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当前共找到 1117 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-01 |
Dermatomyositis is characterized by JAK1-mediated monocyte-driven vasculopathy and inflammation
2025-12-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aea9007
PMID:41442501
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析皮肌炎中JAK1介导的单核细胞驱动血管病变和炎症机制 | 首次通过跨疾病比较（皮肌炎与红斑狼疮）揭示皮肌炎特异性单核细胞与内皮细胞互作导致的血管病变，并发现JAK1抑制可逆转相关表型 | 样本量有限且主要聚焦皮肤组织，对肌肉病变机制未深入探讨 | 阐明皮肌炎免疫发病机制，尤其是血管病变和炎症的分子基础 | 皮肌炎患者的非病灶皮肤、病灶皮肤及外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序 | 细胞通讯网络分析 | 基因表达数据 | 皮肌炎、红斑狼疮患者及健康对照的皮肤和外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2 | 2025-12-26 |
HDAC5 deacetylates cytosolic ACTN4 during skin reepithelialization and represents a therapeutic target for chronic wound healing
2025-12-24, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ads0594
PMID:41442502
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研究论文 | 本研究揭示了HDAC5通过去乙酰化ACTN4促进皮肤再上皮化的新机制，并发现其激活剂可改善慢性伤口愈合 | 首次发现HDAC5通过核质穿梭去乙酰化非组蛋白ACTN4，调控YBX1转录活性，从而促进皮肤再上皮化，并鉴定出HDAC5选择性激活剂G194-0712在多种慢性伤口模型中的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和离体人皮肤，临床转化效果需进一步验证 | 探究皮肤伤口愈合中再上皮化的分子调控机制，寻找慢性伤口治疗新靶点 | 人类皮肤组织、小鼠伤口模型（包括糖尿病伤口、缺血性伤口和辐射损伤模型） | 分子生物学与皮肤修复 | 慢性伤口愈合障碍 | 条件性基因敲除小鼠模型、液相色谱-质谱联用、定点突变、免疫荧光、荧光素酶报告基因检测、单细胞转录组分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、图像数据 | 未明确具体样本数量，涉及人类组织、多种小鼠伤口模型 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 3 | 2025-12-08 |
Multi-omics integrated analysis identifies causal risk factors and therapeutic targets for diabetic retinopathy
2025-12-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07353-x
PMID:41340073
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，系统识别了糖尿病视网膜病变的因果风险因素和治疗靶点 | 首次通过双样本孟德尔随机化、共定位/SMR、NHANES数据、转录组学和机器学习等多方法整合，系统识别DR的因果基因、风险因素和核心调控靶点 | 研究主要基于观察性数据和遗传学证据，需要进一步实验验证靶点的功能机制 | 探索糖尿病视网膜病变的风险因素、致病机制和潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者及其亚型（背景性DR、增殖性DR） | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 孟德尔随机化、共定位分析、SMR、转录组学、单细胞转录组学、机器学习 | 逻辑回归、限制性立方样条、机器学习模型、列线图 | 遗传数据、蛋白质数据、转录组数据、临床调查数据 | NHANES 1999-2010横断面数据，涉及16,989个基因和2,923个蛋白质 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-07-25 |
Integration of angiogenesis and programmed cell death mechanisms unveils potential diagnostic and therapeutic targets in spinal cord injury
2025-12-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07405-2
PMID:41444617
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5 | 2025-12-27 |
HiSTaR: identifying spatial domains with hierarchical spatial transcriptomics variational autoencoder
2025-12-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07404-3
PMID:41437257
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研究论文 | 本文提出了一种名为HiSTaR的分层空间转录组学变分自编码器，用于从空间转录组学数据中捕获多级潜在特征，以识别空间域并校正批次效应 | HiSTaR采用多个分层块来捕获多级潜在特征，支持空间域识别、批次效应校正、轨迹分析和差异基因表达分析，无需外部工具即可整合多个组织切片 | NA | 开发一种计算工具以改进空间转录组学数据的分析，特别是空间域识别和批次效应校正 | 空间转录组学数据中的点（spots） | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器（VAE） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6 | 2025-12-22 |
Molecular subtyping and prognostic evaluation in idiopathic pulmonary fibrosis: a focus on mechanical-related genes
2025-12-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07365-7
PMID:41408564
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研究论文 | 本研究聚焦于机械力相关基因，对特发性肺纤维化进行分子分型与预后评估 | 首次将机械力相关基因评分应用于IPF，识别出与机械力相关的核心基因和分子亚型，并通过单细胞RNA测序和CMap分析揭示了潜在的致病机制与治疗靶点 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要前瞻性临床队列验证核心基因的预后价值 | 探究机械敏感基因在特发性肺纤维化发病机制中的作用，并进行分子分型与预后评估 | 特发性肺纤维化患者样本与对照样本 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，机器学习算法，Cox回归分析，Connectivity Map分析 | 机器学习算法，Cox回归模型，列线图 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据，临床病理数据 | IPF样本与对照样本（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-13 |
Discovery of highly potent marine-derived compound Penicolinate H reveals SREBP-1 mediated lipogenesis as a druggable vulnerability in gastric cancer
2025-12-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07323-3
PMID:41366453
|
研究论文 | 本研究从海洋来源真菌中发现了一种新型化合物Penicolinate H，通过靶向SREBP-1介导的脂质合成，揭示了其在胃癌治疗中的潜力 | 首次发现海洋来源化合物Penicolinate H作为SREBP-1抑制剂，并证实SREBP-1介导的脂质合成是胃癌的可成药性脆弱点 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证 | 探索天然海洋产物作为抗胃癌先导化合物，并揭示其作用机制与治疗靶点 | 胃癌细胞系、动物模型及患者转录组数据 | 癌症研究 | 胃癌 | 高通量RNA测序、生物信息学分析、内源性亲和下拉实验、细胞热位移实验、表面等离子共振实验、分子对接 | NA | 转录组数据、体外实验数据、体内实验数据 | 胃癌细胞系及动物模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞转录组分析、高通量RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2025-12-13 |
Hypoxic migrasomes drive colorectal cancer liver metastasis by mediating CD5L+ macrophage efferocytosis via NRP2/PROX1 axis
2025-12-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07485-0
PMID:41361466
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧条件下结直肠癌细胞来源的迁移体通过NRP2/PROX1轴介导CD5L+巨噬细胞胞葬作用，从而驱动结直肠癌肝转移的机制 | 首次阐明了迁移体在结直肠癌肝转移中的具体作用机制，特别是发现了缺氧迁移体通过NRP2/PROX1轴重编程肿瘤微环境，诱导CD5L+巨噬细胞分化的新通路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人体内的验证和临床转化仍需进一步研究 | 探究结直肠癌来源的迁移体在肝转移中的作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 | 结直肠癌组织、细胞、小鼠肝转移模型、肝脏转移灶中的免疫细胞和基质细胞 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 透射电子显微镜、免疫荧光、活细胞成像、单细胞RNA测序 | 小鼠肝转移模型 | 图像数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及CRC组织、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-07-25 |
Multi-modal integration of histopathology and transcriptomics reveals STAB1+ macrophage-associated efferocytosis as a suppressive immune mechanism in colon adenocarcinoma
2025-12-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07348-8
PMID:41361444
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-12-10 |
CXCL12 deficiency promotes colorectal cancer progression and reduces anti-PD-L1 immunotherapy efficacy through MDSC regulation
2025-12-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07309-1
PMID:41351014
|
研究论文 | 本研究探讨了CXCL12缺乏如何通过调控髓源性抑制细胞（MDSC）促进结直肠癌进展并降低抗PD-L1免疫疗法的疗效 | 首次将CXCL12缺乏与MDSC调控及抗PD-L1耐药性联系起来，并识别了CPEB3、DDX39B和SIDT2作为结直肠癌的新型生物标志物 | 研究机制仍需进一步深入探索，且临床转化策略有待优化 | 阐明CXCL12缺乏在结直肠癌进展及抗PD-L1免疫疗法耐药性中的作用机制 | 结直肠癌细胞、动物模型以及单细胞转录组数据 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、体外细胞实验、体内动物实验 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-07-23 |
Tfh2 and a subset of Tfh1 cells associate with antibody-mediated immunity to malaria
2025-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196828
PMID:41118256
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和VDJ测序分析疟疾感染中Tfh细胞的异质性，发现Tfh2和部分Tfh1细胞与保护性抗体反应相关 | 首次在人类疟疾感染中揭示Tfh细胞基于CCR7表达的额外异质性，并明确Tfh1-CCR7+和Tfh2亚群与抗体介导免疫的关联 | NA | 研究人类外周血Tfh细胞在疟疾感染中的表型和功能异质性，及其与保护性抗体反应的关系 | 健康个体在控制性人类疟疾感染前后的外周血Tfh细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | 基因表达数据, 免疫受体序列数据 | 健康个体（具体数量未在摘要中提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和VDJ测序 |
| 12 | 2026-07-23 |
Next-generation immune profiling - beyond blood cancer cells
2025-12, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2025.06.004
PMID:40645853
|
评论 | 文章讨论了在血液恶性肿瘤诊断中整合下一代免疫分析技术的重要性，以超越传统的癌细胞特征分类 | 提出将免疫微环境分析纳入血液恶性肿瘤诊断分类，并标准化炎症亚型定义 | 未提及具体技术实现细节或临床验证数据 | 强调在血液肿瘤诊断中整合下一代免疫分析技术的必要性 | 血液恶性肿瘤的免疫微环境 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序,空间转录组学,先进流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-07-13 |
Completing spatial transcriptomics data for gene expression prediction benchmarking
2025-12, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103754
PMID:40885036
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研究论文 | 提出SpaRED数据库和SpaCKLE模型，用于评估和改善基于组织学图像的基因表达预测 | 首次建立系统化的空间转录组公共数据集SpaRED，并开发基于Transformer的基因表达补全模型SpaCKLE，大幅降低预测均方误差 | 未提及具体局限性 | 解决空间转录组数据成本高、基因捕获效率低及模型评估不一致的问题 | 空间转录组公共数据集和基因表达预测模型 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | Transformer | 图像 | 26个公共数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 14 | 2026-07-10 |
Piezo1 promotes colitis progression by modulating the Nrf2/NF-κB/NLRP3 signaling pathway
2025-Dec, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117293
PMID:40886854
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研究论文 | 该研究探讨了机械敏感离子通道Piezo1通过调节Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路促进结肠炎进展的机制 | 首次揭示Piezo1通过机械感知特性调控Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路在结肠炎发展中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类IBD患者中验证，Piezo1介导机械信号的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Piezo1在肠道炎症病理生理中的作用及其对Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路的调节机制 | 野生型和Piezo1Lyz2溃疡性结肠炎小鼠模型的结肠组织及巨噬细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序， RNA测序 | NA | 基因表达数据， 图像 | 小鼠结肠组织样本及巨噬细胞样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-07-10 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 通过对300多名健康成年人进行单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术等多组学分析，揭示了年龄相关的免疫动态变化 | 发现了年龄相关的T细胞亚群非线性转录重编程，且该过程不由系统性炎症或慢性巨细胞病毒感染驱动，并揭示了记忆T细胞中T2细胞偏向性功能与流感疫苗中高度增强抗原的B细胞反应失调相关 | 未明确提及局限性 | 研究年龄如何影响外周免疫的组成和状态，以及免疫衰老的机制 | 300多名健康成年人（25至90岁），其中96人接受为期2年的纵向季节性流感疫苗接种随访 | 单细胞组学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 300多名健康成年人（16百万以上外周血单核细胞，71个免疫细胞亚群），96人纵向随访 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-07-10 |
Structural and functional characteristics of local immune memory formation in SARS-CoV-2-infected cynomolgus macaques
2025-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110589
PMID:40882689
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫检测技术，研究SARS-CoV-2奥密克戎感染的非人灵长类动物模型中局部免疫记忆的形成机制 | 首次在非人灵长类动物模型中揭示iBALT形成功能性三级淋巴结构及其在SARS-CoV-2感染后局部免疫记忆中的作用 | 样本量有限，且仅针对奥密克戎变种，未涵盖其他SARS-CoV-2变种 | 探究SARS-CoV-2感染后肺部局部免疫记忆的结构和功能特征 | SARS-CoV-2奥密克戎感染的食蟹猴 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫检测 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,免疫检测数据 | 非人灵长类动物（食蟹猴）样本，具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium 单细胞RNA测序，10x Visium 空间转录组学 |
| 17 | 2026-07-10 |
Exploring the toxicological impact of 6PPDQ exposure on psoriasis through network toxicology, machine learning, and multidimensional bioinformatics analysis
2025-Dec-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127291
PMID:41120051
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研究论文 | 通过网络毒理学、机器学习和多维生物信息学分析，探究轮胎抗氧化剂衍生物6PPDQ暴露对银屑病的毒性影响 | 首次结合网络毒理学框架、机器学习（LASSO和SVM-RFE）及单细胞RNA测序数据，系统揭示6PPDQ通过核心基因（如NR3C1）调控免疫炎症通路（如IL-23/Th17轴）加重银屑病的机制，并建立了不良结局通路模型 | 研究基于计算预测和公开数据集，缺乏体内外实验验证；分子对接和动力学模拟未考虑代谢物或实际环境暴露浓度的影响 | 探索环境污染物6PPDQ暴露与银屑病发病之间的潜在关联及分子机制 | 6PPDQ与银屑病重叠的290个靶点基因，以及通过机器学习筛选的四个核心基因（CD3D、IRF7、NR3C1、HDAC1） | 机器学习和生物信息学 | 银屑病 | 网络毒理学、机器学习（LASSO和SVM-RFE）、基因本体论和KEGG通路分析、免疫浸润分析、单细胞RNA-seq、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO回归和SVM-RFE模型 | 基因表达数据和单细胞RNA-seq数据 | 使用公开数据集GSE13355（银屑病转录组样本），具体样本量未在标题和摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-07-05 |
YAP-Induced Glycolysis Drives Fibroinflammation and Disrupts Fibroblast Fidelity
2025-Dec-05, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326480
PMID:41165345
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研究论文 | 本研究揭示了YAP诱导的糖酵解驱动纤维炎症并破坏成纤维细胞谱系保真度的机制 | 首次发现右心房成纤维细胞比其他心脏腔室具有更高的糖酵解活性和YAP活性，并揭示YAP通过诱导糖酵解驱动纤维化，同时破坏成纤维细胞谱系保真度使其转化为表达SOX9的骨软骨祖细胞状态 | NA | 探究Hippo/YAP通路如何调控心脏成纤维细胞的代谢微环境及其在纤维炎症中的作用 | 心脏成纤维细胞及其在不同心脏腔室的代谢和转录组差异 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序, 空间转录组学, 同位素标记葡萄糖摄取实验 | NA | 转录组数据, 表观组数据, 空间转录组数据 | 人类和小鼠心脏样本 | 10x Genomics | 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 19 | 2026-07-04 |
Identification of sepsis pyroptosis-related genes based on single-cell sequencing technology and experimental verification
2025-12-05, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00785-6
PMID:41350624
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研究论文 | 基于单细胞测序技术鉴定脓毒症焦亡相关基因并进行实验验证 | 结合单细胞测序技术与多种机器学习方法（随机森林、SVM、Lasso回归）联合识别核心基因，并通过孟德尔随机化分析探讨基因表达与疾病风险的因果关系 | 未提及研究的具体局限性 | 筛选脓毒症的新型生物标志物 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血样本 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞测序 | 随机森林, SVM, Lasso回归 | 基因表达数据 | 23名脓毒症患者和10名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-07-03 |
Beyond FoxP3-Identification of a Chicken Regulatory T Cell Signature
2025-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70106
PMID:41416935
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析鸡脾细胞中的CD4+亚群，定义了一种新的鸡调节性T细胞标志组合 | 首次描述了鸡特异性CTLA-4抗体，该抗体仅能在细胞内区室中染色CTLA-4，与哺乳动物中的定位方式不同 | CTLA-4的细胞内表达限制了其在功能实验中的可用性 | 定义可靠标志物以鉴定和表征鸡调节性T细胞 | 鸡脾细胞中的CD4+ T细胞亚群 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |