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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-01-02 |
Cinobufagin Directly Targets PDE4D to Disrupt Fibroblast-Dendritic Cell Crosstalk in Atopic Dermatitis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501670
PMID:41059955
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PDE4D是特应性皮炎发病机制的关键调节因子,并鉴定出蟾毒灵作为其有效抑制剂,通过靶向PDE4D-cAMP/PKA/CREB通路破坏成纤维细胞-树突状细胞相互作用来改善疾病 | 首次将PDE4D确定为特应性皮炎的关键驱动因子和治疗靶点,并发现蟾毒灵作为新型PDE4D抑制剂,其疗效优于临床使用的其他PDE4抑制剂,且通过单细胞测序揭示了MIF信号通路在病变组织中的激活机制 | 研究主要在动物模型中进行,尚未在人体临床试验中验证蟾毒灵的疗效和安全性 | 探索特应性皮炎的新治疗靶点和治疗策略 | 特应性皮炎小鼠模型、病变组织、PDE4D基因敲除小鼠 | 单细胞组学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 482 | 2026-01-02 |
Spatial Transcriptomics and snRNA-seq Expose CAF Niches Orchestrating Dual Stromal-Immune Barriers in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514661
PMID:41057994
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研究论文 | 本研究整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了肝细胞癌中缺氧代谢性肌成纤维细胞在构建双重基质-免疫屏障中的核心作用 | 首次通过多模态方法鉴定hmmyCAFs作为物理免疫抑制、分子调控和代谢重塑的三重架构者,并明确其与临床预后的关联 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步功能实验验证hmmyCAFs的具体作用机制 | 探究肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞在免疫抑制微环境中的角色及其临床意义 | 肝细胞癌组织样本中的细胞群体,包括成纤维细胞、T_NK细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | RCTD算法 | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 483 | 2026-01-02 |
Erucic Acid, Derived by Lactobacillus Crispatus, Induces Ferroptosis in Cervical Cancer Organoids Through the PPAR-δ Signaling Pathway
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512599
PMID:41082335
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研究论文 | 本研究通过16S rRNA测序发现宫颈癌患者阴道微生物群中Lactobacillus crispatus的丰度差异,并揭示其代谢产物芥酸通过激活PPAR-δ信号通路诱导宫颈癌细胞铁死亡 | 首次发现Lactobacillus crispatus代谢产物芥酸作为PPARδ受体配体,通过激活PPAR-δ通路诱导宫颈癌细胞铁死亡,为宫颈癌治疗提供了新的辅助治疗策略 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床转化效果需进一步验证;微生物群与癌症相互作用的机制细节尚未完全阐明 | 探究阴道微生物群中Lactobacillus crispatus及其代谢产物在宫颈癌治疗中的作用机制 | 宫颈癌患者阴道微生物群、宫颈癌细胞、患者来源类器官(PDO)、宫颈癌异种移植(CDX)模型 | 微生物组学与癌症生物学 | 宫颈癌 | 16S rRNA测序、靶向细菌培养、非靶向代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 微生物组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 | 宫颈癌患者与健康个体的阴道微生物样本、患者来源类器官、细胞系及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 484 | 2026-01-01 |
Glycosylated IgG antibodies contribute to the recovery of haemorrhagic fever with renal syndrome patients
2025-Dec-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.106989
PMID:41460167
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析肾综合征出血热患者的B细胞亚群,结合超高效液相色谱检测IgG糖基化,揭示了IgG糖基化在汉坦病毒感染恢复中的关键作用 | 首次系统研究了肾综合征出血热患者中IgG抗体的糖基化特征,发现急性期患者抗体分泌记忆B细胞和浆母细胞显著扩增,并揭示了糖基化相关基因在特定B细胞亚群中的差异表达,为优化糖工程治疗抗体提供了新见解 | 样本来源仅限于外周血单核细胞,未涉及其他组织或体液;研究为观察性分析,缺乏直接的机制验证实验;糖基化分析的深度和广度可能受技术限制 | 探究肾综合征出血热患者中IgG抗体的糖基化特征及其在病毒感染恢复中的作用 | 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞及IgG抗体 | 免疫学 | 肾综合征出血热 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 酶联免疫吸附试验, 超高效液相色谱 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 色谱数据 | 肾综合征出血热患者的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 485 | 2026-01-01 |
Turncoat antibodies unmasked in a model of autoimmune demyelination: From biology to therapy
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424988122
PMID:41405856
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研究论文 | 本研究在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中发现了分泌自身抗体的卵泡外浆母细胞,并开发了一种合成抗体变体来中和致病性抗MOG抗体 | 首次在EAE模型中鉴定出分泌非亲和力成熟IgG抗体的卵泡外浆母细胞,并证明合成抗体8-18C5及其变体可阻断致病性抗体结合并减轻疾病严重程度 | 研究基于小鼠模型,结果在人类疾病中的直接应用需进一步验证 | 开发选择性中和自身抗体的疗法,以治疗自身免疫性疾病 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型及MOG抗体疾病患者 | NA | 自身免疫性脱髓鞘疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2026-01-01 |
Single-nucleus and spatial transcriptomics reveal the cell populations of intercalary meristems in bamboo
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511701122
PMID:41410774
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术,结合染色体水平基因组组装和高分辨率解剖图谱,揭示了竹子节间分生组织的细胞群体动态及其遗传基础 | 首次在竹子中整合单核RNA测序与空间转录组学,构建了节间分生组织的动态单核转录组连续体,并识别了关键的干细胞样亚群及其功能 | 研究主要基于毛竹,结果在其他单子叶植物中的普适性有待验证,且功能实验仅初步探索了特定基因的作用 | 理解单子叶植物节间分生组织的细胞群体动态、遗传基础及其在快速茎伸长中的作用 | 毛竹的节间分生组织及其相关细胞群体 | 植物发育生物学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位杂交, 超微结构成像 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 涉及毛竹节间分生组织的三个关键发育阶段(初始细胞分裂期、快速细胞分裂期、快速细胞伸长期) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 487 | 2026-01-01 |
Mapping Gene Impact on Single-cell Transcriptomic Networks via Perturbation Response Scanning
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694358
PMID:41473321
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞扰动影响指数(scPII)的数据驱动度量方法,用于量化基因扰动对系统层面的影响,无需依赖CRISPR筛选信息 | 将最初为蛋白质结构动力学开发的扰动响应框架应用于单细胞转录组网络,以识别最易受扰动的基因模块 | 未明确提及具体的技术或数据限制,但方法依赖于基因调控网络的准确性 | 开发一种量化基因扰动系统级影响的方法,以识别对细胞状态有最大全局影响的基因 | 单细胞转录组网络和基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 488 | 2026-01-01 |
Stem cell-based approach to identify regulatory TFs during mammalian cell differentiation
2025-Dec-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102716
PMID:41270744
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研究论文 | 本文开发了一种结合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR转录因子功能缺失筛选的方法,用于识别哺乳动物细胞分化过程中的关键转录因子 | 整合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR筛选,系统性识别脊髓运动神经元分化中的关键转录因子,并揭示小鼠与人类之间的调控保守性 | 方法主要针对脊髓运动神经元分化,在其他分化途径中的普适性有待进一步验证 | 识别哺乳动物细胞分化过程中关键的转录因子 | 小鼠和人类的脊髓运动神经元分化过程 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR筛选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 489 | 2026-01-01 |
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Dec, European journal of epidemiology
IF:7.7Q1
DOI:10.1007/s10654-025-01284-z
PMID:40906027
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研究论文 | 本研究通过前瞻性队列分析,探讨了血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险之间的关联 | 首次结合LASSO-COX和随机森林方法筛选代谢物,并构建代谢风险评分,同时联合生活方式因素评估结直肠癌风险 | 研究基于英国生物银行数据,可能受人群特异性限制,且代谢物测量为单时间点,无法反映动态变化 | 评估代谢物、代谢风险评分及其与生活方式因素的联合效应对结直肠癌风险的影响 | 英国生物银行中的82,514名参与者 | 代谢组学与流行病学 | 结直肠癌 | 血浆代谢物分析、单细胞RNA测序 | LASSO-COX、随机森林、Cox回归 | 代谢组数据、临床随访数据、单细胞RNA测序数据 | 82,514名参与者,其中1,151例结直肠癌病例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 490 | 2026-01-01 |
Distinct roles of Atf3, Zfp711 and Bcl6b in early embryonic hematopoietic and endothelial lineage specification
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204792
PMID:41200855
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术结合基因敲除,探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在小鼠胚胎干细胞早期造血和内皮谱系分化中的不同作用 | 首次在单细胞分辨率下系统研究Atf3、Zfp711和Bcl6b在早期胚胎造血发育中的功能,揭示了它们对谱系分化的特异性调控机制 | 研究基于体外小鼠胚胎干细胞分化模型,可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性;Bcl6b敲除未观察到明显表型,其功能需进一步探索 | 解析早期胚胎造血发育中转录因子的调控网络 | 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血和内皮谱系细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 未明确样本数量,使用体外分化的小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 491 | 2026-01-01 |
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052311
PMID:40899264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了皮下与舌根原位小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的差异 | 首次利用单细胞RNA测序系统比较了不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽癌免疫动态方面的准确性,并揭示了模型选择与免疫治疗反应预测的相关性 | 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类肿瘤样本的免疫特征,且样本量有限 | 评估不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的适用性 | HPV阳性口咽鳞状细胞癌的小鼠模型(皮下和舌根原位模型) | 单细胞测序 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2026-01-01 |
The mouse neonatal small intestine is regionally specialized for protein absorption and transepithelial transport
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205127
PMID:41208810
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠新生儿小肠中空肠与回肠肠上皮细胞在蛋白质吸收与跨上皮转运方面的区域特异性功能分工 | 首次通过体内外转运实验结合转录组学方法,系统阐明了新生儿小肠不同区段(空肠与回肠)肠上皮细胞在完整蛋白质转运与降解方面的功能分化及其分子基础 | 研究主要基于小鼠模型,人类新生儿肠道是否存在完全相同的机制仍需验证;Dab2条件性敲除对蛋白质转运的影响机制尚未完全解析 | 探究新生儿肠道蛋白质吸收的区域特异性机制及其分子调控网络 | 新生小鼠小肠肠上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、遗传学方法、体内外转运实验 | NA | 转录组数据、遗传数据、功能实验数据 | 新生小鼠肠道组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 493 | 2026-01-01 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验,揭示了ETV1作为肠道L细胞中PYY激素表达的关键转录调节因子 | 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1,揭示了L细胞谱系中特定激素的转录调控机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官实验,尚未在人体中验证;ETV1对PYY的调控作用较为有限 | 探究肠道L细胞中激素GLP-1和PYY的转录调控机制 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 494 | 2026-01-01 |
NETosis-Like Response Triggered by Extracellular Vesicle (EV)-Delivered Viral Nucleic Acid, a Novel Cellular Immune Mechanism in Crustacean
2025-Dec, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70210
PMID:41457043
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研究论文 | 本研究揭示了在甲壳动物中,细胞外囊泡递送病毒核酸触发NETosis样反应的新型细胞免疫机制 | 首次在甲壳动物中基于单细胞转录组学鉴定出中性粒细胞样细胞,并揭示了由EVs递送病毒核酸介导的新型NETosis诱导机制 | 研究主要聚焦于甲壳动物模型,机制在脊椎动物中的普适性尚未验证 | 探究甲壳动物中细胞外囊泡在病毒核酸递送和NETosis样免疫反应中的作用机制 | 泥蟹的血细胞(特别是中性粒细胞样细胞)和WSSV病毒 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 495 | 2026-01-01 |
A novel computational analysis integrating social determinants information from EHR and literature with Alzheimer's disease biological knowledge through large language models and knowledge graphs
2025-Dec, Innovation in aging
IF:4.9Q1
DOI:10.1093/geroni/igaf102
PMID:41458885
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研究论文 | 本研究利用大型语言模型和知识图谱整合电子健康记录与文献中的社会健康决定因素信息,通过图深度学习预测阿尔茨海默病相关生物网络中的链接 | 首次将社会健康决定因素与阿尔茨海默病生物知识通过知识图谱和大型语言模型进行整合,并利用图深度学习进行链接预测 | 研究主要基于现有文献和电子健康记录数据,可能受数据质量和覆盖范围的限制 | 探索社会健康决定因素对阿尔茨海默病的影响,并整合生物知识以增强疾病理解 | 阿尔茨海默病及相关痴呆症 | 自然语言处理 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | 图深度学习 | 文本、多模态生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 496 | 2025-12-31 |
Nanoplastics in Duckweed: Single-Cell Responses and Recovery
2025-Dec-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c15989
PMID:41400345
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、酶活性测定和铕掺杂纳米塑料示踪技术,全面探究了浮萍对聚苯乙烯纳米塑料在环境相关剂量和高剂量下的响应与恢复过程 | 首次在单细胞分辨率下揭示了浮萍对纳米塑料的细胞类型特异性响应机制,并整合纳米示踪技术量化了吸收与排泄过程 | 研究仅针对聚苯乙烯纳米塑料和浮萍模型,其他类型纳米塑料或水生植物的响应机制仍需进一步探究 | 阐明水生植物对纳米塑料污染的响应与恢复分子机制 | 浮萍(水生植物模型) | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学,酶活性测定,纳米示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据,酶活性数据,示踪定量数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) |
| 497 | 2025-12-31 |
Influenza A infection accelerates disease-associated microglia formation during physiological aging
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693336
PMID:41415465
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研究论文 | 本研究探讨了甲型流感病毒感染如何加速生理性衰老过程中疾病相关小胶质细胞的形成 | 首次揭示了非神经侵袭性流感肺炎可诱导大脑小胶质细胞的转录反应,驱动疾病相关小胶质细胞的过早扩增,并阐明了其代谢特征和空间分布模式 | 研究主要使用雄性小鼠模型,未考虑性别差异;人类样本分析仅限于中额回区域 | 探究流感感染对大脑免疫细胞(特别是小胶质细胞)在衰老过程中的影响机制 | 年轻、中年和老年雄性小鼠的大脑免疫细胞;正常老年人、超级老人和痴呆患者的中额回组织 | 神经免疫学 | 老年性疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 不同年龄段的雄性小鼠;人类中额回组织样本(包括正常老年人、超级老人和痴呆患者) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 498 | 2025-12-31 |
Multimodal analysis defines GNG4 as a distinguishing feature of germinal center-positioned CD4 T follicular helper cells in humans
2025-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693235
PMID:41427421
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞测序和空间转录组学,揭示了人类生发中心定位的CD4 T滤泡辅助细胞中GNG4作为区分特征的关键作用 | 首次结合trimodal单细胞测序和空间转录组学,将GNG4鉴定为人类生发中心内活化Tfh细胞的标志性特征,其特异性优于传统GC相关标记 | 研究主要基于扁桃体和外周血样本,可能未涵盖其他淋巴组织或疾病状态下的Tfh细胞异质性 | 阐明人类Tfh细胞的功能异质性及其在生发中心微环境中的分子特征 | 人类扁桃体和外周血中的CD4 T滤泡辅助细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | trimodal单细胞测序、光谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据(表观基因组、转录组、蛋白质组)及空间转录组数据 | 未明确样本数量,但涉及人类扁桃体和外周血样本 | NA | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 499 | 2025-12-31 |
Building dynamical models of multi-step state transitions from single cell gene expression trajectories
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693064
PMID:41415381
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为NetDes的计算方法,用于从单细胞基因表达轨迹中推断核心转录因子调控网络并构建基于ODE的动态模型 | NetDes整合了自上而下和自下而上的系统生物学方法,能够在一个动态模型中捕获顺序状态转换,相比现有方法具有优势 | 未在摘要中明确说明 | 研究多步细胞状态转换(如细胞分化和疾病进展)的调控机制 | 单细胞基因表达轨迹,包括人类iPSC分化过程中的时间序列scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | ODE-based dynamical models | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 500 | 2025-12-31 |
Heat-shock pathway activation by TRC051384 protects spiral ganglion neurons from noise-induced hearing loss
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693048
PMID:41415422
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和空间转录组学发现噪声暴露会诱导螺旋神经元及其支持细胞内质网伴侣和蛋白酶体亚基的短暂上调,并证实小分子化合物TRC051384可通过激活热休克转录因子Hsf1来保护螺旋神经元免受噪声性听力损失 | 首次在噪声性听力损失模型中揭示螺旋神经元的蛋白毒性应激是关键驱动因素,并发现激活HSF1是一种有前景的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人体验证;TRC051384的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究噪声性听力损失的分子机制并开发保护螺旋神经元的治疗策略 | 小鼠耳蜗螺旋神经元及其支持细胞 | 空间转录组学 | 噪声性听力损失 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |