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当前共找到 764 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-17 |
Glycolysis maintains effector function of lung Th17 TRM cells in precision cut lung slices
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114051
PMID:41399496
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和精准肺切片模型，揭示了糖酵解在维持肺CD4 Th17组织驻留记忆细胞效应功能中的关键作用 | 首次利用精准肺切片模型结合单细胞RNA测序，系统追踪抗原特异性CD4 TRM细胞随时间变化的代谢特征，并明确糖酵解对其效应功能的维持作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚需进一步开展 | 探究肺CD4 Th17组织驻留记忆细胞的维持机制 | 肺CD4 Th17组织驻留记忆细胞 | 免疫学 | 肺部感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点（第30、90、184天）的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-12-17 |
Combined HIF-1α blockade and CHIR99021 treatment reverses pulmonary fibrosis via modulation endothelial-to-mesenchymal transition
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114028
PMID:41399517
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研究论文 | 本研究通过联合抑制HIF-1α和GSK-3β，逆转了辐射诱导的肺纤维化，并揭示了其通过调节内皮-间质转化、DNA修复和染色质重塑的机制 | 首次提出联合靶向HIF-1α和GSK-3β（使用2-ME和CHIR99021）来逆转肺纤维化，并通过单细胞RNA测序和谱系追踪证实了其在恢复内皮细胞特性和抑制间质转化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和患者成纤维细胞，尚未在人体临床试验中验证，且具体信号通路细节需进一步探索 | 探索逆转辐射诱导肺纤维化（RIPF）和特发性肺纤维化的新治疗策略 | 内皮细胞、肺成纤维细胞、小鼠RIPF模型以及特发性肺纤维化患者的成纤维细胞 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | RNA测序数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和患者成纤维细胞样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-12-17 |
[Single-cell RNA sequencing of B cells reveals molecular typing in Sjögren syndrome]
2025-Dec-18, Beijing da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Peking University. Health sciences
PMID:41399063
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研究论文 | 本研究通过B细胞单细胞RNA测序数据，对干燥综合征患者进行无监督聚类，建立了分子分型框架，揭示了三种具有不同生物学特征和临床异质性的亚型 | 首次基于B细胞scRNA-seq数据对干燥综合征进行分子分型，定义了三种新的亚型（干扰素主导型、B细胞活化型和内质网应激型），并阐明了各亚型特异的基因特征、通路富集、自身抗体谱和B细胞亚群分布 | 研究样本量有限（24名患者和4名健康对照），数据来源于公共数据库（GEO），缺乏独立队列验证，且未进行功能实验验证所识别的核心基因和潜在治疗靶点 | 建立干燥综合征的分子分型框架，以阐明其临床异质性并为靶向治疗开发提供见解 | 干燥综合征患者和健康对照者的B细胞 | 数字病理学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 24名干燥综合征患者和4名健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-12-17 |
HLA-DQB1*03:01 strongly affects age of onset of type 1 narcolepsy independently of DQA1 and ethnicity
2025-Dec-16, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2513989122
PMID:41364757
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研究论文 | 本研究通过跨种族全基因组关联分析，首次发现HLA-DQB1*03:01是独立于DQA1和种族、显著影响1型发作性睡病发病年龄的主要遗传因素 | 首次进行跨种族GWAS研究，明确HLA-DQB1*03:01对发病年龄的独立且保守的强效应，并探索其可能通过影响T细胞受体库发挥作用的机制 | 研究主要基于遗传关联分析，疾病致病性T细胞的具体鉴定及其与病理生理学的直接关联仍需进一步实验验证 | 探究影响1型发作性睡病发病年龄的遗传因素及其跨种族保守性 | 1型发作性睡病患者 | 遗传学 | 发作性睡病 | 全基因组关联研究（GWAS）、批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 来自中国、欧洲、韩国、日本和美国的5339例病例 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-12-17 |
The intratumor microbiome and cancer immunity: from pathogenesis to therapeutic opportunities through artificial intelligence
2025-Dec-16, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2602537
PMID:41368873
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物组在癌症免疫中的作用，探讨了其从发病机制到通过人工智能挖掘治疗机会的潜力 | 整合了肿瘤内微生物组与免疫系统的相互作用，并强调了人工智能（包括机器学习和深度学习）在结合空间转录组学等多组学数据中，用于诊断、治疗反应预测和个性化肿瘤学的创新应用 | 面临数据异质性、模型可解释性以及伦理问题等障碍，需要标准化协议、高分辨率空间分析、外部验证和专业注释数据集来克服 | 评估肿瘤内微生物组在癌变不同阶段（包括起始、进展和转移）与免疫系统的相互作用，并探索通过人工智能技术推动精准肿瘤学的机会 | 肿瘤内微生物组（包括细菌、真菌和病毒）及其在肿瘤微环境中的功能 | 机器学习 | 癌症 | 下一代测序，空间转录组学 | 机器学习，深度学习 | 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，下一代测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-12-17 |
Multi-omics characterization of autophagy-related molecular features in intrahepatic cholestasis of pregnancy†
2025-Dec-16, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf184
PMID:40796229
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研究论文 | 本研究通过多组学方法系统表征了妊娠期肝内胆汁淤积症中自噬相关的分子特征 | 首次结合非靶向脂质组学、单细胞RNA测序和RNA测序数据，全面揭示ICP中自噬相关脂质、细胞和基因表达变化，并验证了TNFSF10作为潜在治疗靶点 | 样本量未在摘要中明确说明，可能限制结果的普遍性 | 探究自噬在妊娠期肝内胆汁淤积症发病机制中的作用 | 胎盘组织、细胞模型和动物模型 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 非靶向脂质组学, scRNA-seq, RNA-seq | NA | 脂质组数据, 单细胞RNA测序数据, RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-17 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
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研究论文 | 本研究提出了一种名为PASTA的空间通路表达插补方法，旨在通过整合细胞类型和空间邻近性信息，提高空间转录组学数据中未测量基因表达预测的准确性和生物相关性 | PASTA创新性地结合细胞类型和空间邻近性假设，并整合通路信息进行基因表达插补，从而提升预测的稳健性和生物学意义，区别于传统关注单个基因的方法 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种计算方法来预测空间转录组学数据中未测量的基因表达，以克服靶向原位技术基因测量数量有限的障碍 | 空间转录组学数据和单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | PASTA（通路导向的空间基因插补方法） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-17 |
Ovarian cancer metastasis to the human omentum disrupts organ homeostasis and induces fundamental tissue reprogramming
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67557-z
PMID:41397972
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了卵巢癌转移至人类大网膜时如何破坏器官稳态并诱导组织重编程 | 首次系统性地绘制了良性及转移状态下大网膜不同解剖区域的单细胞图谱，并识别了小网膜作为前转移微环境的关键特征 | 研究样本可能有限，且未深入探讨癌症细胞信号对远端组织区域的具体分子机制 | 探究大网膜在维持稳态中的作用及其对卵巢癌转移的反应 | 良性条件患者和卵巢癌转移患者的网膜组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及良性条件和转移患者的网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-12-17 |
Vitamin D Regulates Olfactory Function via Dual Transcriptional and mTOR-Dependent Translational Control of Synaptic Proteins
2025-Dec-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507181
PMID:41400017
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研究论文 | 本文揭示了维生素D通过VDR受体和mTOR信号通路，在转录和翻译水平上调控嗅球僧帽细胞突触蛋白表达，从而影响嗅觉功能的细胞特异性机制 | 首次发现维生素D通过VDR-mTOR翻译调控轴与经典转录调控并行作用，将营养状态与突触功能及感觉处理直接联系起来 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性及临床转化潜力尚需进一步验证 | 探究维生素D缺乏与神经功能障碍的细胞类型特异性机制 | 小鼠（从断奶到成年期控制维生素D水平） | 神经科学 | 神经功能障碍 | 单核RNA测序（snRNA-seq）、空间转录组学、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq） | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、染色质结合数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2025-12-17 |
Nanoplastics in Duckweed: Single-Cell Responses and Recovery
2025-Dec-16, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c15989
PMID:41400345
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、酶学分析和铕掺杂纳米塑料示踪技术，全面探究了浮萍在环境相关剂量和高剂量聚苯乙烯纳米塑料暴露及恢复阶段的响应与恢复机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示了浮萍对纳米塑料的细胞类型特异性响应机制，并整合纳米示踪技术量化了吸收与排泄过程 | 研究仅针对聚苯乙烯纳米塑料和浮萍模型，其他类型纳米塑料或水生植物的响应机制仍需进一步探究 | 阐明水生植物对纳米塑料污染的响应与恢复的分子机制 | 浮萍（水生植物模型） | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学，酶学分析，铕掺杂纳米塑料示踪 | NA | 单细胞转录组数据，酶活性数据，纳米塑料定量数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序 |
| 11 | 2025-12-17 |
Myeloid CD36 deficiency alleviates hepatic fibrosis by promoting adaptive immunity of macrophage
2025-Dec-16, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001646
PMID:41400628
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研究论文 | 本研究揭示了CD36介导的巨噬细胞脂质代谢如何通过影响抗原呈递和CD8⁺ T细胞功能调控肝纤维化进展 | 首次阐明CD36驱动的脂质摄取通过诱导铁死亡和损害适应性免疫来重编程巨噬细胞代谢，并发现靶向CD36可恢复巨噬细胞抗原呈递功能 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本分析，尚未进行大规模临床试验验证CD36靶向治疗的安全性和有效性 | 探究巨噬细胞CD36介导的脂质代谢如何调节免疫功能及肝纤维化发展 | 肝巨噬细胞、肝星状细胞、CD8⁺ T细胞及肝硬化患者样本 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、组织学分析、血清学分析 | NA | RNA测序数据、组织图像、血清数据 | 小鼠模型及肝硬化患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-12-17 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of GL261 Glioblastoma Cells Reveals Gene Expression Signatures Underlying Tumorigenicity
2025-Dec-16, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01635-0
PMID:41400763
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对GL261胶质母细胞瘤细胞进行转录组分析，揭示了与肿瘤发生相关的基因表达特征 | 首次在GL261胶质母细胞瘤细胞系中应用单细胞RNA测序技术，全面揭示了其转录组特征，并识别了与肿瘤发生相关的关键基因表达变化 | 研究仅基于GL261细胞系，未涉及临床样本，可能无法完全反映人类胶质母细胞瘤的复杂性 | 探究GL261胶质母细胞瘤细胞的转录组特征，以理解肿瘤生物学和治疗反应 | GL261胶质母细胞瘤细胞系（包括贴壁细胞和神经球细胞） | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | PCA, UMAP | 单细胞转录组数据 | 5764个贴壁细胞和4951个神经球细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-12-17 |
Analyzing cell-type-specific isoform expression using IsoDiffR and long-read single-cell RNA sequencing
2025-Dec-16, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf664
PMID:41400872
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研究论文 | 本文介绍了IsoDiffR，一个用于分析长读长单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性RNA异构体表达的工具 | 开发了IsoDiffR工具，专门针对长读长单细胞RNA测序技术，能够识别跨细胞类型中表达模式不同于对应基因或主要异构体的RNA异构体，支持成对和多细胞类型比较 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 开发和分析长读长单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性RNA异构体表达的方法，以深入理解基因表达调控 | Macaca fascicularis的角膜缘和人类额叶皮层的长读长单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未在摘要中指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2025-12-17 |
Pair-rule-like transcription patterns during neural tube closure in a proto-vertebrate
2025-Dec-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.205064
PMID:41217384
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研究论文 | 本研究在原始脊椎动物海鞘中揭示了Lmx1、Cdkn1b和Msx基因在神经管闭合过程中调控背侧中线动态的转录回路 | 首次在原始脊椎动物中发现神经管闭合过程中存在类似体节对规则的转录模式，并揭示了Lmx1和Cdkn1b的互补交替表达协调增殖与融合的新机制 | 研究主要基于海鞘模型，在高等脊椎动物中的普适性有待进一步验证 | 探究神经管闭合过程中转录程序如何协调形态发生行为 | 海鞘(Ciona)胚胎的神经管闭合过程 | 发育生物学 | NA | 高分辨率HCR原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-12-17 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2025-Dec-15, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
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研究论文 | 本研究利用大鼠模型，通过bulk和空间转录组学技术，揭示了创伤诱导急性肾损伤中出血性休克和横纹肌溶解的个体及协同作用机制 | 首次在临床相关大鼠模型中结合bulk和空间转录组学，成功将小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾脏组织，实现了成本效益高且区域特异性的基因表达分析 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的直接适用性需进一步验证 | 阐明创伤诱导急性肾损伤的分子机制，以识别新型生物标志物和治疗策略 | 大鼠肾脏组织 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | bulk转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 16 | 2025-12-17 |
New insights into macrophage heterogeneity in renal injury and repair
2025-Dec-15, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70369
PMID:41396841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤不同阶段的动态变化和异质性 | 识别了四种不同的肾脏巨噬细胞亚群，并阐明了单核来源巨噬细胞在损伤进展中驱动炎症，而肾脏驻留Cx3cr1巨噬细胞通过AXL-GAS6信号介导的胞葬作用促进修复 | NA | 探究巨噬细胞在急性肾损伤中的异质性及其在肾脏损伤和修复中的作用 | 巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤模型中的动态变化 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-12-17 |
MAGNET: Multi-view graph autoencoder with cell-gene attention for cell interaction network reconstruction from spatial transcriptomics
2025-Dec-15, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013810
PMID:41397026
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研究论文 | 提出一种名为MAGNET的多视图图自编码器框架，通过细胞-基因注意力模块重建空间转录组数据中的细胞间相互作用网络 | 开发了细胞-基因注意力模块，将细胞的外部相互作用与内部基因调控在统一表示中连接起来，克服了现有方法简单拼接的局限 | 未明确说明模型的计算复杂度或对大规模数据集的扩展性 | 从空间转录组数据中准确推断细胞间相互作用网络 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 多视图图自编码器 | 空间转录组数据 | 基准数据集（seqFISH、MERFISH、STARMAP）及乳腺癌数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 18 | 2025-12-17 |
scRepli-RamDA-seq: a multi-omics technology enabling the analysis of gene expression dynamics during S-phase
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64688-1
PMID:41397953
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRepli-RamDA-seq（scRR-seq）的新型单细胞多组学技术，能够同时分析S期进展过程中的DNA复制和基因表达动态 | scRR-seq首次实现了在单细胞水平上以单倍型特异性的方式，高分辨率地分析DNA复制谱和全长总RNA测序，并能基于DNA复制数据确定细胞的S期阶段，从而研究S期进展中的基因表达动态 | NA | 开发一种能够分析S期进展过程中基因表达动态的单细胞多组学技术 | 单细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞DNA复制谱分析、全长总RNA测序 | NA | DNA复制数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 19 | 2025-12-17 |
New insights into the mechanism of microvascular rarefaction via endothelial-mesenchymal transition in steroid-induced osteonecrosis of femoral head
2025-Dec-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30454-y
PMID:41398023
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研究论文 | 本研究探讨了内皮-间质转化在激素性股骨头坏死中的作用及其与微血管稀疏和组织损伤的关联，并初步探索了糖皮质激素诱导的氧化应激是否参与此过程 | 首次发现内皮-间质转化可能参与激素性股骨头坏死的发病机制，并揭示其与微血管稀疏的密切关联 | 研究为初步探索，需进一步验证EndMT在SONFH中的具体分子机制和临床转化潜力 | 研究激素性股骨头坏死的发病机制，特别是微血管稀疏的潜在机制 | 激素性股骨头坏死的囊性病变组织、人脐静脉内皮细胞以及糖皮质激素诱导的SONFH小鼠模型 | 数字病理学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据, 体外细胞实验数据, 动物模型数据 | 未明确指定具体样本数量，涉及SONFH囊性病变组织、HUVECs细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2025-12-17 |
Persistent pneumococcal colonisation in antiretroviral-treated HIV infection is associated with nasal inflammation
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67258-7
PMID:41398159
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研究论文 | 本研究揭示了长期抗逆转录病毒治疗（ART）的HIV感染者鼻黏膜免疫未能恢复，并发现其与肺炎球菌持续定植相关的鼻部炎症特征 | 首次在长期ART治疗的HIV感染者中，通过多组学方法系统揭示了鼻黏膜特异性免疫失调的特征，并发现了上皮细胞驱动的中性粒细胞炎症与肺炎球菌定植密度之间的正反馈循环机制 | 研究样本量相对有限，且为横断面研究，未能明确因果关系；未评估其他呼吸道病原体的影响 | 探究长期ART治疗的HIV感染者鼻黏膜免疫状态与肺炎球菌持续定植的关联机制 | 接受抗逆转录病毒治疗超过1年的HIV感染者（PLHIV-ART） | 数字病理学 | HIV感染/肺炎球菌感染 | 流式细胞术、单细胞转录组学、中性粒细胞功能检测 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、功能实验数据 | 接受ART治疗超过1年的HIV感染者群体（具体人数未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |