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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-11-18 |
Bone morphogenetic protein 1 as a macromolecular pan-cancer biomarker modulating the immune microenvironment and malignant phenotypes in glioblastoma
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148136
PMID:41067356
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示骨形态发生蛋白1(BMP1)在胶质母细胞瘤中的致癌作用,并发现AH.6809化合物能有效抑制肿瘤生长 | 首次系统阐明BMP1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的调控机制,并通过分子对接发现新型抑制剂AH.6809 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多体内实验验证 | 探索BMP1在胶质母细胞瘤进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接,动态模拟,基因集富集分析 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 利用TCGA、CGGA、GEO、CPTAC、TISCH、HPA、SpatialTME等多个公共数据库 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 682 | 2025-11-18 |
GPX2 induces macrophage M2 polarization through the MIF signaling pathway to promote colorectal cancer progression
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148341
PMID:41106750
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研究论文 | 本研究揭示了GPX2通过MIF信号通路诱导巨噬细胞M2极化从而促进结直肠癌进展的新机制 | 首次发现GPX2通过USP7介导的去泛素化稳定MIF表达,进而促进巨噬细胞M2极化的新信号轴 | NA | 阐明GPX2在结直肠癌进展中的作用机制 | 结直肠癌细胞、巨噬细胞、动物模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 683 | 2025-11-17 |
A single-cell multi-omics framework identifies immune cell drivers of migraine and repurposable therapeutics
2025-Nov-13, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02179-w
PMID:41233745
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研究论文 | 本研究通过建立单细胞多组学分析框架,识别偏头痛的免疫细胞驱动因素和可重新利用的治疗药物 | 首次整合单细胞表达数量性状位点数据和单细胞孟德尔随机化分析,系统探索偏头痛的免疫介导调控机制 | 未在文中明确说明研究的具体局限性 | 探索偏头痛的免疫遗传学基础并识别潜在治疗靶点 | 14种免疫细胞类型和9,117个独特的sc-eQTL | 生物信息学 | 偏头痛 | 单细胞表达数量性状位点分析, 单细胞孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 全表型组关联研究 | 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据, 表型数据 | 涉及9,117个sc-eQTL和14种免疫细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 684 | 2025-11-17 |
Single-cell transcriptome analysis profiles the enlarged subsets of myeloid-biased HSPCs with preleukemic characters in disuse osteoporosis mice
2025-Nov-12, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01499-3
PMID:41225641
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了废用性骨质疏松小鼠中具有白血病前特征的髓系偏态造血干细胞祖细胞亚群的扩增机制 | 首次在骨质疏松模型中系统鉴定并表征了具有白血病前特征的髓系偏态HSPC亚群,并发现BRD4染色质重塑蛋白在此过程中的关键调控作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证;BRD4抑制剂仅部分恢复表型,可能存在其他调控机制 | 探究骨质疏松条件下髓系偏态造血的发生机制及其与白血病发生的关系 | 废用性骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 骨质疏松小鼠模型的造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2025-11-17 |
Distinct Tumor-Associated Macrophage Signatures Shape the Immune Microenvironment and Patient Prognosis in Renal Cell Carcinoma
2025-Nov-06, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14211740
PMID:41227385
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发了肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞特征,建立了预后风险模型 | 首次在肾细胞癌中系统鉴定8种不同的肿瘤相关巨噬细胞特征,并构建27基因风险预测模型 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 探讨肿瘤相关巨噬细胞特征对肾细胞癌免疫微环境和患者预后的影响 | 肾细胞癌患者及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,LASSO Cox回归分析 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床生存数据 | TCGA数据集和多个独立肾细胞癌队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 686 | 2025-11-17 |
Integrated Multi-Omics Analysis Uncovers Immune-Metabolic Interplay in Hepatocellular Carcinoma Tumor Microenvironment
2025-Nov-03, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17213565
PMID:41228357
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示肝细胞癌肿瘤微环境中免疫与代谢的相互作用 | 首次通过整合基因组学、表观基因组学和单细胞转录组学系统解析HCC肿瘤微环境中免疫代谢互作机制,发现启动子低甲基化驱动的关键基因表达与患者预后相关 | 样本量相对有限(60例患者),需要更大队列验证发现 | 解析肝细胞癌肿瘤微环境的免疫和代谢特征及其临床意义 | 60例肝细胞癌患者的肿瘤样本 | 多组学整合分析 | 肝细胞癌 | 多组学分析, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据, 单细胞转录组数据 | 60例HCC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 687 | 2025-11-17 |
CoCo-ST detects global and local biological structures in spatial transcriptomics datasets
2025-Nov, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01781-z
PMID:41083603
|
研究论文 | 提出一种名为CoCo-ST的图对比特征表示框架,用于检测空间转录组数据中的全局和局部生物结构 | 通过比较目标样本与背景样本,能够同时检测高方差和低方差的空间结构,解决了现有方法忽略低方差结构的问题 | NA | 开发能够检测空间转录组数据中高方差和低方差生物结构的计算方法 | 小鼠肺前癌样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 图对比学习 | 图对比特征表示框架 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Xenium Prime 5K, Visium HD | spot-level Visium数据, 单细胞Xenium Prime 5K数据, 亚细胞Visium HD数据 |
| 688 | 2025-11-17 |
Ubiquitous dysregulation of the Wnt pathway in immune thrombocytopenia genetic susceptibility
2025-Nov, Blood vessels, thrombosis & hemostasis
DOI:10.1016/j.bvth.2025.100107
PMID:41235340
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研究论文 | 本研究通过功能基因组学和单细胞RNA测序分析,揭示了Wnt信号通路在免疫性血小板减少症中的广泛失调 | 首次在ITP中系统性地证明了Wnt信号通路的多基因、多细胞类型特异性失调模式 | 研究主要基于遗传关联和基因表达分析,缺乏直接的机制验证实验 | 探究Wnt信号通路在免疫性血小板减少症发病机制中的作用 | 免疫性血小板减少症患者和健康对照的遗传及单细胞转录组数据 | 基因组学 | 免疫性血小板减少症 | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序, 功能基因组学分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 689 | 2025-11-17 |
Mechanistic study of ANXA3-mediated endoplasmic reticulum stress promoting M1 macrophage polarization in pulmonary arterial hypertension based on bioinformatics and nine machine learning algorithms
2025-Nov, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111215
PMID:41110296
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和九种机器学习算法揭示了ANXA3通过内质网应激促进M1巨噬细胞极化在肺动脉高压中的作用机制 | 首次系统整合多种机器学习算法识别肺动脉高压中内质网应激相关关键基因,并通过实验验证ANXA3在调控M1巨噬细胞极化和肺动脉平滑肌细胞功能中的核心作用 | 样本量相对有限(100例患者和61例对照),且主要基于动物模型验证,需要进一步临床研究确认 | 阐明内质网应激在肺动脉高压免疫调节中的分子机制,识别关键调控基因 | 肺动脉高压患者外周血单核细胞、特发性肺动脉高压患者样本、两种肺动脉高压大鼠模型(MCT诱导和SuHx诱导) | 生物信息学 | 肺动脉高压 | 转录组分析、机器学习算法、qRT-PCR、单细胞RNA测序、免疫荧光、功能实验 | LASSO回归等九种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 161例人类样本(100例患者+61例对照)和20例特发性肺动脉高压患者,两种大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 690 | 2025-11-16 |
Clinical characteristics and target exploration via scRNA-seq and high-throughput drug screening of FOXO1 fusion positive rhabdomyosarcoma
2025-Nov-15, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-06241-1
PMID:41240117
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高通量药物筛选探索FOXO1融合阳性横纹肌肉瘤的临床特征和治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序与高通量药物筛选系统研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤的影响,并发现MET作为潜在治疗靶点 | 样本量相对有限(65例患者),且包含罕见病例类型 | 研究FOXO1融合状态对横纹肌肉瘤临床特征和治疗靶点的影响 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者及其肿瘤组织 | 数字病理学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞RNA测序,高通量药物筛选,患者来源异种移植模型 | Cox回归分析,Kaplan-Meier估计 | 临床数据,单细胞转录组数据 | 65例儿童横纹肌肉瘤患者(36例胚胎型,15例腺泡型,14例其他类型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 691 | 2025-11-16 |
Targeting the HMGB1-IL32 pathway to alleviate T cell exhaustion in epithelial ovarian cancer
2025-Nov-15, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01963-5
PMID:41240232
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了卵巢癌细胞通过HMGB1-IL32信号通路影响终末耗竭CD8+T细胞的机制 | 首次发现HMGB1-HAVCR2配体-受体对介导卵巢癌细胞与终末耗竭CD8+T细胞的通讯,并阐明HMGB1通过NFKB1和TP53调控IL32表达的新信号通路 | NA | 解析卵巢癌微环境中细胞间通讯对终末耗竭CD8+T细胞的影响机制 | 卵巢癌微环境中的癌细胞和CD8+T细胞 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 692 | 2025-11-16 |
Identification of key diagnostic and prognostic biomarkers for aortic valve stenosis with coronary artery disease through immunological profiling integrating proteomics, single-cell sequencing, and machine learning
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152855
PMID:41151411
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学、单细胞测序和机器学习的免疫学分析,识别主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病的关键诊断和预后生物标志物 | 首次系统整合多组学数据和机器学习方法识别AS-CAD特异性生物标志物FGL1,并验证其诊断和预后价值 | 样本量有限,需要更大规模的多中心研究验证 | 系统识别AS-CAD的分子生物标志物并评估其临床预后相关性 | 主动脉瓣狭窄合并冠状动脉疾病患者组织样本、ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型、RAW264.7巨噬细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、LASSO回归、ELISA、免疫组化、Western blotting | LASSO回归 | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据、临床数据 | AS-CAD患者组织样本、独立临床队列、多中心前瞻性TAVI患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 693 | 2025-11-16 |
Immunosuppression of HMOX1 contributes to metastasis and poor prognosis in glioma
2025-Nov-14, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152848
PMID:41151408
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研究论文 | 本研究探讨HMOX1在胶质瘤免疫抑制和转移中的作用机制 | 首次系统揭示HMOX1通过促进M2巨噬细胞极化介导胶质瘤免疫抑制和转移的分子机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要更多临床样本验证 | 阐明HMOX1与胶质瘤免疫抑制和转移的关系 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 异种移植模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA数据库693例患者, TCGA数据库702例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 694 | 2025-11-16 |
An islet-resident macrophage antioxidant program preserves β cell physiology
2025-Nov-14, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adz5181
PMID:41237222
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研究论文 | 本研究揭示了胰岛驻留巨噬细胞的抗氧化程序如何保护β细胞生理功能 | 首次发现SLC7A11驱动的转录程序在CD9阳性胰岛巨噬细胞中增强抗氧化防御,并确定这些巨噬细胞作为内分泌胰腺中专化免疫哨兵的功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类胰岛巨噬细胞的功能验证仍需进一步研究 | 探究胰岛驻留巨噬细胞的起源、异质性和功能作用 | 小鼠和人类胰岛中的驻留巨噬细胞 | 免疫学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,命运图谱系统 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 695 | 2025-11-16 |
Hepatocyte metabolic adaptations during pregnancy and lactation
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.007
PMID:40882627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统揭示了小鼠在妊娠和哺乳期间肝细胞的代谢适应机制 | 发现了控制妊娠代谢变化的'妊娠时钟'周期性轨迹,并揭示了哺乳期独特的脂质合成分支轨迹 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明妊娠和哺乳期间肝细胞代谢适应的精确过程和调控机制 | 小鼠肝细胞,绵羊肝细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠妊娠和产后多个阶段的肝细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 高分辨率单细胞RNA测序 |
| 696 | 2025-11-16 |
Stereo-seq V2: Spatial mapping of total RNA on FFPE sections with high resolution
2025-Nov-13, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.08.008
PMID:40882628
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研究论文 | 介绍Stereo-seq V2技术,能够在FFPE组织切片上实现高分辨率全RNA空间图谱分析 | 采用随机引物策略在FFPE切片上实现原位RNA捕获测序,提供单细胞分辨率,具有无偏转录本捕获和均匀基因覆盖特性 | NA | 开发适用于FFPE样本的空间转录组技术,提升临床样本的RNA分析能力 | 三阴性乳腺癌组织切片、结核分枝杆菌感染小鼠模型、人类结核肺样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌, 结核病 | 空间转录组测序 | NA | 空间RNA表达数据 | 临床FFPE样本、小鼠感染模型、人类结核样本 | 华大基因(BGI) | 空间转录组学 | Stereo-seq V2 | 基于随机引物的FFPE切片空间全RNA分析技术 |
| 697 | 2025-11-16 |
Anti-diuretic hormone ITP signals via a guanylate cyclase receptor to modulate systemic homeostasis in Drosophila
2025-Nov-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97043
PMID:41222455
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研究论文 | 本研究系统表征了果蝇中离子转运肽(ITP)信号系统及其通过鸟苷酸环化酶受体Gyc76C调节全身稳态的机制 | 首次鉴定Gyc76C为ITP的专一性受体,揭示了ITP信号系统在渗透调节和代谢稳态中的双重功能 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的保守性需要进一步验证 | 阐明果蝇中抗利尿激素ITP信号系统在维持全身稳态中的作用机制 | 果蝇(Drosophila)的神经系统、肾小管、直肠和脂肪体等组织 | 分子生物学 | 代谢性疾病 | RNA干扰、外分泌测定、异源哺乳动物细胞测定、连接组学、单细胞转录组学 | 基因敲低、过表达 | 基因表达数据、生理功能数据、行为数据 | 果蝇幼虫和成虫组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 698 | 2025-11-16 |
Age-impaired remyelination is associated with dysregulated microglial transitions
2025-Nov-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64906-w
PMID:41224757
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脱髓鞘小鼠模型中微胶质细胞在髓鞘再生过程中的反应 | 发现髓鞘再生早期存在多种不同的微胶质细胞状态,这些状态最终汇聚为包含髓鞘转录物的解决状态,且该状态也存在于多发性硬化症患者大脑中 | 研究基于小鼠模型,结果向人类应用的转化需要进一步验证 | 探究年龄相关的髓鞘再生障碍与微胶质细胞状态转变失调的关联 | 小鼠模型中的微胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 699 | 2025-11-16 |
HPCAL1 as a novel prognostic biomarker in acute myeloid leukemia and its correlation with immune infiltrates
2025-Nov-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23386-0
PMID:41224963
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研究论文 | 本研究探讨HPCAL1作为急性髓系白血病新型预后生物标志物的潜力及其与免疫浸润的关联 | 首次将钙结合蛋白HPCAL1确立为AML的新型预后指标,并揭示其通过免疫微环境调节和单核细胞群体动态介导不良预后的机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证来阐明HPCAL1在AML发病机制中的具体作用 | 探索HPCAL1在急性髓系白血病中的预后价值及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 急性髓系白血病患者样本和多个独立队列数据集 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA测序,单细胞RNA测序,ESTIMATE分析,GSEA/GSVA分析 | 共表达网络分析,蛋白质相互作用分析 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 多个独立队列(GSE13159,GSE34184,GSE24395,机构数据和GSE130756单细胞数据集) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2025-11-16 |
The landscape of dynamic tumor immunophenotyping on neoadjuvant chemotherapy combined with trastuzumab for the treatment of HER2-positive breast cancer
2025-Nov-12, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02483-8
PMID:41225463
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研究论文 | 本研究通过空间表达谱分析探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合曲妥珠单抗治疗期间肿瘤微环境的动态免疫表型变化 | 首次在HER2阳性乳腺癌中建立与治疗疗效相关的动态免疫表型分类系统,并验证其在多个数据集中的可重复性 | 样本量相对有限(28例患者),需要更大规模研究验证 | 探索HER2阳性乳腺癌新辅助化疗联合靶向治疗期间肿瘤微环境动态变化与病理完全缓解的关系 | 28例HER2阳性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间表达谱分析,DSP技术 | NA | 空间转录组数据,单细胞数据 | 28例患者的94个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |