单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1001 篇文献，本页显示第 801 - 820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2025-11-12 |
Oligo-CALL: A next-generation barcoding platform for studying resistance to targeted therapy
2025-Nov-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw9990
PMID:41202131
|
研究论文 | 开发了一种名为Oligo-CALL的新型细胞条形码平台，用于研究靶向治疗耐药性 | 开发了Oligo-CALL平台，实现了高效的谱系追踪、活克隆分离以及与单细胞RNA测序的无缝整合 | NA | 研究靶向治疗耐药性的分子机制和谱系演化 | 肺癌细胞 | 单细胞多组学 | 肺癌 | CRISPR-based cellular barcoding, single-cell RNA sequencing | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | Oligo-CALL | 寡核苷酸诱导的CRISPR转录激活因子辅助谱系标记平台 |
| 802 | 2025-11-12 |
TransST: transfer learning embedded spatial factor modeling of spatial transcriptomics data
2025-Nov-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06099-z
PMID:41199193
|
研究论文 | 提出一种名为TransST的迁移学习框架，用于提升空间转录组数据的细胞水平异质性推断 | 通过迁移学习自适应利用外部细胞标记信息来改善空间转录组数据分析 | NA | 开发空间转录组数据分析方法以更可靠地提取生物信号 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 803 | 2025-11-12 |
CellSP enables module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Nov-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08891-2
PMID:41193576
|
研究论文 | 本文提出了CellSP计算框架，用于识别、可视化和表征亚细胞空间转录组数据中的功能相关模式 | 引入了'基因-细胞模块'概念，能够识别多个细胞中具有协调亚细胞转录分布的基因集 | NA | 开发能够识别和解释亚细胞转录空间分布功能模式的工具 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | 多种组织和技术的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 804 | 2025-11-12 |
Multi-Omics Advances in Major Depressive Disorder for Molecular Insights, Biomarker Discovery, and Therapeutic Development
2025-Nov-05, Aging and disease
IF:7.0Q1
DOI:10.14336/AD.2025.1075
PMID:41213078
|
综述 | 本文综述了多组学技术在重度抑郁症研究中的最新进展，包括分子机制解析、生物标志物发现和治疗方法开发 | 整合多组学方法与计算系统生物学，将多组学信号转化为候选生物标志物和机制导向疗法 | 讨论了当前研究的局限性和转化优先事项 | 通过多组学方法解析重度抑郁症的多因素病因学并开发精准精神病学方法 | 重度抑郁症的分子机制、生物标志物和治疗方法 | 自然语言处理 | 精神疾病 | GWAS、单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | AI驱动的网络建模 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 805 | 2025-11-12 |
Serum response factor is essential for endometrial function and prevention of inflammatory fibrosis
2025-Nov-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2510060122
PMID:41150713
|
研究论文 | 本研究揭示血清反应因子(SRF)对子宫内膜功能和防止炎症性纤维化的重要作用 | 首次发现SRF在子宫内膜中的关键功能及其在子宫内膜异位症中的失调机制 | 动物模型与人类疾病的差异可能限制结果的直接转化应用 | 探究SRF在子宫内膜功能和生殖成功中的分子机制 | 人类子宫内膜异位症患者组织、人子宫内膜基质细胞、条件性基因敲除小鼠 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 免疫组织化学分析、RNA干扰、单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、组织学图像 | 人类子宫内膜异位症患者组织样本和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 806 | 2025-11-12 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2025-Nov-03, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
|
研究论文 | 提出了一种名为STORIES的新计算方法，通过最优传输学习空间转录组数据中的细胞命运景观 | 将最优传输扩展到空间转录组数据分析，学习空间感知的细胞分化潜能 | NA | 从多个时间点的空间转录组数据推断细胞命运轨迹 | 空间转录组数据，特别是蝾螈神经再生和小鼠胶质细胞生成过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输，神经网络 | 空间转录组数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 807 | 2025-11-12 |
MYEOV Is a Novel Marker of Differentiated Corneal Epithelium
2025-Nov-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.14.7
PMID:41186354
|
研究论文 | 本研究揭示了MYEOV作为角膜上皮分化标志物的特异性表达及其调控机制 | 首次发现MYEOV在KRT12阳性角膜上皮细胞中特异性高表达，且受PAX6和KLF4调控 | 研究主要基于体外实验和免疫染色分析，缺乏体内功能验证 | 表征MYEOV在人类眼表组织中的表达和调控机制 | 人类角膜上皮细胞和角膜组织 | 细胞生物学 | 眼科疾病 | RNA测序，免疫染色，基因敲低，Western blot，细胞增殖检测 | NA | 图像，基因表达数据 | 人类角膜组织及体外培养的角膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 808 | 2025-11-11 |
Harnessing Arginase-2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive Cutaneous T cell Lymphoma
2025-Nov-10, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf450
PMID:41208405
|
研究论文 | 本研究证明ARG2特异性CD8⁺ T细胞能够靶向识别并杀伤表达ARG2的皮肤T细胞淋巴瘤细胞 | 首次发现ARG2特异性CD8⁺ T细胞可靶向识别恶性CTCL细胞，揭示了ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的潜力 | 研究仅使用了8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集，样本量有限 | 探索ARG2特异性CD8⁺ T细胞靶向治疗皮肤T细胞淋巴瘤的新免疫治疗策略 | 皮肤T细胞淋巴瘤细胞系和患者病灶中的恶性T细胞 | 免疫治疗 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | western blotting, 单细胞RNA测序, IFN-γ ELISPOT, CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 蛋白质印迹数据, 单细胞RNA测序数据, 细胞因子分泌数据 | 8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集中的CTCL患者病灶 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 809 | 2025-11-11 |
LMO7 Suppresses Tumor-Associated Macrophage Phagocytosis of Tumor Cells Through Degradation of LRP1
2025-Nov-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511162
PMID:41208232
|
研究论文 | 本研究揭示了LMO7通过降解LRP1抑制肿瘤相关巨噬细胞吞噬肿瘤细胞的机制 | 首次发现LMO7通过促进LRP1的K48连接多聚泛素化降解来抑制巨噬细胞吞噬功能，并证明LMO7缺失与SIRPα阻断联合治疗的协同抗肿瘤效果 | NA | 探究LMO7在肿瘤相关巨噬细胞功能调控中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 实体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 810 | 2025-11-11 |
Integrative SMR and single cell & spatial analysis reveals the spatial heterogeneity and prognostic value of CASP9-mediated apoptotic pathways in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03798-0
PMID:41201629
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析，揭示了CASP9介导的凋亡通路在透明细胞肾细胞癌中的空间异质性及其预后价值 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学与孟德尔随机化方法结合，系统解析了CASP9驱动的凋亡程序在肾癌中的空间组织和免疫抑制功能 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步实验验证CASP9在肿瘤-巨噬细胞相互作用中的具体机制 | 阐明凋亡相关基因程序在透明细胞肾细胞癌中的空间动态、转录异质性和预后相关性 | 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织中的恶性细胞亚群 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 | LASSO Cox回归, DeepSurv | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组数据 | TCGA和E-MTAB-1980队列的透明细胞肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 811 | 2025-11-11 |
EGR4 transcriptionally upregulates GDF15 to promote gastric cancer metastasis
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08095-w
PMID:41203604
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现EGR4通过转录上调GDF15促进胃癌转移的新机制 | 首次发现EGR4/GDF15轴在胃癌转移中的关键作用，并揭示了其通过ErbB受体异源二聚化和CAF激活的双重促转移机制 | 样本量较小（仅6例患者），需要更大规模研究验证 | 探究胃癌转移的分子驱动机制 | 胃癌患者原发肿瘤和匹配的转移淋巴结 | 单细胞测序 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, ChIP-seq数据 | 6例胃癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 812 | 2025-11-11 |
Targeting the ac4C 'Writer' NAT10 enhances pancreatic cancer immunotherapy via dual modulation of CD8+ T cells and tumor cells
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08156-0
PMID:41203621
|
研究论文 | 本研究探索了NAT10介导的ac4C RNA修饰在胰腺癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 首次揭示NAT10通过ac4C乙酰化稳定ETS2和KRT8 mRNA，形成正反馈环上调PD-L1表达，促进胰腺癌免疫逃逸 | NA | 探索NAT10在胰腺癌免疫治疗耐药中的作用机制及治疗潜力 | 胰腺癌细胞、CD8+T细胞、肿瘤微环境 | 癌症免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 813 | 2025-11-11 |
The transcription factor ZEB2 mediates the antitumor efficacy of tumor-infiltrating lymphocytes in non-small cell lung cancer
2025-Nov-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08112-y
PMID:41203628
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现转录因子ZEB2在非小细胞肺癌中驱动CD8+T细胞向细胞毒性效应轨迹分化 | 首次通过metaVIPER单细胞RNA测序分析揭示ZEB2作为主调节子在CD8+T细胞分化中的关键作用，并发现T-bet/ZEB2轴在肺癌免疫治疗中的新机制 | 研究样本量较小（14例初治患者），且动物模型结果需要进一步临床验证 | 探索非小细胞肺癌中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能调节机制，寻找改善免疫检查点阻断治疗效果的策略 | 非小细胞肺癌患者CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、小鼠肺癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，metaVIPER分析，体外细胞实验，动物模型 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 14例初治非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 814 | 2025-11-11 |
Single-cell analysis unravels divergent gene signatures shaping seminoma stemness and metastasis
2025-Nov-07, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02802-4
PMID:41203637
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示精原细胞瘤干性与转移的分子特征 | 首次整合单细胞RNA测序、TCGA数据挖掘和细胞生物学实验，发现DPPA4/PSMA7高表达细胞具有高干性和转移特性，而PAGE5/SAT1高表达细胞特性相反 | 研究样本量有限，主要基于Tcam-2和NCCIT细胞系，需要更多临床样本验证 | 探索精原细胞瘤转移机制并开发转移风险分层工具 | 精原细胞瘤肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序, TCGA数据挖掘, 细胞生物学实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 细胞实验数据 | Tcam-2和NCCIT两种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 815 | 2025-11-11 |
Single-cell RNA sequencing identifies potential critical prognostic biomarkers in bladder carcinoma
2025-Nov-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23975-z
PMID:41203683
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌的潜在关键预后生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据识别膀胱癌预后相关基因，并发现IGFBP5、KRT14和SERPINF1与不良生存结局相关 | 研究样本来源于公共数据库，需要进一步实验验证和临床队列验证 | 识别能够预测膀胱癌患者预后的遗传标志物 | 膀胱癌患者样本和膀胱癌细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质印迹 | LASSO-Cox回归模型 | RNA测序数据, 基因表达数据 | GSA-Human数据库中的膀胱癌样本和6种膀胱癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 816 | 2025-11-11 |
Laminar CD34+ membranous cells with mechanosensitive properties in subcutaneous fascia of the abdominal midline
2025-Nov-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-25651-8
PMID:41203776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在腹部中线皮下筋膜中发现了一种新型CD34+膜性细胞群 | 首次识别出具有机械敏感特性的CD34+膜性细胞群，揭示了其在筋膜中作为机械装置和信号枢纽的新功能 | 研究仅限于大鼠腹部中线皮下筋膜，人类样本和其他解剖部位尚未验证 | 探索筋膜精细结构和细胞组成，揭示新型细胞群的功能特性 | 大鼠腹部中线皮下筋膜组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，形态学验证，超微结构分析 | NA | 单细胞转录组数据，显微图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 817 | 2025-11-11 |
Cucurbitacin E inhibits M1 macrophage polarization and attenuates rheumatoid arthritis: a multi-omics analysis and experimental validation
2025-Nov-07, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06332-8
PMID:41204223
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证探讨葫芦素E通过抑制M1巨噬细胞极化缓解类风湿性关节炎的作用机制 | 首次整合转录组学、单细胞测序和网络药理学多组学方法系统研究葫芦素E在类风湿性关节炎中的作用机制 | 需要进一步临床研究验证葫芦素E的治疗效果 | 探索葫芦素E在类风湿性关节炎中的治疗机制 | 类风湿性关节炎患者样本和巨噬细胞极化过程 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎 | 转录组学, 单细胞测序, 网络药理学, 流式细胞术 | 机器学习, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 818 | 2025-11-11 |
Multi-omics analyses identify mannose phosphate isomerase-centered hypoxia-induced angiogenesis signature in colorectal cancer
2025-Nov-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07291-8
PMID:41204349
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中缺氧诱导血管生成的转录调控机制，并鉴定出甘露糖磷酸异构酶(MPI)在这一过程中的关键作用 | 首次系统识别了12个HIFs转录激活的HIA相关基因，构建了HIAscore预后评分系统，并发现MPI通过LDHA相互作用激活JAK2/STAT3信号通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外实验验证，需要更多临床样本和机制研究进一步证实 | 探索结直肠癌中缺氧诱导血管生成的调控网络、分子机制和预后价值 | 结直肠癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微阵列, RT-qPCR, Co-IP, western blot, 集落形成实验, 管形成实验, 皮下异种移植瘤模型 | ssGSEA, SRGA, 共识聚类 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 819 | 2025-11-11 |
The multifaceted roles of non-coding RNAs in cell-cell communication in cardiovascular health and disease
2025-Nov-07, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01484-w
PMID:41204346
|
综述 | 探讨非编码RNA在心血管系统细胞间通讯中的多重作用及其在心脏发育、功能和疾病进展中的调控机制 | 系统对比已确立的microRNA通讯机制与新兴长链非编码RNA的重要性，并强调测序技术对解析非编码RNA通讯网络的革新性贡献 | 长链非编码RNA及其载体在心脏细胞间信号传导中的作用研究不足，非编码RNA摄取机制及其影响的理解存在空白 | 阐明非编码RNA通过细胞外囊泡等载体介导心血管系统细胞间通讯的分子机制 | 心血管系统中的非编码RNA（包括microRNA和长链非编码RNA）及其载体（细胞外囊泡、RNA结合蛋白、脂蛋白复合物） | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 820 | 2025-11-11 |
Identification of gene modules associated with B cell activation and tissue remodeling in primary Sjögren's syndrome
2025-Nov-07, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00765-w
PMID:41204409
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别与原发性干燥综合征中B细胞激活和组织重塑相关的基因模块 | 首次应用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)和scRank方法在单细胞水平解析pSS的基因调控网络 | 样本量较小(仅3例患者和3例对照), 需要未来功能验证 | 探索pSS中B细胞相关基因模块并发现新的治疗靶点 | 原发性干燥综合征患者的唇唾液腺细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, Gene Ontology富集分析 | hdWGCNA, scRank | 单细胞基因表达数据 | 32,337个细胞(来自3例pSS患者和3例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |