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当前共找到 1237 篇文献,本页显示第 1 - 20 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-02-12
Distinct immune landscapes between murine and human periodontitis
2025-Dec-19, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的免疫景观差异,并评估了Pg补充对模型可转化性的影响 首次系统性地比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的单细胞免疫景观,揭示了B/浆细胞和巨噬细胞在比例和激活状态上的显著差异 Pg补充未能减少小鼠与人类之间的免疫学差异,模型的可转化性有限 评估小鼠结扎模型作为人类牙周炎研究模型的适用性 人类牙周炎患者和小鼠结扎模型的牙龈组织 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 小鼠结扎、结扎+Pg和对照组牙龈组织,整合人类数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2025-12-31
Bulk and single-cell transcriptome analysis reveal shared key genes and patterns of immune dysregulation in systemic lupus erythematosus and sepsis
2025-Dec-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3 2026-02-11
MRGPRX2-expressing mast cells are increased in the GI tract of individuals with active inflammatory bowel disease and hereditary α-tryptasemia
2025-Dec-30, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究探讨了遗传性α-类胰蛋白酶血症(HαT)与炎症性肠病(IBD)患者胃肠道中MRGPRX2阳性肥大细胞的增加及其与疾病活动的关联 首次在HαT和IBD背景下,通过多平台方法(空间转录组学、质谱流式细胞术)系统揭示了胃肠道肥大细胞丰度增加、活化标志物(CD203c、LAMP-1、SIGLEC8)上调以及MRGPRX2表达增强的现象 样本量相对较小(空间转录组学n=8,质谱流式细胞术n=14),且研究主要基于观察性关联,尚未明确MRGPRX2介导的肥大细胞活化在HαT相关胃肠道症状中的直接因果机制 探究HαT是否通过改变肥大细胞受体MRGPRX2的表达及活化状态,影响IBD的胃肠道病理过程 HαT患者、非HαT的IBD患者以及健康对照者的胃肠道组织样本 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学、质谱流式细胞术(CyTOF)、数字PCR(ddPCR)、基因分型 NA 组织样本、转录组数据、蛋白质表达数据 共分析873份样本(854份生物库IBD样本用于基因分型,8份结肠组织用于空间转录组学,14份小肠活检用于质谱流式细胞术) NA 空间转录组学, 质谱流式细胞术 NA NA
4 2026-02-11
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-12, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
研究论文 本研究构建了一个基于NOTCH相关基因的预后风险模型(NOTCH评分),用于预测头颈部鳞状细胞癌患者的生存、免疫浸润和治疗反应 首次整合NOTCH信号通路相关基因构建预后模型,并系统评估其与肿瘤微环境、免疫治疗反应及药物敏感性的关联 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在单细胞和蛋白水平的验证样本量有限 开发头颈部鳞状细胞癌的预后预测工具并探索其与肿瘤微环境及治疗反应的关联 头颈部鳞状细胞癌患者 生物信息学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归模型 基因表达数据、临床数据 未明确具体样本数量,但包含训练和验证队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-02-10
Identifying Potential Drug Targets in the Knee Osteoarthritis: Insights from the Druggable Genome
2025-Dec-31, Rejuvenation research IF:2.2Q3
研究论文 本研究通过整合可药基因组和孟德尔随机化分析,识别了膝骨关节炎的潜在药物靶点 结合多组织表达数量性状位点、单细胞MR分析、蛋白质组学验证及遗传信息空间映射框架,从外周和中枢组织角度系统识别并验证了KOA的潜在治疗靶点 需要未来进一步实验验证所识别靶点在KOA中的作用机制 寻找膝骨关节炎的潜在药物靶点 膝骨关节炎 生物信息学 骨关节炎 表达数量性状位点分析、孟德尔随机化分析、单细胞MR分析、蛋白质组学验证、遗传信息空间映射 孟德尔随机化模型、gsMap框架 基因组关联研究数据、空间转录组学数据、蛋白质定量性状位点数据 NA NA 空间转录组学 NA E16.5小鼠胚胎组织的空间转录组学
6 2026-02-10
Exploring hypoxia- and cuproptosis-related biomarkers in periodontitis based on transcriptome and single-cell analysis
2025-Dec-29, Clinical oral investigations IF:3.1Q1
研究论文 本研究通过转录组和单细胞分析,探索了牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的生物标志物 首次将缺氧相关基因与铜死亡相关基因结合,在牙周炎中进行系统性生物标志物鉴定,并利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平验证了关键基因的表达模式 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的实验验证和前瞻性临床研究来确认生物标志物的临床效用 识别和表征牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的关键生物标志物,以深入理解其分子机制 牙周炎患者与健康对照的基因表达数据 生物信息学 牙周炎 转录组分析,单细胞RNA测序 机器学习(Boruta算法,LASSO回归,递归特征消除) 基因表达数据 来自GEO数据库的多个牙周炎数据集(包括GSE16134, GSE10334, GSE152042) NA 单细胞RNA-seq NA NA
7 2026-02-10
Molecular signatures and signaling interactions of the hair follicle stem cell niche
2025-Dec-15, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过高灵敏度单细胞转录组分析,定义了毛囊干细胞及其微环境中多种细胞类型的转录组特征,并揭示了细胞间通讯网络 首次通过流式分选结合高灵敏度转录组测序,对毛囊微环境中四种相邻区域的六种细胞群体进行系统分析,实现了前所未有的基因检测灵敏度 研究基于小鼠背部皮肤样本,人类数据的验证仍需进一步研究 揭示毛囊干细胞及其微环境的分子特征和信号相互作用机制 小鼠背部皮肤中的毛囊乳头细胞、隆突干细胞、毛胚干细胞、表皮细胞、毛囊上皮细胞和真皮成纤维细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞分选 NA 转录组数据 从小鼠背部4个相邻区域分选的6种细胞群体,共56个全转录组测量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-02-09
IL-1β+ lung-resident macrophages mediate endothelial dysfunction and acute lung injury in sepsis through immune-metabolic crosstalk
2025-Dec-08, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过小鼠脓毒症模型,揭示了表达IL-1β的肺驻留巨噬细胞在脓毒症诱导的急性肺损伤中通过免疫-代谢串扰介导内皮功能障碍和组织损伤的关键作用 识别了IL-1β⁺肺驻留巨噬细胞亚群作为脓毒症肺损伤的关键贡献者,并揭示了其通过免疫-代谢轴协调内皮功能障碍的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;免疫-代谢相互作用的分子通路细节尚未完全阐明 阐明脓毒症诱导急性肺损伤中免疫细胞与肺内皮相互作用的分子调节机制 小鼠脓毒症模型中的肺驻留巨噬细胞和肺内皮细胞 数字病理学 脓毒症/急性肺损伤 单细胞RNA测序,代谢组学,免疫测定,Western印迹,组织病理学,体外共培养实验 NA RNA测序数据,代谢组数据,蛋白质数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-02-08
EPI-SauriCas9-based mouse ovarian cancer models recapitulating pten deletion in patients
2025-Dec-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究开发并验证了使用EPI-SauriCas9系统构建的携带Pten和Trp53缺失的小鼠卵巢上皮模型(MEPP),用于模拟患者PTEN缺失的卵巢癌 利用EPI-SauriCas9系统创建了首个模拟PTEN和TP53缺失的小鼠卵巢癌模型,揭示了Pten缺失在促进肿瘤发生和转移中的作用,并通过单细胞RNA测序鉴定了具有不同转移潜能的独特上皮亚群 模型可能无法完全复制人类卵巢癌的所有复杂性,且研究主要聚焦于PTEN和TP53缺失的特定亚型 开发一个用于研究PTEN缺失卵巢癌的平台,并探索其肿瘤发生机制及潜在治疗方法 小鼠卵巢上皮细胞及由此衍生的肿瘤模型 癌症研究 卵巢癌 EPI-SauriCas9基因编辑系统,单细胞RNA测序,高通量药物筛选 基因编辑小鼠模型 基因表达数据,药物反应数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
10 2026-02-08
Probing cellular landscapes in plants via single-cell transcriptomics
2025-Dec-25, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1
综述 本文全面综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在植物系统中的研究进展、应用、挑战及未来方向 整合了跨植物物种和组织类型的见解,提供了关于植物发育和适应的交叉视角,并批判性地评估了关键技术挑战及潜在解决方案 植物系统中scRNA-seq与功能基因组学和空间技术的整合仍然有限,存在原生质体分离、标记基因可用性有限和细胞类型注释等关键挑战 综述scRNA-seq在解析植物细胞异质性、发育过程、基因调控、胁迫响应和细胞命运决定方面的应用与进展 多种植物组织 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学,多组学方法 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
11 2026-02-08
ScRNA profiling of peripheral blood in kidney transplant recipients across rejection responses and treatments
2025-Dec-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾移植受者外周血细胞,比较了不同排斥类型和治疗阶段的免疫细胞组成差异 首次提供了肾移植后不同排斥类型和治疗阶段的外周血单细胞转录组数据集,支持免疫细胞亚群的比较分析 样本量较小(仅5名参与者),且为初步分析,需要更大规模研究验证 探索肾移植受者外周血免疫细胞在排斥反应和免疫抑制治疗中的变化 肾移植受者的外周血细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 5名肾移植受者,98,595个质量控制通过的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-02-08
CIA: unveiling cellular identities with cluster-independent annotation in single-cell RNA sequencing data for comprehensive cell type characterization and exploration
2025-Dec-17, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CIA(Cluster Independent Annotation)的新型计算工具,用于在单细胞RNA测序数据中准确识别细胞类型,无需完全注释的参考数据集或复杂机器学习过程 开发了CIA工具,基于预定义细胞类型签名,提供用户友好且实用的单细胞类型和功能注释解决方案,支持Python和R语言,适用于所有主要单细胞分析框架 NA 解决单细胞RNA测序数据中细胞识别和分类的挑战,提供高效且可解释的细胞类型注释工具 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-02-08
BGN Secreted by Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via Activation of TLR4-Mediated Erk and NF-κB Signaling Pathways
2025-Dec-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞分泌的BGN通过激活TLR4介导的Erk和NF-κB信号通路促进食管鳞状细胞癌进展 首次在ESCC中鉴定出CAF分泌的BGN是关键促癌因子,并阐明其通过TLR4受体激活Erk和NF-κB信号通路的分子机制 研究主要基于细胞系和体外共培养模型,缺乏体内动物实验验证;临床样本量有限(66例) 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌进展中的具体作用机制 食管鳞状细胞癌细胞系(TE-9、TE-10、TE-15)、间充质干细胞、66例ESCC组织样本 肿瘤生物学 食管鳞状细胞癌 cDNA微阵列分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 共培养模型 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 3个ESCC细胞系、间充质干细胞、66例ESCC组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
14 2026-02-07
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了一种微生物-胆汁酸-TLR信号轴在间质性膀胱炎中驱动膀胱损伤的机制 首次整合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序,识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变,并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 研究主要基于实验模型验证,人类样本的直接临床转化和长期效果需进一步评估 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征(HIC)的上游驱动机制,以寻找生物标志物和靶向治疗机会 Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 多组学分析 间质性膀胱炎 宏基因组测序、靶向代谢组学、单细胞RNA测序 NA 基因组、代谢组、转录组数据 NA NA 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-02-07
Construction of a single-cell transcriptome atlas for Pogostemon cablin embryoids reveals PcNAC048 as a dual regulator coordinating lateral root morphogenesis and patchouli alcohol biosynthesis
2025-Dec-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了广藿香胚状体的单细胞转录组图谱,揭示了PcNAC048作为协调侧根形态发生和广藿香醇生物合成的双重调控因子 首次在广藿香中应用单细胞RNA测序技术构建胚状体转录组图谱,并鉴定出PcNAC048作为同时调控发育和次生代谢的新转录因子 研究主要基于体外培养的胚状体,可能无法完全反映自然生长条件下的基因表达模式,且转基因验证仅在拟南芥中进行 探究广藿香胚状体发育的细胞分化轨迹及调控广藿香醇生物合成的分子机制 广藿香(Pogostemon cablin)的胚状体,包括球形胚、心形胚、鱼雷形胚和子叶胚 植物生物学 NA 单细胞RNA测序,酵母单杂交,双荧光素酶报告基因检测,病毒诱导基因沉默 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但包括球形胚和子叶胚阶段的单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
16 2026-02-07
Repeated Dextran Sulfate Sodium Exposure Elicits Distinct Immune Responses Reflecting Human Ulcerative Colitis
2025-Dec-24, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过比较单次与重复DSS暴露诱导的小鼠结肠炎模型,评估其与人类溃疡性结肠炎的免疫反应相似性 首次系统比较急性与重复DSS暴露模型的免疫细胞转录组差异,并揭示重复暴露模型更接近人类溃疡性结肠炎的免疫特征 研究基于小鼠模型,人类疾病复杂性可能未完全体现;样本量未明确说明 评估不同DSS暴露方案作为溃疡性结肠炎研究模型的适用性 DSS诱导的小鼠结肠炎模型及人类溃疡性结肠炎免疫特征 单细胞组学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序, 16S rRNA分析, 流式细胞术, 组织病理学 NA 单细胞转录组数据, 微生物组数据, 流式细胞数据, 组织病理图像 NA NA 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 NA NA
17 2026-02-07
CYP27A1 suppresses brain metastasis via ferroptosis in lung adenocarcinoma: a six-gene signature predicting the immunotherapy response and clinical outcomes
2025-Dec-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别了肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建了一个六基因预后模型,并验证了CYP27A1通过铁死亡抑制脑转移的功能 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据识别肺腺癌脑转移相关基因,构建了六基因预后模型,并揭示了CYP27A1通过调控铁死亡抑制脑转移的新机制 样本量相对较小(仅4例患者的单细胞数据),功能验证仅限于体外实验,缺乏体内模型验证 识别肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建预后模型并评估免疫治疗反应 肺腺癌患者及其脑转移相关细胞 数字病理学 肺癌 scRNA-seq, bulk RNA-seq LASSO Cox回归模型 基因表达数据 4例LUAD患者的scRNA-seq数据(GSE117570)和TCGA-LUAD队列的批量RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
18 2026-02-07
Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promote Metabolic Dysfunction-associated Steatohepatitis Progression via Interleukin-1R1-mediated Chemokine Production Induced by Macrophage-derived Interleukin-1β
2025-Dec-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞来源的IL-1β通过作用于肝窦内皮细胞上的IL1R1受体,诱导趋化因子产生,从而驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的炎症和纤维化进程 首次阐明了在MASH中,巨噬细胞-肝窦内皮细胞通过IL1B-IL1R1轴相互作用的具体机制,并利用空间转录组学证实了门静脉周围炎症-纤维化微生态位的形成 研究主要基于细胞系和小鼠模型,人类样本分析为回顾性,且空间转录组数据来源于肝癌患者的非肿瘤区域,可能不能完全代表单纯MASH的病理状态 阐明IL-1β在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎病理进展中的作用机制,并探索其治疗靶点 THP-1巨噬细胞系、TMNK-1肝窦内皮细胞系、内皮细胞特异性Il1r1敲除小鼠、系统性Cxcl10敲除小鼠、西方饮食诱导的MASH小鼠模型、MASLD患者肝组织RNA测序数据、MASH相关肝癌样本的非肿瘤区域空间转录组数据 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎 RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间基因表达数据 涉及小鼠模型、细胞系以及人类患者数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) NA 空间转录组学 NA NA
19 2026-02-06
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analyses Uncover Cell-Specific Mechanisms in Epigenetic Age Acceleration
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据,结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,揭示了免疫细胞特异性基因表达对四种主要表观遗传时钟的因果影响 首次在单细胞分辨率下,结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,系统性地识别了影响表观遗传年龄加速的细胞特异性因果基因 研究主要聚焦于14种免疫细胞类型,可能未涵盖其他细胞类型对表观遗传年龄的影响 阐明表观遗传年龄加速背后的细胞特异性基因调控机制 14种免疫细胞类型中的基因表达与四种表观遗传时钟(IEAA, HannumAge, GrimAge, PhenoAge)的关联 生物信息学 衰老相关疾病 单细胞表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位, 表型全基因组关联研究 孟德尔随机化模型, 贝叶斯共定位模型 单细胞RNA-seq数据, 表观遗传时钟数据, 全基因组关联研究数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-02-06
MMP14-Dependent Activation of TGF-β Signaling Enhances Malignancies via Promoting Necroptosis in Glioblastoma
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了MMP14通过激活TGF-β信号通路促进胶质母细胞瘤坏死性凋亡和恶性行为的机制 首次将MMP14鉴定为胶质母细胞瘤中与坏死性凋亡相关的枢纽基因,并阐明了其通过TGF-β-SMAD2-RIP1信号轴调控坏死性凋亡异质性的新机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型的直接验证 探究坏死性凋亡在胶质母细胞瘤恶性进展中的作用机制 胶质母细胞瘤细胞及相关的分子信号通路 数字病理学 胶质母细胞瘤 加权基因共表达网络分析,单细胞分析,空间转录组学 NA 转录组数据,单细胞数据,空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq NA NA
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