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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1001 | 2025-11-07 |
Multiomics analysis reveals the genetic and epigenetic features of high-risk NK cell-type chronic active EBV infection
2025-Nov-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024026805
PMID:40737598
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示高危NK细胞型慢性活动性EBV感染的遗传和表观遗传特征 | 首次通过综合多组学分析鉴定出NK细胞型CAEBV的CIMP亚型,并发现其与NK/T细胞淋巴瘤相似的DNA甲基化模式 | 样本量相对有限(65例患者),需要更大规模研究验证 | 探索慢性活动性EBV感染的分子机制和潜在治疗方法 | 65例慢性活动性EBV感染患者 | 生物医学 | 慢性活动性EBV感染 | 基因组学、转录组学、表观基因组学、单细胞转录组学、表面蛋白质组学 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据、单细胞数据 | 65例CAEBV患者 | NA | 单细胞转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 1002 | 2025-11-07 |
Stromal Cell-Mast Cell Communication Orchestrates Anti-Viral Immunity in the Meninges
2025-Nov-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514842
PMID:41195564
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜中肥大细胞通过与基质细胞通讯在抗病毒免疫中的关键作用 | 首次发现肥大细胞在脑膜血管周围的分布模式及断奶后成熟过程,并阐明IL-33受体介导的基质细胞-肥大细胞通讯机制 | NA | 探究肥大细胞在脑膜抗病毒免疫中的功能和作用机制 | 脑膜肥大细胞和基质细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1003 | 2025-11-07 |
Hair follicle stem cell fate supports distinct clinical endotypes in hidradenitis suppurativa
2025-Nov-06, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70152
PMID:41195937
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了毛囊干细胞在化脓性汗腺炎早期发病机制中的两种不同分化轨迹,并基于临床表型定义了三种疾病内型 | 首次发现毛囊干细胞存在两种不同的分化轨迹,分别与炎症和角化相关,并基于此定义了三种临床内型 | 样本量相对有限(49例患者),且仅分析了病灶周围皮肤 | 研究毛囊干细胞命运在化脓性汗腺炎早期发病机制中的作用 | 化脓性汗腺炎患者和健康捐赠者的毛囊细胞 | 单细胞生物学 | 化脓性汗腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 49例HS患者和健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1004 | 2025-11-07 |
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2025-Nov-06, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70154
PMID:41195968
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示莫格利珠单抗相关皮疹中抗淋巴瘤免疫反应的分子特征 | 首次在单细胞水平揭示MAR中残留恶性T细胞克隆的沉默状态及抗肿瘤免疫微环境特征 | 样本量较小(MAR组4例,CTCL组6例,健康对照组4例) | 对莫格利珠单抗相关皮疹进行全面的分子特征分析 | 皮肤活检样本(来自MAR患者、未经治疗的CTCL患者和健康对照) | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例皮肤活检(4例MAR,6例CTCL,4例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1005 | 2025-11-07 |
CD103-Positive Tumor-Infiltrating Lymphocytes Predict a Favorable Prognosis in Colorectal Cancer with Liver Metastasis
2025-Nov-06, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-17977-4
PMID:41196535
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研究论文 | 本研究探讨CD103+肿瘤浸润淋巴细胞在结直肠癌肝转移中的空间分布特征及其预后价值 | 首次系统揭示CD103+TILs在结直肠癌原发灶和肝转移灶中的空间分布异质性及其不同的预后意义 | 样本量相对有限(84例患者),且为回顾性研究设计 | 阐明CD103+肿瘤浸润淋巴细胞在结直肠癌肝转移中的临床意义和功能特征 | 84例同时接受原发结直肠癌和肝转移灶手术切除的患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 免疫组织化学,多重免疫荧光分析,单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 组织切片图像,基因表达数据 | 84例患者(包含原发肿瘤和肝转移灶配对样本) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1006 | 2025-11-07 |
TransGRN: a transfer learning-based framework for inferring gene regulatory networks across cell lines
2025-Nov-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的跨细胞系基因调控网络推断框架TransGRN | 采用跨细胞系预训练策略,结合多源细胞系scRNA-seq数据与大型语言模型获取的生物学知识,整合基因表达谱与语义信息 | NA | 解决目标细胞类型调控数据稀缺情况下的基因调控网络推断问题 | 跨细胞系的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习, 大型语言模型 | 基因表达数据, 语义信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1007 | 2025-11-07 |
Rapid clonal selection within early hematopoietic cell compartments presages outcome to ivosidenib combination therapy
2025-Nov-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027948
PMID:41191518
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了ivosidenib联合疗法在IDH1突变髓系肿瘤患者中早期克隆选择的动力学特征 | 首次结合高灵敏度单细胞基因分型和单细胞RNA测序技术,在治疗早期识别出具有复发风险的克隆选择过程 | 样本量较小(仅8例患者),需要更大规模研究验证 | 探究靶向治疗中克隆选择的动力学特征和分子机制 | 8例IDH1突变髓系肿瘤患者 | 单细胞组学 | 髓系肿瘤 | 单细胞基因分型, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1008 | 2025-11-07 |
From Gene to Scar: Proteome-Wide Causal Insights into Keloid Pathogenesis and Prevention
2025-Nov-05, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918251387987
PMID:41192836
|
研究论文 | 通过大规模孟德尔随机化研究和单细胞RNA测序分析,系统评估血浆蛋白及生活方式因素对瘢痕疙瘩发病风险的因果影响 | 首次建立多层因果推断框架,整合蛋白质组学、表型组学和单细胞转录组学数据,在单细胞分辨率上验证RSPO3作为瘢痕疙瘩致病因子 | 研究样本量相对有限,仅包含30名患者的单细胞数据 | 识别瘢痕疙瘩的新型治疗靶点和可改变风险因素 | 瘢痕疙瘩患者和4,907种血浆蛋白及8,155种生活方式相关特征 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,中介分析 | 因果推断模型 | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 30名患者的194,366个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1009 | 2025-11-07 |
Notch signaling is a driver of glandular stem cell activity and regenerative migration after damage
2025-Nov-05, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00607-w
PMID:41193641
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了Notch信号在腺体干细胞自我更新和损伤后迁移修复中的核心调控作用 | 首次整合单细胞RNA测序和批量ATAC/RNA测序系统解析腺体器官干细胞的调控机制,并证实Notch信号在多种腺体组织再生中的保守功能 | 主要基于小鼠模型和类器官系统,人体验证数据有限 | 探索腺体器官干细胞的调控机制及其在组织再生中的作用 | 小鼠唾液腺类器官、唾液腺组织、鼠源及患者来源的唾液腺、乳腺和甲状腺类器官 | 单细胞生物学 | 腺体疾病 | 单细胞RNA测序, 批量ATAC测序, 批量RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 多种腺体类器官模型和辐射损伤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量ATAC-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1010 | 2025-11-07 |
Macrophage-Targeted Magnesium Ion-Nourisher for NLRP3 Inflammasome Inhibition to Enhance Liver Inflammatory Disease Treatment
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513798
PMID:41194407
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研究论文 | 开发了一种靶向巨噬细胞的镁离子营养剂,通过抑制NLRP3炎症小体激活来增强肝脏炎症疾病治疗 | 利用巨噬细胞的胞葬作用设计纳米级镁离子靶向递送系统,首次揭示细胞内镁离子对NLRP3炎症小体的抑制作用 | 镁离子的免疫调节机制尚未完全阐明,且对多种细胞具有广泛影响 | 开发靶向巨噬细胞的镁离子递送策略以治疗肝脏炎症疾病 | 巨噬细胞、Kupffer细胞、肠道屏障 | 生物医学工程 | 肝脏炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1011 | 2025-11-07 |
Stress-Induced Activation of Prolactin-NR4A1-Midkine Axis Exacerbates Skin Inflammation
2025-Nov-05, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509679
PMID:41194398
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研究论文 | 本研究揭示了压力通过催乳素-NR4A1-中期因子轴加剧皮肤炎症的新机制 | 首次发现压力通过催乳素激活真皮上层APCDD1成纤维细胞中的NR4A1-中期因子轴,从而放大皮肤炎症反应 | NA | 阐明压力加剧皮肤炎症的分子机制 | 人类银屑病患者、小鼠皮肤炎症模型 | 单细胞转录组学 | 皮肤炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、血浆样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1012 | 2025-11-07 |
HMGB3 promotes brain metastasis of lung adenocarcinoma by recruiting SSBP1 for nuclear translocation to remodel mitochondrial metabolism
2025-Nov-05, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70075
PMID:41194553
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研究论文 | 本研究揭示了HMGB3通过招募SSBP1进行核转位重塑线粒体代谢,从而促进肺腺癌脑转移的分子机制 | 首次发现HMGB3通过招募SSBP1诱导其核转位,重编程线粒体代谢,激活PI3K-Akt信号通路促进肺腺癌脑转移的新机制 | 研究主要基于细胞模型和回顾性队列,需要更多前瞻性临床研究验证 | 探究HMGB3在调控肿瘤细胞代谢促进肺腺癌脑转移中的作用 | 肺腺癌细胞、临床肺腺癌患者组织样本 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫共沉淀, 质谱分析, Western blotting, 功能获得与缺失实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据, 临床病理数据 | 两个回顾性队列:原发性肺腺癌队列和肺腺癌脑转移队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1013 | 2025-11-07 |
A Single-cell and Spatially Resolved Cell Atlas of Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf095
PMID:41191515
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术构建了人类食管鳞状细胞癌的单细胞和空间分辨率细胞图谱 | 首次系统揭示了COL17A1+上皮细胞和POSTN+成纤维细胞亚群在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用及其相互作用机制 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌免疫抑制微环境的分子特征和机制 | 人类食管鳞状细胞癌及匹配的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学 | NA | 单细胞RNA序列数据,空间转录组数据,代谢组数据 | 一系列人类食管鳞状细胞癌及匹配非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 1014 | 2025-11-07 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进肝细胞脂质积累和代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡通过S100A8+巨噬细胞-CCN3-CD36轴驱动肝脏脂肪变性的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究脂肪细胞死亡如何促进肝脏脂肪积累和MASLD进展 | 基因修饰小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 1015 | 2025-11-07 |
Elucidating the role of SIRT2 in hepatocellular carcinoma through multi-omics and deep learning
2025-Nov-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03879-0
PMID:41182638
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和深度学习探讨SIRT2在肝细胞癌中的作用机制 | 首次结合铜死亡机制、单细胞测序、空间转录组和深度学习生存神经网络构建肝细胞癌预后模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需实验验证 | 阐明SIRT2在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌组织样本和相关的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA测序, 深度学习 | DeepSurv神经网络 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1016 | 2025-11-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
|
研究论文 | 本研究探讨了18q染色体缺失如何通过改变TGFβ信号通路影响人胚胎干细胞中前后神经外胚层命运决定 | 首次揭示了18q缺失通过干扰TGFβ信号通路导致前后神经外胚层命运决定失衡的具体机制 | 研究仅针对体外培养的干细胞模型,未验证在体内环境中的表现 | 探究染色体异常对人多能干细胞分化潜能的影响机制 | 人胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达时序分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 具有复杂核型的人胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1017 | 2025-11-07 |
Long-read RNA sequencing of transposable elements from single cells using CELLO-seq
2025-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01203-2
PMID:40670609
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研究论文 | 开发了一种名为CELLO-seq的单细胞长读长RNA测序协议,用于精确映射转座元件的表达 | 通过整合50个核苷酸的独特分子标识符和高PCR重复数,实现了长读长的错误校正,能够将表达数据高保真地映射到高度序列相似的年轻转座元件 | 需要用户具备分子生物学和转录组分析经验 | 开发能够精确映射转座元件表达的单细胞测序方法 | 哺乳动物转座元件 | 单细胞测序 | NA | 长读长RNA测序,单细胞测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | CELLO-seq | 整合50个核苷酸独特分子标识符和高PCR重复数的单细胞长读长RNA测序协议 |
| 1018 | 2025-11-07 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
|
研究论文 | 通过回顾性转录组分析研究体积性肌肉损失损伤后线粒体基因和代谢通路的时序性失调 | 首次利用现有RNA-seq数据集系统分析VML损伤后不同时间点的线粒体基因表达和代谢通路变化 | 研究为回顾性分析,依赖公开数据集,缺乏实验验证 | 探究体积性肌肉损失损伤后线粒体和代谢转录组的变化规律 | 大鼠和小鼠的肌肉组织 | 转录组学 | 肌肉损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因集富集分析 | NA | 转录组数据 | 包含bulk RNA-seq数据集(大鼠)和单细胞RNA-seq数据集(小鼠) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1019 | 2025-11-07 |
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70018
PMID:40044625
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研究论文 | 本研究探讨miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡、炎症和氧化应激在骨关节炎中的作用机制 | 首次发现miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡参与骨关节炎发病机制 | 铁死亡在OA中的具体作用和机制仍需进一步研究 | 探索骨关节炎的新型治疗策略 | C28/I2细胞、miR-140-3p、CILP蛋白、铁死亡相关基因 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 细胞系研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1020 | 2025-11-07 |
Current trends in single-cell RNA sequencing applications in diabetes mellitus
2025-Nov, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70061
PMID:40537978
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新进展和应用 | 聚焦单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新应用趋势 | NA | 探索糖尿病发病机制并寻求新的诊断和治疗方法 | 人类胰岛细胞和免疫细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |