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当前共找到 940 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-01-08 |
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000046084
PMID:41327651
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据，揭示了结直肠癌与肌肉减少症之间共享细胞类型的跨组织功能异质性及其微环境相互作用机制 | 首次结合CRC肿瘤组织和SP肌肉组织的单细胞转录组数据，系统解析跨组织微环境异质性，识别共享核心细胞类型及其功能分化，并发现潜在的全域调控因子 | 样本量相对有限（16个CRC组织和17个SP组织），且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证 | 阐明结直肠癌与肌肉减少症之间的微环境相互作用机制及其对预后的影响 | 结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | Harmony（批次效应校正）、CellChat（细胞通讯建模） | 单细胞转录组数据 | 16个CRC肿瘤组织和17个SP肌肉组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-01-08 |
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045975
PMID:41327739
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 | 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，系统探索了铁死亡相关基因在主动脉夹层中的细胞特异性表达模式，并揭示了肠道微生物和血清代谢物与疾病的潜在因果关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏实验验证；孟德尔随机化分析结果可能受混杂因素影响 | 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 主动脉夹层患者与对照组的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组和血清代谢组数据 | 生物信息学与多组学整合分析 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | LASSO回归, 受试者工作特征分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 微生物组数据, 代谢组数据 | 基于公共数据库（GEO）的样本，具体数量未明确说明；涉及211种肠道微生物分类群和1400种血清代谢物的GWAS汇总数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2026-01-08 |
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02447-z
PMID:41307600
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研究论文 | 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据，揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂（IRE1/XBP1、ATF6、PERK）作为一个分级调控系统在单细胞分辨率上的动态协调机制 | 引入了臂特异性指标（如Rheostat Index和平衡度）来量化UPR各臂的活动及其协调性，并首次在单细胞水平上描绘了UPR三臂沿谱系轨迹的动态优势切换模式 | 转录组分析仅能推断臂特异性协调，功能验证需要扰动研究和蛋白质水平读数 | 探究胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂是否作为单细胞分辨率的分级控制系统运作 | 胶质母细胞瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 发现队列871个细胞，验证队列11,877个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SMART-seq | 10x Chromium单细胞基因表达解决方案，SMART-seq全长单细胞RNA测序技术 |
| 124 | 2026-01-08 |
Mesothelin-expressing triple-negative breast cancer: a highly invasive and immunosuppressive subtype
2025-Nov-25, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-025-07860-x
PMID:41288782
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研究论文 | 本研究探讨了间皮素（MSLN）在三阴性乳腺癌（TNBC）中的表达及其与肿瘤侵袭性和免疫抑制微环境的关系 | 首次通过泛癌分析揭示MSLN在TNBC中的重要性，结合空间转录组学和单细胞数据识别MSLN高表达的肿瘤亚群及其特征 | 研究样本量有限，且主要基于局部队列，缺乏大规模多中心验证 | 探究MSLN在TNBC中的临床病理特征及其对治疗反应的影响 | 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，单细胞数据 | 局部队列及公共单细胞数据，具体样本数未明确 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-01-08 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
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研究论文 | 本研究通过一项随机、双盲、安慰剂对照试验，评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对健康中年成年人免疫系统的影响 | 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够调节免疫细胞组成和功能，特别是扩增幼稚样CD8 T细胞并增强其脂肪酸氧化能力 | 样本量较小（50名参与者），干预时间较短（仅4周），且研究对象为健康中年成年人，结果可能不适用于其他人群 | 探究尿石素A是否能够改善与年龄相关的免疫衰退 | 健康中年成年人的外周血免疫细胞 | NA | 老年性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，单细胞转录组数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-01-07 |
SGMS2+ macrophages enhance NR4A3hi NK cell infiltration to improve prognosis and PD-1 treatment efficacy in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07040-x
PMID:41316300
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研究论文 | 本研究揭示了SGMS2在肝细胞癌中通过极化巨噬细胞为M1表型并分泌CXCL2招募NR4A3hi NK细胞，从而改善预后和增强PD-1治疗效果的机制 | 首次阐明了SGMS2在巨噬细胞中的特异性作用，及其通过CXCL2介导的NK细胞招募机制改善肝细胞癌免疫微环境和PD-1治疗反应 | 研究主要基于回顾性临床数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限（临床队列188例） | 探究SGMS2在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其对患者预后和PD-1治疗疗效的影响 | 肝细胞癌患者组织样本、TCGA数据库、THP-1单核细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、流式细胞术、慢病毒转染 | NA | RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | TCGA-LIHC数据集371例，独立临床队列188例（2017-2022） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 127 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 128 | 2026-01-07 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析，揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用，并识别了FABP4、RNASET2和FILIP1L作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，应用机器学习算法识别与巨噬细胞胆固醇代谢相关的关键基因，并构建风险评分模型进行外部验证，同时通过体外实验验证基因功能 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和批次效应影响；体外实验验证范围有限，需进一步体内研究确认基因功能 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制，并识别相关诊断和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本中的巨噬细胞及相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 逻辑回归, 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的一个单细胞RNA测序数据集和多个批量mRNA转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-01-07 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，识别骨关节炎相关基因并预测潜在药物 | 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别关键基因，并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物效果 | 研究主要依赖公共数据集和预测算法，实验验证仅在斑马鱼模型中进行，未涉及人类临床试验 | 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 | 骨关节炎相关基因和候选药物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，RT-qPCR | 随机森林，hdWGCNA，PPI网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-01-07 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
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研究论文 | 本研究设计了一种多酶纳米催化剂，通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶（Rh@SAE），首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗，并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床试验；纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 | 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎，改善临床预后 | 急性胰腺炎（AP）和重症急性胰腺炎（SAP）的病理过程 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2026-01-07 |
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013667
PMID:41223185
|
研究论文 | 本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的新型深度学习模型SpaMWGDA，用于空间转录组数据的空间域识别 | 通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强，成功捕获了spot特征的全面邻域信息，并自适应地学习空间信息与基因特征之间的依赖关系 | 未在摘要中明确提及 | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图加权融合图卷积网络（GCN） | 基因表达和空间信息数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-01-06 |
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.17.688876
PMID:41332697
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研究论文 | 本研究通过比较单细胞转录组学分析，揭示了囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍在分子特征上的异同 | 首次使用预训练的transformer模型（scGPT）进行基因调控网络分析，通过差异注意力分析识别两种疾病间注意力分数改变的基因和通路 | 研究依赖于公开可用数据及本团队生成的数据，可能存在样本选择偏差，且未进行实验验证 | 比较囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍的分子特征，以指导个性化治疗策略 | 囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍患者的呼吸道细胞 | 自然语言处理 | 囊性纤维化,原发性纤毛运动障碍 | 单细胞RNA-seq | transformer (scGPT) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-01-04 |
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7769205/v1
PMID:41333415
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研究论文 | 本文介绍了人类肿瘤图谱网络（HTAN）开发的基于云的基础设施，用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据 | 引入了两个关键创新：基于来源的HTAN ID表简化了队列构建和跨检测整合；以及将BigQuery的地理空间功能创新性地应用于空间生物学，实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 | 未明确提及具体的技术或应用限制 | 开发一个基于云的基础设施，以降低整合和分析大规模、多模态癌症数据的技术和计算障碍 | 人类肿瘤图谱网络（HTAN）生成的多模态癌症数据，包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 | NA | 单细胞数据、空间数据、临床数据、图像数据 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | Google BigQuery | 基于Google BigQuery的云基础设施，托管于系统生物学研究所癌症云网关（ISB-CGC） | |
| 134 | 2026-01-03 |
Tissue-Resident Memory T Cells in Rheumatoid Immune Diseases: Pathogenic Mechanisms and Therapeutic Strategies
2025-Nov-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13122945
PMID:41462958
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综述 | 本文综述了组织驻留记忆T细胞在类风湿性免疫疾病中的致病机制及靶向治疗策略 | 系统性地总结了T细胞在多种自身免疫病中的疾病特异性致病机制，并批判性地评估了靶向T细胞的新型治疗策略，提出了结合空间转录组学、类器官模型和人工智能的未来精准医学方向 | NA | 阐明组织驻留记忆T细胞在类风湿性免疫疾病中的致病作用并探讨其作为治疗靶点的潜力 | 类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、原发性干燥综合征等类风湿性免疫疾病 | NA | 类风湿性免疫疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 135 | 2026-01-03 |
Decoding epithelial-T cell interactions in colorectal cancer through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04083-w
PMID:41313518
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，解码了结直肠癌中上皮细胞与T细胞之间的相互作用 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术，系统揭示了结直肠癌中上皮细胞与T细胞亚群的空间通信网络和共定位模式 | 样本量相对较小（36例患者），且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证 | 解析结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与T细胞的相互作用机制 | 结直肠癌患者的上皮细胞和T细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Seurat, Harmony, CytoTRACE, Slingshot, CellChat, CellTrek | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 36例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 136 | 2026-01-03 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Acute Myocardial Infarction Reveals Oxidative Stress-Associated Cardiomyocyte Subpopulations and Candidate Predictive Signatures
2025-Nov-28, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14121435
PMID:41462635
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组数据，揭示了急性心肌梗死患者心肌细胞中氧化应激异质性，并识别出高氧化应激亚群及其核心标志基因 | 首次在人类急性心肌梗死心肌细胞中识别出高氧化应激亚群，该亚群表现出独特的代谢激活-免疫抑制特征和细胞可塑性，并利用机器学习框架鉴定了五个核心预测标志基因 | 研究基于整合数据集，样本量相对有限，且为观察性研究，需要进一步功能验证 | 探究急性心肌梗死后心肌细胞氧化应激异质性及其适应性机制 | 人类心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA-seq | 机器学习（集成六种算法） | 单细胞转录组数据 | 64,510个心肌细胞，来自五个整合数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2026-01-03 |
Exploratory Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals Dysregulated Glial Populations and Pathways in Focal Cortical Dysplasia Epilepsy
2025-Nov-27, Biology
DOI:10.3390/biology14121690
PMID:41463463
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探索了局灶性皮质发育不良癫痫中神经胶质细胞的分子变化 | 首次在单细胞分辨率下揭示了FCD II型患者皮质组织中神经胶质细胞（小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞）的组成重塑和共享的分子通路失调，特别是发现了RAC1上调和ATP5F1D下调等共同变化 | 样本量较小（仅1例FCD患者和1例对照），属于探索性研究，结论需要更大样本验证 | 探究局灶性皮质发育不良（FCD）导致耐药性癫痫的细胞特异性发病机制 | 局灶性皮质发育不良II型患者的皮质组织及匹配对照 | 单细胞转录组学 | 癫痫（局灶性皮质发育不良相关） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Seurat工作流程（用于细胞聚类、注释和差异表达基因分析） | 单细胞转录组数据 | 2例（1例FCD II型患者，1例匹配对照） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2026-01-03 |
Differential regulation of 5-lipoxygenase and leukotriene-C4-synthase expression by IFNγ, IL-4 and IL-13 in human monocytes and macrophages from patients with atopic dermatitis
2025-Nov-26, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02108-2
PMID:41296013
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验，探讨了IFNγ、IL-4和IL-13对特应性皮炎患者单核细胞和巨噬细胞中5-脂氧合酶和白细胞三烯C4合酶表达的差异调控 | 首次在单细胞水平分析特应性皮炎皮损中5-LO/ALOX5和LTC4S mRNA表达，并揭示Th1和Th2细胞因子对这两个酶在单核细胞和巨噬细胞中的相反调控作用 | 研究主要基于体外实验和已有scRNA-seq数据的再分析，缺乏体内功能验证，样本来源包括匿名捐赠者，可能影响结果的一致性 | 探究特应性皮炎中CysLTs生物合成关键酶的表达调控机制，以理解炎症介质在疾病中的作用 | 特应性皮炎患者和健康志愿者的单核细胞、巨噬细胞，以及已发表研究中的皮损scRNA-seq数据 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序, q-PCR, 免疫细胞化学 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据, 图像数据 | 特应性皮炎患者、健康志愿者和匿名捐赠者的PBMCs，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 139 | 2026-01-03 |
Influenza virus and Staphylococcus aureus super-infection disrupts spatially coordinated cellular immunity in the mouse lung
2025-Nov-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09268-1
PMID:41276707
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探究了流感病毒与金黄色葡萄球菌超级感染如何破坏小鼠肺部的空间协调细胞免疫 | 首次应用空间转录组学平台（10X Genomics Visium）系统表征超级感染期间免疫细胞的空间协调性，揭示了传统研究无法捕捉的空间背景信息 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；空间转录组学数据可能受技术分辨率限制 | 探究流感病毒与金黄色葡萄球菌超级感染对肺部免疫细胞空间分布和信号传导的影响 | 小鼠肺部组织 | 空间转录组学 | 肺部感染 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组学数据，图像数据 | 未明确指定样本数量，但涉及超级感染、单一流感感染和单一金黄色葡萄球菌感染的比较组 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium 空间转录组学平台 |
| 140 | 2026-01-03 |
Dysfunction and Pathological Origins of Lymphatic Endothelial Cells in Atherosclerosis Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16121398
PMID:41465071
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了动脉粥样硬化中淋巴管内皮细胞的功能障碍和病理起源 | 首次在动脉粥样硬化中识别出淋巴管内皮细胞的两个亚群，并揭示了其双相数值响应、免疫调节能力改变以及从成纤维细胞转分化的新路径 | 研究基于ApoE-/-小鼠模型，可能不完全反映人类疾病情况；样本时间点有限，未覆盖更早期或更晚期阶段 | 阐明淋巴管内皮细胞在动脉粥样硬化进展中的表型和功能动态 | ApoE-/-小鼠主动脉细胞中的淋巴管内皮细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ApoE-/-小鼠主动脉细胞，包括基线、8周（早期疾病）和16周（晚期疾病）三个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |