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当前共找到 1144 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2025-11-19 |
scGeneBank: cross-species screening of functional gene sets at single-cell resolution
2025-Nov-18, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1137
PMID:41251182
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研究论文 | 介绍scGeneBank数据库和分析平台，用于单细胞分辨率下的基因集驱动探索 | 开发首个整合多物种单细胞转录组数据的基因集分析平台，支持跨物种、器官和细胞类型的系统性比较 | NA | 构建统一的基因集活性比较框架，支持发育、进化、衰老、疾病和细胞死亡的系统研究 | 1134个单细胞转录组数据集，涵盖104.9百万个细胞、136个物种、430个器官和1070个解剖区域 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 104.9百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 722 | 2025-11-19 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-18, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
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研究论文 | 本研究揭示了KDM6A-pSer829磷酸化通过FBXW7介导的泛素化降解调控口腔鳞状细胞癌糖酵解代谢和细胞增殖的新机制 | 首次发现KDM6A-pSer829是FBXW7的识别位点，并证明该磷酸化修饰在OSCC糖酵解代谢中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证不足 | 探究KDM6A特定翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌代谢调控中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞和小鼠模型 | 癌症代谢研究 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP、免疫印迹、单细胞RNA测序、免疫荧光成像 | 条件性基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | Kdm6aS829A条件敲入小鼠舌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 723 | 2025-11-19 |
Sodium butyrate inhibits colorectal cancer development by reducing M2 macrophage polarization and PD-L1 expression
2025-Nov-18, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00692-25
PMID:41251471
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示丁酸钠通过抑制M2巨噬细胞极化和PD-L1表达抑制结直肠癌发展的机制 | 首次结合单细胞转录组学与小鼠模型阐明丁酸钠通过HDAC/TLR4/MyD88信号通路调控肿瘤免疫微环境的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索丁酸钠抑制结直肠癌发展的分子机制及其与免疫治疗的协同作用 | 结直肠癌小鼠模型和巨噬细胞-结直肠癌共培养系统 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2025-11-19 |
ZEB1 promotes chemoimmunotherapy resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
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研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫治疗耐药的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16表达和SPP1分泌，同时影响肿瘤焦亡和CD8+ T细胞耗竭的双重耐药机制 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究胰腺癌化疗免疫治疗耐药的分子机制并开发新的治疗策略 | 胰腺癌模型（包括患者来源类器官、异种移植和原位模型） | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、表观遗传分析 | 患者来源类器官、异种移植模型、原位模型 | 转录组数据、表观遗传数据、临床数据 | 胰腺癌患者样本和多种临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 725 | 2025-11-19 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-Nov-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
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研究论文 | 开发了scDUAL-seq方法，首次在单细胞水平同时测量RNA合成和降解速率 | 整合双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序，实现单细胞中转录组范围内RNA合成和降解的同时记录 | NA | 解析动态过程中RNA调控机制 | 异质性细胞群体 | 单细胞测序技术 | NA | 双核苷类似物脉冲标记,化学核苷转化,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2025-11-19 |
Spatial GWAS Atlas: a knowledgebase for decoding the genetic architecture of complex traits in spatial resolution
2025-Nov-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1103
PMID:41243976
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研究论文 | 开发首个系统整合GWAS汇总统计数据与空间转录组数据的知识库，用于在空间分辨率下解析复杂性状的遗传结构 | 首次构建了系统整合GWAS与空间转录组数据的综合资源，能够在单细胞分辨率和空间背景下定位性状相关细胞 | NA | 解码复杂性状在空间分辨率下的遗传结构 | 3854个经过整理的GWAS数据集和635个空间转录组数据集，涵盖多个物种、组织和平台 | 生物信息学 | 复杂性状疾病 | 空间转录组学，全基因组关联分析 | NA | 基因组关联统计数据，空间基因表达数据 | 3854个GWAS数据集和635个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 727 | 2025-11-19 |
PscOA: A Plant scRNA-seq Marker Gene Database for Enhanced Cellular Transcriptome Understanding
2025-Nov-17, Plant & cell physiology
DOI:10.1093/pcp/pcaf151
PMID:41247320
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研究论文 | 开发了一个植物单细胞RNA测序标记基因数据库PscOA，用于增强细胞转录组的理解 | 建立了首个专门针对植物的单细胞RNA测序标记基因数据库，包含39,347个标记基因，整合了BLAST同源基因挖掘和SCSA细胞类型注释工具 | NA | 解决植物科学中单细胞RNA测序标记基因资源有限的问题，促进植物细胞异质性研究 | 植物单细胞RNA测序数据，包括拟南芥、白杨和烟草等物种 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含39,347个标记基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 728 | 2025-11-19 |
Integrative multi-omics and computational modeling reveal RPL22-driven skin aging mechanisms under PM2.5 exposure and identify high-stability natural inhibitors
2025-Nov-17, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04680-0
PMID:41247455
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和计算建模揭示了PM2.5通过上调RPL22加速皮肤衰老的机制，并筛选出高稳定性的天然抑制剂 | 首次结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和分子动力学模拟，系统揭示PM2.5通过RPL22-MYC通路驱动皮肤衰老的因果机制 | 研究基于欧洲人群数据，结果可能不适用于其他种族群体 | 阐明PM2.5暴露与皮肤衰老之间的因果分子机制并筛选有效抑制剂 | 欧洲人群皮肤组织样本和RPL22蛋白靶点 | 计算生物学 | 皮肤衰老 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 虚拟筛选, 分子动力学模拟 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | 基于GSE130973数据集和欧洲人群GWAS数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 729 | 2025-11-19 |
Image-enhanced Multi-Modal Contrastive Transformer for subcellular spatial transcriptomics
2025-Nov-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3630325
PMID:41247893
|
研究论文 | 提出一种图像增强的多模态对比Transformer框架SIMMT，用于整合空间转录组数据和形态学图像以改善亚细胞分辨率分析 | 设计了双Transformer架构分别建模转录组和形态学图像，并引入对比学习模块在细胞水平对齐组织形态和基因表达 | NA | 开发计算方法来有效整合图像特征与转录组谱，实现全面的亚细胞数据分析 | 人类肺癌组织、小鼠脑组织、人类结直肠癌组织和人类卵巢癌组织的亚细胞空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 肺癌, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间分子成像技术 | Transformer, 对比学习 | 图像, 基因表达数据 | 多个组织类型的数据集（人类肺癌、小鼠脑、人类结直肠癌、人类卵巢癌） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 730 | 2025-11-19 |
Meta single-cell atlas and xQTL post-GWAS analysis revealed the pathogenic features of thyroid cancer for target therapy: A multi-omics study
2025-Nov-17, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00988-4
PMID:41249621
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组、批量转录组和GWAS数据，揭示甲状腺癌的致病特征并构建诊断模型 | 首次将单细胞图谱与xQTL后GWAS分析相结合，识别甲状腺癌致病基因并构建多机器学习诊断模型 | 未明确说明样本来源和具体样本量 | 识别甲状腺癌的致病基因特征并开发诊断预测工具 | 甲状腺癌患者样本 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, GWAS, 免疫组织化学 | glmBoost, RF, 多机器学习组合 | 单细胞RNA-seq数据, 批量RNA-seq数据, 基因型数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2025-11-19 |
Peptide-driven identification of TCRs reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2025-Nov-16, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf287
PMID:41241821
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法，用于识别抗原特异性T细胞受体，并应用于结核病患者的研究 | 开发了PDI-TCR检测方法，能够通过比较非重叠肽池反应来区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | 研究中使用的PDI-TCR参数专门针对结核分枝杆菌，需要针对其他抗原系统进行调整 | 开发识别抗原特异性T细胞受体的方法并研究结核病中CD4 T细胞的动态和表型 | 结核病患者和结核分枝杆菌致敏的健康个体的T细胞受体 | 免疫学 | 结核病 | 体外细胞扩增、TCR测序、单细胞RNA测序、统计分析 | NA | 序列数据、RNA测序数据 | 结核病患者和IGRA+健康个体的血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk TCR测序 | NA | NA |
| 732 | 2025-11-19 |
ANPEP as a potential mediator linking aspartame exposure to MAFLD: insights from network toxicology and multi-omics analyses
2025-Nov-14, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004068
PMID:41247865
|
研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和多组学分析，揭示了ANPEP作为阿斯巴甜暴露与代谢相关脂肪性肝病之间的潜在介导因子 | 首次系统性地识别ANPEP作为阿斯巴甜与MAFLD关联的关键分子靶点，并采用多方法验证其在疾病进程中的作用 | 研究主要基于计算预测和动物模型，需要进一步临床研究验证 | 探索阿斯巴甜暴露与代谢相关脂肪性肝病之间的分子机制 | 阿斯巴甜、ANPEP基因、代谢相关脂肪性肝病 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪性肝病 | 网络毒理学,分子对接,分子动力学模拟,机器学习,RNA测序,单细胞转录组学,孟德尔随机化,免疫荧光 | 机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据,组织学数据 | 小鼠模型和人类肝组织样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 733 | 2025-11-19 |
ELLA: modeling subcellular spatial variation of gene expression within cells in high-resolution spatial transcriptomics
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64867-0
PMID:41219206
|
研究论文 | 提出一种名为ELLA的统计框架，用于建模亚细胞mRNA定位并检测细胞内的空间变异基因 | 使用过度分散的非齐次泊松过程建模空间计数数据，并采用统一的细胞坐标系来锚定不同的细胞形态 | NA | 开发用于高分辨率空间转录组学中亚细胞空间表达分析的工具 | 亚细胞水平的基因表达空间变异 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 过度分散非齐次泊松过程 | 空间计数数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |
| 734 | 2025-11-19 |
TMPRSS11B promotes an acidified microenvironment and immune suppression in squamous lung cancer
2025-Nov-10, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00631-1
PMID:41214366
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研究论文 | 本研究揭示了TMPRSS11B通过促进乳酸输出和酸化微环境驱动肺鳞癌免疫抑制的新机制 | 首次发现TMPRSS11B在肺鳞癌中通过酸化肿瘤微环境诱导免疫抑制，并确定其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究TMPRSS11B对肿瘤微环境和免疫系统的影响 | 肺鳞状细胞癌(LUSC)肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA FISH, 空间转录组学, 超pH敏感纳米颗粒成像, 代谢物分析 | NA | 空间转录组数据, 代谢物数据, 成像数据 | 免疫活性小鼠模型和SNL自发肿瘤模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 735 | 2025-11-19 |
Whole-cortex in situ sequencing reveals input-dependent area identity
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07221-6
PMID:38658747
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研究论文 | 通过BARseq高通量原位测序技术研究小鼠大脑皮层神经元转录组特征与区域身份的关系 | 首次使用BARseq技术在完整大脑皮层范围内进行原位测序，揭示了输入依赖性皮层区域身份的形成机制 | 研究仅针对小鼠模型，尚未在其它物种验证；仅检测了104个细胞类型标记基因 | 探索大脑皮层空间组织是否反映在神经元转录组特征中及其发育机制 | 小鼠前脑半球皮层神经元 | 神经科学 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，空间转录组数据 | 1030万细胞，其中4,194,658个皮层神经元，覆盖9个小鼠前脑半球 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | BARseq | 高通量原位测序技术，能够实现细胞分辨率的大规模基因表达分析 |
| 736 | 2025-11-19 |
Improved reconstruction of single-cell developmental potential with CytoTRACE 2
2025-Nov, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02857-2
PMID:41145665
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研究论文 | 本研究开发了CytoTRACE 2深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据预测细胞发育潜能 | 提出了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，在预测发育层次结构方面优于现有方法 | NA | 预测细胞的绝对发育潜能和分化能力 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 737 | 2025-11-19 |
Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09644-1
PMID:41193844
|
研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育的高分辨率转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 通过密集采样构建了胚胎期到出生后发育阶段的单细胞转录组和Multiome数据集，重建了所有兴奋性、抑制性和非神经元细胞类型的发育轨迹图 | 研究仅限于小鼠视觉皮层，未涉及其他脑区或其他物种 | 揭示哺乳动物皮层细胞类型多样化的发育机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的细胞类型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序，单核Multiome测序 | 发育轨迹重建分析 | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | 568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量细胞核 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单核Multiome测序平台 |
| 738 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA-sequencing reveals adventitial fibroblast alterations during mouse atherosclerosis
2025-Nov, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞中的差异表达及其功能影响 | 研究仅使用雄性Ldlr-/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每样本三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，GWAS分析，体外基因敲低实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 雄性Ldlr-/-小鼠，每组两个样本（每样本三只小鼠混合） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 739 | 2025-11-19 |
Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration
2025-Nov, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001
PMID:41046113
|
综述 | 本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新进展、工程策略和临床应用 | 整合材料科学、机器学习和单细胞RNA测序技术推动个性化与标准化的3D细胞球体生物制造 | 细胞球体长期稳定性有限、大规模生产困难以及体内植入后的免疫排斥问题 | 探讨3D细胞球体技术在软骨再生医学中的转化潜力 | 软骨细胞、软骨组织工程模型 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习(ML) | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 740 | 2025-11-19 |
PseudotimeDE-fast: fast testing of differential gene expression along cell pseudotime
2025-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf573
PMID:41117775
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PseudotimeDE-fast的可扩展方法，用于在细胞伪时间轴上检测差异表达基因，并提供校准良好的P值 | 该方法解决了现有方法在伪时间推断中忽略不确定性导致无效P值或难以扩展至大规模数据集的问题，在计算效率上有显著提升 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种快速且统计有效的差异基因表达检测方法，用于单细胞RNA测序数据中的动态生物过程分析 | 沿细胞伪时间轴的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |