单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
21	2025-05-04	Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the prognostic features and immune landscape of exosome-related genes in breast cancer metastasis 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2024.2447917 PMID:39847423	research paper	通过整合RNA-seq和scRNA-seq数据，探索外泌体相关基因在乳腺癌转移中的预后特征和免疫景观	开发了一个基于外泌体相关基因的新型风险评分模型，并通过RNA-seq和scRNA-seq数据的综合分析验证了其预测准确性	模型的预测性能AUC值在0.602至0.654之间，仍有提升空间	探索外泌体相关基因在乳腺癌转移中的作用，并开发可靠的预后模型	乳腺癌（BRCA）样本	digital pathology	breast cancer	RNA-seq, scRNA-seq	Lasso-Cox regression	RNA-seq数据, scRNA-seq数据	TCGA数据库中的BRCA队列样本
22	2025-05-04	Revealing the role of natural killer cells in ankylosing spondylitis: identifying diagnostic biomarkers and therapeutic targets 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2025.2457523 PMID:39853176	研究论文	本研究通过生物信息学方法和实验验证探讨了自然杀伤细胞（NK细胞）在强直性脊柱炎（AS）中的作用	揭示了NK细胞在AS发病机制中的潜在作用，并鉴定出与NK细胞相关的关键基因作为AS的诊断生物标志物和治疗靶点	研究依赖于公共数据集，样本量可能有限，且实验验证部分仅进行了RT-PCR验证	探索NK细胞在AS发病机制中的作用，并寻找诊断生物标志物和治疗靶点	强直性脊柱炎（AS）患者和对照组的NK细胞	生物信息学	强直性脊柱炎	微阵列数据分析、scRNA-seq、WGCNA、RT-PCR	NA	基因表达数据	来自公共数据集GSE25101、GSE73754、GSE194315和Liu的研究的样本
23	2025-05-03	Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment 2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1080/16078454.2025.2452701 PMID:39829399	研究论文	本研究基于中性粒细胞胞外诱捕网相关基因(NETRGs)构建了一个儿童急性淋巴细胞白血病(cALL)的预后模型	首次将多组学数据与体外实验相结合，鉴定出7个预后相关基因并构建风险模型，揭示了TLR2等6个潜在治疗靶点	研究样本来自公共数据库，缺乏独立队列验证实验结果的临床适用性	开发儿童急性淋巴细胞白血病的预后预测模型并探索潜在治疗靶点	儿童急性淋巴细胞白血病患者	生物信息学	急性淋巴细胞白血病	转录组测序、单细胞转录组测序、RT-qPCR	LASSO回归、Cox回归风险模型	基因表达数据	来自TARGET-ALL-P2/P3队列和GSE26713/GSE130116数据集的样本
24	2025-04-24	Construction and validation of renal cell carcinoma tumor cell differentiation-related prognostic classification (RCC-TCDC): an integrated bioinformatic analysis and clinical study 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2025.2490830 PMID:40248945	研究论文	该研究构建并验证了一个基于肾细胞癌肿瘤细胞分化相关预后基因的分子分类系统RCC-TCDC	首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了基于肿瘤细胞分化特征的肾细胞癌预后分类系统	研究样本量有限，需要更大规模的外部验证	开发基于肿瘤细胞分化特征的肾细胞癌分子分类系统以实现精准风险分层和个体化治疗	肾细胞癌患者	生物信息学	肾细胞癌	scRNA-seq, bulk RNA-seq, 免疫组化染色	Lasso回归, 多变量预后模型	基因表达数据	TCGA-KIRC队列和新华队列370例肾肿瘤患者
25	2025-04-13	Multi-omics profiling of acute Pseudomonas aeruginosa pneumonia unmasks conventional NK cell depletion and stage-specific therapeutic targets 2025-Dec, Virulence IF:5.5Q1 DOI:10.1080/21505594.2025.2490206 PMID:40216004	研究论文	该研究通过多组学分析揭示了急性铜绿假单胞菌肺炎中常规NK细胞的耗竭及其阶段特异性治疗靶点	首次发现铜绿假单胞菌肺炎早期常规NK细胞(cNK)而非组织驻留NK细胞(trNK)的耗竭现象，并解析了NK细胞亚群异质性动态变化	研究局限于小鼠模型，尚未在人体临床样本中验证	阐明吸入性铜绿假单胞菌感染后宿主先天免疫反应特征	铜绿假单胞菌肺炎小鼠模型	免疫学	肺炎	RNA测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	小鼠感染模型	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据	未明确说明小鼠数量，但包含多时间点(24h/48h)动态分析
26	2025-04-10	Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration 2025-Dec-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083 PMID:38934409	研究论文	通过单细胞RNA测序揭示斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞和Müller胶质细胞的异质性及相互作用	首次发现两种静止状态的Müller胶质细胞（MG1和MG2）在视网膜损伤后的不同命运转变，以及三种小胶质细胞亚型在损伤后的动态变化	研究局限于斑马鱼模型，结果向哺乳动物的推广需要进一步验证	探究炎症如何调控Müller胶质细胞重编程以促进视网膜再生	斑马鱼视网膜中的免疫细胞和Müller胶质细胞	数字病理学	视网膜疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
27	2025-04-10	Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury 2025-Dec-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063 PMID:39101644	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的动态发展及其在疾病进程中的不同作用	首次在单细胞水平上区分了小胶质细胞和巨噬细胞在脊髓损伤后的不同演化路径，并发现了它们各自的特异性功能表型和细胞间通讯模式	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞和巨噬细胞的动态变化及其功能差异	脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序，空间转录组学	NA	基因表达数据	NA
28	2025-02-13	Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV 2025-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1 DOI:10.1080/22221751.2025.2459136 PMID:39868995	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了猴痘病毒（MPXV）感染患者的外周血单核细胞，揭示了HIV感染者与非感染者的免疫景观差异	首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了HIV感染与非感染猴痘患者的免疫细胞表型和基因表达差异，揭示了HIV感染者病情严重的潜在机制	样本量较小，仅包括6名患者，可能影响结果的普遍性	研究猴痘病毒在HIV感染与非感染患者中的免疫病理学机制	猴痘病毒感染患者的外周血单核细胞	生物信息学	猴痘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	6名患者（3名HIV+，3名HIV-）
29	2024-12-21	A diagnostic signatures for intervertebral disc degeneration using TNFAIP6 and COL6A2 based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analyses 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2024.2443568 PMID:39704340	研究论文	本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路	首次通过单细胞和批量RNA测序结合的方法，识别出TNFAIP6和COL6A2作为椎间盘退变的诊断标志物，并验证了ZEB2作为转录因子在调控这些关键基因中的潜在作用	研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据质量问题	识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路，以辅助诊断和预测疾病活动	椎间盘退变病例的生物标志物和信号通路	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、批量RNA测序、RT-qPCR、免疫组化（IHC）	NA	RNA	多个数据集（GSE70362、GSE124272）和组织样本
30	2024-12-20	Characterisation of the tumour microenvironment and PD-L1 granularity reveals the prognostic value of cancer-associated myofibroblasts in non-invasive bladder cancer 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2024.2438291 PMID:39698899	研究论文	研究分析了非肌肉浸润性膀胱癌（NMIBC）的肿瘤微环境（TME）组成和PD-L1表达，并探讨了癌症相关肌成纤维细胞（myoCAF）的预后价值	首次系统分析了NMIBC的肿瘤微环境组成，并揭示了myoCAF在预测疾病进展和复发中的潜在预后价值	研究样本量有限，且仅限于NMIBC患者，结果的普适性有待进一步验证	探讨NMIBC的肿瘤微环境特征及其在治疗预后中的作用	NMIBC患者的肿瘤和非肿瘤组织样本	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学分析、组织微阵列	NA	组织	73名NMIBC患者及888名独立队列患者