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当前共找到 1157 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-01-24 |
Alveolar Type II Cell-derived MMP1 high basal cells promote destructive microcysts in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693033
PMID:41573956
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研究论文 | 本研究揭示了特发性肺纤维化（IPF）中肺泡II型细胞（AT2）来源的、高表达MMP1的基底细胞在破坏性微囊肿形成中的作用 | 首次使用HTII-280作为AT2来源细胞的短期谱系标记，结合类器官和空间转录组学（Xenium），明确了IPF肺泡微囊肿中AT2来源基底细胞的独特表型及其表达MMP1促进胶原降解的机制，并发现Frizzled 5 WNT激动剂抗体可逆转该表型 | 研究主要基于体外类器官模型和小鼠异种移植实验，人类IPF患者的直接验证仍需进一步开展 | 探究特发性肺纤维化（IPF）中肺泡微囊肿形成的细胞来源和分子机制 | 肺泡II型细胞（AT2）、AT0细胞、基底样/基底细胞、IPF患者肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、类器官培养、异种移植 | NA | 空间转录组数据、组织图像 | 未明确说明具体样本数量，涉及IPF患者肺组织和体外模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | 10x Xenium空间转录组平台 |
| 182 | 2026-01-24 |
SEPAR enables spatial metagene discovery and associated molecular pattern characterization in spatial transcriptomics and multi-omics datasets
2025-Dec-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09340-w
PMID:41372421
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研究论文 | 本文提出了一种名为SEPAR的无监督框架，用于分析空间转录组学数据，通过整合基因活性和空间邻域关系来发现空间元基因并进行多种下游分析 | SEPAR框架能够识别由特定基因子集驱动的局部空间结构，而现有方法多关注全局空间域；它还能在空间多组学数据中揭示共定位的分子相关性 | NA | 开发一种计算框架以更好地解析空间转录组学数据中的空间细胞和分子组织 | 空间转录组学及空间多组学数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，空间多组学 | 无监督框架 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，空间CITE-seq，MISAR-seq | NA | NA |
| 183 | 2026-01-24 |
An α-specific PI3K inhibitor improves chemotherapy efficacy by inhibiting hepatic stellate cell activation in liver cancer
2025-Dec-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001639
PMID:41397162
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研究论文 | 本研究探讨了铂类化疗在肝癌中激活肝星状细胞的作用，并发现α特异性PI3K抑制剂阿培利司可抑制这种激活，从而提高化疗疗效 | 揭示了铂类化疗通过肿瘤细胞产生的过量活性氧激活肝星状细胞的机制，并首次提出使用α特异性PI3K抑制剂作为抑制化疗诱导的肝星状细胞激活的新策略 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证，且未详细探讨其他信号通路可能的影响 | 研究化疗对肝癌中肝星状细胞激活的影响，并探索通过调节肝星状细胞活性来提高治疗效果的策略 | 肝星状细胞、癌症相关成纤维细胞、肝细胞癌和胆道癌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化染色、RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫组化图像、RNA测序数据、流式细胞术数据 | 患者样本和小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-01-24 |
Histopathology and spatial transcriptomics jointly map myofiber-specific pathological programs in mTORC1-driven myopathy
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.692123
PMID:41573854
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研究论文 | 本研究结合组织病理学和空间转录组学技术，在mTORC1过度激活的啮齿动物模型中，揭示了肌纤维类型特异性的病理程序及其分子机制 | 首次将高分辨率Seq-Scope空间转录组学技术与组织病理学整合，在单肌纤维分辨率下解析mTORC1驱动肌病的病理机制 | 研究基于啮齿动物模型，结果可能不完全适用于人类疾病；仅分析了EDL和SOL两种肌肉，未覆盖所有肌肉类型 | 探究mTORC1过度激活如何通过不同代谢和结构途径破坏肌肉稳态，并建立组织病理表型与分子状态之间的直接联系 | 啮齿动物模型中的趾长伸肌（EDL）和比目鱼肌（SOL）肌肉组织 | 数字病理学 | 肌病 | 空间转录组学，组织病理学分析 | NA | 空间转录组数据，组织病理图像 | 啮齿动物模型中的EDL和SOL肌肉组织样本 | NA | 空间转录组学 | Seq-Scope | 高分辨率Seq-Scope技术 |
| 185 | 2026-01-24 |
Single-Cell Multiomic Profiling Uncovers Radiation Dosage-Sensitive, Cluster-Specific Regulatory Dynamics in Glioblastoma
2025-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.01.691699
PMID:41573875
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了胶质母细胞瘤在放射治疗后立即发生的细胞类型特异性转录和染色质可及性动态变化 | 首次在单细胞分辨率下整合RNA-seq和ATAC-seq分析，揭示了胶质母细胞瘤对临床相关放射剂量的即时、剂量依赖性、细胞簇特异性适应机制 | 研究仅分析了放射后三小时的早期反应，未评估长期适应性变化；使用体外培养的胶质瘤干细胞样细胞，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 探究放射治疗对胶质母细胞瘤细胞异质性和治疗抵抗性的影响机制 | 胶质母细胞瘤的胶质瘤干细胞样培养物 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 186 | 2026-01-24 |
Gut microbe-derived short-chain fatty acids regulate joint inflammation and activation of infiltrating and resident myeloid cells after alphavirus infection
2025-Dec-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.03.691668
PMID:41573877
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研究论文 | 本研究探讨了肠道微生物产生的短链脂肪酸在调节甲病毒感染后关节炎症及免疫细胞活化中的作用 | 首次揭示了抗生素诱导的肠道菌群失调通过影响关节组织中浸润和驻留免疫细胞的炎症表型，加剧甲病毒性关节炎的机制 | 研究基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究肠道共生菌、代谢物及宿主免疫机制在促进肌肉骨骼炎症中的作用 | 甲病毒（如基孔肯雅病毒和Mayaro病毒）感染的小鼠模型 | 微生物组学与免疫学 | 关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 187 | 2026-01-24 |
BioLACE: unifying spatial geometry and marker priors for cohesive cell-type clustering in spatial transcriptomics
2025-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.01.691603
PMID:41573943
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研究论文 | 本文提出了一个名为BioLACE的可扩展框架，用于空间转录组学中的细胞类型聚类，该框架统一了空间结构、转录组变异和标记基因信息 | BioLACE首次在共享的变分自编码器潜在空间中统一了空间几何结构、转录组变异和生物标记基因先验，通过联合优化三个互补目标实现了更优的聚类性能 | 未在摘要中明确说明 | 开发一个能够整合空间结构和生物标记基因先验的空间转录组学细胞类型聚类框架 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器 | 基因表达谱和空间坐标 | MERFISH下丘脑、小鼠脊髓和Slide-seq小鼠小脑数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-01-24 |
SpatialProp: tissue perturbation modeling with spatially resolved single-cell transcriptomics
2025-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.11.30.691355
PMID:41573962
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialProp的计算框架，利用图神经网络预测多基因、多细胞类型扰动对完整组织切片中细胞的影响 | 首次提出利用空间分辨单细胞转录组学数据，通过图神经网络建模组织微环境中的扰动传播，填补了传统方法仅限于解离细胞的空白 | 方法依赖于现有空间转录组学数据的自然异质性，可能受数据质量和覆盖范围的限制，且因果推理基准仍需进一步验证 | 开发一个计算框架以预测遗传扰动在完整组织中的空间效应，促进空间模式组织生物学的研究 | 空间分辨单细胞转录组学数据集中的组织微环境和细胞 | 计算生物学 | NA | 空间分辨单细胞转录组学 | 图神经网络 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 189 | 2026-01-24 |
Enhancer-directed gene delivery for digit regeneration based on conserved epidermal factors
2025-Dec-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.01.691633
PMID:41573951
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研究论文 | 本研究基于跨物种保守的表皮因子，开发了一种增强子导向的基因递送平台，用于促进小鼠指端再生 | 利用斑马鱼、蝾螈和小鼠的再生数据，识别出SP转录因子家族作为保守的表皮表达介质，并设计基于增强子的基因疗法来靶向递送FGF8，以部分挽救SP敲除小鼠的指端再生缺陷并加速野生型小鼠的再生过程 | 研究主要基于小鼠指端再生模型，可能不完全适用于更广泛的肢体再生或人类临床转化，且基因递送平台的长期安全性和效率需进一步验证 | 探索基于保守表皮因子的增强子导向基因递送策略，以促进哺乳动物指端再生，为肢体再生医学提供新方法 | 斑马鱼尾鳍、蝾螈肢体和小鼠指端的再生过程，聚焦于SP转录因子家族及其靶基因FGF8 | 再生医学 | 肢体缺失 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、条件性基因敲除、腺相关病毒（AAV）载体介导的基因递送 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 涉及斑马鱼、蝾螈和小鼠的再生组织样本，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2026-01-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals genes relevant to periodontal therapy and periodontitis
2025-Dec-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了健康与牙周炎状态下口腔黏膜和牙龈的基因表达差异及细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序对健康与牙周炎状态下的人类口腔组织进行无偏分子表征，揭示了牙周炎中连接上皮细胞的基因表达变化，包括炎症和抗氧化基因，并预测了牙周炎成纤维细胞中普遍存在的自分泌信号 | NA | 探究口腔黏膜与牙龈的分子差异以及牙周感染对组织间相互作用的影响 | 人类口腔黏膜和牙龈组织，包括健康状态和牙周炎状态 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 191 | 2026-01-23 |
Transcriptome-wide Mendelian randomization and single-cell analysis during CD4+ T cell activation deciphers immunotherapeutic targets for colorectal cancer
2025-Dec-29, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01236-6
PMID:41461936
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研究论文 | 本研究通过转录组范围孟德尔随机化与单细胞分析，揭示了CD4+ T细胞活化在结直肠癌进展中的关键作用，并识别出潜在的免疫治疗靶点 | 首次结合转录组范围孟德尔随机化、单细胞RNA测序与多组学验证，系统解析CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系，识别出PARP14和ORMDL3等关键免疫治疗靶点 | 研究主要基于遗传学与转录组数据，需进一步实验验证靶点的功能机制与临床转化潜力 | 识别结直肠癌免疫治疗的潜在靶点 | CD4+ T细胞活化相关基因与结直肠癌的因果关系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 多组学分析 | 孟德尔随机化模型, 单细胞转录组分析 | 遗传学数据, 转录组数据, 单细胞表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2026-01-23 |
The Distinct Monocyte Subsets and Intercellular Communication in Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Dec-27, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01974-z
PMID:41454184
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了原发性干燥综合征患者中单核细胞亚群、亚群间通讯的异常变化及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在pSS患者中利用scRNA-seq全面表征单核细胞亚群和亚群的异质性，识别出新的亚群变化和潜在生物标志物 | 样本量有限，未进行功能验证实验，且研究仅关注单核细胞，未全面评估其他免疫细胞类型 | 探究原发性干燥综合征患者单核细胞亚群和亚群的变异及其功能角色 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的单核细胞样本 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及pSS患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2026-01-23 |
Intrinsic and non-cell autonomous roles for a neurodevelopmental syndrome-linked transcription factor
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.23.696256
PMID:41509263
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研究论文 | 本文揭示了转录因子UNC-3在运动神经元中的细胞自主和非细胞自主功能，及其与人类EBF3综合征的关联 | 首次发现UNC-3作为终端选择因子，不仅通过细胞自主方式调控神经元身份，还通过胆碱能神经传递介导非细胞自主效应，影响下游GABA运动神经元的转录、形态和连接 | 研究基于线虫模型，人类EBF3综合征的直接机制仍需进一步验证 | 探究转录因子在神经元身份和电路组装中的内在与外在调控作用 | 线虫的胆碱能和GABA运动神经元 | 神经发育生物学 | 神经发育综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 194 | 2026-01-23 |
FlashDeconv enables atlas-scale, multi-resolution spatial deconvolution via structure-preserving sketching
2025-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696108
PMID:41509391
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FlashDeconv的框架，用于图谱规模的空间转录组学解卷积，通过结构保持的随机草图技术，在保持计算效率的同时保留稀有生物信号 | 采用杠杆得分重要性采样来优先处理转录组学上独特的标记，保留标准特征选择丢弃的稀有细胞类型信号，相比基于方差的方法能更准确地解卷积 | 未明确提及具体局限性，但可能依赖于特定数据质量或算法假设 | 开发一个可扩展的数学框架，用于图谱规模的空间转录组学解卷积，以快速进行患者分层和生物结构发现 | 人类卵巢癌队列数据，包括细胞共定位信号和Tuft细胞微环境 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学解卷积 | 结构保持随机草图框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 195 | 2026-01-23 |
In vivo human embryonic spinal cord atlas validates stem cell-derived human dorsal interneurons and reveals ASD spinal signatures
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.696129
PMID:41509229
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研究论文 | 本研究开发了一种改进的方法，通过神经中胚层祖细胞状态从人类胚胎干细胞生成脊髓背侧中间神经元，并构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱，用于验证干细胞来源的神经元并揭示与自闭症谱系障碍相关的脊髓特征 | 提出了一种通过生理中间体（神经中胚层祖细胞）生成人类脊髓背侧中间神经元的新方法，并首次构建了人类胚胎脊髓的单细胞RNA-Seq图谱，揭示了dI4/dI5群体的显著扩张及其与自闭症谱系障碍的关联 | 未明确说明样本大小或实验验证的局限性，可能依赖于体外模型，缺乏体内功能验证 | 开发干细胞分化协议以生成脊髓背侧中间神经元，用于脊髓损伤后的感觉恢复，并探索脊髓在自闭症谱系障碍中的作用 | 人类胚胎干细胞（hESCs）、人类胚胎脊髓组织、脊髓背侧中间神经元（dI1-dI6） | 干细胞生物学与神经科学 | 脊髓损伤、自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA-Seq、干细胞定向分化 | NA | 单细胞RNA-Seq数据、基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 196 | 2026-01-23 |
Glycolysis maintains effector function of lung Th17 TRM cells in precision cut lung slices
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114051
PMID:41399496
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和肺切片培养模型，揭示了糖酵解在维持肺CD4 Th17组织驻留记忆细胞效应功能中的关键作用 | 首次发现糖酵解是维持肺Th17 TRM细胞效应功能的关键代谢途径，并建立了肺切片培养模型作为研究TRM细胞功能的体外平台 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体样本中进一步验证；肺切片培养模型可能无法完全模拟体内微环境 | 探究维持肺组织驻留记忆Th17细胞功能的分子机制 | 肺CD4组织驻留记忆Th17细胞 | 免疫学 | 肺部感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点（第30、90、184天）的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2026-01-23 |
Hydrophobic complementarity-determining region 3 (CDR3) sequences elucidate the cardiotoxic effects of immune checkpoint inhibitors
2025-Dec-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8320867/v1
PMID:41510228
|
研究论文 | 本研究通过分析免疫检查点抑制剂（ICIs）引发心脏毒性患者的免疫细胞，揭示了T细胞受体（TCR）CDR3序列的疏水性特征在心肌炎发病机制中的作用 | 首次发现免疫相关不良事件（irAE）心肌炎患者的T细胞具有更短的TCR CDR3序列和更高的疏水性残基比例，提出了基于TCR功能混杂性和TCR-MHC相互作用的T细胞激活新机制 | 研究样本来自特定患者群体，结果可能受限于样本量，且机制研究主要在描述性层面，需要进一步功能验证 | 阐明免疫检查点抑制剂引发心脏毒性的免疫学机制，为开发靶向TCR物理特性的精准治疗策略提供依据 | 经历ICIs治疗并出现心脏毒性的癌症患者的外周血单个核细胞、心脏组织及心包液中的T细胞 | 免疫学 | 心血管疾病 | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体（TCR）测序 | NA | 单细胞转录组数据、TCR序列数据、流式细胞数据 | 经历ICIs治疗并出现心脏毒性的癌症患者（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2026-01-23 |
Integrative bulk and single-cell transcriptomic profiling identifies core gene networks and potential therapeutic targets in glioma
2025-Dec-13, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15454-5
PMID:41388523
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研究论文 | 本研究通过整合多个队列的转录组数据和单细胞分析，系统性地识别了胶质瘤的核心基因网络和潜在治疗靶点 | 结合多队列批量转录组数据与单细胞RNA测序分析，识别出六个在胶质瘤中一致下调的枢纽基因，并揭示了它们与免疫微环境和肿瘤细胞谱系的关联 | 研究主要基于公共数据集和有限的临床样本验证，未来需要更大规模的独立队列和功能实验进一步验证 | 识别胶质瘤的核心基因网络和潜在诊断生物标志物及治疗靶点 | 胶质瘤组织样本 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | WGCNA, LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据 | 504个批量转录组样本（来自5个GEO数据集）和69个临床样本用于qRT-PCR验证，外加三个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2026-01-23 |
Multiomics insights into rumen microbiome and function in grazing lambs: implications for nutrient absorption and grassland sustainability
2025-Dec-12, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02200-z
PMID:41387926
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究了放牧羔羊瘤胃微生物组与功能，揭示了其对养分吸收和草地可持续性的影响 | 首次结合宏基因组、宏转录组、单细胞RNA测序和血清代谢组学，系统分析了瘤胃微生物与宿主上皮细胞在草料消化和短链脂肪酸代谢中的相互作用 | 研究样本仅限羔羊，结果可能无法直接推广到其他反刍动物或不同放牧条件 | 探究瘤胃微生物组如何调控草料摄入和宿主代谢，以优化反刍动物管理策略和草地可持续性 | 72只放牧羔羊的瘤胃微生物组、瘤胃壁上皮细胞和血清代谢物 | 微生物组学 | NA | 宏基因组分析, 宏转录组分析, 单细胞RNA测序, 血清代谢组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 代谢组数据 | 72只羔羊 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-01-23 |
CD9-positive tumor-associated macrophages promote renal cell carcinoma progression by activating the orphan nuclear receptor Nor1/Nr4a3
2025-Dec-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04060-x
PMID:41388297
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CD9阳性肿瘤相关巨噬细胞通过激活孤儿核受体Nor1/Nr4a3促进肾细胞癌进展 | 首次在肾细胞癌肿瘤组织中鉴定出CD9巨噬细胞亚群，并揭示其通过激活Nor1/Nr4a3促进肿瘤发展的新机制 | 样本量较小（仅3例患者），机制研究仍需进一步验证 | 探究肾细胞癌肿瘤微环境中巨噬细胞的作用机制 | 肾细胞癌患者肿瘤组织、外周血免疫细胞及体外细胞模型 | 单细胞组学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例肾细胞癌患者的肿瘤组织及匹配的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |