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当前共找到 1144 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-12-14 |
Advances in artificial intelligence for spatial transcriptomics in cancer: Special focus on Yin Yang 1 (YY1) and Raf kinase inhibitor protein (RKIP)
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189456
PMID:40992707
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综述 | 本文综述了人工智能在癌症空间转录组学中的应用，特别聚焦于YY1和RKIP基因，探讨了机器学习、人工智能和统计方法如何推动该领域的发展 | 通过整合机器学习、人工智能和统计方法来解析空间转录组数据，为癌症研究提供新视角，并特别以YY1和RKIP基因为例展示应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据或具体模型验证，主要基于现有研究进行总结和讨论 | 探讨人工智能和机器学习在癌症空间转录组学数据分析中的应用，以促进癌症分类、临床结果预测和个性化医疗 | 空间转录组数据，特别是与YY1和RKIP基因相关的癌症微环境研究 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学技术 | SVM, Random Forest, 聚类, PCA, t-SNE, UMAP | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 62 | 2025-12-14 |
Img2ST-Net: efficient high-resolution spatial omics prediction from whole-slide histology images via fully convolutional image-to-image learning
2025-Nov, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.)
DOI:10.1117/1.JMI.12.6.061410
PMID:41210922
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研究论文 | 本研究提出了一种名为Img2ST-Net的高效框架，用于从全切片组织学图像中并行预测高分辨率空间转录组数据 | 提出了首个用于高分辨率空间转录组预测的全卷积图像到图像学习框架，将任务重构为具有数百或数千个输出通道的超内容图像生成问题，并引入了针对高分辨率ST分析的基于结构相似性的评估指标SSIM-ST | 论文未明确说明模型在更广泛的组织类型或疾病中的应用局限性，也未讨论模型对极低表达基因的预测能力 | 开发一种高效、可扩展的框架，以降低高分辨率空间转录组数据获取的成本和时间，直接从常规组织学图像预测基因表达 | 乳腺癌和结直肠癌的组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌, 结直肠癌 | 空间转录组学 | 全卷积神经网络 | 图像, 基因表达数据 | 两个公共Visium HD数据集（乳腺癌和结直肠癌） | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD平台，分辨率为8 μm和16 μm |
| 63 | 2025-12-14 |
STIFT: spatiotemporal transcriptomics integration through spatially informed multi-timepoint bridging
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf644
PMID:41370630
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIFT的时空转录组学整合框架，用于整合发育或再生过程中跨时间点的空间转录组学数据 | STIFT框架结合了发育时空最优传输、时空图构建以及基于时间三元学习的图注意力自编码器，专门为整合时空转录组学数据而设计 | NA | 整合时空转录组学数据，以去除批次效应、识别空间域、推断轨迹并探索发育动态 | 蝾螈脑再生、小鼠胚胎发育和3D涡虫再生数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图注意力自编码器 | 空间转录组学数据（2D或3D） | 数十万个spots | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2025-12-13 |
Integration of genetic, proteomic, and transcriptomic data identifies therapeutic targets and prognostic biomarkers in bladder cancer
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-443
PMID:41368242
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研究论文 | 本研究通过整合遗传、蛋白质组和转录组数据，识别了膀胱癌的潜在治疗靶点和预后生物标志物 | 整合跨组学定量性状位点、OLINK蛋白质组学和转录组学数据，结合前瞻性队列研究和多组学分析，识别新的治疗靶点和生物标志物 | 研究依赖于现有数据库和队列数据，可能受限于样本代表性和数据完整性，需要进一步实验验证 | 识别膀胱癌的分子靶点和候选药物，以改善早期诊断和精准治疗 | 膀胱癌患者及相关遗传、蛋白质和转录组数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | xQTLs, OLINK蛋白质组学, 转录组学, GWAS, 单细胞RNA测序, 甲基化分析 | Cox回归, 随机生存森林模型 | 遗传数据, 蛋白质数据, 转录组数据, 甲基化数据 | 来自UK Biobank Pharma Proteomics Project, deCODE Genetics和Atherosclerosis Risk in Communities study的数据，具体样本数量未明确说明 | OLINK, NA | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 甲基化测序 | OLINK平台, NA | OLINK高通量血浆蛋白测量平台，具体配置未详细说明 |
| 65 | 2025-12-13 |
Migrasome-related long non-coding RNAs orchestrate immune microenvironment and serve as a novel prognostic model in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-541
PMID:41368248
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和临床参数，识别了与透明细胞肾细胞癌预后相关的迁移体相关长链非编码RNA，并构建了一个包含五个MRLs的预后模型，用于风险分层和指导治疗策略 | 首次系统性地识别了迁移体相关长链非编码RNA在透明细胞肾细胞癌中的预后价值，并构建了一个基于五个MRLs的稳健预后模型，同时结合单细胞RNA测序揭示了肿瘤细胞内在VEGF信号通路在调节迁移体相关分子程序中的作用 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性数据，需要进一步的前瞻性临床验证，且单细胞RNA测序数据的样本量可能有限 | 系统识别与透明细胞肾细胞癌预后相关的迁移体相关长链非编码RNA，并构建一个稳健的预后模型以改善风险分层和指导潜在治疗策略 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 转录组分析、LASSO回归、单细胞RNA测序、RT-qPCR | LASSO回归模型 | 转录组数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA数据库中的透明细胞肾细胞癌患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-12-13 |
MSI2 exerts antitumor effects by regulating T-cell function in kidney renal clear cell carcinoma
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-437
PMID:41368259
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研究论文 | 本研究探讨了Musashi 2 (MSI2)在肾透明细胞癌中的表达及其与肿瘤微环境的关系，发现MSI2通过调节T细胞功能发挥抗肿瘤作用 | 首次在肾透明细胞癌中发现MSI2下调并具有抗肿瘤功能，揭示了其在T细胞分化中的动态表达模式 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且MSI2的具体调控机制仍需进一步探索 | 探索MSI2在肾透明细胞癌中的表达、功能及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肾透明细胞癌患者样本、肾细胞系、T细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、伪时序分析、Kaplan-Meier分析、富集分析 | NA | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | 基于公共数据库（TIMER2.0、UALCAN）的肾透明细胞癌患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2025-12-13 |
Multi-omics characterization of metabolic and immune interactions in prostate cancer
2025-Nov-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-502
PMID:41368255
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了前列腺癌中代谢重编程与免疫微环境之间的相互作用，并识别了具有预后意义的关键代谢生物标志物ENO1和CKB | 整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据，首次系统性地揭示了ENO1和CKB在前列腺癌代谢-免疫串扰中的关键作用，并构建了整合这些标志物与临床参数的预后列线图 | 研究主要基于公开数据集，缺乏独立的实验验证队列；单细胞数据来源未明确说明具体平台细节 | 阐明前列腺癌中代谢重编程与免疫微环境相互作用的调控机制，并识别关键的预后代谢生物标志物 | 前列腺癌组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 生物信息学分析 | 多组学分析框架, Seurat, Signac, CIBERSORT, GSVA, GSEA, Cox回归模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 临床数据 | TCGA-PRAD队列（具体样本数未明确说明）及公开可用的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 68 | 2025-12-13 |
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01961-4
PMID:41291215
|
研究论文 | 本研究揭示了单核/巨噬细胞通过NOD样受体信号通路（主要由NLRP3介导）在强直性脊柱炎发病机制中的关键作用，并识别了调控NLRP3的因子及潜在治疗药物 | 首次在AS中识别出经典的单核细胞-巨噬细胞-炎症性巨噬细胞分化轨迹，并明确了单核/巨噬细胞来源的NLRP3通过NOD样受体通路驱动疾病进展，同时发现了多个调控NLRP3表达的因子及潜在靶向治疗化合物 | 研究结论主要基于生物信息学分析和单细胞测序数据验证，仍需进一步的体内外功能实验和临床前模型验证 | 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 | 强直性脊柱炎患者及非AS患者的血液样本、GEO转录组数据集、AS患者和骨折对照患者的骨髓样本 | 生物信息学与免疫学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序、转录组分析、GSEA通路分析、生物信息学分析 | NA | 血液检测数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，涉及AS患者、非AS患者及骨折对照患者的血液和骨髓样本，并利用了GEO公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-12-13 |
Deciphering the role of angiogenesis in glioblastoma: Integrative insights from transcriptomic profiling, single-cell sequencing and interpretable machine learning approaches
2025-Nov-24, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156305
PMID:41380386
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析、单细胞测序和可解释机器学习方法，揭示了血管生成相关基因在胶质母细胞瘤中的作用，并建立了一个基于六个枢纽基因的风险分层模型 | 结合多种机器学习算法和SHAP分析提高模型可解释性，首次识别出六个枢纽ARGs并验证其在独立队列中的预后价值，同时揭示了高风险患者肿瘤微环境的免疫抑制和机械特性改变 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要进一步实验验证枢纽基因的功能机制和靶向治疗的临床效果 | 系统研究血管生成相关基因在胶质母细胞瘤进展中的功能意义，并开发预后预测模型 | 胶质母细胞瘤患者样本及其血管生成相关基因 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序，转录组分析 | Cox回归，LASSO回归，多种机器学习生存预测算法 | 转录组数据，单细胞测序数据 | 多个独立胶质母细胞瘤队列（CGGA-GBM、GSE43378、GSE7696） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2025-12-13 |
Study on the anti-liver cirrhosis of Fuzheng Huayu tablet : Targeting macrophage PPARα axis-fatty acid metabolic
2025-Nov-22, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157586
PMID:41380414
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研究论文 | 本研究通过基础实验评估了扶正化瘀片（FZHY）的抗肝硬化效果，并分析了其作用机制及活性成分 | 首次在基础研究层面评估FZHY的抗肝硬化效果，结合单细胞转录组学、代谢组学等多组学技术及分子生物学实验，揭示了其通过靶向巨噬细胞PPARα轴-脂肪酸代谢通路发挥作用的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证；机制验证虽全面，但人类样本数据缺乏 | 评估扶正化瘀片（FZHY）的抗肝硬化效果并阐明其作用机制及活性成分 | 肝硬化小鼠模型、巨噬细胞（Kupffer细胞、THP1细胞） | NA | 肝硬化 | 单细胞转录组学、代谢组学、16S RNA微生物组分析、流式细胞术、免疫组化、免疫共聚焦显微镜、WB、PCR、油红O染色、LC-MS、分子对接 | NA | 转录组数据、代谢组数据、微生物组数据、图像数据、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 16S RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-12-13 |
An etiology-stratified single-cell atlas identifies FABP4 as a prognostic marker for MASLD-related HCC
2025-Nov-06, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.10.026
PMID:41205757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了HBV感染和代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）对肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境的影响，并鉴定出FABP4作为MASLD相关HCC的潜在预后生物标志物 | 首次基于病因分层（HBV和MASLD状态）比较HCC的肿瘤微环境，并发现FABP4在MASLD相关HCC中通过促进血管正常化和增强CD8+ T细胞浸润来改善免疫治疗预后 | 样本量相对较小（12例患者进行单细胞测序），且主要基于回顾性队列分析，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 比较不同病因（HBV和MASLD）HCC的肿瘤微环境差异，并寻找病因特异性的预后生物标志物 | 肝细胞癌（HCC）患者样本，包括肿瘤和癌旁组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，免疫组织化学，多重免疫组织化学，体外和体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，组织图像数据 | 12例HCC患者的配对肿瘤和癌旁组织进行单细胞测序，224个样本进行免疫组化验证，并分析TCGA-LIHC和两个免疫治疗HCC队列的批量数据 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-12-13 |
Durable B-Cell Impairment While Sparing IgA B Cells After Ocrelizumab Therapy in Multiple Sclerosis
2025-Nov, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70135
PMID:40781066
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研究论文 | 本研究评估了多发性硬化症患者在使用奥瑞珠单抗治疗前、治疗期间及停药后的早期B细胞谱变化 | 首次通过光谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析奥瑞珠单抗治疗对B细胞亚群（特别是IgA B细胞）的长期影响及停药后的重建过程 | 样本量较小（18名患者和3名停药患者），且为观察性研究，需更大规模验证 | 探究奥瑞珠单抗在多发性硬化症中的作用机制及疾病病理生理学 | 早期未治疗的多发性硬化症患者和健康志愿者 | NA | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据，基因表达数据 | 18名患者，10名健康志愿者，3名停药患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-12-12 |
Single-cell transcriptome atlas of adult male and female human hookworm Ancylostoma ceylanicum
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113846
PMID:41362773
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研究论文 | 本研究构建了成年雄性和雌性锡兰钩虫的单细胞转录组图谱，揭示了性别特异性基因表达和细胞多样性 | 首次提供了钩虫的单细胞转录组图谱，发现了新的分子通路和标记物，为理解钩虫生物学提供了全面的细胞框架 | 未明确说明样本数量和技术重复，且仅针对锡兰钩虫，其他钩虫物种可能有所不同 | 推进对钩虫基本生物学的理解，为开发新的治疗或疫苗靶点提供基础 | 成年雄性和雌性锡兰钩虫 | 单细胞转录组学 | 钩虫病 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2025-12-12 |
Single-cell transcriptomics identifies altered neutrophil dynamics and accentuated T-cell cytotoxicity in tobacco flavored e-cigarette exposed mouse lungs
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638715
PMID:40027777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠在急性鼻吸入不同口味电子烟后肺部免疫细胞的转录组变化 | 首次在单细胞分辨率上揭示了不同口味电子烟暴露对肺部免疫细胞功能的特异性影响，特别是发现了烟草口味电子烟会改变中性粒细胞动力学并增强T细胞毒性 | 研究仅采用急性暴露模型（n=2/性别/组），样本量较小，且未评估长期暴露效应 | 探究不同口味电子烟急性暴露对小鼠肺部免疫景观的影响 | C57BL/6J小鼠肺部细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 71,725个细胞（来自对照组和处理组，每组每性别2只小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-12-12 |
Clonal expansion of alveolar fibroblast progeny drives pulmonary fibrosis in mouse models
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191826
PMID:40875468
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了肺泡成纤维细胞后代的克隆扩增是驱动小鼠肺纤维化的关键机制 | 首次系统性地证明了成纤维细胞增殖在肺纤维化中的关键驱动作用，并提出了靶向成纤维细胞增殖作为纤维化疾病治疗新策略 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证仅限于离体肺切片，需要更多临床研究验证 | 探究成纤维细胞增殖在肺纤维化发病机制中的功能重要性 | 小鼠肺泡成纤维细胞及其后代、人类纤维化肺组织 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、谱系追踪、EdU标记 | NA | 单细胞转录组数据、谱系追踪数据 | 2种独立的小鼠肺纤维化模型、人类纤维化与非病变肺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2025-12-12 |
The Spatial Atlas of Human Anatomy (SAHA): A Multimodal Subcellular-Resolution Reference Across Human Organs
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.16.658716
PMID:40611896
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研究论文 | 本文介绍了首个跨多器官系统的健康成人组织多模态亚细胞分辨率参考图谱——人体解剖空间图谱（SAHA） | 首次构建了跨多器官系统的健康成人组织多模态亚细胞分辨率参考图谱，整合了空间转录组学、蛋白质组学和组织学特征 | NA | 为空间诊断和下一代精准医学提供基础框架，开发能够模拟组织行为、解码复杂病理学的上下文感知模型 | 健康成人胃肠道和免疫组织，以及结直肠癌和炎症性肠病的比较分析 | 空间转录组学 | 结直肠癌, 炎症性肠病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单核RNA-seq | NA | 空间转录组数据, 蛋白质组数据, 组织学图像 | 超过100名捐赠者的1500多万个细胞 | NanoString, 10x Genomics, Advanced Cell Diagnostics, NanoString | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单核RNA-seq | CosMx SMI, 10x Xenium, RNAscope, GeoMx DSP | CosMx空间分子成像仪, 10x Xenium原位分析平台, RNAscope多重荧光原位杂交, GeoMx数字空间分析仪 |
| 77 | 2025-12-12 |
SMURF: soft-segmentation for single-cell reconstruction and topological analysis of spatial transcriptomic data
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656357
PMID:40502153
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SMURF的新型软分割算法，用于高分辨率空间转录组学数据中mRNA到单个细胞的准确分配及组织结构的拓扑分析 | 开发了跨平台的软分割算法SMURF，能够将捕获点中的mRNA映射到附近细胞核，并通过投影到笛卡尔坐标“展开”复杂组织结构，实现细胞类型组织和基因表达梯度的分析 | NA | 开发一种新计算方法，用于准确分配空间转录组学数据中的转录本到单个细胞，并分析细胞在原生组织环境中的基因表达 | 空间转录组学数据中的mRNA和细胞核 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 软分割算法 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 78 | 2025-12-12 |
scSPAF: Cell Similarity Purified Adaptive Fusion Network for Single-Cell Multi-Omics Clustering
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3608251
PMID:40928916
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研究论文 | 本文提出了一种名为scSPAF的单细胞多组学聚类网络，通过多层次融合方法探索组学数据的一致性和互补性 | 设计了细胞相似性纯化模块以整合细胞间的邻域信息，并采用自适应融合机制整合组学特异性表示和跨组学一致表示 | NA | 提升单细胞多组学聚类分析的性能 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 自适应融合网络 | 单细胞多组学数据 | 六个真实世界数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 79 | 2025-12-12 |
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00996-x
PMID:41174221
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研究论文 | 一项随机、双盲、安慰剂对照试验，评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对健康中年成年人免疫系统的影响 | 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够调节免疫细胞组成和功能，特别是扩增naive样CD8 T细胞并增强其脂肪酸氧化能力 | 样本量较小（50名参与者），干预时间较短（4周），且仅针对健康中年人群，未包括老年人或免疫功能低下个体 | 评估尿石素A作为干预措施，对抗与年龄相关的免疫衰退和炎症老化 | 50名健康中年成年人 | NA | 老年性疾病 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | 50名健康中年成年人 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-12-12 |
scGCRC: Graph and Contrastive-Based Representation Learning for Single-Cell RNA-Seq Data Clustering
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3629161
PMID:41191468
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研究论文 | 提出了一种基于局部自注意力网络和对比学习的单细胞RNA测序数据聚类新方法 | 通过局部自注意力网络自动聚合细胞关系图中的潜在信息，并采用双对比学习模块同时在细胞层面和聚类层面优化细胞表征，无需预训练自编码器-解码器模块 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，以更准确地识别细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 局部自注意力网络，对比学习，Leiden社区发现算法 | 基因表达数据 | 160个子样本数据集（含不同细胞类型数量）、3个不同协议数据集、9个真实公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |