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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1061 | 2025-11-04 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals a metastasis-associated PCSK1+ neuroendocrine subpopulation in pancreatic neuroendocrine tumors
2025-Nov, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70084
PMID:40817830
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现胰腺神经内分泌肿瘤中与转移相关的PCSK1+神经内分泌亚群 | 首次在胰腺神经内分泌肿瘤中鉴定出富含于肝转移灶的PCSK1+神经内分泌亚群,并揭示其高拷贝数变异负荷、低分化潜能和独特的转录调控特征 | 基于公开数据库的回顾性分析,样本量有限(27个样本),需要后续实验验证机制 | 探索胰腺神经内分泌肿瘤中神经内分泌细胞的异质性及其与转移的关系 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者组织样本(包括癌旁正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | 单细胞组学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 拷贝数变异分析, 伪时间轨迹分析, 转录调控网络分析, 细胞间通讯分析 | CytoTRACE2, Monocle3, SCENIC, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 27个样本(包括正常组织、原发肿瘤和肝转移灶) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1062 | 2025-11-03 |
Differentiation Trajectory of Virus-Induced Tumour Cells in Rice Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70267
PMID:40693410
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示水稻中病毒诱导肿瘤细胞的分化轨迹 | 首次构建水稻病毒感染的细胞类型特异性图谱,揭示水稻黑条矮缩病毒诱导肿瘤细胞从维管薄壁细胞分化的过程 | 仅针对水稻黑条矮缩病毒,未涵盖其他植物病毒 | 研究植物病毒感染引起的宿主细胞异常分化和发育机制 | 水稻叶片鞘细胞 | 植物病理学 | 植物病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 106,973个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1063 | 2025-11-03 |
Ki-67 in meningioma: distribution and implications
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS25438
PMID:40712166
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术解析脑膜瘤中Ki-67表达的细胞来源与分布特征及其临床意义 | 首次在单细胞水平揭示脑膜瘤中Ki-67表达的多细胞来源特征,发现不同WHO分级中Ki-67+细胞组成差异 | 样本量相对有限(32例单细胞分析),需要更大规模研究验证 | 解析脑膜瘤微环境中Ki-67表达的细胞来源、分布特征及其临床基因组学关联 | 脑膜瘤组织样本 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞数据, 基因组数据, 临床数据 | 32例脑膜瘤(单细胞分析), 448例脑膜瘤(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | CyTOF | 质谱流式细胞术(CyTOF)和单细胞RNA测序技术 |
| 1064 | 2025-11-03 |
Use of integrated spatial transcriptomics and histopathological analysis in adamantinomatous craniopharyngiomas to identify stromal cells as a new cellular source of leukemia inhibitory factor
2025-Nov-01, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS243146
PMID:40749237
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和组织病理学分析,鉴定牙釉质瘤型颅咽管瘤中基质细胞是白血病抑制因子的新细胞来源 | 首次确认牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF主要来源于肿瘤微环境基质细胞,发现基质细胞是LIF产生的新细胞来源 | 样本量相对有限(39例),需要进一步验证LIF/LIFR信号通路在肿瘤进展中的具体机制 | 研究牙釉质瘤型颅咽管瘤中LIF的空间分布、细胞来源及其生物学功能 | 39例牙釉质瘤型颅咽管瘤患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 免疫荧光分析 | NA | 转录组数据, 图像数据, 临床数据 | 39例ACP肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1065 | 2025-11-03 |
Endothelial cell-ILC3 crosstalk via the ET-1/EDNRA axis promotes NKp46+ILC3 glycolysis to alleviate intestinal inflammation
2025-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01345-z
PMID:40931105
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研究论文 | 本研究首次揭示肠道内皮细胞通过ET-1/EDNRA轴与ILC3细胞互作,促进NKp46+ILC3糖酵解代谢以缓解肠道炎症 | 首次发现肠道内皮细胞与ILC3细胞通过ET-1/EDNRA信号轴进行交流,并阐明该通路通过调控HIF-1α促进糖酵解代谢的分子机制 | NA | 探究肠道内皮细胞与ILC3细胞间的相互作用机制及其在肠道炎症调控中的作用 | 肠道内皮细胞、第3组固有淋巴细胞(ILC3)、NKp46+ILC3亚群 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞转录组分析、蛋白表达检测 | NA | 转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1066 | 2025-11-03 |
Endothelial βII Spectrin Deletion Exacerbates Inflammation and Impairs Tissue Regeneration in Ischemic-Diabetic Skin Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70103
PMID:41157851
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞βII血影蛋白在糖尿病缺血性皮肤伤口愈合中的作用机制 | 首次发现βII血影蛋白通过调节炎症反应而非血管生成影响糖尿病伤口愈合 | 研究仅使用小鼠模型和HUVECs细胞,尚未在人体组织验证 | 阐明βII血影蛋白在糖尿病伤口愈合中的分子机制 | 糖尿病小鼠模型和人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,基因敲除,组织染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1067 | 2025-11-03 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Dynamic Regulatory Mechanisms of Anther Development in Alfalfa (Medicago sativa L.)
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70276
PMID:40729546
|
研究论文 | 构建了紫花苜蓿花药首个单细胞转录组图谱,揭示了花药发育过程中的细胞类型特异性基因表达和动态调控机制 | 首次构建紫花苜蓿花药单细胞转录组图谱,发现绒毡层在四分体期的快速功能转换,鉴定出MsKIN14P、ERF3和ERF025等关键调控因子 | NA | 解析紫花苜蓿花药发育的单细胞转录景观和动态调控机制 | 紫花苜蓿花药中的各种特化细胞类型,特别是绒毡层和小孢子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1068 | 2025-11-03 |
SMAD7-mediated ferroptosis in macrophages drives osteoporosis progression: A multi-omics study
2025-Nov, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.08.021
PMID:40897147
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SMAD7介导的巨噬细胞铁死亡是骨质疏松进展的关键机制 | 首次揭示SMAD7通过调控巨噬细胞铁死亡驱动骨质疏松的分子机制,并验证SMAD7抑制剂mongersen的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和生物信息学分析,需要更多体内实验验证 | 探索巨噬细胞在骨质疏松发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 骨质疏松患者样本、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化, micro-CT | 人工神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1069 | 2025-11-03 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2025-Nov-01, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
|
综述 | 探讨单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其推动人本营养研究的潜力 | 提出将单细胞组学技术与类器官和器官芯片等先进人类衍生系统相结合,实现生理相关背景下营养-细胞相互作用的机制研究 | 存在技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进人本营养研究,揭示细胞特异性饮食反应和营养敏感通路 | 营养研究中的细胞类型特异性效应和个体间变异性 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞蛋白质组学、单细胞代谢组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 1070 | 2025-11-03 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2025-Nov-01, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序等技术系统揭示Hspa8在调节中性粒细胞浸润和活性氧产生中的关键作用 | 研究主要基于实验模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤免疫反应中的调控机制 | 缺血性脑损伤模型中的免疫细胞(T细胞、中性粒细胞、单核细胞) | 神经免疫学 | 缺血性脑损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 细胞表型数据 | 体外和体内缺血模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1071 | 2025-11-02 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
|
综述 | 总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用与发现 | 首次系统总结空间转录组学在透明细胞肾癌中的研究发现,揭示了肿瘤微环境中空间依赖的细胞互作关系 | 目前仅针对透明细胞肾癌这一亚型进行研究,缺乏其他肾癌亚型的空间转录组数据 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1072 | 2025-11-02 |
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01523-6
PMID:40399534
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序发现功能获得性PPM1D突变可减轻缺血性脑卒中,并鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在治疗方法 | 首次发现功能获得性PPM1D突变对缺血性脑卒中的保护作用,并鉴定出首个PPM1D小分子稳定剂T2755 | 仅在小鼠模型中验证T2755的治疗效果,尚未进行临床试验 | 探索PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并开发新型治疗方法 | 10,241名缺血性脑卒中患者和Ppm1d基因缺陷小鼠 | 基因组学 | 缺血性脑卒中 | 全基因组测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 集成计算建模, 虚拟筛选 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 10,241名患者和基因缺陷小鼠模型 | NA | 全基因组测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1073 | 2025-11-02 |
Systemic activation of NRF2 contributes to the therapeutic efficacy of clinically-approved KRAS-G12C anti-cancer drugs
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03162-7
PMID:40890297
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研究论文 | 研究发现临床批准的KRAS-G12C抗癌药物通过激活NRF2通路增强其治疗效果 | 首次揭示KRAS-G12C抑制剂通过靶向KEAP1半胱氨酸传感器激活NRF2通路,这是抗癌药物正向调控通常被认为是致癌基因的独特案例 | 未明确说明研究样本的具体数量和来源 | 探索异常激活的NRF2如何影响KRASG12C抑制剂的临床反应 | KRAS突变肺癌患者,特别是伴有KEAP1-NRF2通路共突变的患者 | 癌症治疗 | 肺癌 | 基因敲除,单细胞RNA测序,表面等离子共振 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1074 | 2025-11-02 |
Unraveling cellular dynamic changes in tumor evolution induced by long-term low dose-rate radiation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03128-9
PMID:40913060
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了长期低剂量率辐射诱导肿瘤细胞恶性演化的动态过程 | 首次发现长期低剂量率辐射通过ANGPTL4-SDC4配体-受体对促进肿瘤血管生成并增强细胞恶性表型 | 研究仅使用BEAS-2B细胞系,未涉及其他细胞类型或体内直接验证 | 探究长期低剂量率辐射对肿瘤细胞恶性演化的影响机制 | BEAS-2B细胞系及其辐射诱导的肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 肺癌 | scRNA-seq, FACS, 分子对接, 多重免疫组化, qRT-PCR, 免疫共沉淀 | 细胞轨迹分析, 细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 蛋白互作数据 | BEAS-2B细胞系及其辐射处理后的衍生细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1075 | 2025-11-02 |
Tool Comparison for Detecting Tumour Cells in Endometrial Cancer via Single-Cell Copy Number Variations Analysis
2025-Nov, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70932
PMID:41160707
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研究论文 | 比较四种单细胞拷贝数变异分析工具在检测子宫内膜癌细胞方面的性能 | 首次系统比较SCEVAN、CopyKAT、InferCNV和sciCNV四种工具在子宫内膜癌单细胞数据分析中的表现 | InferCNV和sciCNV无法直接预测肿瘤细胞,CNV评分分布曲线未能清晰区分恶性和非恶性细胞群体 | 评估单细胞CNV分析工具在检测子宫内膜癌细胞中的可靠性 | 子宫内膜癌细胞 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | SCEVAN, CopyKAT, InferCNV, sciCNV | 单细胞转录组数据 | 公开可用的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1076 | 2025-11-02 |
VEGF-D Protects the Lung in Neonatal Hyperoxia-induced Lung Injury
2025-Nov, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0544OC
PMID:40343859
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研究论文 | 本研究探讨VEGF-D在新生儿高氧诱导肺损伤中的保护作用及其机制 | 首次揭示肺泡成纤维细胞通过表达VEGF-D调控淋巴管生成和淋巴管结构在BPD中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 阐明VEGF-D在支气管肺发育不良发病机制中的保护作用 | 新生小鼠肺组织 | 病理生理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, 定量PCR, 基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量的小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1077 | 2025-11-02 |
Reply to 'Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma'
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01086-8
PMID:40866723
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1078 | 2025-11-02 |
Enhancing spatial transcriptomics in clear-cell renal cell carcinoma
2025-Nov, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-025-01085-9
PMID:40866724
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1079 | 2025-10-31 |
Eupatilin ameliorates spinal cord injury by inhibiting damage-associated microglia and optimizing the regenerative microenvironment
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113687
PMID:41146716
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现损伤相关小胶质细胞在急性脊髓损伤中的关键作用,并证实黄岑素能促进其向稳态小胶质细胞转化 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据识别急性脊髓损伤特异性损伤相关小胶质细胞亚群,并发现黄岑素促进其向有益表型转化的新功能 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,尚未在更大型动物或临床样本中验证 | 探索脊髓损伤中小胶质细胞的动态变化及黄岑素的治疗机制 | C57BL/6小鼠脊髓挫伤模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1080 | 2025-10-31 |
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501990R
PMID:41160086
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习技术,开发了一个多模态框架来预测非小细胞肺癌患者对免疫治疗的应答 | 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习相结合,通过堆叠集成学习方法识别树突状细胞亚型与免疫治疗应答的关联 | 样本量相对有限,需要在更大规模队列中验证模型的泛化能力 | 预测非小细胞肺癌患者对PD-1抑制剂免疫治疗的应答 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本和影像数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 影像组学, 深度学习 | LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习 | 转录组数据, 临床数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |