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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-12 |
Functional Diversity of Two Novel Embryonic Microglial Subpopulations and Their Developmental Trajectories in Developing Mouse Brains
2025-11, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70064
PMID:40714978
|
research paper | 发现小鼠胚胎大脑中两种新型小胶质细胞亚群及其发育轨迹 | 首次通过无分选单细胞RNA测序识别出两种新型胚胎小胶质细胞亚群EM1和EM2,并揭示其从CD68阴性向CD68阳性转化的发育轨迹 | 尚未在其他物种或人类中验证这些亚群的存在及其功能 | 探究胚胎小胶质细胞的异质性和发育轨迹 | 小鼠胚胎期第14天及出生后第1、14、90天的大脑细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 胚胎期第14天小鼠大脑样本,以及出生后不同时间点样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-05-09 |
Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration
2025-11, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001
PMID:41046113
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综述 | 本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生中的最新进展和新兴策略,重点讨论了其形成机制、工程策略和临床应用,并分析了大规模生产和免疫安全等关键挑战 | 系统总结了三维细胞球体技术在软骨再生中的优势,包括模拟体内微环境、增强细胞间相互作用、促进细胞外基质生成,同时提出结合智能生物材料和机器学习等新兴解决方案以实现个性化标准化生产 | 临床转化受限于细胞球体的长期稳定性有限、大规模生产困难和体内植入后的免疫排斥反应 | 总结三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新发展和未来方向,促进临床转化应用 | 三维细胞球体技术及其在软骨损伤修复、骨关节炎模型构建、药物筛选平台开发中的应用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 三维细胞球体技术、单细胞RNA测序 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2026-05-08 |
CRATER tumor niches facilitate CD8+ T cell engagement and correspond with immunotherapy success
2025-Nov-26, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.09.021
PMID:41109214
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研究论文 | 利用斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本,通过长期体内成像和高分辨率空间转录组学鉴定出肿瘤微环境中促进免疫治疗响应的CRATER肿瘤生态位 | 首次发现并定义CRATER(抗原呈递和T细胞结合滞留区)作为肿瘤基质与黑色素细胞边界处的口袋结构,该区域富含抗原识别分子并具有最高密度CD8 T细胞,在免疫检查点阻断治疗后扩张并与临床响应相关 | 未明确说明研究限制 | 鉴定在免疫治疗期间促进免疫应答的肿瘤微环境域 | 斑马鱼内源性黑色素瘤和人类黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、体内成像 | NA | 图像、转录组数据 | 斑马鱼肿瘤样本和人类黑色素瘤活检样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 64 | 2026-05-08 |
HMGA2 links morphological evolution and microenvironment dynamics to systemic therapy response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012568
PMID:41290257
|
研究论文 | 本研究探讨了HMGA2在透明细胞肾细胞癌中连接形态演变与肿瘤微环境动态,并影响系统治疗反应的作用 | 首次揭示HMGA2在ccRCC中通过促进形态演化和调节免疫微环境(特别是Tpex与cDC1的ICAM-1依赖性互作)来影响免疫检查点抑制剂联合疗法的反应 | 结论需要额外的实验研究来验证这些机制 | 研究HMGA2在ccRCC形态演变、肿瘤微环境动态及系统治疗反应中的作用及其临床影响 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者的肿瘤样本,包括原发性和转移性队列 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学, 免疫组化, 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 图像, 文本, 转录组数据 | 原发性ccRCC样本(ST样本)、转移性ccRCC队列(IHC及RNA-seq数据)以及scRNA-seq和mIHC数据集 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Visium, NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台、Illumina NovaSeq平台用于批量RNA测序和单细胞RNA测序 |
| 65 | 2026-05-06 |
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002903
PMID:40607924
|
研究论文 | 通过多组学泛癌分析揭示MS4A2在肺腺癌中的功能景观,并将其重新定义为肥大细胞驱动的肿瘤进展守护者 | 首次整合四个生存指标(OS/DSS/PFI/DFI)的预后评估,并发现MS4A2通过双向趋化因子调控建立免疫抑制微环境,同时高表达肿瘤对化疗药物敏感 | 未在独立外部队列中验证其预后模型的泛化性,且MS4A2调控免疫微环境的具体分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明MS4A2在肺腺癌中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 33种癌症类型的转录组数据(TCGA/GTEx)和非小细胞肺癌单细胞转录组数据 | 机器学习 | 肺腺癌 | 转录组测序,单细胞转录组测序 | Cox回归,Kaplan-Meier模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据,药物敏感性数据 | 33种癌症的bulk RNA-seq样本和NSCLC单细胞测序队列 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | TCGA/GTEx数据库和GDSC药物基因组学数据 |
| 66 | 2026-05-05 |
Phylogenomic Analysis of Deep-Branching Telonemid
2025-11-28, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf202
PMID:41157959
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序和系统基因组学分析,研究深分支Telonemid的进化关系 | 首次从太平洋远洋水域分离出TEL2亚群的单细胞,填补了Telonemia类群稀疏采样空白,并揭示了其与SAR超类群及其他不稳定超类群的系统发育关系 | 贝叶斯分析未能收敛到同一拓扑结构,且结果在不同数据子集和参数设置下表现出不稳定性 | 探究Telonemia类群与Stramenopila-Alveolata-Rhizaria超类群及其他稀疏采样超类群的进化关系 | 太平洋远洋水域中分离的单个Telonemid细胞(TEL2亚群) | 系统基因组学 | NA | 单细胞转录组测序、系统基因组学分析 | 最大似然法 | 转录组序列 | 1个单细胞样本(太平洋远洋水域) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 67 | 2026-05-03 |
Alterations in Resident Immune Cells in Prenatal Trisomy 21 Lungs
2025-Nov-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14231866
PMID:41369355
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了产前唐氏综合征(T21)胎儿肺部的免疫细胞变化,发现B细胞显著减少,可能解释了对呼吸道感染的易感性增加 | 首次在产前阶段利用单细胞RNA测序技术系统描绘唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞图谱,并发现B细胞数量和成熟标志物的显著改变 | 样本量较小(T21组5例,对照组4例),且仅关注产前阶段,未探讨出生后免疫系统的变化 | 探究产前唐氏综合征胎儿肺部免疫细胞的变化,以解释其对呼吸道感染易感性增高的原因 | 产前唐氏综合征(T21)和非唐氏综合征(非T21)胎儿的肺部组织 | 数字病理学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 免疫荧光染色, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 组织切片图像 | 5例唐氏综合征胎肺和4例非唐氏综合征胎肺 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 68 | 2026-05-03 |
Mouse cortical cellular diversification through lineage progression of radial glia
2025-11-03, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.352826.125
PMID:40774817
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞RNA测序和单核ATAC测序,研究小鼠皮层放射状胶质细胞谱系进程驱动的细胞多样化 | 首次结合时间序列scRNA-seq和snATAC-seq,系统揭示了放射状胶质细胞从早期到晚期转变过程中,通过限制广泛表达的转录因子到特定阶段和细胞类型,驱动皮层细胞多样化的染色质可及性机制 | 未提及 | 研究小鼠皮层放射状胶质细胞内在程序如何驱动皮层细胞多样化 | 纯化的小鼠皮层祖细胞(放射状胶质细胞、中间神经元祖细胞、中间胶质祖细胞) | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 多个胚胎和出生后阶段的小鼠皮层祖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序 | NA | NA |
| 69 | 2026-05-03 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-data set cell type annotation with CAMUS
2025-Nov-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
|
研究论文 | 提出了一种名为CAMUS的跨数据集细胞类型注释方法,通过通用参考数据和方法选择策略实现高准确率和高效率的注释 | 首次提出一种通用的参考数据和方法选择策略,用于跨数据集细胞类型注释,显著提升注释准确率 | 未明确提及局限性,但可能依赖于参考数据集的多样性和覆盖度 | 开发一种能够自动选择最佳参考数据和方法的高准确率细胞类型注释方法 | 跨物种单细胞RNA测序、单细胞空间转录组和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达矩阵 | 672对跨物种单细胞RNA测序数据集、80个单细胞空间转录组数据集和5个单细胞ATAC测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-05-03 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮(SLE)患者血液中CD4+ T细胞的异质性,发现辅助性和功能失调的调节性T细胞亚群 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序详细描绘CD4+ T细胞的复杂亚群,特别是发现功能失调的调节性T细胞亚群与狼疮肾炎相关,并揭示TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调可能关联粘膜微生物失调 | 未提供具体局限性信息 | 阐明系统性红斑狼疮(SLE)中CD4+ T细胞的复杂性和亚群特征,以理解其对疾病活动性和免疫失调的影响 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自儿科患者和健康供体的血液CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用分选后的血液CD4+ T细胞进行单细胞RNA测序 |
| 71 | 2026-05-01 |
White and brown adipose tissue share a convergent fibro-adipogenic progenitor population
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00591-6
PMID:41062857
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对培养的原代白色和棕色前脂肪细胞进行分析,发现两者共享一种共同的纤维脂肪祖细胞亚群 | 首次在棕色脂肪组织中发现纤维脂肪祖细胞样细胞,并揭示白色和棕色脂肪组织祖细胞亚群存在保守性特征 | 研究主要基于体外培养系统,体内验证需进一步扩展;未深入探讨FAPL在病理条件下的功能差异 | 探究体外培养条件对白色和棕色脂肪组织祖细胞异质性的影响及其生理相关性 | 原代白色和棕色前脂肪细胞 | 机器学习和单细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2026-04-30 |
Monocyte/macrophage-derived NLRP3 Promotes the Onset and Progression of Ankylosing Spondylitis Via the NOD-like Receptor Pathway
2025-Nov-26, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01961-4
PMID:41291215
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research paper | 本研究通过单细胞测序和转录组分析揭示了单核细胞/巨噬细胞衍生的NLRP3通过NOD样受体通路促进强直性脊柱炎的发病和进展 | 首次通过单细胞测序分析强直性脊柱炎患者骨髓样本,明确单核细胞-巨噬细胞-炎症性巨噬细胞分化轨迹,并识别NLRP3的核心作用及上游调控因子 | 未提及具体局限性 | 阐明强直性脊柱炎的致病通路并探索潜在治疗策略 | 从强直性脊柱炎患者和骨折对照患者收集的骨髓样本 | machine learning | 强直性脊柱炎 | 单细胞测序, 转录组分析 | NA | 单细胞数据, 转录组数据 | 强直性脊柱炎患者与骨折对照患者的骨髓样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-04-29 |
Multi-omics reveals changes in astrocyte fatty acid metabolism during early stages of Alzheimer's disease
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106049
PMID:40889558
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研究论文 | 通过多组学分析揭示阿尔茨海默病早期星形胶质细胞脂肪酸代谢的变化 | 首次通过多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)联合分析,系统描述了阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的动态变化,并利用人类单细胞RNA测序数据验证了这些变化的临床相关性 | 尚未说明具体局限性 | 探究阿尔茨海默病早期星形胶质细胞中脂肪酸代谢的分子动态变化及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病模型APP/PS1小鼠和野生型小鼠的星形胶质细胞,以及人脑样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 多组学(转录组学、蛋白质组学、空间代谢组学)、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物空间分布数据、单细胞转录组数据 | APP/PS1和WT小鼠在5个时间点(2、4、6、9、12月龄)的星形胶质细胞样本;人脑单细胞核RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-04-29 |
Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system
2025-11, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050
PMID:40930164
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综述 | 系统梳理少突胶质前体细胞与中枢神经系统中其他细胞类型的动态相互作用机制 | 利用单细胞测序和体内成像等新技术,揭示了OPC在神经发育、组织稳态维持和病理微环境重塑中与多种CNS细胞群进行广泛动态相互作用的功能可塑性 | NA | 综合OPC多模式功能的现有证据,评估非成髓鞘贡献,并探讨神经再生医学的有前景治疗靶点 | 少突胶质前体细胞(OPCs)及其与神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞和血管内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 多发性硬化症、脑缺血 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-04-28 |
A novel zinc finger protein gene signature for prognostic prediction, tumor microenvironment characterization, and therapeutic response in uterine corpus endometrial carcinoma
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28415-6
PMID:41309884
|
研究论文 | 利用锌指蛋白基因构建风险评分模型,用于子宫内膜癌的预后预测、肿瘤微环境表征及治疗反应评估 | 首次系统利用锌指蛋白基因确定子宫内膜癌患者的预后结局,并建立风险评分模型 | 基于公开数据库分析,缺乏独立外部验证队列及前瞻性临床验证 | 开发基于锌指蛋白基因的预后预测模型,评估其在子宫内膜癌中的临床应用价值 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、数据非依赖采集定量蛋白质组学分析 | LASSO回归、Cox比例风险回归模型 | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | 未明确说明具体样本数量(来自TCGA和GEO数据库的子宫内膜癌样本) | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-04-28 |
Lactylation-related gene signatures define immune heterogeneity and provide diagnostic biomarkers for periodontitis
2025-Nov-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30213-z
PMID:41310117
|
研究论文 | 通过系统分析牙周炎患者与健康对照的基因表达数据集和单细胞RNA测序数据,鉴定乳酸化相关基因特征,揭示免疫异质性并建立诊断标志物 | 首次系统性地将蛋白质乳酸化修饰与牙周炎的免疫微环境联系起来,通过多级整合分析(包括批量基因表达、单细胞RNA测序和机器学习)识别核心诊断标志物EAF1、NEFL和VIM,并揭示乳酸化相关基因在免疫重塑中的作用 | 数据来源于公开数据集,可能受限于样本大小和异质性;需要更大规模的临床验证来确认诊断标志物的普适性;乳酸化修饰的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究乳酸化相关基因在牙周炎免疫异质性中的作用及其作为诊断标志物的潜力 | 牙周炎患者与健康对照者的牙龈组织和外周血单核细胞 | 机器学习 | 牙周炎 | 基因表达微阵列、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | LASSO回归、随机森林、极限梯度提升 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | GSE10334和GSE16134两个基因表达数据集,以及来自牙周炎患者和健康对照的外周血单核细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-04-28 |
Cross-species identification of conserved cell-type specific mechanisms during early placenta development in ruminants
2025-Nov-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29895-2
PMID:41298965
|
研究论文 | 整合绵羊和牛早期胎盘发育的单细胞RNA测序数据,跨物种鉴定保守的细胞类型特异性机制 | 首次通过跨物种单细胞转录组分析,揭示反刍动物早期胎盘中上皮-间充质转化作为保守关键过程,并发现牛特有的两种滋养层细胞亚群 | 仅依赖已发表的scRNA-seq数据,可能缺少动态时间点或空间信息;未对EMT进行功能验证实验 | 阐明反刍动物早期胎盘发育中保守的细胞类型特异性机制 | 绵羊和牛的早期胎盘组织 | 数字病理学 | 妊娠失败 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 整合绵羊和牛的scRNA-seq数据,具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-04-28 |
Single-cell RNA sequencing revealed the association between proximal tubular epithelial cells and renal interstitial cells in chronic kidney disease progression
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28988-2
PMID:41286490
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示近端肾小管上皮细胞与肾间质细胞在慢性肾病进展中的关联 | 首次鉴定出位于S1节段的受损近端肾小管上皮细胞亚群PT_5,并阐明其通过多种配体-受体对与巨噬细胞、成纤维细胞及免疫细胞协同作用,驱动慢性肾病进展的新机制 | 尚需进一步验证PT_5在人体组织中的存在及其与特定间质细胞协调促进疾病进展的分子机制 | 研究受损近端肾小管上皮细胞在慢性肾病发生中的特征及其与间质细胞的协同机制 | 通过腺嘌呤饮食诱导的慢性肾病小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 共使用0.2%腺嘌呤饮食喂养2周、4周和8周的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-04-28 |
Senescence-related gene signatures in Crohn's disease: integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis
2025-Nov-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-29727-3
PMID:41286494
|
研究论文 | 本研究整合批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,识别与克罗恩病相关的衰老基因特征 | 首次系统性地结合批量与单细胞RNA测序技术,揭示五个衰老相关枢纽基因(STAT1、S100A11、FILIP1L、F3和HPS5)在克罗恩病中的潜在作用及其与免疫浸润的关联 | 未详细说明样本量大小及独立外部数据集的具体来源,可能限制结果的普适性 | 探讨衰老相关基因在克罗恩病中的具体作用及其对预后的影响 | 克罗恩病患者肠道组织样本及小鼠模型 | 计算生物学 | 克罗恩病 | RNA-seq | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-04-28 |
LRP12 promotes gastric cancer progression through AKT/mTOR signaling and M2 macrophage-mediated immunosuppression
2025-Nov-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28503-7
PMID:41276539
|
研究论文 | LRP12通过AKT/mTOR信号通路和M2巨噬细胞介导的免疫抑制促进胃癌进展 | 首次鉴定LRP12为炎症相关预后标志物,并揭示其通过激活AKT/mTOR通路和诱导M2巨噬细胞极化参与胃癌免疫抑制微环境调控 | 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏大规模临床验证及体内免疫微环境动态分析 | 鉴定胃癌中与炎症反应相关的预后生物标志物并阐明其调节肿瘤免疫微环境的机制 | 胃癌细胞系及患者组织样本 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞转录组测序、多重免疫荧光、免疫组化、Western blot、异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织图像 | 公共数据集及内部队列样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |