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当前共找到 1109 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-08 |
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-12, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10163-7
PMID:41028288
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍驱动慢性阻塞性肺疾病（COPD）的免疫代谢紊乱，并提供多变量因果证据 | 首次通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，鉴定CXCL16作为COPD的新因果机制，并揭示其通过影响免疫-代谢稳态驱动疾病进展 | 未提供具体局限性信息 | 识别COPD中由肺泡巨噬细胞功能障碍驱动的关键分子机制及其因果关系 | COPD患者和对照组的肺泡巨噬细胞及其特异性基因CXCL16 | 单细胞组学、免疫学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据（单细胞和批量RNA-seq） | 人类肺组织样本及1283个肺泡巨噬细胞特异性基因的遗传变异数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2026-05-08 |
Multi-omics dissection of RAD21-PON1 axis reveals metabolic-immune crosstalk and prognostic significance in hepatocellular carcinoma
2025-12, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10166-4
PMID:41143965
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示RAD21-PON1轴在肝细胞癌中的代谢-免疫串扰及预后意义 | 首次阐明RAD21作为黏连蛋白亚基通过调控PON1基因表达影响代谢重塑与免疫微环境，构建了RAD21-PON1风险特征用于预后分层 | 基于公开数据集的分析，缺乏独立临床队列验证；RAD21-PON1轴的直接调控机制需进一步实验验证 | 探究RAD21-PON1轴在肝细胞癌中整合代谢与免疫信号的机制及其预后价值 | 肝细胞癌患者的转录组、ChIP-seq和单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | 肝癌 | RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO | 转录组数据, 染色质免疫沉淀测序数据, 单细胞转录组数据 | 基于公开数据库的多组学数据集，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2026-05-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptome analysis reveals the functions of TREM2high macrophages and infarct border dynamics post-myocardial infarction
2025-Dec, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05317-9
PMID:40750734
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学，研究心肌梗死后TREM2高表达巨噬细胞的功能和梗死边界动态 | 首次整合单细胞和空间转录组分析，揭示了TREM2高表达巨噬细胞在心肌梗死后组织修复中的关键作用及其在梗死边界的动态变化 | 未提供 | 探究心肌梗死后细胞和分子水平的复杂动态变化，特别是免疫细胞的作用和调控网络 | 心肌梗死小鼠模型和缺血再灌注模型中的心肌细胞和免疫细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 转录组数据 | 未提供样本数量 | Illumina | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 10x Genomics | 10x Genomics 单细胞RNA测序和空间转录组学平台 |
| 244 | 2026-05-05 |
CrebA regulation of secretory capacity: genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-12-10, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/genetics/iyaf214
PMID:41052780
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体内DNA结合研究，探索果蝇CrebA转录因子对分泌能力的调控机制 | 将单细胞RNA测序与体内DNA结合研究结合，系统分析CrebA在胚胎组织中的转录调控网络，揭示其与靶基因结合位点与功能调控的关系 | 尚不清楚功能性结合与非功能性结合的区别，以及CrebA是否在所有胚胎组织中均为主要分泌途径基因表达驱动因子 | 研究CrebA转录因子在果蝇胚胎中调控分泌能力的作用机制及其保守性 | 果蝇胚胎唾液腺及CrebA空突变体胚胎 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、DNA结合分析、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | CrebA空突变体胚胎与野生型胚胎的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2026-05-03 |
CausalGRN: deciphering causal gene regulatory networks from single-cell CRISPR screens
2025-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.30.692369
PMID:41509211
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研究论文 | 提出CausalGRN算法框架，从单细胞CRISPR筛选数据中推断因果基因调控网络并预测未知扰动效应 | 通过自适应阈值校正消除稀疏单细胞RNA-seq数据中的虚假偏相关，结合扰动观测结果对无向图进行有向定向，实现因果关系推断 | 在多个实验数据集和模拟中验证，但未提及对大规模数据集的计算效率或罕见扰动类型的适用性限制 | 开发一种从单细胞CRISPR筛选数据推断因果基因调控网络的计算方法 | 单细胞CRISPR筛选数据中的基因调控网络 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR筛选 | 网络传播模型（自适应阈值校正及有向图定向） | 单细胞基因表达数据 | 在多种模拟和实验数据集上验证，具体样本数量未在摘要中提供 | 不适用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 不适用 | 不适用 |
| 246 | 2026-05-03 |
ABCA4-mutant human retinal organoids sequencing reveals organoids application in inherited retinal diseases
2025-Dec, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110677
PMID:41038369
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析ABCA4突变的人类视网膜类器官，验证其作为遗传性视网膜疾病模型的可行性 | 首次通过单细胞RNA测序在细胞和转录组水平验证人类视网膜类器官能够捕捉ABCA4突变导致的Stargardt病早期分子变异 | NA | 验证人类视网膜类器官作为ABCA4突变引起的Stargardt病疾病模型的能力 | 2名Stargardt病患者与健康对照的视网膜类器官 | 机器学习 | 遗传性视网膜疾病, 斯塔加特病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2个患者样本和健康对照的视网膜类器官 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 247 | 2026-05-02 |
APOBEC3 promotes squamous differentiation via IL-1A/AP-1 signaling
2025-Dec-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67033-8
PMID:41390483
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研究论文 | 该研究通过基因工程小鼠模型和人类膀胱癌样本，发现APOBEC3通过IL-1A/AP-1信号通路促进鳞状分化 | 首次揭示APOBEC3在膀胱癌中通过IL-1α和AP-1信号通路驱动鳞状分化的功能性作用，并鉴定APOBEC3A是人类中唯一与鳞状分化相关的家族成员 | 未明确提及，但可能涉及小鼠模型与人类疾病的完全一致性需进一步验证 | 探究APOBEC3家族在膀胱癌鳞状分化中的作用机制 | 基因工程小鼠模型（Pten和Trp53条件敲除并过表达小鼠Apobec3）及人类膀胱癌样本 | 癌症生物学 | 膀胱癌（尿路上皮癌） | 条件基因敲除、过表达、RNA测序、单细胞测序、空间转录组学 | 基因工程小鼠模型 | RNA测序数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 小鼠膀胱肿瘤样本及人类膀胱癌样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 248 | 2026-05-01 |
Single-cell and spatial transcriptome sequencing analysis reveals characteristics of a unique subpopulation in high-grade IDH-mutant astrocytoma
2025-Dec-29, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01139-5
PMID:41460424
|
研究论文 | 利用单细胞和空间转录组测序分析揭示高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个独特亚群的特征 | 首次通过单细胞和空间转录组测序联合分析，鉴定出高级别IDH突变型星形细胞瘤中一个具有免疫抑制表型、与不良预后相关的独特肿瘤细胞亚群 | NA | 识别高级别IDH突变型星形细胞瘤中独特的肿瘤细胞亚群及其特征 | 高级别（WHO 3-4级）和低级别（WHO 2级）IDH突变型星形细胞瘤样本 | 数字病理学 | 星形细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 249 | 2026-05-01 |
Igf2 regulates early postnatal DPP4+ preadipocyte pool expansion
2025-12-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352710.125
PMID:40930990
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了Igf2调控早期出生后DPP4+前脂肪细胞池扩展的机制 | 首次发现Igf2在早期生命阶段通过促进DPP4+前脂肪细胞增殖而非分化来驱动脂肪组织扩展 | 未提供具体局限性信息 | 阐明早期生命阶段促进脂肪组织快速扩展的分子机制 | 小鼠皮下脂肪组织中的DPP4+前脂肪细胞群体 | 单细胞转录组学 | 代谢健康肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠皮下脂肪组织样本（断奶前和成年小鼠） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 250 | 2026-05-01 |
αCGRP deficiency aggravates pulmonary fibrosis by promoting senescence in alveolar type 2 cells
2025-12, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00361-3
PMID:41023452
|
研究论文 | 本文探讨αCGRP（Calca）缺乏如何通过促进肺泡2型细胞衰老加剧肺纤维化 | 首次揭示αCGRP缺乏通过促进AT2细胞炎症性衰老加剧肺纤维化的机制，并采用单细胞RNA测序和标记自由蛋白质组学等多组学方法分析 | 未明确说明研究的局限性 | 探究αCGRP缺乏是否通过促进AT2细胞衰老加剧肺纤维化 | 肺纤维化患者样本及Calca基因敲除大鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 标记自由蛋白质组学, 免疫组化 | NA | 组织切片, RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 15名肺纤维化患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2026-05-01 |
Cancer-associated fibroblast miR-148a-5p/CALD1/collagen VI pathway promotes proliferation in Helicobacter pylori-positive gastric cancer
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01116-y
PMID:41171370
|
研究论文 | 发现幽门螺杆菌刺激的癌症相关成纤维细胞通过miR-148a-5p/CALD1/VI型胶原通路促进胃癌增殖 | 首次揭示幽门螺杆菌刺激的癌症相关成纤维细胞中TLR/miR-148a-5p/CALD1/VI型胶原信号通路在幽门螺杆菌阳性胃癌中的关键作用，并验证miR-148a-5p agomir作为化疗增敏剂的潜力 | 缺乏关于幽门螺杆菌对癌症相关成纤维细胞影响或治疗干预靶点的研究 | 研究幽门螺杆菌阳性胃癌中癌症相关成纤维细胞促进肿瘤增殖的机制及潜在治疗靶点 | 幽门螺杆菌阳性胃癌患者及小鼠模型 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞测序，转录组测序，微RNA测序 | NA | 测序数据，细胞系，小鼠模型 | 公开微RNA和转录组测序数据，单细胞测序数据，以及体外和体内模型 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 252 | 2026-05-01 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学揭示Merkel细胞癌中表皮与真皮肿瘤细胞的基因表达差异，强调微环境对肿瘤细胞表型可塑性的影响 | 首次通过高分辨率空间转录组学比较Merkel细胞癌中表皮亲嗜性肿瘤细胞与真皮肿瘤细胞的转录组特征，发现微环境可诱导肿瘤细胞向角质细胞分化 | 未提及具体局限性 | 研究微环境对Merkel细胞癌细胞表型可塑性的调节作用 | Merkel细胞癌的表皮亲嗜性肿瘤细胞、肿瘤核心及血管旁肿瘤细胞 | 数字病理学 | Merkel细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 高分辨率空间转录组学平台及单细胞转录组学平台 |
| 253 | 2026-05-01 |
Transcriptomic Analysis of Skeletal Muscle Systems Comparing Bovines, Humans, and Mice Using scRNA-Seq
2025-12, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70035
PMID:41335100
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序对牛、人类和小鼠的骨骼肌系统进行转录组分析，构建了从产前到产后发育的完整单细胞图谱并比较了跨物种的转录组特征 | 首次构建了牛骨骼肌发育的完整单细胞景观，并系统比较了牛、人类和小鼠三物种在细胞类型、基因表达和调控元件上的进化保守性与物种特异性差异 | 部分细胞谱系的功能和发育程序仍不明确，研究仅基于单细胞转录组数据，缺乏对非编码调控元件或表观遗传修饰的深入分析 | 揭示哺乳动物骨骼肌发育过程中保守和分化的分子机制 | 牛、人类和小鼠的骨骼肌组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 包含牛产前到产后发育阶段的骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 254 | 2025-12-12 |
Fibroblasts in the tumor microenvironment: heterogeneity and dynamic interactions in tumor progression revealed by spatial transcriptomics
2025-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-025-01108-y
PMID:41129052
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 255 | 2026-04-30 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adl1988
PMID:40997217
|
研究论文 | 本研究结合全基因组表观组图谱、表观基因组编辑、表型及单细胞RNA测序CRISPR筛选，发现了一类对机械微环境响应的基因组增强子，并探究其如何通过表观遗传调控影响细胞功能及疾病相关基因 | 首次鉴定出对细胞外基质软硬度响应的“机械增强子”，并通过表观遗传编辑重编程细胞对机械微环境的响应 | 未提及具体局限性 | 探究机械微环境如何通过表观遗传状态调控转录，并识别响应机械信号的基因组增强子 | 肺成纤维细胞（来自健康及纤维化供体） | 表观遗传学、单细胞组学 | 纤维化疾病 | 全基因组表观组学、表观基因组编辑、单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | 表观组数据、单细胞转录组数据 | 健康及纤维化供体的肺成纤维细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 256 | 2026-04-30 |
Spatial Dynamics of Tumor Cell Plasticity in Lung Adenocarcinoma Revealed by Region-Specific Single Cell Transcriptomics
2025-12, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70101
PMID:41454525
|
研究论文 | 通过区域特异性单细胞转录组学揭示肺腺癌中肿瘤细胞可塑性的空间动态 | 首次在单个肺腺癌肿瘤的不同区域（核心、核心旁、边缘）进行单细胞RNA测序，系统刻画了EMT和干性特征的空间异质性，并发现与预后相关的生物标志物PCBP1和PA2G4 | 样本仅来自单个肺腺癌患者，可能限制了结论的普适性；EMT与干性之间的相关性较弱（R=0.17），需进一步验证 | 研究肺腺癌中肿瘤细胞可塑性（EMT和干性）的空间分布及其与预后的关联 | 肺腺癌患者的肿瘤组织样本（10个肿瘤片段来自3个区域） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1例肺腺癌患者的10个肿瘤片段（核心、核心旁、边缘各若干个） | BGI | 单细胞RNA测序 | SURFSeq 5000 | BGI SURFSeq 5000测序平台进行单细胞RNA测序 |
| 257 | 2026-04-29 |
UV induces common cutaneous amyloid-like melanosomal protein aggregates
2025-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.17.689083
PMID:41446198
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研究论文 | 研究表明紫外线诱导黑色素细胞中α-突触核蛋白等形成类淀粉样蛋白聚集体，导致常见色素性疾病和光老化 | 发现紫外线以类朊病毒方式诱导黑色素体蛋白自传播聚集，并首次将黑色素体蛋白病与常见色素异常和光老化联系起来 | 未提及具体局限性 | 阐明紫外线诱导黑色素体蛋白聚集的机制及其在色素性疾病中的作用 | 黑色素细胞、小鼠模型、临床色素性病变样本 | 数字病理学 | 色素性疾病, 帕金森病, 光老化 | RT-QuIC, CUT&RUN, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 电子显微镜 | NA | 图像, 文本 | 多种临床色素性病变样本、原代黑色素细胞和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 258 | 2026-04-24 |
Unraveling the developmental heterogeneity of human retinal ganglion cells within the developing retina to study to the continuity of maturation
2025-Dec, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.025
PMID:40912448
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术解析人类胎儿视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性，并构建连续成熟轨迹 | 首次提出视网膜神经节细胞成熟是一个连续非离散过程，通过伪时间分析构建统一的成熟轨迹，并鉴定出驱动成熟的新基因及细胞内外特征 | 未提及 | 揭示人类视网膜发育过程中视网膜神经节细胞的成熟异质性和连续性 | 人类胎儿视网膜从第8周到第27周的视网膜神经节细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | 人类胎儿视网膜样本，覆盖第8周到第27周 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 259 | 2026-04-23 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083
PMID:38934409
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 | 首次在斑马鱼视网膜再生中系统解析了Müller胶质细胞的两种静止亚型及其向激活状态或杆状前体细胞的转化，并鉴定了小胶质细胞的三种亚型及其动态变化，同时揭示了炎症通过Jak1-Stat3信号通路调控胶质细胞重编程的机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果向哺乳动物视网膜再生的直接转化仍需进一步验证 | 探究炎症在视网膜再生过程中如何调控Müller胶质细胞重编程 | 斑马鱼视网膜中的免疫细胞（特别是小胶质细胞）和Müller胶质细胞 | 单细胞组学 | 视网膜损伤与再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及未损伤和损伤后的斑马鱼视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2026-04-23 |
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063
PMID:39101644
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞在动态发育过程中的不同演化路径和功能差异 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，系统解析了脊髓损伤后小胶质细胞与巨噬细胞的差异化演化轨迹，并识别了巨噬细胞中与促炎效应（整合素β2）和神经保护效应（制瘤素M通路）相关的关键分子机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床样本中得到验证；空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析细胞间相互作用的微观空间结构 | 阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞与巨噬细胞的动态变化及其在炎症反应中的不同作用 | 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |