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当前共找到 940 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-01-02 |
Single-cell aggrephagy landscape delineates intercellular communication of tumor microenvironment associated with ovarian cancer progression and immunotherapy
2025-Nov-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04060-3
PMID:41286472
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研究论文 | 本研究首次描绘了卵巢癌肿瘤微环境中聚集自噬介导的细胞间通讯在调控肿瘤生长和抗肿瘤免疫调节中的作用 | 首次在单细胞水平上描绘了卵巢癌肿瘤微环境中聚集自噬的景观，并揭示了聚集自噬相关基因介导的细胞间通讯在调控肿瘤进展和免疫治疗反应中的关键作用 | 研究样本量相对较小（12个样本），且主要依赖公共数据库和动物模型进行验证，需要在更大临床队列中进行进一步验证 | 阐明聚集自噬在卵巢癌肿瘤微环境中的功能作用及其与免疫治疗反应的关系 | 卵巢癌组织样本、正常组织样本以及ID8卵巢癌小鼠皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 单细胞RNA测序数据 | 12个样本（7个卵巢癌组织和5个正常组织），共65,820个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2026-01-02 |
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28988-2
PMID:41286490
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性肾脏病进展中近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞之间的关联 | 识别了一个位于S1段的独特损伤性近端肾小管上皮细胞亚群（PT_5），并揭示了其通过配体-受体对与巨噬细胞、成纤维细胞及T/NK细胞协调促进疾病进展的多细胞互作机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的直接适用性需进一步验证 | 阐明慢性肾脏病进展中损伤性近端肾小管上皮细胞的特性及其与特定间质细胞协调促进疾病进展的机制 | 慢性肾脏病小鼠模型中的肾脏细胞 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 在0.2%腺嘌呤饮食喂养2、4、8周的小鼠模型中获取的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2026-01-02 |
Senescence-related gene signatures in Crohn's disease: integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29727-3
PMID:41286494
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析，识别了与克罗恩病相关的衰老相关枢纽基因，并探讨了它们在疾病进展和免疫细胞浸润中的作用 | 首次整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据系统研究克罗恩病中的衰老相关基因特征，并在单细胞水平揭示了疾病区域的衰老异质性 | 研究主要基于生物信息学分析和已有数据集，实验验证部分相对有限，需要更多功能实验和更大样本的临床验证 | 阐明衰老相关基因在克罗恩病中的具体作用及其对预后的影响 | 克罗恩病患者（人类）和小鼠模型的肠道组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 多个独立外部数据集、小鼠模型和临床样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2026-01-02 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
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研究论文 | 本文研究了LRP12通过AKT/mTOR信号通路和M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展的机制 | 首次将LRP12鉴定为胃癌中与炎症反应相关的预后生物标志物，并揭示其通过激活AKT/mTOR通路和促进M2巨噬细胞极化来驱动肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏大规模临床队列验证，且LRP12在免疫微环境中的具体作用机制仍需进一步探索 | 识别胃癌中与炎症相关的预后生物标志物，并探究其在肿瘤免疫微环境调控中的作用 | 胃癌细胞系、公共数据集、患者样本、异种移植模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学、多重免疫荧光/免疫组化、Western blot、体外增殖和侵袭实验 | 预后模型 | 转录组数据、图像数据 | 公共数据集与内部队列整合，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 165 | 2026-01-02 |
Integrated multi-omics analysis identifies key biomarkers associated with post-translational modifications and RNA methylation in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04074-x
PMID:41276708
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，识别了与透明细胞肾细胞癌中翻译后修饰和RNA甲基化相关的关键生物标志物和分子亚型 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，结合多种机器学习方法，系统识别了与PTM和RNA甲基化相关的核心生物标志物，并定义了新的分子亚型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证，且样本来源可能受批次效应影响 | 阐明透明细胞肾细胞癌的肿瘤发生机制和肿瘤微环境动态，为诊断和治疗提供潜在靶点 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | LASSO, SVM, 随机森林 | 基因表达数据 | 来自五个GEO数据集的批量RNA-seq数据及单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-01-02 |
Prediction of prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma and immune microenvironment infiltration based on single-cell sequencing and RNA-Seq integration
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04094-7
PMID:41276703
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-Seq数据，识别肝细胞癌的预后生物标志物并探索其在免疫微环境浸润中的作用 | 结合单细胞转录组图谱与TCGA和GEO数据集，识别出六个新的预后生物标志物，并构建了风险分层模型 | 样本量相对较小（8个肿瘤样本和7个正常组织样本），且依赖于公开数据集进行验证 | 识别肝细胞癌的预后生物标志物并评估其与免疫微环境浸润的关系 | 肝细胞癌患者样本中的T细胞及相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 | 15个样本（8个肿瘤, 7个正常），包含53,477个细胞，其中12,333个T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-01-02 |
Machine learning multiomics Deciphers GRHL2 associated tumor microenvironment evolution guiding precision therapeutics in breast cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04120-8
PMID:41276739
|
研究论文 | 本研究通过机器学习与多组学数据分析，揭示了GRHL2在乳腺癌中的预后价值及其与肿瘤微环境演化的关联，为精准治疗提供指导 | 首次整合单细胞RNA测序与多组学数据系统解析GRHL2在乳腺癌中的预后与免疫学意义，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证；GRHL2的具体作用机制仍需实验进一步阐明 | 全面评估GRHL2在乳腺癌中的预后价值、免疫学功能及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌患者的多组学数据（包括单细胞RNA测序和批量RNA测序数据） | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | CoxBoost回归, InferCNV | RNA测序数据 | 多个队列的乳腺癌患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 168 | 2026-01-02 |
Single-cell and spatially resolved omics reveal transcriptional and metabolic signatures of ovarian endometriomas
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66706-8
PMID:41274870
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分辨多组学技术揭示了卵巢子宫内膜异位囊肿的转录组和代谢组特征 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学（DSP-WTA）和空间代谢组学（MALDI-MSI）对卵巢子宫内膜异位囊肿进行综合分析，揭示了细胞类型特异性标志物和空间特异的代谢改变 | 未明确样本量具体数量，且部分代谢物功能尚未鉴定 | 解析卵巢子宫内膜异位囊肿的空间转录组和代谢组特征，寻找疾病相关标志物和通路 | 卵巢子宫内膜异位囊肿组织及卵巢皮质对照组织 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，空间代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，质谱成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，非靶向代谢组学 | Digital Spatial Profiler-Whole Transcriptome Atlas，MALDI-MSI | Digital Spatial Profiler全转录组图谱用于空间转录组学，基质辅助激光解吸/电离-质谱成像用于空间代谢组学 |
| 169 | 2025-11-24 |
Single-cell RNA sequencing reveals neutrophil differentiation-related genes for immunotherapy response prediction in colorectal cancer
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15355-7
PMID:41275131
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2026-01-02 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal lactylation-associated tumor cell clusters and define a prognostic risk model in glioblastoma
2025-Nov-22, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15291-6
PMID:41275140
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了胶质母细胞瘤中乳酸化相关的肿瘤细胞簇及其预后意义 | 首次在胶质母细胞瘤中系统描绘了乳酸化的单细胞和空间景观，并构建了一个基于乳酸化相关基因的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限，且样本来源可能影响模型的普适性 | 探究胶质母细胞瘤中乳酸化的空间和单细胞特征及其预后价值 | 胶质母细胞瘤患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质印迹, 免疫组织化学 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 基于GEO和TCGA数据集的分析，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 171 | 2026-01-02 |
PTPN9 dephosphorylates IGF1RY1165/1166 and alleviates IGF1R-mediated resistance to tyrosine kinase inhibitor in cholangiocarcinoma
2025-Nov-22, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03594-2
PMID:41275311
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研究论文 | 本研究揭示了PTPN9通过去磷酸化IGF1R的Y1165/1166位点来缓解胆管癌对酪氨酸激酶抑制剂的耐药性 | 首次将PTPN9鉴定为IGF1R的新型磷酸酶，并阐明了其在调节mTKI敏感性和肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于临床样本和动物模型，需要进一步的前瞻性临床试验验证其作为生物标志物的有效性 | 探究胆管癌对多靶点酪氨酸激酶抑制剂耐药的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点和生物标志物 | 胆管癌患者、胆管癌细胞系、小鼠原位移植瘤模型 | 癌症生物学 | 胆管癌 | 免疫沉淀-质谱联用、单细胞RNA测序、晶体结构分析、ELISA、免疫组化 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞转录组数据、临床病理数据 | 胆管癌患者临床组织样本、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2026-01-02 |
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and molecular features during postnatal pig testis development
2025-Nov-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12280-8
PMID:41272432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了猪出生后睾丸发育过程中的细胞异质性和分子特征 | 首次在猪模型中系统揭示了睾丸发育的细胞动态和转录调控网络，并进行了跨物种比较分析 | 样本数量有限（8头猪），且仅分析了特定时间点，未覆盖所有发育阶段 | 探究猪出生后睾丸发育的细胞组成和分子机制 | 猪睾丸细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 115,248个睾丸细胞，来自8头猪（0、2、5、24、48月龄） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2026-01-02 |
Bioinformatics analysis of macrophage-associated genes reveals prognostic signatures and immune landscape in gastric cancer
2025-Nov-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04019-4
PMID:41264178
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析，识别了与巨噬细胞相关的胃癌预后基因，并构建了一个预测风险模型 | 整合了多组学数据（TCGA、GEO）和多种分析方法（差异表达、WGCNA、单细胞RNA测序、Cox-LASSO回归），首次构建了基于巨噬细胞相关基因（GPX3、SERPINE1、SPARC）的胃癌预后风险模型，并揭示了其与肿瘤免疫微环境及药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏独立的前瞻性队列验证；生物信息学分析结果需要进一步的实验验证来阐明其生物学机制 | 识别胃癌中与巨噬细胞相关的预后生物标志物，并构建一个预测患者预后的风险模型 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | Cox-LASSO回归模型，风险评分模型，列线图 | 基因表达数据（RNA-seq），临床数据 | TCGA数据集：350个肿瘤样本，31个对照样本；GEO数据集：GSE84437（n=483），GSE183904 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2026-01-02 |
Integrated bioinformatics analysis to elucidate cellular communication in the microenvironment of breast cancer
2025-Nov-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03859-4
PMID:41264182
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析，结合临床样本验证，揭示了乳腺癌肿瘤微环境中细胞间通讯的关键机制 | 整合单细胞和批量mRNA测序数据，识别出乳腺癌肿瘤微环境中最重要的细胞通讯配体-受体对，并验证了相关差异表达基因在免疫细胞浸润中的作用 | 研究主要基于公共数据集和有限临床样本验证，需要进一步实验验证功能机制 | 阐明乳腺癌肿瘤微环境中的细胞间通讯机制及其对肿瘤发展的影响 | 乳腺癌肿瘤微环境中的细胞通讯配体-受体对及相关差异表达基因 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qPCR | NA | mRNA测序数据, 临床样本数据 | 基于公共数据集GSE176078的单细胞数据及临床样本验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2026-01-02 |
A pan-cancer analysis of CTSC as a candidate prognostic and immune-related biomarker
2025-Nov-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04124-4
PMID:41266623
|
研究论文 | 本文通过整合多组学数据，对CTSC在泛癌中的表达模式、预后价值、免疫相关功能及临床相关性进行了全面分析 | 首次在泛癌水平系统评估CTSC作为预后和免疫相关生物标志物的潜力，揭示了其与免疫检查点基因、癌症相关成纤维细胞浸润及γδ T细胞的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证和前瞻性临床队列的确认 | 评估CTSC在多种癌症中的预后价值和免疫相关功能，探索其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 多种癌症类型中的CTSC基因表达、突变、甲基化及免疫浸润数据 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 多组学分析、单细胞测序、生存分析、功能富集分析 | NA | 基因组、转录组、表观基因组、临床数据 | 基于TCGA、GTEx、CPTAC等多个公共数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-01-02 |
[Molecular and Genetic Analysis of a Rare Primary Culture of Head and Neck Paraganglioma]
2025 Nov-Dec, Molekuliarnaia biologiia
DOI:10.7868/S3034555325060091
PMID:41477719
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和外显子测序，分析了头颈部副神经节瘤（HNPGL）原代培养物的分子遗传特征 | 首次对HNPGL原代培养物进行单细胞RNA测序分析，揭示了细胞分群、分化程度及遗传异常，包括特定基因突变和染色体畸变 | 研究基于单一原代培养物，样本量有限，且未进行功能验证或临床前研究 | 探究HNPGL的分子遗传特征，以促进对其发病机制的理解和治疗方法的开发 | 头颈部副神经节瘤（HNPGL）的原代培养细胞 | 数字病理学 | 头颈部副神经节瘤 | 单细胞RNA测序，外显子测序 | NA | 基因表达数据，遗传变异数据 | 一个HNPGL原代培养物 | NA | 单细胞RNA-seq，外显子测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-01-01 |
Exploration of the Prognostic Value of PANoptosis-Related Genes in Bladder Cancer
2025 Nov-Dec, American journal of men's health
DOI:10.1177/15579883251404985
PMID:41451445
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研究论文 | 本研究系统探讨了PANoptosis相关基因在膀胱癌中的预后价值及临床意义 | 首次在膀胱癌中识别出两种具有显著生存差异的PANoptosis分子亚型，并构建了一个包含九个关键基因的预后模型，该模型在训练集和验证集中均表现出强大的风险分层能力，同时通过单细胞测序分析揭示了这些基因在肿瘤微环境中的细胞类型特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库（TCGA和GEO）的回顾性数据，需要前瞻性临床队列进行进一步验证，实验验证仅针对KCNJ15、FASN和ADAMTS12三个基因在组织中的过表达，未涵盖模型中的所有基因 | 探索PANoptosis相关基因在膀胱癌中的预后价值，并构建一个用于患者风险分层的预后模型 | 膀胱癌患者及其相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，生物信息学分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 178 | 2025-12-30 |
LARIS enables accurate and efficient ligand and receptor interaction analysis in spatial transcriptomics
2025-Nov-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.26.690796
PMID:41394607
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研究论文 | 本文提出了一种名为LARIS的方法，用于在空间转录组学中准确高效地分析配体与受体相互作用 | LARIS是首个能够兼容所有空间转录组技术、在单细胞或珠粒分辨率下识别细胞类型特异性和空间受限的配体-受体相互作用的方法，并引入了模拟框架进行性能验证 | NA | 开发一种能够整合空间信息进行细胞间通信推断的稳健且计算高效的方法 | 人类扁桃体和小鼠发育皮层空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 数十万细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 179 | 2025-12-30 |
TissueNarrator: Generative Modeling of Spatial Transcriptomics with Large Language Models
2025-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.24.690325
PMID:41394628
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研究论文 | 本文提出了一种名为TissueNarrator的生成式建模框架，利用大型语言模型分析空间转录组数据，以模拟细胞行为、预测细胞间相互作用并进行扰动分析 | 首次将空间组学分析重新定义为语言建模问题，通过将组织切片表示为空间句子，并利用预训练的大型语言模型学习空间条件化的基因表达模式，实现了对组织系统的生成式建模与推理 | 未明确说明模型在处理超大规模数据集时的计算效率，以及在不同组织类型或疾病状态下的泛化能力 | 开发一个能够生成真实细胞图谱、预测细胞间相互作用并进行自然语言查询的生成式空间转录组分析框架 | 空间转录组数据 | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | 大型语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | MERFISH, Perturb-FISH, CosMx SMI | NA |
| 180 | 2025-12-30 |
Spatiotemporal dynamics of RERE in schizophrenia pathogenesis: insights from multi-omics and single-cell sequencing
2025-Nov-26, Schizophrenia (Heidelberg, Germany)
DOI:10.1038/s41537-025-00705-y
PMID:41298505
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研究论文 | 本研究通过整合多组学和单细胞测序数据，揭示了精神分裂症风险基因RERE的时空动态调控机制及其在疾病发病中的作用 | 首次系统整合GWAS数据、多组学分析和单细胞测序，识别出RERE作为核心风险基因，并揭示其通过表观遗传-神经发育轴影响精神分裂症风险的机制 | 需要未来使用类器官模型进行验证，并探索临床转化应用 | 解析精神分裂症的遗传结构和神经发育机制，识别细胞类型特异性和时间动态调控特征 | 精神分裂症风险基因，特别是RERE，以及其在遗传变异和转录调控层面的作用 | 数字病理学 | 精神分裂症 | GWAS, 多组学分析, 单细胞测序, CUT&Tag | NA | 基因组关联数据, 单细胞测序数据, 表观遗传数据 | 欧洲人群130,644例，东亚人群30,761例 | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | NA |