单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1144 篇文献,本页显示第 901 - 920 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
901 2025-11-13
Single-Cell Transcriptome Atlas Reveals the Underlying Mechanism of Kynurenic Acid in the Regulation of Tumor Immune Microenvironment in Glioblastoma
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了犬尿酸在胶质母细胞瘤中调节肿瘤免疫微环境的潜在机制 首次系统阐明犬尿酸通过重塑髓系免疫抑制细胞和逆转T细胞耗竭来增强抗肿瘤免疫反应的作用机制 研究主要依赖小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;T细胞缺陷模型虽证实适应性免疫的必要性,但具体机制细节仍需深入探索 探究犬尿酸在胶质母细胞瘤免疫微环境调节中的功能机制 胶质母细胞瘤组织样本和原位移植小鼠模型 单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术,蛋白质组学,流式细胞术,靶向代谢组学 NA 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,流式细胞数据 临床队列组织样本和原位GBM小鼠模型 NA 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学,代谢组学 NA NA
902 2025-11-13
High-Resolution Multiplexed Sequencing of Single-Cell Full-length Transcriptome Via Combinational Barcoded Tn5 Transposon Insertion
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本文提出了一种名为CBTi-seq的新型单细胞全长转录组测序技术,通过组合条形码Tn5转座子插入实现高分辨率多重测序 利用Tn5转座酶介导的组合条形码和UMI分子组装,实现单细胞全长转录组的高分辨率测序,正交组合条形码设计在减少DNA条形码多样性的同时增强多重检测灵活性 NA 开发一种能够在单细胞水平实现全长转录组高分辨率测序的新方法 基因编辑细胞和人类睾丸细胞 单细胞测序技术 生殖发育疾病 单细胞全长转录组测序,组合条形码Tn5转座子插入测序 NA 单细胞转录组数据,空间分辨组织微环境数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 CBTi-seq 组合条形码Tn5转座子插入测序技术,兼容单细胞和空间分辨组织微环境分析
903 2025-11-13
FAM135B Deficiency Inhibits Cytotoxic T-Cell Activity in Triple-negative Breast Cancer by Blocking the IFI16-dependent STING Pathway
2025-Nov-11, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示FAM135B通过调控IFI16依赖性STING通路激活细胞毒性T细胞,影响三阴性乳腺癌免疫治疗疗效 首次发现FAM135B作为抗肿瘤免疫调节因子,通过竞争性阻断TRIM21介导的IFI16泛素化降解来激活STING通路 NA 探究三阴性乳腺癌免疫检查点阻断治疗反应差异的分子机制 三阴性乳腺癌患者样本和免疫细胞 癌症免疫学 三阴性乳腺癌 单细胞测序,功能实验 NA 单细胞测序数据,分子相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
904 2025-11-13
Multimodal learning enables chat-based exploration of single-cell data
2025-Nov-11, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 开发了名为CellWhisperer的人工智能模型和软件工具,用于通过自然语言对话探索单细胞数据 建立了转录组与其文本注释的多模态嵌入,通过对比学习连接基因表达与文本描述,实现自然语言交互式探索单细胞数据 NA 解决单细胞测序数据解释的挑战,实现交互式单细胞数据探索 单细胞RNA测序数据和文本注释 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序,对比学习 多模态嵌入模型,大语言模型 基因表达数据,文本数据 100万个RNA测序图谱 NA 单细胞RNA-seq NA NA
905 2025-11-13
Single-cell profiling reveals three endothelial-to-hematopoietic transitions with divergent isoform expression landscapes
2025-Nov-11, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了造血内皮细胞中三种不同的内皮-造血转化轨迹及其异构体表达差异 首次在卵黄囊和AGM区域识别出三种不同的造血内皮细胞亚群,并发现AGM区域造血内皮细胞具有更高的异构体复杂性 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限 探究造血内皮细胞向不同造血祖细胞分化的分子机制 小鼠胚胎卵黄囊和主动脉-性腺-中肾区域的造血内皮细胞 单细胞组学 造血发育 全长单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 卵黄囊和AGM区域的造血内皮细胞群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
906 2025-11-13
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2025-Nov-11, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 开发基于寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的多重蛋白质基因组分析方法,用于分析人类B细胞反应性 建立结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新工作流程,实现并行分析不同抗原特异性B细胞 需要优化抗原与链霉亲和素比例,稀有细胞检测灵敏度仍需提高 开发多重蛋白质基因组分析方法以解析B细胞对抗原的反应性 人类B细胞,特别是外周血中的稀有抗原特异性B细胞 单细胞多组学 传染病(SARS-CoV-2、登革热) 单细胞测序,流式细胞术,寡核苷酸标记 NA 单细胞多组学数据 人类外周血样本 NA 单细胞测序,流式细胞术 NA 寡核苷酸标记抗原组装与荧光标记抗原组装的双重标记方法
907 2025-11-13
Identification of mitochondria-related hub genes and immune associations in acute myocardial infarction: A bioinformatic analysis
2025-Nov-07, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过生物信息学分析识别急性心肌梗死中线粒体相关枢纽基因及其与免疫系统的关联 首次系统性地识别了5个与线粒体相关的AMI诊断枢纽基因,并揭示了这些基因与免疫细胞的关联机制 这是一项探索性研究,需要严格的外部验证才能考虑临床应用 探索急性心肌梗死中线粒体代谢与免疫反应的相互作用机制 急性心肌梗死患者的基因表达数据 生物信息学 心血管疾病 差异表达分析、富集分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞测序、实时定量PCR 机器学习、列线图模型 基因表达数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
908 2025-11-12
Periaortic lymphatic vessels protect against thoracic aortic dissection through mobilizing immune response
2025-Nov-11, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了主动脉周围淋巴管通过CXCL12-CXCR4信号通路招募免疫细胞,从而抑制胸主动脉夹层进展的保护机制 首次发现气管支气管淋巴结是胸主动脉的主要引流淋巴结,并阐明淋巴管通过CXCL12-CXCR4信号介导免疫反应在胸主动脉夹层中的保护作用 NA 探讨淋巴管在胸主动脉夹层发病机制中的作用 胸主动脉夹层患者组织样本和小鼠模型 NA 胸主动脉夹层 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪,组织透明化技术,荧光示踪剂 NA 基因表达数据,组织图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
909 2025-11-12
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,发现SLPI表达的AT2样细胞在肺腺癌侵袭边缘驱动肿瘤进展 首次识别出位于肿瘤侵袭边缘的SLPI表达AT2样细胞亚群,揭示了其通过Wnt通路激活和基质互作协调肺腺癌侵袭的空间机制 NA 阐明肺腺癌侵袭过程中的细胞类型、空间分布和功能互作机制 肺腺癌肿瘤微环境中的SLPI表达AT2样细胞、MRC1表达组织驻留巨噬细胞和癌症相关肌成纤维细胞 数字病理学 肺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,空间分布数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
910 2025-11-12
Unveiling the toxicological impact of cigarette smoke exposure on chronic obstructive pulmonary disease: integrated insights from network toxicology and multi-omics
2025-Nov-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究整合网络毒理学、多组学分析和实验验证,揭示香烟烟雾暴露通过特定化合物和枢纽基因导致慢性阻塞性肺疾病的发病机制 首次系统整合网络毒理学、多组学分析和实验验证,构建香烟烟雾诱导慢性阻塞性肺疾病的化合物-靶点-疾病网络 研究主要基于数据库预测和动物实验,需要进一步临床验证 阐明香烟烟雾暴露诱导慢性阻塞性肺疾病的系统毒理学机制 香烟烟雾中的有害化合物及其与慢性阻塞性肺疾病相关的基因靶点 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 网络毒理学, 多组学分析, 分子对接, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 随机森林(RF), 支持向量机递归特征消除(SVM-RFE), LASSO 基因组数据, 转录组数据 涉及93种香烟有害化合物的筛选和28个致病基因的鉴定 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
911 2025-11-12
PIP4K2A: A Novel CD8+ T Cell-Related Biomarker Associated with Lung Function Decline in COPD
2025-Nov-11, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,识别了与COPD中CD8+ T细胞相关的生物标志物,并构建了诊断模型 首次发现PIP4K2A作为CD8+ T细胞相关生物标志物与COPD肺功能下降显著相关 研究样本来源于公共数据库,临床验证样本规模有限 阐明CD8+ T细胞在COPD发病机制中的分子机制 COPD患者和健康对照者的肺组织样本 生物信息学 慢性阻塞性肺疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 生物信息学分析 LASSO回归, 线性回归 基因表达数据 从GEO数据库获取的COPD患者和对照样本,具体数量未明确说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
912 2025-11-12
STAHD: a scalable and accurate method to detect spatial domains in high-resolution spatial transcriptomics data
2025-Nov-10, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出一种名为STAHD的可扩展且准确的方法,用于检测高分辨率空间转录组数据中的空间域 结合图注意力自编码器和多层次k路图分割技术,将大图分解为紧凑子图并生成低维嵌入,提高了计算效率和聚类准确性 NA 开发能够处理大规模高分辨率空间转录组数据的空间域检测方法 人类和小鼠的空间转录组数据 空间转录组学 肿瘤微环境 空间转录组学 图注意力自编码器, 多层次k路图分割 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
913 2025-11-12
Meflin/ISLR is a meningeal cell-specific marker involved in the development of meninges and meningioma progression
2025-Nov-10, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
研究论文 本研究探讨Meflin/ISLR在脑膜发育和脑膜瘤进展中的表达模式及功能 首次揭示Meflin在脑膜发育早期表达,并发现其高表达与脑膜瘤WNT信号通路激活相关 Meflin在脑膜瘤进展中的具体分子机制仍需进一步研究 探究Meflin在脑膜发育和脑膜瘤病理生理学中的作用 小鼠胚胎脑膜、人类脑膜瘤样本 分子生物学 脑膜瘤 谱系追踪、单细胞RNA测序、基因表达分析 NA 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 Meflin报告基因小鼠系、人类脑膜瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
914 2025-11-12
CPE/HYOU1 axis-activated Hippo-YAP signaling pathway suppresses PANoptosis to facilitate osteosarcoma progression
2025-Nov-08, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组数据分析,鉴定出骨肉瘤中PANoptosis相关的预后生物标志物,并揭示了CPE/HYOU1轴通过激活Hippo-YAP信号通路抑制PANoptosis促进骨肉瘤进展的机制 首次发现CPE通过增强HYOU1蛋白稳定性并激活Hippo-YAP信号通路来抑制PANoptosis,从而促进骨肉瘤进展的新机制 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证 鉴定骨肉瘤中PANoptosis相关的预后生物标志物并阐明其下游调控机制 骨肉瘤细胞和肿瘤组织 生物信息学 骨肉瘤 单细胞转录组测序,批量RNA测序,免疫荧光,流式细胞术,western blot,异种移植肿瘤实验 预后特征模型 转录组数据,实验数据 公共数据库中的骨肉瘤样本数据 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
915 2025-11-12
KLF7 as a biomarker in the pre-metastatic state promotes colorectal liver metastasis via TGFβ autocrine signaling
2025-Nov-08, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过机器学习鉴定结直肠癌转移前状态细胞亚群,发现KLF7通过TGFβ自分泌信号促进肝转移 首次系统定义转移前状态细胞亚群PMS1和PMS2,并揭示KLF7作为关键生物标志物通过TGFβ自分泌信号驱动转移的机制 未明确说明样本规模和具体实验模型的局限性 鉴定结直肠癌转移前状态细胞的生物标志物并阐明其转移机制 结直肠癌细胞系、转移前状态细胞亚群 生物信息学 结直肠癌 机器学习、生物信息学分析、双荧光素酶报告实验、体外和体内实验 机器学习模型 RNA测序数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 NA NA bulk RNA-seq, single-cell sequencing, spatial transcriptomics NA NA
916 2025-11-12
Oligo-CALL: A next-generation barcoding platform for studying resistance to targeted therapy
2025-Nov-07, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 开发了一种名为Oligo-CALL的新型细胞条形码平台,用于研究靶向治疗耐药性 开发了Oligo-CALL平台,实现了高效的谱系追踪、活克隆分离以及与单细胞RNA测序的无缝整合 NA 研究靶向治疗耐药性的分子机制和谱系演化 肺癌细胞 单细胞多组学 肺癌 CRISPR-based cellular barcoding, single-cell RNA sequencing NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 Oligo-CALL 寡核苷酸诱导的CRISPR转录激活因子辅助谱系标记平台
917 2025-11-12
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 提出一种名为TransST的迁移学习框架,用于提升空间转录组数据的细胞水平异质性推断 通过迁移学习自适应利用外部细胞标记信息来改善空间转录组数据分析 NA 开发空间转录组数据分析方法以更可靠地提取生物信号 空间转录组数据 生物信息学 乳腺癌 空间转录组学 迁移学习框架 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
918 2025-11-12
CellSP enables module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Nov-05, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本文提出了CellSP计算框架,用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 引入了'基因-细胞模块'概念,能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布的基因集 NA 开发能够识别和解释亚细胞转录空间分布功能模式的工具 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 空间转录组学 肾脏癌,阿尔茨海默病 空间转录组学 计算框架 空间转录组数据 多种组织和技术的数据 NA 空间转录组学 NA NA
919 2025-11-12
Multi-Omics Advances in Major Depressive Disorder for Molecular Insights, Biomarker Discovery, and Therapeutic Development
2025-Nov-05, Aging and disease IF:7.0Q1
综述 本文综述了多组学技术在重度抑郁症研究中的最新进展,包括分子机制解析、生物标志物发现和治疗方法开发 整合多组学方法与计算系统生物学,将多组学信号转化为候选生物标志物和机制导向疗法 讨论了当前研究的局限性和转化优先事项 通过多组学方法解析重度抑郁症的多因素病因学并开发精准精神病学方法 重度抑郁症的分子机制、生物标志物和治疗方法 自然语言处理 精神疾病 GWAS、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 AI驱动的网络建模 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
920 2025-11-12
Serum response factor is essential for endometrial function and prevention of inflammatory fibrosis
2025-Nov-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究揭示血清反应因子(SRF)对子宫内膜功能和防止炎症性纤维化的重要作用 首次发现SRF在子宫内膜中的关键功能及其在子宫内膜异位症中的失调机制 动物模型与人类疾病的差异可能限制结果的直接转化应用 探究SRF在子宫内膜功能和生殖成功中的分子机制 人类子宫内膜异位症患者组织、人子宫内膜基质细胞、条件性基因敲除小鼠 生殖医学 子宫内膜异位症 免疫组织化学分析、RNA干扰、单细胞RNA测序 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、组织学图像 人类子宫内膜异位症患者组织样本和基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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