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当前共找到 925 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2026-03-14 |
Inference of Tumor Progression Patterns in Colon Cancer Using Optimal Cell Order Analysis in Single Cell Resolution
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3592571
PMID:40811186
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研究论文 | 本研究提出了一种基于单细胞RNA-Seq数据的计算方法，用于推断结肠癌中细胞群体的进展模式 | 开发了一种基于排序的方法，利用最优重排序层次结构推断进展模式，并提供了先进的三维可视化工具和新评估指标 | 方法主要基于单细胞RNA-Seq数据，可能未考虑其他组学层面或更大样本量的验证 | 推断结肠癌中细胞群体的动态进展模式，如分化、信号传导或肿瘤进化轨迹 | 人类结肠样本的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA-Seq | 基于排序的算法，主曲线可视化 | 单细胞RNA-Seq数据 | 未明确指定，但涉及真实人类结肠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 122 | 2026-03-13 |
Serum Procalcitonin: A Novel Tumor Biomarker for Diagnosis and Follow-Up in Fibrolamellar Hepatocellular Carcinoma
2025-Nov-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.11.18.25340286
PMID:41332840
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研究论文 | 本研究探讨了降钙素原（PCT）作为纤维板层型肝细胞癌（FLC）的新型血清和肿瘤生物标志物的诊断和随访价值 | 首次发现并验证了PCT在FLC中特异性高表达，可作为区分FLC与其他原发性肝癌（如HCC、CCA）的敏感且特异的生物标志物，并展示了其在治疗反应监测中的潜在应用 | 样本量相对较小（FLC患者18例），且研究为观察性，需要更大规模的前瞻性研究来进一步验证PCT的临床效用 | 评估降钙素原（PCT）作为纤维板层型肝细胞癌（FLC）诊断和随访生物标志物的潜力 | 纤维板层型肝细胞癌（FLC）患者、肝细胞癌（HCC）患者、胆管癌（CCA）患者、肝硬化患者及相关肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、空间转录组学、免疫组织化学 | NA | 血清样本、肿瘤组织RNA测序数据、空间转录组数据、免疫组化图像 | 血清样本：34份来自18例转移性FLC患者，另加64例HCC、24例CCA、20例肝硬化患者；RNA测序：27个FLC肿瘤、331个HCC肿瘤、39个CCA肿瘤、71个肝母细胞瘤、34个肝细胞腺瘤及55个非肿瘤肝样本；空间转录组：3个FLC；免疫组化：13个FLC和34个其他原发或继发性肝癌 | NA | RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 123 | 2026-03-13 |
Multimodal Integration of Genomic Data Reveals Regulatory Mechanisms at the Polycystic Ovary Syndrome (PCOS)-Associated 12q13.2 Locus
2025-Nov-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211184
PMID:41303667
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研究论文 | 本研究通过整合多种基因组数据，揭示了多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的调控机制 | 首次整合全外显子组测序、STARR-seq增强子活性和单细胞RNA测序数据，系统解析了PCOS相关基因座的功能机制 | 研究主要聚焦于12q13.2基因座，可能未涵盖PCOS的其他遗传因素；样本来源相对有限 | 阐明多囊卵巢综合征相关12q13.2基因座的遗传变异功能机制 | 多囊卵巢综合征患者和正常对照的卵泡膜细胞 | 基因组学 | 多囊卵巢综合征 | 全外显子组测序, STARR-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组测序, eQTL共定位分析 | NA | 基因组变异数据, 增强子活性数据, 单细胞表达数据 | PCOS患者和正常对照的卵泡膜细胞样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 124 | 2026-03-13 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
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研究论文 | 本研究通过在小鼠气道中失活E-cadherin，揭示了其缺失如何导致细胞增殖增加、杯状细胞化生和免疫浸润，模拟哮喘表型，并阐明了上皮细胞内在的应激反应和免疫防御机制 | 首次证明E-cadherin缺失可在无过敏原暴露情况下诱发哮喘样表型，并发现上皮细胞具有感知连接破坏并启动免疫防御的内在能力 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证；未详细探讨其他黏附分子在此过程中的潜在补偿作用 | 探究E-cadherin在气道细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮细胞（特别是club细胞） | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2026-03-10 |
Pharmacological Inhibition of Ferroptosis Attenuates Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Nov, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323269
PMID:41036562
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡在腹主动脉瘤形成中的作用，并通过药理学抑制铁死亡来减轻实验性腹主动脉瘤的形成 | 首次在腹主动脉瘤形成中揭示了铁死亡的作用，并展示了使用liproxstatin-1抑制铁死亡可减轻主动脉炎症和重塑 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且仅使用了一种铁死亡抑制剂 | 探究铁死亡在腹主动脉瘤形成中的机制及药理学抑制的潜在治疗效果 | 人类腹主动脉瘤组织、C57BL/6小鼠（雄性和雌性）的主动脉组织、巨噬细胞和平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、质谱分析、组织学分析、体外细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、质谱数据、组织图像、体外实验数据 | 人类AAA组织数据库、使用弹性蛋白酶或弹性蛋白酶+β-氨基丙腈诱导的C57BL/6小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 126 | 2026-03-09 |
Epithelial pyroptosis-induced TREM1+ macrophages activate Th17 cells to accelerate oral mucosal inflammation
2025-Nov-29, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02853-7
PMID:41318555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组等技术，揭示了口腔黏膜慢性炎症中上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞通过激活Th17细胞加速炎症发展的机制 | 首次揭示了上皮细胞焦亡诱导的TREM1+巨噬细胞在口腔黏膜慢性炎症中的关键作用，并建立了ORGUAMIA在线数据库整合多组学数据 | NA | 探究口腔慢性炎症的发病机制，特别是口腔扁平苔藓的恶性进展过程 | 口腔黏膜组织、免疫细胞（巨噬细胞、Th17细胞） | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 临床随访数据 | 大型临床随访队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 127 | 2026-03-08 |
In vivo differentiation of embryonic cells devoid of key reprogramming factors
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116498
PMID:41171758
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析斑马鱼胚胎中NPS突变细胞在野生型胚胎中的命运，探讨了NPS在发育重编程和分化中的作用 | 揭示了NPS在协调核与细胞质重编程、防止谱系特异性分化程序过早激活中的关键作用，并发现部分细胞可绕过短暂全能性达到类似野生型的中间发育状态 | 研究基于斑马鱼模型，结果可能不直接适用于其他物种；单细胞RNA-seq技术可能无法完全捕捉所有转录动态 | 探究NPS（Nanog、Pou5f3、Sox19b）在胚胎细胞发育重编程和分化中的功能 | 斑马鱼胚胎中的NPS突变细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量，涉及斑马鱼胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 128 | 2026-03-08 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，分析了肾细胞癌中干扰素信号在肿瘤免疫微环境中的作用，并探讨了其如何影响免疫检查点阻断疗法的疗效 | 通过混合效应模型推断细胞类型中干扰素诱导基因的可诱导性，并发现髓系细胞中的IFNγ信号而非肿瘤细胞信号可预测对一线免疫联合疗法的原发性耐药 | 研究主要基于体外实验和临床队列的推断模型，缺乏体内机制的深入验证 | 探究干扰素信号在肾细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 肾细胞癌的肿瘤免疫微环境，特别是髓系细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 129 | 2026-03-08 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
|
研究论文 | 本研究利用现有RNA-seq数据集，回顾性分析了体积性肌肉损失（VML）损伤后线粒体基因和代谢通路的时序性失调 | 通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了VML损伤后长达42天的转录组变化，特别是线粒体相关基因和代谢通路的动态调控 | 研究为回顾性分析，依赖于现有公开数据集，可能受原始实验设计和技术差异的限制 | 探究VML损伤后线粒体和代谢转录组的变化 | 大鼠（Rattus norvegicus）和小鼠（Mus musculus）的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉损伤 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 130 | 2026-03-06 |
Mitochondrial iron transport via MFRN1 is required for erythroid cell cycle progression
2025-Nov-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014887
PMID:40601908
|
研究论文 | 本研究开发了体内方法，探讨铁如何调节红细胞生成，并报告了通过mitoferrin-1（MFRN1）的线粒体铁运输对红细胞细胞周期进程至关重要 | 揭示了MFRN1介导的线粒体铁运输在红细胞细胞周期G2/M期进展中的关键作用，并通过铁补充实验验证了其机制 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型，可能需要在其他生物系统中进一步验证 | 探究铁代谢如何调节红细胞生成过程，特别是细胞周期和分化 | 斑马鱼胚胎中的红细胞（erythroid cells） | NA | NA | 单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing），荧光激活流式分选（fluorescence-activated flow sorting） | NA | RNA测序数据，流式细胞术数据 | 斑马鱼胚胎（包括野生型和mfrn1突变体），具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 131 | 2026-03-06 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
|
研究论文 | 本文提出了一种名为TransST的新型迁移学习框架，用于从空间转录组学数据中推断细胞水平的异质性 | TransST通过自适应地利用外部来源的细胞标记信息，提高了空间转录组学数据中细胞亚群识别和生物标志物检测的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种迁移学习框架，以克服空间转录组学技术中分辨率和测序深度的限制，从而更可靠地提取生物信号 | 空间转录组学数据，特别是乳腺癌研究中的细胞亚群 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2026-03-03 |
Mitochondrial and Glucose Metabolic Patterns in Pre-Granulosa Cells and Oocytes and Their Dysfunctions Induce Impaired Primordial Follicle Formation in Mice
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70110
PMID:41251108
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠卵巢组织中前颗粒细胞和卵母细胞在糖酵解和氧化磷酸化信号通路上的动态基因表达变化，及其对原始卵泡形成的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了原始卵泡形成过程中前颗粒细胞和卵母细胞的能量代谢动态变化模式 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究原始卵泡形成过程中能量代谢的供应与需求机制 | 小鼠卵巢组织中的前颗粒细胞和卵母细胞 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠卵巢组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2026-03-03 |
LogicSR: prior-guided symbolic regression for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf621
PMID:41269283
|
研究论文 | 本文提出了一种名为LogicSR的计算框架，用于从单细胞转录组数据中高精度重建基因调控网络 | 将布尔逻辑模型的机制可解释性与符号回归的方程发现能力相结合，并利用先验知识通过多目标蒙特卡洛树搜索框架确保生物学合理性并加速最优调控方程的搜索 | 未明确提及具体局限性，但可能受限于单细胞数据的稀疏性和噪声，以及动态组合调控的复杂性 | 从单细胞转录组数据中推断基因调控网络，以揭示基因调控机制 | 基因调控网络，特别是转录因子与靶基因之间的复杂组合调控 | 系统生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 布尔逻辑模型，符号回归，蒙特卡洛树搜索 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 134 | 2026-03-03 |
From Single-Cell Atlas to Functional Validation: Critical Next Steps for Understanding Tip Cell-Mediated Communication in the Injured Spinal Cord
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70117
PMID:41288006
|
评论 | 本文对Zeng等人（2025年）利用单细胞RNA测序研究脊髓损伤的研究进行了前瞻性展望和批判性审视，强调了从单细胞图谱到功能验证的关键后续步骤 | 提出了对单细胞测序研究中计算预测的旁分泌网络（如Angptl4-Sdc4轴）进行严格体内功能验证的必要性，并探讨了靶向尖端细胞治疗策略中的治疗困境 | 评论文章本身不产生新数据，主要基于对现有研究的分析和展望；未提供具体的实验验证方案 | 批判性审视单细胞测序在脊髓损伤研究中的应用，提出从描述性见解向机制理解和治疗策略转化的关键挑战 | 脊髓损伤中的内皮尖端细胞、星形胶质细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 135 | 2026-03-02 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
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研究论文 | 本研究利用人类神经类器官模型，通过单细胞RNA测序分析了脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序动态影响 | 首次在可扩展的人类神经类器官模型中，通过单细胞测序揭示了血液暴露引起的细胞特异性转录组变化及其时间动态性，并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内脑出血的复杂微环境；样本量相对有限（18个类器官） | 探究脑出血后血液诱导的继发性神经损伤对不同脑细胞类型的影响，以优化手术清除时机 | 人类神经类器官，包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞测序 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官，共96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 136 | 2026-03-01 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamic reprogramming of testicular immunity in Brucella-infected goat testis
2025-Nov-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了布鲁氏菌感染的山羊睾丸组织中免疫微环境的动态转录重编程 | 首次在单细胞分辨率下描绘了布鲁氏菌感染后睾丸免疫微环境的动态重塑，并识别出硫氧还蛋白相互作用蛋白（TXNIP）作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究仅在山羊模型中进行，结果向其他物种或人类的直接外推需谨慎；机制验证实验（如功能缺失/获得）未在文中报告 | 阐明布鲁氏菌感染导致睾丸免疫病理的分子机制，并寻找免疫调节干预的潜在靶点 | 山羊睾丸组织（生理状态与布鲁氏菌感染状态） | 数字病理学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 137 | 2026-02-27 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Nov, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，并基于单细胞和空间转录组学研究总结了主要发现 | 整合了最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学数据，为神经退行性疾病模型提供了新的分子和细胞层面见解 | 没有模型是完美的，可能存在物种差异和病理不完全模拟的问题 | 研究神经退行性疾病的病因和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 138 | 2026-02-26 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
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研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑亚基DPF2通过调控CACNA1D介导的MAPK通路，在巨噬细胞炎症反应和肠道损伤修复中的关键作用 | 首次发现DPF2缺失通过改变组蛋白修饰（H3K27ac和H3K4me1）调控CACNA1D表达，进而影响细胞内钙水平和MAPK信号通路，最终调节巨噬细胞的炎症极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证的规模可能有限，且具体调控机制中涉及的转录因子或其他共调节因子尚未完全阐明 | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应和肠道再生的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病（IBD）样本、患者来源的类器官 | 单细胞组学与空间转录组学 | 炎症性肠病（IBD） | 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 未明确具体样本数量，但涉及小鼠模型、临床IBD样本和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 139 | 2026-02-26 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
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综述 | 本文系统总结了单细胞转录组学和表观基因组学方法在阿尔茨海默病研究中的应用，重点阐述了细胞类型和亚型特异性转录组改变的特征 | 整合单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学技术，揭示了疾病轨迹和跨病理阶段的细胞通讯网络，为精准医学提供了新见解 | 本文为综述文章，未报告原始实验数据，其总结依赖于现有研究的发现和局限性 | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解，并为通过识别新的治疗靶点和生物标志物实现精准医学铺平道路 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-seq), 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 140 | 2026-02-25 |
A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis
2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241873
PMID:40900124
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析、空间转录组学和功能研究，比较了四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞，识别了保守的疾病相关巨噬细胞 | 首次通过跨物种分析识别了狼疮性肾炎中保守的疾病相关单核细胞和巨噬细胞，并验证了小鼠模型在理解人类疾病中的适用性 | 研究主要基于观察性数据，功能机制验证可能有限，且样本量虽大但可能未覆盖所有疾病亚型 | 探索狼疮性肾炎中肾内髓系细胞的改变，并评估小鼠模型在治疗开发中的适用性 | 四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞分析，空间转录组学，功能研究 | NA | 单细胞数据，空间转录组数据 | 155名狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |