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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-09 |
Causality between Cholecystectomy, Blood Lipids, and Major Adverse Cardiac and Cerebrovascular Events: A Multimodal Approach Highlighting Lipid Regulation
2025-Nov, Bulletin of experimental biology and medicine
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s10517-026-06583-3
PMID:41706273
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研究论文 | 本研究采用孟德尔随机化等多种方法,评估了胆囊切除术对血脂水平和主要不良心脑血管事件风险的因果影响 | 首次采用多模态方法(包括孟德尔随机化、富集分析、多变量MR和表达数量性状位点MR)系统研究胆囊切除术与心血管风险的因果关系,并利用单细胞测序技术解析关键基因的细胞分布 | 研究结果基于公共数据库的遗传数据,可能存在人群特异性和未测量的混杂因素 | 评估胆囊切除术对血脂水平和主要不良心脑血管事件(MACCE)风险的因果影响 | 胆囊切除术患者、血脂水平、主要不良心脑血管事件(包括心绞痛、冠心病、心力衰竭、心肌梗死和中风) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化(MR)、富集分析、多变量MR、表达数量性状位点MR、单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 82 | 2026-03-08 |
In vivo differentiation of embryonic cells devoid of key reprogramming factors
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116498
PMID:41171758
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq分析斑马鱼胚胎中NPS突变细胞在野生型胚胎中的命运,探讨了NPS在发育重编程和分化中的作用 | 揭示了NPS在协调核与细胞质重编程、防止谱系特异性分化程序过早激活中的关键作用,并发现部分细胞可绕过短暂全能性达到类似野生型的中间发育状态 | 研究基于斑马鱼模型,结果可能不直接适用于其他物种;单细胞RNA-seq技术可能无法完全捕捉所有转录动态 | 探究NPS(Nanog、Pou5f3、Sox19b)在胚胎细胞发育重编程和分化中的功能 | 斑马鱼胚胎中的NPS突变细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量,涉及斑马鱼胚胎细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-03-08 |
Myeloid cells mediate interferon-driven resistance to immunotherapy in advanced renal cell carcinoma
2025-Nov-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.10.013
PMID:41175876
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据,分析了肾细胞癌中干扰素信号在肿瘤免疫微环境中的作用,并探讨了其如何影响免疫检查点阻断疗法的疗效 | 通过混合效应模型推断细胞类型中干扰素诱导基因的可诱导性,并发现髓系细胞中的IFNγ信号而非肿瘤细胞信号可预测对一线免疫联合疗法的原发性耐药 | 研究主要基于体外实验和临床队列的推断模型,缺乏体内机制的深入验证 | 探究干扰素信号在肾细胞癌免疫治疗耐药中的作用机制 | 肾细胞癌的肿瘤免疫微环境,特别是髓系细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 混合效应模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-03-08 |
Retrospective transcriptomic analysis indicates temporal dysregulation of mitochondrial genes and metabolic pathways after volumetric muscle loss injury
2025-Nov, Physiological reports
IF:2.2Q3
DOI:10.14814/phy2.70612
PMID:41178047
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研究论文 | 本研究利用现有RNA-seq数据集,回顾性分析了体积性肌肉损失(VML)损伤后线粒体基因和代谢通路的时序性失调 | 通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了VML损伤后长达42天的转录组变化,特别是线粒体相关基因和代谢通路的动态调控 | 研究为回顾性分析,依赖于现有公开数据集,可能受原始实验设计和技术差异的限制 | 探究VML损伤后线粒体和代谢转录组的变化 | 大鼠(Rattus norvegicus)和小鼠(Mus musculus)的肌肉组织 | 数字病理学 | 肌肉损伤 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-03-06 |
Mitochondrial iron transport via MFRN1 is required for erythroid cell cycle progression
2025-Nov-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014887
PMID:40601908
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研究论文 | 本研究开发了体内方法,探讨铁如何调节红细胞生成,并报告了通过mitoferrin-1(MFRN1)的线粒体铁运输对红细胞细胞周期进程至关重要 | 揭示了MFRN1介导的线粒体铁运输在红细胞细胞周期G2/M期进展中的关键作用,并通过铁补充实验验证了其机制 | 研究主要基于斑马鱼胚胎模型,可能需要在其他生物系统中进一步验证 | 探究铁代谢如何调节红细胞生成过程,特别是细胞周期和分化 | 斑马鱼胚胎中的红细胞(erythroid cells) | NA | NA | 单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing),荧光激活流式分选(fluorescence-activated flow sorting) | NA | RNA测序数据,流式细胞术数据 | 斑马鱼胚胎(包括野生型和mfrn1突变体),具体样本数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-03-06 |
Polymer-based chemo-immunotherapy: Combining immunogenic cell death induction and PD-L1 blockade enhances antitumor immunity in melanoma
2025-Nov-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114193
PMID:40907793
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研究论文 | 本研究探讨了一种基于聚合物的化学免疫疗法策略,结合诱导免疫原性细胞死亡的药物与PD-L1阻断剂,以增强黑色素瘤的抗肿瘤免疫反应 | 开发了一种结合可诱导免疫原性细胞死亡的HPMA共聚物-表柔比星偶联物(KT-1)与多价HPMA共聚物-PD-L1肽拮抗剂(MPPA)的新型聚合物化学免疫疗法,并证明其优于传统免疫检查点抑制剂单药治疗,且安全性更高 | 研究主要在B16F10黑色素瘤模型中进行,尚未在更广泛的肿瘤类型或临床环境中验证 | 开发一种更安全有效的化学免疫疗法,以克服黑色素瘤对传统免疫检查点抑制剂治疗的抵抗 | 黑色素瘤(B16F10模型) | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2026-03-06 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
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研究论文 | 本文提出了一种名为TransST的新型迁移学习框架,用于从空间转录组学数据中推断细胞水平的异质性 | TransST通过自适应地利用外部来源的细胞标记信息,提高了空间转录组学数据中细胞亚群识别和生物标志物检测的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种迁移学习框架,以克服空间转录组学技术中分辨率和测序深度的限制,从而更可靠地提取生物信号 | 空间转录组学数据,特别是乳腺癌研究中的细胞亚群 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2026-03-03 |
Enhanced hematopoietic stem cell self-renewal and engraftment through human lung exosomal communication
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.020
PMID:40798884
|
研究论文 | 本研究揭示了肺细胞通过外泌体通讯在造血干细胞自我更新和移植中的重要作用 | 首次通过单细胞外泌体追踪分析和体内移植研究,发现肺细胞通过外泌体通讯调控造血干细胞稳态,挑战了传统认为仅骨髓微环境调控的观点 | 研究主要基于实验条件,在人类疾病如镰状细胞病和骨髓衰竭中的实际应用潜力仍需进一步验证 | 探究肺细胞外泌体通讯对造血干细胞自我更新和移植能力的影响及其分子机制 | 造血干细胞,特别是长期造血干细胞,以及人原代小气道上皮细胞来源的外泌体 | 单细胞生物学 | 镰状细胞病,骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序,外泌体microRNA分析,蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,外泌体microRNA数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-03-03 |
Mitochondrial and Glucose Metabolic Patterns in Pre-Granulosa Cells and Oocytes and Their Dysfunctions Induce Impaired Primordial Follicle Formation in Mice
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70110
PMID:41251108
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠卵巢组织中前颗粒细胞和卵母细胞在糖酵解和氧化磷酸化信号通路上的动态基因表达变化,及其对原始卵泡形成的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统描绘了原始卵泡形成过程中前颗粒细胞和卵母细胞的能量代谢动态变化模式 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类或其他哺乳动物中验证 | 探究原始卵泡形成过程中能量代谢的供应与需求机制 | 小鼠卵巢组织中的前颗粒细胞和卵母细胞 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠卵巢组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-03 |
LogicSR: prior-guided symbolic regression for gene regulatory network inference from single-cell transcriptomics data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf621
PMID:41269283
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研究论文 | 本文提出了一种名为LogicSR的计算框架,用于从单细胞转录组数据中高精度重建基因调控网络 | 将布尔逻辑模型的机制可解释性与符号回归的方程发现能力相结合,并利用先验知识通过多目标蒙特卡洛树搜索框架确保生物学合理性并加速最优调控方程的搜索 | 未明确提及具体局限性,但可能受限于单细胞数据的稀疏性和噪声,以及动态组合调控的复杂性 | 从单细胞转录组数据中推断基因调控网络,以揭示基因调控机制 | 基因调控网络,特别是转录因子与靶基因之间的复杂组合调控 | 系统生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | 布尔逻辑模型,符号回归,蒙特卡洛树搜索 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-03 |
From Single-Cell Atlas to Functional Validation: Critical Next Steps for Understanding Tip Cell-Mediated Communication in the Injured Spinal Cord
2025-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.70117
PMID:41288006
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评论 | 本文对Zeng等人(2025年)利用单细胞RNA测序研究脊髓损伤的研究进行了前瞻性展望和批判性审视,强调了从单细胞图谱到功能验证的关键后续步骤 | 提出了对单细胞测序研究中计算预测的旁分泌网络(如Angptl4-Sdc4轴)进行严格体内功能验证的必要性,并探讨了靶向尖端细胞治疗策略中的治疗困境 | 评论文章本身不产生新数据,主要基于对现有研究的分析和展望;未提供具体的实验验证方案 | 批判性审视单细胞测序在脊髓损伤研究中的应用,提出从描述性见解向机制理解和治疗策略转化的关键挑战 | 脊髓损伤中的内皮尖端细胞、星形胶质细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-03-02 |
Vasculogenic Precedes Neurogenic Differentiation in Dental Pulp Stem Cells
2025-Nov-03, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251379776
PMID:41178677
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内移植实验,揭示了人牙髓干细胞在分化过程中的异质性,并发现血管生成分化先于神经生成分化发生 | 首次在单细胞水平上展示了人牙髓干细胞的异质性,并明确了在移植后微环境中血管生成分化先于神经生成分化的时间顺序 | 研究主要基于免疫缺陷小鼠模型,可能无法完全模拟人体内的复杂微环境;样本量相对较小 | 探究人牙髓干细胞的分化机制,特别是血管生成、成牙本质细胞生成和神经生成分化的顺序与调控 | 人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,流式细胞术,体内移植实验 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量,但涉及体外诱导分化及小鼠移植实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-03-02 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Nov, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
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研究论文 | 本研究利用人类神经类器官模型,通过单细胞RNA测序分析了脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序动态影响 | 首次在可扩展的人类神经类器官模型中,通过单细胞测序揭示了血液暴露引起的细胞特异性转录组变化及其时间动态性,并识别了潜在的治疗靶点 | 研究基于体外类器官模型,可能无法完全模拟体内脑出血的复杂微环境;样本量相对有限(18个类器官) | 探究脑出血后血液诱导的继发性神经损伤对不同脑细胞类型的影响,以优化手术清除时机 | 人类神经类器官,包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞测序 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官,共96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-03-01 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamic reprogramming of testicular immunity in Brucella-infected goat testis
2025-Nov-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了布鲁氏菌感染的山羊睾丸组织中免疫微环境的动态转录重编程 | 首次在单细胞分辨率下描绘了布鲁氏菌感染后睾丸免疫微环境的动态重塑,并识别出硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)作为潜在的免疫治疗靶点 | 研究仅在山羊模型中进行,结果向其他物种或人类的直接外推需谨慎;机制验证实验(如功能缺失/获得)未在文中报告 | 阐明布鲁氏菌感染导致睾丸免疫病理的分子机制,并寻找免疫调节干预的潜在靶点 | 山羊睾丸组织(生理状态与布鲁氏菌感染状态) | 数字病理学 | 布鲁氏菌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-02-27 |
Engineering a spatiotemporal macrophage circuit via STING phase separation to override immune suppression in pancreatic cancer
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504718122
PMID:41264244
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研究论文 | 本研究开发了一种基于STING相分离的时空巨噬细胞重编程平台,用于克服胰腺癌的免疫抑制微环境 | 首次利用STING相分离原理构建时空可控的巨噬细胞回路,实现TAMs的序贯重编程并防止过度炎症反应 | 研究目前处于临床前模型阶段,尚未进行人体临床试验验证 | 开发新型巨噬细胞靶向免疫治疗策略以克服胰腺癌免疫抑制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-02-27 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-Nov, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型,并基于单细胞和空间转录组学研究总结了主要发现 | 整合了最新的单细胞转录组学、多组学和空间转录组学数据,为神经退行性疾病模型提供了新的分子和细胞层面见解 | 没有模型是完美的,可能存在物种差异和病理不完全模拟的问题 | 研究神经退行性疾病的病因和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型,特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 97 | 2026-02-26 |
The SWI/SNF chromatin-remodeling subunit DPF2 regulates macrophage inflammation in intestinal injury via the CACNA1D-mediated MAPK pathway
2025-Nov-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2518762122
PMID:41223220
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研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑亚基DPF2通过调控CACNA1D介导的MAPK通路,在巨噬细胞炎症反应和肠道损伤修复中的关键作用 | 首次发现DPF2缺失通过改变组蛋白修饰(H3K27ac和H3K4me1)调控CACNA1D表达,进而影响细胞内钙水平和MAPK信号通路,最终调节巨噬细胞的炎症极化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证的规模可能有限,且具体调控机制中涉及的转录因子或其他共调节因子尚未完全阐明 | 探究DPF2在肠道损伤中调控巨噬细胞炎症反应和肠道再生的分子机制 | 巨噬细胞、肠道组织、临床炎症性肠病(IBD)样本、患者来源的类器官 | 单细胞组学与空间转录组学 | 炎症性肠病(IBD) | 单细胞RNA测序、空间转录组学、小鼠遗传学、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床样本数据 | 未明确具体样本数量,但涉及小鼠模型、临床IBD样本和患者来源类器官 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2026-02-26 |
Four Decades of Inquiry Into the Genetic Bases of Specific Reading Disability
2025-Nov-11, Journal of speech, language, and hearing research : JSLHR
DOI:10.1044/2025_JSLHR-25-00050
PMID:41091061
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研究论文 | 本研究通过系统梳理过去四十年中与特定阅读障碍相关的候选基因,分析其进化保守性、发育表达模式和功能网络,以揭示阅读障碍的遗传基础 | 挑战了存在阅读特异性基因的观念,提出特定阅读障碍反映了古老进化神经机制在人类特有大脑结构中的破坏,并识别了发育表达转换和功能网络 | 基于文献综述和生物信息学分析,缺乏实验验证,且样本数据主要来自公共数据库,可能受限于数据覆盖范围 | 探究特定阅读障碍的遗传基础,填补阅读能力遗传结构理解的知识空白 | 175个与特定阅读障碍及阅读相关过程相关的候选基因 | 自然语言处理 | 特定阅读障碍 | 生物信息学分析,包括进化保守性分析、发育转录组分析和单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | Allen Brain Atlas | 单细胞RNA-seq,发育转录组学 | NA | Allen Brain Atlas的发育和单细胞转录组数据集 |
| 99 | 2026-02-26 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
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综述 | 本文系统总结了单细胞转录组学和表观基因组学方法在阿尔茨海默病研究中的应用,重点阐述了细胞类型和亚型特异性转录组改变的特征 | 整合单细胞RNA测序、ATAC测序和空间转录组学技术,揭示了疾病轨迹和跨病理阶段的细胞通讯网络,为精准医学提供了新见解 | 本文为综述文章,未报告原始实验数据,其总结依赖于现有研究的发现和局限性 | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解,并为通过识别新的治疗靶点和生物标志物实现精准医学铺平道路 | 阿尔茨海默病患者的大脑细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 转座酶可及染色质测序 (ATAC-seq), 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2026-02-25 |
A human-mouse atlas of intrarenal myeloid cells identifies conserved disease-associated macrophages in lupus nephritis
2025-Nov-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241873
PMID:40900124
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析、空间转录组学和功能研究,比较了四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞,识别了保守的疾病相关巨噬细胞 | 首次通过跨物种分析识别了狼疮性肾炎中保守的疾病相关单核细胞和巨噬细胞,并验证了小鼠模型在理解人类疾病中的适用性 | 研究主要基于观察性数据,功能机制验证可能有限,且样本量虽大但可能未覆盖所有疾病亚型 | 探索狼疮性肾炎中肾内髓系细胞的改变,并评估小鼠模型在治疗开发中的适用性 | 四种小鼠模型和155名狼疮性肾炎患者的肾内髓系细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞分析,空间转录组学,功能研究 | NA | 单细胞数据,空间转录组数据 | 155名狼疮性肾炎患者和四种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |