本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1081 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats
2025-Nov-10, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统阐明开心散通过抑制前驱活性、恢复星形胶质细胞线粒体代谢和重塑神经-星形胶质细胞相互作用网络来增强突触可塑性的抗抑郁机制 | 研究仅针对大鼠下丘脑区域,未涉及其他脑区;样本数量相对有限 | 探究开心散改善抑郁症状的分子机制 | 慢性不可预见轻度应激诱导的抑郁模型大鼠 | 单细胞转录组学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,行为学实验,分子生物学实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | 45,482个下丘脑细胞,来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1082 | 2025-10-31 |
CRISPLD2, a novel insulin-sensitizing adipokine that alters adipocyte size
2025-Nov, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24342
PMID:40855979
|
研究论文 | 本研究探讨新型脂肪因子CRISPLD2在调节脂肪组织纤维化和改善胰岛素敏感性方面的功能 | 首次发现CRISPLD2能够改变脂肪细胞大小并改善胰岛素敏感性,同时揭示其通过调节胶原转录和纤维化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床意义尚需进一步验证 | 探索CRISPLD2脂肪因子在脂肪组织结构和功能调节中的作用机制 | 脂肪特异性过表达CRISPLD2的小鼠模型和3T3-L1脂肪细胞 | 分子生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱分析, transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据 | 脂肪特异性CRISPLD2过表达小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1083 | 2025-10-31 |
Targeting MAT2A synergistically induces DNA damage in osteosarcoma cells through EZH2-mediated H3K27me3 modification
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.09.007
PMID:41146859
|
研究论文 | 本研究通过靶向MAT2A与EZH2抑制联合治疗,协同诱导骨肉瘤细胞DNA损伤并抑制肿瘤生长 | 首次发现MAT2A抑制与EZH2抑制在骨肉瘤治疗中的协同作用机制,通过代谢与表观遗传双重干预策略 | NA | 探索代谢与表观遗传联合干预在骨肉瘤治疗中的潜在价值 | 骨肉瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,高通量化合物筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1084 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮患者血液CD4⁺ T细胞的异质性 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序识别出独特的辅助性T细胞和功能失调调节性T细胞亚群,并发现TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调 | 研究样本仅限于儿童患者,未包含成人队列;样本量相对有限 | 表征系统性红斑狼疮患者CD4⁺ T细胞区室的复杂性 | 儿童系统性红斑狼疮患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1085 | 2025-10-30 |
The spatial and temporal activation of macrophages during fibrosis
2025-Nov, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-025-01186-x
PMID:40467841
|
综述 | 本文探讨巨噬细胞在纤维化过程中的时空激活机制及其治疗潜力 | 提出解释巨噬细胞跨时空调控组织纤维化的新模型,并整合单细胞转录组学揭示的巨噬细胞异质性新发现 | NA | 阐明巨噬细胞在纤维化过程中的时空调控机制 | 人类和小鼠组织中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 纤维化疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1086 | 2025-10-30 |
Utilizing CRISPR-Cas13d-knockdown in zebrafish to study a rare monogenic bone fragility syndrome
2025-Nov, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf153
PMID:41143154
|
研究论文 | 利用CRISPR-Cas13d基因敲降技术研究斑马鱼中罕见单基因骨脆性综合征的分子机制 | 首次应用新型CRISPR-Cas13d基因敲降技术建立斑马鱼疾病模型研究CDL综合征 | 研究仅关注胚胎和早期幼体阶段,未涉及成年期表型分析 | 探究SMS2基因功能及CDL骨脆性综合征的分子机制 | 斑马鱼胚胎和幼体 | 基因功能研究 | 骨质疏松症 | CRISPR-Cas13d基因敲降,单细胞RNA测序,原位杂交 | 斑马鱼疾病模型 | 基因表达数据,表型图像 | 野生型和基因敲降斑马鱼胚胎及幼体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1087 | 2025-10-30 |
Cuproptosis-Related Ferroptosis Gene Signature: A Prognostic Tool for Colon Cancer Patients
2025-Nov, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70372
PMID:41152153
|
研究论文 | 基于铜死亡相关铁死亡基因构建结肠癌预后预测模型 | 首次整合铜死亡和铁死亡两种程序性细胞死亡机制构建结肠癌预后特征模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 构建结肠腺癌预后预测模型并评估其与免疫浸润的关系 | 结肠腺癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, RT-PCR | LASSO算法, Cox回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1088 | 2025-10-29 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析人脑类器官在脑出血模型中对血液暴露的时序动态反应 | 首次在可扩展的人脑类器官模型中系统表征血液诱导的继发性损伤对不同脑细胞类型的时序动态影响 | 研究基于体外类器官模型,可能与体内真实脑出血环境存在差异 | 探究脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序特异性转录组影响 | 人脑类器官包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞组学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官中的96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1089 | 2025-10-29 |
Neuroinflammation and Alzheimer's disease: Unravelling the molecular mechanisms
2025-Nov, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251374353
PMID:40938771
|
综述 | 本文系统探讨神经炎症在阿尔茨海默病发病机制中的核心作用及分子机制 | 深入解析小胶质细胞和星形胶质细胞在神经炎症中的双重功能,并整合单细胞组学技术揭示的胶质细胞异质性新发现 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 阐明神经炎症在阿尔茨海默病发病机制中的分子机制 | 阿尔茨海默病相关的神经炎症机制 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学、脂质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1090 | 2025-10-29 |
Cancer-associated fibroblasts drive lung adenocarcinoma progression via THBS2-mediated epithelial-mesenchymal transition
2025-Nov, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03569-9
PMID:40973793
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过THBS2介导的上皮-间质转化驱动肺腺癌进展的机制 | 首次发现高表达THBS2的基质CAF亚型在肺腺癌进展中的关键作用,并阐明THBS2-SDC4-EMT信号轴 | 未明确THBS2-SDC4相互作用的具体分子机制及在其他癌症类型中的普适性 | 解析癌症相关成纤维细胞在肺腺癌发生发展中的作用机制 | 人肺腺癌组织样本及体外模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | 包含原位腺癌、微浸润腺癌和浸润性腺癌的多阶段样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1091 | 2025-10-29 |
ITGA5 drives glioblastoma progression through SLK-mediated activation of the PI3K-Akt pathway
2025-Nov, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2512437
PMID:40544320
|
研究论文 | 本研究揭示了ITGA5通过SLK激活PI3K-Akt通路驱动胶质母细胞瘤进展的分子机制 | 首次发现ITGA5通过SLK介导的PI3K-Akt通路激活促进胶质母细胞瘤进展,并证实ITGA5-SLK轴可作为新的治疗靶点 | NA | 阐明ITGA5在胶质母细胞瘤中的促癌机制 | 胶质母细胞瘤组织和细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | RNA测序, 蛋白质组学, 磷酸化蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量RNA测序 | NA | NA |
| 1092 | 2025-07-06 |
Combining spatial transcriptomics and AI to enhance brain tumour diagnosis
2025-Nov, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-025-00851-6
PMID:40615732
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1093 | 2025-10-24 |
Piezo1-Mediated Calcium Flux Transfers Mechanosignal to Yes-Associated Protein to Stimulate Matrix Production in Keloid
2025-Nov, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.03.039
PMID:40254148
|
研究论文 | 本研究揭示了Piezo1通过钙流调控YAP核转位促进瘢痕疙瘩基质产生的机械信号传导机制 | 首次发现Piezo1/钙流/YAP信号轴在瘢痕疙瘩机械信号传导中的关键作用,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 探索机械力诱导瘢痕疙瘩形成的分子机制并寻找治疗靶点 | 人瘢痕疙瘩成纤维细胞和患者来源的瘢痕疙瘩异种移植模型 | 细胞生物学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞转录组分析、原子力显微镜、钙离子荧光指示剂、免疫荧光染色、转录组学 | NA | 基因表达数据、生物力学数据、影像数据 | 人瘢痕疙瘩成纤维细胞与正常皮肤成纤维细胞的比较研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1094 | 2025-10-21 |
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-Nov, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251336191
PMID:40454459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和转基因小鼠模型揭示了Wnt1在颅面骨和牙齿发育中的差异作用 | 首次系统揭示Wnt1对神经嵴来源和间充质来源颅面骨发育的差异影响,并发现其对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制作用 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 探究Wnt1信号在颅面骨和牙齿发育中的具体作用机制 | 小鼠切牙及颅面骨组织 | 发育生物学 | 颅面发育异常 | 单细胞测序, bulk RNA测序, 显微CT, 体外实验 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1095 | 2025-10-21 |
Cellular senescence and its association with aldose reductase promote cyst growth in autosomal dominant polycystic kidney disease
2025-Nov, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.05.027
PMID:40578685
|
研究论文 | 本研究探讨细胞衰老及其相关因子醛糖还原酶在常染色体显性多囊肾病囊肿生长中的作用 | 首次揭示细胞衰老通过SASP促进ADPKD囊肿生长,并鉴定AKR1B1为关键SASP因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 阐明细胞衰老在ADPKD发病机制中的作用 | Pkd1突变小鼠和人类ADPKD肾脏组织 | 病理生物学 | 常染色体显性多囊肾病 | 单细胞RNA测序,转基因小鼠模型 | INK-ATTAC转基因小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据 | Pkd1突变小鼠和人类ADPKD肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1096 | 2025-10-20 |
Spatially resolved transcriptomics reveals a unique disease signature and potential biomarkers for chronic traumatic encephalopathy
2025-Nov-01, Journal of neuropathology and experimental neurology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jnen/nlaf078
PMID:40680295
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术揭示慢性创伤性脑病的独特疾病特征和潜在生物标志物 | 首次通过空间转录组学在CTE病灶中发现21个基因的共同特征,揭示星形胶质细胞激活和细胞外基质重塑等关键病理机制 | 研究样本仅限于死后组织,无法进行纵向动态观察 | 解析慢性创伤性脑病的分子病理机制并寻找潜在诊断生物标志物 | 慢性创伤性脑病患者病灶组织与匹配正常组织 | 数字病理学 | 慢性创伤性脑病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 来自同一患者个体的CTE病灶和匹配正常组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组学平台 |
| 1097 | 2025-10-20 |
Neoadjuvant immune checkpoint inhibition improves protection against hepatic melanoma metastasis
2025-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217950
PMID:40714065
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型证明新辅助免疫检查点抑制剂治疗对肝黑色素瘤转移具有更好的保护作用 | 首次比较新辅助与辅助免疫检查点抑制剂治疗在预防肝黑色素瘤转移中的效果差异 | 研究基于小鼠模型,需要进一步临床验证 | 评估新辅助免疫检查点抑制剂是否能预防肝黑色素瘤转移和治疗耐药性 | WT31和B16F10 luc2黑色素瘤细胞系的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光,原位杂交,多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据,细胞因子数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1098 | 2025-10-19 |
Bile acids engage the SIPR-STAT3 signaling axis to modulate regulatory T cell responses in fibrosing cholangiopathies
2025-Nov, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.05.032
PMID:40545044
|
研究论文 | 本研究揭示了胆汁酸通过S1PR-STAT3信号轴调控调节性T细胞在纤维化胆管病中的应答机制 | 首次发现胆汁酸通过S1PR-STAT3信号通路促进Treg细胞向Th17样表型转化,从而抑制其调节功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究胆汁酸在纤维化胆管病中如何影响调节性T细胞的功能 | 小鼠模型和130例胆道闭锁婴儿的肝组织样本 | 免疫学 | 胆管疾病 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, 功能验证实验 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 多个小鼠模型和130例人类婴儿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 1099 | 2025-10-18 |
Single-cell transcriptomics reveals Sox6 positive interneurons enriched in the prefrontal cortex of female mice vulnerable to chronic social stress
2025-Nov, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03088-9
PMID:40581656
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示雌性小鼠前额叶皮层中Sox6阳性中间神经元在慢性社交应激易感性中的富集现象 | 首次在雌性小鼠中发现Sox6中间神经元在应激诱导抑郁中的特异性作用,并揭示其与炎症反应和突触功能的关联 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 探究慢性社交应激下雌性小鼠前额叶皮层的细胞和分子变化机制 | 雌性小鼠的前额叶皮层细胞 | 神经科学 | 抑郁症 | 单核RNA测序,加权基因共表达网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性社交挫败应激模型的雌性小鼠 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 1100 | 2025-10-17 |
Advances in single-cell DNA sequencing enable insights into human somatic mosaicism
2025-Nov, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00832-3
PMID:40281095
|
综述 | 本文综述了单细胞DNA测序技术在揭示人类体细胞嵌合现象方面的最新进展 | 突破了传统单细胞DNA测序的技术瓶颈,能够解析复杂克隆模式组织的遗传景观、稀缺样本和非循环细胞的遗传特征 | NA | 探讨单细胞DNA测序技术在理解体细胞嵌合机制和疾病诊断中的应用 | 人类体细胞和组织样本 | 基因组学 | 癌症和非癌性疾病 | 单细胞DNA测序、全基因组扩增、全基因组测序 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | 单细胞DNA测序 | NA | NA |