单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1001 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-11-17 |
CoCo-ST detects global and local biological structures in spatial transcriptomics datasets
2025-Nov, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01781-z
PMID:41083603
|
研究论文 | 提出一种名为CoCo-ST的图对比特征表示框架，用于检测空间转录组数据中的全局和局部生物结构 | 通过比较目标样本与背景样本，能够同时检测高方差和低方差的空间结构，解决了现有方法忽略低方差结构的问题 | NA | 开发能够检测空间转录组数据中高方差和低方差生物结构的计算方法 | 小鼠肺前癌样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 图对比学习 | 图对比特征表示框架 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Xenium Prime 5K, Visium HD | spot-level Visium数据, 单细胞Xenium Prime 5K数据, 亚细胞Visium HD数据 |
| 702 | 2025-11-17 |
Ubiquitous dysregulation of the Wnt pathway in immune thrombocytopenia genetic susceptibility
2025-Nov, Blood vessels, thrombosis & hemostasis
DOI:10.1016/j.bvth.2025.100107
PMID:41235340
|
研究论文 | 本研究通过功能基因组学和单细胞RNA测序分析，揭示了Wnt信号通路在免疫性血小板减少症中的广泛失调 | 首次在ITP中系统性地证明了Wnt信号通路的多基因、多细胞类型特异性失调模式 | 研究主要基于遗传关联和基因表达分析，缺乏直接的机制验证实验 | 探究Wnt信号通路在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 免疫性血小板减少症患者和健康对照的遗传及单细胞转录组数据 | 基因组学 | 免疫性血小板减少症 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 功能基因组学分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 703 | 2025-11-17 |
Mechanistic study of ANXA3-mediated endoplasmic reticulum stress promoting M1 macrophage polarization in pulmonary arterial hypertension based on bioinformatics and nine machine learning algorithms
2025-Nov, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111215
PMID:41110296
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和九种机器学习算法揭示了ANXA3通过内质网应激促进M1巨噬细胞极化在肺动脉高压中的作用机制 | 首次系统整合多种机器学习算法识别肺动脉高压中内质网应激相关关键基因，并通过实验验证ANXA3在调控M1巨噬细胞极化和肺动脉平滑肌细胞功能中的核心作用 | 样本量相对有限（100例患者和61例对照），且主要基于动物模型验证，需要进一步临床研究确认 | 阐明内质网应激在肺动脉高压免疫调节中的分子机制，识别关键调控基因 | 肺动脉高压患者外周血单核细胞、特发性肺动脉高压患者样本、两种肺动脉高压大鼠模型（MCT诱导和SuHx诱导） | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 转录组分析、机器学习算法、qRT-PCR、单细胞RNA测序、免疫荧光、功能实验 | LASSO回归等九种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 161例人类样本（100例患者+61例对照）和20例特发性肺动脉高压患者，两种大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2025-11-16 |
Clinical characteristics and target exploration via scRNA-seq and high-throughput drug screening of FOXO1 fusion positive rhabdomyosarcoma
2025-Nov-15, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06241-1
PMID:41240117
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量药物筛选探索FOXO1融合阳性横纹肌肉瘤的临床特征和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与高通量药物筛选系统研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤的影响，并发现MET作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限（65例患者），且包含罕见病例类型 | 研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤临床特征和治疗靶点的影响 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选，患者来源异种移植模型 | Cox回归分析，Kaplan-Meier估计 | 临床数据，单细胞转录组数据 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者（36例胚胎型，15例腺泡型，14例其他类型） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 705 | 2025-11-16 |
Targeting the HMGB1-IL32 pathway to alleviate T cell exhaustion in epithelial ovarian cancer
2025-Nov-15, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01963-5
PMID:41240232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了卵巢癌细胞通过HMGB1-IL32信号通路影响终末耗竭CD8+T细胞的机制 | 首次发现HMGB1-HAVCR2配体-受体对介导卵巢癌细胞与终末耗竭CD8+T细胞的通讯，并阐明HMGB1通过NFKB1和TP53调控IL32表达的新信号通路 | NA | 解析卵巢癌微环境中细胞间通讯对终末耗竭CD8+T细胞的影响机制 | 卵巢癌微环境中的癌细胞和CD8+T细胞 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 706 | 2025-11-16 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习的免疫学分析，识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次系统整合多组学数据和机器学习方法识别AS-CAD特异性生物标志物FGL1，并验证其诊断和预后价值 | 样本量有限，需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后相关性 | 主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、ELISA、免疫组化、Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、临床数据 | AS-CAD患者组织样本、独立临床队列、多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 707 | 2025-11-16 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
|
研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次系统揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制和转移的关系 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 708 | 2025-11-16 |
An islet-resident macrophage antioxidant program preserves β cell physiology
2025-Nov-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adz5181
PMID:41237222
|
研究论文 | 本研究揭示了胰岛驻留巨噬细胞的抗氧化程序如何保护β细胞生理功能 | 首次发现SLC7A11驱动的转录程序在CD9阳性胰岛巨噬细胞中增强抗氧化防御，并确定这些巨噬细胞作为内分泌胰腺中专化免疫哨兵的功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类胰岛巨噬细胞的功能验证仍需进一步研究 | 探究胰岛驻留巨噬细胞的起源、异质性和功能作用 | 小鼠和人类胰岛中的驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，命运图谱系统 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-11-16 |
Hepatocyte metabolic adaptations during pregnancy and lactation
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.007
PMID:40882627
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统揭示了小鼠在妊娠和哺乳期间肝细胞的代谢适应机制 | 发现了控制妊娠代谢变化的'妊娠时钟'周期性轨迹，并揭示了哺乳期独特的脂质合成分支轨迹 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明妊娠和哺乳期间肝细胞代谢适应的精确过程和调控机制 | 小鼠肝细胞，绵羊肝细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠妊娠和产后多个阶段的肝细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 710 | 2025-11-16 |
Stereo-seq V2: Spatial mapping of total RNA on FFPE sections with high resolution
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.008
PMID:40882628
|
研究论文 | 介绍Stereo-seq V2技术，能够在FFPE组织切片上实现高分辨率全RNA空间图谱分析 | 采用随机引物策略在FFPE切片上实现原位RNA捕获测序，提供单细胞分辨率，具有无偏转录本捕获和均匀基因覆盖特性 | NA | 开发适用于FFPE样本的空间转录组技术，提升临床样本的RNA分析能力 | 三阴性乳腺癌组织切片、结核分枝杆菌感染小鼠模型、人类结核肺样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 结核病 | 空间转录组测序 | NA | 空间RNA表达数据 | 临床FFPE样本、小鼠感染模型、人类结核样本 | 华大基因(BGI) | 空间转录组学 | Stereo-seq V2 | 基于随机引物的FFPE切片空间全RNA分析技术 |
| 711 | 2025-11-16 |
Single-cell analysis of human airway epithelium identifies cell-type-specific responses to Aspergillus and Coccidioides
2025-Nov-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02121-25
PMID:41081505
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人类气道上皮细胞对两种真菌病原体的细胞类型特异性反应 | 首次报道了使用单细胞转录组分析人类气道上皮细胞对曲霉菌和球孢子菌感染的反应 | 动物模型不能完全重现人类疾病，需要更先进的模型来研究人类-真菌病原体相互作用 | 研究人类气道上皮细胞对不同真菌病原体的早期发病机制 | 原代人类气道上皮细胞 | 单细胞测序 | 呼吸道真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2025-11-16 |
Anti-diuretic hormone ITP signals via a guanylate cyclase receptor to modulate systemic homeostasis in Drosophila
2025-Nov-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97043
PMID:41222455
|
研究论文 | 本研究系统表征了果蝇中离子转运肽(ITP)信号系统及其通过鸟苷酸环化酶受体Gyc76C调节全身稳态的机制 | 首次鉴定Gyc76C为ITP的专一性受体，揭示了ITP信号系统在渗透调节和代谢稳态中的双重功能 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 阐明果蝇中抗利尿激素ITP信号系统在维持全身稳态中的作用机制 | 果蝇(Drosophila)的神经系统、肾小管、直肠和脂肪体等组织 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | RNA干扰、外分泌测定、异源哺乳动物细胞测定、连接组学、单细胞转录组学 | 基因敲低、过表达 | 基因表达数据、生理功能数据、行为数据 | 果蝇幼虫和成虫组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2025-11-16 |
Age-impaired remyelination is associated with dysregulated microglial transitions
2025-Nov-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64906-w
PMID:41224757
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脱髓鞘小鼠模型中微胶质细胞在髓鞘再生过程中的反应 | 发现髓鞘再生早期存在多种不同的微胶质细胞状态，这些状态最终汇聚为包含髓鞘转录物的解决状态，且该状态也存在于多发性硬化症患者大脑中 | 研究基于小鼠模型，结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 探究年龄相关的髓鞘再生障碍与微胶质细胞状态转变失调的关联 | 小鼠模型中的微胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 714 | 2025-11-16 |
HPCAL1 as a novel prognostic biomarker in acute myeloid leukemia and its correlation with immune infiltrates
2025-Nov-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23386-0
PMID:41224963
|
研究论文 | 本研究探讨HPCAL1作为急性髓系白血病新型预后生物标志物的潜力及其与免疫浸润的关联 | 首次将钙结合蛋白HPCAL1确立为AML的新型预后指标，并揭示其通过免疫微环境调节和单核细胞群体动态介导不良预后的机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来阐明HPCAL1在AML发病机制中的具体作用 | 探索HPCAL1在急性髓系白血病中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 急性髓系白血病患者样本和多个独立队列数据集 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，ESTIMATE分析，GSEA/GSVA分析 | 共表达网络分析，蛋白质相互作用分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列（GSE13159，GSE34184，GSE24395，机构数据和GSE130756单细胞数据集） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-11-16 |
The landscape of dynamic tumor immunophenotyping on neoadjuvant chemotherapy combined with trastuzumab for the treatment of HER2-positive breast cancer
2025-Nov-12, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02483-8
PMID:41225463
|
研究论文 | 本研究通过空间表达谱分析探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗期间肿瘤微环境的动态免疫表型变化 | 首次在HER2阳性乳腺癌中建立与治疗疗效相关的动态免疫表型分类系统，并验证其在多个数据集中的可重复性 | 样本量相对有限（28例患者），需要更大规模研究验证 | 探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合靶向治疗期间肿瘤微环境动态变化与病理完全缓解的关系 | 28例HER2阳性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间表达谱分析，DSP技术 | NA | 空间转录组数据，单细胞数据 | 28例患者的94个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 716 | 2025-11-16 |
THBS1high macrophages promote aortic aneurysm formation by orchestrating an inflammatory and smooth muscle cell phenotypic transition program in vascular Behçet's disease
2025-Nov-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04434-y
PMID:41225543
|
研究论文 | 本研究揭示了THBS1高表达巨噬细胞通过协调炎症反应和平滑肌细胞表型转换促进白塞病血管动脉瘤形成的机制 | 首次鉴定出THBS1高表达巨噬细胞在血管白塞病中的关键作用，并阐明其通过ETS2和TNF-α介导的机制促进动脉瘤形成 | 研究样本量有限，动物模型为CaCl2诱导的人源化模型，与真实疾病环境存在差异 | 阐明血管白塞病动脉瘤形成的细胞分子机制 | 血管白塞病患者主动脉组织、巨噬细胞、平滑肌细胞 | 单细胞组学 | 血管白塞病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光染色, 批量RNA测序, 共培养系统 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 基因表达数据 | 血管白塞病患者主动脉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2025-11-16 |
DAPK1 identified as a novel biomarker for colorectal cancer liver metastasis
2025-Nov-12, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04037-w
PMID:41225570
|
研究论文 | 本研究通过机器学习与多组学分析鉴定DAPK1作为结直肠癌肝转移的新型生物标志物 | 首次通过整合机器学习算法与单细胞多组学技术系统鉴定DAPK1在结直肠癌肝转移中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 发现结直肠癌肝转移的新型生物标志物和治疗靶点 | 结直肠癌肝转移组织和LoVo细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, CRISPR/Cas9基因编辑 | Lasso回归, SVM, 随机森林 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 718 | 2025-11-16 |
Single-cell RNA sequencing and in vitro validation reveal risankizumab induces anti-inflammatory macrophage polarization in psoriasis
2025-Nov-12, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03346-0
PMID:41225578
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和体外实验验证瑞莎珠单抗在银屑病中诱导抗炎巨噬细胞极化的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和体外实验系统揭示瑞莎珠单抗通过调控巨噬细胞极化发挥治疗作用 | 研究主要基于公共数据库数据和体外细胞实验，缺乏体内实验验证 | 探索瑞莎珠单抗治疗银屑病的潜在治疗机制 | 银屑病患者单细胞测序数据和THP-1单核细胞分化的巨噬细胞 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, ELISA, CCK-8检测 | Seurat, Harmony, Monocle2 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | 97,434个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2025-11-16 |
Neurogenic inducers inhibit the proliferation of pancreatic cancer by promoting tumor cell transdifferentiation
2025-Nov-12, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03563-9
PMID:41225636
|
研究论文 | 本研究通过诱导胰腺癌细胞转分化来降低其恶性程度 | 发现NeuroD1转录因子可促进胰腺癌细胞向神经元转分化并抑制增殖，鉴定出神经诱导剂Neuropathiazol通过MET-PI3K/Akt通路上调NeuroD1 | NA | 研究诱导胰腺癌细胞转分化是否能降低恶性肿瘤性 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 单细胞测序分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,免疫共沉淀,质谱分析,分子对接 | NA | 单细胞RNA-seq数据,RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 720 | 2025-11-16 |
Unveiling tissue heterogeneity through genomic interaction-encoded image representation of RNA-sequencing data
2025-Nov-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.08.021
PMID:40967222
|
研究论文 | 提出一种基于基因组交互编码图像表示的RNA测序数据分析框架，用于改进组织异质性分析 | 利用基因组交互编码的图像表示方法，结合样本特异性基因表达变异性，通过卷积变分自编码器和高斯混合模型推导特征模式 | 未明确说明方法在特定组织类型或疾病中的适用性限制 | 开发改进的细胞组分分析方法，用于组织异质性研究和下游生物医学应用 | RNA测序数据，特别是批量RNA测序样本 | 生物信息学 | 癌症 | RNA测序，单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 卷积变分自编码器，高斯混合模型 | 基因表达数据，图像表示 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |