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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
61 2026-01-10
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's disease (AD)
2025-Nov-29, Human genomics IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过多区域空间转录组学分析,揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 首次在AD中结合多区域空间转录组学和Aβ免疫荧光染色,系统比较了不同皮质区域的细胞类型比例、基因表达和细胞间通讯差异 样本量较小(仅2名Braak III和Thal 4期AD患者),且未包括早期AD阶段或健康对照样本 探究AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异及其分子机制 阿尔茨海默病患者的内嗅皮质、枕颞皮质、背外侧前额叶皮质和纹状皮质 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组学,免疫荧光染色 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 2名Braak III和Thal 4期AD患者的四个脑区样本 NA 空间转录组学 NA NA
62 2026-01-09
uPAR expression in M-MDSCs under high LDHA activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Nov-30, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了胰腺导管腺癌中高LDHA活性通过调节乳酸代谢影响M-MDSCs上uPAR表达,从而促进免疫抑制肿瘤微环境的机制 首次揭示了LDHA驱动的乳酸代谢通过胆固醇代谢途径调控M-MDSCs中uPAR表达的具体机制,并建立了LDHA活性与uPAR阳性M-MDSCs在人类PDAC样本中的临床相关性 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床验证;机制研究尚未完全阐明uPAR信号传导的具体下游通路 阐明高LDHA肿瘤微环境中乳酸代谢如何调节免疫细胞(特别是MDSCs)并促进胰腺癌免疫抑制 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞(MDSCs),特别是单核细胞性MDSCs(M-MDSCs) 肿瘤免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,基因集富集分析 小鼠Ldha敲低(shLdha)PDAC模型 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 小鼠PDAC模型和人类PDAC样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
63 2026-01-09
Genomic heterogeneity drives distinct infiltration patterns in glioblastoma
2025-Nov-29, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用高维空间转录组学技术,分析了胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,揭示了基因组异质性如何驱动不同的浸润模式 首次使用CosMx空间分子成像仪在单细胞分辨率下对胶质母细胞瘤的肿瘤核心和浸润边缘进行空间转录组分析,识别出一种新的胶质祖细胞样状态,并发现其在经典亚型中富集且与EGFR扩增或突变相关 样本量较小(仅8名患者),且研究基于福尔马林固定石蜡包埋样本,可能影响RNA质量,空间分析仅限于靶向1000个基因的panel 表征胶质母细胞瘤中浸润性肿瘤细胞的基因表达谱和细胞状态,以理解肿瘤异质性对疾病进展的影响 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织,包括肿瘤核心和浸润边缘 数字病理学 胶质母细胞瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 8名胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 NanoString 空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imager CosMx空间分子成像仪,使用靶向1000个基因的panel进行单细胞分辨率空间转录组分析
64 2026-01-09
Identification and validation of SUN modification-related anti-PD-1 immunotherapy-resistance signatures to predict prognosis and immune microenvironment status in glioblastoma
2025-Nov-29, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过生物信息学方法识别并验证了与泛素化、SUMO化和neddylation(统称SUN修饰)及抗PD-1免疫治疗耐药相关的关键基因,构建了一个用于预测胶质母细胞瘤预后和免疫微环境状态的六基因风险模型 首次整合SUN修饰与抗PD-1耐药性,识别出六个关键预后基因(PLK2、CDC73、PSMC2、SOCS3、ETV4、LMO7),并构建了具有优异预测性能(AUC>0.9)的预后风险模型,同时结合单细胞RNA测序和空间转录组分析揭示了SOCS3在单核细胞/巨噬细胞中的特异性表达及其潜在功能 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞系验证,缺乏大规模临床队列的独立验证和体内实验证据 探究SUN修饰相关基因在胶质母细胞瘤中的预后意义及其与抗PD-1免疫治疗耐药性的关联 胶质母细胞瘤(GBM)细胞系及相关的公共基因组学数据 生物信息学 胶质母细胞瘤 差异表达分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、机器学习算法、RT-qPCR、Western blotting、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组分析 机器学习算法(文中未指定具体模型类型) 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
65 2026-01-09
Single-cell transcriptome analysis defines novel molecular subtypes and reveals therapeutic implications of T/myeloid mixed-phenotype acute leukemia
2025-Nov-29, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析定义了T/髓系混合表型急性白血病(T/My MPAL)的新型分子亚型,并揭示了其治疗意义 首次构建了T/My MPAL的单细胞转录组图谱,定义了三种恶性细胞亚群(AML样、T-ALL样和独特亚群),并发现了传统流式细胞术分类的局限性 研究样本量相对有限,且部分发现需进一步临床验证 识别T/My MPAL的分子亚型并开发亚型特异性治疗策略,以改善预后和实现个性化治疗 T/髓系混合表型急性白血病(T/My MPAL)、急性髓系白血病(AML)、T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)患者及正常供体的细胞 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 近275,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
66 2026-01-09
CD74+CCL5+ effector CD8+ T cells drive mucosal inflammation and predict biologics response in inflammatory bowel disease
2025-Nov-29, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、GWAS孟德尔随机化及肠道微生物组分析,识别出CCL5+效应CD8+ T细胞是驱动炎症性肠病黏膜炎症的关键免疫细胞亚群,并开发了一个六基因模型用于预测疾病诊断和英夫利西单抗治疗反应 首次系统性地整合多组学数据,识别出CCL5+效应CD8+ T细胞作为IBD黏膜炎症的核心驱动者,并构建了一个基于六个因果关联基因的预测模型,用于疾病分层和治疗反应预测 样本量相对有限(如免疫组化验证仅涉及12名IBD患者和10名健康对照),外周血中CCL5+CD8+ T细胞的变化趋势不如组织明显,且研究结果需要进一步的功能和临床验证 识别驱动炎症性肠病发病机制的免疫细胞亚群和分子程序,并开发预测生物制剂治疗反应的生物标志物 炎症性肠病患者(包括克罗恩病和溃疡性结肠炎)的结肠组织、外周血样本以及肠道微生物组 数字病理学 炎症性肠病 单细胞RNA测序, 批量转录组去卷积, GWAS孟德尔随机化, 肠道微生物组分析, 免疫组化, 流式细胞术 六基因预测模型 单细胞RNA-seq数据, 批量转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 图像数据(免疫组化), 流式细胞数据 多个IBD队列(具体总数未明确说明),免疫组化涉及12名IBD患者和10名健康对照,流式细胞术涉及7名IBD患者和12名健康个体 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学(未明确指定,但涉及组织分析) NA NA
67 2026-01-09
GPR25 promotes the formation of lung and liver tissue-resident memory CD8 T cells
2025-Nov-21, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本研究揭示了G蛋白偶联受体GPR25在促进肺和肝脏组织驻留记忆CD8 T细胞形成中的关键作用 首次发现GPR25是TGF-β信号诱导的调节因子,通过增强TGF-β信号通路促进组织驻留记忆CD8 T细胞的发育和功能 研究主要基于小鼠模型,在人体中的功能验证尚需进一步研究 阐明组织驻留记忆CD8 T细胞发育的分子调控机制 GPR25缺陷型CD8 T细胞 免疫学 病毒感染与肿瘤 单细胞转录组测序、过继性转移、肿瘤攻击模型 动物模型 基因表达数据 未明确样本数量的小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
68 2026-01-08
Single-cell transcriptome analysis elucidates the microenvironmental interactions between colorectal cancer and sarcopenia
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组数据,揭示了结直肠癌与肌肉减少症之间共享细胞类型的跨组织功能异质性及其微环境相互作用机制 首次结合CRC肿瘤组织和SP肌肉组织的单细胞转录组数据,系统解析跨组织微环境异质性,识别共享核心细胞类型及其功能分化,并发现潜在的全域调控因子 样本量相对有限(16个CRC组织和17个SP组织),且主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证 阐明结直肠癌与肌肉减少症之间的微环境相互作用机制及其对预后的影响 结直肠癌肿瘤组织和肌肉减少症肌肉组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq) Harmony(批次效应校正)、CellChat(细胞通讯建模) 单细胞转录组数据 16个CRC肿瘤组织和17个SP肌肉组织 NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
69 2026-01-08
Identification of ferroptosis-related therapeutic targets and causal risk factors in aortic dissection via multi-omics integration
2025-Nov-28, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过多组学整合分析,识别了主动脉夹层中与铁死亡相关的关键基因、调控网络及潜在的因果风险因素 首次结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,系统探索了铁死亡相关基因在主动脉夹层中的细胞特异性表达模式,并揭示了肠道微生物和血清代谢物与疾病的潜在因果关系 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证;孟德尔随机化分析结果可能受混杂因素影响 阐明铁死亡在主动脉夹层发病机制中的作用,并寻找潜在的治疗靶点 主动脉夹层患者与对照组的基因表达数据、单细胞转录组数据、肠道微生物组和血清代谢组数据 生物信息学与多组学整合分析 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 LASSO回归, 受试者工作特征分析 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 基因组关联数据, 微生物组数据, 代谢组数据 基于公共数据库(GEO)的样本,具体数量未明确说明;涉及211种肠道微生物分类群和1400种血清代谢物的GWAS汇总数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
70 2026-01-08
The Dynamic UPR Rheostat Orchestrates Single-Cell Plasticity in Glioblastoma
2025-Nov-27, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过重新分析公开的单细胞RNA测序数据,揭示了胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂(IRE1/XBP1、ATF6、PERK)作为一个分级调控系统在单细胞分辨率上的动态协调机制 引入了臂特异性指标(如Rheostat Index和平衡度)来量化UPR各臂的活动及其协调性,并首次在单细胞水平上描绘了UPR三臂沿谱系轨迹的动态优势切换模式 转录组分析仅能推断臂特异性协调,功能验证需要扰动研究和蛋白质水平读数 探究胶质母细胞瘤中未折叠蛋白反应三臂是否作为单细胞分辨率的分级控制系统运作 胶质母细胞瘤细胞 单细胞组学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 发现队列871个细胞,验证队列11,877个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium, SMART-seq 10x Chromium单细胞基因表达解决方案,SMART-seq全长单细胞RNA测序技术
71 2026-01-08
Mesothelin-expressing triple-negative breast cancer: a highly invasive and immunosuppressive subtype
2025-Nov-25, Breast cancer research and treatment IF:3.0Q2
研究论文 本研究探讨了间皮素(MSLN)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及其与肿瘤侵袭性和免疫抑制微环境的关系 首次通过泛癌分析揭示MSLN在TNBC中的重要性,结合空间转录组学和单细胞数据识别MSLN高表达的肿瘤亚群及其特征 研究样本量有限,且主要基于局部队列,缺乏大规模多中心验证 探究MSLN在TNBC中的临床病理特征及其对治疗反应的影响 三阴性乳腺癌患者及其肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,单细胞数据 局部队列及公共单细胞数据,具体样本数未明确 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
72 2026-01-08
Effect of the mitophagy inducer urolithin A on age-related immune decline: a randomized, placebo-controlled trial
2025-Nov, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过一项随机、双盲、安慰剂对照试验,评估了线粒体自噬诱导剂尿石素A对健康中年成年人免疫系统的影响 首次在人体临床试验中证明尿石素A能够调节免疫细胞组成和功能,特别是扩增幼稚样CD8 T细胞并增强其脂肪酸氧化能力 样本量较小(50名参与者),干预时间较短(仅4周),且研究对象为健康中年成年人,结果可能不适用于其他人群 探究尿石素A是否能够改善与年龄相关的免疫衰退 健康中年成年人的外周血免疫细胞 NA 老年性疾病 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 临床数据,单细胞转录组数据 50名健康中年成年人 NA 单细胞RNA测序 NA NA
73 2026-01-07
SGMS2+ macrophages enhance NR4A3hi NK cell infiltration to improve prognosis and PD-1 treatment efficacy in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了SGMS2在肝细胞癌中通过极化巨噬细胞为M1表型并分泌CXCL2招募NR4A3hi NK细胞,从而改善预后和增强PD-1治疗效果的机制 首次阐明了SGMS2在巨噬细胞中的特异性作用,及其通过CXCL2介导的NK细胞招募机制改善肝细胞癌免疫微环境和PD-1治疗反应 研究主要基于回顾性临床数据和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本量相对有限(临床队列188例) 探究SGMS2在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其对患者预后和PD-1治疗疗效的影响 肝细胞癌患者组织样本、TCGA数据库、THP-1单核细胞系 数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、流式细胞术、慢病毒转染 NA RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 TCGA-LIHC数据集371例,独立临床队列188例(2017-2022) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
74 2025-11-29
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
75 2026-01-07
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞和批量转录组分析,揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用,并识别了FABP4、RNASET2和FILIP1L作为潜在诊断标志物和治疗靶点 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据,应用机器学习算法识别与巨噬细胞胆固醇代谢相关的关键基因,并构建风险评分模型进行外部验证,同时通过体外实验验证基因功能 研究主要依赖于公共数据库数据,可能受样本来源和批次效应影响;体外实验验证范围有限,需进一步体内研究确认基因功能 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制,并识别相关诊断和治疗靶点 动脉粥样硬化患者组织样本中的巨噬细胞及相关基因 生物信息学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 逻辑回归, 机器学习算法 转录组数据 来自GEO数据库的一个单细胞RNA测序数据集和多个批量mRNA转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
76 2026-01-07
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序数据,识别骨关节炎相关基因并预测潜在药物 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别关键基因,并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物效果 研究主要依赖公共数据集和预测算法,实验验证仅在斑马鱼模型中进行,未涉及人类临床试验 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 骨关节炎相关基因和候选药物 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,RT-qPCR 随机森林,hdWGCNA,PPI网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
77 2026-01-07
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
综述 本文综述了结直肠癌共识分子亚型分类的研究进展及其在预后预测和个性化治疗中的应用 系统总结了CMS分类的预后价值、预测作用、鉴定方法(包括基于深度学习的图像分类器)、与免疫治疗等靶向治疗的关联,并探讨了肿瘤内异质性带来的挑战及单细胞测序等新兴解决方案 肿瘤内异质性和技术壁垒阻碍了临床广泛应用 回顾CMS分类在结直肠癌中的研究进展,旨在推动亚型驱动的治疗策略 结直肠癌及其共识分子亚型 自然语言处理 结直肠癌 基因表达谱分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 深度学习 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
78 2026-01-07
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究设计了一种多酶纳米催化剂,通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶(Rh@SAE),首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗,并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 研究主要基于动物模型,尚未进行临床试验;纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎,改善临床预后 急性胰腺炎(AP)和重症急性胰腺炎(SAP)的病理过程 纳米医学 急性胰腺炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
79 2026-01-07
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的新型深度学习模型SpaMWGDA,用于空间转录组数据的空间域识别 通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强,成功捕获了spot特征的全面邻域信息,并自适应地学习空间信息与基因特征之间的依赖关系 未在摘要中明确提及 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 空间转录组数据 空间转录组学 NA 空间转录组学 多视图加权融合图卷积网络(GCN) 基因表达和空间信息数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
80 2026-01-06
Comparative Single-Cell Transcriptomics Uncovers Shared and Distinct Molecular Signatures in Cystic Fibrosis and Primary Ciliary Dyskinesia
2025-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过比较单细胞转录组学分析,揭示了囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍在分子特征上的异同 首次使用预训练的transformer模型(scGPT)进行基因调控网络分析,通过差异注意力分析识别两种疾病间注意力分数改变的基因和通路 研究依赖于公开可用数据及本团队生成的数据,可能存在样本选择偏差,且未进行实验验证 比较囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍的分子特征,以指导个性化治疗策略 囊性纤维化和原发性纤毛运动障碍患者的呼吸道细胞 自然语言处理 囊性纤维化,原发性纤毛运动障碍 单细胞RNA-seq transformer (scGPT) 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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