单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-03-25	Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia 2025-Dec, Hypertension in pregnancy IF:1.5Q4 DOI:10.1080/10641955.2025.2475814 PMID:40122115	研究论文	通过整合生物信息学分析，识别出与妊娠期糖尿病(GDM)和先兆子痫(PE)共发相关的关键基因和通路	首次发现BCL6在GDM和PE共发患者的中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞(VCTs)中高表达，并可能作为诊断和治疗的新靶点	研究主要基于公开数据集分析，缺乏实验验证	探究GDM和PE共发的分子机制和潜在诊断标志物	GDM和PE患者的基因表达数据	生物信息学	妊娠期糖尿病和先兆子痫	基因表达分析、GO和KEGG通路分析、蛋白质互作网络分析、ROC分析、单细胞测序数据分析	回归模型	基因表达数据	来自GEO数据库的多个GDM和PE数据集
2	2025-03-19	Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration 2025-Dec-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-02083 PMID:38934409	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞和Müller胶质细胞的异质性及其相互作用	揭示了两种静止状态的Müller胶质细胞在视网膜损伤后的不同激活路径，以及视网膜小胶质细胞的三种亚型和它们在损伤后的动态变化	研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的适用性尚需进一步验证	探讨炎症如何调控Müller胶质细胞的重编程以及免疫细胞在视网膜再生中的作用	斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞和免疫细胞	数字病理学	视网膜疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	未明确提及具体样本数量，但涉及斑马鱼视网膜的多种细胞类型
3	2025-03-19	Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury 2025-Dec-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00063 PMID:39101644	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的不同演化路径及其在疾病过程中的作用	首次详细区分了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的不同演化路径及其功能差异，并揭示了巨噬细胞与其他细胞（如成纤维细胞和神经元）的丰富通讯	研究主要基于单细胞RNA测序和空间转录组学数据，仍需进一步的体内实验验证	探讨脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞的动态发展及其在炎症反应中的作用	脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞	数字病理学	脊髓损伤	单细胞RNA测序, 空间转录组学	NA	RNA测序数据, 空间转录组数据	NA
4	2025-03-03	Comprehensive profiling of cell type-specific expression and distribution of complement genes in mouse and human kidneys: insights into normal physiology and response to kidney transplantations 2025-Dec, Renal failure IF:3.0Q1 DOI:10.1080/0886022X.2025.2471568 PMID:40015727	研究论文	本文通过分析小鼠和人类肾脏的单细胞RNA测序数据，全面描绘了补体基因在肾脏中的细胞类型特异性表达和分布，揭示了其在正常生理功能和肾脏移植反应中的重要作用	首次全面分析了补体基因在肾脏细胞演化背景下的表达情况，揭示了补体基因在肾脏损伤中的响应性	研究主要依赖于单细胞RNA测序数据，可能无法完全捕捉到蛋白质水平的表达和功能	研究补体基因在肾脏中的表达和分布，以理解其在肾脏疾病发病机制中的作用	健康人类、C57BL/6小鼠和肾脏移植排斥小鼠的肾脏	生物信息学	肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	健康人类、C57BL/6小鼠和肾脏移植排斥小鼠的肾脏样本
5	2025-02-25	Novel therapeutic targets uncovered by genome-wide integrative analysis in bronchopulmonary dysplasia 2025-Dec, The journal of maternal-fetal & neonatal medicine : the official journal of the European Association of Perinatal Medicine, the Federation of Asia and Oceania Perinatal Societies, the International Society of Perinatal Obstetricians DOI:10.1080/14767058.2025.2469837 PMID:39988826	研究论文	本研究通过整合基因组关联研究、单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了支气管肺发育不良（BPD）的基因表达失调和分子通路	首次结合GWAS、scRNA-seq和MR分析，揭示了BPD的基因表达失调和分子通路，并预测了潜在的治疗药物	未提及样本量及具体实验验证结果	识别BPD的基因表达失调并探索相关分子通路，以发现新的治疗靶点	支气管肺发育不良（BPD）患者	基因组学	支气管肺发育不良	GWAS, scRNA-seq, MR分析	NA	基因组数据、单细胞转录组数据	NA
6	2025-02-25	The Role of Autophagy and Cell Communication in COPD Progression: Insights from Bioinformatics and scRNA-seq 2025-Dec, COPD IF:2.2Q3 DOI:10.1080/15412555.2024.2444663 PMID:39991824	研究论文	本研究利用生物信息学工具和单细胞RNA测序技术，探讨了自噬和细胞通讯在慢性阻塞性肺疾病（COPD）进展中的作用	通过生物信息学工具和scRNA-seq数据，识别了吸烟激活的自噬相关基因，并分析了COPD中的免疫景观和细胞通讯模式	研究主要依赖于生物信息学分析，缺乏实验验证	探讨自噬和细胞通讯在COPD进展中的作用	COPD患者	生物信息学	慢性阻塞性肺疾病	scRNA-seq	NA	基因表达数据	NA
7	2025-02-21	The pancreatic tumor microenvironment of treatment-naïve patients causes a functional shift in γδ T cells, impairing their anti-tumoral defense 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2025.2466301 PMID:39945298	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境（TME）如何通过阻断细胞毒性功能来阻碍γδ T细胞的抗肿瘤能力	首次揭示了PDAC TME对γδ T细胞功能的抑制作用，并通过患者来源的类器官条件培养基验证了这一现象	研究样本仅限于未接受治疗的PDAC患者，可能无法全面反映治疗对TME的影响	探索PDAC TME对γδ T细胞抗肿瘤能力的影响	未接受治疗的PDAC患者和健康个体的γδ T细胞	肿瘤免疫学	胰腺癌	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	细胞数据、基因表达数据	未接受治疗的PDAC患者和健康个体的γδ T细胞
8	2025-02-21	Key RNA-binding proteins in renal fibrosis: a comprehensive bioinformatics and machine learning framework for diagnostic and therapeutic insights 2025-Dec, Renal failure IF:3.0Q1 DOI:10.1080/0886022X.2025.2463560 PMID:39957043	研究论文	本研究通过综合生物信息学和机器学习方法，识别并验证了与肾纤维化相关的关键RNA结合蛋白，提供了诊断和治疗的新见解	结合生物信息学和机器学习方法，识别了五个与肾纤维化相关的关键RNA结合蛋白，并构建了高精度的诊断模型	研究依赖于GEO数据集和实验模型，可能无法完全反映人类肾纤维化的复杂性	探索肾纤维化的分子机制，识别潜在的诊断标志物和治疗靶点	肾纤维化相关的RNA结合蛋白	生物信息学	慢性肾病	RNA测序、单细胞RNA测序、免疫荧光	lasso回归、逻辑回归	RNA测序数据	175个肾纤维化样本和99个正常肾脏样本
9	2025-02-13	Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV 2025-Dec, Emerging microbes & infections IF:8.4Q1 DOI:10.1080/22221751.2025.2459136 PMID:39868995	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了猴痘病毒（MPXV）感染患者的外周血单核细胞，揭示了HIV感染者与非感染者的免疫景观差异	首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了HIV感染与非感染猴痘患者的免疫细胞表型和基因表达差异，揭示了HIV感染者病情严重的潜在机制	样本量较小，仅包括6名患者，可能影响结果的普遍性	研究猴痘病毒在HIV感染与非感染患者中的免疫病理学机制	猴痘病毒感染患者的外周血单核细胞	生物信息学	猴痘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列数据	6名患者（3名HIV+，3名HIV-）
10	2025-02-13	The secretomes of bovine mammary epithelial cell subpopulations differentially modulate macrophage function 2025-Dec, The veterinary quarterly DOI:10.1080/01652176.2025.2463338 PMID:39921381	研究论文	本文研究了牛乳腺上皮细胞亚群的分泌组对巨噬细胞功能的不同调节作用	首次发现不表达CD73的牛乳腺上皮细胞亚群的分泌组能显著增强巨噬细胞的吞噬作用和活性氧积累	未探讨分泌组中具体哪些生物活性因子对巨噬细胞功能起关键作用	优化牛乳腺上皮细胞分泌组作为治疗乳腺炎的生物制剂	牛乳腺上皮细胞亚群及其分泌组、巨噬细胞	细胞生物学	乳腺炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、荧光激活细胞分选(FACS)	NA	RNA测序数据、细胞表型数据	NA
11	2025-01-31	Integrating RNA-seq and scRNA-seq to explore the prognostic features and immune landscape of exosome-related genes in breast cancer metastasis 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2024.2447917 PMID:39847423	研究论文	本研究通过整合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，探索外泌体相关基因在乳腺癌转移中的作用，并开发了一个可靠的预后模型	结合RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，开发了一个基于外泌体相关基因的新型风险评分模型，用于预测乳腺癌患者的生存和免疫景观	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	探索外泌体相关基因在乳腺癌转移中的作用，并开发预后模型	乳腺癌样本	数字病理学	乳腺癌	RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq)	Cox回归模型, Lasso-Cox回归模型	RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据	来自TCGA数据库的乳腺癌样本
12	2025-01-31	Revealing the role of natural killer cells in ankylosing spondylitis: identifying diagnostic biomarkers and therapeutic targets 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2025.2457523 PMID:39853176	研究论文	本研究通过整合生物信息学方法和实验验证，探讨了自然杀伤（NK）细胞在强直性脊柱炎（AS）中的作用，并识别了与NK细胞相关的关键基因作为诊断生物标志物和治疗靶点	首次揭示了NK细胞在AS中的潜在作用，并识别了与NK细胞相关的关键基因，这些基因可能作为AS的诊断生物标志物和治疗靶点	研究依赖于公开的微阵列和单细胞RNA测序数据，样本量可能有限，且实验验证主要在基因表达水平进行，缺乏功能验证	探讨NK细胞在强直性脊柱炎（AS）中的作用，并识别相关的诊断生物标志物和治疗靶点	强直性脊柱炎（AS）患者和健康对照组的基因表达数据	生物信息学	强直性脊柱炎	微阵列分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、实时定量PCR（RT-PCR）	加权基因共表达网络分析（WGCNA）	基因表达数据	来自GSE25101、GSE73754、GSE194315和Liu的研究的微阵列和单细胞RNA测序数据
13	2025-01-22	Prognostic significance of neutrophil extracellular trap-related genes in childhood acute lymphoblastic leukemia: insights from multi-omics and in vitro experiment 2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands) DOI:10.1080/16078454.2025.2452701 PMID:39829399	研究论文	本研究旨在开发基于中性粒细胞胞外陷阱相关基因（NETRGs）的预后模型，用于儿童急性淋巴细胞白血病（cALL）患者	通过多组学分析和体外实验，识别了与cALL预后相关的NETRGs，并构建了风险模型和诺模图	研究依赖于公共数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	开发cALL患者的预后模型并识别潜在治疗靶点	儿童急性淋巴细胞白血病（cALL）患者	生物信息学	急性淋巴细胞白血病	RNA-seq, 单细胞转录组分析, RT-qPCR	LASSO回归, Cox回归分析	转录组数据, 单细胞转录组数据	来自TARGET-ALL-P2和TARGET-ALL-P3队列的数据，以及GSE26713和GSE130116数据集
14	2024-12-28	Deciphering distinct pathogenic mechanisms of ankylosing spondylitis and systemic sclerosis via shared biomarkers ZSWIM6 and CCL3L3: Insights from an integrative bioinformatics approach 2025-Dec, Autoimmunity IF:3.3Q3 DOI:10.1080/08916934.2024.2445557 PMID:39727004	研究论文	通过共享生物标志物ZSWIM6和CCL3L3，揭示强直性脊柱炎和系统性硬化症的不同致病机制	首次通过整合生物信息学方法，识别出ZSWIM6和CCL3L3作为强直性脊柱炎和系统性硬化症的潜在生物标志物，并深入探讨了它们在两种疾病中的不同分子机制	研究主要依赖于公开的RNA-seq数据集，样本来源和数量可能限制了结果的普适性	探索强直性脊柱炎和系统性硬化症的不同炎症致病机制，以提供新的治疗见解	强直性脊柱炎和系统性硬化症患者的外周血单核细胞	生物信息学	自身免疫疾病	RNA-seq, 单细胞RNA测序	SVM, CIBERSORT	RNA-seq数据, 单细胞RNA测序数据	GSE73754和GSE19617数据集中的外周血单核细胞样本，以及GSE194315数据集中的单细胞RNA测序数据
15	2024-12-21	A diagnostic signatures for intervertebral disc degeneration using TNFAIP6 and COL6A2 based on single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq analyses 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2024.2443568 PMID:39704340	研究论文	本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路	首次通过单细胞和批量RNA测序结合的方法，识别出TNFAIP6和COL6A2作为椎间盘退变的诊断标志物，并验证了ZEB2作为转录因子在调控这些关键基因中的潜在作用	研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本偏倚和数据质量问题	识别与椎间盘退变相关的潜在生物标志物和信号通路，以辅助诊断和预测疾病活动	椎间盘退变病例的生物标志物和信号通路	数字病理学	脊柱疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、批量RNA测序、RT-qPCR、免疫组化（IHC）	NA	RNA	多个数据集（GSE70362、GSE124272）和组织样本
16	2024-12-20	Characterisation of the tumour microenvironment and PD-L1 granularity reveals the prognostic value of cancer-associated myofibroblasts in non-invasive bladder cancer 2025-Dec, Oncoimmunology IF:6.5Q1 DOI:10.1080/2162402X.2024.2438291 PMID:39698899	研究论文	研究分析了非肌肉浸润性膀胱癌（NMIBC）的肿瘤微环境（TME）组成和PD-L1表达，并探讨了癌症相关肌成纤维细胞（myoCAF）的预后价值	首次系统分析了NMIBC的肿瘤微环境组成，并揭示了myoCAF在预测疾病进展和复发中的潜在预后价值	研究样本量有限，且仅限于NMIBC患者，结果的普适性有待进一步验证	探讨NMIBC的肿瘤微环境特征及其在治疗预后中的作用	NMIBC患者的肿瘤和非肿瘤组织样本	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学分析、组织微阵列	NA	组织	73名NMIBC患者及888名独立队列患者