单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1237 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-01-10
Sex-dimorphic reprogramming of fetal mouse brain development by maternal estradiol excess
2025-Dec-02, Biology of sex differences IF:4.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,系统分析了母体高雌激素暴露对小鼠胎儿大脑发育的性别二态性影响 首次结合空间转录组学与细胞类型鉴定,揭示了母体高雌激素暴露导致胎儿大脑基因表达、信号通路和调控子活性的性别特异性变化,并发现了雄性大脑皮层神经祖细胞增殖-分化平衡的特定破坏 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;空间转录组学分辨率可能有限,未能捕捉所有细胞亚型的细微变化 探究母体高雌激素暴露如何导致胎儿大脑发育的性别二态性重编程,以理解神经发育障碍的机制 小鼠胎儿大脑组织 空间转录组学 神经发育障碍 空间转录组学,免疫荧光 NA 空间转录组数据,图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
282 2026-01-10
HCMV immediate-early protein IE2 induces neurotoxicity and hearing loss by disrupting TSC2-mTOR signaling and metabolic homeostasis
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了人巨细胞病毒(HCMV)立即早期蛋白IE2通过破坏TSC2-mTOR信号通路和代谢稳态,导致神经毒性和听力损失的机制 首次发现HCMV IE2蛋白通过直接与TSC2相互作用,导致mTOR信号过度激活、代谢失调和线粒体功能障碍,从而引起听力损失,并证明mTOR抑制剂可缓解这些缺陷 研究主要基于转基因小鼠模型,其在人类HCMV感染中的直接相关性仍需进一步验证 探究HCMV立即早期蛋白IE1和IE2在感觉神经性听力损失(SNHL)中的作用及机制 表达HCMV IE1和IE2蛋白的转基因小鼠模型 数字病理学 感觉神经性听力损失 scRNA-seq, 透射电子显微镜 转基因小鼠模型 基因表达数据, 图像数据 转基因小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
283 2026-01-10
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2025-Dec-01, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液(PBS-M),用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 开发了一种低盐度磷酸盐缓冲液(PBS-M),通过添加D-甘露醇来维持高盐度海洋细胞的活力,从而提高scRNA-seq的数据质量和细胞代表性 研究仅在海鞘类物种中进行了验证,尚未在其他海洋生物中广泛测试 优化单细胞RNA测序技术,以更好地应用于高盐度海洋生物的研究 海鞘Ciona robusta的血液细胞以及第二种海鞘物种 单细胞测序 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及海鞘的血液细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
284 2026-01-10
Leveraging two novel droplet-based single-cell RNA Sequencing platforms: a comparative study with 10x genomics
2025-Dec-01, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文对两种新型液滴式单细胞RNA测序平台(SeekOne和MobiDrop)与广泛使用的10x Genomics平台进行了比较研究 首次独立比较了SeekOne和MobiDrop这两种新兴液滴式单细胞RNA测序平台与行业标准10x Genomics的性能差异 研究仅基于特定样本类型进行,可能未涵盖所有生物对象或实验条件,且比较范围有限 评估不同单细胞RNA测序平台的性能,以帮助研究者选择最适合其研究需求的平台 不同复杂度和质量的细胞悬浮液样本 单细胞测序技术 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确指定具体样本数量,但涉及多种样本类型 10x Genomics, SeekOne, MobiDrop 单细胞RNA-seq 10x Chromium, SeekOne平台, MobiDrop平台 液滴式高通量单细胞RNA测序平台,包括10x Chromium系统及两种新型替代平台
285 2026-01-10
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-Dec, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为ASPEN的统计方法,用于在单细胞转录组数据中建模等位基因均值和方差,以提高等位基因动态检测的灵敏度 ASPEN结合了敏感映射流程、调节贝塔二项式模型和自适应收缩技术,能有效区分单细胞中的等位基因失衡和等位基因方差变化,相比现有方法灵敏度提升约30% 未在摘要中明确提及 开发一种统计方法以在单细胞RNA-seq数据中稳健检测等位基因动态,特别是等位基因失衡和方差变化 F1杂交小鼠的脑类器官和T细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA-seq 调节贝塔二项式模型 单细胞转录组数据 未在摘要中明确提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
286 2026-01-10
[Molecular targets of Shenyan Fangshuai Liquid in treating diabetic kidney disease based on transcriptomics]
2025-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
研究论文 本研究基于肾脏组织转录组学,探讨了肾炎防衰液治疗糖尿病肾病的分子靶点 结合转录组测序、WGCNA分析和单细胞测序数据,首次系统鉴定了肾炎防衰液干预糖尿病肾病的关键枢纽基因及其在细胞类型中的特异性表达模式 研究基于小鼠模型,结果需在人类临床样本中进一步验证;机制研究主要依赖生物信息学分析,缺乏深入的实验功能验证 阐明肾炎防衰液治疗糖尿病肾病的分子作用机制 C57BL/6J小鼠的糖尿病肾病模型 转录组学 糖尿病肾病 RNA-Seq测序、RT-qPCR、单细胞测序数据分析 NA 转录组测序数据、单细胞测序数据 72只C57BL/6J小鼠(分为6组,每组12只) NA RNA-seq, 单细胞测序 NA NA
287 2026-01-09
Whole-heart 3D reconstruction of mouse CVB3 myocarditis reveals spatial and transcriptomic heterogeneity of immune foci
2025-Dec-31, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过一种名为CODA的新型大组织学重建工作流程,生成了小鼠CVB3心肌炎的全心脏3D重建,并结合免疫组化染色和空间RNA测序,揭示了心肌炎炎症灶在空间、形态、免疫和转录组学上的异质性 开发了CODA工作流程,首次实现了急性小鼠CVB3心肌炎在单细胞分辨率下的全心脏3D重建,并整合了空间转录组学分析,揭示了免疫灶的空间和转录组异质性 研究主要基于小鼠模型,虽然展示了与人类扩张型心肌病的可转化性,但直接应用于临床仍需进一步验证 研究心肌炎炎症灶的空间、形态、免疫和转录组学异质性 小鼠CVB3心肌炎模型 数字病理学 心血管疾病 空间RNA测序、免疫组化染色、流式细胞术、qRT-PCR NA 图像、转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
288 2026-01-09
Transcription factor activity-based stratification reveals prognostic subtypes and immune landscape in neuroblastoma
2025-Dec-31, Translational pediatrics IF:1.5Q2
研究论文 本研究通过转录因子活性分析,揭示了神经母细胞瘤的预后亚型及其与肿瘤免疫微环境的关联 首次系统性地基于转录因子活性对神经母细胞瘤进行分层,开发了TF_score预后评分,并整合了免疫微环境分析 研究依赖于公共数据集,样本量有限,且未进行实验验证 开发并验证基于转录因子活性的神经母细胞瘤预后评分系统,并探讨其与免疫微环境的关系 498例原发性神经母细胞瘤肿瘤样本 生物信息学 神经母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Cox回归, 共识聚类, Boruta引导的主成分分析 基因表达数据 498例原发性神经母细胞瘤肿瘤样本(GSE49710),外加223例外部验证样本(E-MTAB-8248) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
289 2026-01-09
A complete spatial map of mouse retinal ganglion cells reveals density and gene expression specializations
2025-Dec-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学和机器学习技术,绘制了小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)的完整空间分布图,揭示了其密度和基因表达的特化模式 首次整合en-face冷冻切片、空间转录组学和机器学习方法,全面映射所有已知RGC类型的空间分布,并发现基因表达在特定区域(如ART)内的独立变异 研究主要基于小鼠模型,与灵长类中央视觉特化的比较显示有限相关性,可能限制跨物种推论的普适性 探究小鼠视网膜神经节细胞的空间分布特化及其与视觉功能的关系 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs) 空间转录组学 NA 空间转录组学,机器学习 机器学习 空间转录组数据,图像数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
290 2026-01-09
Overcoming impaired antigen presentation in tumor-draining lymph nodes facilitates immunotherapy
2025-Dec-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了乳腺癌如何通过降低引流淋巴结中的IL-1β细胞因子来损害树突状细胞的抗原呈递功能,并提出通过向远离肿瘤的淋巴结递送免疫佐剂或恢复IL-1β水平来克服这一障碍,从而增强抗肿瘤免疫反应 首次系统阐明了肿瘤通过改变引流淋巴结的细胞因子环境(特别是IL-1β减少)来损害抗原呈递的具体机制,并创新性地提出并验证了两种靶向性治疗策略:向肿瘤远端淋巴结递送免疫佐剂,以及通过瘤内注射恢复IL-1β 研究主要基于小鼠乳腺癌模型,其结论在人类癌症中的普适性有待验证;所提出的治疗策略(如向特定淋巴结递送佐剂)的临床转化路径和可行性尚需进一步探索 探究肿瘤如何损害引流淋巴结的抗原呈递功能,并寻找克服此障碍以增强免疫治疗效果的方法 小鼠乳腺癌模型、肿瘤引流淋巴结、树突状细胞、抗原特异性T细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 流式细胞术、免疫荧光、共聚焦成像、单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据、细胞表型数据、成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
291 2026-01-09
Single-Cell Transcriptome Analysis of the Retina During the Development of Normal Tension Glaucoma in Mice
2025-Dec-28, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析OPTN E50K突变小鼠视网膜,揭示了正常眼压性青光眼发展过程中视网膜神经节细胞和胶质细胞的转录特征及相互作用 首次在单细胞水平系统分析正常眼压性青光眼小鼠模型中视网膜细胞的基因表达谱,并识别了CD74-MIF通路在疾病进展中的关键作用 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类疾病;样本量相对有限;未涉及所有视网膜细胞类型 探究正常眼压性青光眼发展过程中视网膜神经节细胞退行性变的分子机制和细胞间相互作用 OPTN E50K突变小鼠的视网膜细胞 数字病理学 青光眼 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 不同年龄的OPTN E50K突变小鼠视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
292 2026-01-09
Single cell transcriptomic profiling uncovers shared inflammatory pathways and immune dysregulation underlying the asthma to lung cancer transition
2025-Dec-24, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肺癌免疫细胞亚群的复杂空间分布特征,并识别了CXCL12-CXCR4信号轴在免疫调控中的关键作用 结合单细胞转录组学与空间分析技术,系统解析了肺癌免疫微环境中细胞亚群的时空动态变化及关键基因表达模式 研究主要基于单细胞测序数据,缺乏体内功能验证实验,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究肺癌免疫微环境中免疫细胞的时空行为及关键基因表达,以揭示疾病进展机制并寻找治疗靶点 肺癌组织中的免疫细胞(如肿瘤相关巨噬细胞和细胞毒性T细胞)及肺癌细胞系 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,qRT-PCR UMAP,t-SNE 单细胞转录组数据,基因表达数据 未明确说明样本数量,但涉及肺癌组织及细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
293 2026-01-09
Dual regulation of Atf3 and Lonp1 as therapeutic targets in cerebral ischaemia-reperfusion injury
2025-Dec-23, Stroke and vascular neurology IF:4.4Q1
研究论文 本研究探讨了Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的双重调控作用及其作为治疗靶点的潜力 首次结合单细胞转录组学和蛋白质组学分析,揭示了Atf3通过调控Lonp1表达影响线粒体功能和神经元存活的分子机制 未明确说明样本的具体来源(如动物模型或人类组织)及样本量,且实验验证部分在摘要中未详细描述 探究Atf3和Lonp1在脑缺血再灌注损伤中的作用机制,以开发有效的治疗策略 脑缺血再灌注损伤相关的神经元和分子通路 神经科学 脑血管疾病 单细胞转录组学,蛋白质组学 NA 转录组数据,蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
294 2026-01-09
MIF Regulates the Th17/Treg Ratio to Exacerbate Kidney Injury in Chronic Kidney Disease
2025-Dec-23, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究探讨了巨噬细胞迁移抑制因子(MIF)通过调节Th17/Treg比例加剧慢性肾病肾损伤的机制 首次在单细胞水平上揭示了MIF通过MIF-(CD74+CXCR4)通路调控Th17/Treg比例,并证实肾组织特异性MIF抑制能逆转肾损伤 样本量相对较小(15例CKD患者和20例健康人进行单细胞测序),且主要基于相关性分析,需要更多机制研究验证 研究MIF介导的Th17/Treg比例变化对慢性肾病肾损伤的影响 慢性肾病患者、健康个体、5/6肾切除小鼠模型 免疫学 慢性肾病 单细胞测序、流式细胞术、动物模型 动物模型(5/6肾切除小鼠) 单细胞测序数据、流式细胞数据、临床参数 15例CKD患者和20例健康人(单细胞测序),20例CKD患者和10例健康人(流式细胞分析) NA NA NA NA
295 2026-01-09
Physical activity decreases cancer burden by alleviating immunosenescence-related inflammation and improving overall immunity
2025-Dec-16, Cell reports. Medicine
研究论文 本研究通过队列研究和实验分析,揭示了体育锻炼通过减轻炎症、减少免疫衰老和增强整体免疫力来降低癌症风险的机制 首次通过大规模队列和单细胞测序等实验,系统性地证明了体育锻炼剂量依赖性地降低系统性炎症,从而减少炎症相关癌症风险和全癌死亡率,并阐明了其分子机制 研究主要基于观察性队列和动物模型,人类因果关系的直接证据有限,且具体运动类型和强度的优化方案需进一步探索 探究体育锻炼与癌症发病率及死亡率之间的关联及其潜在机制 英国和美国的443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 生物医学研究 癌症 单细胞测序, RNA测序, 细胞计数术, 炎症阵列 NA 队列数据, 基因表达数据, 细胞表型数据 443,768名成年人,以及小鼠和仓鼠动物模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
296 2026-01-09
A conserved differentiation programme facilitates inhibitory neuron production in the developing mouse and human cerebellum
2025-Dec-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠和人类小脑发育中表达巢蛋白的祖细胞向抑制性神经元分化的保守分子机制 首次在小鼠和人类小脑发育中鉴定FOXO1作为ASCL1下游关键调控因子,并揭示WNT信号通路促进ASCL1+向FOXO1+细胞状态转变的保守机制 研究主要基于体外培养系统,体内验证不足;人类样本可能有限,未全面评估其他细胞类型或信号通路的影响 探究哺乳动物小脑发育中抑制性神经元产生的分子机制和转录因子协同作用 新生小鼠小脑和人类原代培养的表达巢蛋白的祖细胞 发育生物学 脊髓小脑性共济失调 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,涉及小鼠和人类原代培养细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
297 2026-01-09
Identification and validation of efferocytosis-related biomarkers for the diagnosis of atherosclerosis based on bioinformatics and machine learning
2025-Dec-15, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过生物信息学和机器学习方法,识别并验证了与动脉粥样硬化诊断相关的胞葬作用生物标志物 结合机器学习筛选出5个潜在诊断生物标志物,并利用单细胞RNA测序和细胞实验验证其在动脉粥样硬化巨噬细胞中的特异性上调 研究主要基于公共数据库数据,外部验证样本有限,且未深入探讨生物标志物的具体作用机制 识别和验证与动脉粥样硬化诊断相关的胞葬作用生物标志物,并构建临床预测模型 动脉粥样硬化样本和对照样本的基因表达数据 生物信息学 心血管疾病 基因表达分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、功能富集分析、机器学习、免疫浸润分析、单细胞RNA测序、细胞实验 机器学习模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
298 2026-01-09
Exploring the role of PANoptosis in idiopathic pulmonary fibrosis based on scRNA-seq and bulk-seq
2025-Dec-10, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,探讨了PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 首次将PANoptosis(一种整合了焦亡、凋亡和坏死性凋亡的新型程序性细胞死亡形式)与特发性肺纤维化联系起来,并基于相关基因构建了诊断预测模型 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大规模的人类临床样本中进行验证 阐明PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 特发性肺纤维化患者和动物模型 生物信息学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序,转录组测序,qRT-PCR WGCNA,机器学习方法 基因表达数据 基于GEO数据集GSE227136(具体样本数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
299 2026-01-09
IL-15 signaling via cis- and trans-presentation to progenitor-exhausted CD8+ T cells enhances radio-immunotherapy efficacy in ESCC
2025-Dec-01, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究探讨了IL-15信号通过顺式和反式呈递给祖细胞耗竭CD8+ T细胞,以增强食管鳞状细胞癌(ESCC)放疗-免疫联合疗法疗效的机制 揭示了IL-15在ESCC肿瘤微环境中的关键作用,明确了其通过顺式/反式呈递激活祖细胞耗竭CD8+ T细胞的空间依赖性机制,并首次提出IL-15可作为预测放疗联合免疫治疗疗效的生物标志物 研究主要基于临床队列和临床前小鼠模型,需要更大规模的前瞻性临床试验验证IL-15作为生物标志物的可靠性 探究IL-15在食管鳞状细胞癌(ESCC)放疗联合免疫治疗中的作用机制,并评估其作为疗效预测生物标志物的潜力 接受放疗和免疫治疗的ESCC患者队列、患者血液和组织样本、临床前小鼠模型 肿瘤免疫学 食管鳞状细胞癌 ELISA、流式细胞术、单细胞RNA测序、空间分析 临床队列分析、临床前小鼠模型 蛋白质表达数据、细胞表型数据、单细胞转录组数据、空间分布数据 ESCC患者临床队列(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
300 2026-01-09
Expression of Opioid Growth Factor,Opioid Growth Factor Receptor,P16,and P21 and Their Correlations With Clinicopathological Characteristics in Elderly Patients With Colorectal Cancer
2025-Dec, Zhongguo yi xue ke xue yuan xue bao. Acta Academiae Medicinae Sinicae
研究论文 本研究探讨了阿片样生长因子(OGF)、其受体(OGFR)以及P16和P21在老年结直肠癌患者中的表达情况,并分析了它们与临床病理特征及预后的相关性 首次在老年结直肠癌患者中综合分析了OGF/OGFR信号通路与细胞周期调控蛋白P16、P21的关联,并结合生物信息学分析(包括单细胞RNA测序和空间转录组学)与多种实验方法(ELISA、Western blot、免疫组化)进行验证 研究样本量相对有限(共167例),且为单中心回顾性研究,可能存在选择偏倚;未深入探讨OGF/OGFR通路抑制P16/P21的具体分子机制 探究OGF、OGFR、P16和P21在老年结直肠癌中的表达模式及其与临床病理特征和患者预后的关系 老年结直肠癌患者的癌组织及癌旁正常组织 数字病理学 结直肠癌 ELISA, Western blot, 免疫组织化学, 生物信息学分析(差异表达分析、生存分析) NA 组织样本(新鲜组织、石蜡包埋组织)、基因表达数据 167例老年结直肠癌患者(30例新鲜组织样本,137例石蜡包埋组织样本) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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