本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2025-10-05 |
Exosomal gene signature in esophageal carcinoma: Insights from single-cell and bulk RNA sequencing
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102490
PMID:40816225
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,开发并验证了一个用于食管癌预后预测的外泌体相关九基因标志物 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据构建食管癌外泌体相关基因标志物,并验证其在免疫治疗预测中的潜在价值 | 免疫治疗相关性分析基于膀胱癌队列而非食管癌特异性队列,需要进一步在食管癌免疫治疗队列中验证 | 开发食管癌预后预测和免疫治疗反应预测的生物标志物 | 食管鳞状细胞癌(ESCA)患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO-Cox回归风险模型 | RNA测序数据 | TCGA-ESCA、GSE53625、GSE196756等多个公共数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 902 | 2025-10-05 |
Single-cell omics reveal the mechanisms of traditional Chinese medicines
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157204
PMID:40916282
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在中医药研究中的应用及其在揭示中药作用机制方面的潜力 | 首次系统探讨单细胞组学技术在解析中药复杂成分和作用机制中的变革性潜力 | 存在技术限制和数据复杂性等挑战 | 探索单细胞组学在中医药现代化和科学验证中的作用 | 传统中药及其活性成分 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 903 | 2025-10-05 |
Integrated transcriptome and single-cell RNA sequencing analysis revealed the prognostic significance of GBP4 in pancreatic adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102532
PMID:40944976
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,揭示了GBP4在胰腺腺癌中的预后意义 | 首次系统性地确定了GBP4在胰腺腺癌中的预后价值,并通过单细胞分辨率揭示了其在肿瘤微环境中的表达动态 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步独立队列验证 | 确定GBP4基因对胰腺腺癌的影响 | 胰腺腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 904 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501
PMID:40811979
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响,并开发了基于棕榈酰化特征的12基因风险模型 | 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证,实验验证主要集中于ASPH基因 | 探索棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性和预后预测中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,GSVA,ssGSEA,拷贝数变异分析,伪时间序列分析,细胞互作分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | TCGA数据集和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 905 | 2025-10-05 |
Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165
PMID:40839986
|
研究论文 | 通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法,阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统研究白藜芦醇对BPH的治疗机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内实验验证 | 阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理机制和关键信号通路 | 良性前列腺增生疾病模型和前列腺细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌相关疾病 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 体外实验验证 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 906 | 2025-10-05 |
Genistein ameliorates thoracic aortic dissection by inhibiting CB1 receptor hyperactivation and modulating its-mediated cAMP-PKA signaling
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157178
PMID:40845589
|
研究论文 | 本研究探讨染料木黄酮通过抑制CB1受体过度激活并调节其介导的cAMP-PKA信号通路来改善胸主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CB1受体在胸主动脉夹层中的过度表达及其通过抑制cAMP-PKA信号通路促进疾病发展的机制,并发现染料木黄酮通过靶向该通路发挥治疗作用 | 研究主要聚焦于CB1受体-cAMP-PKA信号轴,可能还存在其他未被探索的分子机制参与胸主动脉夹层的发病过程 | 研究染料木黄酮通过抑制CB1受体和调节cAMP-PKA信号通路缓解胸主动脉夹层进展的潜力 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)和胸主动脉夹层动物模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序,体外和体内实验 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 907 | 2025-10-05 |
IV Immunoglobulin Is Associated With Epigenetic, Ribosomal, and Immune Changes in Pediatric Acute-Onset Neuropsychiatric Syndrome
2025-Nov, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200467
PMID:40953324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析静脉注射免疫球蛋白对儿童急性发作神经精神综合征患者外周免疫细胞基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示PANS患者接受IVIg治疗前后的表观遗传、核糖体和免疫通路变化 | 样本量较小(5例患者,4例对照),采用开放性标签设计 | 研究IVIg对PANS患者细胞特异性基因表达的影响 | 儿童急性发作神经精神综合征患者的外周免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 儿童急性发作神经精神综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5名PANS儿童患者(治疗前后配对样本)和4名对照儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 908 | 2025-10-05 |
Targeting CLK1/SRSF7 axis-dependent alternative splicing sensitizes pancreatic ductal adenocarcinoma to chemotherapy and immunotherapy
2025-Nov, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101292
PMID:40840404
|
研究论文 | 本研究揭示了环状RNA cALG8通过调控选择性剪接促进胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫抑制的分子机制 | 首次发现cALG8作为蛋白支架促进CLK1磷酸化SRSF7,形成ATM203剪接变体,增强DNA损伤修复和免疫微环境重塑 | 研究主要基于临床前模型,需要进一步临床试验验证 | 阐明胰腺导管腺癌对吉西他滨耐药的分子机制并开发靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞、患者来源类器官、患者来源异种移植模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 环状RNA测序、液相色谱-质谱联用、单细胞测序、分子生物学技术 | NA | RNA测序数据、质谱数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 909 | 2025-10-05 |
RAB26 promotes prostate cancer progression via the MAPK/ERK-TWIST1 signaling axis
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101689
PMID:40821113
|
研究论文 | 本研究揭示RAB26通过MAPK/ERK-TWIST1信号轴促进前列腺癌进展的分子机制 | 首次阐明RAB26在前列腺癌中通过调控MAPK/ERK通路激活TWIST1表达诱导上皮间质转化的新机制 | NA | 探究RAB26在前列腺癌进展中的功能作用和分子机制 | 前列腺癌细胞 | 癌症研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录序列分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 数据集GSE141445 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 910 | 2025-10-05 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq and ATAC-seq in lens epithelial cells: Unveiling the role of ATF6 as a key transcription factor
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101610
PMID:40837408
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序和ATAC测序数据,揭示ATF6作为关键转录因子在晶状体上皮细胞稳态维持和上皮-间质转化中的作用 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和scATAC-seq数据研究晶状体上皮细胞发育,发现ATF6在EMT过程中的关键调控作用 | 研究仅基于9-23周胎儿眼组织数据,缺乏成人样本验证 | 探究晶状体上皮细胞中上皮-间质转化的分子机制 | 胎儿晶状体上皮细胞 | 单细胞组学 | 白内障 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 9-23周胎儿眼组织(来自先前发表研究) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 911 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous response of interlamellar cell mass to hypoxic stress in crucian carp (Carassius auratus) gills
2025-Nov, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110584
PMID:40701446
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示鲫鱼鳃中间片细胞团对缺氧应激的异质性响应机制 | 首次在单细胞水平揭示鲫鱼鳃中间片细胞团对缺氧应激的异质性响应,发现内质网应激是细胞凋亡主要通路 | 研究仅针对鲫鱼特定细胞类型,未验证其他鱼类或组织的普适性 | 探究鱼类鳃组织对缺氧应激的细胞分子响应机制 | 鲫鱼(Carassius auratus)鳃组织中的间片细胞团 | 单细胞生物学 | 缺氧应激 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 912 | 2025-10-05 |
Hemocyte diversity in crustaceans
2025-Nov, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110612
PMID:40750028
|
综述 | 本文综述了甲壳动物血细胞多样性的研究进展,包括传统分类方法和新兴单细胞RNA测序技术带来的新发现 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了新的血细胞分子标记,挑战了基于形态学的传统血细胞分类方法 | NA | 探讨甲壳动物血细胞的多样性、分类和功能 | 甲壳动物(特别是小龙虾和虾类)的循环血细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 913 | 2025-10-05 |
Nkx2.5 triggers vascular remodeling in chicken but not in emu wing mesoderm
2025-Nov, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.08.007
PMID:40812617
|
研究论文 | 本研究通过比较鸡和鸸鹋胚胎翅膀中Nkx2.5基因的功能差异,揭示了该基因在血管重塑中的物种特异性作用 | 首次发现Nkx2.5在鸡翅膀中胚层能诱导血管生成基因Scl表达并引发血管重塑,但在鸸鹋翅膀发育中无此功能 | 研究主要基于胚胎实验和单细胞测序数据分析,缺乏更深入的机制验证 | 探究Nkx2.5基因在肢体中胚层发育中的细胞效应和物种差异 | 鸡胚胎和鸸鹋胚胎的翅膀中胚层组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,局部电穿孔 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 鸡胚胎和鸸鹋胚胎样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 914 | 2025-10-05 |
Smpd3 regulates odontoblast differentiation through the Shh-Gli1 pathway
2025-Nov, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117587
PMID:40639673
|
研究论文 | 本研究揭示了Smpd3通过Shh-Gli1通路调控成牙本质细胞分化的分子机制 | 首次发现Smpd3在成牙本质细胞分化中的关键作用,并阐明其通过Shh信号通路调控牙本质形成的机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类系统中验证 | 探究调控成牙本质细胞分化的分子机制 | 小鼠牙乳头细胞和牙胚 | 发育生物学 | 牙科疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA干扰, 体外培养 | NA | 基因表达数据, 组织学图像 | 小鼠磨牙单细胞数据及体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 915 | 2025-10-05 |
Origin, functions, heterogeneity and associated diseases of B-1 cells
2025-Nov, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110561
PMID:40651736
|
综述 | 本文综述了B-1细胞的起源、生物学功能及其在人类疾病中的作用 | 通过单细胞测序分析揭示了B-1细胞在特定病理生理特征下的异质性 | B-1细胞的起源尚未完全明确,存在两种假说 | 探讨B-1细胞的起源、功能和与疾病的关联 | B-1细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病,感染性疾病,炎症性疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 916 | 2025-10-05 |
Large-scale proteomics analysis identifies plasma protein biomarkers and potential therapeutic targets for rheumatoid arthritis: A prospective study in UK Biobank
2025-Nov, Bone
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.bone.2025.117593
PMID:40669587
|
研究论文 | 通过大规模蛋白质组学分析鉴定类风湿关节炎的血浆蛋白生物标志物和潜在治疗靶点 | 整合蛋白质组学、全基因组关联研究和单细胞RNA测序数据,系统评估RA风险相关蛋白并识别新型治疗靶点 | 预测模型性能中等(AUC=0.74),样本量相对有限 | 识别类风湿关节炎的生物标志物和潜在治疗靶点 | 类风湿关节炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学, GWAS, 单细胞RNA测序 | XGBoost | 蛋白质组数据, 基因组数据, 转录组数据 | 706例RA患者和1410例对照 | NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 917 | 2025-10-05 |
BCAP31 promotes colorectal cancer metastasis via oxidative phosphorylation-dependent macrophage immunosuppression: A single-cell transcriptomic study
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示BCAP31通过氧化磷酸化依赖性巨噬细胞免疫抑制促进结直肠癌转移的机制 | 首次发现BCAP31在结直肠癌转移中的关键作用,建立了10基因巨噬细胞相关预后特征,揭示了线粒体-免疫串扰新机制 | 研究样本量有限,功能验证需要进一步扩展 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中巨噬细胞驱动的免疫抑制机制 | 结直肠癌组织和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据 | 结直肠癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 918 | 2025-10-05 |
Transcriptional profiling uncovers microglial HIF-1α signaling as a therapeutic target of radiation-induced brain injury
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示颅脑放疗后小胶质细胞中HIF-1α信号通路的特异性激活及其在辐射性脑损伤中的关键作用 | 首次在单细胞水平发现辐射特异性激活小胶质细胞HIF-1α信号通路,该现象在传统批量分析中无法检测 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床样本中验证 | 探索辐射性脑损伤的细胞分子机制并寻找治疗靶点 | 接受颅脑放疗的小鼠模型及其小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 919 | 2025-10-06 |
Alternative splicing as a novel pathogenic mechanism in chronic kidney disease
2025-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111972
PMID:40614890
|
综述 | 本文综述了选择性剪接作为慢性肾脏病新型致病机制的研究进展 | 首次系统阐述选择性剪接在慢性肾脏病中的致病作用,提出靶向选择性剪接的治疗策略 | 需要进一步研究选择性剪接及其调控因子在慢性肾脏病中的动态变化和功能贡献 | 阐明选择性剪接与慢性肾脏病之间的功能联系 | 肾小管上皮细胞及其选择性剪接事件 | 生物医学 | 慢性肾脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | 全球超过10%人口 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 920 | 2025-10-06 |
N-glycosylation stabilized TNFAIP6 promotes ovarian cancer metastasis by activating the PI3K-AKT signaling pathway
2025-Nov, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112013
PMID:40701312
|
研究论文 | 本研究揭示了N-糖基化稳定的TNFAIP6通过激活PI3K-AKT信号通路促进卵巢癌转移的分子机制 | 首次发现N-糖基化通过抑制泛素-蛋白酶体降解途径稳定TNFAIP6蛋白,并阐明其通过PI3K/AKT信号通路驱动卵巢癌转移的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,需要进一步临床验证;免疫抑制微环境与治疗抵抗的具体机制仍需深入探索 | 阐明卵巢癌转移的分子驱动机制并寻找潜在治疗靶点 | 卵巢癌细胞系、动物转移模型和临床样本数据 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq, Western blot, 免疫荧光, 慢病毒shRNA敲降/过表达, Co-IP | 动物转移模型 | 基因组数据, 蛋白质数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |