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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
221 2026-05-18
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 GLP-1R激动剂直接提高小鼠集合淋巴管的泵血能力 首次发现GLP-1R激动剂(如semaglutide)可直接作用于淋巴管内皮细胞(LECs),通过血管舒张增加淋巴管泵血能力,且该作用独立于体重减轻带来的系统性益处 机制中除一氧化氮、活性氧和血管舒张性前列腺素外,其他信号成分尚待阐明 研究GLP-1R激动剂对淋巴管功能的直接作用及其分子机制 健康野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 数字病理学 继发性淋巴水肿 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 NA 图像、基因表达数据 小鼠淋巴管样本,具体数量未报告 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于淋巴管细胞转录组分析
222 2026-05-18
Integrating pathology genomics and single-cell genomics to identify lactate metabolism-related prognostic features and therapeutic strategies for melanoma
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过整合病理基因组学与单细胞基因组学,识别与黑色素瘤乳酸代谢相关的预后特征和治疗策略 首次整合病理图像特征、单细胞转录组、空间转录组等多组学数据,构建乳酸代谢预后模型(LMS),并发现RAB32在肿瘤代谢重编程和侵袭性中的核心作用 未提及明显的局限性 系统表征黑色素瘤中乳酸代谢的分子特征,构建预后模型并探索潜在治疗策略 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者的病理图像、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据及临床信息 数字病理学、机器学习 黑色素瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、深度学习、基因集变异分析、RAB32敲低实验 ResNet50卷积神经网络、LMS预后模型(基于10种机器学习算法的101种组合) 图像、文本(基因表达数据)、视频(非核心) TCGA训练集和验证集样本、单细胞测序样本、小鼠异种移植模型样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序技术、空间转录组学技术、病理图像分析技术 NA NA
223 2026-05-18
Endothelial SPRY1 deficiency associates with angiogenic-metabolic reprogramming in pulmonary arterial hypertension: a multi-omics analysis of bulk and single-cell transcriptomic profiles
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过多组学分析揭示内皮SPRY1缺陷与肺动脉高压中血管生成-代谢重编程的关系 首次通过整合单细胞RNA测序数据和高维加权基因共表达网络分析与机器学习,鉴定SPRY1为肺动脉高压发病机制中的新型关键生物标志物,并证实其在疾病中的显著下调 研究仅基于数据库分析,且仅在一个大鼠模型中验证,缺乏更多临床样本和功能验证实验 探究肺动脉高压中内皮细胞稳态失调的分子机制,特别是SPRY1在血管重塑中的作用 肺动脉高压患者和正常对照的肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型 机器学习 肺动脉高压 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、机器学习 高维加权基因共表达网络分析、机器学习模型 基因表达数据 来自GEO数据库的肺动脉高压患者和正常对照肺组织样本,以及野百合碱诱导的PAH大鼠模型组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
224 2026-05-18
ERO1A-positive tumor epithelial cells in colorectal cancer progression: a multi-omics perspective
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究采用多组学方法,整合21个多中心结直肠癌队列数据,鉴定了ERO1A阳性肿瘤上皮细胞亚群,并发现其与癌症进展和不良预后相关 首次鉴定出ERO1A阳性上皮细胞亚群在结直肠癌进展中的关键作用,并构建了基于该细胞亚群与肿瘤微环境相互作用的风险预测模型ETSRM,该模型优于111个现有结直肠癌模型 未提及明显局限 探讨ERO1A阳性肿瘤上皮细胞在结直肠癌进展中的作用及其作为预后标志物的潜力 结直肠癌肿瘤上皮细胞,特别是ERO1A阳性上皮细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学、批量转录组学、空间转录组学、蛋白质组学 风险预测模型(ETSRM) 转录组数据、空间转录组数据、蛋白质组数据 2767名患者,来自21个结直肠癌队列 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
225 2026-05-18
LCN2 drives ferroptosis-associated ischemia-reperfusion injury after renal transplantation: integrated machine learning and in vivo validation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过整合机器学习与体内验证,揭示LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的关键作用 首次结合加权基因共表达网络分析、113种机器学习算法和单细胞测序,系统鉴定并验证LCN2在肾移植缺血再灌注损伤中驱动铁死亡和免疫失调的核心机制,提出新型诊断框架和治疗靶点 研究主要基于小鼠模型和有限的人类移植队列数据,LCN2抑制剂的临床转化效果和长期安全性尚需进一步验证 探究LCN2在肾移植后铁死亡相关缺血再灌注损伤中的作用,并构建基于机器学习的诊断模型 小鼠缺血再灌注损伤模型和人类肾移植队列样本 机器学习 肾脏疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 机器学习的 逻辑回归, 随机森林, 集成模型 基因表达数据, 转录组数据 6个小鼠IRI转录组数据集(83个样本)和2个人类移植队列(212个样本) NA 单细胞RNA-seq NA 使用GSE237429单细胞RNA-seq数据集
226 2026-05-18
Neutrophil CD11b is a pivotal PANoptosis marker correlated with disease activity in antineutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究鉴定CD11b为中性粒细胞PANoptosis的关键标志物,并发现其活性与ANCA相关性血管炎疾病活动度呈正相关 首次发现CD11b作为PANoptosis关键基因在AAV中的枢纽作用,并揭示其通过脂肪酸代谢异常调控中性粒细胞活化与PANoptosis的机制 未明确说明样本量大小及多中心验证,动物模型仅使用ANCA-GN小鼠,临床相关性分析可能受限于单中心数据 鉴定ANCA相关性血管炎中PANoptosis关键标志物并探索其与疾病活动度的关联 AAV患者外周血中性粒细胞、尿液及血浆样本、肾活检标本、ANCA-GN小鼠模型 数字病理学 心血管疾病 基因微阵列,单细胞测序,免疫荧光染色,代谢途径分析 综合生物信息分析 基因表达数据,单细胞转录组数据 AAV患者血液、尿液和肾标本,ANCA-GN小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA 来自GEO数据库的基因微阵列数据及小鼠单细胞测序数据
227 2026-05-18
Deciphering macrophage heterogeneity and factors driving M2 polarization in lung adenocarcinoma through single-cell RNA sequencing
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序解析肺腺癌中巨噬细胞的异质性及驱动M2极化的因素 首次发现BCAT1在免疫耐药患者组织中与M2巨噬细胞浸润正相关,并证实BCAT1可通过驱动M2极化促进免疫抑制微环境 未提及具体局限性 揭示肺腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性和可塑性,并识别影响其极化的基因 肺腺癌患者组织中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 使用公开数据集GSE207422 NA 单细胞RNA测序 NA NA
228 2026-05-18
Multi-omics nominates VDAC2 as a candidate protective locus in sepsis-associated cholesterol dysregulation
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 利用多组学和机器学习方法探索败血症中胆固醇代谢失调的机制,并识别候选保护基因VDAC2 首次通过整合转录组、单细胞RNA测序和机器学习算法,将VDAC2确定为败血症相关胆固醇代谢失调的候选保护基因,并构建了高精度的诊断和预后模型 NA 探索败血症中胆固醇代谢失调的分子机制,识别新的治疗靶点 败血症患者的转录组和单细胞RNA测序数据 机器学习和多组学 败血症 转录组测序、单细胞RNA测序、机器学习 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、非负矩阵分解(NMF)、101种机器学习算法集成模型 基因表达数据 多个队列的败血症患者样本,具体数量未提及 NA 转录组测序、单细胞RNA测序 NA NA
229 2026-05-17
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-12, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2
研究论文 研究年龄对年轻和中年小鼠股骨近端骨折愈合的影响 利用空间转录组学结合多重细胞因子分析,揭示了中年小鼠骨折愈合能力下降与衰老相关分泌表型(SASP)因子的关联 仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未包括雌性小鼠及更年长小鼠,且未深入探讨SASP因子的具体分子机制 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响,并评估该模型是否适用于研究年龄相关性延迟骨折愈合的分子机制 12周龄(年轻)和52周龄(中年)雄性C57BL/6J小鼠 机器学习 骨质疏松, 骨折 空间转录组学, 多重细胞因子分析, μCT分析, 组织形态计量学, 免疫染色 NA 基因表达数据, 图像数据 12周龄和52周龄雄性C57BL/6J小鼠(具体数量未提及) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于骨折后14天的组织分析
230 2026-05-17
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-12-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究发现ETS变异转录因子1(ETV1)是肠内分泌L细胞中PYY产生的关键调节因子 首次揭示ETV1在L细胞中特异调节PYY表达的转录调控机制,而对GLP-1表达无影响 未明确说明 探究肠内分泌L细胞中ETV1对激素PYY和GLP-1的转录调控作用 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 医学 代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR NA 基因表达数据 小鼠小肠组织样本和类器官培养样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
231 2026-05-16
Genetic insights into drug targets for alzheimer's disease: integrative multi-omics analysis
2025-12-05, Alzheimer's research & therapy
研究论文 整合多组学孟德尔随机化分析识别阿尔茨海默病药物靶点 通过大规模多组学数据整合(包括50多个GWAS数据集、蛋白质组QTL、单细胞RNA测序和蛋白质互作网络),建立了一个全面的阿尔茨海默病靶点图谱,并验证了六个最高置信度靶点 未明确说明,但可能包括依赖现有数据库的质量和样本量,以及孟德尔随机化方法的固有局限性 识别阿尔茨海默病的稳健治疗靶点,建立从机制到安全性的临床可操作框架 阿尔茨海默病的潜在药物靶点 机器学习 阿尔茨海默病 全基因组关联研究、蛋白质组定量性状位点分析、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 涉及超过50个GWAS数据集及大规模蛋白质组学研究数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
232 2026-05-16
An Integrated Single-Cell Atlas of the Mouse Ileum Links Nutrient Metabolism with Epithelial and Immune Crosstalk
2025-12, The Journal of nutrition IF:3.7Q2
研究论文 构建小鼠回肠综合单细胞图谱,揭示营养代谢与上皮-免疫细胞互作机制 首次整合小鼠回肠单细胞转录组图谱,同时覆盖上皮和免疫细胞群体,发现Bco2-Il18在多种细胞类型中的共表达以及非经典杯状细胞的高表达特征 研究仅基于雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别和遗传背景差异;缺乏功能验证实验 构建回肠细胞异质性图谱,解析上皮分化、营养代谢程序及上皮-免疫互作在健康与疾病中的作用 8周龄雄性C57BL/6J小鼠的回肠细胞 计算生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 32,076个回肠细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 使用Seurat软件进行基因表达聚类分析,结合伪时间轨迹、细胞间通讯和通路富集分析
233 2026-05-16
Oxidative Stress and Pyroptosis Mediated by CEBPB/HMGB1 Signaling in Sepsis-Exacerbated Coronary Atherosclerosis
2025-12, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
研究论文 本研究探讨了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠状动脉粥样硬化中介导氧化应激和细胞焦亡的作用 首次揭示了CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加重冠心病中的分子机制,为心血管并发症的预防提供了新靶点 研究主要在动物模型和细胞实验中进行,尚需更大规模临床样本验证 阐明脓毒症加重冠状动脉疾病的氧化应激和炎症信号通路机制 雄性ApoE小鼠模型和THP-1来源巨噬细胞及人主动脉内皮细胞 数字病理学 冠状动脉疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测, 酶联免疫吸附测定, 活性氧检测, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 分子生物学数据 使用ApoE小鼠模型(样本量未明确报告),以及THP-1来源巨噬细胞和人主动脉内皮细胞 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
234 2026-05-10
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究探讨缺氧如何通过HIF-1α依赖性方式影响患者来源回肠类器官中干细胞命运 首次证明生理性缺氧通过HIF-1α稳定化直接调控肠道上皮干细胞命运,揭示氧梯度在隐窝-绒毛轴中维持肠道稳态的机制 未明确说明,但可能包括类器官模型与体内环境的差异及样本量限制 研究氧气可用性如何影响肠道干细胞增殖和分化 患者来源的人回肠类器官(肠类器官) 数字病理学 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 患者来源的人回肠类器官(具体数量未提及) Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq 批量RNA测序和单细胞RNA测序于Illumina NovaSeq平台
235 2026-05-10
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种名为PASTA的空间通路基因表达插补方法,利用细胞类型和空间邻近性提高预测准确性 创新性地将通路信息整合到空间转录组基因表达插补过程中,利用邻近细胞及同类型细胞的相似表达模式提高预测鲁棒性和生物学相关性 标题和摘要未明确提及方法的局限性 准确预测空间转录组中未测量的基因表达,特别是在通路水平上实现稳定且具有生物学意义的插补 空间转录组数据中未测量的基因表达 机器学习 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 PASTA(通路导向空间基因插补模型) 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
236 2026-05-09
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过条件性敲除小鼠模型,发现PRMT5缺失导致基底角质细胞样异常细胞群出现和表皮分层缺陷 首次揭示PRMT5通过抑制Cdkn1a表达来阻止基底角质细胞衰老,为先天性皮肤病的表观遗传调控提供新见解 NA 探究PRMT5在体内维持角质细胞干细胞表型的作用及其机制 条件性敲除Prmt5的小鼠表皮 机器学习 先天性皮肤病 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序 NA 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 条件性敲除Prmt5小鼠及其对照 10x Genomics 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 10x Chromium NA
237 2026-05-09
High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics IF:4.8Q1
研究论文 本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达,激活YAP/β-catenin通路促进PDGF-BB分泌,进而诱导血管平滑肌细胞表型转化并促进颅内动脉瘤形成的机制 首次阐明内皮Piezo1通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路介导高剪切应力与颅内动脉瘤形成的机械生物学耦合机制 未提及具体局限性 探究高剪切应力下内皮Piezo1调控颅内动脉瘤形成的机械生物学机制 人类颅内动脉瘤标本、内皮细胞、血管平滑肌细胞、Piezo1基因敲除小鼠颅内动脉瘤模型 机器学习和数字病理学未涉及,属于基础医学研究 颅内动脉瘤 CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析 NA 基因表达数据、组织样本 人类颅内动脉瘤样本、小鼠模型(8周龄雄性Piezo1flox/flox小鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
238 2026-05-08
Non-parasite genome encoded virus-like RNAs reprogram the pathogenicity of human blood flukes
2025-Dec-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 发现非寄生虫基因组编码的病毒样RNA调控日本血吸虫的致病性 首次发现非寄生虫基因组编码的病毒样RNA(ngRNAs)在血吸虫中存在并通过编码RNA依赖的RNA聚合酶影响胚胎活力和卵子生成,揭示了ngRNAs在寄生虫生物学中的调控机制 未详细说明ngRNAs在其他物种中的保守性及长期感染条件下的动态变化 探究非寄生虫基因组编码的病毒样RNA在血吸虫致病性中的作用及其潜在治疗靶点 日本血吸虫(Schistosoma japonicum)和涡虫(Dugesia japonica) 数字病理学 血吸虫病 宏转录组学(metatranscriptomics),单细胞RNA测序(scRNA-seq),RNA干扰 NA 转录组数据 未明确说明样本数量 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
239 2026-05-08
Oral immunotherapy directs systemic transcriptomic changes in children with hen's egg allergy
2025-Dec, Asian Pacific journal of allergy and immunology IF:2.3Q3
研究论文 一项关于口服免疫疗法如何影响鸡蛋过敏儿童全身转录组变化的研究 首次通过单细胞RNA测序揭示鸡蛋口服免疫疗法诱导的系统性免疫细胞转录组改变,发现CD8+ T细胞耗竭状态和IKZF2高表达的调节性T细胞增加 样本量较小(仅8名完成治疗的患者),且未涉及长期随访或机制验证实验 探究鸡蛋过敏儿童口服免疫疗法相关的全身免疫表型和转录组变化 3至12岁确诊鸡蛋过敏的儿童(中位年龄4.5岁) 分子免疫学 食物过敏(鸡蛋过敏) 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(转录组) 16名鸡蛋过敏儿童,其中8名完成治疗阶段(血液样本) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台,用于外周血单个核细胞的转录组分析
240 2026-05-08
Integrative multiomics elucidate crotonylation-associated GCDH in Parkinson's disease pathogenesis via metabolome remodeling
2025-12, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society IF:2.7Q2
研究论文 通过整合多组学分析,揭示了巴豆酰化相关基因GCDH通过代谢组重塑在帕金森病发病机制中的作用 利用孟德尔随机化结合中介分析首次建立巴豆酰化相关基因与帕金森病之间的因果关系,并系统解析代谢物介导的机制,同时整合单细胞转录组数据揭示GCDH在星形胶质细胞中的特异性表达和调控模式 未明确说明,但可能包括孟德尔随机化分析的固有局限性(如工具变量假设)以及单细胞数据来自公共数据库的样本异质性 阐明巴豆酰化及其代谢调控网络在帕金森病病理生理中的重要性 巴豆酰化相关基因(如SIRT1、GCDH、HDAC7)及其代谢物和帕金森病风险 机器学习 帕金森病 孟德尔随机化、单细胞转录组测序 NA 基因表达数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 涉及eQTLGen数据集和GEO单细胞转录组数据,具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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