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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-11-08 |
PA2G4 in CAFs promotes biochemical recurrence of prostate cancer via H3K18la
2025-Nov-04, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01485-9
PMID:41189032
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定前列腺癌相关成纤维细胞乳酸代谢特征并建立预后指数 | 首次发现CAFs通过乳酸代谢影响前列腺癌进展,建立新型乳酸代谢相关临床预后指数LMCAFCPI,并揭示PA2G4通过抑制H3K18la调控前列腺癌增殖转移的新机制 | NA | 探索前列腺癌相关成纤维细胞通过乳酸代谢影响前列腺癌进展的机制并开发预后工具 | 前列腺癌相关成纤维细胞和前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习,CUT-TAG测序 | 机器学习模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 822 | 2025-11-08 |
Neutrophil extracellular traps regulate LDHA expression to promote colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07174-y
PMID:41184884
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞胞外诱捕网通过调控LDHA表达促进结直肠癌肝转移的机制 | 首次发现NETs通过PI3K/AKT通路调控糖代谢关键酶LDHA表达促进结直肠癌转移 | NA | 探索中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌肝转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞、裸鼠肝脏异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 823 | 2025-11-08 |
Fragile X mental retardation 1 gene FMR1 promotes proliferation, migration, and invasion of gastric cancer cells via c-MYC
2025-Nov-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07140-8
PMID:41184982
|
研究论文 | 本研究探讨FMR1基因通过c-MYC信号通路促进胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的机制 | 首次揭示FMR1在胃癌中通过稳定c-MYC蛋白促进肿瘤恶性表型的新机制 | 研究主要基于体外实验和数据库分析,需要更多体内实验验证 | 阐明FMR1基因在胃癌发生发展中的作用机制 | 胃癌细胞系和临床胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | qRT-PCR, Western blotting, 免疫组化, 单细胞转录组学, 免疫共沉淀, ELISA | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | TCGA队列和临床样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | TIMER2.0平台, TISIDB数据库, inferCNV分析工具 |
| 824 | 2025-11-08 |
GCNLA: Inferring Cell-Cell Interactions From Spatial Transcriptomics With Long Short-Term Memory and Graph Convolutional Networks
2025-Nov, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3572383
PMID:40402695
|
研究论文 | 提出一种基于图卷积网络和长短期记忆注意力模块的GCNLA网络架构,用于从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | GCNLA不仅能学习细胞的空间结构,还能捕获远端细胞间的相互作用信息,注意力模块进一步提取和增强与细胞间相互作用相关的特征 | NA | 从空间转录组数据推断细胞间相互作用 | 细胞间相互作用 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络(GCN), 长短期记忆网络(LSTM) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | seqFISH, MERFISH | NA |
| 825 | 2025-11-08 |
Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.002
PMID:40603206
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研究论文 | 本研究通过循环原位杂交技术结合空间转录组学,在系统性硬化症皮肤中发现并表征了新型成纤维细胞亚群及其致病作用 | 首次在单细胞分辨率下实现原位深度转录谱分析,发现SFRP2+网状真皮成纤维细胞和CCL19+非血管周成纤维细胞两个新型亚群 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 通过空间转录组学技术研究系统性硬化症皮肤中成纤维细胞亚群的分布特征和致病机制 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤组织 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 循环原位杂交,单细胞RNA测序 | BANKSY聚类算法 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 826 | 2025-11-08 |
Discovering Heterogeneous Leukocytes Subsets Associated With Alcoholic Steatohepatitis by scRNAseq Analysis
2025-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70448
PMID:41190282
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与酒精性脂肪性肝炎相关的异质性白细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统分析酒精性脂肪性肝炎中免疫白细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究酒精性肝病中免疫细胞类型的特异性反应 | 酒精性肝病诱导小鼠和健康对照小鼠的免疫白细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, SingleR | 单细胞转录组数据 | 酒精诱导和健康对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 827 | 2025-11-08 |
Matrix stiffness regulates profibrotic fibroblast differentiation and fibrotic niche activation in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.016
PMID:40579317
|
研究论文 | 本研究探讨基质硬度如何调节系统性硬化症中促纤维化成纤维细胞分化和纤维化生态位激活 | 首次揭示基质硬度通过机械转导驱动PI16+前体细胞向SFRP2+COMP+PU.1+肌成纤维细胞分化的机制 | 研究主要基于体外3D培养系统,需进一步体内验证 | 探究基质硬度对成纤维细胞转录状态和谱系分化的影响 | 系统性硬化症患者和健康人皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | SSc患者和健康人皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 828 | 2025-11-08 |
Diamond-Inspired DNA Hydrogel Based on Tetrahedral Framework Nucleic Acids for Burn Wound Healing
2025-Nov, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202509727
PMID:40817796
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于四面体框架核酸的钻石启发DNA水凝胶,用于促进烧伤创面愈合 | 首次利用四面体框架核酸构建具有钻石结构的DNA水凝胶,显著提升了机械强度并具备多重功能特性 | 研究主要在小鼠模型中进行,尚未在更大动物模型或临床试验中验证 | 开发一种具有增强机械性能和多重功能的新型DNA水凝胶用于烧伤创面治疗 | 烧伤创面愈合过程中的免疫微环境和细胞相互作用 | 组织工程与再生医学 | 烧伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 829 | 2025-11-08 |
Single-Cell Immune Signature and Response to Neoadjuvant Chemotherapy in BRCA1/2-Mutated Breast Cancer
2025-Nov, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00349
PMID:41197086
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征,并开发预测新辅助化疗反应的BRCA-IM模型 | 首次在单细胞水平揭示BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境图谱,并建立基于单细胞和bulk RNA-seq数据的免疫特征预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 探索BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征及其与新辅助化疗反应的关系 | BRCA1/2突变乳腺癌患者和BRCA野生型乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学 | BRCA-IM预测模型 | 基因表达数据, 病理数据 | 80例BRCA1/2携带者(新辅助化疗队列),40例BRCA1/2携带者和56例非携带者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 830 | 2025-11-07 |
DEHP promotes psoriasis via immune modulation and direct molecular interactions: Evidence from epidemiology, multi-omics, and structural simulation
2025-Nov-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.180723
PMID:41124907
|
研究论文 | 本研究通过流行病学分析、多组学整合和分子模拟揭示了DEHP通过免疫调节和直接分子相互作用促进银屑病的机制 | 首次提供人群水平的DEHP与银屑病关联证据,整合多组学数据识别核心基因,并通过分子模拟验证DEHP与蛋白的稳定结合 | 研究主要基于美国NHANES数据,样本代表性有限;机制验证主要依赖计算模拟,需要实验进一步证实 | 阐明环境污染物DEHP在银屑病发病机制中的作用 | 美国成年人群体、银屑病相关基因和蛋白、免疫细胞 | 多组学整合分析 | 银屑病 | 流行病学分析、转录组测序、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习、加权基因共表达网络分析 | 流行病学数据、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 1523名美国成年人 | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |
| 831 | 2025-11-07 |
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2025-Nov-06, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70154
PMID:41195968
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示莫格利珠单抗相关皮疹中抗淋巴瘤免疫反应的分子特征 | 首次在单细胞水平揭示MAR中残留恶性T细胞克隆的沉默状态及抗肿瘤免疫微环境特征 | 样本量较小(MAR组4例,CTCL组6例,健康对照组4例) | 对莫格利珠单抗相关皮疹进行全面的分子特征分析 | 皮肤活检样本(来自MAR患者、未经治疗的CTCL患者和健康对照) | 单细胞基因组学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 14例皮肤活检(4例MAR,6例CTCL,4例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 832 | 2025-11-07 |
TransGRN: a transfer learning-based framework for inferring gene regulatory networks across cell lines
2025-Nov-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3628564
PMID:41191474
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的跨细胞系基因调控网络推断框架TransGRN | 采用跨细胞系预训练策略,结合多源细胞系scRNA-seq数据与大型语言模型获取的生物学知识,整合基因表达谱与语义信息 | NA | 解决目标细胞类型调控数据稀缺情况下的基因调控网络推断问题 | 跨细胞系的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 迁移学习, 大型语言模型 | 基因表达数据, 语义信息 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 833 | 2025-11-07 |
Rapid clonal selection within early hematopoietic cell compartments presages outcome to ivosidenib combination therapy
2025-Nov-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027948
PMID:41191518
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了ivosidenib联合疗法在IDH1突变髓系肿瘤患者中早期克隆选择的动力学特征 | 首次结合高灵敏度单细胞基因分型和单细胞RNA测序技术,在治疗早期识别出具有复发风险的克隆选择过程 | 样本量较小(仅8例患者),需要更大规模研究验证 | 探究靶向治疗中克隆选择的动力学特征和分子机制 | 8例IDH1突变髓系肿瘤患者 | 单细胞组学 | 髓系肿瘤 | 单细胞基因分型, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 834 | 2025-11-07 |
From Gene to Scar: Proteome-Wide Causal Insights into Keloid Pathogenesis and Prevention
2025-Nov-05, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918251387987
PMID:41192836
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研究论文 | 通过大规模孟德尔随机化研究和单细胞RNA测序分析,系统评估血浆蛋白及生活方式因素对瘢痕疙瘩发病风险的因果影响 | 首次建立多层因果推断框架,整合蛋白质组学、表型组学和单细胞转录组学数据,在单细胞分辨率上验证RSPO3作为瘢痕疙瘩致病因子 | 研究样本量相对有限,仅包含30名患者的单细胞数据 | 识别瘢痕疙瘩的新型治疗靶点和可改变风险因素 | 瘢痕疙瘩患者和4,907种血浆蛋白及8,155种生活方式相关特征 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,中介分析 | 因果推断模型 | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 30名患者的194,366个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 835 | 2025-11-07 |
A Single-cell and Spatially Resolved Cell Atlas of Human Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf095
PMID:41191515
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和代谢组学技术构建了人类食管鳞状细胞癌的单细胞和空间分辨率细胞图谱 | 首次系统揭示了COL17A1+上皮细胞和POSTN+成纤维细胞亚群在肿瘤免疫抑制微环境中的关键作用及其相互作用机制 | NA | 阐明食管鳞状细胞癌免疫抑制微环境的分子特征和机制 | 人类食管鳞状细胞癌及匹配的非肿瘤组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学 | NA | 单细胞RNA序列数据,空间转录组数据,代谢组数据 | 一系列人类食管鳞状细胞癌及匹配非肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 836 | 2025-11-07 |
Adipocyte death promotes hepatic infiltration of S100A8+ macrophages and steatotic liver disease progression in mice
2025-Nov-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI190635
PMID:41178716
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研究论文 | 本研究揭示脂肪细胞死亡通过诱导S100A8+巨噬细胞肝脏浸润促进肝细胞脂质积累和代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现脂肪细胞死亡通过S100A8+巨噬细胞-CCN3-CD36轴驱动肝脏脂肪变性的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究脂肪细胞死亡如何促进肝脏脂肪积累和MASLD进展 | 基因修饰小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | bulk RNA-Seq, single-cell RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 837 | 2025-11-07 |
Elucidating the role of SIRT2 in hepatocellular carcinoma through multi-omics and deep learning
2025-Nov-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03879-0
PMID:41182638
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和深度学习探讨SIRT2在肝细胞癌中的作用机制 | 首次结合铜死亡机制、单细胞测序、空间转录组和深度学习生存神经网络构建肝细胞癌预后模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需实验验证 | 阐明SIRT2在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌组织样本和相关的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA测序, 深度学习 | DeepSurv神经网络 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 838 | 2025-11-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
|
研究论文 | 本研究探讨了18q染色体缺失如何通过改变TGFβ信号通路影响人胚胎干细胞中前后神经外胚层命运决定 | 首次揭示了18q缺失通过干扰TGFβ信号通路导致前后神经外胚层命运决定失衡的具体机制 | 研究仅针对体外培养的干细胞模型,未验证在体内环境中的表现 | 探究染色体异常对人多能干细胞分化潜能的影响机制 | 人胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达时序分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 具有复杂核型的人胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 839 | 2025-11-07 |
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70018
PMID:40044625
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研究论文 | 本研究探讨miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡、炎症和氧化应激在骨关节炎中的作用机制 | 首次发现miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡参与骨关节炎发病机制 | 铁死亡在OA中的具体作用和机制仍需进一步研究 | 探索骨关节炎的新型治疗策略 | C28/I2细胞、miR-140-3p、CILP蛋白、铁死亡相关基因 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 细胞系研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 840 | 2025-11-07 |
Current trends in single-cell RNA sequencing applications in diabetes mellitus
2025-Nov, FEBS open bio
IF:2.8Q3
DOI:10.1002/2211-5463.70061
PMID:40537978
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综述 | 总结单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新进展和应用 | 聚焦单细胞RNA测序技术在糖尿病研究中的最新应用趋势 | NA | 探索糖尿病发病机制并寻求新的诊断和治疗方法 | 人类胰岛细胞和免疫细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |