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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 961 | 2025-11-09 |
Spatial and functional dissection of cancer-associated fibroblasts-mediated immune modulation in H. pylori-associated gastric cancer
2025-Nov-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02490-9
PMID:41194113
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA-seq分析,揭示了幽门螺杆菌相关胃癌中癌症相关成纤维细胞的空间分布和免疫调节功能 | 首次系统解析了幽门螺杆菌阳性胃癌中CAF亚型的空间分布特征及其通过WNT5-FZD相互作用和ZFP36介导的FN1 mRNA稳定性调控免疫抑制的新机制 | 研究样本量相对有限(71例GC患者),且主要基于回顾性队列分析 | 阐明癌症相关成纤维细胞在幽门螺杆菌相关胃癌中的空间组织和免疫调节功能 | 胃癌患者的肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,LACE-seq,CIBERSORT-ABS,Kaplan-Meier分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,临床数据 | 71例GC患者肿瘤组织,整合三个独立队列(中国、美国、新加坡)数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 962 | 2025-11-09 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2025-Nov-06, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定人类脱落乳牙干细胞的功能亚群并分离BAMBI⁺亚群 | 首次在单细胞水平揭示SHEDs的异质性,识别出具有高增殖、软骨形成和血管生成能力的BAMBI⁺功能亚群 | NA | 鉴定人类脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标志物,为干细胞精细化应用提供理论基础 | 人类脱落乳牙干细胞(SHEDs) | 单细胞测序分析 | 口腔组织再生 | 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 组织化学染色, 血管生成实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 963 | 2025-11-09 |
Galectin-9 inhibition of the MIF-CD74/CD44 pathway suppresses chronic arthritis
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.08.016
PMID:40798883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现类风湿关节炎中MIF亚群,并证明galectin-9通过抑制MIF-CD74/CD44通路可有效抑制关节炎破坏性表型 | 首次发现MIF亚群在类风湿关节炎中的作用机制,并证实重组galectin-9作为新型抗MIF药物可通过阻断CD44抑制关节炎破坏进程 | 研究主要基于动物模型,尚未进行临床验证 | 探索治疗类风湿关节炎的新靶点和治疗策略 | 类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(FLSs) | 单细胞测序 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 964 | 2025-11-09 |
Spatial transcriptomic landscape and cellular neighborhood heterogeneity in cervical cancer: integrative single-cell and spatial RNA sequencing analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03788-2
PMID:41191175
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,构建了首个宫颈癌综合空间分子图谱 | 首次建立宫颈癌综合空间转录组图谱,识别38个具有独特分子特征的细胞邻域,揭示肿瘤微环境的空间组织模式 | NA | 构建宫颈癌空间转录组图谱,解析肿瘤微环境的空间组织和细胞间关系 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 定量PCR | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 公共GEO数据库数据集和实验验证细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 965 | 2025-11-09 |
Exploration of prognosis and immune infiltration characteristics in glioblastoma multiforme based on lipid metabolism related genes
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03865-6
PMID:41191203
|
研究论文 | 本研究基于脂代谢相关基因探索多形性胶质母细胞瘤的预后和免疫浸润特征 | 首次基于脂代谢相关基因将GBM患者分为两个预后不同的亚群,并鉴定出四个新的预后相关枢纽基因 | 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 识别GBM中与脂代谢相关的预后生物标志物和治疗靶点 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 转录组分析,单细胞测序,生物信息学算法 | LASSO-Cox回归分析 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 966 | 2025-11-09 |
Identification of lactylation-related biomarkers in HNSC by integrating machine learning and Spatial transcriptomics analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03849-6
PMID:41191207
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研究论文 | 通过整合机器学习和空间转录组学分析识别头颈部鳞状细胞癌中与乳酸化修饰相关的生物标志物 | 首次结合12种机器学习方法和空间转录组学技术系统筛选HNSC中乳酸化相关关键基因,并揭示其在肿瘤核心区域的优先表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因在乳酸化修饰中的具体分子机制 | 识别头颈部鳞状细胞癌中关键的乳酸化相关基因及其预后影响 | 头颈部鳞状细胞癌患者基因表达数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学,单细胞分析,Western blotting,RT-qPCR | 多种机器学习方法,WGCNA,CIBERSORT | 基因表达数据,空间转录组数据 | TCGA-HNSC队列和GSE6631数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 967 | 2025-11-09 |
Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65704-0
PMID:41193468
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据构建了人类肺部空间单细胞图谱,揭示了健康与疾病状态下肺组织的区域变异 | 首次在人类肺部应用三种空间转录组学方法,构建了具有空间分辨率的三维组织参考图谱,并发现了慢性阻塞性肺病中上皮细胞类型组成的未知失衡 | 研究仅关注了三个代表性肺部区域,可能未完全覆盖整个肺部的空间异质性 | 理解肺组织地形和外部因素对细胞类型内基因表达变异的影响 | 人类肺部细胞,包括罕见上皮细胞 | 空间转录组学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 三种不同的空间转录组学方法 |
| 968 | 2025-11-09 |
Bone marrow-derived emergency monopoiesis drives brain-lung axis injury after traumatic brain injury via IL-1
2025-Nov-05, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03589-y
PMID:41194087
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤后骨髓来源的紧急单核细胞生成通过IL-1驱动脑-肺轴损伤的机制 | 首次发现颅骨骨髓在TBI后24小时内发生IL-1驱动的紧急单核细胞生成,并阐明其作为多器官损伤核心驱动因素的新机制 | NA | 探索创伤性脑损伤引发外周器官损伤的机制基础 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 969 | 2025-11-09 |
Integrating genetics and transcriptome analyses identify potential biomarkers and immune interactions in metabolic syndrome-related sarcopenia
2025-Nov-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07191-x
PMID:41194111
|
研究论文 | 本研究通过整合遗传学和转录组学分析,识别代谢综合征相关肌肉减少症的潜在生物标志物和免疫相互作用 | 首次从遗传学角度揭示代谢综合征与肌肉减少症的共病机制,发现9个多效性基因作为潜在干预靶点 | 研究结果需要在更大样本和更多人群中进一步验证 | 探索代谢综合征与肌肉减少症之间的潜在机制和生物标志物 | 代谢综合征和肌肉减少症相关的遗传和转录组数据 | 生物信息学 | 代谢综合征和肌肉减少症 | 全基因组关联研究,连锁不平衡评分回归,孟德尔随机化,转录组范围关联研究,单细胞RNA测序 | 临床预测模型 | 遗传数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 970 | 2025-11-09 |
Harnessing multi-omics approaches to decipher tumor evolution and improve diagnosis and therapy in lung cancer
2025-Nov-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00859-y
PMID:41194170
|
综述 | 本文综述了多组学方法在解析肺癌肿瘤进化及改善诊疗中的应用前景 | 系统阐述多组学方法在构建肺癌生态系统全景中的整合应用价值 | NA | 探讨多组学方法在肺癌研究中的潜力与应用 | 肺癌肿瘤异质性与肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 全基因组测序,单细胞测序,空间转录组学 | 多组学整合模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 971 | 2025-11-09 |
In vitro derivation of midbrain dopaminergic neurons from porcine embryonic stem cells in multi-dimensional conditions
2025-Nov-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04693-9
PMID:41194288
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研究论文 | 本研究建立了从猪胚胎干细胞在二维和三维条件下高效分化中脑多巴胺能神经元的物种优化方案 | 首次建立了从猪干细胞生成功能验证的中脑多巴胺能神经元和中脑类器官的稳健平台,揭示了物种特异性信号动态 | 仅使用猪胚胎干细胞进行研究,未与其他物种进行直接比较 | 建立物种优化的条件,从猪胚胎干细胞在二维和三维环境中衍生功能性中脑多巴胺能神经元 | 体外受精和孤雌生殖激活来源的猪胚胎干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 免疫荧光、膜片钳电生理学、微电极阵列记录、多巴胺ELISA、RNA测序 | NA | 基因表达数据、电生理数据、蛋白质数据 | 猪胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 972 | 2025-11-09 |
The molecular complexity of deep vein thrombosis was preliminarily explored based on the ceRNA network, scRNA-seq and AlphaFold 2
2025-Nov-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02239-9
PMID:41188916
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研究论文 | 本研究通过ceRNA网络、单细胞RNA测序和AlphaFold 2技术初步探索深静脉血栓形成的分子复杂性 | 首次结合ceRNA网络构建、多种PPI网络算法、AlphaFold 2结构预测和单细胞RNA测序技术系统研究深静脉血栓的分子机制 | 样本量较小(内部测试集10例,外部验证集14例,单细胞测序6例),需要更大规模研究验证 | 识别与深静脉血栓相关的高度特异性基因并研究其复杂性 | 深静脉血栓患者和健康对照者的血液样本 | 生物信息学 | 深静脉血栓 | 单细胞RNA测序, 全转录组分析, 蛋白质结构预测 | ceRNA网络模型, PPI网络分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 内部测试集10例(4例患者+6例对照),外部验证集14例,单细胞测序6例(3例患者+3例对照) | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 973 | 2025-11-09 |
USP2-mediated PPARγ stabilization promotes hepatocellular carcinoma progression and M2 macrophage polarization via oleic acid
2025-Nov-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012721
PMID:41193183
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研究论文 | 本研究揭示USP2通过稳定PPARγ促进肝癌进展和M2巨噬细胞极化的分子机制 | 首次发现USP2通过去泛素化稳定PPARγ,促进脂肪酸合成和油酸产生,进而驱动M2巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于体外模型和动物实验,需要进一步临床验证 | 探索USP2在肝细胞癌进展和肿瘤微环境调控中的作用机制 | 肝癌患者来源类器官、肝癌细胞系、动物模型和巨噬细胞 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫共沉淀、CUT&RUN、ELISA、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 974 | 2025-11-09 |
Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417129
PMID:40779122
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研究论文 | 本研究揭示大黄素通过靶向中性粒细胞BCL-10抑制NETosis,缓解脓毒症引起的多器官损伤 | 首次发现大黄素可直接靶向BCL-10蛋白,通过调节BCL-10/MALT1复合物抑制NF-κB信号通路和NETs形成 | NA | 探究大黄素在脓毒症中对多器官保护作用的分子机制 | 中性粒细胞及其NETs形成过程 | 分子生物学 | 脓毒症 | 蛋白质微阵列,表面等离子共振,分子对接,单细胞测序 | NA | 体外实验数据,体内实验数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 975 | 2025-11-09 |
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Nov, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70025
PMID:40906332
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研究论文 | 本研究揭示HLA-A*02:01通过半胱氨酸修饰呈递青霉素修饰肽段激活T细胞反应的分子机制 | 首次发现青霉素优先修饰HLA肽段中的半胱氨酸残基,并证实通过二硫键介导的肽段修饰机制可诱导T细胞识别 | 研究仅聚焦于HLA-A*02:01单倍型和青霉素特异性反应,未涵盖其他HLA类型或β-内酰胺类药物 | 阐明青霉素诱导T细胞介导过敏反应的分子机制 | HLA-A*02:01呈递的青霉素修饰肽段及患者来源的青霉素特异性T细胞 | 免疫学 | 药物过敏 | 免疫肽组学、单细胞测序、报告细胞系检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞TCR序列数据 | 过敏患者来源的CD8+ T细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 976 | 2025-11-09 |
Globotriaosylceramide Gb3 Influences Wound Healing and Scar Formation by Orchestrating Fibroblast Heterogeneity
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509733
PMID:40810720
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研究论文 | 本研究系统探讨了globotriaosylceramide (Gb3)通过调控成纤维细胞异质性影响伤口愈合和瘢痕形成的机制 | 发现了HEXB-Gb3-FGF2调控轴在成纤维细胞表型可塑性中的新作用机制 | 研究主要基于特定烧伤模型,在其他类型伤口中的适用性需进一步验证 | 阐明Gb3在皮肤再生过程中的功能作用及其调控机制 | 皮肤成纤维细胞、浅二度烧伤和深二度烧伤临床标本 | 单细胞组学 | 皮肤烧伤 | 单细胞RNA测序, 空间组学, 脂质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据, 空间组学数据, 脂质组学数据, 组织学图像 | 临床烧伤标本(浅二度和深二度烧伤) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 977 | 2025-11-09 |
Distinct stromal cell populations define the B-cell acute lymphoblastic leukemia microenvironment
2025-Nov, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02734-z
PMID:40817406
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示了B细胞急性淋巴细胞白血病微环境中不同的基质细胞群体及其功能 | 首次在B-ALL患者中鉴定出两种不同的间充质基质细胞群体,并发现第三种成骨谱系细胞群体,揭示了这些细胞通过不同机制支持白血病细胞生存和化疗耐药 | 研究样本仅限于儿科B-ALL患者,未包括成人患者;样本量相对有限 | 解析B细胞急性淋巴细胞白血病骨髓微环境的细胞异质性和功能特性 | 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 | 单细胞生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析,功能体外测定 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 儿科B-ALL患者的骨髓抽吸物和骨活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 978 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Redefines Macrophage Heterogeneity and Function in Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70107
PMID:41204881
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在皮肤伤口愈合研究中揭示巨噬细胞异质性和功能多样性的进展 | 通过单细胞测序技术系统揭示巨噬细胞在伤口愈合过程中的异质性、功能多样性及动态变化特征 | NA | 阐明巨噬细胞在皮肤伤口愈合过程中的细胞异质性和功能作用 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 979 | 2025-11-08 |
Elucidating cardiomyocyte state transitions in zebrafish heart development using transcriptome dynamics
2025-Nov-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152736
PMID:41110187
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型分析心脏发育过程中的转录组动态,揭示了心肌细胞状态转变的关键机制 | 首次通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析,识别出M5模块在心肌细胞状态转变中的关键作用,并发现smtnl1作为枢纽基因 | 研究仅聚焦于斑马鱼胚胎发育早期阶段(24-48 hpf),未验证在哺乳动物或人类中的保守性 | 阐明心脏发育过程中心肌细胞状态转变的分子机制,为先天性心脏病发病机制提供新见解 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎心脏在24、30、36、48 hpf四个时间点的样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 980 | 2025-11-08 |
Inflammatory niches as spatial drivers of disease mechanisms and targets for personalized treatment
2025-Nov-07, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70170
PMID:41200832
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综述 | 本文探讨炎症微空间作为疾病机制的空间驱动因素及其在个性化治疗中的靶向价值 | 整合单细胞测序与空间分析技术揭示疾病特异性炎症机制,提出空间组织化炎症微环境的新范式 | NA | 解析炎症微空间在疾病机制中的作用并推动个性化治疗策略发展 | 免疫细胞与非免疫细胞在组织空间中的相互作用网络 | 空间转录组学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞测序, 空间分析 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |