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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2025-11-10 |
Suppression of 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase promotes remyelination in multiple sclerosis
2025-Nov-06, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04351-0
PMID:41199250
|
研究论文 | 本研究揭示6-丙酮酰四氢蝶呤合酶(PTS)通过抑制少突胶质前体细胞增殖阻碍多发性硬化症髓鞘再生 | 首次发现PTS是少突胶质前体细胞增殖的负调控因子,并阐明其通过胆固醇生物合成途径影响髓鞘再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化价值需进一步验证 | 探究PTS在多发性硬化症髓鞘再生障碍中的作用机制 | 少突胶质前体细胞和多发性硬化症小鼠模型 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序、条件性基因敲除、转录组分析 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 单细胞测序数据、组织染色图像、转录组数据 | 人类和小鼠少突胶质细胞谱系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 802 | 2025-11-10 |
Research on the expression, prognostic value, and regulatory effects on immune microenvironment of NETO2 in oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15164-y
PMID:41193984
|
研究论文 | 本研究探讨NETO2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 首次系统研究NETO2在OSCC中的表达特征,结合单细胞RNA测序分析其在免疫细胞中的表达模式,并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库分析,实验验证部分有限,需要更多临床样本验证 | 阐明NETO2在口腔鳞状细胞癌中的生物学功能和临床意义 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析, 分子对接, 细胞功能实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 803 | 2025-11-10 |
MaskGraphene: an advanced framework for interpretable joint representation for multi-slice, multi-condition spatial transcriptomics
2025-Nov-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03850-w
PMID:41194133
|
研究论文 | 提出MaskGraphene框架,通过图神经网络和自监督学习实现多切片空间转录组数据的可解释联合表征 | 结合掩码自监督学习、三元组损失和聚类级局部对齐,通过软链接和硬链接建立跨切片连接,生成具有高几何保真度的联合嵌入 | NA | 开发能够保持空间几何结构并校正批次效应的空间转录组数据整合方法 | 多切片、多条件的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 804 | 2025-11-10 |
Ascorbic acid attenuates immunosenescence and cognitive decline via MYH9-Mediated CD8⁺ T cell differentiation
2025-Nov-05, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-025-00538-4
PMID:41194177
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研究论文 | 本研究揭示抗坏血酸通过MYH9介导的CD8⁺ T细胞分化减轻免疫衰老并改善认知功能 | 首次发现抗坏血酸通过结合MYH9蛋白调节细胞骨架通路,特异性促进CD8⁺ T细胞分化,从而改善年龄相关的免疫衰老和认知衰退 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验验证;MYH9抑制实验使用blebbistatin可能存在脱靶效应 | 探究抗坏血酸在缓解免疫衰老和认知衰退中的作用机制 | 16月龄C57BL/6老年小鼠、造血干细胞、外周血单个核细胞、CD8⁺ T细胞 | 免疫学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、体外分化实验 | 动物模型 | 基因表达数据、细胞计数数据、行为学数据 | 老年C57BL/6小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 805 | 2025-11-10 |
Prognostic evaluation and experimental validation of cuproptosis-related hub genes identified through weighted gene co-expression network analysis in uveal melanoma
2025-Nov-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03978-6
PMID:41194198
|
研究论文 | 本研究通过加权基因共表达网络分析识别铜死亡相关基因,构建了能够准确预测葡萄膜黑色素瘤预后的CRG_score模型 | 首次在葡萄膜黑色素瘤中系统研究铜死亡相关基因,构建了具有高预测准确性的预后模型,并验证了铜死亡诱导剂对肿瘤细胞的抑制作用 | 研究样本量相对有限,需要更多临床样本验证模型的普适性 | 探索铜死亡相关基因在葡萄膜黑色素瘤预后评估和治疗中的作用 | 葡萄膜黑色素瘤患者样本和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 加权基因共表达网络分析,转录组相关性分析,差异分析,LASSO Cox回归,单细胞RNA测序,细胞实验 | CRG_score预后模型 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 221例葡萄膜黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 806 | 2025-11-10 |
Oral Multi-Enzymatic Manganese-Carbon Dots Alleviate Sepsis-Associated Lung Injury via the Gut-Lung Axis
2025-Nov-04, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c10625
PMID:41128412
|
研究论文 | 本研究开发口服锰掺杂碳点通过调节肠道菌群稳态和靶向肠肺轴缓解脓毒症相关肺损伤 | 首次设计具有多酶模拟活性的锰掺杂碳点,通过肠肺轴机制调控巨噬细胞胞葬作用和抗炎极化 | 研究主要基于小鼠模型,人体应用效果尚需验证 | 探索通过肠肺轴干预脓毒症相关肺损伤的新策略 | 脓毒症相关肺损伤小鼠模型和巨噬细胞 | 生物医学工程 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学,粪便微生物移植 | NA | 基因组数据,代谢组数据,转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | NA |
| 807 | 2025-11-10 |
Decoding melanoma's cellular mosaic to unlock immunotherapy potential
2025-Nov, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.01.009
PMID:40023663
|
综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示皮肤黑色素瘤的细胞异质性及其对免疫治疗耐药机制的理解 | 将单细胞多组学技术应用于解析黑色素瘤的细胞异质性,类比庞贝城马赛克解读来阐释癌症研究的突破性视角 | NA | 探讨单细胞多组学技术对黑色素瘤生物学特性及免疫治疗耐药机制的研究进展 | 皮肤黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 808 | 2025-11-10 |
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013664
PMID:41183107
|
研究论文 | 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架,用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 开发了基于异构图变换器的多组学整合方法,能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 | NA | 解析细胞分化过程中的基因调控机制 | 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 图变换器, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | 三个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 809 | 2025-11-09 |
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327060
PMID:41090219
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统描绘了心脏衰老过程中的微环境变化,并识别出血管相关细胞生态位作为衰老的关键热点 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类心脏组织中验证 | 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 | 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 810 | 2025-11-09 |
Spatial and functional dissection of cancer-associated fibroblasts-mediated immune modulation in H. pylori-associated gastric cancer
2025-Nov-06, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02490-9
PMID:41194113
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA-seq分析,揭示了幽门螺杆菌相关胃癌中癌症相关成纤维细胞的空间分布和免疫调节功能 | 首次系统解析了幽门螺杆菌阳性胃癌中CAF亚型的空间分布特征及其通过WNT5-FZD相互作用和ZFP36介导的FN1 mRNA稳定性调控免疫抑制的新机制 | 研究样本量相对有限(71例GC患者),且主要基于回顾性队列分析 | 阐明癌症相关成纤维细胞在幽门螺杆菌相关胃癌中的空间组织和免疫调节功能 | 胃癌患者的肿瘤组织样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,LACE-seq,CIBERSORT-ABS,Kaplan-Meier分析 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,临床数据 | 71例GC患者肿瘤组织,整合三个独立队列(中国、美国、新加坡)数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 811 | 2025-11-09 |
Spatial transcriptomic landscape and cellular neighborhood heterogeneity in cervical cancer: integrative single-cell and spatial RNA sequencing analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03788-2
PMID:41191175
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,构建了首个宫颈癌综合空间分子图谱 | 首次建立宫颈癌综合空间转录组图谱,识别38个具有独特分子特征的细胞邻域,揭示肿瘤微环境的空间组织模式 | NA | 构建宫颈癌空间转录组图谱,解析肿瘤微环境的空间组织和细胞间关系 | 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 定量PCR | NA | 基因表达数据, 空间位置数据 | 公共GEO数据库数据集和实验验证细胞系 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 812 | 2025-11-09 |
Exploration of prognosis and immune infiltration characteristics in glioblastoma multiforme based on lipid metabolism related genes
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03865-6
PMID:41191203
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研究论文 | 本研究基于脂代谢相关基因探索多形性胶质母细胞瘤的预后和免疫浸润特征 | 首次基于脂代谢相关基因将GBM患者分为两个预后不同的亚群,并鉴定出四个新的预后相关枢纽基因 | 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 识别GBM中与脂代谢相关的预后生物标志物和治疗靶点 | 多形性胶质母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 转录组分析,单细胞测序,生物信息学算法 | LASSO-Cox回归分析 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 813 | 2025-11-09 |
Identification of lactylation-related biomarkers in HNSC by integrating machine learning and Spatial transcriptomics analysis
2025-Nov-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03849-6
PMID:41191207
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研究论文 | 通过整合机器学习和空间转录组学分析识别头颈部鳞状细胞癌中与乳酸化修饰相关的生物标志物 | 首次结合12种机器学习方法和空间转录组学技术系统筛选HNSC中乳酸化相关关键基因,并揭示其在肿瘤核心区域的优先表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因在乳酸化修饰中的具体分子机制 | 识别头颈部鳞状细胞癌中关键的乳酸化相关基因及其预后影响 | 头颈部鳞状细胞癌患者基因表达数据 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学,单细胞分析,Western blotting,RT-qPCR | 多种机器学习方法,WGCNA,CIBERSORT | 基因表达数据,空间转录组数据 | TCGA-HNSC队列和GSE6631数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 814 | 2025-11-09 |
Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65704-0
PMID:41193468
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据构建了人类肺部空间单细胞图谱,揭示了健康与疾病状态下肺组织的区域变异 | 首次在人类肺部应用三种空间转录组学方法,构建了具有空间分辨率的三维组织参考图谱,并发现了慢性阻塞性肺病中上皮细胞类型组成的未知失衡 | 研究仅关注了三个代表性肺部区域,可能未完全覆盖整个肺部的空间异质性 | 理解肺组织地形和外部因素对细胞类型内基因表达变异的影响 | 人类肺部细胞,包括罕见上皮细胞 | 空间转录组学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 三种不同的空间转录组学方法 |
| 815 | 2025-11-09 |
Bone marrow-derived emergency monopoiesis drives brain-lung axis injury after traumatic brain injury via IL-1
2025-Nov-05, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03589-y
PMID:41194087
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研究论文 | 本研究揭示了创伤性脑损伤后骨髓来源的紧急单核细胞生成通过IL-1驱动脑-肺轴损伤的机制 | 首次发现颅骨骨髓在TBI后24小时内发生IL-1驱动的紧急单核细胞生成,并阐明其作为多器官损伤核心驱动因素的新机制 | NA | 探索创伤性脑损伤引发外周器官损伤的机制基础 | 创伤性脑损伤患者和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 816 | 2025-11-09 |
Harnessing multi-omics approaches to decipher tumor evolution and improve diagnosis and therapy in lung cancer
2025-Nov-05, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00859-y
PMID:41194170
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综述 | 本文综述了多组学方法在解析肺癌肿瘤进化及改善诊疗中的应用前景 | 系统阐述多组学方法在构建肺癌生态系统全景中的整合应用价值 | NA | 探讨多组学方法在肺癌研究中的潜力与应用 | 肺癌肿瘤异质性与肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肺癌 | 全基因组测序,单细胞测序,空间转录组学 | 多组学整合模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 817 | 2025-11-09 |
In vitro derivation of midbrain dopaminergic neurons from porcine embryonic stem cells in multi-dimensional conditions
2025-Nov-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04693-9
PMID:41194288
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研究论文 | 本研究建立了从猪胚胎干细胞在二维和三维条件下高效分化中脑多巴胺能神经元的物种优化方案 | 首次建立了从猪干细胞生成功能验证的中脑多巴胺能神经元和中脑类器官的稳健平台,揭示了物种特异性信号动态 | 仅使用猪胚胎干细胞进行研究,未与其他物种进行直接比较 | 建立物种优化的条件,从猪胚胎干细胞在二维和三维环境中衍生功能性中脑多巴胺能神经元 | 体外受精和孤雌生殖激活来源的猪胚胎干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 免疫荧光、膜片钳电生理学、微电极阵列记录、多巴胺ELISA、RNA测序 | NA | 基因表达数据、电生理数据、蛋白质数据 | 猪胚胎干细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 818 | 2025-11-09 |
The molecular complexity of deep vein thrombosis was preliminarily explored based on the ceRNA network, scRNA-seq and AlphaFold 2
2025-Nov-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02239-9
PMID:41188916
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研究论文 | 本研究通过ceRNA网络、单细胞RNA测序和AlphaFold 2技术初步探索深静脉血栓形成的分子复杂性 | 首次结合ceRNA网络构建、多种PPI网络算法、AlphaFold 2结构预测和单细胞RNA测序技术系统研究深静脉血栓的分子机制 | 样本量较小(内部测试集10例,外部验证集14例,单细胞测序6例),需要更大规模研究验证 | 识别与深静脉血栓相关的高度特异性基因并研究其复杂性 | 深静脉血栓患者和健康对照者的血液样本 | 生物信息学 | 深静脉血栓 | 单细胞RNA测序, 全转录组分析, 蛋白质结构预测 | ceRNA网络模型, PPI网络分析 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 内部测试集10例(4例患者+6例对照),外部验证集14例,单细胞测序6例(3例患者+3例对照) | NA | 单细胞RNA测序, 全转录组测序 | NA | NA |
| 819 | 2025-11-09 |
Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417129
PMID:40779122
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研究论文 | 本研究揭示大黄素通过靶向中性粒细胞BCL-10抑制NETosis,缓解脓毒症引起的多器官损伤 | 首次发现大黄素可直接靶向BCL-10蛋白,通过调节BCL-10/MALT1复合物抑制NF-κB信号通路和NETs形成 | NA | 探究大黄素在脓毒症中对多器官保护作用的分子机制 | 中性粒细胞及其NETs形成过程 | 分子生物学 | 脓毒症 | 蛋白质微阵列,表面等离子共振,分子对接,单细胞测序 | NA | 体外实验数据,体内实验数据,蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 820 | 2025-11-09 |
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Nov, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70025
PMID:40906332
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研究论文 | 本研究揭示HLA-A*02:01通过半胱氨酸修饰呈递青霉素修饰肽段激活T细胞反应的分子机制 | 首次发现青霉素优先修饰HLA肽段中的半胱氨酸残基,并证实通过二硫键介导的肽段修饰机制可诱导T细胞识别 | 研究仅聚焦于HLA-A*02:01单倍型和青霉素特异性反应,未涵盖其他HLA类型或β-内酰胺类药物 | 阐明青霉素诱导T细胞介导过敏反应的分子机制 | HLA-A*02:01呈递的青霉素修饰肽段及患者来源的青霉素特异性T细胞 | 免疫学 | 药物过敏 | 免疫肽组学、单细胞测序、报告细胞系检测 | NA | 蛋白质组数据、单细胞TCR序列数据 | 过敏患者来源的CD8+ T细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |