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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2025-12-28
Immune involvement in neuropsychiatric disorders: Insights from single-cell transcriptomic studies
2025-Dec-27, Psychiatry and clinical neurosciences IF:5.0Q1
综述 本文综述了单细胞转录组学技术在神经精神疾病免疫机制研究中的应用与发现 整合单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,克服了批量RNA测序的平均化效应,揭示了多种神经精神疾病中的细胞类型特异性免疫改变 单细胞和单核RNA测序方法仍面临技术挑战,如细胞捕获效率、测序深度和数据分析复杂性 探讨免疫系统在神经精神疾病中的作用,并综述相关单细胞转录组学研究进展 精神疾病(如精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症、自闭症谱系障碍、注意力缺陷多动障碍)和神经系统疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病、路易体痴呆、多发性硬化症、抗NMDA受体脑炎) 数字病理学 神经精神疾病 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
482 2025-12-28
Non-parasite genome encoded virus-like RNAs reprogram the pathogenicity of human blood flukes
2025-Dec-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究发现了四种存在于日本血吸虫中的非寄生虫基因组编码的病毒样RNA,这些RNA在生殖细胞中富集,通过编码RNA依赖性RNA聚合酶调控胚胎活力和产卵,从而影响宿主病理 首次在人类血吸虫中鉴定出非寄生虫基因组编码的病毒样RNA,并揭示其通过RdRp调控生殖和生存的关键功能,为血吸虫病控制提供了新的潜在治疗靶点 研究主要聚焦于日本血吸虫和涡虫,其他寄生虫或生物中的ngRNA功能尚未探索,且机制细节需进一步验证 探究非寄生虫基因组编码RNA在寄生虫生物学中的作用,特别是其对病原性和生存的影响 日本血吸虫(Schistosoma japonicum)和涡虫(Dugesia japonica) 寄生虫学 血吸虫病 宏转录组学、单细胞RNA测序、RNA干扰、分子生物学方法 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
483 2025-12-28
Phosphodiesterase ENPP2, which is co-upregulated in obese and pregnant mice, is essential for islet beta cell compensation during obesity
2025-Dec-26, Diabetologia IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别了在肥胖和妊娠小鼠胰岛β细胞中共同上调的磷酸二酯酶ENPP2,并验证了其通过LPA-Akt/mTOR信号通路促进β细胞增殖、抑制凋亡和增强胰岛素分泌的关键作用 首次利用单细胞RNA测序比较肥胖和妊娠小鼠胰岛细胞的转录组,发现ENPP2作为共同上调基因,在β细胞补偿中起核心调节作用,并揭示了其通过LPA受体2介导的Akt/mTOR通路机制 研究主要基于小鼠模型,人类糖尿病样本中ENPP2表达降低的临床相关性及治疗潜力需进一步验证 识别能适度增强肥胖期间β细胞补偿能力的关键分子 饮食诱导肥胖小鼠、妊娠小鼠的胰岛细胞,Min6 β细胞系,以及Enpp2基因敲除和过表达转基因小鼠 单细胞组学 糖尿病 单细胞RNA-seq, 定量PCR, 免疫荧光 NA RNA表达数据 未明确指定样本数量,涉及多种小鼠模型和细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
484 2025-12-28
Coronary Artery Calcification: Decoding Mechanisms, Innovations, and Translational Strategies from Bench to Bedside
2025-Dec-26, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
综述 本文回顾了冠状动脉钙化(CAC)30年的研究进展,整合了病理机制、技术创新和临床证据,并探讨了从被动标志物到主动调控过程的认知转变 总结了单细胞测序揭示的CAC内膜与中膜亚型及其驱动通路(如BMP2/Smad、OPG/RANKL),并强调了血管内碎石术(IVL)和人工智能在影像分析中的创新应用 指出他汀类药物对钙化的双重效应、亚型诊断空白、以及先进工具(如IVL)在资源有限地区普及率低(>70%无法获得)等挑战 旨在综合CAC的病理机制、技术进展与临床管理策略,推动从被动治疗向主动血管健康优化的转变 冠状动脉钙化(CAC)及其相关的动脉粥样硬化病理过程 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序,人工智能影像分析 NA NA NA NA NA NA NA
485 2025-12-28
Decoding anoikis-related genes in lung adenocarcinoma brainmetastasis via single-cell RNA sequencing: CD44-mediated functions
2025-Dec-26, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解码了肺腺癌脑转移中失巢凋亡相关基因的作用,并验证了CD44的关键功能 首次在单细胞水平上系统分析了肺腺癌脑转移过程中失巢凋亡相关基因的表达变化和功能,并构建了基于批量RNA数据的预后模型 样本量相对较小(6个肺癌样本和6个脑转移样本),且为回顾性研究 探究失巢凋亡相关基因在肺腺癌脑转移进展中的作用 肺腺癌原发肿瘤组织和脑转移组织 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 预后模型 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据,临床生存数据 6个肺癌样本和6个脑转移样本(来自单细胞RNA测序数据集),外加用于验证的临床样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
486 2025-12-28
Identification of conserved canonical marker genes in human and mouse adrenal glands using Visium spatial transcriptomics
2025-Dec-24, Histochemistry and cell biology IF:2.1Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,全面绘制了成年人类和小鼠肾上腺的基因表达图谱,旨在鉴定跨物种保守的经典标记基因 首次在人类和小鼠肾上腺中系统性地整合空间转录组数据,揭示了一个定义肾上腺分区和功能的保守经典标记基因目录,并强调了小鼠模型在肾上腺研究中的转化价值 研究样本量有限(仅1例人类样本和4只小鼠),且人类和小鼠样本采用了不同的制备方法(OCT vs FFPE),可能影响直接比较 鉴定人类和小鼠肾上腺中保守的经典标记基因,以理解肾上腺组织的分子保守性和支持小鼠模型的转化研究 成年人类肾上腺(31岁女性)和成年小鼠肾上腺(10周龄雄性CD-1小鼠) 空间转录组学 NA 空间转录组学 无监督聚类 空间基因表达数据 1例人类肾上腺样本,4只小鼠肾上腺样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium NA
487 2025-12-28
Identification of coagulation-related hub genes in ischemic stroke based on bioinformatics integration analysis and investigation of their immune regulatory mechanisms
2025-Dec-24, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学整合分析,识别了缺血性脑卒中中与凝血相关的枢纽基因,并探讨了其免疫调控机制 结合多个数据集和机器学习模型筛选枢纽基因,并通过单细胞RNA-seq分析其在特定细胞簇中的表达定位 部分枢纽基因在独立数据集和RT-qPCR验证中表达趋势不完全一致,且样本量有限 探索凝血相关基因在缺血性脑卒中发病机制中的作用,并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 缺血性脑卒中患者样本及相关基因表达数据 生物信息学 缺血性脑卒中 生物信息学整合分析、机器学习、RT-qPCR、单细胞RNA-seq 随机森林、梯度提升决策树、支持向量机 基因表达数据 多个数据集(GSE16561、GSE9877、GSE58294、GSE224273)及临床样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
488 2025-12-28
Characterization of m6A-regulated targets and immune cells in dental caries: insights from multi-omics analysis
2025-Dec-24, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据,探讨了m6A相关遗传位点与龋齿之间的因果关系,并提供了龋齿的单细胞转录组图谱 首次结合m6A-QTL数据、GWAS数据和单细胞RNA测序数据,系统研究了m6A修饰在龋齿发病机制中的作用,并利用孟德尔随机化方法验证了免疫细胞特征与龋齿的因果关系 研究主要基于公开数据库和单细胞测序数据,样本量相对有限,且龋齿的病因复杂,其他环境因素和遗传因素可能未被完全考虑 探究m6A相关遗传变异与龋齿之间的因果关系,并分析龋齿中的免疫细胞特征 龋齿患者和健康个体的牙髓组织,以及相关的遗传位点和免疫细胞 多组学分析 龋齿 单细胞RNA测序、全基因组关联研究、孟德尔随机化、基因集富集分析 NA 遗传数据、单细胞转录组数据 单细胞RNA测序包含53,595个细胞;孟德尔随机化分析涉及161,113例病例和216,164例对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
489 2025-12-28
Single-cell transcriptomic landscape of keratinocyte transformation from actinic keratosis to skin carcinoma
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序揭示了从光化性角化病到皮肤鳞状细胞癌的角质形成细胞转化过程中的细胞和分子变化 首次在单细胞水平上描绘了皮肤鳞状细胞癌进展中角质形成细胞、T细胞和B细胞群体的动态重塑,并识别出一个关键的免疫调节通路IL-13/IL13RA1/IL4R信号轴 样本量相对有限(65,485个细胞),且仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 阐明皮肤鳞状细胞癌从正常皮肤到光化性角化病再到侵袭性癌的逐步进展过程中的细胞和分子事件 正常皮肤、光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌组织中的细胞 数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 65,485个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
490 2025-12-28
Astrocyte-Mediated Plasticity: Multi-Scale Mechanisms Linking Synaptic Dynamics to Learning and Memory
2025-Dec-05, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了星形胶质细胞通过多尺度机制调控突触动态、学习与记忆的作用 整合了超分辨成像、空间转录组学等新技术,提出了星形胶质细胞钙信号作为分布式记忆基质的理论框架 NA 阐明星形胶质细胞如何调控突触功能与记忆形成 星形胶质细胞、突触、神经环路 神经科学 神经精神疾病 超分辨成像、空间转录组学 神经元-星形胶质细胞联想记忆模型 图像、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
491 2025-12-28
The NF-κB Signalling Regulates the Abnormal Functions of Neutrophils in Severe Periodontal Disease
2025-Dec, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,探讨了中性粒细胞在重度牙周炎中的调控机制,特别是NF-κB信号通路的作用 利用单细胞RNA-seq和hdWGCNA技术,首次在重度牙周炎中性粒细胞中识别出Nrf2转录因子和NF-κB信号通路的激活,揭示了其在细胞间通讯中的关键作用 研究主要基于GEO数据库的转录组数据,样本来源和实验条件可能有限,未详细说明样本的具体临床背景或多样性 探索中性粒细胞在重度牙周炎中的调控机制,以理解其如何促进牙周炎症进展 重度牙周炎患者的中性粒细胞,特别是从牙龈组织中提取的细胞 数字病理学 牙周病 单细胞RNA-seq, bulk RNA转录组分析, 实时PCR, 共免疫染色 NA RNA-seq数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
492 2025-12-28
Fibroblast Ferroptosis Aggravates Inflammation Response in Dental Pulpitis
2025-Dec, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 本研究揭示了牙髓炎中成纤维细胞铁死亡与免疫病理之间的机制联系,为活髓保存提供了新的治疗策略见解 首次识别牙髓炎中成纤维细胞铁死亡的作用,并证明其抑制可减轻炎症反应 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,临床转化需进一步验证 探究铁死亡在牙髓炎中的功能意义,识别发生铁死亡的细胞类型,并为治疗策略提供新见解 人类牙髓组织、小鼠模型、牙髓成纤维细胞 数字病理学 牙髓炎 单细胞转录组测序、免疫荧光共定位、体外细胞培养 NA 转录组数据、图像数据 人类牙髓组织样本、小鼠模型、体外培养的牙髓成纤维细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
493 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过组织微阵列和Visium 10x空间RNA测序技术,分析了阿尔茨海默病相关血管病理中Aβ对血管的影响,并鉴定了Aβ特异性炎症血管特征 利用空间转录组学技术解析了CAA和ABRA患者血管中Aβ积累的差异,并首次在ABRA患者中发现了I型干扰素反应特征 样本量较小(仅16例脑活检样本),且研究主要基于组织微阵列,可能无法完全代表整体脑部病理变化 探究Aβ对血管的影响,寻找ARIA的新生物标志物和治疗方法 脑活检样本(包括对照、PCNVS、CAA和ABRA患者)以及ADNI队列的CSF蛋白质组学数据 数字病理学 阿尔茨海默病 组织微阵列、Visium 10x空间RNA测序、SOMAscan蛋白质组学 聚类分析、基因本体分析 空间转录组数据、组织病理学图像、蛋白质组学数据 16例脑活检样本(4对照、3 PCNVS、4 CAA、5 ABRA)和503例ADNI参与者CSF样本 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium Visium 10x空间RNA测序平台
494 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过整合单细胞核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了阿尔茨海默病中与L2/3神经元丢失相关的关键细胞间通讯机制 首次结合snRNA-Seq和空间转录组学,系统分析了阿尔茨海默病中L2/3神经元与胶质细胞(小胶质细胞和星形胶质细胞)的配体-受体相互作用,并发现APOE-LRP1等通路与pTau积累及神经元丢失相关 空间转录组学分析仅基于一名AD供体进行初步验证,样本量有限;相互作用机制尚未通过功能实验验证 探究阿尔茨海默病中非神经元细胞(小胶质细胞和星形胶质细胞)如何通过细胞间通讯影响L2/3神经元丢失 阿尔茨海默病患者颞下回脑组织中的L2/3神经元、小胶质细胞和星形胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞核RNA测序(snRNA-Seq),空间转录组学,细胞间通讯分析 LIANA(配体-受体分析框架) 单细胞基因表达数据,空间基因表达数据 32名供者(从正常衰老到重度AD病理的连续谱系)的颞下回脑组织样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
495 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
综述 本文探讨了阿尔茨海默病中非神经元细胞(星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞)的作用及其动态互作机制 聚焦于星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞之间的动态互作,特别是它们与神经元和少突胶质细胞的相互作用,以及这些互作在Aβ沉积、tau病理和脱髓鞘等关键病理特征中的调控作用 对星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞之间同时发生的互作机制(如炎症信号、代谢耦合或Aβ/tau传播)研究较少 揭示阿尔茨海默病中复杂的细胞互作网络,以识别新的治疗靶点 阿尔茨海默病中的非神经元细胞(星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞) 神经科学 阿尔茨海默病 空间转录组学、人工智能 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
496 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究结合iPSC细胞模型和功能基因组学,系统性地探索了阿尔茨海默病和多发性硬化症风险位点的因果基因 首次将iPSC衍生细胞模型与CRISPRi单细胞筛选相结合,系统性地扰动AD和MS风险SNP,揭示了新的风险基因如MAF和ELMO1 研究主要基于体外细胞模型,与体内环境的生理相关性仍需进一步验证 识别阿尔茨海默病和多发性硬化症风险位点的因果基因及其在神经免疫通路中的作用 iPSC衍生的神经祖细胞、兴奋性神经元、星形胶质细胞和小胶质细胞,以及原代人类脑细胞 功能基因组学 阿尔茨海默病, 多发性硬化症 RNA-seq, H3K27ac ChIP-seq, Promoter Capture Hi-C, CRISPRi, 单细胞RNA-seq iPSC细胞模型 基因组学数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
497 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文介绍了阿尔茨海默病知识门户(AD Knowledge Portal)作为一个数据共享平台的功能、资源规模、使用情况及其对阿尔茨海默病研究的推动作用 整合了来自14个NIH资助研究项目和97项资助的多元化数据资源,提供大规模多模态单细胞组学数据,并支持与云端分析平台的互操作性 NA 促进阿尔茨海默病研究数据的共享与再利用 人类和非人类(动物模型)的阿尔茨海默病相关数据 数字病理学 阿尔茨海默病 下一代测序,成像,行为数据分析 NA 基因组测序数据,影像数据,行为数据,单细胞组学数据 来自超过11,000个个体的数据 NA 单细胞组学,空间转录组学,下一代测序 NA NA
498 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序、遗传学、功能/物理测量、转录组学和代谢组学信息,提出了一个多组学框架,以表征阿尔茨海默病(AD)中遗传学支持的代谢物信号网络在特定细胞环境中的动态变化 开发了单细胞功能代谢物传感器通信(scFUMES)算法,用于在单细胞水平预测代谢感知谱,并系统揭示了循环代谢物介导的信号重编程网络 研究主要基于特定脑区域(如MTG和DLPFC)的数据,可能无法全面反映AD在所有脑区的代谢异质性,且scFUMES算法的泛化能力需进一步验证 旨在阐明AD中代谢信号动态如何以单细胞水平重编程细胞病理生物学,以理解代谢异质性和基于代谢的治疗开发 阿尔茨海默病患者和非AD对照的脑组织样本,重点关注神经元细胞、非神经细胞(如免疫细胞和少突胶质细胞) 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 遗传学分析, 转录组学, 代谢组学, Mendelian Randomization分析 scFUMES算法 单细胞RNA测序数据, 遗传数据, 功能/物理测量数据, 转录组数据, 代谢组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
499 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究开发了一种新型人源化APOE小鼠模型,以探究APOE4等位基因如何影响阿尔茨海默病中tau蛋白的局部传播 首次在APOE人源化小鼠模型中结合tau过表达,模拟AD早期tau蛋白的区域特异性传播,并揭示APOE基因型、性别和年龄对病理过程的交互影响 研究基于小鼠模型,可能无法完全复制人类AD的复杂性;样本量未明确说明;结果存在性别依赖性差异,需进一步验证 探究APOE4等位基因是否以局部方式改变阿尔茨海默病中tau蛋白的传播 人源化APOE小鼠模型(APOE3/3和APOE4/4基因型),包括雄性和雌性小鼠 神经科学 阿尔茨海默病 空间转录组学分析,体内和体外技术 小鼠疾病模型 基因表达数据,病理学数据,行为学数据 小鼠在三个时间点(5-7、15-17和25-27个月)被分析,具体数量未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
500 2025-12-28
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究使用Xenium空间转录组学技术,探讨外周炎症如何通过改变小胶质细胞的转录谱影响阿尔茨海默病模型中的Aβ和tau病理 首次结合单细胞多组学测序(Multiome)与空间转录组学,系统分析外周病毒感染诱导的炎症对小胶质细胞转录组的动态影响及其与神经退行性病变的关联 研究仅基于3xTg-AD小鼠模型,人类临床意义尚不明确;样本时间点有限(7天和2个月),长期效应需进一步验证 探究外周炎症是否通过改变小胶质细胞转录状态来影响阿尔茨海默病病理进程 3xTg-AD转基因小鼠的小胶质细胞、神经元和内皮细胞 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学、单细胞多组学测序(RNA-seq+ATAC-seq)、免疫染色、ELISA NA 空间转录组数据、单细胞转录组数据、表观遗传数据、蛋白质表达数据 3xTg-AD小鼠脑组织样本(感染后7天和2个月时间点) 10x Genomics 空间转录组学, 单细胞多组学测序 Xenium, 10x Chromium Xenium空间转录组学平台用于原位基因表达分析,10x Chromium系统用于单细胞多组学测序
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