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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-11-22 |
Unveiling gastric stem cell dynamics in gastric atrophy and carcinogenesis: revisiting mechanisms and advancing experimental models - a narrative review
2025-Nov-04, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003733
PMID:41186567
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综述 | 本叙述性综述深入探讨胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的动态作用机制及实验模型进展 | 提出胃干细胞在癌变过程中表现为克隆扩张而非耗竭的新范式,并倡导整合猫螺杆菌诱导模型与非他莫昔依赖谱系追踪的创新实验体系 | 指出化学致癌模型转化相关性有限及他莫昔芬依赖谱系追踪系统存在混杂效应的方法学局限 | 阐明胃干细胞在胃萎缩和癌变过程中的动态作用机制 | 胃干细胞(GSCs) | 数字病理 | 胃癌 | 谱系追踪、空间转录组学、类器官培养 | NA | 实验数据、文献资料 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 662 | 2025-11-22 |
Tenascin-C Expression in Relation to Tumor-Stroma Interaction in Ameloblastoma
2025-Nov, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104237
PMID:40912374
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研究论文 | 本研究探讨了细胞外基质糖蛋白Tenascin-C在成釉细胞瘤进展中的作用及其与肿瘤-基质相互关系的关联 | 首次发现成釉细胞瘤细胞来源的TN-C通过肿瘤-基质相互作用促进肿瘤细胞迁移,并确定其在侵袭前沿和恶性转化区域的特异性表达 | 研究主要基于体外细胞系实验和有限的组织样本,需要更大规模的临床验证 | 阐明TN-C在成釉细胞瘤进展中的分子机制及其临床意义 | 成釉细胞瘤组织标本和AM-1细胞系 | 数字病理学 | 成釉细胞瘤 | 免疫组织化学、RNA原位杂交、空间转录组学 | NA | 组织图像、基因表达数据 | 成釉细胞瘤组织标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 663 | 2025-11-22 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated With Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Nov, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100866
PMID:40803647
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研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法,用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次利用匹配的大规模结直肠癌空间转录组数据训练深度学习模型,直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息 | 仅凭组织学图像无法完全捕获某些肿瘤相关通路 | 开发从标准H&E组织图像推断空间分子信息的方法,用于结直肠癌预后评估 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理 | 结直肠癌 | 空间转录组学,深度学习 | UNI, ResNet-50, Vision Transformer, Vision Mamba | 组织图像,基因表达数据 | 45名患者,超过300,000个Visium位点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 664 | 2025-11-22 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Bidirectional Development of Infantile Hemangioma
2025-Nov-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.10.593
PMID:41177260
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示婴儿血管瘤的双向发育机制 | 首次在人类婴儿血管瘤中构建单细胞图谱,发现血管瘤壁细胞通过释放VEGFA和PGF配体促进内皮细胞增殖和血管生成的新机制 | 样本量较小(仅3名婴儿),缺乏功能验证实验 | 深入理解婴儿血管瘤的发病机制和潜在治疗策略 | 3名婴儿血管瘤患者的肿瘤组织样本 | 单细胞测序 | 婴儿血管瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光共定位 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像 | 3名婴儿血管瘤患者的36,237个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 665 | 2025-11-22 |
Monohaloacetamide disinfection by-products are potential risk factors for the quality of mouse oocytes
2025-Nov-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119343
PMID:41187544
|
研究论文 | 本研究系统评估了单卤乙酰胺对雌性小鼠的生殖毒性及其分子机制 | 首次系统比较不同单卤乙酰胺的生殖毒性等级,并通过单细胞RNA测序揭示其分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,人类相关性需进一步验证;暴露浓度可能高于实际环境水平 | 评估单卤乙酰胺消毒副产物的生殖毒性及其作用机制 | 雌性小鼠卵母细胞 | 毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,氧化应激生物标志物检测,线粒体功能测定 | 小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理学图像,生化指标 | 未明确具体样本数量,但涉及雌性小鼠群体实验 | NA | 单细胞RNA测序 | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |
| 666 | 2025-11-22 |
Leptin Receptor-Expressing (LepR+) Fibroblasts Activated by BMP Signaling Promote Bone Resorption in Developmental Odontogenic Cysts
2025-Nov, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104239
PMID:40946915
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研究论文 | 本研究揭示了发育性牙源性囊肿中表达瘦素受体的成纤维细胞通过BMP信号通路促进骨吸收的新机制 | 首次发现LepR+成纤维细胞通过与活化浆细胞的相互作用驱动发育性牙源性囊肿的骨吸收过程 | 研究样本量有限,仅针对最常见的发育性牙源性囊肿(含牙囊肿)进行分析 | 阐明发育性牙源性囊肿中骨吸收的原因和机制 | 发育性牙源性囊肿(含牙囊肿)和埋伏牙的牙滤泡组织 | 单细胞基因组学 | 牙源性囊肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 含牙囊肿和埋伏牙牙滤泡组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 667 | 2025-11-21 |
CD9 antibody enhances the anti-leukemia efficacy of γδT cells in adult B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113752
PMID:41244573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定B细胞急性淋巴细胞白血病中的侵袭性preB_CD9+亚群,并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞的抗白血病疗效 | 首次发现CD9在B-ALL复发患者中高表达,并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞对CD9高表达白血病细胞的杀伤作用 | 样本量较小(10个样本),需要更大规模研究验证 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病的肿瘤微环境特征及免疫治疗新策略 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者样本和健康志愿者样本 | 单细胞测序分析 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个样本(3例复发患者,3例新诊断患者,4例健康志愿者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 668 | 2025-11-21 |
IGFBP7 and CCT2 are novel lactylation-driven mediators of endothelial-to-mesenchymal transition in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Nov-20, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01761-4
PMID:41261179
|
研究论文 | 本研究系统探讨了乳酸化修饰在特发性肺纤维化中的作用机制,发现IGFBP7和CCT2是乳酸化驱动的内皮-间质转化的新型介质 | 首次系统研究乳酸化在IPF中的作用,鉴定出IGFBP7和CCT2两个新的乳酸化特征基因,并揭示TGF-β通过代谢重编程促进乳酸化介导的内皮-间质转化机制 | NA | 探究乳酸化修饰在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者和健康人群的样本,血管内皮细胞 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞测序,bulk RNA测序,机器学习算法,Cox回归分析,孟德尔随机化,RNA干扰,伤口愈合实验 | 多种机器学习算法,Cox回归模型 | 基因表达数据,单细胞数据 | IPF患者和健康人群样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 669 | 2025-11-21 |
An easy and reproducible method for rapid tissue macroarray block construction
2025-Nov-20, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04326-9
PMID:41261245
|
研究论文 | 提出一种快速构建组织大阵列块的新方法,确保精确的组织定向且无需专用仪器 | 开发了使用海绵作为支架的快速组织大阵列构建技术,将处理时间减少10倍并解决组织定向难题 | 未提及方法验证的样本规模或与其他方法的直接比较数据 | 改进组织大阵列构建技术,提高病理诊断和研究效率 | 石蜡包埋组织样本 | 数字病理学 | NA | 组织大阵列构建技术 | NA | 组织样本 | 每个大阵列包含9-48个组织核心 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 670 | 2025-11-21 |
NONCODE v7.0: updated lncRNA resource integrating scRNA-seq data encompassing immune baseline, development, and disease
2025-Nov-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1132
PMID:41261731
|
研究论文 | NONCODE v7.0数据库通过整合单细胞RNA测序数据更新了长链非编码RNA资源 | 首次整合2061个人类单细胞RNA测序样本,涵盖免疫基线、生理发育和病理疾病三大核心类别,并提供单细胞定制的功能模块 | 数据库主要基于现有公开数据集,可能未覆盖所有组织类型和疾病状态 | 构建一个系统分析长链非编码RNA表达的综合数据库平台 | 人类长链非编码RNA及其在单细胞水平的表达特征 | 生物信息学 | 多种疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 2061个人类单细胞RNA测序样本,来自229个数据集,包含1400万个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 671 | 2025-11-21 |
Endothelial CEPT1 Promotes Angiogenesis Through PPARα and VEGF-A Signaling
2025-Nov-20, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323302
PMID:41263082
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研究论文 | 本研究探讨内皮细胞CEPT1通过PPARα和VEGF-A信号通路促进血管生成的作用机制 | 首次揭示CEPT1通过调控PPARα-VEGF-A信号轴促进糖尿病条件下缺血后血管生成和恢复的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证相对有限 | 阐明CEPT1在糖尿病相关外周动脉疾病中促进血管生成的作用机制 | 人类外周动脉疾病患者样本、内皮细胞特异性Cept1过表达转基因小鼠、小鼠主动脉和内皮细胞 | 分子生物学 | 外周动脉疾病、糖尿病 | 单细胞RNA测序、分子通路分析、基因工程小鼠模型 | 条件性基因过表达小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、功能实验数据 | 人类患者外周动脉样本、C57BL/6J转基因小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 672 | 2025-11-21 |
Lung Microphysiological System Validates Novel Cell Therapy for Acute Respiratory Distress Syndrome
2025-Nov-20, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500225
PMID:41263118
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研究论文 | 本研究通过新型肺微生理系统评估人脐带血来源间充质干细胞对急性呼吸窘迫综合征的治疗潜力 | 开发了模拟ARDS肺环境的新型微生理系统,首次比较hUCB-pMSCs与地塞米松的治疗效果并发现其激活血管生成通路的新机制 | 微生理系统可能无法完全模拟体内复杂环境,研究样本规模有限 | 评估hUCB-pMSCs作为ARDS替代疗法的疗效 | 人脐带血来源间充质干细胞(hUCB-pMSCs)和地塞米松 | 生物医学工程 | 急性呼吸窘迫综合征 | 荧光成像,单细胞RNA测序 | 微生理系统(MPS) | 图像,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-11-21 |
Multiplexed RNA imaging and in situ profiling in living cells
2025-Nov-19, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06220a
PMID:41210282
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综述 | 本文探讨活细胞多重RNA成像技术及其与固定细胞空间转录组学方法的比较 | 开发了能够在活细胞中进行多重RNA成像的先进荧光探针技术,实现RNA定位、相互作用和浓度变化的实时监测 | 传统空间转录组学方法需要细胞固定和透化,只能提供静态快照 | 推进时空RNA分析技术,追踪RNA动态变化并揭示多种RNA物种间的时间关系 | 活细胞中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 多重RNA成像,荧光原位杂交,测序 | NA | RNA图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA分析 | NA | NA |
| 674 | 2025-11-21 |
Targeting the origins of multiple myeloma along hematopoietic stem cell lymphoid lineage differentiation
2025-Nov-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu0114
PMID:41259534
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序追踪多发性骨髓瘤在B细胞谱系分化过程中的恶性转化机制 | 首次在B细胞分化过程中识别了1q扩增和17p缺失的起源阶段,并发现FCRL5通过IRF4/SPI1复合物驱动恶性转化 | 未明确说明样本规模和实验设计的局限性 | 探索多发性骨髓瘤起始细胞的恶性转化机制和驱动基因 | 多发性骨髓瘤患者的造血干细胞至淋巴谱系分化各阶段细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序, 遗传示踪分析 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2025-11-21 |
Insights into the relevance of targeting fibroblasts to control cancer
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102395
PMID:41187743
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综述 | 本文总结了以癌症相关成纤维细胞为靶点控制癌症的最新研究进展 | 探讨了通过AI平台解析新型大数据识别CAFs在肿瘤进展和治疗逃逸中的作用,并提出针对CAF异质性需要个性化治疗的新观点 | NA | 探索以癌症相关成纤维细胞为靶点控制癌症的策略 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 676 | 2025-11-21 |
Integrated transcriptome profiling of plasma exosomes reveals molecular stratification of exocrine and endocrine disorders and S100A8-mediated cell interactions in chronic pancreatitis
2025-Nov-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00832-x
PMID:41249153
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研究论文 | 通过血浆外泌体转录组测序建立慢性胰腺炎分子分型系统并揭示miR-24-3p/S100A8轴在疾病进展中的作用机制 | 首次建立基于血浆外泌体12个miRNA表达的3阶段分型系统,并发现外泌体miR-24-3p通过调控中性粒细胞S100A8影响胰腺星状细胞纤维化和巨噬细胞炎症的新机制 | 分型系统仅完成初步验证,需要更大样本量的前瞻性研究确认临床适用性 | 开发慢性胰腺炎外分泌和内分泌功能障碍的分子分型方法并探索其发病机制 | 慢性胰腺炎患者血浆外泌体、胰腺病变组织、CP小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性胰腺炎 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞测序数据 | CP患者队列和外部验证队列 | NA | 外泌体转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-11-21 |
Virus envelope glycoprotein targeting bispecific T cell engager protects mice from lethal severe fever with thrombocytopenia virus infection
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102458
PMID:41260206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现T细胞缺陷与SFTS致死相关,并开发了靶向病毒包膜糖蛋白的双特异性T细胞衔接器抗体,成功保护小鼠免受致命SFTS病毒感染 | 首次揭示CD4 T细胞功能受损与SFTS致死率的直接关联,并创新性地开发了靶向SFTSV包膜糖蛋白Gn的双特异性T细胞衔接器疗法 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发针对严重发热伴血小板减少综合征病毒的有效治疗方法 | SFTS病毒感染的小鼠模型和患者样本 | 免疫学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据 | SFTS患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2025-11-21 |
Butyrate modifies epigenetic and immune pathways in peripheral mononuclear cells from children with neurodevelopmental disorders associated with chromatin dysregulation
2025-Nov-18, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00792
PMID:41260988
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研究论文 | 本研究探讨了丁酸盐对染色质相关神经发育障碍儿童外周血单核细胞表观遗传和免疫通路的调控作用 | 首次在染色质相关神经发育障碍中鉴定出共同的核糖体-免疫RNA特征,并证明丁酸盐能逆转这些异常通路 | 样本量较小(总样本数21,单细胞测序仅6个样本),且仅针对外周血细胞进行研究 | 研究丁酸盐作为组蛋白去乙酰化酶抑制剂对神经发育障碍的治疗潜力 | 染色质相关神经发育障碍儿童(Kabuki综合征、CHARGE综合征、Rett综合征)和非单基因诊断神经发育障碍儿童的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 神经发育障碍 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 总样本21个(患者19个,对照2个),单细胞测序101,539个外周免疫细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 679 | 2025-11-21 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
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研究论文 | 本研究揭示E-钙黏蛋白缺失通过上皮细胞内在机制和上皮-免疫互导导致气道重塑和哮喘样表型 | 首次发现E-钙黏蛋白在气道上皮祖细胞中的特异性缺失可诱发无需过敏原暴露的哮喘样表型,并识别出上皮细胞感知连接破坏并启动免疫防御的内在能力 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究E-钙黏蛋白在气道细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮细胞(特别是club细胞和纤毛细胞) | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 680 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术揭示了机械应力驱动的杨树木材异质性发育机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学和磷酸化蛋白质组学,系统解析了张力木形成的细胞类型、谱系关系和分子调控网络 | 研究主要聚焦于杨树特定发育阶段,在其他树种或发育时期的普适性有待验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞异质性发育机制 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材的木质部组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 代谢物数据, 蛋白质磷酸化数据 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |