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当前共找到 940 篇文献，本页显示第 841 - 860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2025-11-07 |
SLGCA: spatial cross-level graph contrastive autoencoder for multislice spatial domain identification and microenvironment exploration
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf574
PMID:41182757
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研究论文 | 提出一种基于跨层级图对比学习的空间转录组数据分析方法SLGCA，用于多切片空间域识别和微环境探索 | 采用双通道学习机制，结合基于空间邻域信息的局部层级对比学习和跨视图的全局信息对比学习 | NA | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,肝癌 | 空间转录组技术 | 图对比自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 842 | 2025-11-07 |
Cell Type-Specific Expression of Long Noncoding RNAs in Human Diabetic Kidneys Identifies TARID as a Key Regulator of Podocyte Function
2025-Nov-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0272
PMID:40902080
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术识别人类糖尿病肾脏中细胞类型特异性的长链非编码RNA，并发现TARID是调控足细胞功能的关键因子 | 首次在单细胞水平系统研究肾脏中lncRNA的细胞类型特异性表达，并发现TARID在足细胞中的关键功能 | 样本量较小（5名健康个体和6名DKD患者），需要在更大队列中验证发现 | 探索长链非编码RNA在糖尿病肾病中的细胞类型特异性表达和功能 | 人类肾脏样本（健康个体和糖尿病肾病患者） | 单细胞基因组学 | 糖尿病肾病 | 单核RNA测序，eQTL分析，GWAS，基因调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 11个肾脏样本（5健康+6糖尿病肾病） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 843 | 2025-11-07 |
The transcription factor LbYABBY1 of Limonium bicolor raises salt sensitivity by repressing the LbSAD2 pathway
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70560
PMID:41196280
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研究论文 | 本研究揭示了二色补血草转录因子LbYABBY1通过抑制LbSAD2通路负调控盐腺发育和盐敏感性的分子机制 | 首次发现LbYABBY1转录因子通过与LbKNAT7互作增强对LbSAD2的转录抑制，从而负调控盐腺发育 | NA | 探究LbYABBY1转录因子在盐腺发育和盐敏感性调控中的功能 | 二色补血草(Limonium bicolor)和拟南芥(Arabidopsis thaliana) | 植物分子生物学 | NA | RNA原位杂交, 启动子驱动GUS组织染色, 酵母双杂交, 分裂荧光素酶互补, GST pull-down | NA | 基因表达数据, 蛋白互作数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 844 | 2025-11-06 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-Nov-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
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研究论文 | 通过时间序列单细胞测序技术研究小鼠皮层放射状胶质细胞的谱系进展与细胞多样化机制 | 首次构建了皮层细胞谱系进展的全面分子图谱，揭示染色质可及性通过限制转录因子表达时序驱动细胞多样化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，人类皮层发育可能存在物种特异性差异 | 探索皮层细胞多样化的细胞内在程序机制 | 小鼠皮层放射状胶质细胞及其衍生细胞类型 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据 | 胚胎期和出生后多个发育阶段的小鼠皮层祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 845 | 2025-11-06 |
Neoadjuvant Immunotherapy Promotes the Formation of Mature Tertiary Lymphoid Structures in a Remodeled Pancreatic Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0387
PMID:40815230
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研究论文 | 本研究通过构建胰腺导管腺癌的空间多组学图谱，揭示了新辅助免疫治疗促进成熟三级淋巴结构形成及其在肿瘤微环境重塑中的作用 | 首次报道了新辅助免疫治疗在胰腺癌中促进成熟三级淋巴结构形成的空间特征，并发现了与患者生存改善相关的TLS特异性空间基因表达特征 | 研究样本量有限，且主要关注特定免疫治疗方案下的反应机制 | 探究三级淋巴结构在胰腺导管腺癌免疫治疗中的作用及其空间分布特征 | 接受新辅助免疫治疗联合治疗的胰腺导管腺癌患者肿瘤组织及肿瘤邻近淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,无监督基因表达矩阵分解 | 机器学习分类模型,无监督学习 | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,成像质谱流式 | NA | NA |
| 846 | 2025-11-06 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
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研究论文 | 提出一种通用参考数据和方法选择策略CAMUS，用于跨数据集细胞类型注释 | 开发了首个通用参考数据和方法选择策略，显著提升细胞类型注释准确性 | NA | 提高单细胞数据中细胞类型注释的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 672对跨物种scRNA-seq数据集，80个scST数据集，5个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 847 | 2025-11-06 |
Evaluation of Proton Minibeam Radiotherapy on Antitumor Immune Responses in a Rat Model of Glioblastoma
2025-Nov-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0902
PMID:40833465
|
研究论文 | 评估质子微束放疗在胶质母细胞瘤大鼠模型中对抗肿瘤免疫反应的影响 | 首次在临床前胶质母细胞瘤模型中系统研究质子微束放疗的免疫调节作用，发现其优于传统质子疗法的免疫激活特性 | 研究仅限于大鼠模型，尚未在人体验证；单细胞转录组学分析可能未完全捕捉所有免疫细胞亚群 | 探索质子微束放疗对胶质母细胞瘤免疫反应的调节机制 | 胶质母细胞瘤原位大鼠模型 | 放射肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学，质子微束放疗 | NA | 基因表达数据，免疫细胞密度数据 | 胶质母细胞瘤大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 848 | 2025-11-06 |
Improving predictive accuracy in multiple myeloma using a plasma cell profile derived from single-cell RNA sequencing
2025-Nov-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.287586
PMID:40438979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤肿瘤细胞异质性，发现了一个侵袭性细胞亚群并建立了七基因标志物的整合风险分层模型 | 首次在单细胞分辨率下识别出多发性骨髓瘤中具有染色体不稳定性和高耐药性的侵袭性细胞亚群，并开发了基于七基因标志物的新型风险分层模型 | 样本量相对较小（12例新诊断患者），需要在更大队列中进一步验证 | 改善多发性骨髓瘤的风险分层和预后预测准确性 | 多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，数字PCR | Cox比例风险模型，整合风险分层模型 | 单细胞转录组数据 | 12例新诊断多发性骨髓瘤患者，并在5个独立数据集中验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 849 | 2025-11-06 |
Integrative Transcriptomic Analysis Decodes the Interplay Between Aging, Senescence, and Cancer
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70178
PMID:40899323
|
研究论文 | 通过整合基因组学、表观基因组学及单细胞转录组学分析，揭示细胞衰老与肿瘤发生之间的反向转录特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较正常衰老、细胞衰老和癌症的特征，发现648个衰老依赖性衰老相关共调控模块 | 研究主要关注17种组织，可能未覆盖所有组织类型；机制研究仍需进一步实验验证 | 解析衰老、细胞衰老与癌症之间的相互作用机制 | 17种人体组织中的内皮细胞、T细胞、上皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 基因组学、表观基因组学、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | 17种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 850 | 2025-11-06 |
Increased AIF-1-mediated p38 MAPK phosphorylation in the mid-secretory endometrium impairs endometrial receptivity in women with recurrent implantation failure
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf174
PMID:41003697
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研究论文 | 本研究探讨了同种异体移植炎症因子-1（AIF-1）通过p38 MAPK磷酸化途径损害复发性种植失败患者子宫内膜容受性的机制 | 首次揭示AIF-1在子宫内膜基质细胞中通过p38 MAPK磷酸化途径抑制细胞增殖和蜕膜化，从而降低子宫内膜容受性的新机制 | AIF-1在子宫内膜巨噬细胞在胚胎植入过程中的作用尚不明确 | 研究AIF-1对复发性种植失败患者子宫内膜容受性的影响机制 | 复发性种植失败患者和生育能力正常女性的子宫内膜组织、人子宫内膜基质细胞、子宫内膜基质细胞系、CD-1小鼠 | 生殖医学 | 复发性种植失败 | 单细胞RNA测序、定量PCR、Western blot、免疫组织化学、免疫荧光分析、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像数据 | 18例RIF患者、18例对照患者、30例不同月经周期阶段的额外对照患者、CD-1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 851 | 2025-11-06 |
Identifying candidate genes for spermatogenic failure and predicting ICSI outcomes using single-cell RNA sequencing and protein-protein interaction networks
2025-Nov-01, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deaf186
PMID:41033661
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和蛋白质-蛋白质相互作用网络，通过机器学习框架识别精子发生障碍候选基因并预测ICSI治疗结局 | 首次将单细胞转录组数据与PPI网络结合，利用机器学习算法同时实现基因优先排序和临床结局预测 | 训练数据依赖文献整理和数据库标注，可能存在错误分类或注释偏差；缺乏实验验证；外部队列样本量有限且多样性不足 | 改进精子发生障碍的基因优先排序方法并预测ICSI治疗结局 | 精子发生障碍患者（包括无精子症、弱精子症、畸形精子症） | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 随机森林, Node2Vec | 单细胞转录组数据, 蛋白质相互作用数据, 临床数据 | 34名精子发生障碍亚型患者 | NA | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 852 | 2025-11-06 |
Single-Cell Transcriptomics Identifies Novel Prognostic Signatures in HNSCC Immunotherapy Response
2025-Nov, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70171
PMID:40791099
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析头颈鳞状细胞癌免疫治疗反应，开发预后风险分层模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据开发LASSO-Cox风险分层模型，识别治疗前后免疫细胞亚群变化 | 样本量较小（仅3例患者），需更大队列验证 | 分析HNSCC免疫微环境变化并建立免疫治疗预后预测模型 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 单细胞转录组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据 | 3例HNSCC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 853 | 2025-11-06 |
Deciphering genetic associations with blood pressure in peripheral blood mononuclear cells through single-cell transcriptomic profiling
2025-Nov, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-025-02344-3
PMID:40877473
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示外周血单个核细胞中与血压相关的遗传关联 | 首次在14种不同免疫细胞类型中系统识别血压相关基因，并发现ERAP2基因在CD8+T细胞和自然杀伤细胞中的显著异常表达 | 样本量相对有限（18名个体），需要在更大规模人群中验证 | 识别免疫细胞中与血压相关的功能基因 | 外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，全基因组关联研究，基于汇总数据的孟德尔随机化 | SMR方法 | 单细胞转录组数据 | 18名个体（10名主要研究+8名验证），总计140,613个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 854 | 2025-11-05 |
Immune cell quantification of in situ inflammation partitions human lupus nephritis into mechanistic subtypes
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192669
PMID:40906524
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研究论文 | 通过免疫细胞定量分析将人类狼疮性肾炎划分为机制亚型 | 使用高维共聚焦显微镜、空间转录组学和计算机视觉技术量化免疫细胞群体，首次发现狼疮性肾炎和肾移植排斥反应中免疫细胞亚群形成相同的独特生态位 | 样本量相对有限（54例活检组织），研究结果需要更大规模验证 | 解析人类狼疮性肾炎的炎症机制和异质性 | 狼疮性肾炎和肾移植排斥反应的肾脏活检组织 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 高维共聚焦显微镜, 空间转录组学, 计算机视觉 | 计算机视觉技术 | 图像, 空间转录组数据 | 54例去标识化肾脏活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 855 | 2025-11-05 |
DISSyphilis and the Risk of HIV Infection: A Mendelian Randomization Study
2025-Nov, AIDS research and human retroviruses
IF:1.5Q4
DOI:10.1089/AID.2024.0005
PMID:39086230
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析评估梅毒对HIV感染的因果效应 | 首次使用孟德尔随机化方法证实梅毒与HIV感染之间的直接因果关系，并发现RPAIN基因变异在疾病进展中的关键作用 | 研究依赖于公开数据库的基因组数据，样本特征和人群异质性可能影响结果推广 | 评估梅毒对HIV感染的因果效应及潜在分子机制 | 梅毒和HIV感染相关的基因组数据及基因表达数据 | 生物信息学 | HIV感染/梅毒 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 基因组关联分析 | 加权中位数, MR Egger, 逆方差加权 | 基因组数据, 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库和基因组关联研究获取的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 856 | 2025-11-05 |
BDNF as a Key Mediator in Eosinophilic Inflammation in CRSwNP: Insights From Transcriptomic and Functional Analysis
2025-Nov, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23628
PMID:40600933
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研究论文 | 本研究通过转录组学和功能分析揭示了BDNF在慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）中作为嗜酸性粒细胞炎症关键介质的作用机制 | 首次在CRSwNP中系统阐明BDNF通过上皮细胞-嗜酸性粒细胞相互作用驱动嗜酸性炎症的分子机制 | 样本量相对有限（23例组织样本和95例鼻腔分泌物），且为观察性研究 | 探究BDNF在CRSwNP嗜酸性炎症中的调控作用和功能机制 | 鼻腔黏膜组织、鼻腔分泌物、原代人鼻上皮细胞和嗜酸性粒细胞 | 生物医学研究 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA测序, ELISA, 免疫荧光染色, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质定量数据, 细胞功能数据 | 23例鼻腔黏膜样本和95例鼻腔分泌物样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 857 | 2025-11-05 |
Single-cell transcriptome atlas and genome-wide Mendelian randomization reveal chemokine involvement in diverse immune cells in type 2 diabetes
2025-Nov, International journal of obesity (2005)
DOI:10.1038/s41366-025-01846-x
PMID:40684027
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱和全基因组孟德尔随机化分析揭示趋化因子在2型糖尿病多种免疫细胞中的参与机制 | 整合孟德尔随机化、动物模型验证和单细胞RNA测序构建2型糖尿病免疫病理中趋化因子信号传导的系统级框架 | 研究主要基于小鼠模型和外周血单核细胞，需要进一步在人类组织和更多细胞类型中验证 | 阐明趋化因子在2型糖尿病免疫失调中的因果作用和细胞特异性机制 | 2型糖尿病相关免疫细胞和趋化因子信号通路 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 血清学数据 | 链脲佐菌素诱导的小鼠2型糖尿病模型的外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 858 | 2025-11-05 |
Multi-omics integration reveals key miRNAs, immune inflammation, and signaling pathways in Alzheimer's disease: Implications for targeted therapy
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147874
PMID:41005404
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示阿尔茨海默病中关键miRNAs、免疫炎症和信号通路的作用机制 | 整合三种组学数据集识别出AD相关关键miRNAs和信号通路，并提出免疫调节与神经再生相结合的治疗框架 | 候选miRNAs对成熟神经元标志物作用有限，需要合适的神经元环境才能诱导神经元分化 | 阐明阿尔茨海默病的分子机制并探索靶向治疗策略 | 阿尔茨海默病患者的多组学数据及神经元细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | miRNA-seq, RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 三种组学数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 859 | 2025-11-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals LGALS9+ epithelial and COMP+ stromal cell crosstalk driving keratoconus pathogenesis
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147969
PMID:41022233
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示圆锥角膜发病机制中LGALS9+上皮细胞与COMP+基质细胞的相互作用 | 首次识别出圆锥角膜特异性细胞亚群——LGALS9阳性角膜上皮细胞和COMP阳性角膜基质细胞，并发现它们通过LGALS9-CD44/CD45和血小板反应蛋白信号通路形成促纤维化和促炎症网络 | 样本量较小（5例患者和5例对照），需要更大规模研究验证发现 | 研究圆锥角膜的细胞景观，揭示导致疾病进展的关键病理细胞群和信号通路 | 圆锥角膜患者和健康对照者的角膜组织 | 单细胞组学 | 圆锥角膜 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 免疫荧光, 蛋白质印迹 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质数据 | 5例圆锥角膜患者和5例健康对照的角膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 860 | 2025-11-05 |
Comprehensive single-cell analysis reveals mast cells' roles in cancer immunity
2025-Nov, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03590-y
PMID:41073552
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能多样性及其对癌症免疫的影响 | 首次在15种实体瘤中系统鉴定出10种肥大细胞状态，发现具有抗原呈递功能的C7-HLA-DR簇可增强免疫治疗效果 | 研究样本量相对有限（264名患者），未涉及所有癌症类型 | 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的功能多样性及其对免疫治疗的影响 | 15种实体瘤中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 264名患者的385个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |