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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1101 | 2025-07-17 |
Mapping trait-associated cells with spatial transcriptomics
2025-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00877-4
PMID:40664743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1102 | 2025-10-15 |
Exploring the Epidemiology and Molecular Mechanisms of Riboflavin Against Chronic Kidney Disease Based on Data Mining, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2025 Nov-Dec, Journal of the American Nutrition Association
IF:6.8Q1
DOI:10.1080/27697061.2025.2509900
PMID:40435123
|
研究论文 | 本研究通过数据挖掘、单细胞RNA测序和分子对接探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及分子机制 | 首次结合流行病学调查、单细胞RNA测序和分子对接技术系统揭示核黄素通过调节炎症因子和信号通路预防慢性肾脏病的机制 | 研究主要基于公共数据库和回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索核黄素与慢性肾脏病的流行病学关联及其分子作用机制 | 慢性肾脏病患者及核黄素作用靶点 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 分子对接, 数据挖掘, 逻辑回归模型, 限制性立方样条 | 逻辑回归模型, 中介分析模型 | 流行病学调查数据, 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | 美国国家健康与营养调查数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1103 | 2025-10-11 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
|
综述 | 系统总结单细胞测序技术在阿尔茨海默病研究中的应用,揭示脑细胞异质性与疾病发病机制 | 整合单细胞转录组、表观基因组和空间转录组数据,阐明疾病轨迹和细胞通讯网络 | NA | 通过单细胞测序技术深入理解阿尔茨海默病的发病机制 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1104 | 2025-10-11 |
Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05201-z
PMID:40681826
|
研究论文 | 本研究探讨妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响,特别是对调节食欲和能量平衡的神经元群体形成的影响 | 首次揭示必需氨基酸减少通过mTOR信号通路和表观遗传机制选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元分化 | 仅研究了特定发育窗口期,需要进一步研究其他发育阶段 | 探究宫内生长受限与长期代谢紊乱风险的机制联系 | 妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑发育 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, EdU标记, 免疫组织化学, RNAscope, mTOR信号分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 甲基化数据 | 妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1105 | 2025-10-05 |
Multi-pronged analysis of pediatric low-grade glioma and ganglioglioma reveals a unique tumor microenvironment associated with BRAF alterations
2025-Nov, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
DOI:10.1111/bpa.70023
PMID:40588233
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和细胞因子分析研究儿童低级别胶质瘤和神经节胶质瘤的肿瘤微环境特征 | 首次采用多组学方法揭示不同BRAF突变类型肿瘤的免疫微环境差异 | 需要进一步研究免疫细胞浸润和肿瘤-免疫相互作用的机制 | 深入理解儿童低级别胶质瘤生物学特征以开发更有效的治疗方法 | 毛细胞星形细胞瘤(PA)和神经节胶质瘤(GG) | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1106 | 2025-10-05 |
Prognostic model for predicting recurrence-free survival in hepatocellular carcinoma using integrated analysis of single-cell RNA-sequencing and bulk RNA-sequencing
2025-Nov, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.15283
PMID:41040911
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,构建了预测肝细胞癌患者无复发生存期的预后模型 | 首次整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据构建肝细胞癌预后模型,识别出6个与无复发生存相关的关键基因 | 未明确说明样本来源和具体数量,缺乏多中心验证 | 开发可靠的肝细胞癌复发预测模型以满足临床需求 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR | LASSO Cox惩罚回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1107 | 2025-10-05 |
Fueling fibrosis: metabolic dysregulation in systemic sclerosis
2025-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001123
PMID:40916994
|
综述 | 本综述探讨代谢重编程如何驱动系统性硬化症的纤维化和免疫失调 | 系统阐明系统性硬化症中从分解代谢向合成代谢转变的分子机制,揭示代谢通路与纤维化信号的新型关联 | NA | 研究代谢重编程在系统性硬化症发病机制中的作用 | 系统性硬化症患者的代谢通路和纤维化过程 | NA | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1108 | 2025-10-05 |
TargetPair: A Single Cell-omics Resource of Clinical Trials-derived Therapeutical Target Combinations for Cancer Therapy
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169399
PMID:40840587
|
研究论文 | 建立TargetPair数据库,提供临床试验来源的癌症治疗靶点组合及其单细胞组学特征 | 首次系统整合临床相关癌症靶点组合并计算其单细胞水平组学特征 | 数据来源依赖于已发表的临床试验和文献,可能存在选择偏差 | 开发癌症多靶点治疗的理性设计资源 | 癌症治疗靶点组合及其单细胞组学特征 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞组学数据 | 3,022,556个单细胞,588名患者,16种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1109 | 2025-10-05 |
Illuminating lymphoid tissue HIV reservoirs: advanced assays and their relevance to achieving an HIV cure
2025-Nov-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000974
PMID:40891589
|
综述 | 本综述探讨了用于可视化和表征淋巴组织中HIV病毒库的先进检测方法及其在实现HIV治愈中的意义 | 整合了活体显微镜、空间转录组学、新一代测序和多重单细胞分析等创新技术,揭示病毒库的异质性和病毒持久性机制 | NA | 评估当前和新兴检测方法在表征淋巴组织HIV病毒库中的应用价值 | 淋巴组织中的HIV病毒库 | NA | HIV/艾滋病 | 活体显微镜、空间转录组学、新一代测序、单细胞分析 | NA | 图像、序列数据、单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
| 1110 | 2025-10-05 |
Integrated Analysis of Single-cell and Bulk RNA-Sequencing Identifies a Signature Based on Cancer-related Fibroblast Marker Genes to Predict Prognosis and Therapy Response in Lung Adenocarcinoma
2025 Nov-Dec 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000577
PMID:40831319
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,基于癌症相关成纤维细胞标志基因构建了一个预测肺腺癌预后和治疗反应的签名 | 首次基于癌症相关成纤维细胞标志基因构建肺腺癌预后签名,整合单细胞和bulk RNA测序数据进行综合分析 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证签名的普适性 | 分析肺腺癌中癌症相关成纤维细胞标志基因表达并构建预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qRT-PCR | 预后签名模型,列线图 | 基因表达数据 | 716例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1111 | 2025-10-05 |
Glycoprotein Ib-CD11b + monocyte-derived macrophages mediate atherosclerosis-exacerbated psoriatic inflammation
2025-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123960
PMID:40945652
|
研究论文 | 本研究揭示了糖蛋白Ib-CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞通过GPIb-CD11b轴介导动脉粥样硬化加剧银屑病炎症的机制 | 首次发现CD11b+单核细胞来源的巨噬细胞在动脉粥样硬化合并银屑病病变中显著增加,并阐明血小板来源的GPIb通过GPIb-CD11b轴促进巨噬细胞M1极化的新机制 | 研究样本量有限,主要基于初治患者,需要更大规模研究验证 | 阐明动脉粥样硬化与银屑病之间的炎症相互作用机制 | 银屑病合并动脉粥样硬化患者的皮肤活检组织、分离的巨噬细胞和血小板、咪喹莫特诱导的银屑病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 银屑病, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 体外功能实验, 动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据, 实验数据 | 初治银屑病合并动脉粥样硬化患者的皮肤活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1112 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals early cell dynamics of MSC-based therapy in long bone critical-size defects in mice
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.08.007
PMID:40995603
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究MSC疗法在小鼠长骨临界尺寸缺损早期愈合过程中的细胞动态变化 | 首次在临界尺寸骨缺损模型中应用单细胞RNA测序技术揭示MSC治疗早期免疫微环境变化和细胞间通讯网络 | 研究仅观察了治疗后1周时间点,样本量有限,且仅在雄性小鼠中进行 | 阐明MSC在骨缺损愈合早期如何调节局部骨微环境并与其他细胞相互作用 | 10-12周龄BALB/c雄性小鼠的股骨临界尺寸缺损模型 | 单细胞组学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠(空组、支架组、支架+MSC组),每组具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1113 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics profiling identifies Cmpk1 as a monocyte-specific therapeutic target for renal ischemia-reperfusion injury
2025-Nov-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123924
PMID:40848967
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定Cmpk1作为肾脏缺血再灌注损伤中单核细胞特异性治疗靶点 | 首次揭示单核细胞特异性核苷酸代谢重编程在肾脏缺血再灌注损伤中的关键作用,并确定Cmpk1为核心调控基因 | 研究主要聚焦于单核细胞,其他肾细胞类型的作用可能未被充分探索 | 解析肾脏缺血再灌注损伤中细胞特异性代谢重编程机制并识别治疗靶点 | 肾脏缺血再灌注损伤模型中的单核细胞及其他肾细胞类型 | 多组学整合分析 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据,代谢物数据,空间转录数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量转录组学,代谢组学 | NA | NA |
| 1114 | 2025-10-05 |
A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis
2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241873
PMID:40900124
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研究论文 | 通过跨物种比较研究狼疮性肾炎中肾内髓系细胞的保守特征 | 首次建立人鼠肾内髓系细胞图谱,识别出在狼疮性肾炎中保守的疾病相关巨噬细胞亚群 | 研究仅针对狼疮性肾炎,未涉及其他肾脏疾病 | 比较狼疮性肾炎患者和小鼠模型中肾内髓系细胞的异同 | 155例狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型的肾内髓系细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞分析, 空间转录组学, 功能研究 | NA | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 155例狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1115 | 2025-10-05 |
Hyperactivation of the m6A demethylase FTO to down-regulate SLC7A11/xCT-mediated redox homeostasis and epigenetic remodeling in facial infiltrating lipomatosis
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了m6A去甲基化酶FTO通过下调SLC7A11破坏氧化还原稳态和表观遗传重编程,从而促进面部浸润性脂肪瘤病发病的分子机制 | 首次发现FTO通过m6A依赖方式抑制SLC7A11,扰乱氧化还原平衡,并通过SIRT6-H3K9ac介导的表观遗传重编程促进脂肪生成的新机制 | 研究聚焦于罕见疾病面部浸润性脂肪瘤病,样本量可能有限,且机制研究主要在细胞和动物模型中进行 | 探究FTO介导的m6A去甲基化在面部浸润性脂肪瘤病发病机制中的作用 | 面部浸润性脂肪瘤病患者组织、脂肪干细胞和祖细胞(ASPCs)、异种移植模型 | 分子生物学 | 面部浸润性脂肪瘤病 | Western blotting, qPCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, MeRIP-seq, RIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测, ATAC-seq, ChIP-qPCR, 酶活性检测 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1116 | 2025-10-05 |
Exosomal gene signature in esophageal carcinoma: Insights from single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102490
PMID:40816225
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,开发并验证了一个用于食管癌预后预测的外泌体相关九基因标志物 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据构建食管癌外泌体相关基因标志物,并验证其在免疫治疗预测中的潜在价值 | 免疫治疗相关性分析基于膀胱癌队列而非食管癌特异性队列,需要进一步在食管癌免疫治疗队列中验证 | 开发食管癌预后预测和免疫治疗反应预测的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌(ESCA)患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO-Cox回归风险模型 | RNA测序数据 | TCGA-ESCA、GSE53625、GSE196756等多个公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1117 | 2025-10-05 |
Single-cell omics reveal the mechanisms of traditional Chinese medicines
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157204
PMID:40916282
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在中医药研究中的应用及其在揭示中药作用机制方面的潜力 | 首次系统探讨单细胞组学技术在解析中药复杂成分和作用机制中的变革性潜力 | 存在技术限制和数据复杂性等挑战 | 探索单细胞组学在中医药现代化和科学验证中的作用 | 传统中药及其活性成分 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1118 | 2025-10-05 |
Integrated transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis revealed the prognostic significance of GBP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102532
PMID:40944976
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,揭示了GBP4在胰腺腺癌中的预后意义 | 首次系统性地确定了GBP4在胰腺腺癌中的预后价值,并通过单细胞分辨率揭示了其在肿瘤微环境中的表达动态 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步独立队列验证 | 确定GBP4基因对胰腺腺癌的影响 | 胰腺腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1119 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501
PMID:40811979
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响,并开发了基于棕榈酰化特征的12基因风险模型 | 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证,实验验证主要集中于ASPH基因 | 探索棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性和预后预测中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,GSVA,ssGSEA,拷贝数变异分析,伪时间序列分析,细胞互作分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | TCGA数据集和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 1120 | 2025-10-05 |
Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165
PMID:40839986
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研究论文 | 通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法,阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统研究白藜芦醇对BPH的治疗机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内实验验证 | 阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理机制和关键信号通路 | 良性前列腺增生疾病模型和前列腺细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌相关疾病 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 体外实验验证 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |