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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2025-11-14 |
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2025-Nov-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0940
PMID:41231245
|
研究论文 | 开发了CanSig基准测试工具,用于评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 开发了首个综合评估单细胞转录组特征发现方法可重复性的基准测试框架 | 仅评估了13种方法在12个数据集上的表现,覆盖的癌症类型和方法数量有限 | 建立标准化框架评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 单细胞RNA测序数据和癌症细胞状态发现方法 | 生物信息学 | 多癌种(胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤、皮肤鳞状细胞癌) | 单细胞RNA测序 | 多种整合方法(包括Harmony、BBKNN、fastMNN等) | 单细胞转录组数据 | 185名患者的174,000个恶性细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 862 | 2025-11-14 |
Insulin production is sustained during DNA damage-mediated senescence in adult human beta cells
2025-Nov-13, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06603-3
PMID:41231256
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研究论文 | 本研究探讨DNA损伤介导的衰老对成人胰岛β细胞胰岛素产生的影响 | 首次证明在DNA损伤介导的衰老过程中,成人胰岛β细胞仍能维持胰岛素产生能力 | 研究主要使用体外诱导的衰老模型,体内验证仍需进一步研究 | 阐明DNA损伤相关衰老对胰岛β细胞胰岛素产生的影响机制 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5人β细胞系 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | Western blot, ELISA, 流式细胞术, FACS, 免疫荧光染色 | NA | 蛋白质印迹数据, 酶联免疫数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 | 人类供体胰岛、EndoC-βH5细胞系及公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | Humanislets.com蛋白质组学数据库和Human Pancreas Analysis Program单细胞RNA测序数据库 |
| 863 | 2025-11-14 |
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0966
PMID:41223328
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和肿瘤芯片技术,识别出一种产生细胞外基质的癌症相关成纤维细胞亚群(ECM-myCAFs),该亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2驱动三阴性乳腺癌化疗耐药 | 首次识别出特定的ECM-myCAF亚群在化疗耐药中的关键作用,并揭示SRC激活和G0S2上调是介导耐药的新机制 | 研究主要基于体外模型,需要进一步体内验证;机制细节如ECM-myCAFs分泌的具体因子尚未完全阐明 | 解析三阴性乳腺癌化疗耐药机制,识别驱动耐药的关键CAF亚群 | 三阴性乳腺癌患者样本和肿瘤芯片模型中的癌细胞与癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 肿瘤芯片技术, 高级细胞成像, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 三阴性乳腺癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 864 | 2025-11-14 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
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研究论文 | 开发了跨物种整合癌症细胞状态的深度学习工具scVital | 使用变分自编码器和判别器创建物种无关的潜在空间,并开发了潜在空间相似性评分新指标 | NA | 克服物种间比较的生物批次效应,识别跨物种共享的细胞状态 | 基因工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌细胞状态 | 机器学习 | 胰腺癌,肺癌,肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 865 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2025-Nov-12, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示老年脓毒症中骨髓免疫重塑的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘老年脓毒症的骨髓免疫图谱,发现HSC-髓系细胞间Lgals9-Cd44信号通路的通讯障碍是免疫衰竭的关键机制 | 临床可行性和安全性尚未验证,样本量较小(每组2-3只小鼠) | 探究老年脓毒症免疫功能障碍的分子机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,CellChat细胞通讯分析,Transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 10只小鼠(Y-Sham组2只,Y-CLP组3只,A-Sham组2只,A-CLP组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 866 | 2025-11-14 |
A phenotype-driven data and drug repurposing strategy used to identify potential treatments targeting chondrocyte hypertrophy in osteoarthritis
2025-Nov-11, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118773
PMID:41223767
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研究论文 | 本研究通过表型驱动的数据和药物重定位策略,结合单细胞转录组学数据识别能够逆转骨关节炎中软骨细胞肥大表型的潜在治疗方法 | 首次将单细胞转录组学数据与药物重定位策略相结合,应用特征逆转原理来识别针对软骨细胞肥大表型的潜在治疗药物 | 研究主要基于体外实验和离体组织验证,尚未进行体内动物模型或临床试验验证 | 开发针对骨关节炎中软骨细胞肥大表型的有效药物治疗策略 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织外植体 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,体外细胞培养,离体组织培养 | 特征逆转分析,基因表达速度分析 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 867 | 2025-11-14 |
"Oxygen tone" drives stage-specific OPC phenotypes for cell-based stroke therapy
2025-Nov-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102709
PMID:41223837
|
研究论文 | 本研究探索缺氧如何影响缺血性中风后少突胶质前体细胞(OPCs)的表型特征 | 揭示了氧浓度依赖的OPC表型可同时促进血管生成和髓鞘再生 | NA | 探索缺氧环境对OPC功能特性的影响及其在中风细胞治疗中的潜力 | 少突胶质前体细胞(OPCs) | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 868 | 2025-11-14 |
Single Cell Transcriptomics of Traditional Chinese Medicine Bioactives: Mapping Immune, Neural and Hepatic Responses
2025-Nov-10, Zhongguo ying yong sheng li xue za zhi = Zhongguo yingyong shenglixue zazhi = Chinese journal of applied physiology
DOI:10.62958/j.cjap.2025.028
PMID:41207694
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术解析中药活性成分对免疫、神经和肝脏系统的细胞特异性反应 | 首次在单细胞分辨率揭示中药活性成分的细胞特异性药效学机制,发现传统批量转录组学研究无法检测的细胞类型特异性反应 | 研究仅使用小鼠模型,样本数量相对有限,需要进一步人体验证 | 阐明中药活性成分在免疫、神经和肝脏系统中的细胞特异性药理作用机制 | 小鼠脾脏、海马体和肝脏组织分离的单细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫荧光 | Seurat,CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过42,000个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 869 | 2025-11-14 |
Descendants of hypertrophic chondrocytes promote angiogenesis by secreting THBS4 during bone growth and injury repair
2025-Nov-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00469-2
PMID:41207902
|
研究论文 | 本研究揭示了肥大软骨细胞后代通过分泌THBS4促进血管生成在骨骼生长和损伤修复中的关键作用 | 首次发现肥大软骨细胞后代中特定细胞亚群(PADs)通过分泌THBS4调控血管生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肥大软骨细胞转化在骨骼发育和修复中的病理生理意义 | 小鼠肥大软骨细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,组织透明化,体外细胞培养 | Col10a1-Cre; R26基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠股骨和跖骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 870 | 2025-11-14 |
Unveiling prognostic biomarkers and immunotherapeutic insights in prostate cancer through multi-omics and machine learning
2025-Nov-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03363-z
PMID:41207909
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别前列腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 整合单细胞和bulk转录组数据,开发包含14种算法和162种算法组合的机器学习框架构建共识免疫预后特征 | NA | 评估前列腺癌相关基因的临床相关性和预后潜力 | 前列腺癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学分析 | 机器学习集成算法 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 871 | 2025-11-14 |
STAT3 regulates NK and NKT cell differentiation through C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1) in hyper-IgE syndrome
2025-Nov-10, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00323-1
PMID:41212476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了STAT3基因突变通过CX3CR1调控NK和NKT细胞分化在高IgE综合征中的作用机制 | 首次发现STAT3突变导致CX3CR1CD57 NK和NKT细胞群体增加,并通过CUT&Tag分析揭示突变STAT3增强与IL-4转录起始位点的结合 | STAT3突变的分子机制仍然复杂且未完全阐明,研究样本量有限 | 探究STAT3突变在高IgE综合征中导致免疫失调的分子机制 | STAT3突变患者、STAT3条件性敲除小鼠的免疫细胞(NK细胞、NKT细胞、CD4 T细胞) | 免疫学 | 高IgE综合征 | 单细胞测序, 流式细胞术, CUT&Tag分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 表观基因组数据 | STAT3突变患者和STAT3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 872 | 2025-11-14 |
MZT2B promotes malignant phenotypes in NSCLC cells by enhancing mitochondrial function and COX5B expression
2025-Nov-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08182-y
PMID:41213905
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研究论文 | 本研究揭示MZT2B通过增强线粒体功能和促进COX5B表达驱动非小细胞肺癌恶性进展的分子机制 | 首次发现MZT2B在NSCLC中的致癌作用及其通过调控线粒体功能和COX5B表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索NSCLC新型治疗靶点及MZT2B的致癌机制 | 非小细胞肺癌细胞系、临床组织标本和皮下异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, shRNA基因沉默, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 功能实验数据 | TCGA数据库NSCLC组织样本、多种NSCLC细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 873 | 2025-11-14 |
Distinct autoreactive CD19- plasma cell subsets accumulate in lupus-prone mice
2025-Nov-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65906-6
PMID:41213970
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术鉴定了狼疮易感小鼠中自身反应性CD19⁻浆细胞亚群的积累特征 | 首次发现自身反应性CD19⁻浆细胞亚群在狼疮发病中的关键作用,并揭示其独特的基因表达谱和来源途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 鉴定系统性红斑狼疮中致病性浆细胞亚群,为靶向治疗提供依据 | 狼疮易感小鼠和系统性红斑狼疮患者外周血 | 单细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, 遗传模型 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 狼疮易感小鼠模型和SLE患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 874 | 2025-11-14 |
Neutrophil-derived Il1r2 modulates inflammation and alleviates acute lung injury by promoting M2 macrophage polarization
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14278-4
PMID:41213982
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的Il1r2通过促进M2巨噬细胞极化调节炎症反应并缓解急性肺损伤的分子机制 | 首次发现中性粒细胞表达的Il1r2在急性肺损伤中通过促进M2巨噬细胞极化发挥抗炎作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索急性肺损伤的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blotting, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习, 基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 875 | 2025-11-14 |
Identification of T cell stress response state (TSTR) and key genes related to T cells in discoid lupus erythematosus
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23088-7
PMID:41214060
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研究论文 | 通过转录组和单细胞测序数据联合分析,鉴定盘状红斑狼疮中T细胞应激反应状态及相关关键基因 | 首次在DLE真皮中发现大量浸润的T细胞应激反应状态(TSTR),并通过多组学数据交叉验证筛选出CXCL13等9个关键疾病基因 | 需要进一步实验验证这些关键基因在DLE发病机制中的具体功能 | 深入探索盘状红斑狼疮的发病机制和生物标志物 | 盘状红斑狼疮患者的T细胞 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,WGCNA分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 876 | 2025-11-14 |
Development and validation of a novel nerve-related prognostic model for gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15202-9
PMID:41214583
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研究论文 | 基于大量和单细胞RNA测序数据开发并验证了一种新型的胃癌神经相关预后模型 | 首次结合大量和单细胞RNA测序数据构建神经相关风险评分模型,系统分析神经相关基因在胃癌中的预后价值和肿瘤微环境特征 | 样本量相对有限,单细胞测序仅包含8例患者,需要更大规模验证 | 开发胃癌神经相关预后模型并评估其临床价值 | 胃癌患者组织样本和公开数据库中的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,大量RNA测序,LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据,临床数据 | 8例胃癌患者的匹配癌组织和癌旁组织(单细胞测序),TCGA和GEO数据库中的大量数据 | NA | 单细胞RNA-seq,大量RNA-seq | NA | NA |
| 877 | 2025-11-14 |
Integrated clinical and single-cell profiling of BCMA CAR-T therapy in relapsed/refractory multiple myeloma
2025-Nov-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07106-w
PMID:41214679
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研究论文 | 本研究评估了自体BCMA CAR-T细胞疗法在复发/难治性多发性骨髓瘤患者中的安全性和有效性,并通过单细胞分析揭示了CAR-T细胞异质性与临床结局的关系 | 首次结合临床数据和单细胞测序分析本地生产的BCMA CAR-T疗法,揭示了CD8⁺ T细胞亚群功能特化、克隆适应性演变与免疫调节在治疗反应中的关键作用 | 样本量较小(仅6例患者),单臂试验设计缺乏对照组 | 评估本地生产的BCMA CAR-T细胞疗法在复发/难治性多发性骨髓瘤患者中的安全性和有效性 | 6例复发/难治性多发性骨髓瘤患者 | 单细胞分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据,临床数据 | 6例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 878 | 2025-11-14 |
Targeting bone marrow adipocyte-driven fatty acid metabolism to overcome drug resistance in lung cancer bone metastasis
2025-Nov-10, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03792-2
PMID:41214690
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研究论文 | 本研究探讨骨髓脂肪细胞通过调节脂肪酸代谢促进肺癌骨转移耐药性的机制,并开发了靶向纳米颗粒治疗策略 | 首次揭示骨髓脂肪细胞驱动脂肪酸代谢重编程在肺癌骨转移耐药中的作用,并开发了具有骨靶向功能的酸性微环境响应型纳米颗粒递送系统 | 研究主要基于体外共培养模型和单细胞测序,缺乏大规模临床验证 | 克服肺癌骨转移中的药物耐药性问题 | 肺癌骨转移微环境中的骨髓脂肪细胞和转移性肺癌细胞 | 肿瘤代谢 | 肺癌 | 单细胞测序, 体外共培养, 纳米颗粒递送系统 | NA | 单细胞测序数据, 体外实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 879 | 2025-11-14 |
Analysis of the associations between DNA methylation and clinical features reveals the potential oncogenic effect of CFAP52 in esophageal squamous cell cancer
2025-Nov-10, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03934-4
PMID:41214700
|
研究论文 | 本研究通过分析DNA甲基化与临床特征的关联,揭示了CFAP52在食管鳞癌中的潜在致癌作用 | 首次系统揭示DNA甲基化与食管鳞癌性别差异和饮酒习惯的关联,并发现CFAP52作为新的癌基因通过影响花生四烯酸代谢促进肿瘤进展 | 研究主要基于TCGA数据库分析,实验验证主要在细胞水平进行,缺乏体内动物模型验证 | 探索DNA甲基化在食管鳞癌发展中的潜在作用机制 | 食管鳞癌患者组织样本、细胞系和公共数据库数据 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | DNA甲基化分析,RNA-seq,单细胞RNA-seq,Western blot,UPLC-MS/MS,免疫组化 | Cox回归分析,共识聚类,CIBERSORTx免疫细胞分析 | 基因组数据,转录组数据,蛋白质数据,代谢组数据 | TCGA ESCA队列数据,多个GEO数据集(GSE53624,GSE160269,GSE203115) | Illumina | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | Seurat软件包用于单细胞RNA-seq数据分析 |
| 880 | 2025-11-14 |
Identification and validation of stemness-related gene signatures to predict prognosis and immune infiltration in osteosarcoma reveals a critical role for S100A13
2025-Nov-08, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14939-7
PMID:41206435
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别骨肉瘤中具有高干性特征的肿瘤细胞,建立预后模型并鉴定S100A13为关键基因 | 首次在骨肉瘤中通过单细胞RNA测序识别高干性肿瘤细胞群,并建立基于干性特征的预后模型,发现S100A13在骨肉瘤恶性进展和干性调控中的关键作用 | 研究样本量有限,功能验证仅在MG-63和HOS两种骨肉瘤细胞系中进行 | 探索骨肉瘤细胞干性特征与预后及免疫浸润的关系 | 骨肉瘤患者样本和骨肉瘤细胞系(MG-63和HOS) | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,功能验证实验(集落形成、肿瘤球形成、伤口愈合、Transwell迁移和侵袭实验) | 预后风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |