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当前共找到 764 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2025-12-12
SEPAR enables spatial metagene discovery and associated molecular pattern characterization in spatial transcriptomics and multi-omics datasets
2025-Dec-10, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 介绍了一种名为SEPAR的无监督框架,用于通过整合基因活性和空间邻域关系分析空间转录组学数据,以发现空间元基因并表征相关分子模式 SEPAR框架通过利用空间元基因分析SRT数据,能够识别由特定基因子集驱动的局部结构,而现有方法多关注全局空间域 NA 解决空间转录组学数据解释中理解空间细胞和分子组织的挑战 空间转录组学及空间多组学数据集 空间转录组学 NA 空间转录组学,空间多组学 无监督框架 基因表达数据,空间多组学数据 NA NA 空间转录组学,空间多组学 NA NA
262 2025-12-12
A trispecific antibody engaging T cells with tumour and myeloid cells augments antitumour immunity
2025-Dec-10, Nature biomedical engineering IF:26.8Q1
研究论文 本研究开发了一种靶向B7H3、CD3和PDL1的三特异性抗体,用于重定向T细胞并减轻免疫抑制,以增强抗肿瘤免疫 通过分析单细胞RNA测序数据,识别了多种恶性肿瘤中功能受限的旁观者T细胞,并设计了首个同时靶向肿瘤细胞、T细胞和免疫检查点的三特异性抗体,结合机器学习模型预测患者反应 研究主要基于体外和动物模型验证,临床疗效和安全性尚未在人体试验中全面评估 增强免疫无响应肿瘤的抗肿瘤免疫,克服免疫检查点抑制剂耐药性 卵巢癌、结直肠癌等17种肿瘤类型中的T细胞和肿瘤微环境 机器学习 卵巢癌、结直肠癌 单细胞RNA测序、成像流式细胞术、机器学习 机器学习模型 单细胞转录组数据、细胞毒性数据 300名患者,覆盖17种肿瘤类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
263 2025-12-12
Single cell transcriptional perturbome in pluripotent stem cell models
2025-Dec-10, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为iPS2-seq的可诱导、克隆感知筛选平台,用于在人类诱导多能干细胞衍生物中进行单细胞水平的功能基因组学研究 开发了iPS2-seq平台,能够区分真实的扰动效应与遗传和表观遗传变异,支持多种格式并与单细胞RNA测序技术整合 NA 在人类诱导多能干细胞模型中进行功能基因组学筛选,以研究基因功能丧失效应 人类诱导多能干细胞及其衍生物,包括单层心肌细胞和类器官 单细胞组学 先天性心脏病 单细胞RNA测序,多组学分析 NA 单细胞转录组数据,染色质和蛋白质数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单细胞多组学 NA NA
264 2025-12-12
Modelling the metastatic immune microenvironment in triple-negative breast cancer
2025-Dec-10, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究使用4T1.2和67NR小鼠乳腺癌细胞系,通过比较乳腺脂肪垫原位注射与乳腺导管内注射两种方法,模拟三阴性乳腺癌的转移免疫微环境 揭示了注射方法对肿瘤转移潜力、进展及肿瘤微环境共演化的影响,特别是导管内注射能更好地模拟早期肿瘤发生事件并保留组织微环境 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类三阴性乳腺癌的复杂性 探究三阴性乳腺癌转移免疫微环境的建模方法及其对肿瘤进展的影响 4T1.2和67NR小鼠乳腺癌细胞系及其在免疫活性小鼠模型中的肿瘤微环境 肿瘤免疫学 乳腺癌 靶向单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用两种小鼠乳腺癌细胞系(4T1.2和67NR)在免疫活性小鼠模型中进行的实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
265 2025-12-12
CYP27A1 suppresses brain metastasis via ferroptosis in lung adenocarcinoma: a six-gene signature predicting the immunotherapy response and clinical outcomes
2025-Dec-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别了与肺腺癌脑转移相关的关键基因,构建了一个六基因风险模型,并验证了CYP27A1通过铁死亡抑制脑转移的机制 首次发现CYP27A1通过调控铁稳态和脂质过氧化诱导铁死亡来抑制肺腺癌脑转移,并构建了一个基于六基因的风险模型用于预测免疫治疗反应和临床预后 研究样本量有限,仅使用了4例患者的单细胞数据和TCGA队列的批量数据,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 识别肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建预后模型并评估免疫治疗反应 肺腺癌患者及其脑转移相关细胞 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 LASSO Cox回归模型 基因表达数据 4例肺腺癌患者的单细胞数据及TCGA-LUAD队列的批量RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
266 2025-12-12
Acute neuroinflammation induces prolonged transcriptional reprogramming in microglia
2025-Dec-10, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了急性神经炎症对小鼠小胶质细胞的长期转录影响,揭示了其在炎症消退后持续存在的疾病相关特征 首次通过单细胞RNA测序证明急性神经炎症可诱导小胶质细胞产生持久的转录重编程,并与人类神经退行性疾病状态重叠 观察期短于慢性神经退行性疾病的自然病程,可能未完全捕捉长期效应 探究急性神经炎症对小胶质细胞的长期影响及其与神经退行性疾病的潜在关联 小鼠模型中的小胶质细胞,以及人类多发性硬化症、阿尔茨海默病等神经炎症疾病的小胶质细胞数据 单细胞组学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
267 2025-12-12
A core stemness-associated module reveals PLK1, NUF2, KIF23, CDCA8, TOP2A, CENPF, AURKA, and ASPM as key genes in rectal cancer
2025-Dec-10, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学和高维共表达网络分析,在直肠癌中鉴定了一个与干细胞性相关的八基因核心模块,并验证了其诊断和预后价值 整合单细胞图谱构建与hdWGCNA分析,首次在直肠癌中定义了一个跨队列泛化的八基因癌症干细胞特征,并揭示了PLK1/AURKA激酶作为关键治疗靶点 研究主要基于体外实验,缺乏体内和临床验证,且样本量相对有限 识别直肠癌特异性癌症干细胞生物标志物和治疗靶点 直肠癌组织样本、癌症细胞系(SW620、Caco-2)及正常肠上皮细胞(HIEC-6) 数字病理学 直肠癌 单细胞RNA-seq、qRT-PCR、分子对接、伤口愈合实验、Transwell实验、CCK-8检测 hdWGCNA(高维加权基因共表达网络分析) 单细胞转录组数据、批量RNA-seq数据 单细胞数据集GSE199726、TCGA-READ队列、GEO GSE90627队列及体外细胞系实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
268 2025-12-12
GBP1 as a machine learning-prioritized biomarker and therapeutic target for epstein-barr virus-induced clear cell renal cell carcinoma: multi-omics causal validation
2025-Dec-10, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过孟德尔随机化、单细胞RNA测序和机器学习,揭示了EBV感染通过调节性T细胞和B细胞介导增加透明细胞肾细胞癌风险的因果机制,并确定GBP1为核心生物标志物和潜在治疗靶点 首次将孟德尔随机化、单细胞RNA测序与机器学习模型(SHAP框架)相结合,系统性地识别并验证了EBV诱导ccRCC的因果机制和核心靶点GBP1,并通过药物预测和分子对接提出了非那雄胺作为潜在抑制剂的新治疗策略 研究主要基于遗传学和计算生物学证据,缺乏体内或体外实验的功能性验证;药物预测结果需要进一步的临床前和临床研究确认 探索EBV在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制,并识别可操作的生物标志物和治疗靶点 EBV感染、透明细胞肾细胞癌、免疫细胞(调节性T细胞和B细胞)、候选基因(GBP1等) 机器学习 肾细胞癌 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 机器学习, 药物预测, 分子对接 机器学习模型(未指定具体类型,使用SHAP框架进行解释) 遗传数据, 单细胞RNA测序数据, 批量mRNA数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
269 2025-12-12
scCirclehunter delineates ecDNA-containing cells using single-cell ATAC-seq, with a focus on glioblastoma
2025-Dec-09, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究介绍了scCirclehunter框架,用于从单细胞ATAC-seq数据中识别ecDNA并分配到特定细胞群,聚焦于胶质母细胞瘤 开发了首个从单细胞ATAC-seq数据中识别ecDNA的框架scCirclehunter,实现了患者特异性ecDNA的单细胞精度分析 研究主要基于现有胶质母细胞瘤数据集,可能受数据质量和样本量限制,且ecDNA与线粒体转移频率的关联仅为初步发现 开发单细胞精度分析ecDNA的方法,以揭示ecDNA在胶质母细胞瘤异质性中的作用 胶质母细胞瘤患者来源的细胞,特别是携带ecDNA的恶性细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA 单细胞表观基因组数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
270 2025-12-12
Integrated multi-Omics and network toxicology elucidate the multi-target mechanisms of environmental hormones in driving hepatocellular carcinoma
2025-Dec-09, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过整合多组学与网络毒理学方法,系统揭示了环境激素通过多靶点、多通路机制驱动肝细胞癌发生发展的过程,并构建了一个九基因风险模型用于诊断、预后和药物敏感性预测 首次系统整合网络毒理学、多组学数据(包括单细胞转录组)和多种机器学习算法,从多靶点、多通路角度阐明环境激素在肝细胞癌中的作用机制,并构建了具有跨癌种适用性的预后模型 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,缺乏体内外实验验证;环境激素暴露的剂量和时间效应未详细探讨;模型在临床实际应用中的有效性有待进一步验证 阐明内分泌干扰物(EDCs)在肝细胞癌发生发展中的多靶点作用机制,并构建用于诊断、预后和药物敏感性预测的风险模型 肝细胞癌(HCC)相关的基因表达数据、患者临床数据、单细胞转录组数据以及环境激素的潜在靶点 生物信息学,计算生物学 肝细胞癌 网络毒理学预测,加权基因共表达网络分析(WGCNA),多种机器学习算法(如CatBoost),分子对接,分子动力学模拟,单细胞RNA测序分析 CatBoost,多变量Cox比例风险模型,多种机器学习算法(共14种) 基因表达数据(来自GEO, TCGA),单细胞转录组数据,药物敏感性数据(来自GDSC),临床数据 涉及来自GEO和TCGA-LIHC等多个公共数据库的肝细胞癌患者样本,具体数量未在摘要中明确说明,但包含用于模型构建和验证的队列 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
271 2025-12-12
Single-cell transcriptomics unveils atrazine's impact on neurons and microglia in C57BL/6 mice
2025-Dec-09, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了环境相关剂量的除草剂阿特拉津通过破坏神经元-小胶质细胞相互作用,诱导帕金森病样病理的神经毒性机制 首次利用单细胞RNA测序技术,结合CellChat算法重建细胞间通讯网络,系统阐明了阿特拉津通过神经元钙稳态失调和小胶质细胞M1极化双重机制驱动神经退行性病变的新机制 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,未在人类样本或其他动物模型中验证;暴露时间为28天,未能评估长期暴露效应;样本量较小(每组n=6) 探究环境相关剂量阿特拉津暴露如何通过破坏神经元-小胶质细胞相互作用导致帕金森病样病理 C57BL/6小鼠的中脑组织 单细胞转录组学 帕金森病 单细胞RNA测序,定量实时PCR,组织病理学分析 CellChat算法 单细胞转录组数据,行为学数据,组织病理学图像 每组6只C57BL/6小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
272 2025-12-12
Single-cell sequencing and organoids: applications in organ development and disease
2025-Dec-08, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 本文系统探讨了单细胞测序与类器官技术在器官发育和疾病研究中的协同应用潜力 整合单细胞测序与类器官技术,构建生理相关的多功能研究平台,以高分辨率解析细胞异质性和动态行为,推动从描述性研究向机制驱动、精准导向和个性化方法的转变 NA 探索单细胞测序与类器官技术在生物医学研究中的整合应用,以加速疾病机制阐明和精准医学、再生医学的创新突破 器官发育机制(如脑、肺、心脏、肝、肠、肾)以及多种疾病的体外模型(如神经退行性疾病、遗传病、传染病、代谢综合征、肿瘤) NA 神经退行性疾病, 遗传病, 传染病, 代谢综合征, 肿瘤 单细胞测序, 空间转录组学, 基因编辑 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
273 2025-12-12
Interferon signaling pathways in health and disease
2025-Dec-08, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 本文全面综述了干扰素信号通路的分子机制及其在健康和疾病中的作用 系统整合了经典与非经典干扰素信号通路,并探讨了其在治疗策略中的双重应用及基于单细胞组学的个性化治疗前景 NA 概述干扰素信号通路的分子机制及其在免疫调节和疾病治疗中的临床意义 干扰素信号通路及其在健康与疾病状态下的功能 NA 自身免疫性疾病、神经炎症、心血管疾病、癌症 单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学 NA NA NA NA NA NA NA
274 2025-12-12
IER3 drives the transition from sepsis-associated AKI to CKD by suppressing the mitochondrial translocation of PRDX5
2025-Dec-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了IER3通过抑制PRDX5的线粒体转位,驱动脓毒症相关急性肾损伤向慢性肾病转变的机制 首次发现IER3通过抑制PRDX5的线粒体转位促进肾小管上皮细胞应激诱导衰老,从而加剧AKI向CKD的转变 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分,且具体信号通路细节有待进一步阐明 探究IER3在脓毒症相关急性肾损伤向慢性肾病转变中的作用机制 肾小管上皮细胞、小鼠模型、患者样本 分子生物学 肾脏疾病 scRNA-seq、RNA-seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、RNA测序 NA NA
275 2025-12-12
Heterogeneity of active mast cells, endothelial cells, and fibroblasts in hemophilic arthritis defined by synovial single-cell sequencing
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了血友病性关节炎滑膜的单细胞转录组图谱,识别了活化的肥大细胞和调控铁死亡的新型SCARA5+成纤维细胞亚群 首次绘制了血友病性关节炎滑膜的单细胞转录组图谱,发现了独特的肥大细胞活化现象和调控铁死亡的新型SCARA5+成纤维细胞亚群,揭示了HA中独特的细胞相互作用网络 研究样本来源于接受全膝关节置换术的患者,可能无法完全代表疾病早期或不同严重阶段的滑膜状态;样本量相对有限 探索血友病性关节炎滑膜的转录组特征,揭示其潜在的病理机制 血友病性关节炎患者的滑膜组织 单细胞组学 血友病性关节炎 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫荧光,免疫组化,体外细胞实验 NA 单细胞转录组数据,组织学图像数据 接受全膝关节置换术的血友病性关节炎患者的滑膜组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
276 2025-12-12
Ferritinophagy-related prognostic genes UBE2Q1, NEDD4L, and TCP11L2 for prognosis prediction in sepsis
2025-Dec-08, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据,识别出与脓毒症预后相关的铁蛋白自噬相关基因,并构建了一个基于UBE2Q1、NEDD4L和TCP11L2的风险预测模型 首次将铁蛋白自噬相关基因与脓毒症预后联系起来,并采用整合批量转录组、单细胞转录组和孟德尔随机化的多组学方法进行因果关联分析 研究结果为脓毒症发病机制提供了初步线索,但具体的分子机制和靶向治疗的可行性仍需进一步实验验证 识别脓毒症的预后生物标志物和潜在治疗靶点 脓毒症患者 生物信息学 脓毒症 批量转录组测序,单细胞RNA测序,孟德尔随机化 风险预测模型 基因表达数据(转录组) 涉及1047个候选基因,具体患者样本数未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
277 2025-12-12
Colorectal cancer organoids drive hypoxia, TGF-β, and patient-specific diversification of NK cell activation programs
2025-Dec-05, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究建立了一个结直肠癌患者来源类器官与原发性同种异体NK细胞共培养平台,以探索肿瘤微环境对NK细胞功能的影响 利用遗传多样性的结直肠癌患者来源类器官与NK细胞共培养,结合单细胞RNA测序数据,揭示了缺氧和TGF-β通路在NK细胞激活中的共同作用,并识别了患者特异性的NK细胞活化程序 研究基于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性;样本队列规模可能有限,需要进一步验证 探究结直肠癌肿瘤微环境中驱动NK细胞激活或抑制的分子机制,并开发患者定制化免疫疗法 结直肠癌患者来源类器官和原发性同种异体NK细胞 数字病理学 结直肠癌 RNA测序, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, IncuCyte活细胞成像分析, CRISPR-Cas9基因编辑 共培养平台 RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据, 活细胞成像数据 遗传多样性的结直肠癌患者来源类器官队列 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
278 2025-12-12
CD301b lectin expression in the breast tumor microenvironment augments tumor growth
2025-Dec-03, Research square
研究论文 本研究探讨了CD301b凝集素在乳腺癌微环境中的表达如何促进肿瘤生长 首次将肿瘤糖基化与CD301b凝集素信号传导联系起来,揭示了CD301b⁺免疫细胞(特别是cDC2s)通过髓系-肿瘤相互作用促进肿瘤进展的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅通过单细胞RNA测序分析,缺乏直接的体内功能验证 探究糖基化-凝集素相互作用对乳腺癌进展的影响,并识别潜在的免疫治疗靶点 三阴性乳腺癌小鼠模型和人类乳腺癌样本 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
279 2025-12-12
Sp3 ameliorated experimental autoimmune encephalomyelitis by triggering Socs3 in Th17 cells
2025-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了Sp3通过触发Th17细胞中的Socs3来改善实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的新机制 首次发现miR-223/Sp3/Socs3/TGF-β信号通路在Th17细胞分化中的调控作用,并揭示了Sp3与Socs3之间的反馈调节机制 研究主要在EAE动物模型中进行,临床转化价值需进一步验证;机制研究多依赖体外实验,体内复杂微环境的影响需更深入探讨 探索Sp3对Th17细胞介导的实验性自身免疫性脑脊髓炎的影响及其分子机制 实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)小鼠模型、Th17细胞、Sp3基因敲除小鼠 免疫学 多发性硬化症 scRNA-seq数据分析、流式细胞术、ELISA、PCR、Western blot、免疫荧光、报告基因技术 动物疾病模型(EAE) 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、分子生物学检测数据 未明确说明具体样本数量,使用Sp3+/+CD4Cre小鼠和Sp3+/-敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
280 2025-12-12
Neonatal sevoflurane exposures inhibits DHHC5-mediated palmitoylation of TfR1 in oligodendrocytes, leading to hypomyelination and neurological impairments
2025-Dec, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了新生儿期七氟烷暴露通过抑制少突胶质细胞中DHHC5介导的TfR1棕榈酰化,导致铁积累、铁死亡、髓鞘形成减少和神经功能损伤的机制 首次发现新生儿麻醉神经毒性的关键时期与TfR1的瞬时表达窗口相关,并阐明DHHC5-TfR1棕榈酰化轴在调控少突胶质细胞铁稳态和铁死亡中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证;机制研究集中在少突胶质细胞,其他神经细胞类型的贡献未充分探讨 阐明新生儿麻醉相关神经损伤的分子机制,重点关注铁稳态和少突胶质细胞功能 新生野生型及Pdgfrα-CreERT转基因小鼠的少突胶质细胞和胼胝体组织 神经科学 新生儿麻醉相关神经损伤 单细胞RNA测序、共免疫沉淀、酰基树脂辅助捕获测定、行为学测试、遗传调控 动物模型(小鼠) 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、行为学数据 未明确具体数量,使用P6-P8新生小鼠进行实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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