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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
81 2026-01-04
Analysis of clinical, single cell, and spatial data from the Human Tumor Atlas Network (HTAN) with massively distributed cloud-based queries
2025-Nov-17, Research square
研究论文 本文介绍了人类肿瘤图谱网络(HTAN)开发的基于云的基础设施,用于整合和分析大规模、多模态的癌症数据 引入了两个关键创新:基于来源的HTAN ID表简化了队列构建和跨检测整合;以及将BigQuery的地理空间功能创新性地应用于空间生物学,实现了肿瘤微环境的邻域和相关性分析 未明确提及具体的技术或应用限制 开发一个基于云的基础设施,以降低整合和分析大规模、多模态癌症数据的技术和计算障碍 人类肿瘤图谱网络(HTAN)生成的多模态癌症数据,包括单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像数据以及临床数据 生物信息学 癌症 单细胞转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 单细胞数据、空间数据、临床数据、图像数据 NA Google 单细胞RNA-seq、空间转录组学 Google BigQuery 基于Google BigQuery的云基础设施,托管于系统生物学研究所癌症云网关(ISB-CGC)
82 2026-01-03
Tissue-Resident Memory T Cells in Rheumatoid Immune Diseases: Pathogenic Mechanisms and Therapeutic Strategies
2025-Nov-30, Biomedicines IF:3.9Q1
综述 本文综述了组织驻留记忆T细胞在类风湿性免疫疾病中的致病机制及靶向治疗策略 系统性地总结了T细胞在多种自身免疫病中的疾病特异性致病机制,并批判性地评估了靶向T细胞的新型治疗策略,提出了结合空间转录组学、类器官模型和人工智能的未来精准医学方向 NA 阐明组织驻留记忆T细胞在类风湿性免疫疾病中的致病作用并探讨其作为治疗靶点的潜力 类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、原发性干燥综合征等类风湿性免疫疾病 NA 类风湿性免疫疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
83 2026-01-03
Decoding epithelial-T cell interactions in colorectal cancer through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Nov-28, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,解码了结直肠癌中上皮细胞与T细胞之间的相互作用 首次结合单细胞和空间转录组学技术,系统揭示了结直肠癌中上皮细胞与T细胞亚群的空间通信网络和共定位模式 样本量相对较小(36例患者),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 解析结直肠癌肿瘤微环境中上皮细胞与T细胞的相互作用机制 结直肠癌患者的上皮细胞和T细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 Seurat, Harmony, CytoTRACE, Slingshot, CellChat, CellTrek 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 36例结直肠癌患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
84 2026-01-03
Single-Cell Transcriptomics of Human Acute Myocardial Infarction Reveals Oxidative Stress-Associated Cardiomyocyte Subpopulations and Candidate Predictive Signatures
2025-Nov-28, Antioxidants (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组数据,揭示了急性心肌梗死患者心肌细胞中氧化应激异质性,并识别出高氧化应激亚群及其核心标志基因 首次在人类急性心肌梗死心肌细胞中识别出高氧化应激亚群,该亚群表现出独特的代谢激活-免疫抑制特征和细胞可塑性,并利用机器学习框架鉴定了五个核心预测标志基因 研究基于整合数据集,样本量相对有限,且为观察性研究,需要进一步功能验证 探究急性心肌梗死后心肌细胞氧化应激异质性及其适应性机制 人类心肌细胞 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA-seq 机器学习(集成六种算法) 单细胞转录组数据 64,510个心肌细胞,来自五个整合数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
85 2026-01-03
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Develops a Glutamine Metabolism-Based Prognostic Model and Identifies MSMO1 as a Therapeutic Target in Osteosarcoma
2025-Nov-28, Biomolecules IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序与批量队列数据,开发了一个基于谷氨酰胺代谢的预后模型,并鉴定MSMO1作为骨肉瘤的治疗靶点 首次在骨肉瘤中建立了基于谷氨酰胺代谢的患者分层框架,结合单细胞与机器学习分析,开发了外部验证的预后模型,并揭示了MSMO1在代谢信号传导中的关键作用 模型的区分能力中等,需要进一步的机制和体内研究验证 开发基于谷氨酰胺代谢的骨肉瘤预后模型并识别治疗靶点 骨肉瘤患者样本和U2OS细胞系 机器学习 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 机器学习 Step-Cox [forward] + Ridge RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及单细胞和批量队列数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
86 2026-01-03
Exploratory Single-Cell Transcriptomic Profiling Reveals Dysregulated Glial Populations and Pathways in Focal Cortical Dysplasia Epilepsy
2025-Nov-27, Biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序技术,探索了局灶性皮质发育不良癫痫中神经胶质细胞的分子变化 首次在单细胞分辨率下揭示了FCD II型患者皮质组织中神经胶质细胞(小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞)的组成重塑和共享的分子通路失调,特别是发现了RAC1上调和ATP5F1D下调等共同变化 样本量较小(仅1例FCD患者和1例对照),属于探索性研究,结论需要更大样本验证 探究局灶性皮质发育不良(FCD)导致耐药性癫痫的细胞特异性发病机制 局灶性皮质发育不良II型患者的皮质组织及匹配对照 单细胞转录组学 癫痫(局灶性皮质发育不良相关) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Seurat工作流程(用于细胞聚类、注释和差异表达基因分析) 单细胞转录组数据 2例(1例FCD II型患者,1例匹配对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
87 2026-01-03
Differential regulation of 5-lipoxygenase and leukotriene-C4-synthase expression by IFNγ, IL-4 and IL-13 in human monocytes and macrophages from patients with atopic dermatitis
2025-Nov-26, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验,探讨了IFNγ、IL-4和IL-13对特应性皮炎患者单核细胞和巨噬细胞中5-脂氧合酶和白细胞三烯C4合酶表达的差异调控 首次在单细胞水平分析特应性皮炎皮损中5-LO/ALOX5和LTC4S mRNA表达,并揭示Th1和Th2细胞因子对这两个酶在单核细胞和巨噬细胞中的相反调控作用 研究主要基于体外实验和已有scRNA-seq数据的再分析,缺乏体内功能验证,样本来源包括匿名捐赠者,可能影响结果的一致性 探究特应性皮炎中CysLTs生物合成关键酶的表达调控机制,以理解炎症介质在疾病中的作用 特应性皮炎患者和健康志愿者的单核细胞、巨噬细胞,以及已发表研究中的皮损scRNA-seq数据 NA 特应性皮炎 单细胞RNA测序, q-PCR, 免疫细胞化学 NA RNA测序数据, 基因表达数据, 图像数据 特应性皮炎患者、健康志愿者和匿名捐赠者的PBMCs,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
88 2026-01-03
Influenza virus and Staphylococcus aureus super-infection disrupts spatially coordinated cellular immunity in the mouse lung
2025-Nov-23, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探究了流感病毒与金黄色葡萄球菌超级感染如何破坏小鼠肺部的空间协调细胞免疫 首次应用空间转录组学平台(10X Genomics Visium)系统表征超级感染期间免疫细胞的空间协调性,揭示了传统研究无法捕捉的空间背景信息 研究仅限于小鼠模型,未涉及人类样本;空间转录组学数据可能受技术分辨率限制 探究流感病毒与金黄色葡萄球菌超级感染对肺部免疫细胞空间分布和信号传导的影响 小鼠肺部组织 空间转录组学 肺部感染 空间转录组学,免疫荧光染色 NA 空间转录组学数据,图像数据 未明确指定样本数量,但涉及超级感染、单一流感感染和单一金黄色葡萄球菌感染的比较组 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10X Genomics Visium 空间转录组学平台
89 2026-01-03
Dysfunction and Pathological Origins of Lymphatic Endothelial Cells in Atherosclerosis Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-21, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了动脉粥样硬化中淋巴管内皮细胞的功能障碍和病理起源 首次在动脉粥样硬化中识别出淋巴管内皮细胞的两个亚群,并揭示了其双相数值响应、免疫调节能力改变以及从成纤维细胞转分化的新路径 研究基于ApoE-/-小鼠模型,可能不完全反映人类疾病情况;样本时间点有限,未覆盖更早期或更晚期阶段 阐明淋巴管内皮细胞在动脉粥样硬化进展中的表型和功能动态 ApoE-/-小鼠主动脉细胞中的淋巴管内皮细胞 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 ApoE-/-小鼠主动脉细胞,包括基线、8周(早期疾病)和16周(晚期疾病)三个时间点 NA 单细胞RNA-seq NA NA
90 2026-01-03
Early female germline development in Xenopus laevis: Stem cells, nurse cells, and germline cysts
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和高分辨率成像技术,重构了非洲爪蟾早期雌性生殖系发育轨迹,揭示了其与无脊椎动物及小鼠生殖囊泡发育的显著相似性 首次在非哺乳类脊椎动物中系统揭示了生殖囊泡的极性结构(类融合体)及其功能,并鉴定出具有神经元特异性和转座子沉默基因表达特征的独特生殖系干细胞群体 研究聚焦于非洲爪蟾,其结论在其他两栖类或更高等脊椎动物中的普适性仍需验证,且未深入探究类融合体极性运输的具体分子机制 阐明非哺乳类脊椎动物(非洲爪蟾)早期雌性生殖系发育过程中生殖囊泡的结构、极性及功能 非洲爪蟾(Xenopus laevis)的雌性生殖细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,高分辨率成像 NA 单细胞转录组数据,显微图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
91 2026-01-02
Multi-omics approaches including single-cell analysis and machine learning were used to identify the roles of telomere-related genes in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov-28, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过多组学方法结合单细胞分析和机器学习,识别了端粒相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后作用 首次系统性地将端粒相关基因与食管鳞状细胞癌的预后、肿瘤免疫微环境异质性和药物敏感性联系起来,并构建了有效的预后风险预测模型 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步的前瞻性临床验证 探究端粒相关基因在食管鳞状细胞癌中的预后价值和临床意义 食管鳞状细胞癌患者 机器学习 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 转录组学, 定量实时PCR LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床信息 来自TCGA和GEO数据库的食管鳞状细胞癌患者数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
92 2026-01-02
Single-cell sequencing reveals the complexity of cutaneous T-cell lymphoma
2025-Nov-27, Discover oncology IF:2.8Q2
综述 本文综述了单细胞测序技术在揭示皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)的基因组复杂性、肿瘤微环境和疾病进展机制方面的最新研究进展 系统总结了单细胞测序在CTCL研究中的应用,聚焦于基因改变、生物标志物、疾病起源与进展以及肿瘤微环境等关键领域,为个性化治疗策略提供新见解 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要依赖现有文献进行总结和分析 通过总结单细胞测序在CTCL中的研究进展,为新的药物发现和改进治疗策略提供参考 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) 数字病理学 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞测序 NA 单细胞基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
93 2026-01-02
Exploring tumor heterogeneity and drug resistance in cervical cancer through single-cell and bulk transcriptomics
2025-Nov-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过单细胞和空间转录组学技术,探索了宫颈癌的肿瘤异质性和耐药性机制 揭示了PI3+和SLC40A1+肿瘤细胞群在耐药性发展中的潜在作用,并首次强调了LGALS9在抑制T细胞功能、塑造免疫抑制微环境及与化疗耐药、免疫治疗无效和不良预后关联中的关键角色,为宫颈癌的早期诊断、分子分型和个性化治疗提供了新的生物标志物和见解 NA 深入研究宫颈癌肿瘤耐药性的潜在机制,以改善治疗效果 宫颈癌组织样本 数字病理学 宫颈癌 单细胞测序,空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
94 2026-01-02
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究首次利用锌指蛋白(ZNF)基因家族构建了一个用于预测子宫体子宫内膜癌(UCEC)预后、表征肿瘤微环境和评估治疗反应的ZNF评分系统 首次系统性地研究ZNF基因家族在UCEC中的作用,并基于8个预后相关的ZNF基因构建了一个综合风险评分模型(ZNF score),该模型能有效预测患者预后、免疫浸润状态和药物敏感性 研究主要基于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和临床实用性 系统探索ZNF基因家族在子宫体子宫内膜癌(UCEC)中的表达模式、预后价值、与肿瘤微环境的关联以及对治疗反应的影响 子宫体子宫内膜癌(UCEC)患者 生物信息学与计算生物学 子宫内膜癌 转录组分析,单细胞RNA测序,免疫组化,数据非依赖性采集定量蛋白质组学分析 COX回归,LASSO回归,风险评分模型 转录组数据,临床数据,单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据 来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌患者样本(具体数量未在摘要中明确给出) NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq,定量蛋白质组学 NA NA
95 2026-01-02
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过分析牙周炎患者的基因表达数据,鉴定出与乳酸化修饰相关的基因特征,并评估其在免疫异质性和诊断生物标志物中的作用 首次系统性地将乳酸化修饰相关基因与牙周炎的免疫异质性联系起来,并利用多组学数据结合机器学习算法识别出核心诊断标志物 研究主要基于公共数据集和回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证,且样本量有限 探索乳酸化修饰相关基因在牙周炎免疫调控中的作用,并开发诊断生物标志物 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织及外周血单核细胞 生物信息学 牙周炎 微阵列基因表达分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 LASSO回归、随机森林、XGBoost 基因表达数据、单细胞转录组数据、图像数据 来自GSE10334和GSE16134队列的牙周炎患者和健康对照样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
96 2026-01-02
A deep learning-based multiscale integration of spatial omics with tumor morphology
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种基于深度学习的多尺度整合方法MISO,用于从H&E染色组织切片预测空间转录组数据 首次开发了能够从常规H&E切片预测高分辨率空间转录组数据的深度学习模型,实现了接近单细胞分辨率的基因表达空间预测 模型训练依赖于有限的Visium样本数据,且预测精度可能受组织类型和染色质量影响 开发一种能够从常规病理切片预测空间转录组数据的计算方法,以克服空间转录组技术临床应用的局限性 肿瘤组织样本,包括72个10X Genomics Visium样本和348个来自MOSAIC联盟的样本 数字病理学 肿瘤 空间转录组学,深度学习 深度学习模型 图像,基因表达数据 420个样本(72个Visium样本 + 348个MOSAIC样本) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10X Genomics Visium平台
97 2026-01-02
p75NTR alleviates diabetic periodontitis in mice by inhibiting inflammatory macrophage recruitment
2025-Nov-27, BMC oral health IF:2.6Q1
研究论文 本研究探讨了p75NTR在糖尿病性牙周炎小鼠模型中通过抑制炎症性巨噬细胞招募来缓解疾病的作用机制 首次结合单细胞RNA测序技术揭示了p75NTR敲除对颌骨组织巨噬细胞异质性的影响,并明确了其通过调控巨噬细胞炎症反应减轻糖尿病性牙周炎的具体通路 研究仅在小鼠模型中进行,样本量较小(每组6只),且未探讨p75NTR在人类糖尿病性牙周炎中的直接临床应用价值 探究p75NTR在糖尿病性牙周炎中对巨噬细胞的作用及潜在分子机制 p75NTR野生型和敲除型糖尿病性牙周炎小鼠模型,重点关注颌骨组织中的巨噬细胞 单细胞组学 糖尿病性牙周炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Micro-CT成像、组织学染色、免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据、影像数据、组织切片图像 24只健康雄性小鼠(分为4组,每组6只) NA 单细胞RNA-seq NA NA
98 2026-01-02
Location and aetiology are determinants of fibroblast activation and heterogeneity in the failing human heart
2025-Nov-27, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析,探讨了心力衰竭患者左心室心肌中成纤维细胞的异质性和空间分布,揭示了纤维化表型的独特特征 首次在人类终末期心力衰竭中,结合单核RNA测序与空间转录组学数据,系统识别了成纤维细胞亚群的异质性、空间定位及其在缺血性和扩张型心肌病中的差异激活机制 样本量相对较小(仅20例),且仅聚焦于左心室组织,可能未完全代表心脏其他区域的纤维化动态 旨在解析心力衰竭中心脏纤维化的成纤维细胞异质性、空间分布及其在疾病表型中的作用,以寻找潜在治疗靶点 人类左心室心肌组织样本,包括非衰竭心脏、扩张型心肌病心脏、缺血性心肌病心脏及其疤痕区域 数字病理学 心血管疾病 单核RNA测序,空间转录组学 聚类分析,差异表达分析,配体-受体推断,伪时间轨迹映射 RNA测序数据,空间转录组数据 20例人类左心室组织样本(4例非衰竭,6例扩张型心肌病,5例缺血性心肌病,5例缺血性疤痕) NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
99 2026-01-02
A fibroblast-specific gene signature as a therapeutic target for glioblastoma developed based on the characteristics of tumor microenvironment
2025-Nov-27, European journal of medical research IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于胶质母细胞瘤肿瘤微环境中成纤维细胞的特征,开发了一个用于预测生存结果和指导个性化治疗的RiskScore模型 通过单细胞RNA测序识别成纤维细胞特异性基因,并构建了一个6基因的RiskScore模型,该模型能有效区分患者风险,并揭示了成纤维细胞在胶质母细胞瘤侵袭中的新作用机制 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分相对有限,且模型需在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证 提高胶质母细胞瘤的预后准确性并指导个性化治疗 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的成纤维细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,qPCR,CCK-8,伤口愈合实验,Transwell实验 RiskScore模型(基于Lasso Cox回归分析) 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 基于GSE273274队列,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
100 2026-01-02
Prognostic and therapeutic response prediction in glioblastoma multiforme using a lactylation-associated gene signature
2025-Nov-26, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过分析乳酸化相关基因,构建了一个用于预测胶质母细胞瘤预后和治疗反应的基因特征模型 首次将乳酸化相关基因特征用于胶质母细胞瘤的预后和治疗反应预测,并揭示了乳酸化在肿瘤微环境免疫细胞中的差异表达 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性研究进一步验证模型的临床适用性 探索乳酸化修饰在胶质母细胞瘤进展中的作用,并开发预后和治疗预测模型 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织和正常组织 生物信息学 胶质母细胞瘤 基因表达数据分析,单细胞测序 LASSO回归模型 基因表达数据,单细胞测序数据 CGGA队列中的胶质母细胞瘤患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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