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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-12-14 |
ZFPL1 Promotes Colorectal Cancer Progression by Stabilizing ASS1 to Drive the Urea Cycle and M2 Macrophage-Mediated Metastatic Colonization
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505291
PMID:41216870
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研究论文 | 本文通过整合分析多个单细胞RNA测序数据库,发现ZFPL1在结直肠癌恶性细胞中特异性富集,并通过稳定ASS1激活尿素循环代谢,驱动肿瘤进展和M2巨噬细胞介导的转移定植 | 首次揭示ZFPL1通过直接结合并稳定ASS1,激活尿素循环代谢,从而驱动结直肠癌进展,并发现Salvianolic acid B可作为ZFPL1抑制剂,与抗PD-1疗法协同抑制肿瘤 | 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,临床转化潜力需进一步验证 | 探究结直肠癌进展的分子机制,并寻找新的治疗靶点 | 结直肠癌细胞、肿瘤微环境中的巨噬细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、多组学分析、虚拟筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | 多个单细胞RNA测序数据库中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 182 | 2025-12-14 |
A unified single-cell atlas of human lung provides insights into pulmonary diseases
2025-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106025
PMID:41237668
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研究论文 | 本研究构建了名为uniLUNG的最全面人类肺单细胞RNA测序图谱,整合了来自1807名供体的920万个细胞数据,涵盖健康和17种疾病状态,旨在揭示不同肺部疾病中的独特细胞类型和细胞转变 | 创建了首个跨疾病、高分辨率的人类肺单细胞图谱,整合了大规模已发表数据集,并结合空间转录组学识别了肺癌中的过渡性恶性亚群,如NSCLC-like SCLC,为理解肿瘤进化提供了新见解 | 研究主要基于已发表的单细胞数据集,可能存在批次效应或技术偏差,且空间多组学分析的深度和广度可能受现有数据限制 | 构建统一的人类肺单细胞图谱,以揭示不同肺部疾病的细胞机制和共享致病通路 | 人类肺组织细胞,涵盖健康状态和17种肺部疾病条件 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 920万个细胞,来自1807名供体,涵盖62个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 183 | 2025-12-14 |
Skeletal muscle-derived IL-33 mediates muscle-to-bone crosstalk and regulates bone metabolism via CD8+ T cell-secreted CCL5
2025-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106024
PMID:41237669
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研究论文 | 本研究揭示了一种由骨骼肌分泌的IL-33介导的肌肉-骨骼通讯机制,该机制通过CD8+ T细胞分泌的CCL5调控骨代谢 | 首次发现并证实了IL-33作为一种肌因子,在肌肉与骨骼的交互作用中扮演关键角色,并阐明了其通过CD8+ T细胞-CCL5-CCR3信号轴调控骨代谢的具体分子通路 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人体中的直接因果机制验证尚不充分;临床队列研究为观察性,无法完全排除混杂因素的影响 | 探究肌肉与骨骼之间的交互作用机制,特别是肌肉功能障碍如何导致骨丢失,并寻找潜在的治疗靶点 | 老年人群(临床队列)和大鼠模型(结合负重运动、肌肉萎缩和卵巢切除模型) | 肌肉骨骼生物学 | 骨质疏松症,肌肉减少症 | 单细胞RNA测序,抗体中和实验,重组蛋白处理,受体拮抗剂干预 | NA | 临床数据,动物模型数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-12-14 |
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106030
PMID:41265130
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研究论文 | 本研究是一项多中心回顾性研究,探讨了成熟三级淋巴结构(mTLS)在直肠癌抗肿瘤免疫中的作用及其受新辅助治疗的影响 | 首次在直肠癌中系统性地将成熟三级淋巴结构与B细胞介导的免疫特征、克隆多样性和患者预后相关联,并揭示了新辅助治疗对肿瘤免疫微环境(特别是TLS)的独特影响 | 研究为回顾性设计,样本量有限(特别是单细胞测序部分),且新辅助治疗队列的样本量较小,需要前瞻性研究验证 | 阐明成熟三级淋巴结构在直肠癌抗肿瘤免疫中的作用及其受新辅助治疗的调控机制 | 直肠癌患者,包括未接受治疗的患者和接受新辅助治疗的患者 | 数字病理学 | 直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组织化学, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 图像数据 | 未治疗队列:bulk RNA-seq (n=123), IHC/mIF (n=161), scRNA-seq (n=10), scBCR-seq (n=10);新辅助治疗队列:bulk RNA-seq (n=19), IHC (n=125) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 空间转录组学(通过多重免疫荧光间接评估) | NA | NA |
| 185 | 2025-12-14 |
Harnessing dental stem cell-derived synovial cells for IBD therapy: dual modulation of gut immunity and crypt repair
2025-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106039
PMID:41270582
|
研究论文 | 本研究提出利用人脱落乳牙干细胞分化为静息成纤维样滑膜细胞,通过双重调节肠道免疫和修复隐窝来治疗炎症性肠病 | 首次发现SHEDs可通过β-catenin非依赖的Wnt/JNK通路分化为具有双重治疗功能的QFLSs,同时靶向上皮损伤和免疫失调 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织验证,尚未开展临床人体试验 | 开发基于干细胞的新型IBD治疗方法 | 人脱落乳牙干细胞、小鼠结肠炎模型、人类IBD组织 | 干细胞治疗 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、类器官共培养 | NA | 单细胞转录组数据、组织学数据 | 小鼠模型(DSS/TNBS诱导)和人类IBD组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-12-14 |
Guided co-clustering transfer across unpaired and paired single-cell multi-omics data
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf639
PMID:41325188
|
研究论文 | 本文提出了一种名为GuidedCoC的新框架,用于将未配对scRNA-seq源数据的结构知识迁移到配对scRNA-seq/scATAC-seq目标数据中,以改进细胞聚类和特征对齐 | 通过统一的信息论目标联合跨模态和跨域共聚类细胞与特征,同时隐式执行跨模态降维以减少噪声,并自动对齐未配对和配对数据集中的细胞群体,无需显式标注 | 未在摘要中明确提及 | 提高单细胞多组学数据(特别是配对scRNA-seq和scATAC-seq数据)的集成鲁棒性、可扩展性和可解释性 | 未配对scRNA-seq数据和配对scRNA-seq/scATAC-seq数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | Guided Co-clustering Transfer (GuidedCoC)框架 | 单细胞基因表达和染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 187 | 2025-12-14 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2025-Dec-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
|
研究论文 | 本研究开发了两种基于机器学习的框架,用于在脑癌患者体内进行代谢通量估计,克服了组织采样、肿瘤微环境异质性和非稳态条件等挑战 | 首次将数字孪生框架和单细胞代谢通量分析框架应用于人类患者体内代谢通量估计,结合了第一性原理模拟、卷积神经网络和单细胞RNA测序数据与C-同位素示踪技术 | 研究主要针对脑癌患者,可能未涵盖其他癌症类型;依赖于患者样本的可用性和质量;框架在临床应用前需进一步验证 | 开发能够估计人类患者体内代谢通量的方法,以促进代谢疗法和生物标志物的发现 | 脑癌患者和脑癌小鼠模型中的代谢活动,特别是神经胶质瘤细胞 | 机器学习 | 脑癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、C-同位素示踪 | 卷积神经网络(CNN) | 单细胞RNA测序数据、同位素示踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-12-14 |
Association of Neuronal Autoantibodies with Overall Survival in Patients with Gastric Cancer
2025-Dec-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0495
PMID:41332104
|
研究论文 | 本研究探讨了胃癌患者中神经元自身抗体的存在及其与总生存期的关联 | 首次在无副肿瘤性神经综合征的胃癌患者中检测神经元自身抗体,并揭示其与较差的临床预后和肿瘤微环境中CD8+ T细胞浸润减少相关 | 单中心队列研究,样本量有限,单细胞测序仅使用有限肿瘤样本,需要进一步机制研究验证 | 探究胃癌患者神经元自身抗体的临床意义及其与生存预后的关系 | 胃癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 免疫荧光、细胞实验、单细胞测序 | NA | 血清样本、肿瘤组织 | 323例胃癌患者(TBA阳性144例,TBA阴性179例) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-12-14 |
Effect of Dipyridamole on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Pathogenicity
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.16
PMID:41334959
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研究论文 | 本研究探讨了双嘧达莫对实验性自身免疫性葡萄膜炎的影响,通过单细胞RNA测序分析揭示了其通过cAMP-STAT3-PIM1轴调节免疫细胞景观和降低Th17致病性的机制 | 首次将双嘧达莫应用于葡萄膜炎治疗研究,并利用单细胞RNA测序技术系统揭示了其通过cAMP-STAT3-PIM1信号轴调节免疫稳态的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类患者中进行临床试验验证 | 评估双嘧达莫对自身免疫性葡萄膜炎的治疗效果并探索其免疫调节机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型和葡萄膜炎患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠和葡萄膜炎患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-12-14 |
Targeting MCM6 Enhances Melphalan Chemosensitivity in Retinoblastoma by Modulating DNA Damage Response
2025-Dec-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.15.14
PMID:41334961
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研究论文 | 本研究探讨了DNA复制许可因子MCM6在视网膜母细胞瘤进展中的作用及其对美法仑化疗敏感性的影响 | 首次利用单细胞RNA测序揭示了MCM6在视网膜母细胞瘤中的表达模式,并证明靶向MCM6可增强美法仑的化疗敏感性 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本数量有限,需要进一步临床试验验证 | 探究MCM6在视网膜母细胞瘤中的作用机制及作为化疗增敏靶点的潜力 | 视网膜母细胞瘤细胞、患者肿瘤样本、小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 患者肿瘤样本(包括美法仑治疗失败标本)及细胞系模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2025-12-14 |
Pericyte-myofibroblast transition: a novel mechanism in peritoneal fibrosis and the effect of Asiaticoside
2025-Dec-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.11.072
PMID:41338386
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研究论文 | 本研究揭示了周细胞-肌成纤维细胞转化(PMT)是腹膜纤维化的关键机制,并评估了天然三萜类化合物积雪草苷(ASI)通过抑制PDGFRβ信号通路治疗纤维化的潜力 | 首次在腹膜纤维化中明确了周细胞向肌成纤维细胞转化的关键作用,并发现积雪草苷可通过靶向PDGFRβ信号通路抑制该过程,为抗纤维化治疗提供了新视角 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性仍需进一步验证;蛋白质组学分析的下游机制有待更深入探索 | 阐明腹膜纤维化的细胞起源机制,并探索针对PDGFRβ信号通路的抗纤维化治疗策略 | 氯己定葡糖酸盐诱导的腹膜纤维化小鼠模型、小鼠腹膜微血管周细胞 | 数字病理学 | 腹膜纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2025-12-14 |
The recombinant zoster vaccine induces trained immunity in monocytes through persistent downregulation of TGFβ
2025-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013759
PMID:41348857
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研究论文 | 本研究探讨了重组带状疱疹疫苗(RZV)在单核细胞中通过持续下调TGFβ诱导训练免疫的机制 | 首次揭示RZV通过基因组水平抑制TGFβ-1产生训练免疫,并证实其对同源(VZV-gE)和异源(HCMV、HSV)抗原的交叉保护作用 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本时间跨度较长但样本量未明确说明 | 探究高效能重组带状疱疹疫苗诱导训练免疫的分子机制 | 疫苗接种后的单核细胞、NK细胞和树突状细胞 | 免疫学 | 带状疱疹 | ATAC-seq、scRNA-seq、免疫蛋白质组学 | NA | 基因组可及性数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、ATAC测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-12-14 |
Multi-omics integration reveals hypoxia-driven mechanisms in vascular dementia: a machine learning and single-cell sequencing approach
2025-Dec, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004296
PMID:41377395
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研究论文 | 本研究通过多组学整合、机器学习和单细胞测序方法,识别并分析了血管性痴呆中与缺氧相关的枢纽基因,揭示了其在代谢、免疫反应和细胞分化中的作用 | 结合WGCNA、机器学习(如ssGSEA)和单细胞测序技术,首次在血管性痴呆中系统鉴定出DUSP1、MAFF和TGFBI作为缺氧相关枢纽基因,并关联到代谢通路、细胞死亡途径和免疫微环境 | 研究主要基于公共数据集(GSE122063、GSE282111)和动物模型(2VO),缺乏大规模临床样本验证,且机制探索仍需进一步实验确认 | 识别血管性痴呆中的缺氧相关枢纽基因,探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 血管性痴呆相关的基因表达数据、慢性脑低灌注模型(2VO)的脑组织样本 | 机器学习 | 血管性痴呆 | 单细胞测序、高通量测序、免疫组化 | 机器学习方法(具体未指定,如WGCNA、ssGSEA) | 基因表达数据(RNA-seq)、单细胞数据 | 基于公共数据集GSE122063和GSE282111,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2025-12-14 |
Unveiling the dental cellular landscape: A comprehensive review of single-cell RNA sequencing in human dental tissues
2025-Dec, The Japanese dental science review
DOI:10.1016/j.jdsr.2025.11.004
PMID:41377691
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综述 | 本文系统回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在揭示人类牙组织细胞异质性和分子动态方面的应用 | 首次对scRNA-seq在人类牙组织研究中的应用进行系统性综述,比较了健康与疾病状态下以及体内与培养环境中的细胞组成差异 | 仅纳入15项符合标准的研究,样本量有限;部分细胞亚群的具体功能仍需进一步验证 | 评估scRNA-seq在解析人类牙组织细胞图谱、理解组织稳态、再生和疾病机制方面的贡献 | 人类牙组织(包括牙髓、牙周组织等) | 单细胞组学 | 牙科疾病(龋齿、牙周炎) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 15项研究(具体样本数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-12-14 |
Systematic analysis of the expression profiles and prognostic values of the FAM72 family in liver cancer
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102358
PMID:41378103
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析评估了FAM72家族成员在肝癌中的表达水平及其预后相关性 | 首次系统分析了FAM72A-D在肝癌中的表达谱和预后价值,并开发了基于FAM72的基因特征用于预测肝癌患者预后 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;单细胞RNA测序数据仅提示FAM72A-D主要存在于增殖性T细胞中,具体机制未深入探讨 | 探究FAM72家族在肝癌中的表达特征和预后意义 | 肝癌组织与正常组织中的FAM72A-D基因 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-12-14 |
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-Dec-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052610
PMID:41048045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和类器官实验,揭示了ETV1作为调节肠道内分泌细胞中PYY表达的关键转录因子 | 首次发现ETV1特异性调控PYY表达而不影响GLP-1,揭示了L细胞谱系中激素转录调控的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和类器官,尚未在人体中进行验证 | 探究肠道内分泌激素PYY的转录调控机制 | 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 | 单细胞组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序, 定量PCR | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-12-14 |
Neutrophil-chemoattractant CXCL5 increases lung barrier permeability in acute lung injury
2025-Dec, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.003
PMID:41076014
|
研究论文 | 本研究探讨了中性粒细胞趋化因子CXCL5在急性肺损伤中对肺屏障通透性的影响 | 揭示了CXCL5除了已知的中性粒细胞招募作用外,还能独立增加肺泡上皮屏障的通透性 | NA | 研究CXCL5在肺屏障功能和炎症中的作用 | 严重肺炎患者、体外和体内急性肺损伤模型、Cxcl5缺陷小鼠、人类原代肺泡上皮细胞 | NA | 急性肺损伤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2025-12-14 |
Aqueous Humor Exosomal Membrane Proteins: Decoding Pathogenic Molecular Signatures in Retinitis Pigmentosa
2025-Dec-01, Translational vision science & technology
IF:2.6Q2
DOI:10.1167/tvst.14.12.15
PMID:41384798
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研究论文 | 本研究通过建立房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架,揭示了其在视网膜色素变性中的病理意义 | 首次建立房水外泌体膜蛋白的细胞来源追踪框架,并利用EVArray技术结合单细胞RNA测序数据,解码了视网膜色素变性中的免疫和胶质细胞相关分子特征 | 样本量较小(14例RP患者和7例对照),且研究对象为并发白内障的RP患者,可能限制了结果的普遍性 | 解码视网膜色素变性中房水外泌体膜蛋白的致病分子特征 | 房水外泌体膜蛋白 | 数字病理学 | 视网膜色素变性 | EVArray技术、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 | 14例视网膜色素变性并发白内障患者和7例年龄匹配的老年性白内障对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-12-13 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adl1988
PMID:40997217
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑及单细胞RNA测序CRISPR筛选,发现并验证了一类响应机械微环境的基因组增强子,即“机械增强子”,它们能调节细胞功能并影响疾病相关基因 | 首次系统性地识别并验证了响应基质硬度的基因组增强子,通过表观基因组编辑技术重编程细胞对机械微环境的响应,为机械驱动疾病的精准靶向提供了新策略 | 研究主要基于体外细胞模型和有限的人类肺成纤维细胞样本,体内验证和更广泛疾病模型的适用性尚需进一步探索 | 探究机械微环境如何通过表观遗传机制调控基因表达和细胞表型,以识别新型机械响应增强子 | 人类肺成纤维细胞(来自健康和纤维化供体)及相关的基因组增强子区域 | 表观遗传学 | 肺纤维化 | 全基因组表观基因组分析、表观基因组编辑、单细胞RNA测序CRISPR筛选 | CRISPR筛选 | 基因组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 200 | 2025-12-13 |
Comparative analysis of human and mouse ovaries across age
2025-Dec-11, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx0659
PMID:41066539
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研究论文 | 本文通过三维成像、单细胞转录组学和功能研究,比较了人类和小鼠卵巢在年龄变化中的差异 | 首次系统比较了人类和小鼠卵巢在转录和信号传导方面的物种特异性差异及年龄相关变化,并识别了卵巢交感神经和胶质细胞的作用 | 研究可能受限于样本数量或物种间生物学差异的复杂性,未详细探讨所有潜在机制 | 比较人类和小鼠卵巢的生物学特性,以评估小鼠作为人类卵巢生物学模型的适用性 | 人类和小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | NA | 三维成像, 单细胞转录组学 | NA | 图像, 转录组数据 | 未指定具体样本数量,但涉及人类和小鼠卵巢 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |