本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-01-05 |
Plasma apolipoprotein E protein attenuates pulmonary fibrosis through LRP1 and PLAU dual receptor-mediated TGF-β/Smad inhibition
2025-Dec-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.045
PMID:41475664
|
研究论文 | 本研究揭示了血浆载脂蛋白E(apoE)通过双重受体LRP1和PLAU抑制TGF-β/Smad信号通路,从而减轻肺纤维化的新机制,并提出了LXR激动剂RGX-104作为潜在治疗策略 | 首次发现血浆apoE是肺纤维化的因果性保护因子,并阐明其通过LRP1和PLAU双重受体协同作用抑制TGF-β/Smad信号通路的新机制;利用CRISPR工程APOE缺陷犬模型和单细胞转录组学等技术进行跨物种验证和机制解析 | 研究主要基于动物模型和体外实验,其临床转化效果和长期安全性仍需进一步的人体临床试验验证 | 识别肺纤维化的新治疗靶点并阐明血浆apoE减轻该疾病的机制 | 特发性肺纤维化(IPF) | NA | 肺纤维化 | 整合荟萃分析、双样本孟德尔随机化、CRISPR基因编辑、单细胞转录组学、SPIDER技术、表面等离子体共振(SPR) | NA | 血浆队列数据、基因数据、转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 七个血浆队列(具体样本数未明确)、APOE缺陷犬、Apoe‒/‒小鼠、人精准切割肺切片 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2026-01-05 |
Expression patterns and clinical implications of chaperonin subunit 3 mRNA and protein in laryngeal squamous cell carcinoma
2025-Dec-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i12.112161
PMID:41480162
|
研究论文 | 本研究探讨了伴侣蛋白亚基3(CCT3)在喉鳞状细胞癌(LSCC)中的表达模式、临床意义及其对癌细胞生长的影响 | 首次通过整合多数据库mRNA表达数据、单细胞RNA-seq验证、免疫组化分析及CRISPR基因敲除功能实验,系统揭示了CCT3在LSCC中的致癌作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 临床样本量相对有限(88例免疫组化样本),且临床参数亚组分析未发现显著差异,需更大规模队列验证 | 探究CCT3在喉鳞状细胞癌中的表达特征、临床相关性及其对癌细胞生长的调控机制 | 喉鳞状细胞癌(LSCC)组织样本(269例mRNA数据、88例蛋白数据)及LSCC细胞系 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA-seq, 免疫组化, CRISPR基因敲除, 基因集富集分析, 蛋白质相互作用网络构建 | NA | mRNA表达数据, 单细胞RNA-seq数据, 免疫组化图像数据 | 269例LSCC组织(mRNA数据), 88例临床样本(30例LSCC vs 58例非LSCC,蛋白数据) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2026-01-05 |
Predictive markers for the efficacy of CAR T-cell therapy: the interplay between CAR T-cell fitness and systemic immunity
2025-Dec-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017873
PMID:41061151
|
综述 | 本文探讨了CAR T细胞疗法疗效的预测标志物,重点关注CAR T细胞适应性与系统性免疫之间的相互作用 | 整合了单细胞转录组学、蛋白质组学分析和细胞因子多功能性检测等新兴技术,结合机器学习方法,用于识别预测性生物标志物并优化治疗策略 | NA | 识别和优化CAR T细胞疗法的预测性生物标志物,以改善患者分层和治疗效果 | CAR T细胞疗法在复发或难治性淋巴恶性肿瘤患者中的应用 | 机器学习 | 淋巴恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质组学分析、细胞因子多功能性检测 | 机器学习 | 转录组、蛋白质组、细胞因子数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2026-01-05 |
Guardians within: Cross-talk between the gut microbiome and host immune system
2025-Dec-22, World journal of gastrointestinal pathophysiology
DOI:10.4291/wjgp.v16.i4.111245
PMID:41479870
|
综述 | 本文综述了肠道微生物群与宿主免疫系统之间的复杂互作,探讨了微生物如何影响免疫细胞分化、调节炎症反应并维持免疫稳态 | 整合了宏基因组学、代谢组学和单细胞测序等最新技术进展,深入揭示了微生物-免疫轴的作用机制,为基于微生物组的治疗策略开辟了新途径 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且微生物-免疫互作的因果机制仍需进一步实验验证 | 探讨肠道微生物群与宿主免疫系统之间的互作关系及其在健康和疾病中的作用 | 肠道微生物群、宿主免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、自然杀伤细胞、先天淋巴细胞、T细胞、B细胞)及其代谢产物(如短链脂肪酸) | NA | 自身免疫性疾病、炎症性疾病、癌症 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2026-01-04 |
Identifying vascular stiffening-sensitive macrophages through integration of single-cell transcriptomics and imaging flow cytometry
2025-Dec-31, Biophysics reports
DOI:10.52601/bpr.2025.240063
PMID:41477484
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和成像流式细胞术,识别了在血管硬化过程中对细胞外基质刚度敏感的SPP1+巨噬细胞亚群 | 首次结合单细胞转录组学与成像流式细胞术,在动脉硬化模型中系统性地识别并验证了SPP1+巨噬细胞是对细胞外基质刚度敏感的特定免疫细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型和体外培养系统,在人体样本中的验证尚不充分,且未深入探讨SPP1+巨噬细胞促进血管硬化的具体分子机制 | 旨在识别在心血管疾病中响应动脉硬化的特定免疫细胞成分和关键因子 | 硬化颈动脉斑块中的免疫细胞、不同刚度聚丙烯酰胺凝胶上培养的巨噬细胞、急性钙化小鼠模型中的血管组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,成像流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2026-01-04 |
A competition model of multilineage priming and cell-fate decisions
2025-Dec-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116690
PMID:41481416
|
综述 | 本文综述了多谱系启动和细胞命运决策的竞争模型,探讨了祖细胞如何通过基因表达程序的竞争产生多样化的细胞命运 | 提出了集体多能性作为群体自我调节以平衡胚胎发育中所有下游命运产生的新兴状态,并整合了诱导性发育与自主性命运选择模式 | NA | 探讨祖细胞和干细胞如何通过多谱系启动和基因表达程序的竞争性相互作用产生多样化的细胞命运 | 祖细胞、干细胞及其在胚胎发育中的命运决策过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、克隆谱系追踪、多组学整合 | 竞争模型 | 转录组数据、谱系数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 407 | 2026-01-04 |
Epidermal resident memory T cell fitness requires antigen encounter in the skin
2025-Dec-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.107096
PMID:41468295
|
研究论文 | 本文研究了表皮驻留记忆T细胞(T)的适应性,发现其在皮肤中遭遇抗原的经历能增强其持久性和增殖能力 | 揭示了抗原在表皮中的遭遇如何通过TGFβ信号通路增强T细胞的持久性和增殖能力,并识别了TGFβRIII的关键作用 | NA | 探讨表皮驻留记忆T细胞适应性的机制,特别是抗原遭遇对其持久性和功能的影响 | 表皮驻留记忆T细胞(T) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2026-01-04 |
Quantum Generative Modeling of Single-Cell transcriptomes: Capturing Gene-Gene and Cell-Cell Interactions
2025-Dec-19, ArXiv
PMID:41281198
|
研究论文 | 本文提出了一种基于量子计算的单细胞转录组模拟器qSimCells,利用量子纠缠同时建模基因-基因和细胞-细胞相互作用 | 首次引入量子计算框架,通过参数化量子电路和CNOT门编码非线性基因调控网络和具有明确因果方向的细胞间通讯拓扑,克服了经典方法仅依赖线性相关的局限 | 未明确说明模拟数据规模与真实数据的定量对比指标,且量子计算硬件依赖可能限制实际应用 | 开发能够捕获单细胞转录组数据中非线性依赖关系的高保真模拟方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 量子生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2026-01-04 |
Temporal single-cell analysis reveals age-associated delay in immune resolution after respiratory viral infection
2025-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.15.694321
PMID:41446064
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术,比较了年轻和老年小鼠在流感病毒感染后的肺部免疫反应,揭示了老年宿主中干扰素信号通路异常导致免疫细胞持续存在和慢性免疫病理的机制 | 首次在老年宿主中系统性地结合时间序列单细胞分析,识别出干扰素α/γ信号通路在单核细胞来源巨噬细胞和间质巨噬细胞亚群中的关键作用,并证明抑制该通路可改善长期呼吸结局 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;且主要关注肺部免疫,未全面评估全身性免疫反应 | 阐明老年宿主在急性呼吸道病毒感染后免疫病理增强和肺修复延迟的免疫决定因素 | 年轻和老年小鼠的肺部组织 | 数字病理学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 年轻和老年小鼠的肺部样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-01-04 |
Host Genetic Architecture between Epstein-Barr Virus Activity and Multiple Sclerosis Reveals Shared Pathways
2025-Dec-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2025.12.11.25342083
PMID:41445616
|
研究论文 | 本研究通过开发从全基因组测序数据量化EBV DNA的流程,进行了跨祖先的EBV DNA阳性全基因组关联研究,揭示了EBV活动与多发性硬化症风险之间的遗传和细胞联系 | 开发了从全基因组测序数据量化EBV DNA的新流程,并首次在人群规模队列中进行了跨祖先的EBV DNA阳性GWAS,同时建立了优化的单细胞RNA-seq方法用于EBV检测 | 未明确说明样本的具体临床特征或随访时间,且独立验证队列样本量较小(n=94) | 阐明EBV活动与多发性硬化症之间的宿主遗传机制和细胞通路 | EBV感染、多发性硬化症、宿主遗传变异、B细胞 | 基因组学 | 多发性硬化症 | 全基因组测序、GWAS、qPCR、单细胞RNA-seq、孟德尔随机化分析 | 多基因风险评分、孟德尔随机化 | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 617,186名个体(GWAS),94名个体(独立验证队列),以及MS患者和健康个体的单细胞样本 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2026-01-04 |
MisTIC: Missegmented Transcript Inference Correction for Improved Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Dec-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693759
PMID:41446065
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MisTIC的变分贝叶斯模型,用于校正空间转录组学数据中的转录本错误分配问题,以提高分析准确性 | MisTIC模型无需重新分割细胞,即可有效校正转录本错误分配,从而提升下游分析的精度并支持新的研究视角 | NA | 开发一种校正空间转录组学数据中转录本错误分配的方法,以改善细胞类型识别、差异表达分析和细胞间通讯检测 | 空间转录组学数据中的转录本分配错误 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 变分贝叶斯模型 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学 | 10X Xenium, MERSCOPE, CosMx | NA |
| 412 | 2026-01-04 |
SEEK-VEC: Robust Latent Structure Discovery via Ensemble Topic Modeling
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.12.693799
PMID:41427368
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SEEK-VEC的集成框架,用于通过主题建模发现计数数据中的潜在结构 | SEEK-VEC通过集成多个候选主题模型,利用谱集成程序自动强化信号并减轻噪声,生成数据的共识低维嵌入,从而在信号弱时优于现有方法 | NA | 开发一个鲁棒的集成框架,用于在计数数据中检测潜在结构,以克服标准主题建模方法的限制 | 计数数据,包括自报告的心理病理症状数据、食物偏好问卷和单细胞转录组学数据 | 机器学习 | NA | 主题建模 | 集成主题模型 | 计数数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2026-01-04 |
Spatiotemporal Atlas of Heart Development Reveals Blood-Flow-Dependent Cellular, Structural, Metabolic, and Spatial Remodeling
2025-Dec-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693024
PMID:41427371
|
研究论文 | 本研究通过扰动鸡胚胎心脏血流,结合单细胞和空间转录组学,构建了血流依赖的心脏发育时空图谱,揭示了血流力学如何重塑心脏组织的细胞、结构和代谢特征 | 首次在胚胎心脏发育中系统整合血流力学扰动与高分辨率空间转录组学,揭示了血流依赖的跨尺度(分子、细胞、结构)重塑机制,并识别了LOX表达心肌细胞等新的血流敏感细胞状态 | 研究基于鸡胚胎模型,其结论在哺乳动物或人类中的普适性需进一步验证;空间转录组分辨率虽高但仍存在技术限制 | 探究血流力学如何调控胚胎心脏的细胞程序、组织结构和代谢适应,阐明血流依赖的发育重塑机制 | 鸡胚胎心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-01-04 |
Riemannian Metric Learning for Alignment of Spatial Multiomics
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.09.693237
PMID:41427348
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Manifold Gromov-Wasserstein (MGW)的度量学习框架,用于对齐空间多组学数据中的异构模态 | MGW框架利用神经场推断模态特定的黎曼度量,并通过Gromov-Wasserstein最优传输对齐这些度量,实现了无需超参数的成本计算,并具有理论不变性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够对齐空间多组学数据中不同模态的方法 | 空间多组学数据,包括转录组、表观基因组、蛋白质组和代谢组等 | 机器学习 | 结直肠癌、肾癌 | 空间转录组学、空间代谢组学 | 神经场 | 空间多模态数据 | 数千个细胞 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 415 | 2026-01-03 |
Single-cell RNA-seq analysis of longitudinal CD4+ T cell samples reveals cell-type-specific changes during early stages of type 1 diabetes
2025-Dec-29, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01574-x
PMID:41462339
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了1型糖尿病早期阶段CD4+ T细胞中细胞类型特异性的转录变化和基因调控网络 | 首次对1型糖尿病早期阶段的CD4+ T细胞进行纵向单细胞转录组分析,识别了与疾病进展相关的细胞类型特异性基因表达模式和调控网络变化 | 样本量相对较小(N=22),且仅关注CD4+ T细胞,未涵盖其他免疫细胞类型 | 探究1型糖尿病早期阶段CD4+ T细胞的转录组变化和基因调控网络,以理解早期免疫失调机制 | 来自后续发展为1型糖尿病的儿童(N=11)及其匹配对照(N=11)的纵向CD4+ T细胞样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 73个纵向CD4+ T细胞样本,来自22名儿童(11名病例,11名对照),分析超过99,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-01-03 |
Centromere Protein I, a Cell Cycle Checkpoint Gene, Accelerates Tumor Progression via the Hippo Pathway and Mediates Immune Escape in Hepatocellular Carcinoma
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00127
PMID:41473255
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后意义,并揭示了CENPI通过Hippo通路促进肿瘤进展及免疫逃逸的机制 | 首次将CENPI鉴定为肝细胞癌的关键枢纽基因,阐明其通过抑制YAP磷酸化增强核转位驱动恶性进展,并揭示其通过破坏肿瘤抗原呈递和趋化因子介导的CD8+ T细胞趋化作用促进免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,临床样本验证和体内机制深度探索有待加强,免疫逃逸机制的具体信号通路细节需进一步阐明 | 探索细胞周期检查点相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其促进肿瘤进展的分子机制 | 肝细胞癌患者数据集、HCC细胞系、动物模型及患者来源的HCC组织标本 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、体外功能实验、动物实验 | 预后模型(Kaplan-Meier、nomogram、决策曲线分析、ROC分析) | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床病理数据 | 来自TCGA和ICGC的HCC数据集、GSE149614单细胞RNA测序数据、患者来源的HCC标本及细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2026-01-03 |
PDK4 Regulates Inflammatory Injury in Acute-on-chronic Liver Failure by Phosphorylating STAT1-mediated M1 Polarization of Macrophages
2025-Dec-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2025.00343
PMID:41473257
|
研究论文 | 本研究探讨了丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)在慢加急性肝衰竭(ACLF)中通过磷酸化STAT1介导巨噬细胞M1极化来调节炎症损伤的作用机制 | 首次揭示了PDK4在ACLF中作为关键促炎调节因子,通过激活STAT1信号通路促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床验证尚不充分,且PDK4抑制剂的具体临床应用潜力需进一步评估 | 探究PDK4在ACLF中的作用机制,以寻找调节巨噬细胞功能、缓解ACLF进展的治疗靶点 | 健康与ACLF肝组织、ACLF患者外周血单个核细胞、LO2肝细胞、ACLF小鼠模型 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序、转录组学分析、体外实验、体内验证 | NA | RNA测序数据、转录组数据 | 来自数据库的单细胞RNA测序数据、ACLF患者外周血单个核细胞转录组数据(GSE168048)、体外细胞实验、ACLF小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2026-01-03 |
Single-cell analysis identifies inflammatory and tissue remodeling tumor-associated macrophages distinct from M1/M2 paradigm
2025-Dec-26, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf176
PMID:41347255
|
研究论文 | 本文通过整合分析公开的单细胞RNA测序数据,识别了乳腺癌中七种与M1/M2范式不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群,揭示了其功能异质性 | 首次在单细胞水平上系统识别了乳腺癌中七种转录特征不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群,这些亚群不遵循传统的M1/M2极化分类,并发现了与组织修复和干扰素反应相关的独特功能特征 | 研究主要基于公开数据集进行生物信息学分析,实验验证部分仅在小规模墨西哥患者队列中进行初步验证,样本代表性可能有限 | 深入表征乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性,探索其功能亚群与患者预后的关系 | 乳腺癌患者及健康个体的血液、肿瘤和非肿瘤乳腺组织中的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学整合分析 | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库的多个乳腺癌患者和健康个体样本,具体数量未明确说明,但包含血液、肿瘤及非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 419 | 2026-01-03 |
Endoplasmic reticulum stress exacerbates ischemia-reperfusion-induced pulmonary endothelial barrier dysfunction by activating TXNDC5
2025-Dec-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.039
PMID:41456650
|
研究论文 | 本研究探讨了内质网应激通过激活TXNDC5加剧肺缺血再灌注损伤中肺内皮屏障功能障碍的机制 | 首次揭示了内质网应激通过ATF6-TXNDC5轴调控肺内皮屏障功能,并构建了基于TXNDC5的LIRI早期预警模型 | 研究主要基于动物和细胞模型,临床验证样本量有限,需进一步多中心验证 | 探究TXNDC5在肺缺血再灌注损伤诱导的肺内皮屏障破坏中的作用及其机制与治疗潜力 | 大鼠肺缺血再灌注损伤模型、人脐静脉内皮细胞、LIRI患者血浆样本 | 基础医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、血浆蛋白质组学、AAV-shRNA敲低 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、临床数据 | 动物模型、细胞模型及LIRI患者血浆样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 420 | 2026-01-03 |
Copper-linked metabolic stress as a potential contributor to gastric epithelial transformation and metastasis
2025-Dec-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046590
PMID:41465895
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA-seq数据和孟德尔随机化分析,探讨了铜相关代谢应激在胃上皮细胞转化和转移中的潜在作用 | 首次在单细胞水平识别了胃上皮从正常到恶性的过渡表型,并结合遗传学证据(孟德尔随机化)系统性地将循环铜水平与胃肿瘤风险联系起来 | 研究结果虽支持铜的因果作用假说,但并非确证;需要正交组织验证、铜处理/铜死亡通路的功能扰动实验以及扩展的遗传分析(如多变量/共定位分析)来进一步证实 | 阐明胃上皮从正常到恶性转化及转移过程中的分子事件,特别关注铜相关代谢应激的作用 | 胃组织(来自公共数据库)、循环铜水平(遗传代理变量)、良性胃肿瘤和胃癌(GWAS数据) | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, 孟德尔随机化 | 基于典型相关分析的批次校正, 伪时间推断(Monocle; 自然样条模型), 通路活性评分(GSVA/GSEA) | 基因表达数据(单细胞RNA-seq), 遗传关联数据(GWAS) | 两个公共单细胞RNA-seq数据集(来源:GEO数据库),以及来自FinnGen和GWAS Catalog的汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |