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当前共找到 1157 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-01-01 |
Mapping Gene Impact on Single-cell Transcriptomic Networks via Perturbation Response Scanning
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694358
PMID:41473321
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞扰动影响指数（scPII）的数据驱动度量方法，用于量化基因扰动对系统层面的影响，无需依赖CRISPR筛选信息 | 将最初为蛋白质结构动力学开发的扰动响应框架应用于单细胞转录组网络，以识别最易受扰动的基因模块 | 未明确提及具体的技术或数据限制，但方法依赖于基因调控网络的准确性 | 开发一种量化基因扰动系统级影响的方法，以识别对细胞状态有最大全局影响的基因 | 单细胞转录组网络和基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2026-01-01 |
CrebA regulation of secretory capacity: genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Dec-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaf214
PMID:41052780
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研究论文 | 本研究通过DNA结合实验、表达分析和单细胞RNA测序，揭示了果蝇CrebA转录因子通过直接调控分泌途径组分基因来增强胚胎唾液腺的分泌能力，并探讨了其与哺乳动物同源蛋白的保守功能 | 首次结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究，系统评估CrebA在调控分泌能力中的作用，并利用单细胞RNA测序技术比较突变体与野生型样本，深入探索CrebA结合与基因调控的关系 | CrebA结合大量基因但仅调控部分，功能结合与非功能结合的区分机制尚不明确；CrebA是否在所有果蝇胚胎组织中驱动分泌途径组分基因表达或调控其他组织特异性功能仍需进一步研究 | 探究果蝇CrebA转录因子在增强分泌能力中的调控机制及其与哺乳动物同源蛋白的保守性 | 果蝇胚胎唾液腺及多种组织中的分泌途径组分基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、DNA结合实验、表达分析、结合位点诱变 | NA | 基因表达数据、DNA结合数据 | CrebA缺失突变胚胎与现有野生型样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 463 | 2026-01-01 |
Stem cell-based approach to identify regulatory TFs during mammalian cell differentiation
2025-Dec-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102716
PMID:41270744
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研究论文 | 本文开发了一种结合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR转录因子功能缺失筛选的方法，用于识别哺乳动物细胞分化过程中的关键转录因子 | 整合多能干细胞分化、单细胞转录组学和CRISPR筛选，系统性识别脊髓运动神经元分化中的关键转录因子，并揭示小鼠与人类之间的调控保守性 | 方法主要针对脊髓运动神经元分化，在其他分化途径中的普适性有待进一步验证 | 识别哺乳动物细胞分化过程中关键的转录因子 | 小鼠和人类的脊髓运动神经元分化过程 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR筛选 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 464 | 2026-01-01 |
Plasma metabolites, metabolic risk score and colorectal cancer risk: a prospective cohort study
2025-Dec, European journal of epidemiology
IF:7.7Q1
DOI:10.1007/s10654-025-01284-z
PMID:40906027
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研究论文 | 本研究通过前瞻性队列分析，探讨了血浆代谢物、代谢风险评分与结直肠癌风险之间的关联 | 首次结合LASSO-COX和随机森林方法筛选代谢物，并构建代谢风险评分，同时联合生活方式因素评估结直肠癌风险 | 研究基于英国生物银行数据，可能受人群特异性限制，且代谢物测量为单时间点，无法反映动态变化 | 评估代谢物、代谢风险评分及其与生活方式因素的联合效应对结直肠癌风险的影响 | 英国生物银行中的82,514名参与者 | 代谢组学与流行病学 | 结直肠癌 | 血浆代谢物分析、单细胞RNA测序 | LASSO-COX、随机森林、Cox回归 | 代谢组数据、临床随访数据、单细胞RNA测序数据 | 82,514名参与者，其中1,151例结直肠癌病例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2026-01-01 |
Distinct roles of Atf3, Zfp711 and Bcl6b in early embryonic hematopoietic and endothelial lineage specification
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204792
PMID:41200855
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术结合基因敲除，探讨了Atf3、Zfp711和Bcl6b三个转录因子在小鼠胚胎干细胞早期造血和内皮谱系分化中的不同作用 | 首次在单细胞分辨率下系统研究Atf3、Zfp711和Bcl6b在早期胚胎造血发育中的功能，揭示了它们对谱系分化的特异性调控机制 | 研究基于体外小鼠胚胎干细胞分化模型，可能无法完全模拟体内胚胎发育的复杂性；Bcl6b敲除未观察到明显表型，其功能需进一步探索 | 解析早期胚胎造血发育中转录因子的调控网络 | 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血和内皮谱系细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 未明确样本数量，使用体外分化的小鼠胚胎干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 466 | 2026-01-01 |
Immunological dynamics in orthotopic compared with subcutaneous murine models of HPV-positive oropharyngeal cancer
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052311
PMID:40899264
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术比较了皮下与舌根原位小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的差异 | 首次利用单细胞RNA测序系统比较了不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽癌免疫动态方面的准确性，并揭示了模型选择与免疫治疗反应预测的相关性 | 研究仅基于小鼠模型，未直接验证人类肿瘤样本的免疫特征，且样本量有限 | 评估不同小鼠模型在模拟HPV阳性口咽鳞状细胞癌免疫特征方面的适用性 | HPV阳性口咽鳞状细胞癌的小鼠模型（皮下和舌根原位模型） | 单细胞测序 | 口咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2026-01-01 |
The mouse neonatal small intestine is regionally specialized for protein absorption and transepithelial transport
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205127
PMID:41208810
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠新生儿小肠中空肠与回肠肠上皮细胞在蛋白质吸收与跨上皮转运方面的区域特异性功能分工 | 首次通过体内外转运实验结合转录组学方法，系统阐明了新生儿小肠不同区段（空肠与回肠）肠上皮细胞在完整蛋白质转运与降解方面的功能分化及其分子基础 | 研究主要基于小鼠模型，人类新生儿肠道是否存在完全相同的机制仍需验证；Dab2条件性敲除对蛋白质转运的影响机制尚未完全解析 | 探究新生儿肠道蛋白质吸收的区域特异性机制及其分子调控网络 | 新生小鼠小肠肠上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、遗传学方法、体内外转运实验 | NA | 转录组数据、遗传数据、功能实验数据 | 新生小鼠肠道组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2026-01-01 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验，揭示了ETV1作为肠道L细胞中PYY激素表达的关键转录调节因子 | 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1，揭示了L细胞谱系中特定激素的转录调控机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官实验，尚未在人体中验证；ETV1对PYY的调控作用较为有限 | 探究肠道L细胞中激素GLP-1和PYY的转录调控机制 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2026-01-01 |
NETosis-Like Response Triggered by Extracellular Vesicle (EV)-Delivered Viral Nucleic Acid, a Novel Cellular Immune Mechanism in Crustacean
2025-Dec, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70210
PMID:41457043
|
研究论文 | 本研究揭示了在甲壳动物中，细胞外囊泡递送病毒核酸触发NETosis样反应的新型细胞免疫机制 | 首次在甲壳动物中基于单细胞转录组学鉴定出中性粒细胞样细胞，并揭示了由EVs递送病毒核酸介导的新型NETosis诱导机制 | 研究主要聚焦于甲壳动物模型，机制在脊椎动物中的普适性尚未验证 | 探究甲壳动物中细胞外囊泡在病毒核酸递送和NETosis样免疫反应中的作用机制 | 泥蟹的血细胞（特别是中性粒细胞样细胞）和WSSV病毒 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 470 | 2026-01-01 |
High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70715
PMID:41457305
|
研究论文 | 本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达，进而激活YAP/β-catenin信号通路促进PDGF-BB分泌，最终通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路诱导血管平滑肌细胞表型转化，从而促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次阐明了内皮细胞机械敏感离子通道Piezo1在高剪切应力诱导颅内动脉瘤形成中的关键作用，并发现了PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路作为Piezo1下游效应器的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限；AAV2-BR1-Tie2-Cre介导的Piezo1条件性敲除可能存在脱靶效应 | 探究高剪切应力诱导颅内动脉瘤形成的分子机制，重点关注内皮细胞Piezo1通道在其中的作用 | 人类颅内动脉瘤样本、小鼠颅内动脉瘤模型、体外共培养的内皮细胞和血管平滑肌细胞 | 血管生物学与疾病机制研究 | 颅内动脉瘤 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、平行板流动腔系统、AAV介导的基因敲除、细胞共培养、受体-配体对分析 | 小鼠颅内动脉瘤模型、体外细胞共培养模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括人类IA样本、Piezo1flox/flox转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 471 | 2026-01-01 |
A novel computational analysis integrating social determinants information from EHR and literature with Alzheimer's disease biological knowledge through large language models and knowledge graphs
2025-Dec, Innovation in aging
IF:4.9Q1
DOI:10.1093/geroni/igaf102
PMID:41458885
|
研究论文 | 本研究利用大型语言模型和知识图谱整合电子健康记录与文献中的社会健康决定因素信息，通过图深度学习预测阿尔茨海默病相关生物网络中的链接 | 首次将社会健康决定因素与阿尔茨海默病生物知识通过知识图谱和大型语言模型进行整合，并利用图深度学习进行链接预测 | 研究主要基于现有文献和电子健康记录数据，可能受数据质量和覆盖范围的限制 | 探索社会健康决定因素对阿尔茨海默病的影响，并整合生物知识以增强疾病理解 | 阿尔茨海默病及相关痴呆症 | 自然语言处理 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | 图深度学习 | 文本、多模态生物数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-12-31 |
Nanoplastics in Duckweed: Single-Cell Responses and Recovery
2025-Dec-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c15989
PMID:41400345
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、酶活性测定和铕掺杂纳米塑料示踪技术，全面探究了浮萍对聚苯乙烯纳米塑料在环境相关剂量和高剂量下的响应与恢复过程 | 首次在单细胞分辨率下揭示了浮萍对纳米塑料的细胞类型特异性响应机制，并整合纳米示踪技术量化了吸收与排泄过程 | 研究仅针对聚苯乙烯纳米塑料和浮萍模型，其他类型纳米塑料或水生植物的响应机制仍需进一步探究 | 阐明水生植物对纳米塑料污染的响应与恢复分子机制 | 浮萍（水生植物模型） | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学，酶活性测定，纳米示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据，酶活性数据，示踪定量数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） |
| 473 | 2025-12-31 |
Influenza A infection accelerates disease-associated microglia formation during physiological aging
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693336
PMID:41415465
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研究论文 | 本研究探讨了甲型流感病毒感染如何加速生理性衰老过程中疾病相关小胶质细胞的形成 | 首次揭示了非神经侵袭性流感肺炎可诱导大脑小胶质细胞的转录反应，驱动疾病相关小胶质细胞的过早扩增，并阐明了其代谢特征和空间分布模式 | 研究主要使用雄性小鼠模型，未考虑性别差异；人类样本分析仅限于中额回区域 | 探究流感感染对大脑免疫细胞（特别是小胶质细胞）在衰老过程中的影响机制 | 年轻、中年和老年雄性小鼠的大脑免疫细胞；正常老年人、超级老人和痴呆患者的中额回组织 | 神经免疫学 | 老年性疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 不同年龄段的雄性小鼠；人类中额回组织样本（包括正常老年人、超级老人和痴呆患者） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-12-31 |
Multimodal analysis defines GNG4 as a distinguishing feature of germinal center-positioned CD4 T follicular helper cells in humans
2025-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693235
PMID:41427421
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞测序和空间转录组学，揭示了人类生发中心定位的CD4 T滤泡辅助细胞中GNG4作为区分特征的关键作用 | 首次结合trimodal单细胞测序和空间转录组学，将GNG4鉴定为人类生发中心内活化Tfh细胞的标志性特征，其特异性优于传统GC相关标记 | 研究主要基于扁桃体和外周血样本，可能未涵盖其他淋巴组织或疾病状态下的Tfh细胞异质性 | 阐明人类Tfh细胞的功能异质性及其在生发中心微环境中的分子特征 | 人类扁桃体和外周血中的CD4 T滤泡辅助细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | trimodal单细胞测序、光谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据（表观基因组、转录组、蛋白质组）及空间转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及人类扁桃体和外周血样本 | NA | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 475 | 2025-12-31 |
Building dynamical models of multi-step state transitions from single cell gene expression trajectories
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693064
PMID:41415381
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NetDes的计算方法，用于从单细胞基因表达轨迹中推断核心转录因子调控网络并构建基于ODE的动态模型 | NetDes整合了自上而下和自下而上的系统生物学方法，能够在一个动态模型中捕获顺序状态转换，相比现有方法具有优势 | 未在摘要中明确说明 | 研究多步细胞状态转换（如细胞分化和疾病进展）的调控机制 | 单细胞基因表达轨迹，包括人类iPSC分化过程中的时间序列scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ODE-based dynamical models | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 476 | 2025-12-31 |
Heat-shock pathway activation by TRC051384 protects spiral ganglion neurons from noise-induced hearing loss
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693048
PMID:41415422
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和空间转录组学发现噪声暴露会诱导螺旋神经元及其支持细胞内质网伴侣和蛋白酶体亚基的短暂上调，并证实小分子化合物TRC051384可通过激活热休克转录因子Hsf1来保护螺旋神经元免受噪声性听力损失 | 首次在噪声性听力损失模型中揭示螺旋神经元的蛋白毒性应激是关键驱动因素，并发现激活HSF1是一种有前景的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；TRC051384的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究噪声性听力损失的分子机制并开发保护螺旋神经元的治疗策略 | 小鼠耳蜗螺旋神经元及其支持细胞 | 空间转录组学 | 噪声性听力损失 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
| 477 | 2025-12-31 |
Plasma cell identity escape drives resistance to anti-BCMA T-cell-redirecting therapy in multiple myeloma
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692978
PMID:41415462
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研究论文 | 本文通过全基因组测序和单细胞RNA测序，揭示了多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的T细胞重定向疗法产生原发性耐药的细胞和分子机制，包括基因组复杂性和浆细胞身份逃逸现象 | 首次提出“浆细胞身份逃逸”概念，并发现其与高增殖特征、BCMA表达降低及CD8 T细胞免疫失调相关，通过临床队列和临床前模型验证了这些机制 | 研究样本量相对有限（102例复发患者），且主要关注原发性耐药，对继发性耐药机制探讨不足，临床前模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的CAR-T和T细胞衔接子疗法产生原发性耐药的机制 | 接受抗BCMA CAR-T或T细胞衔接子治疗的复发多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 102例复发多发性骨髓瘤患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-12-31 |
OddSNP: a predictive framework for optimizing multiplexed single-cell RNA-seq experiments
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692882
PMID:41415468
|
研究论文 | 开发了一个名为OddSNP的预测框架，用于优化多重单细胞RNA测序实验的设计 | 提出了SNP-信息含量（SNP-IC）这一可量化的新指标，能够基于简单的未混合先导数据准确预测基于基因型的分型成功率 | 未明确说明该框架在不同组织类型或疾病模型中的普适性验证情况 | 为单细胞RNA测序中的供体多重实验提供可靠的实验设计指导 | 干细胞和类器官模型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 基因型数据、测序数据 | 多个大规模数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 479 | 2025-12-31 |
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66229-2
PMID:41365874
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研究论文 | 本文探讨了早期皮肤定居调节性T细胞（ETregs）在新生儿皮肤中通过调控PPARγ信号通路，促进毛囊黑素干细胞介导的皮肤色素沉着的作用 | 首次揭示了ETregs在出生后第一周内对皮肤色素沉着的关键调控作用，并明确了PPARγ信号通路在此过程中的核心地位 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来源于对白癜风患者的单细胞转录组分析，需要进一步验证ETregs在人类皮肤发育中的具体机制 | 探究早期皮肤定居调节性T细胞（ETregs）在新生儿皮肤发育中对色素沉着的调控机制 | 小鼠新生儿皮肤组织、人类白癜风患者皮肤组织 | 免疫学与皮肤生物学 | 白癜风 | 单细胞转录组分析、转录组学分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2025-12-31 |
Copula modeling of gene coexpression in single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692380
PMID:41415412
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研究论文 | 本文评估了六种Copula模型在单细胞RNA测序数据中模拟基因共表达的能力，发现高斯Copula在准确性和速度之间提供了最佳平衡 | 首次系统评估Copula模型在scRNA-seq数据中模拟基因共表达的应用，比较了不同模型的准确性和效率 | Vine Copula虽具高准确性潜力，但当前实现无法扩展到典型scRNA-seq数据集的大规模 | 开发准确的统计模型来模拟单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Copula模型（包括高斯Copula、Vine Copula等） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |