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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 761 | 2025-11-18 |
Genetic and Cellular Architecture of Breast Cancer Risk in Multi-Ancestry Studies of 159,297 Cases and 212,102 Controls
2025-Nov-07, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.20.25334075
PMID:40909829
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研究论文 | 本研究通过多祖先群体的全基因组关联分析,探索了乳腺癌的遗传结构和细胞特征 | 迄今为止规模最大的多祖先乳腺癌GWAS研究,整合单细胞RNA-seq图谱识别跨祖先共享的细胞类型关联 | 样本量在不同祖先群体间分布不均,某些群体间的遗传相关性估计存在较大标准误 | 探索乳腺癌在多祖先群体中的遗传结构和细胞基础 | 159,297例乳腺癌患者和212,102例对照,涵盖非洲、东亚、欧洲和西班牙/拉丁裔祖先群体 | 基因组学 | 乳腺癌 | GWAS, 单细胞RNA-seq | 稀疏正态混合效应模型 | 基因组关联汇总统计数据 | 159,297病例和212,102对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens单细胞RNA-seq图谱 |
| 762 | 2025-11-18 |
Rs61731397-C in OR2A25 increases the risk of chronic rhinosinusitis in the Chinese population
2025-Nov, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.032
PMID:40669566
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析发现OR2A25基因中的rs61731397-C变异会增加中国人群慢性鼻窦炎的发病风险 | 首次在中国人群中鉴定出OR2A25基因变异与慢性鼻窦炎的关联,并通过功能实验证实该变异通过降低蛋白稳定性影响疾病发生 | 研究主要聚焦于中国人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别中国人群慢性鼻窦炎的遗传风险变异并阐明其作用机制 | 中国人群(昆山队列和北京队列) | 遗传学 | 慢性鼻窦炎 | 全基因组关联分析、单细胞RNA测序、结构预测、体外表达研究、Western blot分析 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 两个独立队列(昆山队列和北京队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 763 | 2025-11-18 |
Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index
2025-Nov, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC
PMID:40938630
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析识别了非结核分枝杆菌肺病的新遗传位点,并发现体重指数可能具有保护作用 | 发现了两个新的NTM-PD相关遗传位点,并验证了一个已知位点,首次通过孟德尔随机化证明体重指数与NTM-PD存在潜在因果关系 | 研究样本主要来自亚洲人群,欧洲队列样本量相对较小 | 识别NTM-PD的遗传结构并探索其与风险因素的关联 | 非结核分枝杆菌肺病患者和健康对照者 | 基因组学 | 肺部疾病 | 全基因组关联研究, 单细胞转录组测序, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 韩国队列: 1,949例患者和2,955例对照; 日本队列: 1,137例患者和1,546例对照; 欧洲队列: 243例患者和570例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 764 | 2025-11-18 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals neutrophil diversity and spatial heterogeneity in acute kidney injury
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148478
PMID:41135905
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示急性肾损伤中中性粒细胞的多样性和空间异质性 | 首次在AKI中鉴定出6个中性粒细胞亚群,其中3个为全新发现;发现了以中性粒细胞为中心的新型微环境单元 | NA | 阐明急性肾损伤中中性粒细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 急性肾损伤模型中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 765 | 2025-11-18 |
The cell as a token: high-dimensional geometry in language models and cell embeddings
2025-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf595
PMID:41165609
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综述 | 探讨自然语言嵌入结构理解如何为单细胞数据集分析提供启示 | 将语言模型中的标记概念与细胞嵌入相类比,提出高维几何结构的相似性分析 | NA | 探索语言模型分析方法在单细胞数据分析中的应用前景 | 单细胞测序数据和语言模型嵌入结构 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型, 语言模型 | 单细胞数据, 文本数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 766 | 2025-11-18 |
Advancing Precision Medicine in Inflammatory Skin Disease
2025-Nov, American journal of clinical dermatology
IF:8.6Q1
DOI:10.1007/s40257-025-00963-7
PMID:40819342
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观点文章 | 本文探讨精准医学在慢性炎症性皮肤病治疗中的应用前景与挑战 | 提出将单细胞RNA测序和空间转录组学等精准技术整合到皮肤病诊疗框架中,通过分子表型分析提升治疗精准度 | 生物标志物验证有限、成本高昂、研究队列广度不足 | 推动精准医学在皮肤病学领域的临床应用 | 慢性炎症性皮肤病患者 | 精准医学 | 炎症性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 分子表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 767 | 2025-11-18 |
Specificity of brassinosteroid perception and its integration at signaling crossroads in vascular development
2025-Nov, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70570
PMID:41235729
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综述 | 本文综述了油菜素甾醇信号感知的特异性及其在维管发育信号交叉点的整合机制 | 揭示了BR感知主要具有细胞自主性和强烈环境依赖性,并作为模块化局部调节器通过典型和非典型途径协调植物发育 | NA | 探讨油菜素甾醇信号感知的特异性及其与其他信号通路的整合机制 | 植物维管发育系统 | 植物分子生物学 | NA | 组织特异性CRISPR、先进成像技术、单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 768 | 2025-11-18 |
CluVar: clustering of variants using autoencoder for inferring cancer subclones from single cell RNA sequencing data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf603
PMID:41240059
|
研究论文 | 提出基于自编码器的CluVar框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断癌症亚克隆的系统发育关系 | 开发了针对scRNA-seq数据高缺失率特点的自定义损失函数和多隐藏层聚类优化方法 | 未明确说明样本规模和对不同癌症类型的普适性验证 | 从单细胞RNA测序数据重建癌症亚克隆的进化轨迹 | 肿瘤组织中的恶性亚克隆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 769 | 2025-11-18 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human bladder cancer
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00947-z
PMID:40819112
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和空间代谢组技术,揭示了人类膀胱癌的代谢异质性 | 首次结合空间转录组学和空间代谢组学技术系统研究膀胱癌的分子机制 | NA | 探索膀胱癌恶性转化的分子机制 | 人类膀胱癌组织及癌旁正常组织 | 空间生物学 | 膀胱癌 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 770 | 2025-11-18 |
Bone morphogenetic protein 1 as a macromolecular pan-cancer biomarker modulating the immune microenvironment and malignant phenotypes in glioblastoma
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148136
PMID:41067356
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示骨形态发生蛋白1(BMP1)在胶质母细胞瘤中的致癌作用,并发现AH.6809化合物能有效抑制肿瘤生长 | 首次系统阐明BMP1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的调控机制,并通过分子对接发现新型抑制剂AH.6809 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多体内实验验证 | 探索BMP1在胶质母细胞瘤进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,动态模拟,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 利用TCGA、CGGA、GEO、CPTAC、TISCH、HPA、SpatialTME等多个公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 771 | 2025-11-18 |
GPX2 induces macrophage M2 polarization through the MIF signaling pathway to promote colorectal cancer progression
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148341
PMID:41106750
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研究论文 | 本研究揭示了GPX2通过MIF信号通路诱导巨噬细胞M2极化从而促进结直肠癌进展的新机制 | 首次发现GPX2通过USP7介导的去泛素化稳定MIF表达,进而促进巨噬细胞M2极化的新信号轴 | NA | 阐明GPX2在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、动物模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 772 | 2025-11-17 |
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2025-Nov-15, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00364-0
PMID:41241671
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研究论文 | 本研究通过时空转录组学分析揭示了铁死亡在缺血再灌注急性肾损伤中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 整合单细胞和空间转录组学技术,首次系统揭示TFRC等铁死亡相关基因在肾小管细胞中的空间表达模式及其与巨噬浸润的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究铁死亡相关基因在急性肾损伤中的表达特征、空间分布及免疫相互作用,寻找潜在治疗靶点 | 小鼠缺血再灌注急性肾损伤模型、肾小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,共培养实验 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 773 | 2025-11-17 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术,揭示了胰腺中细胞群落的空间组织模式及其在功能组织架构形成中的作用 | 首次系统性地绘制了胰腺从胚胎发育到成年稳态的空间细胞图谱,发现了上皮-间质单元作为基本组织微环境,并揭示了间质谱系在发育过程中的多样化与成年后的简化过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 解析胰腺组织中细胞空间组织和相互作用的机制 | 小鼠和人类胰腺组织,从胚胎发育到成年阶段的细胞 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠胚胎发育到成年多个时间点的胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 774 | 2025-11-17 |
A single-cell multi-omics framework identifies immune cell drivers of migraine and repurposable therapeutics
2025-Nov-13, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02179-w
PMID:41233745
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研究论文 | 本研究通过建立单细胞多组学分析框架,识别偏头痛的免疫细胞驱动因素和可重新利用的治疗药物 | 首次整合单细胞表达数量性状位点数据和单细胞孟德尔随机化分析,系统探索偏头痛的免疫介导调控机制 | 未在文中明确说明研究的具体局限性 | 探索偏头痛的免疫遗传学基础并识别潜在治疗靶点 | 14种免疫细胞类型和9,117个独特的sc-eQTL | 生物信息学 | 偏头痛 | 单细胞表达数量性状位点分析, 单细胞孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 全表型组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据, 表型数据 | 涉及9,117个sc-eQTL和14种免疫细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 775 | 2025-11-17 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing analysis to reveal characterization of mechanical stimulus-related genes and prognostic signatures in breast cancer
2025-Nov-13, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-025-02130-6
PMID:41233852
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研究论文 | 通过整合bulk和单细胞RNA测序分析,揭示机械刺激相关基因在乳腺癌中的特征并建立预后预测模型 | 首次建立基于机械刺激相关基因的乳腺癌预后评分模型,并在单细胞分辨率上验证机械刺激对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 预测乳腺癌患者预后并理解机械刺激在乳腺肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, SCISSOR算法, 体外和体内实验 | 预后评分模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库乳腺癌样本,具体数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 776 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice
2025-Nov-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01499-3
PMID:41225641
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中具有白血病前特征的髓系偏态造血干细胞祖细胞亚群的扩增机制 | 首次在骨质疏松模型中系统鉴定并表征了具有白血病前特征的髓系偏态HSPC亚群,并发现BRD4染色质重塑蛋白在此过程中的关键调控作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证;BRD4抑制剂仅部分恢复表型,可能存在其他调控机制 | 探究骨质疏松条件下髓系偏态造血的发生机制及其与白血病发生的关系 | 废用性骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 777 | 2025-11-17 |
Microglial HMOX1 drives retinal angiogenesis via modulation of endothelial STAT3 signaling
2025-Nov-11, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示小胶质细胞HMOX1通过调控内皮STAT3信号通路驱动视网膜血管生成的新机制 | 首次发现小胶质细胞HMOX1在缺氧条件下通过旁分泌信号激活内皮STAT3-VEGF轴驱动病理性血管生成 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究小胶质细胞HMOX1在视网膜血管生成中的作用机制 | 早产儿视网膜病变小鼠模型、小胶质细胞和内皮细胞 | 分子生物学 | 早产儿视网膜病变 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞共培养实验 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 778 | 2025-11-17 |
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Nov-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.09.011
PMID:41151577
|
研究论文 | 开发了一种人类心脏-巨噬细胞组装体模型,用于模拟免疫-心脏相互作用并研究心律失常疾病 | 首次通过将自体人类多能干细胞衍生的胚胎单核细胞整合到心脏类器官中,生成生理相关的心脏组织驻留巨噬细胞 | NA | 研究免疫-心脏相互作用机制并建立心律失常疾病模型 | 人类心脏-巨噬细胞组装体模型 | 疾病建模 | 心律失常 | 单细胞转录组学、实时成像、蛋白质组学 | 组装体模型 | 转录组数据、图像数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 779 | 2025-11-17 |
Inhibition of microglial Slc2a5 attenuates ischemic brain injury
2025-Nov-06, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156429
PMID:41205649
|
研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞Slc2a5介导的果糖代谢通路在急性缺血性脑卒中中的关键作用 | 首次发现小胶质细胞Slc2a5通过调控果糖代谢影响脑卒中进展,并阐明PKM2在此过程中的介导作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究小胶质细胞果糖代谢在急性缺血性脑卒中中的作用机制 | 小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 急性缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序,体外实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 780 | 2025-11-17 |
Distinct Tumor-Associated Macrophage Signatures Shape the Immune Microenvironment and Patient Prognosis in Renal Cell Carcinoma
2025-Nov-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211740
PMID:41227385
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发了肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞特征,建立了预后风险模型 | 首次在肾细胞癌中系统鉴定8种不同的肿瘤相关巨噬细胞特征,并构建27基因风险预测模型 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞特征对肾细胞癌免疫微环境和患者预后的影响 | 肾细胞癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,LASSO Cox回归分析 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床生存数据 | TCGA数据集和多个独立肾细胞癌队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |