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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-02-19
Proneural-mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Nov-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究探讨了胶质母细胞瘤中前神经-间充质杂交细胞的特性及其在治疗抵抗中的作用 首次实时监测胶质母细胞瘤细胞可塑性,并揭示了杂交细胞在治疗抵抗中的关键作用及其分子机制 研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型,临床转化仍需进一步验证 探究胶质母细胞瘤细胞可塑性的分子机制及治疗抵抗的原因 胶质母细胞瘤细胞,特别是前神经-间充质杂交细胞 数字病理学 胶质母细胞瘤 RNA测序,单细胞RNA测序,单细胞ChIP测序,核蛋白质组学,高分辨率成像 NA 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 多个患者来源的细胞系 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
62 2026-02-19
ZiPo: A Deep Neural Network to De-Noise Single-Cell RNA Sequencing Data
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文介绍了一种名为ZiPo的深度人工神经网络,用于去噪单细胞RNA测序数据,通过估计率和预测文库大小来处理测量丢失问题 ZiPo引入了可调节的零膨胀分布来捕获丢失事件,并采用尺度不变损失项使权重稀疏,从而提高模型的生物可解释性 NA 改进单细胞RNA测序数据分析,减少测量丢失对结果的影响 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度人工神经网络,深度自编码器 基因表达数据 三个数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-02-18
Sig27 stratifies prostate cancer recurrence by assessing the immunosuppressive properties of tumors
2025-Nov-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2
研究论文 本研究评估了新型27基因面板Sig27及其衍生面板Sig27IMG在前列腺癌复发预测中的作用,并揭示了其与免疫抑制特征(特别是肿瘤相关单核/巨噬细胞和内皮细胞)的关联 开发了新型27基因面板Sig27及其衍生5基因面板Sig27IMG,用于前列腺癌复发风险分层,并首次系统性地揭示了这些基因在多种癌症类型中与肿瘤相关单核/巨噬细胞、树突状细胞和内皮细胞的免疫抑制功能的关联 研究主要基于回顾性RNA-seq数据集,需要前瞻性临床验证来确认其预测价值;样本量虽大但可能存在批次效应;未详细探讨这些基因在肿瘤微环境中的具体作用机制 开发并验证基因表达面板用于前列腺癌复发风险分层,并探究其与肿瘤免疫抑制特征的关联 前列腺癌患者肿瘤组织样本(包括原发性和转移性)以及多种癌症类型的肿瘤样本 数字病理学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq 基因表达面板(多基因特征) 基因表达数据(RNA-seq和scRNA-seq) 批量RNA-seq:3,133个肿瘤样本(13个数据集);单细胞RNA-seq:53名患者(6个数据集);多癌症类型验证:单细胞RNA-seq 386名患者(26种癌症类型),批量RNA-seq 5,672名患者(17种癌症类型) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
64 2026-02-17
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究开创了一个整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习的多模态框架,用于解码树突状细胞介导的非小细胞肺癌抗PD-1治疗反应机制 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习通过堆叠集成学习模型相结合,用于预测NSCLC免疫治疗反应,并识别出六个与树突状细胞亚型相关的关键标志基因 研究样本量有限,且结果需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证 预测非小细胞肺癌患者对免疫检查点抑制剂(抗PD-1)的治疗反应 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本(来自应答者和无应答者) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,影像组学分析,机器学习 LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习模型 单细胞转录组数据,临床数据,影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
65 2026-02-17
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过双向孟德尔随机化分析、单细胞转录组数据整合及神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关联,并识别出小胶质细胞中CTSH-GRN-TMEM106B和TREM2-IL-34相关网络在疾病发生发展中的潜在作用 采用双向孟德尔随机化框架,结合单细胞转录组数据和神经病理学验证,系统性地建立了外周血浆/脑脊液蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关联,并构建了与小胶质细胞功能相关的蛋白互作网络 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,虽然进行了神经病理学验证,但仍需进一步的功能实验来证实这些蛋白网络在AD中的具体分子机制 阐明外周生物标志物与阿尔茨海默病中枢神经系统之间的因果关联及潜在机制 阿尔茨海默病患者及对照个体的血浆蛋白、脑脊液蛋白、大脑蛋白质组数据以及前额叶皮层单细胞转录组数据 生物信息学与计算生物学 阿尔茨海默病 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学,免疫荧光,蛋白质-蛋白质相互作用分析 NA 蛋白质组数据,单细胞转录组数据,遗传数据,组织图像数据 分析涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种大脑蛋白,并使用AD患者死后脑组织样本进行验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-02-17
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中类凋亡相关基因的图谱,并分析了其与预后及免疫微环境的关系,同时通过实验验证了关键调控因子TNK2的功能 首次在骨肉瘤中系统描绘类凋亡相关基因的图谱,揭示了其与预后和免疫微环境的关联,并通过单细胞RNA测序和功能实验验证了TNK2在类凋亡调控中的关键作用 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,实验验证部分仅限于细胞功能学实验,缺乏体内模型和临床样本的进一步验证 阐明骨肉瘤中类凋亡相关基因的分子特征及其对预后和免疫微环境的影响,识别关键调控因子 骨肉瘤患者队列(TARGET和GSE21257数据集)及骨肉瘤细胞系 生物信息学 骨肉瘤 生物信息学分析、单细胞RNA测序、细胞功能实验(增殖、活力、迁移实验) LASSO-Cox回归模型、共识聚类 基因表达数据(RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 TARGET和GSE21257两个患者队列(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
67 2026-02-17
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology IF:4.2Q1
综述 本文综述了将抗菌药物、双硫仑和二甲双胍重新用于癌症治疗的潜力,并探讨了RNA测序在揭示其作用机制和指导临床转化中的关键作用 系统性地将多种抗菌药物与双硫仑、二甲双胍并列,探讨其抗癌重定位的共性机制,并强调利用转录组学(尤其是单细胞和空间转录组学)来弥合机制认知差距并指导精准治疗 临床转化结果参差不齐,面临药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境成分等关键挑战,且除二甲双胍外,其他候选药物的临床前和临床研究数据相对有限 探讨药物重定位用于癌症治疗的潜力,并阐明RNA测序技术在理解药物作用机制和指导临床转化中的应用 抗菌药物(阿奇霉素、克拉霉素、氯碘羟喹、氯喹、多西环素、红霉素、伊维菌素、替加环素)、双硫仑和二甲双胍 自然语言处理 癌症 RNA测序 NA 文本 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
68 2026-02-15
A TLR4-dependent fibroblast-monocyte axis in tumor-draining lymph nodes contributes to metastasis in triple-negative breast cancer
2025-Nov-11, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 本文探讨了三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结内细胞网络的重组,揭示了TLR4依赖的成纤维细胞-单核细胞轴在促进免疫逃逸和转移中的作用 发现TLR4配体通过诱导FRC表达CCL2和CCL7,促进单核细胞归巢至TDLN,形成免疫抑制微环境,并证明局部TLR4抑制联合αPD-1疗法可减少转移 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且TLR4抑制疗法的长期安全性和临床转化需进一步评估 研究三阴性乳腺癌中肿瘤引流淋巴结的细胞网络重组及其在免疫逃逸和转移中的作用机制 三阴性乳腺癌小鼠模型及人类TNBC TDLN样本 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
69 2026-02-13
Spatial transcriptomics and immunophenotyping uncover chronic inflammation-induced immune adaptations favoring dysplasia development in patients at risk of colitis-associated cancer
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
研究论文 本研究利用空间转录组学和免疫表型分析,揭示了慢性炎症诱导的免疫适应如何促进炎症性肠病患者中结肠炎相关癌症的发育 结合GeoMx数字空间分析和成像质谱流式技术,首次在组织学未发炎的结肠中识别出代谢和应激反应通路上调,以及CD8+上皮内T细胞减少与癌症风险的关联 样本量较小(发现队列11例,验证队列最多18例),且为观察性研究,无法确定因果关系 确定慢性炎症诱导的免疫细胞重编程在炎症性肠病患者中促进结肠炎相关癌症发展的机制 结肠炎相关癌症患者、散发性结直肠癌患者、有或无发育不良的炎症性肠病患者 数字病理学 结肠炎相关癌症 空间转录组学、成像质谱流式、免疫组织化学、免疫荧光 NA 空间转录组数据、成像质谱数据、组织图像 发现队列11例(CAC和SCRC患者),验证队列包括CAC患者10例、SCRC患者14例,以及IBD患者有发育不良6例、无发育不良18例 NA 空间转录组学, 成像质谱流式 GeoMx GeoMx数字空间分析
70 2026-02-12
[Expression Characteristics and Prognostic Study of PPP1R13L in Brain Metastases 
of Lung Adenocarcinoma]
2025-Nov-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
研究论文 本研究通过单细胞测序和临床样本分析,探讨了PPP1R13L基因编码的iASPP蛋白在肺腺癌脑转移组织中的表达特征及其临床意义 首次在肺腺癌脑转移的肿瘤微环境中,结合单细胞测序和临床样本,揭示了PPP1R13L作为上调差异基因在特定上皮细胞亚群中的高表达,并发现其阳性细胞与成纤维细胞之间的相互作用通过COL1A1-CD44配体-受体对激活细胞-基质粘附相关通路 单细胞测序样本量较小(仅4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织),且临床样本来自单一医院,可能存在选择偏倚 分析肺腺癌脑转移患者的肿瘤微环境特征,并探索PPP1R13L在脑转移组织中的表达及其临床意义 肺腺癌脑转移患者的脑组织、临床样本及公共数据库中的肺腺癌和正常肺组织单细胞测序数据 数字病理学 肺癌 单细胞测序, 免疫组织化学 NA 单细胞测序数据, 临床病理数据, 图像数据 单细胞测序:4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织;临床分析:50例肺腺癌脑转移患者的石蜡切片和临床数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
71 2026-02-12
Atlas-Guided Discovery of Transcription Factors for T Cell Programming
2025-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过整合转录组和表观遗传数据,构建了CD8+ T细胞状态的综合图谱,并利用CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术,鉴定了调控T细胞分化的关键转录因子 开发了一个综合图谱平台,结合了转录和表观遗传数据,并首次通过体内Perturb-seq技术系统性地识别了调控T细胞状态的转录因子,包括新发现的ZSCAN20和JDP2 研究主要基于小鼠模型,人类T细胞验证数据有限,且未涵盖所有可能的T细胞状态或疾病环境 系统定义驱动CD8+ T细胞不同状态的转录因子,以优化免疫疗法设计 CD8+ T细胞,特别是终末耗竭T细胞(TEXterm)和组织驻留记忆T细胞(TRM) 免疫学 癌症和慢性感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR筛选,表观遗传分析 NA 转录组数据,表观遗传数据 涉及九个CD8+ T细胞状态,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
72 2026-02-10
Lifting regenerative barriers promotes epithelial cell fate plasticity supporting lineage conversion
2025-Nov-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了成年上皮细胞在再生过程中命运可塑性的调控机制,揭示了HIF1a-SOX9轴作为限制细胞身份转换的关键屏障 首次发现HIF1a-SOX9轴作为上皮细胞命运可塑性的关键调节因子,并证明解除再生屏障可促进食管细胞向皮肤细胞的谱系转换 研究基于3D再生培养系统,可能无法完全模拟体内复杂环境;谱系转换效率较低,机制仍需进一步验证 探究成年上皮细胞命运可塑性的调控机制及再生过程中的谱系转换限制因素 成年食管上皮细胞与真皮基质细胞 再生医学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
73 2026-02-10
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术,揭示了牛感染布氏锥虫时存在隐秘的传播适应性血流形式,挑战了基于啮齿动物模型的传统假设 首次在牛的低寄生虫血症水平下,通过单细胞转录组学识别出具有细长型和粗短型相关转录组的混合寄生虫群体,揭示了宿主特异性差异 研究主要基于牛和鼠类感染模型,可能未完全覆盖所有自然宿主或环境条件下的寄生虫行为,且形态学标记蛋白表达未在粗短型样寄生虫中检测到 探究布氏锥虫在自然宿主(牛)中的发育和传播机制,特别是低寄生虫血症条件下的形式分化 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的寄生虫群体,包括其转录组和形态特征 寄生虫学与传染病学 非洲动物锥虫病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、显微镜观察 NA 转录组数据、图像数据 牛和鼠类感染样本,具体数量未在摘要中指定 NA 单细胞RNA-seq NA NA
74 2026-02-09
Biallelic BRF2 mutations disrupt redox homeostasis as etiological factors in syndromic immunodeficiency and developmental disorders
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过鉴定并表征一个家族病例中的新型双等位基因BRF2变异,揭示了BRF2功能障碍通过破坏氧化还原稳态导致综合征性免疫缺陷和发育异常的分子机制 首次将BRF2双等位基因突变与氧化还原稳态破坏联系起来,并阐明其在血液免疫和发育异常中的致病机制 研究基于单个家族病例,样本量有限,且分子机制主要在细胞水平验证 阐明BRF2基因突变导致综合征性免疫缺陷和发育异常的分子病因学 携带新型双等位基因BRF2变异的家族病例患者 NA 综合征性免疫缺陷和发育异常 全外显子组测序,单细胞RNA测序 NA 基因组测序数据,单细胞转录组数据 一个家族病例(患者及其家庭成员) NA 全外显子组测序,单细胞RNA测序 NA NA
75 2026-02-09
Galectin-9 inhibition of the MIF-CD74/CD44 pathway suppresses chronic arthritis
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别出类风湿关节炎中一个独特的MIF亚群,并探索了稳定重组半乳糖凝集素-9(sGal-9)作为CD44阻断剂,通过抑制MIF-CD44通路来抑制关节炎的破坏性表型 首次在单细胞水平识别出RA-FLSs中的MIF亚群,并证明sGal-9作为新型抗MIF剂,能有效抑制关节炎的破坏性表型 研究主要基于体外和动物模型,尚未进行临床试验,且sGal-9的长期安全性和疗效需进一步验证 探索针对类风湿关节炎中成纤维样滑膜细胞(FLSs)的治疗策略,特别是通过抑制MIF-CD44通路来减轻关节炎的破坏 类风湿关节炎患者的成纤维样滑膜细胞(RA-FLSs)以及小鼠关节炎模型 单细胞测序与分子生物学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 未明确指定样本数量,但涉及RA患者的FLSs和小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
76 2026-02-09
Precision T cell correction platform for inborn errors of immunity
2025-Nov-05, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本文介绍了一种基于CRISPR-Cas9和同源定向修复的T细胞单核苷酸变异精确校正平台,用于治疗先天性免疫缺陷病 开发了一种高效的T细胞单核苷酸变异校正平台,通过同源定向修复实现高达80%的校正率,并在多个IEI模型中验证了功能校正,同时通过多组学安全分析未检测到基因组、转录组或蛋白质组异常 该平台可能不适用于晚期疾病、严重炎症或急性感染患者,且目前仅针对特定单基因免疫缺陷病模型进行了验证 开发一种精确的基因编辑平台,用于治疗先天性免疫缺陷病,特别是通过校正T细胞来替代造血干细胞移植 T细胞,以及STAT1功能获得性突变、软骨毛发发育不全、ADA2缺乏症和自身免疫性多内分泌病-念珠菌病-外胚层营养不良等IEI模型 基因编辑与细胞治疗 先天性免疫缺陷病 CRISPR-Cas9基因编辑,同源定向修复,GUIDE-seq,单细胞RNA测序,长读长基因组测序,蛋白质组学分析 NA 基因组数据,转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序,长读长基因组测序 NA NA
77 2026-02-05
FOXA1 Upregulates HILPDA to Enhance Lipid Droplet Accumulation and Anoikis Resistance in Lung Adenocarcinoma
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了FOXA1通过转录激活HILPDA,促进脂滴积累,从而增强肺腺癌细胞的失巢凋亡抵抗和转移潜能 首次阐明了FOXA1/HILPDA轴通过调控脂滴代谢介导肺腺癌失巢凋亡抵抗的具体分子机制 研究主要基于A549细胞系和小鼠模型,缺乏临床患者样本的直接验证 探究HILPDA在肺腺癌失巢凋亡抵抗中的作用及其上游调控机制 肺腺癌细胞系A549及其失巢凋亡抵抗变体A549-AR 肿瘤生物学 肺癌 单细胞测序、生物信息学分析、ChIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测、Western blot、免疫荧光、油红O染色 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞功能数据 细胞系实验及小鼠异种移植模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
78 2026-02-05
Dissecting Shared Genetic Architecture of Thoracic Aortic Aneurysm and Aortic Related Traits and Identifying SplA/Ryanodine Receptor Domain and SOCS Box Containing 1 Involved in Smooth Muscle Phenotype Switching and Cell Senescence Through Alternative Splicing
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合基因组关联研究数据,揭示了胸主动脉瘤与相关性状的共享遗传结构,并验证了SPSB1基因在平滑肌细胞表型转换和细胞衰老中的作用 首次通过多性状GWAS分析(MTAG和N-GWAMA)系统解析胸主动脉瘤与相关性状的共享遗传变异,并结合单细胞RNA测序验证SPSB1基因在平滑肌细胞表型转换中的关键调控作用 研究主要基于遗传关联分析和小鼠模型验证,在人类样本中的功能验证和临床转化仍需进一步探索 解析胸主动脉瘤与相关性状的共享遗传结构,并鉴定关键基因在疾病发生中的作用机制 胸主动脉瘤患者、小鼠模型以及平滑肌细胞 机器学习和基因组学 心血管疾病 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序、质谱分析、RNA测序 机器学习 图像、基因组数据、转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及TAA患者和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、质谱分析、RNA测序 NA NA
79 2026-02-05
Unraveling the Role of PTGIR in Atrial Fibrillation: Insights From Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Nov-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,揭示了PTGIR等基因在心房颤动发病机制中的关键作用 首次整合单细胞测序与孟德尔随机化分析,系统鉴定心房颤动相关的成纤维细胞特异性基因及其因果关联 样本量相对有限,动物模型验证仍需进一步临床研究证实 探究心房颤动的分子机制,特别是成纤维细胞在其中的作用 心房颤动患者样本和对照样本,以及大鼠模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 NA 单细胞转录组数据 47,565个细胞(来自AF和对照样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
80 2026-02-03
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco flavored e-cigarette exposed mouse lungs
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了小鼠肺部在急性暴露于不同口味电子烟气溶胶后,免疫细胞(特别是髓系和淋巴系细胞)的动态变化及风味依赖性影响 首次利用单细胞转录组学全面解析了不同口味电子烟暴露下小鼠肺部的细胞特异性免疫变化,并发现了烟草口味电子烟导致的嗜中性粒细胞动态改变和T细胞毒性增强 研究仅基于小鼠模型,样本量较小(每组2只/性别),且为急性暴露实验,长期效应尚不明确 探究不同口味电子烟气溶胶急性暴露对小鼠肺部免疫景观的影响 C57BL/6J小鼠的肺部细胞 数字病理学 肺部疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,流式细胞数据,图像数据 71,725个细胞,来自对照组和处理组(每组每性别2只小鼠) NA 单细胞RNA-seq NA NA
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