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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 821 | 2025-11-09 |
Globotriaosylceramide Gb3 Influences Wound Healing and Scar Formation by Orchestrating Fibroblast Heterogeneity
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509733
PMID:40810720
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研究论文 | 本研究系统探讨了globotriaosylceramide (Gb3)通过调控成纤维细胞异质性影响伤口愈合和瘢痕形成的机制 | 发现了HEXB-Gb3-FGF2调控轴在成纤维细胞表型可塑性中的新作用机制 | 研究主要基于特定烧伤模型,在其他类型伤口中的适用性需进一步验证 | 阐明Gb3在皮肤再生过程中的功能作用及其调控机制 | 皮肤成纤维细胞、浅二度烧伤和深二度烧伤临床标本 | 单细胞组学 | 皮肤烧伤 | 单细胞RNA测序, 空间组学, 脂质组学, 组织学评估 | NA | 单细胞转录组数据, 空间组学数据, 脂质组学数据, 组织学图像 | 临床烧伤标本(浅二度和深二度烧伤) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 822 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Redefines Macrophage Heterogeneity and Function in Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70107
PMID:41204881
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综述 | 本文综述单细胞测序技术在皮肤伤口愈合研究中揭示巨噬细胞异质性和功能多样性的进展 | 通过单细胞测序技术系统揭示巨噬细胞在伤口愈合过程中的异质性、功能多样性及动态变化特征 | NA | 阐明巨噬细胞在皮肤伤口愈合过程中的细胞异质性和功能作用 | 皮肤伤口愈合过程中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤伤口愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 823 | 2025-11-08 |
Elucidating cardiomyocyte state transitions in zebrafish heart development using transcriptome dynamics
2025-Nov-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152736
PMID:41110187
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型分析心脏发育过程中的转录组动态,揭示了心肌细胞状态转变的关键机制 | 首次通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq分析,识别出M5模块在心肌细胞状态转变中的关键作用,并发现smtnl1作为枢纽基因 | 研究仅聚焦于斑马鱼胚胎发育早期阶段(24-48 hpf),未验证在哺乳动物或人类中的保守性 | 阐明心脏发育过程中心肌细胞状态转变的分子机制,为先天性心脏病发病机制提供新见解 | 斑马鱼胚胎心脏发育过程 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 加权基因共表达网络分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼胚胎心脏在24、30、36、48 hpf四个时间点的样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 824 | 2025-11-08 |
Sox9 prevents retinal degeneration and is required for limbal stem cell differentiation in the adult mouse eye
2025-Nov-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102337
PMID:41190718
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研究论文 | 本研究揭示了Sox9转录因子在成年小鼠眼睛中维持视网膜完整性和促进角膜缘干细胞分化的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术证明Sox9在基底角膜缘干细胞群体中的表达及其在形成两种长寿细胞克隆中的功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 揭示Sox9转录因子在成年眼睛不同细胞类型中的功能 | 成年小鼠的眼睛组织,特别是视网膜色素上皮细胞、Müller胶质细胞和角膜缘基底上皮细胞 | 发育生物学 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | 成年基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 825 | 2025-11-08 |
Single-nuclei sequencing of Moricandia arvensis reveals bundle sheath cell function in the photorespiratory shuttle of C3-C4 intermediate Brassicaceae
2025-Nov-04, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf245
PMID:40590299
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序技术揭示了Moricandia arvensis中维管束鞘细胞在C3-C4中间型光合作用中的功能 | 首次在十字花科C3-C4中间型植物中应用单核RNA测序技术,揭示了光呼吸相关基因在维管束鞘细胞中的特异性表达模式 | 研究仅限于十字花科中的一种C3-C4中间型植物,需要更多物种验证 | 探究C3-C4中间型植物中细胞特异性对光呼吸途径的影响 | Moricandia arvensis(十字花科C3-C4中间型植物)和拟南芥(C3植物)的叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单核RNA测序,电子显微镜,免疫金标记 | NA | 单细胞转录组数据,显微镜图像 | Moricandia arvensis单核RNA测序数据集和拟南芥公开单细胞转录组数据 | NA | 单核RNA测序,单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 826 | 2025-11-08 |
RANBP1 promotes immune evasion in triple-negative breast cancer by suppressing T cell infiltration via the miR-769-5p/PRUNE2 axis
2025-Nov-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03872-7
PMID:41186818
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研究论文 | 本研究揭示RANBP1通过miR-769-5p/PRUNE2轴抑制T细胞浸润,促进三阴性乳腺癌免疫逃避的分子机制 | 首次发现RANBP1通过调控miR-769-5p/PRUNE2通路影响T细胞浸润,揭示了三阴性乳腺癌免疫逃避的新机制 | 研究样本量有限(87例TNBC组织),机制研究仍需进一步验证 | 探究RANBP1在三阴性乳腺癌中调控T细胞浸润和肿瘤进展的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组织化学、Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床生存数据 | 87对三阴性乳腺癌肿瘤及癌旁组织,TCGA和GSE65194数据库 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 827 | 2025-11-08 |
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning reveals 4-aminobiphenyl exposure signatures and novel diagnostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03819-y
PMID:41186865
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了4-氨基联苯暴露特征并识别了膀胱癌的新型诊断生物标志物 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明4-氨基联苯的致癌机制,并通过机器学习识别出由六个核心基因组成的诊断面板 | 研究具有回顾性性质,依赖公共测序数据,缺乏详细临床元数据,无法对识别亚型进行生存分析 | 研究环境致癌物4-氨基联苯在膀胱癌发生中的分子机制并识别诊断生物标志物 | 膀胱癌组织样本 | 生物信息学, 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 分子对接模拟, ssGSEA | LASSO, SVM, 随机森林 | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 95,136个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 828 | 2025-11-08 |
Heterogeneity in an adeno-associated virus transfection-based production process limits the production efficiency
2025-Nov-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-26261-0
PMID:41188389
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了基于腺相关病毒转染的生产过程中细胞异质性对生产效率的限制 | 首次在单细胞水平上揭示了rAAV生产过程中细胞转染异质性的关键瓶颈,发现仅不到5%的细胞实际产生病毒颗粒 | 研究仅针对rAAV9血清型和HEK293T细胞系,结果可能不适用于其他AAV血清型或生产细胞系 | 提高基于瞬时转染的rAAV生产效率和产量 | HEK293T细胞系和rAAV9病毒载体 | 生物技术 | 基因治疗 | 单细胞转录组学,流式细胞术,qPCR | NA | 转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 829 | 2025-11-08 |
Single-cell multi-omics analysis revealed the expansion of age-associated B cells in the pancreas of type 1 autoimmune pancreatitis patients
2025-Nov-04, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01567-w
PMID:41188893
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示了1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺中年龄相关B细胞的扩增现象 | 首次在AIP胰腺中发现IgD-年龄相关B细胞(ABCs)的扩增,并揭示了CXCL9+巨噬细胞通过CXCL9-CXCR3轴招募ABCs以及Tfh细胞通过IL-21与ABCs相互作用的新机制 | 样本量有限,仅基于活检样本分析,需要更大规模研究验证 | 表征1型自身免疫性胰腺炎患者胰腺的局部免疫特征 | 1型自身免疫性胰腺炎患者的胰腺活检组织 | 单细胞组学 | 自身免疫性胰腺炎 | 单细胞RNA测序,免疫受体组库测序,空间转录组测序,流式细胞术,多色免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫受体序列数据 | AIP患者胰腺活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞免疫受体组库测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 830 | 2025-11-08 |
PA2G4 in CAFs promotes biochemical recurrence of prostate cancer via H3K18la
2025-Nov-04, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01485-9
PMID:41189032
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定前列腺癌相关成纤维细胞乳酸代谢特征并建立预后指数 | 首次发现CAFs通过乳酸代谢影响前列腺癌进展,建立新型乳酸代谢相关临床预后指数LMCAFCPI,并揭示PA2G4通过抑制H3K18la调控前列腺癌增殖转移的新机制 | NA | 探索前列腺癌相关成纤维细胞通过乳酸代谢影响前列腺癌进展的机制并开发预后工具 | 前列腺癌相关成纤维细胞和前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,机器学习,CUT-TAG测序 | 机器学习模型 | 转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 831 | 2025-11-08 |
Spatially informed phenotyping by cyclic-in-situ-hybridisation identifies novel fibroblast populations and their pathogenic niches in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.06.002
PMID:40603206
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研究论文 | 本研究通过循环原位杂交技术结合空间转录组学,在系统性硬化症皮肤中发现并表征了新型成纤维细胞亚群及其致病作用 | 首次在单细胞分辨率下实现原位深度转录谱分析,发现SFRP2+网状真皮成纤维细胞和CCL19+非血管周成纤维细胞两个新型亚群 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 通过空间转录组学技术研究系统性硬化症皮肤中成纤维细胞亚群的分布特征和致病机制 | 系统性硬化症患者和健康个体的皮肤组织 | 空间转录组学 | 系统性硬化症 | 循环原位杂交,单细胞RNA测序 | BANKSY聚类算法 | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 832 | 2025-11-08 |
Discovering Heterogeneous Leukocytes Subsets Associated With Alcoholic Steatohepatitis by scRNAseq Analysis
2025-Nov, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70448
PMID:41190282
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与酒精性脂肪性肝炎相关的异质性白细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统分析酒精性脂肪性肝炎中免疫白细胞的异质性及其与肝纤维化的关联 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究酒精性肝病中免疫细胞类型的特异性反应 | 酒精性肝病诱导小鼠和健康对照小鼠的免疫白细胞 | 单细胞组学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | t-SNE, SingleR | 单细胞转录组数据 | 酒精诱导和健康对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 833 | 2025-11-08 |
Matrix stiffness regulates profibrotic fibroblast differentiation and fibrotic niche activation in systemic sclerosis
2025-Nov, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.016
PMID:40579317
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研究论文 | 本研究探讨基质硬度如何调节系统性硬化症中促纤维化成纤维细胞分化和纤维化生态位激活 | 首次揭示基质硬度通过机械转导驱动PI16+前体细胞向SFRP2+COMP+PU.1+肌成纤维细胞分化的机制 | 研究主要基于体外3D培养系统,需进一步体内验证 | 探究基质硬度对成纤维细胞转录状态和谱系分化的影响 | 系统性硬化症患者和健康人皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 系统性硬化症 | RNA测序,单细胞RNA测序,空间转录组分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | SSc患者和健康人皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 834 | 2025-11-08 |
Single-Cell Immune Signature and Response to Neoadjuvant Chemotherapy in BRCA1/2-Mutated Breast Cancer
2025-Nov, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00349
PMID:41197086
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征,并开发预测新辅助化疗反应的BRCA-IM模型 | 首次在单细胞水平揭示BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境图谱,并建立基于单细胞和bulk RNA-seq数据的免疫特征预测模型 | 样本量相对有限,需要在更大队列中进一步验证 | 探索BRCA1/2突变乳腺癌的免疫微环境特征及其与新辅助化疗反应的关系 | BRCA1/2突变乳腺癌患者和BRCA野生型乳腺癌患者 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组织化学 | BRCA-IM预测模型 | 基因表达数据, 病理数据 | 80例BRCA1/2携带者(新辅助化疗队列),40例BRCA1/2携带者和56例非携带者(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 835 | 2025-11-07 |
DEHP promotes psoriasis via immune modulation and direct molecular interactions: Evidence from epidemiology, multi-omics, and structural simulation
2025-Nov-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.180723
PMID:41124907
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研究论文 | 本研究通过流行病学分析、多组学整合和分子模拟揭示了DEHP通过免疫调节和直接分子相互作用促进银屑病的机制 | 首次提供人群水平的DEHP与银屑病关联证据,整合多组学数据识别核心基因,并通过分子模拟验证DEHP与蛋白的稳定结合 | 研究主要基于美国NHANES数据,样本代表性有限;机制验证主要依赖计算模拟,需要实验进一步证实 | 阐明环境污染物DEHP在银屑病发病机制中的作用 | 美国成年人群体、银屑病相关基因和蛋白、免疫细胞 | 多组学整合分析 | 银屑病 | 流行病学分析、转录组测序、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 机器学习、加权基因共表达网络分析 | 流行病学数据、基因表达数据、蛋白质结构数据 | 1523名美国成年人 | NA | 单细胞RNA测序、转录组测序 | NA | NA |
| 836 | 2025-11-07 |
Rapid clonal selection within early hematopoietic cell compartments presages outcome to ivosidenib combination therapy
2025-Nov-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027948
PMID:41191518
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示了ivosidenib联合疗法在IDH1突变髓系肿瘤患者中早期克隆选择的动力学特征 | 首次结合高灵敏度单细胞基因分型和单细胞RNA测序技术,在治疗早期识别出具有复发风险的克隆选择过程 | 样本量较小(仅8例患者),需要更大规模研究验证 | 探究靶向治疗中克隆选择的动力学特征和分子机制 | 8例IDH1突变髓系肿瘤患者 | 单细胞组学 | 髓系肿瘤 | 单细胞基因分型, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 837 | 2025-11-07 |
From Gene to Scar: Proteome-Wide Causal Insights into Keloid Pathogenesis and Prevention
2025-Nov-05, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/21621918251387987
PMID:41192836
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研究论文 | 通过大规模孟德尔随机化研究和单细胞RNA测序分析,系统评估血浆蛋白及生活方式因素对瘢痕疙瘩发病风险的因果影响 | 首次建立多层因果推断框架,整合蛋白质组学、表型组学和单细胞转录组学数据,在单细胞分辨率上验证RSPO3作为瘢痕疙瘩致病因子 | 研究样本量相对有限,仅包含30名患者的单细胞数据 | 识别瘢痕疙瘩的新型治疗靶点和可改变风险因素 | 瘢痕疙瘩患者和4,907种血浆蛋白及8,155种生活方式相关特征 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,中介分析 | 因果推断模型 | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 30名患者的194,366个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 838 | 2025-11-07 |
Elucidating the role of SIRT2 in hepatocellular carcinoma through multi-omics and deep learning
2025-Nov-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03879-0
PMID:41182638
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和深度学习探讨SIRT2在肝细胞癌中的作用机制 | 首次结合铜死亡机制、单细胞测序、空间转录组和深度学习生存神经网络构建肝细胞癌预后模型 | 未明确说明样本量大小,机制研究仍需实验验证 | 阐明SIRT2在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 肝细胞癌组织样本和相关的基因表达数据 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA测序, 深度学习 | DeepSurv神经网络 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 839 | 2025-11-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
|
研究论文 | 本研究探讨了18q染色体缺失如何通过改变TGFβ信号通路影响人胚胎干细胞中前后神经外胚层命运决定 | 首次揭示了18q缺失通过干扰TGFβ信号通路导致前后神经外胚层命运决定失衡的具体机制 | 研究仅针对体外培养的干细胞模型,未验证在体内环境中的表现 | 探究染色体异常对人多能干细胞分化潜能的影响机制 | 人胚胎干细胞(hESCs)及其分化产物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因表达时序分析 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 具有复杂核型的人胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 840 | 2025-11-07 |
Exploring the Therapeutic Potential of MIR-140-3p in Osteoarthritis: Targeting CILP and Ferroptosis for Novel Treatment Strategies
2025-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70018
PMID:40044625
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研究论文 | 本研究探讨miR-140-3p通过靶向CILP调控铁死亡、炎症和氧化应激在骨关节炎中的作用机制 | 首次发现miR-140-3p/CILP轴通过调控铁死亡参与骨关节炎发病机制 | 铁死亡在OA中的具体作用和机制仍需进一步研究 | 探索骨关节炎的新型治疗策略 | C28/I2细胞、miR-140-3p、CILP蛋白、铁死亡相关基因 | 分子生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,hdWGCNA分析,生物信息学分析,qRT-PCR,双荧光素酶实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 细胞系研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |