单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202511-202511] [清除筛选条件]
当前共找到 925 篇文献,本页显示第 81 - 100 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-04-28
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Neutrophil Clusters Associated with Autoimmune Neuroinflammation
2025-Nov-19, Research square
研究论文 利用单细胞RNA测序揭示与自身免疫性神经炎症相关的中性粒细胞亚群 首次通过单细胞RNA测序技术,在实验性自身免疫性脑脊髓炎模型中揭示了中性粒细胞的异质性及其在脑靶向自身免疫炎症中的致病性,并发现Saa3/SAA1作为潜在的生物标志物和治疗靶点 研究基于小鼠模型,其向人类多发性硬化症的转化应用需要进一步验证 阐明中性粒细胞在自身免疫性神经炎症中的致病机制及寻找潜在生物标志物和治疗靶点 中性粒细胞,特别是髓系细胞和中性粒细胞中SOCS3缺陷的小鼠模型 免疫学与神经科学 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 小鼠小脑和脊髓的中性粒细胞,包括初始状态和实验性自身免疫性脑脊髓炎模型,以及人类多发性硬化症患者血浆样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
82 2026-04-28
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Nov-06, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 通过将人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞整合到心脏类器官中,构建出人心脏-巨噬细胞组装体模型,用于模拟免疫-心脏相互作用和心律失常疾病建模 首次利用自体人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞与心脏类器官整合,生成具有生理相关性的胚胎组织驻留巨噬细胞,并长期维持以促进心脏发生 未明确提及 研究心脏组织驻留巨噬细胞在心脏发育和心律失常疾病中的功能及机制 人类心脏-巨噬细胞组装体模型及心脏驻留巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 类器官模型 单细胞转录组数据、活体成像数据、蛋白质组数据 未明确提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
83 2026-04-28
Microvascular Endothelial Cells License APS Vasculopathy Through YAP1- and CCN2-Mediated Signaling
2025-Nov-04, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了抗磷脂综合征(APS)中微血管内皮细胞通过YAP1和CCN2介导的信号通路促进血管病变的机制 首次通过单细胞RNA测序鉴定出APS患者皮肤微血管内皮细胞中CCN1和CCN2表达增高,并阐明YAP1-CCN2信号轴在介导内皮细胞与血管平滑肌细胞间的促增殖通讯中的关键作用 未能在摘要中明确指出研究局限性 阐明APS血管病变的细胞和分子机制,寻找潜在治疗靶点 抗磷脂综合征(APS)患者及其微血管内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、免疫荧光显微镜、ELISA、定量PCR、免疫印迹 NA 图像、文本 APS患者的皮肤活检样本、肾脏活检样本以及血浆样本;健康人真皮微血管内皮细胞培养;小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
84 2026-04-27
SPP1 + macrophage and Treg interaction mediates immunosuppression and adverse survival in HER2 + breast cancer
2025-Nov-26, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 利用单细胞转录组数据和空间转录组学揭示SPP1+巨噬细胞与Treg细胞相互作用如何介导HER2+乳腺癌免疫抑制和不良预后 首次在HER2+乳腺癌中鉴定出SPP1+巨噬细胞通过CD86-CTLA4轴增强Treg免疫抑制功能,并利用空间转录组学验证其促肿瘤机制 NA 阐明SPP1+巨噬细胞在HER2+乳腺癌中的促肿瘤能力及其分子机制,寻找新的治疗靶点 健康乳腺组织和HER2+乳腺癌组织中的细胞亚群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据 包含健康乳腺组织和新辅助治疗前后HER2+乳腺癌样本的批量转录组数据集及独立内部患者队列 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE
85 2026-04-25
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Nov, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1
研究论文 通过深度学习从H&E染色组织图像推断虚拟RNA表达,揭示结直肠癌转移相关通路 首次在大规模结直肠癌空间转录组数据集上训练虚拟RNA推断模型,利用多种先进深度学习架构实现从常规H&E图像推断近细胞分辨率的空间基因表达,无需进行昂贵的空间转录组实验 某些肿瘤相关通路无法完全通过组织学图像捕获,模型对‘组织学相关’通路的推断效果较好但对其他通路覆盖有限 开发并验证一种从常规H&E染色图像推断空间转录组水平分子信息的方法,用于大规模流行病学研究中肿瘤微环境表征和预后评估 结直肠癌患者的原发肿瘤组织样本及其对应H&E染色图像和空间转录组数据 数字病理学 结直肠癌 HE染色成像,空间转录组测序,虚拟RNA推断 UNI,ResNet-50,视觉Transformer,Vision Mamba 组织图像,基因表达数据 45名结直肠癌患者的超过30万个Visium斑点 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
86 2026-04-25
Deciphering genetic associations with blood pressure in peripheral blood mononuclear cells through single-cell transcriptomic profiling
2025-11, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension IF:4.3Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析,解析外周血单核细胞中与血压相关的遗传关联 利用单细胞转录组测序结合全基因组关联研究和孟德尔随机化方法,在免疫细胞亚型中识别与血压相关的候选基因,并发现ERAP2在CD8+ T细胞和自然杀伤细胞中的显著失调 样本量较小(10个个体用于测序,8个个体用于验证),可能限制结果的泛化性 鉴定与血压相关的免疫细胞特异性功能基因 外周血单核细胞中的免疫细胞亚型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 10个个体(111,694个细胞)用于测序,8个个体(28,919个细胞)用于验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
87 2026-04-25
Myocardial reprogramming by HMGN1 underlies heart defects in trisomy 21
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文鉴定出HMGN1基因是21三体综合征(唐氏综合症)相关先天性心脏缺陷的关键驱动因子 首次将HMGN1鉴定为21号染色体上影响房室管发育的剂量敏感基因,并通过单细胞转录组学、CRISPR激活筛选和动物模型验证其致病机制 研究主要依赖人诱导多能干细胞和转基因小鼠模型,可能需要更多临床样本验证结果 阐明21三体综合征中先天性心脏缺陷的遗传机制 人诱导多能干细胞来源的心肌细胞、唐氏综合症转基因小鼠模型 数字病理学、机器学习 唐氏综合症、先天性心脏缺陷 单细胞转录组学、CRISPR激活筛选、CROP-seq 单细胞RNA测序、CRISPR激活筛选 基因表达数据 人诱导多能干细胞系、小鼠胚胎心脏样本(具体数量未在摘要中明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' RNA测序、CROP-seq筛选
88 2026-04-21
Tracking clonal evolution during treatment in ovarian cancer using cell-free DNA
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究开发了CloneSeq-SV方法,结合单细胞全基因组测序和靶向深度测序,利用克隆特异性结构变异追踪卵巢癌治疗过程中的克隆演化 利用肿瘤克隆特异性结构变异作为高灵敏内源性cfDNA标志物,实现治疗过程中共存克隆群体的相对丰度测量和进化分析 研究样本量有限(18例患者),且主要针对高级别浆液性卵巢癌,可能不适用于其他癌症类型 研究高级别浆液性卵巢癌治疗过程中耐药性的克隆演化机制 高级别浆液性卵巢癌患者 基因组学 卵巢癌 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 NA 基因组DNA,细胞游离DNA,RNA 18例患者 NA 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 NA NA
89 2026-04-19
A parabrachial hub for need-state control of enduring pain
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学、神经操控、活动记录和计算建模,揭示了表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元在长期持续性疼痛中的关键作用,并发现饥饿、口渴或捕食者信号能通过释放NPY抑制这些神经元,从而缓解疼痛 首次识别出臂旁核中表达Y1受体的神经元作为内源性镇痛枢纽,并证明其活动能预测功能应对行为,且多种生理需求状态(如饥饿、口渴)能通过NPY释放抑制这些神经元以缓解持续性疼痛 NA 探究慢性疼痛条件下持续性疼痛的中枢机制,特别是组织愈合后疼痛信号的调控 表达神经肽Y受体Y1的臂旁核神经元及其在疼痛和生理需求状态下的活动 神经科学 慢性疼痛 空间转录组学、神经操控、活动记录、计算建模 NA 转录组数据、神经活动数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
90 2026-04-17
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序数据,识别骨关节炎相关基因并预测潜在治疗药物 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别OA关键基因,并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物作用 研究主要基于生物信息学预测和斑马鱼模型,需进一步在哺乳动物或临床样本中验证 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 骨关节炎相关基因和候选药物 生物信息学 骨关节炎 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR 随机森林, 网络分析 基因表达数据 从GEO数据库获取的scRNA-seq和bulk-RNA seq数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
91 2026-04-15
Gain-of-function PPM1D mutations attenuate ischemic stroke
2025-Nov, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 本文通过全基因组测序发现PPM1D基因的功能获得性突变可减轻缺血性脑卒中损伤,并揭示了其通过PPARα通路影响内皮细胞脂肪酸代谢的机制,同时鉴定出小分子稳定剂T2755作为潜在疗法 首次在缺血性脑卒中患者中鉴定出PPM1D基因的功能获得性突变具有保护作用,并发现小分子化合物T2755可通过稳定PPM1D蛋白减轻脑损伤 研究样本中PPM1D突变携带者仅8例,样本量较小;机制研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接验证有限 探究PPM1D基因在缺血性脑卒中中的作用机制并寻找潜在治疗策略 缺血性脑卒中患者(人类)和Ppm1d基因缺陷小鼠(动物模型) 基因组学与分子机制研究 缺血性脑卒中 全基因组测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 NA 基因组测序数据,转录组数据,蛋白质组数据 10,241名缺血性脑卒中患者(其中8例携带PPM1D突变)及Ppm1d缺陷小鼠模型 NA 全基因组测序,空间转录组学 NA NA
92 2026-04-15
Mechanical confinement governs phenotypic plasticity in melanoma
2025-11, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过斑马鱼模型和人类样本,揭示了机械限制通过染色质重塑介导黑色素瘤细胞表型可塑性转换的机制 首次证明机械限制通过HMGB2蛋白介导的染色质重塑驱动黑色素瘤细胞在增殖与侵袭状态间的可逆转换 研究主要基于斑马鱼模型,人类样本验证相对有限,且机械限制的具体物理参数尚未完全量化 探究黑色素瘤细胞表型可塑性转换的外部触发机制 黑色素瘤细胞(斑马鱼模型及人类样本) 癌症生物学 黑色素瘤 空间转录组学、单细胞转录组学、形态学分析、定量建模 NA 转录组数据、形态学图像 斑马鱼黑色素瘤模型及人类肿瘤样本(具体数量未明确) NA 空间转录组学, 单细胞转录组学 NA NA
93 2026-04-12
Dual-modality Molecular Cartography: Integrating Multiplex mRNA Detection with Protein Imaging Mass Cytometry
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种整合多重mRNA检测与蛋白质成像质谱流式技术的双模态分子图谱方法,用于同时分析组织切片中的蛋白质和mRNA 创新性地将蛋白质成像质谱流式技术与mRNA原位杂交结合,利用金属探针系统避免了荧光光谱溢出和组织自发荧光问题 NA 开发一种能够同时检测蛋白质和mRNA的空间解析技术,以更好地理解细胞在微环境中的通讯机制 组织切片中的蛋白质和mRNA分子 数字病理学 NA mRNA原位杂交,蛋白质成像质谱流式技术 NA 图像,分子表达数据 NA NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 基于金属探针的检测系统
94 2026-04-12
Microfluidics-based High-throughput Circulating Tumor Cell Sorting and Single-cell Sequencing Technology
2025-11-14, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文介绍了一种集成了微流控技术的高通量循环肿瘤细胞分选与单细胞测序平台 提出了一种集CTC富集、纯化和单细胞测序于一体的统一微流控工作流程,采用动态控制磁捕获、涡旋混合和基于流阻差异的高精度单细胞捕获芯片,克服了传统方法回收率低、工作流程繁琐和污染风险高的问题 未在摘要中明确提及具体局限性 开发一种高效、高通量的循环肿瘤细胞分选与单细胞测序技术,以克服现有方法的不足 循环肿瘤细胞 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
95 2026-04-10
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Nov-14, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过比较血浆蛋白质组学和单细胞转录组学,描述了HIV-1治疗停止后病毒反弹前的免疫反应特征 发现病毒反弹前CD16++单核细胞显著增加并具有增强的抗病毒基因表达,以及血浆中炎症蛋白在可检测反弹后出现 研究样本可能有限,且未详细探讨长期临床影响或治疗策略的具体验证 识别治疗停止后病毒反弹前的早期信号,以延长病毒反弹时间并治愈HIV-1 外周血单个核细胞和血浆样本 单细胞转录组学 HIV-1感染 单细胞转录组学, 血浆蛋白质组学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-04-04
Altered Epithelial-Mesenchymal Progenitor States Lead to Matrix Deposition, Tissue Inflammation, and Transitional Epithelial State in Congenital Diaphragmatic Hernia
2025 Nov-Dec, Fetal and pediatric pathology IF:0.7Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了先天性膈疝肺中上皮-间质祖细胞状态的改变,导致基质沉积、组织炎症和上皮细胞过渡状态 首次在先天性膈疝模型中利用单细胞RNA测序技术系统性地分析了间质祖细胞的异常状态及其对上皮-间质转化动态的破坏作用 研究仅基于大鼠模型,尚未在人类样本中验证,且样本量相对有限 探究先天性膈疝肺发育异常的分子机制,特别是上皮-间质祖细胞状态改变对肺发育的影响 正常和先天性膈疝胎鼠肺组织(E17、E19、E21时间点) 单细胞组学 先天性膈疝 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 正常和CDH胎鼠肺组织(E17、E19、E21三个发育阶段) NA 单细胞RNA-seq NA NA
97 2026-04-04
Single-Cell Analysis of L-Myc Expressing Neural Stem Cells and Their Extracellular Vesicles Revealed Distinct Progenitor Populations With Neurogenic Potential
2025-Nov, Journal of extracellular biology
研究论文 本研究通过单细胞分析,表征了表达L-MYC基因的人类胎儿神经干细胞系及其细胞外囊泡,揭示了它们具有神经保护潜力,并探讨了在化疗诱导的神经毒性模型中的应用 首次对表达L-MYC的神经干细胞系及其细胞外囊泡进行单细胞转录组和蛋白质组学表征,揭示了它们在神经保护方面的差异和潜力 研究未能成功挽救少突胶质祖细胞,表明需要重复或补充性干预来恢复少突胶质细胞群 表征治疗相关的人类胎儿神经干细胞系及其细胞外囊泡,以促进脑修复和对抗化疗诱导的神经毒性 人类胎儿神经干细胞系LMNSC01和LMNSC02,以及它们释放的细胞外囊泡 单细胞分析 神经毒性 单细胞RNA测序,单细胞外囊泡纳米显微镜技术,蛋白质组学分析 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,显微镜图像 两个人类胎儿神经干细胞系(LMNSC01和LMNSC02)及其细胞外囊泡 NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-04-02
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2025-Nov-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文系统性地比较了三种商业成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能 首次在包含多种肿瘤和正常组织的组织微阵列上,对10X Xenium、Vizgen MERSCOPE和Nanostring CosMx三种iST平台进行综合技术性能与生物性能基准测试 研究仅基于组织微阵列的连续切片,可能未完全反映实际临床应用中的组织异质性,且平台比较受限于匹配基因集 评估和比较不同成像空间转录组学平台在FFPE组织中的性能,为研究者在珍贵样本研究中提供方法选择指导 包含17种肿瘤和16种正常组织类型的组织微阵列的连续切片 空间转录组学 多种肿瘤 成像空间转录组学 NA 空间转录组数据 组织微阵列包含33种组织类型(17种肿瘤和16种正常) 10X Genomics, Vizgen, Nanostring 成像空间转录组学 10X Xenium, Vizgen MERSCOPE, Nanostring CosMx 商业成像空间转录组学平台应用于FFPE组织切片
99 2026-04-01
Pancreatic hypersecretion of amyloid-forming human amylin dysregulates the neuro-immune axis and B cell development in a model of type-2 diabetes
2025-11, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究探讨了2型糖尿病中胰腺过度分泌的人胰淀素如何通过影响外周和神经免疫反应,特别是B细胞发育,导致免疫失调和神经退行性变化 首次揭示了人胰淀素在2型糖尿病中通过下调脑血管ICAM-1和上调B细胞CXCR4表达,导致免疫细胞迁移减少和B细胞发育缺陷,并发现CXCL12/CXCR4信号轴作为潜在治疗靶点 研究主要基于转基因动物模型,人类数据仅通过单细胞测序初步验证,慢性暴露机制和临床转化需进一步探索 探究2型糖尿病中胰腺人胰淀素积累如何影响外周和神经免疫反应,特别是与认知衰退和神经退行性变相关的机制 转基因大鼠和小鼠模型,以及2型糖尿病患者的单细胞测序数据 免疫学与神经科学交叉研究 2型糖尿病 单细胞测序,转基因动物模型,免疫细胞分析 转基因动物模型(大鼠和小鼠) 基因表达数据,免疫细胞计数数据 转基因大鼠和小鼠模型,以及2型糖尿病患者单细胞测序样本(具体数量未明确) NA 单细胞测序 NA NA
100 2026-03-29
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
综述 本文综述了结直肠癌共识分子分型(CMS)的分类、预后预测作用、识别方法及其在指导个体化治疗中的应用与挑战 系统总结了基于基因表达谱、免疫组化(IHC)和基于深度学习的图像分类器(imCMS)等多种CMS识别方法,并探讨了利用单细胞RNA测序解决肿瘤内异质性(ITH)等新兴策略 肿瘤内异质性(ITH)和技术障碍阻碍了CMS分类在临床中的广泛采用 回顾CMS分类在结直肠癌中的预后和预测作用,评估其指导个体化治疗的潜力,并探讨临床应用的障碍与解决方案 结直肠癌(CRC)及其共识分子亚型(CMS1-4) 数字病理学 结直肠癌 基因表达谱分析,免疫组化(IHC),单细胞RNA测序,基于计算模型的图像分类(如深度学习) 深度学习 基因表达数据,组织图像 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部