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当前共找到 1109 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-06-06 |
scSelector: A Flexible Single-Cell Data Analysis Assistant for Biomedical Researchers
2025-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010002
PMID:41595423
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research paper | 开发了一个交互式软件工具包scSelector，允许生物医学研究者基于专业知识灵活选择和分析单细胞数据中的细胞群 | 整合了套索选择工具与大型语言模型（DeepSeek/Gemini）辅助的细胞类型预测，突破了传统聚类依赖方法的刚性限制 | 可能依赖API稳定性，且不同数据集的生物学知识指导可能需要人工调整 | 为生物医学研究者提供灵活的单细胞数据分析工具，提高细胞亚群识别和功能异质性解析的精度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群，包括稀有细胞亚群和标准质控中丢弃的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 大型语言模型 | 大型语言模型 | 单细胞表达数据 | 多个公共数据集，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2026-05-31 |
RAB25 modulates pit cell commitment by coordinating transforming growth factor-alpha secretion from gastric epithelial cells
2025-Dec-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08316-2
PMID:41365858
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现Rab25在胃上皮细胞中调控转化生长因子-α分泌，从而调节胃小凹细胞定向分化的机制 | 首次揭示Rab25通过调控TGFA分泌协调EGFR信号通路，影响胃体部小凹细胞定向分化的分子机制，并发现其在人Ménétrier病中表达降低 | 主要基于小鼠模型和体外细胞培养实验，人类样本数据有限，具体机制研究尚需进一步验证 | 探究胃上皮细胞中Rab25对转化生长因子-α分泌及小凹细胞定向分化的调控机制 | 胃体部小凹细胞和胃上皮细胞 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠原代细胞培养样本及RAB25敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-05-30 |
Daytime SHP2 inhibitor dosing, when immune cell numbers are elevated, shrinks neurofibromas
2025-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503359
PMID:40992926
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序，验证了白天给予SHP2抑制剂可缩小神经纤维瘤，并揭示其通过靶向单核细胞来源的巨噬细胞和调节免疫微环境发挥作用 | 首次发现SHP2抑制剂对神经纤维瘤的疗效受给药时间（白天）影响，并与单核细胞昼夜节律性迁移相关，将免疫调节与药效时间生物学相结合 | 未明确单核细胞节律性迁移的具体分子机制，以及SHP2抑制剂联合抗PD1治疗导致肿瘤体积恢复的临床转化潜力有待进一步验证 | 探究SHP2抑制剂能否通过阻断RAS-MAPK信号通路和调节免疫微环境缩小神经纤维瘤 | NF1缺失的雪旺细胞形成的良性神经鞘瘤（PNF）及其相关免疫细胞 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肿瘤组织样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 204 | 2026-05-30 |
KANSL3 directs transcriptional programs essential for hepatic metabolism and differentiation
2025-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503238
PMID:41044006
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研究论文 | 该研究揭示表观遗传调控因子KANSL3通过组蛋白乙酰化维持肝脏代谢和分化所必需的转录程序，其缺失导致早期肝病 | 首次发现KANSL3作为NSL复合物关键组分，通过组蛋白乙酰化特异性调控肝细胞固醇和脂质代谢的转录网络，并利用单细胞RNA测序揭示其体内外对肝细胞分化的必要性 | 未说明具体局限性，可能包括缺乏人体样本验证或机制深度不足 | 阐明表观遗传调控因子KANSL3在肝脏代谢和分化中的作用机制 | 肝细胞特异性KANSL3敲除小鼠、胆管和胎儿肝脏类器官 | 表观遗传学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2026-05-30 |
Beneficial and detrimental consequences of AHR activation in intestinal infection
2025-12, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503414
PMID:41057229
|
研究论文 | 研究AHR受体激活在肠道感染中的有益与有害后果，揭示配体代谢差异和遗传操作对免疫应答的影响 | 首次区分了基因驱动与污染物（TCDD）诱导的AHR持续激活对宿主免疫反应的差异影响，并通过单细胞多组学揭示了TCDD特异性抑制树突状细胞功能的机制 | 未明确说明局限性 | 探究AHR持续激活（因配体代谢低效或遗传操作）是否决定了其有益与有害作用的区分 | 肠道病原体柠檬酸杆菌感染的小鼠模型及其免疫细胞 | 免疫学 | 肠道感染 | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质开放数据 | 涉及感染小鼠的免疫细胞样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序与单细胞ATAC测序平台 |
| 206 | 2026-05-29 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals T cell heterogeneity and metabolic reprogramming in human immune-mediated glomerulonephritis
2025-12-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2582720
PMID:41241792
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示人类免疫介导性肾小球肾炎中T细胞的异质性和代谢重编程 | 首次构建人类IMGN T细胞的单细胞图谱，揭示疾病特异性T细胞状态、代谢特征和激活机制 | 现有研究缺乏对人类IMGN T细胞特征和功能作用的全面理解 | 探究T细胞在免疫介导性肾小球肾炎发病机制中的异质性和代谢特征 | 三种主要IMGN类型（IgA肾病、狼疮肾炎、膜性肾病）的T细胞 | 机器学习和单细胞分析 | 肾脏疾病，免疫介导性肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序(sc-RNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 三种IMGN类型的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 使用先进的sc-RNA-seq计算流程构建基因共表达网络、推断T细胞分化轨迹并评估代谢和细胞间信号特征 |
| 207 | 2026-05-29 |
The role of IRF-1 in mediating T-cell immune imbalance in systemic lupus erythematosus and the construction of a diagnostic model
2025-12-31, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2581723
PMID:41261757
|
研究论文 | 本文整合单细胞转录组和批量转录组数据，研究IRF-1在系统性红斑狼疮T细胞免疫失衡中的作用，并构建诊断模型 | 首次通过单细胞RNA-seq揭示IRF-1在活动期SLE中T细胞亚群显著下调，并基于IRF-1相关基因构建机器学习诊断模型，实现高精度非侵入性诊断 | 未提及具体局限性，如样本量有限或验证队列的多样性不足 | 阐明IRF-1在SLE免疫失衡中的机制并开发诊断工具 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照 | 机器学习和生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA-seq、批量转录组测序、机器学习 | 广义线性模型和偏最小二乘模型 | 基因表达数据 | 1079例SLE患者和137例对照的批量转录组数据，70例SLE患者和58例对照的临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 208 | 2026-05-29 |
Disturbed flow induces reprogramming of endothelial cells to immune-like and foam cells under hypercholesterolaemia during atherogenesis
2025-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf233
PMID:41288601
|
研究论文 | 研究扰动血流和高胆固醇血症对动脉粥样硬化过程中内皮细胞重编程为免疫样细胞和泡沫细胞的影响 | 首次提出并验证了扰动血流和高胆固醇血症双重打击假说，发现内皮细胞可发生部分内皮-免疫细胞样转化和内皮-泡沫样细胞转化 | 未提及具体局限性 | 验证扰动血流和高胆固醇血症联合作用诱导内皮细胞重编程的假说 | 小鼠颈动脉内皮细胞和人主动脉内皮细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 95只小鼠共98,553个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 209 | 2026-05-29 |
Whole-heart 3D reconstruction of mouse CVB3 myocarditis reveals spatial and transcriptomic heterogeneity of immune foci
2025-12-31, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf209
PMID:41401444
|
研究论文 | 利用CODA工作流程对小鼠CVB3心肌炎进行全心脏3D重建，揭示了免疫病灶的空间和转录组异质性 | 首次通过CODA工作流程实现单细胞分辨率下小鼠急性CVB3心肌炎全心脏3D重建，并整合免疫组化染色和空间RNA测序，揭示了免疫病灶在器官水平上的空间异质性和转录组差异，以及其与人类扩张型心肌病的关联 | 该研究主要基于小鼠模型，虽然结果与人类DCM心脏有相似性，但未直接验证人类心肌炎；3D重建和空间转录组技术可能受限于样本处理和数据分析的复杂性 | 探索心肌炎炎症病灶在三维空间中的空间、形态、免疫和转录组异质性 | 小鼠急性CVB3心肌炎模型的全心脏，以及人类扩张型心肌病离体心脏 | 数字病理学 | 心肌炎、扩张型心肌病 | 空间RNA测序、免疫组化染色、流式细胞术、定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR) | NA | 图像、转录组数据 | 小鼠CVB3心肌炎模型的全心脏样本，具体数量未在摘要中提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 210 | 2026-05-29 |
Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2459136
PMID:39868995
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析猴痘患者的PBMCs，揭示HIV合并感染者的免疫景观 | 首次在单细胞水平全面描绘猴痘合并HIV感染患者的免疫细胞图谱，发现急性期和恢复期外周免疫细胞表型重塑以及HIV+患者异常的基因表达和细胞亚群 | 样本量有限（六例患者），HIV+患者均处于病毒抑制状态，可能无法完全代表其他临床情况 | 了解猴痘病毒在HIV感染与非感染者中的免疫病理机制 | 猴痘患者的周围血单核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 猴痘，艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6例住院猴痘患者（3例HIV阳性且RNA低于检测限，3例仅感染猴痘） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台用于单细胞3'文库构建 |
| 211 | 2026-05-29 |
Phenotypic Changes in a Monocyte Cluster with High Interleukin-1 Beta Expression during Long-Term Anti-CD20 Therapy
2025-12, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.78004
PMID:40879186
|
研究论文 | 通过多组学单细胞分析研究长期抗CD20治疗期间高表达白介素-1β的单核细胞簇的表型变化 | 首次利用多组学单细胞分析发现一个高表达IL1B的经典单核细胞亚群在未治疗的多发性硬化患者中显著减少，并在抗CD20治疗后数量增加6倍，揭示了该细胞群潜在的CNS浸润表型及其与治疗的关联 | 样本量有限（64份血液样本），仅涉及PBMCs研究，缺乏对CNS组织的直接验证 | 探究多发性硬化患者中与疾病和抗CD20治疗相关的外周血单个核细胞变化 | 多发性硬化患者和健康对照的外周血单个核细胞 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞转录组测序、单细胞表位测序、多色光谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 64份血液样本（多发性硬化患者基线及抗CD20治疗后3个时间点，以及健康对照），其中15份进行流式细胞术 | 10x Genomics | 单细胞转录组测序、单细胞表位测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5' 用于单细胞测序 |
| 212 | 2026-05-29 |
Multi-omics identification of RNASE6 as an immune regulatory RNA-binding protein associated with melanoma metastasis
2025-12, Autoimmunity
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/08916934.2025.2561663
PMID:41055424
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定RNASE6作为与黑色素瘤转移相关的免疫调节RNA结合蛋白，并阐明其在巨噬细胞极化中的作用 | 首次鉴定RNASE6作为免疫调节RNA结合蛋白，并通过孟德尔随机化证明其对黑色素瘤的因果保护作用，揭示了RNASE6通过促进M1巨噬细胞极化抑制转移的新机制 | 未提及具体的样本量和实验验证的规模限制，可能需要更多临床队列验证 | 探索黑色素瘤转移中与免疫调节相关的RNA结合蛋白，并明确RNASE6在免疫调控中的角色 | 黑色素瘤样本的bulk RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据、GWAS数据以及巨噬细胞实验 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, GWAS, 孟德尔随机化 | WGCNA, 机器学习算法, COX回归 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 213 | 2026-05-28 |
A clinically relevant pan-cancer prognostic signature derived from T-cell activation immune genes: Experimental validation across malignancies with emphasis on breast cancer
2025-12, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.108044
PMID:41274393
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研究论文 | 基于T细胞活化免疫基因建立泛癌预后模型，并在多种恶性肿瘤中实验验证，重点关注乳腺癌 | 创新性建立了一个包含23个T细胞活化相关免疫反应基因的泛癌预后特征，并通过单细胞RNA测序发现PTGER4基因主要表达于T细胞，揭示了其在PD-1免疫治疗中的潜在增效作用 | 研究主要基于公开数据库的转录组数据，缺乏大规模前瞻性临床验证；PTGER4的作用机制仅在动物模型中验证，需进一步在临床样本中确认 | 开发一个基于T细胞活化相关免疫反应基因的泛癌预后模型，并探索其在免疫治疗中的潜在应用价值 | 多种恶性肿瘤（泛癌），特别关注乳腺癌 | 机器学习 | 泛癌 | RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据 | 泛癌转录组数据来自UCSC Xena数据库，包含多种癌症样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2026-05-23 |
Identification of diagnostic and prognostic phospholipid biomarkers in idiopathic pulmonary fibrosis via machine learning and in vivo validation
2025-Dec-12, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00845-3
PMID:41388329
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研究论文 | 通过机器学习识别特发性肺纤维化中诊断和预后的磷脂生物标志物并进行体内验证 | 首次结合加权基因共表达网络分析、机器学习及单细胞测序和动物模型验证，识别出IPF相关的磷脂生物标志物并构建高精度的诊断和预后模型 | 需要进一步验证其临床适用性 | 探究磷脂相关生物标志物在特发性肺纤维化诊断和预后中的应用 | 特发性肺纤维化患者和动物模型 | 机器学习 | 肺纤维化 | 微阵列分析、单细胞测序、动物模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 8个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2026-05-23 |
Endothelial LRRC8A mitigates pressure overload-induced cardiac hypertrophy by promoting coronary angiogenesis
2025-12-07, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10021-9
PMID:41353685
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞LRRC8A在压力超负荷诱导的心肌肥大中的作用，发现其通过促进冠状动脉血管生成来缓解肥大 | 首次阐明内皮细胞LRRC8A通过调控VEGF-VEGFR2轴和VEGFR2内吞作用，促进冠状动脉血管生成，从而缓解压力超负荷诱导的心肌肥大 | 未提及具体局限性，但可能包括研究仅在动物模型和体外实验中进行，临床转化需进一步验证 | 研究内皮细胞LRRC8A在压力超负荷诱导的病理性心肌肥大中的作用及机制 | 人类和小鼠的肥大心脏及心脏内皮细胞 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者和小鼠的肥大心脏样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序 |
| 216 | 2026-05-23 |
Neoadjuvant chemotherapy modulates mast cell phenotypes and immune infiltration in high-grade serous carcinoma
2025-12, Gynecologic oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.ygyno.2025.10.014
PMID:41176887
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研究论文 | 新辅助化疗调控高级别浆液性癌中肥大细胞表型及免疫浸润模式 | 首次揭示新辅助化疗后高级别浆液性癌中CD52+KIT+肥大细胞向JUN+/TNFRSF12A+亚群转变，并发现KIT表达增加与化疗应答及预后相关 | 样本量较小（8例化疗前和7例化疗后肿瘤样本的RNA测序数据），且单细胞RNA-seq数据来自公共数据集，需进一步在更大队列中验证 | 探究新辅助化疗对高级别浆液性癌免疫浸润模式的影响及其临床意义 | 高级别浆液性癌患者肿瘤组织（化疗前后配对样本） | 数字病理学 | 卵巢癌（高级别浆液性癌） | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组化 | NA | 基因表达数据，图像（免疫组化） | 15个RNA测序样本（8例化疗前、7例化疗后），73例配对化疗前后样本（用于免疫组化），单细胞RNA-seq数据取自公共数据集（GSE165897） | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2026-05-21 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-12, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.07.017
PMID:40946801
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示M2a巨噬细胞与肺腺癌气腔扩散的关联 | 创新性地结合单细胞RNA测序和数字空间分析空间转录组学技术，研究特定类型肿瘤相关巨噬细胞对肺腺癌气腔扩散发生和发展的影响机制 | 未提及明显的局限性 | 探索肿瘤相关巨噬细胞亚型在肺腺癌气腔扩散中的作用及其分子机制 | 肺腺癌中的气腔扩散和M2a巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 218 | 2026-05-20 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.693132
PMID:41509209
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研究论文 | 详细描述了利用Xenium Prime 5K平台对小鼠脱钙骨骼肌组织进行空间转录组分析的完整样本处理流程 | 首次提出针对小鼠骨骼肌组织的完整样本处理流程，包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及共嵌入策略，实现了高质量空间转录组数据生成，并保留了关键解剖背景 | 未提及明显的局限性，但可实现性可能受限于特定组织类型和平台成本 | 开发一个能够高效生成小鼠骨骼肌组织空间转录组数据的样本处理流程 | 成年小鼠完整膝关节、胫骨和腰椎骨样本 | 数字病理学 | 不适用 | 基于成像的空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 成年小鼠的多个肌肉骨骼组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | 10x Genomics Xenium Prime 5K平台进行成像型空间转录组分析 |
| 219 | 2026-05-20 |
Resistance of endothelial cells to SARS-CoV-2 infection in vitro
2025-12-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01205-25
PMID:41347787
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研究论文 | 本研究重新评估了内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性，发现培养的或原位的内皮细胞均不容易被活病毒直接感染 | 首次在体外培养及人肺切片原位实验中证明，无论培养还是天然的人内皮细胞均不易直接受SARS-CoV-2感染，这挑战了之前认为内皮细胞是病毒靶点的观点 | 研究主要基于体外实验，可能无法完全模拟体内复杂环境；且样本量有限，结果需要进一步在动物模型或临床研究中验证 | 探讨内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性，以澄清其在COVID-19血管炎症中的角色 | 人肺、主动脉内皮细胞、内皮祖细胞以及人肺切片中的原位内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、ELISA、RT-qPCR、假病毒试验 | NA | 图像、基因表达数据 | 内皮细胞来自肺、主动脉和祖细胞培养物，以及人肺切片中的原位细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于人肺切片的单细胞RNA测序，捕获与SARS-CoV-2病毒基因组对齐的分子标识符 |
| 220 | 2026-05-19 |
Integrative analysis of RiboSis-related gene expression in colorectal cancer: implications for prognosis and immunotherapy
2025-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02166-1
PMID:40839324
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研究论文 | 综合分析了结直肠癌中核糖体生物合成相关基因的表达，探讨了其在预后和免疫治疗中的意义 | 首次利用单细胞RNA测序和整合机器学习方法，构建了基于核糖体生物合成相关基因的预后模型，并验证了PFDN2作为枢纽基因在结直肠癌中的作用 | 未提及具体局限性 | 探索核糖体生物合成相关基因在结直肠癌中的临床意义，特别是在预后和免疫治疗响应中的潜在作用 | 结直肠癌组织样本中的细胞和基因 | 机器学习 | 结直肠癌 | scRNA-seq, NMF, 机器学习 | 基于十种算法的整合机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | 3个结直肠癌组织的scRNA-seq数据，13个样本的26,961个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |