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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
381 2026-01-14
Hematopoietic EphA4 deficiency alters microglial heterogeneity and improves chronic spatial memory after brain injury
2025-Dec-05, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了造血细胞特异性EphA4缺失如何通过影响小胶质细胞异质性和神经免疫重塑,改善创伤性脑损伤后的慢性空间记忆功能 首次揭示了外周免疫来源的EphA4信号在调控小胶质细胞异质性及长期神经功能恢复中的关键作用,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了特定的小胶质细胞亚群 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性有待验证;且未深入探讨EphA4信号影响小胶质细胞功能的具体分子机制 探究外周免疫细胞来源的EphA4信号在创伤性脑损伤后小胶质细胞动态变化及神经功能恢复中的作用 造血细胞特异性EphA4敲除的骨髓嵌合小鼠及创伤性脑损伤模型 神经科学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明具体样本数量,使用骨髓嵌合小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
382 2026-01-13
Spatial and single-cell transcriptomics landscape of adenomyosis
2025-Dec-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞和空间转录组学技术,深入解析了子宫腺肌症的细胞和分子特征,并评估了促性腺激素释放激素激动剂治疗的影响 首次在单细胞和空间转录组学水平上全面描绘了子宫腺肌症的细胞景观,揭示了纤毛上皮细胞和免疫-血管生成互作在疾病发病机制中的关键作用,并阐明了GnRHa治疗的作用机制 样本量相对较小,且主要基于转录组数据,需要进一步的功能实验验证 解析子宫腺肌症的病因和细胞分子机制,并评估GnRHa治疗的效果 子宫腺肌症患者和健康对照者的子宫组织样本 数字病理学 子宫腺肌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 图像数据 15名参与者用于测序分析(11名患者和4名对照),额外13名参与者用于验证(11名患者和2名对照) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
383 2026-01-13
The Role of Metabolites in Cell-Cell Communication: A Review of Databases and Computational Tools
2025-Dec-26, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了用于识别代谢物介导的细胞间通讯的现有数据库和计算工具,并讨论了当前局限性与未来改进方向 系统总结并批判性评估了基于scRNA-seq数据的代谢物介导细胞间通讯的数据库与计算工具,并提出了结合空间组学和人工智能的未来发展方向 现有数据库因缺乏统一标准而变异性大,计算工具多从通用CCC推断方法改编,未能充分捕捉代谢物与其传感器间复杂的互作机制 总结和评估用于推断代谢物介导细胞间通讯的数据库与计算工具,以促进该领域的方法学发展 代谢物介导的细胞间通讯及其相关数据库与计算工具 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA scRNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
384 2026-01-13
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了一种名为STARIT的新方法,它将成像空间转录组学数据转换为图像张量表示,以利用亚细胞异质性识别细胞类型和状态 STARIT创新地将imSRT数据中的转录本转换为图像张量表示,结合深度学习计算机视觉模型,首次实现了基于亚细胞转录定位的细胞状态识别,克服了传统基因计数方法的局限 方法依赖于模拟数据和真实imSRT数据的验证,但未明确说明在更广泛数据集或不同技术平台上的泛化能力,且可能受细胞分割质量的影响 开发一种新方法来利用成像空间转录组学数据中的亚细胞分子异质性,以更精确地识别和表征细胞类型和状态 成像空间转录组学数据中的细胞及其亚细胞转录本分布 计算机视觉 NA 成像空间转录组学 深度学习计算机视觉模型 图像张量 NA NA 成像空间转录组学 NA NA
385 2026-01-13
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals distinct tumor microenvironment dynamics in cervical adenocarcinoma and squamous cell carcinoma
2025-Dec-19, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了宫颈腺癌和鳞状细胞癌之间不同的肿瘤微环境动态特征 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统比较了宫颈癌两种主要组织学亚型的细胞和空间异质性,并发现了亚型特异性的免疫和基质特征 未明确说明样本的具体数量,且研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 解析宫颈癌不同组织学亚型的肿瘤微环境异质性,为开发亚型特异性治疗策略提供依据 宫颈腺癌和鳞状细胞癌组织 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
386 2026-01-13
AI-driven virtual cell models in preclinical research: technical pathways, validation mechanisms, and clinical translation potential
2025-Dec-11, NPJ digital medicine IF:12.4Q1
综述 本文综述了AI驱动的虚拟细胞模型在临床前研究中的技术路径、验证机制及临床转化潜力 通过整合多模态组学数据与深度生成模型、图神经网络等先进算法,构建高精度预测药物反应、基因扰动和疾病进展的虚拟细胞模型,并强调从计算评估到CRISPR检测和类器官平台实验验证的闭环工作流程 在监管接受度、数据隐私和模型可解释性方面仍面临挑战 探讨AI驱动的虚拟细胞模型在生命科学研究中的技术路径、验证机制及其在精准医疗和药物发现中的临床转化潜力 虚拟细胞模型及其在药物筛选和疾病建模中的应用 机器学习 NA 单细胞转录组学、蛋白质组学、CRISPR检测 深度生成模型、图神经网络 多模态组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq、单细胞蛋白质组学 NA NA
387 2026-01-13
AI-based Predictive Signaling Pathway Profiling in Cardiac Fibrosis Suggests a Novel Combinatorial Treatment Strategy
2025-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用人工智能分析心脏纤维化相关文献,结合单细胞RNA测序数据,揭示了JAK-STAT和TGF-β信号通路在急慢性心脏损伤中的动态作用,并提出了一种基于时序的组合治疗策略 首次利用AI模型从大量文献中预测心脏纤维化的关键信号通路,并通过单细胞分析验证了致病性肌成纤维细胞亚群,提出了一种时序差异性的JAK-STAT与TGF-β联合抑制新策略 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本,AI模型的预测依赖于历史文献数据,可能无法涵盖所有未知机制,且联合治疗策略的临床转化效果仍需进一步验证 探索心脏纤维化的关键信号通路机制,并开发更有效的治疗策略以减轻病理性纤维化而不影响急性损伤后的代偿性瘢痕形成 小鼠心脏纤维化模型(急性心肌梗死和慢性横向主动脉缩窄)及临床心脏损伤样本 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,动态富集分析,基因敲除技术 AI预测模型 文本(文献数据),基因表达数据 基于过去十年6,528篇心脏纤维化出版物训练的AI模型,以及小鼠模型和临床样本的单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
388 2026-01-13
Study design and rationale for the NeoTRACE trial: a multicenter phase II study of neoadjuvant sacituzumab govitecan plus zimberelimab followed by adjuvant zimberelimab with or without sacituzumab govitecan in patients with resectable non-small cell lung cancer
2025-Dec, Future oncology (London, England)
研究论文 本文介绍了NeoTRACE试验的研究设计和原理,该试验是一项评估新辅助sacituzumab govitecan联合zimberelimab,随后进行辅助zimberelimab联合或不联合sacituzumab govitecan在可切除非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性的II期研究 评估一种不含铂类药物的新辅助治疗方案(sacituzumab govitecan联合PD-1抑制剂zimberelimab)在可切除NSCLC中的应用,并探索循环肿瘤DNA动态、TROP2表达和空间转录组学作为生物标志物 该研究为单臂II期研究,缺乏对照组,且样本量较小(计划纳入50名参与者) 旨在提高可切除非小细胞肺癌患者的病理完全缓解率,降低毒性,提高手术可行性,并通过个性化辅助治疗改善长期预后 可切除的II期至IIIB(N2)期、无已知EGFR/ALK突变的非小细胞肺癌患者 NA 肺癌 循环肿瘤DNA分析,空间转录组学 NA NA 计划纳入50名参与者 NA NA NA NA
389 2026-01-13
Hypergraph-driven spatial multimodal fusion for precise domain delineation and tumor microenvironment decoding
2025-Dec-01, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出了一种名为HAST的超图驱动空间多模态融合工具,用于精确划分空间域和解码肿瘤微环境 HAST通过整合基因表达、空间坐标和组织学特征构建局部超图,有效建模多对多空间关系,并利用超图卷积网络结合自监督对比学习融合多视图信息 未在摘要中明确提及 精确划分空间域并解码肿瘤微环境,以促进癌症研究中的空间组学分析 肿瘤微环境中的空间域和细胞相互作用 空间转录组学 肿瘤 空间转录组学 超图卷积网络 基因表达、空间坐标、组织学特征 NA NA 空间转录组学 NA NA
390 2026-01-12
Comprehensive analysis of gene signature linking hypoxia and lactylation for predicting prognosis and immunotherapy response in patients with gastric cancer
2025-Dec-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,揭示了胃癌的细胞异质性,并基于缺氧和乳酸化相关基因构建了预后模型,用于预测临床预后和免疫治疗反应 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组数据分析胃癌的细胞异质性,并基于缺氧和乳酸化相关基因构建预后模型,探索其在免疫治疗反应预测中的潜力 研究依赖于公共数据库数据,未进行实验验证;模型在外部队列中的验证可能受样本异质性影响 研究缺氧和乳酸化对胃癌的影响,并构建相关预后模型以预测临床预后和免疫治疗反应 胃癌患者 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序,空间转录组测序,LASSO算法,CIBERSORT算法,TIDE评分,ESTIMATE方法,InferCNV分析 LASSO回归模型 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,临床数据 scRNA-seq数据包含23,447个基因和104,150个细胞;使用TCGA和GEO数据集进行模型构建和验证 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
391 2026-01-12
Identification of differentiation markers and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma using machine learning combined with single-cell analysis
2025-Dec-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究结合机器学习和单细胞转录组分析,识别头颈鳞状细胞癌分化相关分子标志物并探索不同分化状态下的免疫微环境差异 首次整合机器学习与单细胞分析识别HNSCC分化标志物,发现CRABP2低表达是低分化肿瘤的关键驱动因素,并揭示低分化肿瘤具有免疫抑制微环境特征 研究主要基于公共数据库数据,实验验证样本量有限,需进一步扩大临床队列验证标志物的普适性 识别头颈鳞状细胞癌分化相关分子标志物并探索不同分化状态下的免疫微环境差异 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者肿瘤组织 机器学习 头颈鳞状细胞癌 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,伪时间轨迹分析,分支表达分析建模,蛋白质印迹,定量聚合酶链反应,免疫组织化学,球体形成实验,多重免疫荧光 WGCNA,Monocle,BEAM 转录组数据,单细胞RNA测序数据 TCGA-HNSC数据集及GEO数据库单细胞数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
392 2026-01-12
Molecular characterization and prognostic modeling of liquid-liquid phase separation-related genes in osteosarcoma based on single-cell sequencing and weighted gene co-expression network analysis
2025-Dec-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究基于单细胞测序和加权基因共表达网络分析,构建了与液-液相分离相关的骨肉瘤预后风险模型 首次在骨肉瘤中探索液-液相分离的作用,并构建了一个包含七个新基因的预后模型 研究主要基于公开数据集,实验验证部分有限,且骨肉瘤样本量可能不足 构建骨肉瘤的预后风险模型并探究液-液相分离相关基因的作用 骨肉瘤样本和细胞系 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-qPCR, 免疫组化, CCK-8, EdU, 克隆形成实验 Cox回归, LASSO回归, 加权基因共表达网络分析 基因表达数据 基于公开数据集GSE162454和GSE21257,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
393 2026-01-12
OX40L and IL-2 combination strategy for gastric cancer immunotherapy
2025-Dec-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究评估了IL-2和OX40L联合刺激在胃癌免疫治疗中的协同作用,通过分析表达模式、体外实验及构建重组腺病毒载体,验证其增强T细胞活化和抗肿瘤反应的能力 首次提出并验证了IL-2与OX40L联合使用的协同免疫刺激策略,并构建了共表达IL-2和OX40L的重组腺病毒载体用于增强T细胞介导的细胞毒性 研究主要基于体外实验和初步临床样本分析,缺乏体内动物模型验证和长期疗效评估 评估IL-2和OX40L联合刺激是否能协同增强胃癌中的T细胞活化,以克服肿瘤免疫抑制微环境 胃癌患者的肿瘤组织、肿瘤浸润淋巴细胞和外周血单个核细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序,生物信息学分析,重组腺病毒载体构建 NA 基因表达数据,单细胞测序数据,体外实验数据 70名未经治疗的胃癌患者的肿瘤组织和配对外周血单个核细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
394 2026-01-12
Targeting CLIC6 with theaflavin enhances radiotherapy sensitivity in ER+/HER2- breast cancer
2025-Dec-31, Translational cancer research IF:1.5Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与转录组分析,鉴定出CLIC6作为ER+/HER2-乳腺癌放疗抵抗的关键基因,并发现茶黄素可作为其天然放射增敏剂 首次将CLIC6鉴定为ER+/HER2-乳腺癌放疗抵抗的关键基因,并揭示茶黄素通过高亲和力结合CLIC6发挥放射增敏作用 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且未涉及其他乳腺癌亚型 探索ER+/HER2-乳腺癌内在放疗抵抗的分子机制并寻找放射增敏策略 ER+/HER2-乳腺癌肿瘤细胞 生物信息学与分子生物学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 转录组分析, 高维加权基因共表达网络分析, 分子对接, 克隆形成实验, CCK-8增殖实验 hdWGCNA RNA测序数据, 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
395 2026-01-12
Single-cell RNA sequencing reveals a quiescence-senescence continuum and distinct senotypes following chemotherapy
2025-Dec-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过结合延时成像和单细胞RNA测序技术,揭示了化疗后细胞静止与衰老状态的连续体及不同的衰老类型 首次将细胞周期动态的延时成像与单细胞RNA测序配对,以区分静止和衰老状态,并识别出多种衰老类型及其与两种细胞周期停滞途径的关联 NA 研究化疗后细胞静止与衰老状态的区分及其转录组特征 化疗处理后的细胞 单细胞组学 癌症 单细胞RNA测序 NA 图像、转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
396 2026-01-12
Machine learning-driven comprehensive profiling of tumor heterogeneity and sialylation in hepatocellular carcinoma
2025-Dec-17, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术解析肝细胞癌的细胞异质性,识别了五个恶性肝细胞亚群,并开发了一个基于PGAM2和唾液酸化相关基因的预后模型 首次在单细胞水平系统描绘了肝细胞癌的肿瘤生态系统,识别了与疾病进展阶段特异相关的恶性亚群,并构建了一个整合转录调控因子与唾液酸化过程的临床预后工具 样本量相对有限,功能验证主要在体外进行,缺乏大规模前瞻性队列验证 解析肝细胞癌的细胞异质性及其与疾病进展、免疫微环境重塑的关系,并开发预后预测工具 人类肝细胞癌组织样本 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 机器学习驱动的预后模型 单细胞转录组数据 32,247个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
397 2026-01-12
New insights into the mechanism of microvascular rarefaction via endothelial-mesenchymal transition in steroid-induced osteonecrosis of femoral head
2025-Dec-15, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了内皮-间质转化在激素性股骨头坏死中的作用及其与微血管稀疏和组织损伤的关联 首次通过单细胞RNA测序结合体内外实验,揭示了EndMT在SONFH发病机制中的潜在作用及其与微血管稀疏的紧密联系 研究为初步探索,抗氧化干预的效果仅部分缓解了病理变化,具体分子机制和临床应用潜力需进一步验证 探究EndMT在SONFH中的作用机制,评估其与微血管稀疏和组织损伤的关联,并初步探索糖皮质激素诱导的氧化应激是否参与此过程 激素性股骨头坏死的囊性病变组织、人脐静脉内皮细胞以及糖皮质激素诱导的SONFH小鼠模型 数字病理学 股骨头坏死 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未明确指定样本数量,涉及SONFH囊性病变组织、HUVECs细胞系及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
398 2026-01-12
Spatial transcriptomics analysis uncovers ER stress in MANF-deficient Purkinje cells underlying alcohol-induced cerebellar neurodegeneration in mice
2025-Dec-03, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析,揭示了MANF缺陷的浦肯野细胞中内质网应激在酒精诱导的小鼠小脑神经退行性变中的作用 首次结合PC特异性MANF敲除小鼠模型、空间转录组学和高通量原位分析,揭示了MANF缺陷通过性别特异性方式影响浦肯野细胞的转录组景观,并阐明了其在酒精诱导的内质网应激和神经退行性变中的保护作用 研究主要基于小鼠模型,其在人类酒精使用障碍中的直接相关性仍需进一步验证;性别差异的分子机制尚未完全阐明 探究MANF是否在保护浦肯野细胞免受酒精诱导的内质网应激和神经退行性变中发挥作用 浦肯野细胞特异性MANF敲除小鼠 空间转录组学 酒精使用障碍 空间转录组学,高通量Xenium原位分析 PC特异性MANF敲除小鼠模型 空间转录组数据,原位基因表达数据,行为学数据 成年PC特异性MANF敲除小鼠(包括雄性和雌性) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, Xenium 用于空间转录组学分析和原位基因表达分析
399 2026-01-12
Comprehensive bulk and single-cell RNA sequencing uncovers senescence-associated biomarkers in therapeutic mesenchymal stem cells
2025-Dec-01, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过结合形态学、分子和转录组学分析,深入表征了犬间充质干细胞在衰老过程中的变化,并利用bulk和单细胞RNA测序发现了衰老相关的生物标志物 首次在犬模型中系统结合bulk和单细胞RNA测序技术研究间充质干细胞的衰老过程,揭示了衰老亚群的异质性分布并发现了新的潜在衰老标志基因 研究仅基于体外传代模型,未在体内验证衰老标志物的临床相关性;样本量相对有限 探究间充质干细胞衰老的分子机制并识别衰老相关的生物标志物,以提高细胞治疗的质量控制 犬间充质干细胞(早期传代P2和晚期传代P6) 单细胞组学 衰老相关疾病 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, SA-β-半乳糖苷酶染色, 细胞周期分析 NA RNA测序数据, 形态学数据 早期传代(P2)和晚期传代(P6)犬间充质干细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
400 2026-01-12
Single-Cell Sequencing of a Bile Sample From an Acute Cholecystitis Patient
2025-Dec, Cureus
研究论文 本研究利用单细胞测序技术分析急性胆囊炎患者的胆汁样本,探索细菌感染 首次应用单细胞扩增基因组测序技术于急性胆囊炎患者的胆汁样本,提供细菌感染的新颖基因组信息 单细胞测序的基因组覆盖度较低(9.45-42.88%),与传统全基因组测序相比存在序列缺口 评估单细胞测序技术在临床细菌感染样本中的应用潜力 急性胆囊炎患者的胆汁样本及其中的细菌 微生物基因组学 急性胆囊炎 单细胞扩增基因组测序,16S宏基因组分析 NA 基因组序列数据 1例患者的胆汁样本,从中分离出4个细菌菌落 NA 单细胞基因组测序 NA NA
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