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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-02 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
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研究论文 | 该文章揭示了SPOP抑制剂作为分子胶水降解剂通过稳定STING增强黑色素瘤免疫治疗效果的作用机制 | 首次发现SPOP抑制剂不仅阻断SPOP与STING的识别,还能作为分子胶水重定向SPOP降解新底物CBX4,通过DNA损伤激活STING通路,增强先天免疫应答 | 研究主要基于黑色素瘤模型,尚需在其他肿瘤类型中验证;单细胞RNA-seq分析仅在异种移植模型中进行,缺乏临床样本验证 | 探讨SPOP在肿瘤免疫中的作用及其抑制剂作为分子胶水降解剂的潜在治疗价值 | 黑色素瘤B16肿瘤模型、小鼠模型、CAR.CD19-T细胞疗法 | 机器学习和数字病理 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 异种移植黑色素瘤B16肿瘤模型小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 22 | 2026-05-02 |
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67033-8
PMID:41390483
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研究论文 | 该研究通过基因工程小鼠模型和人类膀胱癌样本,发现APOBEC3通过IL-1A/AP-1信号通路促进鳞状分化 | 首次揭示APOBEC3在膀胱癌中通过IL-1α和AP-1信号通路驱动鳞状分化的功能性作用,并鉴定APOBEC3A是人类中唯一与鳞状分化相关的家族成员 | 未明确提及,但可能涉及小鼠模型与人类疾病的完全一致性需进一步验证 | 探究APOBEC3家族在膀胱癌鳞状分化中的作用机制 | 基因工程小鼠模型(Pten和Trp53条件敲除并过表达小鼠Apobec3)及人类膀胱癌样本 | 癌症生物学 | 膀胱癌(尿路上皮癌) | 条件基因敲除、过表达、RNA测序、单细胞测序、空间转录组学 | 基因工程小鼠模型 | RNA测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 小鼠膀胱肿瘤样本及人类膀胱癌样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2026-05-02 |
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011665
PMID:41386973
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研究论文 | 本文研究原位DC启动疫苗联合CD137激动剂通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+T细胞应答诱导持久抗肿瘤免疫 | 首次揭示原位疫苗与CD137激动剂联合治疗通过cDC1细胞依赖性增强肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞应答,并实现Treg细胞功能重塑以减轻免疫抑制 | 研究局限于小鼠移植瘤模型,未验证在人类肿瘤微环境中的疗效及长期安全性 | 评估原位DC启动疫苗联合CD137激动剂在肺癌和结肠癌小鼠模型中的治疗潜力及免疫机制 | 肺癌和结肠癌小鼠移植瘤模型 | 免疫学 | 肺癌, 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 植入性小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2026-05-02 |
Rod-shaped microglia interact with neuronal dendrites to attenuate cortical excitability during TDP-43-related neurodegeneration
2025-Dec-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.08.016
PMID:40975067
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研究论文 | 该论文揭示了在TDP-43相关神经退行性变中,杆状小胶质细胞通过与神经元树突相互作用来减弱皮质过度兴奋 | 首次发现杆状小胶质细胞亚群及其在神经退行性变中通过重塑兴奋性突触输入来保护神经元的机制,并阐明了TREM2在其中的关键作用 | 具体局限性未在摘要中提及 | 研究小胶质细胞在TDP-43相关神经退行性变中调控皮质兴奋性的作用 | rNLS8转基因小鼠模型中的小胶质细胞和神经元 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 多通道探针记录、纵向体内钙成像、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 电生理数据、钙成像数据、基因表达数据 | rNLS8小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 25 | 2026-05-01 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing analysis reveals characteristics of a unique subpopulation in high-grade IDH-mutant astrocytoma
2025-Dec-29, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01139-5
PMID:41460424
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研究论文 | 利用单细胞和空间转录组测序分析揭示高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个独特亚群的特征 | 首次通过单细胞和空间转录组测序联合分析,鉴定出高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个具有免疫抑制表型、与不良预后相关的独特肿瘤细胞亚群 | NA | 识别高级别IDH突变型星形细胞瘤中独特的肿瘤细胞亚群及其特征 | 高级别(WHO 3-4级)和低级别(WHO 2级)IDH突变型星形细胞瘤样本 | 数字病理学 | 星形细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 26 | 2026-05-01 |
Dermatomyositis is characterized by JAK1-mediated monocyte-driven vasculopathy and inflammation
2025-Dec-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea9007
PMID:41442501
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析皮肌炎中JAK1介导的单核细胞驱动血管病变和炎症机制 | 首次通过跨疾病比较(皮肌炎与红斑狼疮)揭示皮肌炎特异性单核细胞与内皮细胞互作导致的血管病变,并发现JAK1抑制可逆转相关表型 | 样本量有限且主要聚焦皮肤组织,对肌肉病变机制未深入探讨 | 阐明皮肌炎免疫发病机制,尤其是血管病变和炎症的分子基础 | 皮肌炎患者的非病灶皮肤、病灶皮肤及外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯网络分析 | 基因表达数据 | 皮肌炎、红斑狼疮患者及健康对照的皮肤和外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 27 | 2026-05-01 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-12-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了Igf2调控早期出生后DPP4+前脂肪细胞池扩展的机制 | 首次发现Igf2在早期生命阶段通过促进DPP4+前脂肪细胞增殖而非分化来驱动脂肪组织扩展 | 未提供具体局限性信息 | 阐明早期生命阶段促进脂肪组织快速扩展的分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织中的DPP4+前脂肪细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢健康肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮下脂肪组织样本(断奶前和成年小鼠) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 28 | 2026-05-01 |
αCGRP deficiency aggravates pulmonary fibrosis by promoting senescence in alveolar type 2 cells
2025-12, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00361-3
PMID:41023452
|
研究论文 | 本文探讨αCGRP(Calca)缺乏如何通过促进肺泡2型细胞衰老加剧肺纤维化 | 首次揭示αCGRP缺乏通过促进AT2细胞炎症性衰老加剧肺纤维化的机制,并采用单细胞RNA测序和标记自由蛋白质组学等多组学方法分析 | 未明确说明研究的局限性 | 探究αCGRP缺乏是否通过促进AT2细胞衰老加剧肺纤维化 | 肺纤维化患者样本及Calca基因敲除大鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 标记自由蛋白质组学, 免疫组化 | NA | 组织切片, RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 15名肺纤维化患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-01 |
Cancer-associated fibroblast miR-148a-5p/CALD1/collagen VI pathway promotes proliferation in Helicobacter pylori-positive gastric cancer
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01116-y
PMID:41171370
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研究论文 | 发现幽门螺杆菌刺激的癌症相关成纤维细胞通过miR-148a-5p/CALD1/VI型胶原通路促进胃癌增殖 | 首次揭示幽门螺杆菌刺激的癌症相关成纤维细胞中TLR/miR-148a-5p/CALD1/VI型胶原信号通路在幽门螺杆菌阳性胃癌中的关键作用,并验证miR-148a-5p agomir作为化疗增敏剂的潜力 | 缺乏关于幽门螺杆菌对癌症相关成纤维细胞影响或治疗干预靶点的研究 | 研究幽门螺杆菌阳性胃癌中癌症相关成纤维细胞促进肿瘤增殖的机制及潜在治疗靶点 | 幽门螺杆菌阳性胃癌患者及小鼠模型 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞测序,转录组测序,微RNA测序 | NA | 测序数据,细胞系,小鼠模型 | 公开微RNA和转录组测序数据,单细胞测序数据,以及体外和体内模型 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-05-01 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学揭示Merkel细胞癌中表皮与真皮肿瘤细胞的基因表达差异,强调微环境对肿瘤细胞表型可塑性的影响 | 首次通过高分辨率空间转录组学比较Merkel细胞癌中表皮亲嗜性肿瘤细胞与真皮肿瘤细胞的转录组特征,发现微环境可诱导肿瘤细胞向角质细胞分化 | 未提及具体局限性 | 研究微环境对Merkel细胞癌细胞表型可塑性的调节作用 | Merkel细胞癌的表皮亲嗜性肿瘤细胞、肿瘤核心及血管旁肿瘤细胞 | 数字病理学 | Merkel细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 高分辨率空间转录组学平台及单细胞转录组学平台 |
| 31 | 2026-05-01 |
Transcriptomic Analysis of Skeletal Muscle Systems Comparing Bovines, Humans, and Mice Using scRNA-Seq
2025-12, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70035
PMID:41335100
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对牛、人类和小鼠的骨骼肌系统进行转录组分析,构建了从产前到产后发育的完整单细胞图谱并比较了跨物种的转录组特征 | 首次构建了牛骨骼肌发育的完整单细胞景观,并系统比较了牛、人类和小鼠三物种在细胞类型、基因表达和调控元件上的进化保守性与物种特异性差异 | 部分细胞谱系的功能和发育程序仍不明确,研究仅基于单细胞转录组数据,缺乏对非编码调控元件或表观遗传修饰的深入分析 | 揭示哺乳动物骨骼肌发育过程中保守和分化的分子机制 | 牛、人类和小鼠的骨骼肌组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | 基因表达数据 | 包含牛产前到产后发育阶段的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-12-12 |
Fibroblasts in the tumor microenvironment: heterogeneity and dynamic interactions in tumor progression revealed by spatial transcriptomics
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01108-y
PMID:41129052
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2026-04-30 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adl1988
PMID:40997217
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研究论文 | 本研究结合全基因组表观组图谱、表观基因组编辑、表型及单细胞RNA测序CRISPR筛选,发现了一类对机械微环境响应的基因组增强子,并探究其如何通过表观遗传调控影响细胞功能及疾病相关基因 | 首次鉴定出对细胞外基质软硬度响应的“机械增强子”,并通过表观遗传编辑重编程细胞对机械微环境的响应 | 未提及具体局限性 | 探究机械微环境如何通过表观遗传状态调控转录,并识别响应机械信号的基因组增强子 | 肺成纤维细胞(来自健康及纤维化供体) | 表观遗传学、单细胞组学 | 纤维化疾病 | 全基因组表观组学、表观基因组编辑、单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | 表观组数据、单细胞转录组数据 | 健康及纤维化供体的肺成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 34 | 2026-04-30 |
Single-cell transcriptomics of human organoid-derived enteroendocrine cell populations from the small intestine
2025-12, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287463
PMID:39639676
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类小肠类器官来源的肠内分泌细胞群体 | 首次利用CRISPR-Cas9标记的类器官模型结合单细胞RNA测序,系统绘制人类小肠肠内分泌细胞图谱,并揭示不同细胞亚型的激素、营养感应机制及转录因子的差异表达 | 未提及具体局限性,但类器官模型可能无法完全模拟体内微环境 | 利用单细胞RNA测序绘制人类小肠肠内分泌细胞图谱,比较不同细胞类型的分子特征 | 人类十二指肠和回肠类器官来源的肠内分泌细胞(EECs) | 单细胞转录组学 | 糖尿病、肥胖、肠道疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CRISPR-Cas9 | 细胞类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 人类十二指肠和回肠类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 单细胞RNA测序平台 |
| 35 | 2026-04-30 |
Spatial Dynamics of Tumor Cell Plasticity in Lung Adenocarcinoma Revealed by Region-Specific Single Cell Transcriptomics
2025-12, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70101
PMID:41454525
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研究论文 | 通过区域特异性单细胞转录组学揭示肺腺癌中肿瘤细胞可塑性的空间动态 | 首次在单个肺腺癌肿瘤的不同区域(核心、核心旁、边缘)进行单细胞RNA测序,系统刻画了EMT和干性特征的空间异质性,并发现与预后相关的生物标志物PCBP1和PA2G4 | 样本仅来自单个肺腺癌患者,可能限制了结论的普适性;EMT与干性之间的相关性较弱(R=0.17),需进一步验证 | 研究肺腺癌中肿瘤细胞可塑性(EMT和干性)的空间分布及其与预后的关联 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本(10个肿瘤片段来自3个区域) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1例肺腺癌患者的10个肿瘤片段(核心、核心旁、边缘各若干个) | BGI | 单细胞RNA测序 | SURFSeq 5000 | BGI SURFSeq 5000测序平台进行单细胞RNA测序 |
| 36 | 2026-04-29 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces wide-spread changes in gene expression across diverse cell types
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.19.695600
PMID:41497643
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研究论文 | 本研究通过感染小鼠适应型SARS-CoV-2病毒,探究其对5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型神经病理学的影响 | 首次使用小鼠适应型SARS-CoV-2病毒(MA10)在5xFAD小鼠模型中系统评估病毒对阿尔茨海默病神经病理的直接作用 | 未检测到中枢神经系统内病毒RNA,且未观察到明显的胶质细胞激活或神经炎症反应 | 阐明SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学的潜在分子机制 | 10-14月龄的5xFAD和野生型C57BL/6小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病, 新冠肺炎 | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 感染后第7天和21天的小鼠脑样本,具体数量未提供 | Illumina | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq | NA |
| 37 | 2026-04-29 |
UV induces common cutaneous amyloid-like melanosomal protein aggregates
2025-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.689083
PMID:41446198
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研究论文 | 研究表明紫外线诱导黑色素细胞中α-突触核蛋白等形成类淀粉样蛋白聚集体,导致常见色素性疾病和光老化 | 发现紫外线以类朊病毒方式诱导黑色素体蛋白自传播聚集,并首次将黑色素体蛋白病与常见色素异常和光老化联系起来 | 未提及具体局限性 | 阐明紫外线诱导黑色素体蛋白聚集的机制及其在色素性疾病中的作用 | 黑色素细胞、小鼠模型、临床色素性病变样本 | 数字病理学 | 色素性疾病, 帕金森病, 光老化 | RT-QuIC, CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | 多种临床色素性病变样本、原代黑色素细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2026-04-28 |
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28921-7
PMID:41461777
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研究论文 | 基于衰老相关特征基因构建肺动脉高压早期诊断模型并识别潜在治疗靶点 | 首次基于衰老相关基因通过LASSO回归、随机森林和支持向量机三种机器学习方法筛选特征基因,构建高精度诊断列线图,并识别TUL-XXI039作为多靶点潜在治疗化合物 | 研究基于公开数据集和体外模型,需要在更大规模临床样本和体内模型中进行验证 | 开发肺动脉高压的早期诊断生物标志物和基于衰老的靶向治疗策略 | 肺动脉高压患者转录组数据及肺动脉平滑肌细胞体外缺氧模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、分子对接 | LASSO回归、随机森林、支持向量机、列线图 | 基因表达数据 | 多个公开数据集,包括训练队列和独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2026-04-28 |
Exploring the expression and prognostic roles of LAD1 in lung adenocarcinoma
2025-Dec-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33277-z
PMID:41423496
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研究论文 | 探索LAD1在肺腺癌中的表达和预后作用 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据全面分析LAD1在肺腺癌中的表达模式和预后价值,并通过实验验证LAD1敲低对细胞迁移和侵袭的影响 | 样本量有限,缺乏LAD1在肺腺癌中作用机制的深入分子生物学验证 | 鉴定肺腺癌的新型生物标志物并理解其潜在机制 | 肺腺癌患者肿瘤组织、相邻正常组织以及A549细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化染色、siRNA敲低实验 | 列线图模型 | 单细胞基因表达数据、批量基因表达数据、临床病理数据 | 10名肺腺癌患者(scRNA-seq),36名肺腺癌患者(免疫组化) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-04-25 |
The High Expression of PD-1 Defines A Subpopulation of Tfh Cells Responding to COVID-19 Vaccine in Humans
2025-Dec-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf019
PMID:40080696
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研究论文 | 利用单细胞测序和流式细胞术,研究了COVID-19疫苗加强针后PD-1高表达Tfh细胞亚群的应答特征及其对抗体反应的长期维持作用 | 首次发现PD-1高表达经典Tfh细胞亚群在COVID-19疫苗加强针后显著活化,其比例与抗体滴度相关,并通过定制算法识别病毒诱导的T细胞受体,揭示了该亚群可维持超过90天的免疫应答 | 未明确说明局限性(基于摘要推断) | 研究COVID-19疫苗加强针后CD4+ T细胞尤其是Tfh细胞的应答特征及其对抗体产生的作用 | COVID-19疫苗接种后的人体CD4+ T细胞(包括Tfh细胞) | 机器学习, 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎(COVID-19) | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞免疫数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |