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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-11-15 |
Spatial Multiomics Defines a Shared Tumor Infiltrative Signature at the Resection Margin in High-Grade Gliomas
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4708
PMID:40759029
|
研究论文 | 本研究通过空间多组学技术定义了高级别胶质瘤切除边缘的共享肿瘤浸润特征 | 首次在匹配的肿瘤核心和边缘区域生成单核多组学数据集,结合空间转录组学识别出跨HGG亚型的共享浸润特征 | 样本量较小(4例用于单核测序,2例用于空间转录组学),需要更大队列验证 | 研究高级别胶质瘤切除边缘的残留病变生物学特征 | 高级别胶质瘤患者的肿瘤核心和边缘组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9, 染色质免疫沉淀测序 | 计算分析包括功能富集、差异分析、RNA速度和伪时间分析 | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 4例不同亚型的4级高级别胶质瘤(36,811个snRNA-seq核,30,705个snATAC-seq核),外加2例用于空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 722 | 2025-11-15 |
Insulin signalling-associated cell fate promotes neoplastic invasiveness in non-functioning pituitary gonadotroph adenoma via cis-regulatory elements activation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03122-1
PMID:40935899
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据揭示了胰岛素信号相关细胞命运通过顺式调控元件激活促进无功能性垂体促性腺激素腺瘤的侵袭性 | 首次发现胰岛素信号相关细胞命运驱动肿瘤侵袭性,并识别了SREBF1和IGF2BP2相关顺式调控元件在染色质互作重建中的关键作用 | 样本量相对有限(3例单细胞测序患者),需要更大规模研究验证 | 探究无功能性垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的分子机制 | 无功能性垂体促性腺激素腺瘤患者和原代细胞系 | 单细胞多组学 | 垂体腺瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 顺式共可及网络分析 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 | 3例NFGA患者(单细胞测序),210例患者队列验证,3个原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 723 | 2025-11-15 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
|
综述 | 本文系统阐述了免疫细胞在心脏损伤中的动态变化机制及其治疗意义 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据,提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明免疫细胞在心血管疾病中的动态作用机制及治疗策略 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 724 | 2025-11-15 |
Spatial immune landscapes of the human placenta: Biomarkers and therapeutic insights in pregnancy disorders
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118688
PMID:41160999
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研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学技术揭示人类胎盘的免疫景观及其在妊娠疾病中的生物标志物和治疗潜力 | 首次利用空间分析技术解析胎盘微环境中免疫细胞与滋养细胞的相互作用空间组织 | 未整合多组学和纵向分析数据 | 研究胎盘微环境在妊娠疾病中的免疫调控机制 | 人类胎盘组织 | 空间转录组学 | 妊娠疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间基因表达数据, 空间蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 725 | 2025-11-15 |
Osteopontin inhibitor alleviates neuroinflammation after subarachnoid hemorrhage in rats via TLR4/NF-κB pathway
2025-Nov, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨骨桥蛋白抑制剂通过TLR4/NF-κB通路减轻大鼠蛛网膜下腔出血后神经炎症的作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现蛛网膜下腔出血大鼠颞叶组织中SPP1(OPN)显著增加,并验证OPN抑制剂通过TLR4/NF-κB通路发挥神经保护作用 | 研究仅使用大鼠模型,样本量未明确说明,缺乏临床验证 | 研究骨桥蛋白抑制剂对蛛网膜下腔出血后神经炎症的保护作用 | 蛛网膜下腔出血大鼠模型 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序,脑立体定向注射,免疫荧光 | 动物模型 | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 726 | 2025-11-15 |
The role of hypothyroidism in cirrhosis pathogenesis: A retrospective cohort study and multi-omics integration analysis
2025-Nov, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011947
PMID:41202080
|
研究论文 | 本研究通过回顾性队列分析和多组学整合分析揭示了甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系及潜在分子机制 | 首次揭示甲状腺功能减退症与肝硬化之间的因果关系,发现HLA-DQA1和CD27作为潜在治疗靶点,并鉴定甘草酸和左甲状腺素钠为候选药物 | 研究主要基于回顾性数据和遗传分析方法,需要进一步实验验证 | 探讨甲状腺功能减退在肝硬化发病机制中的作用 | 肝硬化患者和甲状腺功能减退患者 | 多组学整合分析 | 肝硬化 | 连锁不平衡评分回归,孟德尔随机化,转录组关联研究,加权基因共表达网络分析,单细胞RNA测序,分子对接 | 孟德尔随机化模型,基因共表达网络模型,分子对接模型 | 临床数据,遗传数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 基于Medical Information Mart for Intensive Care临床数据库的纵向数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 727 | 2025-11-15 |
Curcumin-chitosan microspheres inhibit epithelial cell PANoptosis: analysis of key PANoptosis gene distribution via single-cell RNA sequencing and in vivo validation in ulcerative colitis mice
2025-Nov, General physiology and biophysics
IF:1.3Q4
DOI:10.4149/gpb_2025030
PMID:41217223
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内实验验证姜黄素-壳聚糖微球通过抑制上皮细胞PANoptosis改善溃疡性结肠炎 | 首次揭示姜黄素-壳聚糖微球通过调控肠上皮细胞PANoptosis缓解溃疡性结肠炎的机制 | NA | 探究姜黄素-壳聚糖微球对溃疡性结肠炎的治疗作用机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和Caco-2细胞系 | 单细胞测序 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 728 | 2025-11-15 |
Single-cell transcriptome atlas unveils transcriptional regulation networks of banana root tips in response to Fusarium oxysporum infection
2025-Nov, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf220
PMID:41220693
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了香蕉根尖响应尖孢镰刀菌感染的转录调控网络 | 首次构建香蕉根尖单细胞转录图谱,发现周鞘细胞是TR4感染下的主要响应细胞类型,并鉴定出MaKAN4调控锌依赖性基因模块的关键作用 | NA | 解析香蕉根尖细胞类型对尖孢镰刀菌感染的转录响应机制 | 香蕉根尖细胞 | 单细胞生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 19个细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2025-11-14 |
Characteristics of ectopic alveolar basal cells relative to airway basal cells in fibrosis
2025-Nov, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.01259-2024
PMID:41220820
|
研究论文 | 本研究通过比较间质性肺病患者中异位肺泡基底细胞与气道基底细胞的特性,探索其起源和功能差异 | 首次在相同ILD患者中同时分离和比较肺泡与气道基底细胞,揭示两者在转录组和类器官形成能力上的差异 | 样本来源于活检组织,数量有限;动物模型使用博来霉素损伤小鼠,可能不完全反映人类疾病情况 | 阐明间质性肺病中异位肺泡基底细胞的起源和功能特性 | 间质性肺病患者的肺泡基底细胞和气道基底细胞 | 单细胞生物学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序,实时荧光定量PCR,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 来自ILD患者的经支气管和气道黏膜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2025-11-15 |
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study
2025-Nov, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1177/10849785251383288
PMID:41235474
|
研究论文 | 本研究应用机器学习技术分析结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的关联 | 首次结合机器学习与单细胞RNA测序技术系统揭示结直肠癌中基因表达特征与免疫细胞浸润的复杂关系 | NA | 探究结直肠癌中基因表达与免疫细胞浸润的关联及其临床意义 | 结直肠癌患者的基因表达数据和免疫细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 聚类分析, 生存分析, 基因富集分析 | 预后模型, 聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 731 | 2025-11-14 |
Mapping atherogenesis mechanisms in smooth muscle cells by targeting genes linked to coronary artery disease
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113698
PMID:41210961
|
研究论文 | 本研究结合冠状动脉疾病GWAS与单细胞RNA测序,识别平滑肌细胞中的风险基因并揭示其在动脉粥样硬化中的调控机制 | 首次将CAD GWAS与动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序整合,通过扰动实验发现不同风险基因共同调控收缩装置、细胞周期等关键通路 | 研究主要聚焦于平滑肌细胞,未全面评估其他血管细胞类型的贡献 | 解析冠状动脉疾病中平滑肌细胞的发病机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及SMC来源的间充质细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 732 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2025-Nov-12, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示老年脓毒症中骨髓免疫重塑的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘老年脓毒症的骨髓免疫图谱,发现HSC-髓系细胞间Lgals9-Cd44信号通路的通讯障碍是免疫衰竭的关键机制 | 临床可行性和安全性尚未验证,样本量较小(每组2-3只小鼠) | 探究老年脓毒症免疫功能障碍的分子机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,CellChat细胞通讯分析,Transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 10只小鼠(Y-Sham组2只,Y-CLP组3只,A-Sham组2只,A-CLP组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 733 | 2025-11-14 |
Single Cell Transcriptomics of Traditional Chinese Medicine Bioactives: Mapping Immune, Neural and Hepatic Responses
2025-Nov-10, Zhongguo ying yong sheng li xue za zhi = Zhongguo yingyong shenglixue zazhi = Chinese journal of applied physiology
DOI:10.62958/j.cjap.2025.028
PMID:41207694
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术解析中药活性成分对免疫、神经和肝脏系统的细胞特异性反应 | 首次在单细胞分辨率揭示中药活性成分的细胞特异性药效学机制,发现传统批量转录组学研究无法检测的细胞类型特异性反应 | 研究仅使用小鼠模型,样本数量相对有限,需要进一步人体验证 | 阐明中药活性成分在免疫、神经和肝脏系统中的细胞特异性药理作用机制 | 小鼠脾脏、海马体和肝脏组织分离的单细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫荧光 | Seurat,CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过42,000个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 734 | 2025-11-14 |
Descendants of hypertrophic chondrocytes promote angiogenesis by secreting THBS4 during bone growth and injury repair
2025-Nov-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00469-2
PMID:41207902
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研究论文 | 本研究揭示了肥大软骨细胞后代通过分泌THBS4促进血管生成在骨骼生长和损伤修复中的关键作用 | 首次发现肥大软骨细胞后代中特定细胞亚群(PADs)通过分泌THBS4调控血管生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肥大软骨细胞转化在骨骼发育和修复中的病理生理意义 | 小鼠肥大软骨细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,组织透明化,体外细胞培养 | Col10a1-Cre; R26基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠股骨和跖骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 735 | 2025-11-14 |
Unveiling prognostic biomarkers and immunotherapeutic insights in prostate cancer through multi-omics and machine learning
2025-Nov-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03363-z
PMID:41207909
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别前列腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 整合单细胞和bulk转录组数据,开发包含14种算法和162种算法组合的机器学习框架构建共识免疫预后特征 | NA | 评估前列腺癌相关基因的临床相关性和预后潜力 | 前列腺癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学分析 | 机器学习集成算法 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2025-11-14 |
STAT3 regulates NK and NKT cell differentiation through C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1) in hyper-IgE syndrome
2025-Nov-10, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00323-1
PMID:41212476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了STAT3基因突变通过CX3CR1调控NK和NKT细胞分化在高IgE综合征中的作用机制 | 首次发现STAT3突变导致CX3CR1CD57 NK和NKT细胞群体增加,并通过CUT&Tag分析揭示突变STAT3增强与IL-4转录起始位点的结合 | STAT3突变的分子机制仍然复杂且未完全阐明,研究样本量有限 | 探究STAT3突变在高IgE综合征中导致免疫失调的分子机制 | STAT3突变患者、STAT3条件性敲除小鼠的免疫细胞(NK细胞、NKT细胞、CD4 T细胞) | 免疫学 | 高IgE综合征 | 单细胞测序, 流式细胞术, CUT&Tag分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 表观基因组数据 | STAT3突变患者和STAT3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 737 | 2025-11-14 |
MZT2B promotes malignant phenotypes in NSCLC cells by enhancing mitochondrial function and COX5B expression
2025-Nov-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08182-y
PMID:41213905
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研究论文 | 本研究揭示MZT2B通过增强线粒体功能和促进COX5B表达驱动非小细胞肺癌恶性进展的分子机制 | 首次发现MZT2B在NSCLC中的致癌作用及其通过调控线粒体功能和COX5B表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索NSCLC新型治疗靶点及MZT2B的致癌机制 | 非小细胞肺癌细胞系、临床组织标本和皮下异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, shRNA基因沉默, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 功能实验数据 | TCGA数据库NSCLC组织样本、多种NSCLC细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 738 | 2025-11-14 |
Distinct autoreactive CD19- plasma cell subsets accumulate in lupus-prone mice
2025-Nov-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65906-6
PMID:41213970
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术鉴定了狼疮易感小鼠中自身反应性CD19⁻浆细胞亚群的积累特征 | 首次发现自身反应性CD19⁻浆细胞亚群在狼疮发病中的关键作用,并揭示其独特的基因表达谱和来源途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 鉴定系统性红斑狼疮中致病性浆细胞亚群,为靶向治疗提供依据 | 狼疮易感小鼠和系统性红斑狼疮患者外周血 | 单细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, 遗传模型 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 狼疮易感小鼠模型和SLE患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2025-11-14 |
Neutrophil-derived Il1r2 modulates inflammation and alleviates acute lung injury by promoting M2 macrophage polarization
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14278-4
PMID:41213982
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的Il1r2通过促进M2巨噬细胞极化调节炎症反应并缓解急性肺损伤的分子机制 | 首次发现中性粒细胞表达的Il1r2在急性肺损伤中通过促进M2巨噬细胞极化发挥抗炎作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索急性肺损伤的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blotting, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习, 基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 740 | 2025-11-14 |
Identification of T cell stress response state (TSTR) and key genes related to T cells in discoid lupus erythematosus
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23088-7
PMID:41214060
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研究论文 | 通过转录组和单细胞测序数据联合分析,鉴定盘状红斑狼疮中T细胞应激反应状态及相关关键基因 | 首次在DLE真皮中发现大量浸润的T细胞应激反应状态(TSTR),并通过多组学数据交叉验证筛选出CXCL13等9个关键疾病基因 | 需要进一步实验验证这些关键基因在DLE发病机制中的具体功能 | 深入探索盘状红斑狼疮的发病机制和生物标志物 | 盘状红斑狼疮患者的T细胞 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,WGCNA分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |