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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-12-12 |
Dual function of MrgprB2 receptor-dependent neural immune axis in chronic pain
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.037
PMID:40024332
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研究论文 | 本研究探讨了MrgprB2受体依赖的神经免疫轴在化疗诱导的神经病理性疼痛中的双向调节作用 | 揭示了MrgprB2/Tryptase/PAR2轴在疼痛发展和缓解中的双重功能,强调了疼痛不同阶段机制差异的重要性 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 研究MrgprB2介导的神经免疫相互作用在化疗诱导神经病理性疼痛中的双向调节 | 野生型小鼠、MrgprD敲除小鼠、肥大细胞缺陷小鼠、MrgprB2敲除小鼠、MrgprB2-Cre tdTomato小鼠 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | 钙成像、细胞因子抗体阵列、单细胞测序数据库挖掘、免疫荧光、Western blotting、共免疫沉淀 | NA | 实验数据 | 多种基因修饰小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 282 | 2025-12-12 |
From inflammation to remodelling: A novel BASP1+ monocyte subset as a catalyst for acute aortic dissection
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.003
PMID:40057028
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因工程小鼠模型,揭示了BASP1阳性单核细胞亚群在急性主动脉夹层发展中的关键作用及其调控机制 | 首次识别并验证了BASP1阳性单核细胞亚群作为急性主动脉夹层发展的关键催化剂,并阐明了其通过“PIP2-SP1-ACTN1/VAV3”和“ITGB1-Rac1-GSN”信号通路促进炎症和血管重塑的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的直接验证和临床转化潜力尚需进一步探索 | 探究BASP1阳性单核细胞亚群在促进急性主动脉夹层发展中的作用及其分子机制 | 人类外周血和主动脉组织中的单核细胞/巨噬细胞,以及BASP1-CreER/Lyz2-DreER-tdT报告基因小鼠 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,激光散斑成像,超声成像,Co-IP,ChIP测序,条件性基因敲除,siRNA干扰 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据,图像数据,蛋白质互作数据 | 人类外周血和主动脉组织样本,以及基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 283 | 2025-12-12 |
Deciphering the Immunomodulatory Function of GSN + Inflammatory Cancer-Associated Fibroblasts in Renal Cell Carcinoma Immunotherapy: Insights From Pan-Cancer Single-Cell Landscape and Spatial Transcriptomics Analysis
2025-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70062
PMID:40375605
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研究论文 | 本研究通过泛癌单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了GSN+炎症性癌症相关成纤维细胞在肾细胞癌免疫治疗中的免疫调节功能,并开发了预测免疫检查点抑制剂反应的Caf.Sig模型 | 首次在泛癌层面结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,识别GSN+ iCAFs亚型,并开发了基于CAF基因特征和机器学习预测ICI反应的Caf.Sig模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外/体内实验,临床验证样本可能有限,且模型在更广泛人群中的普适性需进一步验证 | 探究癌症相关成纤维细胞异质性对免疫检查点抑制剂治疗反应的影响,并开发预测模型 | 泛癌患者样本、肾透明细胞癌样本、小鼠模型、原代CAFs、肿瘤细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学测序、bulk RNA测序、机器学习、体内外实验 | 机器学习模型(Caf.Sig) | 单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据、bulk RNA测序数据 | 泛癌患者样本、肾透明细胞癌样本、小鼠模型及原代细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 284 | 2025-12-12 |
Repetitive Transcranial Magnetic Stimulation Induces Cognitive Recovery in Alzheimer's Disease via GABAergic Neuron Activation of the Cx3cl1-Cx3cr1 Axis
2025-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70061
PMID:40415257
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研究论文 | 本研究探讨了重复经颅磁刺激通过激活GABA能神经元和调控Cx3cl1-Cx3cr1信号轴,促进阿尔茨海默病认知恢复的分子机制 | 首次揭示了rTMS通过激活GABA能神经元上调Cx3cl1,进而增强小胶质细胞吞噬功能、减轻淀粉样斑块负担的分子通路,为AD非侵入性治疗提供了新靶点 | 研究基于5xFAD小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证;机制研究主要集中于Cx3cl1-Cx3cr1轴,可能存在其他未被发现的信号通路 | 探究重复经颅磁刺激治疗阿尔茨海默病的分子机制和认知恢复效果 | 5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2025-12-12 |
Mechanotransduction Mediated by PDLIM5: The Critical Role of Serpin E2/Integrin β3-Cytoskeleton-Nucleoskeleton Axis in Mechanical Osteogenic Programming
2025-Dec, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70067
PMID:40457949
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研究论文 | 本研究探讨了机械敏感蛋白PDLIM5在周期性拉伸应力下调控人脂肪来源干细胞成骨分化的作用及其机制 | 首次揭示了PDLIM5通过serpin E2/整合素β3-细胞骨架-核骨架轴在机械成骨编程中的关键作用 | 研究主要基于体外细胞实验,体内验证有限,且机制细节需进一步探索 | 研究PDLIM5在机械应力诱导干细胞成骨分化中的作用机制 | 人脂肪来源干细胞、整合素β3敲除小鼠的骨组织及原代脂肪来源干细胞 | 细胞生物学 | 骨缺损 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光、ALP染色、慢病毒转染、CCK-8、transwell迁移实验、伤口愈合实验、蛋白质相互作用分析、H&E染色、免疫组织化学 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 未明确样本数量,涉及人脂肪来源干细胞及小鼠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2025-12-12 |
Spatial and functional characterization of IL1RL1+ mast cells reveals immune regulatory roles in renal cancer
2025-Dec, Molecular and cellular probes
IF:2.3Q4
DOI:10.1016/j.mcp.2025.102049
PMID:40912479
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研究论文 | 本研究通过分析IL1RL1在肾透明细胞癌中的表达模式,揭示了IL1RL1+肥大细胞在肿瘤免疫调控中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统性地研究了IL1RL1+肥大细胞在肾癌中的空间分布和免疫功能,并发现其通过MHC-I信号通路增强CD8+ T细胞活化 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内功能验证,且样本来源有限 | 探究IL1RL1在肾透明细胞癌中的表达模式、细胞定位及其在肿瘤免疫微环境中的调控作用 | 肾透明细胞癌组织、IL1RL1+肥大细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化、基因敲除实验 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 基于TCGA和GEO数据库的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2025-12-12 |
Single-cell RNA sequencing reveals genes relevant to periodontal therapy and periodontitis
2025-Dec-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,比较了健康与牙周炎状态下人类口腔黏膜和牙龈的基因表达模式及细胞间相互作用 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示了口腔黏膜与牙龈间以及健康与牙周炎牙龈间的分子差异,并预测了关键的细胞间信号通路 | 研究基于单细胞RNA测序数据进行分析,未进行功能性实验验证预测的细胞间相互作用 | 探究口腔黏膜与牙龈的分子差异以及牙周感染对组织间相互作用的影响 | 人类口腔黏膜组织、牙龈组织(包括健康与牙周炎状态) | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 288 | 2025-12-12 |
Neoadjuvant chemotherapy modulates mast cell phenotypes and immune infiltration in high-grade serous carcinoma
2025-Dec, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.10.014
PMID:41176887
|
研究论文 | 本研究探讨了新辅助化疗(NACT)对高级别浆液性癌(HGSC)免疫浸润模式的影响,特别关注肥大细胞表型的变化及其临床意义 | 首次系统分析了NACT前后HGSC中肥大细胞表型的动态变化,并发现KIT表达与预后不良相关,为NACT疗效评估提供了新的生物标志物 | 样本量相对较小(特别是RNA-seq数据),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性验证 | 研究NACT对HGSC免疫景观的影响,探索免疫细胞浸润模式的变化及其临床相关性 | 高级别浆液性癌(HGSC)患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌(高级别浆液性癌) | RNA测序,免疫组织化学,单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据,免疫组化图像,单细胞RNA-seq数据 | 内部RNA-seq数据(8个NACT前和7个NACT后样本),三个GEO数据集,73对NACT前后配对样本的免疫组化分析 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 289 | 2025-12-12 |
Benchmarking porcine pancreatic ductal organoids for drug screening applications
2025-Dec, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00330-3
PMID:41188536
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研究论文 | 本研究通过建立和基准测试猪胰腺导管类器官(PPDO),将其作为药物筛选平台,评估其与人类胰腺导管类器官(HPDO)的相似性和应用潜力 | 首次建立猪胰腺导管类器官(PPDO)作为可靠、遗传定义明确且易于获取的模型系统,用于模拟胰腺导管/祖细胞生物学,并通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析进行基准测试 | PPDO向内分泌谱系的分化潜力有限,且研究未涉及人类供体材料的广泛可用性问题 | 开发并验证猪胰腺导管类器官作为药物筛选和胰腺疾病研究的替代模型 | 猪胰腺导管类器官(PPDO)、人类胰腺导管类器官(HPDO)和原代猪胰腺组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、蛋白质组学分析 | NA | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 290 | 2025-12-12 |
Dynamic changes in chromatin accessibility during cell fate specification at the neural plate border
2025-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204943
PMID:41235466
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研究论文 | 本研究利用单细胞ATAC测序技术,探究了鸡神经板边界细胞在分化为神经细胞、神经嵴细胞和基板细胞过程中染色质可及性的动态变化 | 开发了名为'single cell Advanced Chromatin Exploration'的Nextflow流程,整合scATAC-seq和scRNA-seq数据,识别细胞状态特异性可及性谱和协调动态行为的染色质区域组(可及性模块),并预测并实验验证了Foxk2作为基板细胞分化的新调控因子 | 研究仅基于鸡胚胎模型,未涉及其他物种或更广泛的发育阶段,且实验验证部分可能有限 | 探究发育过程中染色质可及性动态变化如何驱动细胞命运特化 | 鸡神经板边界细胞及其分化的神经细胞、神经嵴细胞和基板细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞ATAC测序(scATAC-seq),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2025-12-12 |
Inhibiting cholesterol synthesis halts rhabdomyosarcoma growth via ER stress and cell cycle arrest
2025-Dec, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00336-x
PMID:41249736
|
研究论文 | 本研究揭示了胆固醇生物合成作为横纹肌肉瘤的关键代谢弱点,通过抑制该通路可诱导细胞周期停滞和内质网应激介导的凋亡 | 首次发现转录因子PROX1调控胆固醇生物合成通路,并证明RMS细胞独特依赖内源性胆固醇合成(无法被外源LDL拯救),而正常细胞主要依赖外源摄取 | 未明确胆固醇生物合成抑制剂在体内模型中的毒副作用及临床转化潜力 | 探索横纹肌肉瘤的代谢脆弱性及潜在治疗靶点 | 横纹肌肉瘤细胞系、临床样本、正常成肌细胞与星形胶质细胞 | 肿瘤代谢研究 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、临床生存数据 | 未明确具体样本数量,包含细胞系与临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2025-12-12 |
Electron Microscopy and Multi-Omics Reveal Mitochondrial Dysfunction and Structural Remodeling in the Hearts of Elderly Mice
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70286
PMID:41250825
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研究论文 | 本研究采用整合多组学策略结合电子显微镜,揭示了老年小鼠心脏中线粒体功能障碍和结构重塑的分子机制 | 首次将空间转录组学、蛋白质组学、代谢-脂质组学与电子显微镜相结合,对小鼠心脏衰老进行多尺度、系统水平的综合分析 | 研究仅在鼠模型中进行,结果在人类模型中的验证至关重要以确立其转化相关性 | 揭示心脏衰老的复杂分子机制,并识别潜在的治疗靶点以缓解年龄相关的功能衰退 | 小鼠心脏组织 | 多组学整合分析 | 心脏衰老/功能障碍 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢-脂质组学, 电子显微镜 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据, 脂质组数据, 电子显微镜图像 | 三个生命阶段的小鼠:成年(12个月)、中年(24个月)和老年(30个月) | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 293 | 2025-12-12 |
Pan-cancer analysis identifies adhesion G protein-coupled receptor G6 as a potential prognostic and immunotherapeutic biomarker with its functional validation
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149128
PMID:41265596
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研究论文 | 本研究通过泛癌分析,将粘附G蛋白偶联受体G6(ADGRG6)鉴定为一种潜在的预后和免疫治疗生物标志物,并进行了功能验证 | 首次在泛癌背景下全面评估ADGRG6的表达模式、临床意义、分子调控机制、免疫调节作用和治疗潜力,并通过体外、共培养和体内实验验证其作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库(如TCGA、GTEx、GEO)的数据,实验验证集中在乳腺癌和胶质瘤细胞系,需要在更多癌症类型和临床样本中进行验证 | 评估ADGRG6在多种癌症中的表达、预后价值和作为免疫治疗靶点的潜力 | 33种癌症类型,包括乳腺癌(BRCA)、低级别胶质瘤(LGG)、肺鳞状细胞癌(LUSC)和胰腺癌(PAAD)等 | 生物信息学 | 泛癌 | 空间转录组学,体外细胞培养,共培养实验,体内实验 | NA | 基因表达数据,临床数据,空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和空间转录组学数据库的多种癌症样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 294 | 2025-12-12 |
Study design and rationale for the NeoTRACE trial: a multicenter phase II study of neoadjuvant sacituzumab govitecan plus zimberelimab followed by adjuvant zimberelimab with or without sacituzumab govitecan in patients with resectable non-small cell lung cancer
2025-Dec, Future oncology (London, England)
DOI:10.1080/14796694.2025.2591213
PMID:41268635
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研究论文 | 本文介绍了NeoTRACE试验的设计与原理,这是一项评估新辅助sacituzumab govitecan联合zimberelimab在可切除非小细胞肺癌中疗效的多中心II期研究 | 评估铂类豁免方案(sacituzumab govitecan联合PD-1抑制剂)在可切除NSCLC中的新辅助应用,并探索ctDNA动态、TROP2表达和空间转录组学作为生物标志物 | 单臂II期研究设计,样本量较小(计划50名参与者),缺乏随机对照,且辅助治疗方案由医生酌情决定,可能引入偏倚 | 提高可切除非小细胞肺癌患者的病理完全缓解率,减少毒性,增强手术资格,并通过个性化辅助治疗改善长期预后 | 可切除的II期至IIIB(N2)非小细胞肺癌患者,无已知EGFR/ALK突变 | NA | 肺癌 | 循环肿瘤DNA动态分析、TROP2表达检测、空间转录组学 | NA | 临床数据、分子生物标志物数据 | 计划招募50名参与者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 295 | 2025-12-12 |
Integrated bioinformatics and in vitro validation reveal TUBB as a core gene and therapeutic target in NAFLD-related hepatocellular carcinoma
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.149026
PMID:41271048
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研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和体外实验验证,揭示了TUBB基因是NAFLD相关肝细胞癌的核心基因和治疗靶点 | 首次通过整合多组学数据和多种机器学习算法,结合单细胞RNA测序和体外药物验证,系统性地识别了NAFLD向HCC转变过程中的核心基因TUBB及其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,体外实验验证仍需进一步的体内实验和临床研究支持 | 探究非酒精性脂肪肝病向肝细胞癌转变的分子机制,并寻找潜在的诊断标志物和治疗靶点 | NAFLD和HCC相关的转录组数据及HCC细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 | 加权基因共表达网络分析, 多种机器学习算法 | 转录组数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的NAFLD和HCC转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2025-11-26 |
From slices to deep dishes: spatial transcriptomics and translatomics of thick tissue blocks
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02815-y
PMID:41286202
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 297 | 2025-12-12 |
Scalable spatial single-cell transcriptomics and translatomics in 3D thick tissue blocks
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02867-0
PMID:41286200
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研究论文 | 开发了Deep-STARmap和Deep-RIBOmap技术,用于在60-200微米厚的组织块中进行3D空间单细胞转录组和翻译组分析 | 首次实现了在厚组织块中进行3D空间单细胞转录和翻译活动的原位定量分析,突破了现有技术仅限于薄切片的限制 | NA | 揭示基因在健康和疾病状态下如何塑造组织结构和功能 | 小鼠大脑和人类皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间单细胞转录组学, 空间翻译组学 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2025-12-12 |
FX-Cell: a method for single-cell RNA sequencing on difficult-to-digest and cryopreserved plant samples
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02900-2
PMID:41310055
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研究论文 | 本文开发了FX-Cell方法及其衍生技术,用于对难以消化和冷冻保存的植物样本进行单细胞RNA测序 | 通过优化固定缓冲液和减少RNA降解,该方法能在高温下实现高效细胞壁消化,并在长期冷冻保存后保持高质量单细胞,避免了使用不具代表性的细胞核 | NA | 解决植物单细胞RNA测序中样本难以消化和野外条件下及时制备原生质体的挑战 | 水稻分蘖节、野生稻根茎和玉米冠根等植物组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 299 | 2025-12-12 |
Chemosensory protein 3 is a brain host factor for the induction of enhanced-locomotory activity in the BmNPV-silkworm infection model
2025-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013701
PMID:41325423
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了家蚕核型多角体病毒感染后,化学感受蛋白3作为脑内宿主因子调控幼虫增强运动行为的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下解析病毒感染对昆虫脑部的影响,发现化学感受蛋白3在调控病毒感染诱导的行为变化中的新功能,并证实其通过结合神经递质和脂质发挥作用 | 研究主要聚焦于感染后96小时的时间点,缺乏感染过程的动态观察;体外结合实验未能完全模拟体内复杂环境 | 探究杆状病毒感染诱导昆虫行为变化的宿主调控因子及其分子机制 | 家蚕幼虫及其脑组织细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒传染病 | 单核RNA测序,靶向代谢组学,结构建模,分子动力学模拟,体外结合实验 | NA | 单细胞转录组数据,代谢组数据,蛋白质结构数据 | 家蚕幼虫脑组织(具体数量未明确说明) | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-12-03 |
Next-generation method for preparing plant cells for single-cell RNA sequencing
2025-Dec, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02940-8
PMID:41326821
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |