮-免疫相互作用 | 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 32,076个回肠细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 484 | 2025-12-06 |
Distinct senotypes in p16- and p21-positive cells across human and mouse aging tissues
2025-Dec, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00601-2
PMID:41162753
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研究论文 | 本研究通过分析人类和小鼠衰老组织的单细胞RNA测序数据,揭示了p21和p16阳性细胞在衰老过程中的异质性及其与衰老相关分泌表型(SASP)的关联 | 首次在体内系统比较了p21和p16作为衰老标志物的表达异质性,并发现它们在不同细胞类型和组织中缺乏共表达,且具有独立的轨迹动态 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 阐明p21和p16在细胞衰老过程中的个体角色及其与SASP的关系 | 人类和小鼠衰老组织中的细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | RNA velocity分析、伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 多个数据集,涵盖人类和小鼠的多种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2025-12-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune response dynamics and infection mechanisms in PRRSV-infected porcine alveolar macrophages
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148719
PMID:41192717
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PRRSV感染猪肺泡巨噬细胞的免疫应答动态和感染机制 | 首次在单细胞水平上揭示了PRRSV感染过程中猪肺泡巨噬细胞的转录异质性,并发现了CD16受体在病毒进入中的作用以及SPP1蛋白的抗病毒功能 | 研究基于体外感染模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本规模未明确说明,可能影响统计效力 | 探究PRRSV感染过程中宿主细胞的免疫应答机制和病毒感染动力学 | PRRSV感染的猪肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2025-12-06 |
Endothelial septin 4 reduction contributes to lipopolysaccharide-induced acute lung injury by disrupting endothelial barrier integrity and promoting infiltration of ISG+ cells
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148790
PMID:41207585
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞特异性SEPT4在脂多糖诱导的急性肺损伤中的作用机制 | 首次揭示了SEPT4在内皮屏障完整性中的关键作用及其缺失如何通过促进ISG+细胞浸润加剧急性肺损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类组织验证有限;机制研究尚未完全阐明SEPT4调控细胞骨架的具体分子通路 | 阐明内皮特异性SEPTs在急性肺损伤中的功能和分子机制 | 小鼠肺组织、内皮细胞、成纤维细胞 | 分子病理学 | 急性肺损伤 | scRNA-seq、条件性基因敲除、组织病理学分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、组织切片图像、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了基因敲除小鼠模型和scRNA-seq数据分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 487 | 2025-12-06 |
SIRT1 inhibits ferroptosis of granulosa cells in polycystic ovarian syndrome
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148931
PMID:41237881
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析与实验验证,探讨了铁死亡相关基因在PCOS中的作用,并发现SIRT1通过Nrf2去乙酰化抑制颗粒细胞铁死亡 | 首次将SIRT1与PCOS中的铁死亡联系起来,并通过scRNA-seq和分子对接揭示了SIRT1-Nrf2相互作用机制 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏大规模临床样本验证 | 探究铁死亡在PCOS发病机制中的作用,并寻找潜在治疗靶点 | 多囊卵巢综合征患者的颗粒细胞 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | scRNA-seq, 分子对接, 免疫共沉淀 | 机器学习 | 基因表达数据 | 基于GEO数据集的PCOS与对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 488 | 2025-12-06 |
ATP6V1E1 and NDUFB5 identified as potential biomarkers for Alzheimer's disease through integrative analysis
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148733
PMID:41242442
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研究论文 | 本研究通过整合分析阿尔茨海默病(AD)患者颞叶和外周血样本的差异表达基因,识别出ATP6V1E1和NDUFB5作为关键基因和潜在的AD风险因素,并验证了其诊断性能及在AD小鼠模型中的表达下调与病理相关性 | 首次通过整合分析识别ATP6V1E1和NDUFB5作为AD的潜在生物标志物,并揭示其在微胶质细胞中的表达与线粒体复合物I和V-ATP酶亚基的系统性下调,提示线粒体和溶酶体系统协同功能障碍在AD发病机制中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的直接验证,且未深入探讨这些基因作为治疗靶点的具体机制 | 识别与氧化磷酸化(OXPHOS)相关的AD生物标志物,以用于早期干预 | 阿尔茨海默病(AD)患者样本(颞叶和外周血)及AD小鼠模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Western blotting、多变量逻辑回归、LASSO回归 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | AD患者颞叶和外周血样本(具体数量未明确),两个独立队列验证,AD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2025-12-06 |
Eosinophils enhance granuloma-mediated control of persistent Salmonella infection in mice
2025-Dec, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02187-1
PMID:41272146
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研究论文 | 本文通过小鼠模型揭示了嗜酸性粒细胞在控制鼠伤寒沙门氏菌持续感染中的宿主保护作用 | 首次发现嗜酸性粒细胞通过CCL11依赖性招募和活化,在肉芽肿中调节巨噬细胞极化并限制沙门氏菌的利用 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究嗜酸性粒细胞在沙门氏菌持续感染控制中的作用机制 | 感染鼠伤寒沙门氏菌的小鼠模型,特别是肠系膜淋巴结中的肉芽肿 | 免疫学 | 沙门氏菌感染 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 490 | 2025-12-06 |
SUV39H2 is a vulnerability in glioblastoma stem cells enhanced by co-targeting SUV39H1
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2568366
PMID:41047764
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研究论文 | 本研究探讨了SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,并评估了同时靶向SUV39H2和SUV39H1对破坏干细胞维持的效果 | 发现SUV39H2是胶质母细胞瘤干细胞的新调控因子,且同时靶向SUV39H2和SUV39H1能更有效地破坏干细胞维持 | NA | 研究SUV39H2在胶质母细胞瘤干细胞中的作用,并评估同时靶向SUV39H2和SUV39H1的治疗潜力 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, western blot | NA | RNA-seq数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 491 | 2025-12-06 |
Human neural stem cell-derived exosomes promote functional recovery in subarachnoid hemorrhage via bdnf/trkb pathway activation and astrocyte modulation
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02155-0
PMID:41327445
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研究论文 | 本研究探讨了人神经干细胞来源的外泌体通过激活BDNF/TRKB通路和调节星形胶质细胞,在蛛网膜下腔出血模型中促进功能恢复的神经保护作用 | 首次利用单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了hNSC-exo通过BDNF/TRKB信号通路激活和星形胶质细胞调节发挥神经保护作用的分子机制 | 研究基于大鼠模型,临床转化潜力需进一步验证;未详细探讨外泌体的具体成分及其递送效率 | 探究人神经干细胞来源的外泌体在蛛网膜下腔出血中的神经保护潜力及其分子机制 | 大鼠蛛网膜下腔出血模型、人神经干细胞来源的外泌体 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及大鼠模型和体外实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 492 | 2025-12-06 |
Brain-derived neurotrophic factor supports pericyte and vascular homeostasis in the aging brain
2025-Dec-01, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02181-y
PMID:41327464
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研究论文 | 本研究揭示了脑源性神经营养因子(BDNF)通过激活Akt信号通路调节周细胞PDGFRβ表达,从而维持衰老大脑中周细胞和微血管稳态的机制 | 首次发现并证实了BDNF-TrkB信号通路在衰老大脑周细胞稳态和微血管完整性中的直接调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;对BDNF信号通路下游的具体分子机制探索尚不全面 | 探究BDNF在衰老大脑中维持周细胞和微血管稳态的调控机制 | 不同年龄段的C57BL/6J小鼠、条件性敲除Bdnf基因的C57BL/6小鼠、以及体外培养的周细胞系 | 神经生物学 | 衰老相关脑疾病 | 免疫染色、Western blot、流式细胞术、单细胞测序、转录组分析 | NA | 图像数据、蛋白质印迹数据、流式细胞数据、测序数据 | 使用不同年龄段的小鼠模型及体外培养的周细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 493 | 2025-12-06 |
Integration of single-cell and RNA-seq analysis reveals sepsis heterogeneity and prognostic significance of FCGR3A+ Macrophage subtypes
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102352
PMID:41332909
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和批量转录组数据,揭示了脓毒症免疫微环境异质性,并识别出FCGR3A+巨噬细胞亚型在预后中的关键作用 | 首次通过整合单细胞与批量转录组数据,系统分析了脓毒症的免疫微环境异质性,并发现FCGR3A+巨噬细胞亚型在预后中的核心作用 | 样本量相对有限,且未进行外部验证队列的独立验证 | 分析脓毒症的免疫微环境异质性并开发预后标志物 | 脓毒症患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | scVI算法, BayesPrism分析, StepCox + Ridge模型 | RNA测序数据 | 53个单细胞RNA测序样本和479个脓毒症患者的批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2025-12-06 |
Materiobiology in the omics era
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102539
PMID:41332940
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综述 | 本文综述了多组学技术在材料生物学中的应用,包括单细胞转录组学、转录组学、RNomics、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学、糖组学和免疫组学,并讨论了多组学策略如何支持骨类器官的构建 | 整合多种组学技术揭示细胞与生物材料相互作用的复杂调控机制,为下一代生物材料的理性设计提供理论基础和方法学 | NA | 探讨多组学技术在材料生物学中的应用,以推动精准和再生医学中的材料创新 | 细胞与生物材料的相互作用,以及骨类器官作为生理相关模型 | 材料生物学 | NA | 单细胞转录组学, 转录组学, RNomics, 基因组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 脂质组学, 糖组学, 免疫组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 495 | 2025-12-06 |
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052311
PMID:40899264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了HPV阳性口咽鳞状细胞癌的皮下和原位小鼠模型在免疫特征上的差异 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统比较了HPV阳性口咽鳞状细胞癌的皮下和原位小鼠模型的免疫动态,揭示了它们在模拟人类肿瘤不同免疫阶段的适用性 | 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类样本,且样本规模可能有限 | 评估HPV阳性口咽鳞状细胞癌小鼠模型在免疫特征上的代表性,以指导临床前免疫治疗研究 | HPV阳性口咽鳞状细胞癌的小鼠模型(皮下和原位) | 单细胞测序 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 496 | 2025-12-06 |
Considerations for Spatial Omics, Metabolite Analyses, and Tissue-Harvesting Artifacts
2025-Dec, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.70315
PMID:41347273
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评论 | 本文讨论了空间组学、代谢物分析和组织采集伪影的考虑因素,强调了在空间生物学新兴领域中组织准备的重要性 | 强调了在空间分子技术应用中,适当组织采集和酶失活方法以避免神经化学降解和伪影生成的创新点 | 未具体说明实验数据或样本量,主要基于理论讨论,缺乏实证验证 | 探讨空间生物学中新兴分析技术的应用,并强调组织准备在避免伪影中的关键作用 | 空间组学技术、代谢物分析、组织采集方法 | 空间生物学 | NA | 空间质谱成像、空间转录组学、激光显微切割、单细胞类型分析、NGS | NA | 空间分子数据、代谢物数据 | NA | NA | 空间质谱成像, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 497 | 2025-12-05 |
Spatial Myeloid Landscape of Large Artery Atherosclerotic and Cardioembolic Thrombi Retrieved by Mechanical Thrombectomy
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501658RR
PMID:41329022
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和免疫组化分析,比较了大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性血栓的免疫细胞组成和分子特征 | 首次在急性缺血性卒中的两种主要亚型中,结合空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了巨噬细胞和中性粒细胞在血栓形成中的特异性免疫血栓模式 | 样本量相对较小(空间转录组学分析仅8例,免疫组化分析35例),且未包括其他卒中病因亚型 | 探究大动脉粥样硬化性和心源性栓塞性卒中血栓中髓系细胞的分子特征和免疫血栓机制 | 接受血管内血栓切除术的急性缺血性卒中患者的血栓样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 免疫组化, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫组化图像, 单细胞RNA测序数据 | 42例急性缺血性卒中患者(其中8例LAA,27例CE),空间转录组学分析8例(4例LAA,4例CE),免疫组化分析35例(8例LAA,27例CE) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2025-12-05 |
Comparing great apes reveals human-specific ZEB2 roles in neural development
2025-Dec-04, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf318
PMID:41340546
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研究论文 | 本研究通过比较人类、黑猩猩和猩猩的ZEB2转录因子调控差异,揭示了人类特异性神经发育调控网络 | 首次在可控细胞系统中检测到跨物种ZEB2调控差异,并发现人类ZEB2调控更多神经发育相关基因,特别是非编码基因的富集 | 研究主要使用B淋巴细胞样细胞系作为模型,虽验证于脑类器官,但仍需更多直接神经组织验证 | 探究人类与其他灵长类在转录调控层面的进化差异 | 人类、黑猩猩、猩猩的B淋巴细胞样细胞及脑类器官数据 | 基因组学与进化生物学 | NA | 转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据 | 三种大猿物种的B淋巴细胞样细胞系(含生物学重复) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2025-12-05 |
Pericytes and Lung Vascular Remodeling
2025-Dec-04, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322518
PMID:41342143
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综述 | 本文综述了周细胞在肺血管重塑中的作用,特别是在肺动脉高压中的病理生物学机制 | 利用单细胞RNA测序技术识别了新的特异性周细胞标记物,揭示了周细胞亚型,并阐明了其在缺氧信号、TGF-β等机制下的表型转换 | 周细胞由于与其他壁细胞共享标记物和谱系关系,在单细胞数据集中存在识别重叠和代表性不足的问题 | 探讨周细胞在肺血管重塑和肺动脉高压病理生物学中的角色及潜在治疗靶点 | 周细胞(毛细血管壁细胞)及其在肺等器官中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 500 | 2025-12-05 |
Endothelial ADAR1 Deficit Induces the NOCT-IRF7 Axis in Pulmonary Hypertension
2025-Dec-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326277
PMID:41342206
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研究论文 | 本研究揭示了缺氧诱导的ADAR1缺乏通过上调NOCT表达,激活肺内皮细胞干扰素信号通路,导致细胞凋亡并促进肺动脉高压的发病机制 | 首次发现ADAR1通过RNA编辑调控NOCT基因表达,并建立了ADAR1-NOCT轴在肺动脉高压中的关键作用机制 | 研究主要基于体外细胞和动物模型,人类样本验证相对有限,且具体RNA编辑位点的功能机制需进一步阐明 | 阐明ADAR1依赖性RNA编辑在调控肺内皮细胞病理表型和肺动脉高压发病中的功能和靶点 | 肺内皮细胞、人类和小鼠肺动脉高压模型 | 分子生物学 | 肺动脉高压 | RNA测序、单细胞RNA测序、腺相关病毒表达 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据 | 人类肺动脉高压肺组织、缺氧PH小鼠模型、多种啮齿动物疾病模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |